5JQ5A

Crystal structure of cdk2 in complex with inhibitor icec0942
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
296
structure length
287
Chain Sequence
NFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Inhibitor Selectivity for Cyclin-Dependent Kinase 7: A Structural, Thermodynamic, and Modelling Study.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Cyclin-dependent kinase 2
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 81
structure length 287
sequence length 296
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2016-05-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5jq5A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5jq5A01
3QTWA 4D28A 4NK9A 2B9JA 3PJ8A 1PMVA 4KKGA 4C4JA 4BZNA 2BRNA 4XV2A 3CEKA 4UXQA 4RFZA 1ZYSA 2UW6A 2GFSA 5AP6A 1IASA 3VUGA 3W2PA 3GFEA 3UZPA 2RFDA 2IZSA 3EYGA 3ZOSA 3TKHA 2BCJA 4RIWB 4YJVA 3COIA 3GC0A 3DNEA 2R3LA 3NYVA 2VD5A 2XYNA 2OIQA 4FKUA 3FI4A 3VUDA 3PXZA 3BEGA 4EK4A 5J79A 5CEKA 2W4OA 4F9AA 5DVRA 1LPUA 3LKMA 5BVWA 4P5QA 3RNIA 2J0JA 2YERA 3EFLA 3VHEA 4ZXTA 4WUNA 4C2WA 1CTPE 2VUWA 3QZIA 5HVYA 4DE4A 5F20A 5CALA 5BNJA 1WVXA 3ZLYA 4Z7HA 5E4HA 1U5RA 2WIPA 1YHVA 4MK0A 5LMBA 3HV6A 5E8XA 4K8AA 4LUEA 4PDOA 5KZ0A 4F7NA 2XIZA 5E8TA 2JLDA 3UOHA 5CF8A 4JRNA 4BDEA 4KIPA 2WQMA 2BHHA 5IMEA 4FSUA 3NYXA 2PULA 3LFNA 1PYXA 4G5JA 4H39A 4H1JA 4V04A 3ODZX 2FGIA 2R3PA 2YFXA 3SG9A 4PTGA 3CD8A 4GFGA 4IHPA 5BUEA 3Q5IA 3OF0A 3QQFA 3RTPA 3FDNA 2C4GA 2XNPA 4M14A 2GNLA 2Y7JA 3PG1A 3V5PA 1H28A 1APME 1YWNA 4IXPA 1UA2A 3R04A 2C3LA 3QCYA 1T45A 4AZVA 5AIRA 3GT8A 3SRVB 4FKLA 5AA8A 3K54A 4GUBA 1MUOA 2WTJA 4MQ1A 3Q5ZA 5T68A 2X1NA 2V5QA 2BHEA 5ANKA 5C03A 1W7HA 4WSYA 4BVUA 3KXXA 3Q53A 4H3PA 3UC4A 2GSFA 3ORIA 3DJ6A 4I6BA 3F66A 4X3FB 3JR1A 1WZYA 4O7YA 2WQEA 4PWNA 2BDFA 2SRCA 4Y5QA 1SMHA 3VN9A 2JKKA 2Z02A 4W4VA 2BAJA 3VUTA 3H9OA 4CTCA 4RC3A 2AYPA 4IM0A 2ZM3A 4TWNA 2I7QA 4R77A 2X7OA 3R1NA 2X4ZA 2WD1A 3A8XA 4ACDA 2QODA 2X81A 4IAYA 3DTCA 4AW0A 3QHWA 4BDBA 3ZUUA 1PF8A 4CSVA 5A14A 5A46A 