5JQ8A

Crystal structure of cdk2 in complex with inhibitor icec0943
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
296
structure length
278
Chain Sequence
NFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Inhibitor Selectivity for Cyclin-Dependent Kinase 7: A Structural, Thermodynamic, and Modelling Study.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords Cyclin-dependent kinase 2
total genus 77
structure length 278
sequence length 296
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2016-05-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5jq8A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5jq8A01
3ZLSA 5GZ9A 4DEEA 4EJ7A 3H9FA 2XBJA 3FC1X 4I93A 3NUXA 4HNIA 1J7UA 1JWHA 1Y91A 4WUNA 4PMPA 3SX9A 4D5HA 3Q52A 4JDIA 1JVPP 4EL9A 4QMOA 4YLJA 4MTAA 1BX6A 2G2FA 4PTEA 2JLDA 5GJGA 5CASA 5JGAA 3ZUUA 4JL9A 1Q5KA 2V0DA 3D94A 4C8BA 4O2ZA 2OSCA 4YZDA 2QOLA 5IH5A 2XCHA 1WVWA 4Z16A 4O86A 4PPAA 4U79A 3V01A 5FBNC 4BTMA 5AP7A 5T3QA 4M69A 1XR1A 3ENHA 4GFMA 5AUWA 3NUUA 4RC2A 1ZWSA 4R6VA 4I94A 2I6LA 3LPBA 3OXZA 4FIGA 4EQCA 4B4LA 5DPVA 3N51A 3KEXA 4F64A 4EI4A 4FV3A 3T8OA 2O63A 3OC1A 4F7SA 3CC6A 5DR6A 4KAOA 3VHKA 4U40A 3FZSA 5KCVA 4O7NA 4FKGA 3AQVA 4BCFA 2Z02A 1U59A 4CKIA 3DOGA 2WMRA 5BNJA 3T3VA 4L43A 2VGOA 4IBMA 1MRUA 3MFSA 5D9HA 2QNJA 4QPSA 2WKMA 3NYXA 4J52A 4FZ6A 4XG7A 4C35A 3O96A 2PZYA 2XNEA 3KQ7A 3BZ3A 2I7QA 4NM7A 2WIHA 5E8TA 4HGLA 4D2TA 4YBKA 2BR1A 4RLKA 3IGGA 3JVSA 3PPZA 3ZCLA 2B53A 1H00A 4WBOA 4QMQA 4TYHA 1EH4A 3FQEA 3EIDA 2H6DA 3HMNA 5KMMA 4W4VA 3F3WA 3BHYA 4RA4A 4ZIMA 2FSTX 3TDWA 4D2SA 2UZOA 3HNGA 3NCZA 3HA6A 3DNEA 5I9UA 3VJNA 2J50A 2A0CX 2BALA 3U4WA 2C4GA 5KMIA 4MCVA 4NEUA 2WMBA 3ITZA 4FV4A 5CANA 2WNTA 2XK9A 1R3CA 4ONAA 3BQCA 3NLBA 4E4MA 5D12A 2Y0AA 4NCTC 5J9LA 4KSPA 4WT6A 3BV2A 2VTQA 4HYUA 4UZDA 1PW2A 2AUHA 2VTHA 3MH0A 2UZDA 4OTPA 3RHXA 3KF4A 2BRHA 