5KHXA 5GJFA 4IDTA 3ZLXA 3IW7A 4XBUA 3QYWA 4CMTA 4C3FA 5DMZA 2G01A 3FYJX 2QU6A 4FKGA 1HCLA 5IQAA 1JOWB 4RX5A 5LCKA 4I4EA 3LE6A 5LVOA 5IUGA 5J9LA 3VC4A 4PP9A 2XRUA 1LUFA 4EH4A 1W83A 2GU8A 3BV3A 3ZU7A 5L2IA 2CNVA 3OXTA 4IMYA 5IPJA 2HOGA 3TM0A 4V0GA 1FMKA 1Y8YA 3EN9A 3ZXZA 3FPMA 3SHEA 2QONA 4FSYA 4G3EA 1Q99A 4BCHA 4DGNA 4F1MA 1GAGA 3WF9A 4EQCA 4FIEA 5AV2A 5LWNA 4TKSA 4JIKA 3CQEA 4GH2A 4ANQA 4DEDA 3QRTA 3D7TA 3TTIA 2BILB 3E8EA 5JZNA 2OKRA 3KCKA 2W17A 2YDJA 5F4NA 2XIKA 4CYIA 1KE8A 4U6RA 2R3KA 1JWHA 4EHZA 4G31A 1H0VA 2NRYA 2WEIA 3A4OX 4FE2A 2VO6A 3W2OA 3OUKA 2OXYA 2UZEA 5LWMA 2HWOA 3BYVA 5T3QA 4AW5A 2QNJA 4GG5A 2VWWA 2RG6A 3DDPA 5BVKA 1CMKE 4EHVA 2C0OA 2IJMA 1ZOHA 2QI8A 4XG9A 5D10A 4ZSAA 4J71A 2A27A 4I24A 4I0TA 4XMOA 4QP6A 4R5YA 3PIXA 4DF3A 5CNNA 1YXTA 2HZ4A 2R7BA 1WCCA 4YTHA 4FIIA 2B54A 4YBKA 3LHJA 4N70A 3Q9XA 4ZLOA 5M44A 3SGCA 4W4XA 4IZ5A 2XBAA 3CR0A 5ANOA 4N4SA 3F3WA 5I5ZA 3C0IA 4G6OA 4KD1A 4R7HA 5BMSA 2QOCA 3QF9A 4A9YA 4BB4A 2J6MA 4MEDA 1Q3DA 2WTIA 3WF8A 2X9FA 5IA4A 1YOMA 3PVBA 2QO9A 4FTOA 4AG8A 2XJ0A 3SOAA 3T9IA 3WBLA 3U55A 4O7RA 2C30A 3GP0A 2RIOA 5HO8A 4DBXA 4TYIA 2B7AA 4G3CA 3UOKA 3Q6UA 4FL3A 4I5MA 5CU4A 2E9NA 5FWKK 2PU8A 3RK9A 4RFMA 3ULZA 4RWLA 4UMUA 5LMKA 5D41A 4XJ0A 2XM9A 4I5CA 2XJ2A 4RWJA 3VULA 1DI8A 3W2QA 4F7SA 3L9LA 3R21A 4QNAA 3BZ3A 4GMYA 4A9TA 4W8DA 2XNEA 2Y6MA 3BGZA 1ZMVA 3UIMA 3UNKA 1F5QA 4KIOA 1ZMWA 1WVYA 3EFWA 5M4UA 4M15A 4FEVA 1JKSA 4R3RA 3PA4A 3MFSA 4N6ZA 4BDIA 3E92A 2UZUE 3I5NA 5L8JA 4RC2A 3SDJA 3OCTA 1OIYA 4WG3A 5KMNA 5IQGA 5K5NA 4RA4A 5BYLA 3NW7A 1MP8A 2OZAB 3WF7A 4D2WA 1K2PA 2GS2A 4FSWA 4JRVA 2YACA 3QD4A 1O6KA 4RIXB 2O8YA 4TNBA 3PXQA 3ROYA 2C5OA 3COKA 2C68A 3E62A 3HUCA 1SVEA 4UWBA 4FV4A 3BLRA 4BI0A 4FZ6A 4L7SA 4B99A 3TNHA 1Q8UA 1OKVA 2BTRA 1GJOA 2JFLA 3S00A 3RM6A 3RPSA 3BPRA 4ANSA 5CXHA 4O7VA 2EUFB 1FMOE 5A4CA 4AS0A 2YCQA 1ERKA 3KB7A 2FUMA 1BX6A 4IZ7A 4PTCA 4FIFA 3KN5A 5TKDA 3SXSA 3GC8A 4Y5HA 3WYYA 4AT4A 3EJ1A 4J95A 5E8UA 3AC1A 1OPLA 4P5ZA 3E87A 2E9OA 3DS6A 4W9XA 4EZ7A 1TKIA 3KF4A 2YITA 