3C50A 5I9VA 5CAVA 3P23A 3GU6A 3HKOA 3I4BA 4W9XA 3FEGA 4ZY5A 2J51A 2PZIA 2QR7A 4ACHA 3F2NA 2PZPA 5CF4A 3EN9A 3NW7A 4QPMA 4K18A 2WELA 4XHKB 4FKPA 3C51A 3NNUA 5DYJA 3DB6A 3O51A 5M55A 3LCOA 5AAFA 5IA0A 4TZRA 4EOSA 2J4ZA 4D2PA 4C4IA 3UODA 3WZJA 2Q0BA 4BHNA 3HMIA 5LVLA 4I4EA 4E5BA 2O5KA 2LAVA 3MB6A 4DLIA 3LFNA 2HWPA 3V5QA 4AG8A 5BUIA 1OI9A 3C9WA 4O0VA 2OZAA 3BYUA 3PJ8A 1IG1A 2WEVA 4FV7A 4V0GA 5CNNA 2VWVA 4C4JA 4BIEA 3F3VA 2E9NA 3FMKA 3G0EA 2X0GA 2HIWA 3OXTA 2YAKA 4S2ZA 4U5JA 1YXSA 2J0IA 3E87A 1PHKA 3LFQA 4C34A 2XK3A 5KZ0A 4DITA 4BYJA 5I4NA 4BDDA 3OD6X 3B2WA 4PRJA 4QTDA 2Y6MA 2GNGA 3TL8A 3UIUA 2RFSA 3CR0A 1FPUA 1PXJA 3VN9A 1Q62A 4L8MA 3CSVA 3QLFA 4DEGA 4ZTSA 2Q83A 5EI2A 4FSQA 4GVJA 1OL2A 1DM2A 1QL6A 3D4QA 2BDWA 4FT3A 2JIIA 4RVTA 4IANA 3A7HA 4ZLYA 1MP8A 3FSFA 3IDCA 3QD0A 4YJQA 1KOAA 2VWYA 4IM2A 3V5LA 3VBXA 3DXPA 5HVJA 3Q2JA 4RG0A 4XBUA 3EWHA 2NNWB 2BKKA 3S3IA 3WZDA 3RP9A 4TNDA 3U51A 4EK5A 5K9IA 1T46A 3WF9A 3PVWA 4DAWA 3F66A 2OXXA 4GL9A 4ID7A 3LMIA 2HYYA 1UNLA 4LRKA 4M0YA 2BPMA 3PXFA 3KN6A 4RJ6A 4EK8A 1WBSA 3QCYA 2CNUA 3VS5A 4WKQA 2W5HA 2WMVA 3QKMA 4C4GA 5HU3A 4DH1A 3PZHA 3GC9A 4W4XA 4UYAA 4YNOA 4AXAA 5CF8A 5HO8A 3MESA 5CI7A 3DLSA 2GS2A 2JEDA 2R9SA 3U6JA 4HZRA 2ZM3A 5FWKK 3R28A 3R9HA 4IIRA 4GFGA 4RIXB 2VWIA 3QTXA 4BN1A 2R3FA 5DBXA 2E9OA 4OTHA 3AT4A 4AT3A 3DBCA 3PE1A 3ZM4A 3KRWA 3OROA 4Y73A 4M67A 3THBA 5IUIA 4MBLA 3D7TB 3EKKA 4CTBA 2A4LA 2C5YA 2W1ZA 4EC8A 1X8BA 4EOPA 3R00A 3I60A 4D1XA 5E8YA 4BDGA 1IAHA 4BCNA 2X7FA 1DI9A 4UMQA 4CKRA 2J0JA 1Y8GA 4YPDA 5LQFA 4ORKA 3FKLA 1QPCA 2C5VA 4GUEA 4G34A 5EFQA 3MTLA 4IDVA 4XH6A 4CKJA 4AW5A 3LFEA 3C4FA 2C6IA 4BKJA 4PP7A 4W4WA 3A8WA 3MFRA 3BYVA 3D7ZA 4FX3A 3G5DA 4YPSA 3V6RA 3OEFX 4UALA 3EZVA 3ZOSA 3PZEA 2ZJWA 2AC5A 3VNTA 1UKHA 2W96B 2WTJA 3UYTA 2YZLA 3FPMA 5I9ZA 3W16A 4AN3A 2X8DA 4LYNA 4YJTA 4KRDA 4UMUA 4R7BA 4D9TA 2X7OA 4M68A 4C0TA 4AACA 4IWPA 4K11A 4LOOA 4N6ZA 1WZYA 1SNXA 2GTMA 1TQPA 4O7WA 5F4NA 3QTZA 4IWDA 5L3AA 4GYIA 4J53A 2V7OA 3QCQA 4QQCA 4BGHA 1OZ1A 3RMFA 2WD1A 4I4FA 4C57A 4DLJA 4EH8A 5BVFA 3FZOA 3IW5A 4BFMA 2QOKA 3ZFMA 4O96A 4RJ8A 3LFFA 3LFBA 4NCTA 5HLPA 4NWMA 3FHIA 3Q6UA 4O7VA 3MI9A 4Q9ZA 3LJ0A 2DS1A 3HEGA 2P2IA 3FHRA 3BI6A 3LQ8A 2WQMA 3FL4A 4J7BA 1V1KA 5EG3A 2BMCA 3CJFA 4M84A 3IW7A 4Y95A 3QLGA 4YLKA 2W17A 3C4ZA 1OKYA 5IUHA 3F3UA 3ZFXA 4BDCA 2Z7LA 1YWVA 3IONA 4H3PA 4RX7A 4LV8A 3UIBA 3QD2B 4C4HA 5JN2A 3RTPA 5AUUA 4B0GA 4EYMA 5HVYA 4QTEA 1ZYCA 4F63A 5CQUA 3C0HA 3IQ7A 4NTSA 1H24A 2QOBA 4GIHA 3V3VA 2OH4A 2QO2A 3SW4A 4FIHA 3O8PA 4PWNA 3F82A 3KY2A 3Q4UA 4K77A 3PY0A 4FICA 1SVHA 2R3HA 2J6MA 1BL6A 1W7HA 2BAKA 3D5XA 3NW5A 4FTUA 3VUIA 1F3MC 3ZZWA 4QMZA 5DT0A 4DA5A 4EBWA 2PWLA 4XV2A 5HKMA 2HZ4A 4IC7A 3WILA 4QMPA 4CQGA 3CCNA 4RVMA 4DH7A 1IASA 2X9FA 2ZM1A 3OBGA 2OIBA 3O2MA 4OUCA 2Z7SA 2G2IA 5GNKA 1NT2A 1OIUA 3LJ1A 2C69A 2BAQA 5AA8A 4C2WA 5AIKA 3KB7A 1JPAA 2BAJA 3PE2A 3HZTA 4DTAA 4KRCA 4F99A 2BRGA 3EQGA 4O7TA 5HD4A 3MPAA 2VO6A 3JVRA 3DDPA 3MWUA 3VS2A 1PRYA 2R3IA 3C7QA 4DEIA 4F0FA 4ZSGA 3PUPA 3W2OA 3VW6A 4USDA 5K0XA 1NW1A 2BZJA 4TT7A 3A62A 3LCKA 3Q9ZA 5A4CA 2XYUA 4L67A 5L2WA 2UZNA 5ANKA 2OJGA 1PMNA 2OICA 4HYIA 5HIBA 3EYGA 3R21A 5KMKA 2C1AA 1JSVA 1YI3A 2C6OA 4QP7A 4XP3A 4EYJA 5J79A 4AE9A 5IQEA 5L2QA 4H3BA 4AOTA 4HW7A 3DBFA 3GCPA 4FK3A 2IW6A 2VTAA 3G6GA 4G2FA 3M2WA 4RJ7A 4ZP5A 4A7CA 4GV1A 3UOJA 2JFLA 3FE3A 1REKA 4A06A 3COIA 3C4EA 5AV4A 2CKQA 4U3ZA 4F65A 4FF8A 2CPKE 5ICPA 1ZARA 5D7VA 4RFYA 2E9UA 3P86A 4TWOA 5IA1A 4JAIA 3LQ3A 1KE5A 3B8QA 4I20A 3F7WA 1Q4LA 3PP1A 4J8NA 1Y8YA 4X7QA 2WQNA 4R77A 4FVRA 4I3ZA 2VWBA 5AX9A 2BFXA 2YCSA 4NU1A 5IEXA 4PY1A 4EKLA 4YU2A 4O2PA 4R1VA 5EM5A 4CFMA 4IC8A 2JDTA 2R0UA 4IADA 4PL5A 4EK3A 2W9FB 5BX0A 4ALVA 1YHSA 3C4XA 4EZ7A 3SLSA 3QTSA 1HCKA 3GC7A 4OAVB 3FMHA 4FIIA 2IPXA 2DWBA 4ZS4A 4RWKA 2ITYA 