4O96A 4FKOA 1V0PA 4YPSA 4GK4A 3SD0A 4CV9A 4CV8A 4I94A 4R6VA 3WE8A 3A4PA 3G33A 5E8ZA 4GKHA 4XS2A 2CCHA 4EEVA 3T3UA 4UY9A 4XEYA 2JDVA 3RCDA 4EJNA 5EW8A 3F9NA 2QOLA 2HXLA 4C4EA 3ZDIA 3UNZA 4FKRA 2XKFA 3IW5A 4UZDA 5DHJA 4ZSEA 2Y4IC 3ZO4A 3FY0A 1M7QA 2BROA 2OXDA 4L67A 4FSQA 3NUSA 4TRLA 3IECA 4USDA 3W10A 4R3PA 3NUYA 4CTBA 2CGWA 3HNGA 3QTQA 3TACA 5F9EA 3FHRA 3FI8A 4X7QA 4A9UA 3QU0A 1PXJA 5J7HA 1W8CA 2F49A 4E7WA 2BFYA 3LXLA 1J1BA 1VEBA 2J0KA 4C62A 5J5SA 4IAAA 2BRBA 3O8TA 4K33A 3TIZA 3AD4A 2C5YA 2W4KA 4FI1A 3TNQB 1Q8WA 3PWYA 4FYNA 3TDVA 4BY9E 4DGOA 4TYGA 3LZBA 4QNYA 4RLLA 4E6CA 4G3GA 2X2LA 2YN8A 2OLCA 1ND4A 1JKTA 2W4JA 3KMMA 3KQ7A 4IADA 4MVFA 4GVJA 4FV7A 4GK2A 2AUHA 2BZHB 4NFMA 3F82A 3KMWA 3QZHA 3VBTA 1DAWA 3F5PA 1XH8A 1UU7A 3NYNA 2P2IA 3P78A 1H8FA 4HGLA 5BYYA 3ZRMA 4NTSA 2QOHA 2PZRA 5HICA 4LOPA 3QTUA 3S2PA 2IVTA 4CG8A 3W2CA 2ITPA 3I6UA 4I3ZA 2WMBA 4CT2A 2G1TA 4D0XA 3WIGA 5K9IA 2UW3A 4G16A 5JT2A 3FJQE 3NX8A 4QPAA 3U4UA 3FLQA 4KKHA 4ZTNA 4DGGA 3OXIA 3N51A 4RWKA 3POOA 4FKPA 3UQCA 3LLTA 1DAYA 2OO8X 4G34A 3RAWA 3HUBA 3ZM9A 1E1VA 1WBSA 4PTEA 4BI2A 1MRVA 4U42A 2FA2A 4S33A 4MHAA 4HPUE 4L8MA 2IZRA 3QGYA 4BDAA 4ZTSA 4QMXA 4B4LA 4ACHA 1L3RE 2R0UA 4W8EA 3JS2A 1IG1A 4AN9A 5DLSA 2W06A 5ANIA 4B8MA 5M55A 2WMAA 3QRIA 3V5JA 3CTQA 5BVDA 1XHAA 3BHHA 4LOQA 2HXQA 4JNWA 5TO8A 4NJDA 3W18A 3UZRA 3NNUA 1SNUA 3OHTA 3VHKA 4CD0A 5FUTA 3R1SA 4ZY6A 3RNYA 3SW7A 1CSNA 3MIAA 1V1KA 4W4YA 4BKJA 3Q60A 4LGGA 3P1AA 3EZVA 3PPJA 1OECA 3TJDA 3ZDUA 4B9DA 4U7ZA 3QRJA 3VS2A 5FP6A 3RCJA 3LVPA 2OU7A 1BI8A 3RM7A 2CJMA 3FZSA 5JN2A 3FLWA 3GC9A 3W1FA 2XS0A 2IPXA 5FM2A 4HNIA 2R7IA 3M1SA 3CLYA 2GPHA 2ZV9A 4EOIA 4BHZA 5JFWA 3L8PA 4FUYA 3DKCA 4UXLA 4DEEA 4FEXA 1GZNA 3MIYA 4X2GA 5DFPA 3BIZA 3V8TA 2YIWA 3MTFA 3FBVA 5DEYA 3HMOA 4HCUA 2O63A 4FZ7A 3L9PA 3QGWA 3FLNC 5A54A 1ZAOA 1O6LA 3D94A 2VTHA 4IAFA 2B9HA 3P5KA 3LPBA 3QALE 4EBVA 2WZJA 3G6GA 2C6DA 4JG6A 3PYYA 4FV1A 4QP2A 3AT4A 4J52A 3DBFA 3E3PA 4RC4A 2XA4A 4LV5A 3CSVA 4OW8A 5CS6A 4HYSA 5BVOA 3R1YA 2ZAZA 4M69B 3TNWA 3D5WA 4UWCA 5JZJA 3BRBA 3FQHA 4PMMA 4F65A 2XCHA 1H27A 3KA0A 2ZM4A 4D55A 4Y73A 3LMHA 3E88A 4IEBA 5KMMA 5AUZA 2JDSA 4MXCA 4GV1A 3DY7A 4ZZMA 1OB3A 2IWIA 3PRIA 5JK3A 3MFRA 1P4OA 2BVAA 5HI2A 1PHKA 3COHA 2PVNA 5AV3A 2ZDTA 4KB8A 5BUJA 4ZLYA 4Q2AA 5L2WA 5CYIA 5AX9A 3HP5A 4RIWA 4EONA 3IW6A 5CASA 4ZSGA 3NUNA 2G2HA 2G15A 5CNOA 2IZUA 4I5HA 5FDXA 1H01A 3QXOA 5ANGA 3UBDA 3EN6A 5AUXA 3S4QA 1XQZA 2C5NA 3JY0A 5EYDA 2X8IA 3IO7A 1Q61A 1WBWA 4C3RA 5IA1A 3U4WA 1PRYA 4N57A 4AGCA 1O9UA 5AUVA 3OT3A 3VJNA 3MH1A 3ZO2A 1SNXA 4ZLZA 4JI9A 1B39A 4QMYA 5C26A 5TE0A 4C02A 5IH4A 3DXQA 4O84A 4NL0A 1GNGA 2ZDUA 4TWCA 3FQSA 4HGTA 2BIYA 3IGGA 3PZEA 1BL6A 4U44A 3F61A 4OTFA 3TZ7A 3W8LA 3WF5A 1G3NA 3LCKA 1OIUA 5FTQA 3LFQA 4YU2A 2P33A 2OF2A 3MPMA 4OTHA 4G9CA 2I0HA 3O71A 4J8NA 3RAIA 4L44A 5DR6A 4XP3A 3VQUA 2QQ7A 5J9ZA 5FXRA 5J95A 2HZ0A 3NAYA 4O1PA 3F88A 3ZYAA 2OJFE 3PE1A 5FG8A 3VS3A 4DH5A 4OTIA 2P2HA 4CCBA 2V55A 1ZOGA 3PIZA 3QCXA 5LMKC 4JBVA 5IQBA 1H1QA 3KXMA 3Q4ZA 2JGZA 3QYZA 4QMVA 4U43A 5CF6A 1R78A 5K0XA 1YHSA 4M68A 3C4WA 1OI9A 1H24A 5AMNA 4AWIA 3P7BA 4GKIA 4I6HA 5CEMA 5AJQA 5HLNA 3PLAE 4YZCA 3SRVA 4FTQA 4XG2A 4JDKA 2WKMA 1KE5A 4MCVA 3DU8A 4YC6A 4K6ZA 4KINA 3DAKA 3F7WA 3SQQA 4D2RA 4C33A 4I0SA 4AE9A 2OIDA 4JVGA 3ORTA 5GNKA 5JH6A 4O81A 1H1RA 3DPKA 3FLZA 3NLBA 4NM3A 5K4IA 3NUAA 4DH7A 3JVRA 4FTLA 3U6JA 4KS8A 4X3FA 3C4CA 2UZLA 3BWJA 1REKA 3QFVA 4S34A 4ZTQA 3PXFA 5IDPA 4E6QA 2C1BA 3TZ9A 5I4NA 4JR7A 4PL4A 2UW5A 4Z9LA 3RZFA 1KE7A 3R00A 4O91A 2UW0A 2ITOA 3COMA 2R0IA 4O0WA 2WMWA 3BCEA 3C4EA 3QUDA 4IAZA 5EM7A 3BELA 3DNDA 4YJOA 4D4YA 4C38A 4XHKB 5HQ0A 2CNUA 5C01A 5CANA 1ZRZA 5E9EA 4AX8A 4B0GA 3BBWA 2YM3A 3PXKA 3AQVA 4NW5A 4C35A 5AV4A 5M4CA 4JS8A 3UOLA 4OAVB 2EB3A 2PVLA 3WIKA 3KULB 4G9RA 1JNKA 4QQTA 4MXZA 3TL8A 5EOLA 4ZJVA 1UNLA 2P3GX 2R64A 3BE2A 4V05A 4ALUA 3FEGA 1Q62A 4KIKB 2RKUA 5J9YA 3E7VA 1DS5A 5DE2A 5ANDA 3C5UA 3GQLA 4ZP5A 4MXOA 3I81A 5H9BA 2I0EA 2RFEA 3CQUA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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