3OWJA 5H8GA 3UGCA 2YA9A 2AC3A 3W33A 2XNBA 4EOMA 5HG9A 4EH7A 3FMJA 1GNGA 2JGZA 4NM0A 4ANNA 4LMNA 1BYGA 4J8MA 4ZJJA 4ZLZA 5K5XA 3KULB 3BELA 3Q5IA 3DK7A 3KCFA 3TKHA 2FSLX 4GT5A 4X2JA 3KRJA 1H27A 4J98A 1UKIA 4MWIA 3W18A 3SGCA 3DKCA 5AIRA 1W0XC 3NYOA 2CCHA 3N9XA 2YISA 3PFQA 4M66A 4FC0A 2G15A 3MIYA 2QO7A 2XP2A 3FLWA 3UZTA 3EL8A 3UP2A 1H0WA 1L3RE 1GZOA 3AGMA 2XIZA 3E8NA 2JDSA 2PVHA 3F5XA 4E6DA 4QYHA 3L9LA 4RFZA 4AN2A 3P7AA 4GFOA 2UVYA 3P4KA 1H1RA 4GKIA 5ETAA 4P90A 3IGOA 3CTQA 5CU2A 4JOAA 1P2AA 4BDKA 4XMOA 3FI2A 4EH5A 3I5NA 2BDFA 1FMOE 3NS9A 5DWRA 4M15A 4DFNA 3LZBA 2CJMA 5K3YA 3V8WA 3AXWA 3R7IA 3VQUA 4AGUA 2QOHA 4FTLA 1SZMA 1YDRE 1YRPA 3QCSA 4GK3A 5ANOA 4EQUA 1WCCA 3EFLA 4PDOA 4AQCA 5HIDA 4D4RA 3LXLA 3TUCA 2EXCX 2EXMA 4EWHA 3CLYA 2CLQA 4BB4A 5HE3A 2UUEA 4GU6A 2C0TA 2CN5A 5IDNA 4NYEA 1Q8ZA 3OCSA 5IQFA 2XIKA 4B6LA 3O17A 2P33A 4JG6A 4JR3A 4PNKA 4FTTA 2WMQA 3CBLA 1REJA 5IMEA 4LM5A 4EH4A 4YMJA 4RWJA 5JRQA 4YC3A 1JSTA 4Y72A 5BVKA 3OF0A 1YXXA 5E91A 3KU2A 3RWPA 3CP9A 3PPKA 3RZBA 4A9UA 4BDJA 4U80A 3PLSA 4IACA 5F9EA 4S33A 3ROCA 3CPCA 3D5VA 4X3FC 3BBTB 1E1XA 2Y9QA 3P0MA 4H39A 3QQFA 2CNQA 5LVMA 3QWKA 4OW8A 3D5WA 5JQ5A 5E90A 4BWXA 4RLLA 4WG4A 4C4EA 4E4XA 3NR9A 4KINA 1Q24A 4CFNA 5AAEA 4ANSA 3EMGA 2IJMA 3CQUA 4I1ZA 4RX8A 4S34A 4ZTQA 4WHZA 2PMIA 2WU6A 3RCJA 4EH6A 2B54A 5L6WL 2O3PA 4M69B 2CSNA 3FLYA 1PXNA 5EM6A 2PL0A 2VO3A 5EW9A 3ZO2A 5H9BA 4C33A 2YCFA 4IVBA 3C5IA 1ZMWA 3RPOA 5JGBA 5AUXA 4ZTMA 4IZAA 2B7AA 4Q5EA 2X81A 4TNBA 5HGIA 3SXFA 1YI6A 2GNIA 3HECA 4L68A 2YM5A 1H4LA 2O64A 3PJ1A 4EK4A 2XNGA 5LARA 3IOKA 3HP2A 1LEWA 2JKQA 5A4QA 1JKKA 2WZJA 2XKEA 3B8RA 4EQMA 4D58A 2PUIA 4UXQA 3RAHA 3VS7A 4DGMA 3NUNA 2RG5A 3WYYA 5M4FA 3CKXA 4AAAA 3FSKA 2XJ1A 2XJ2A 3KRLA 1PJKA 2REIA 2ITOA 2JFMA 1GY3A 3DNDA 3IK3A 3OXIA 3PA4A 4WUAA 3MA6A 3ZO3A 2WFYA 4X3JA 3U8WA 5FM3A 4JRVA 4XG3A 4BKYA 4XG4A 1ZLTA 3QQLA 2XVDA 4BI1A 1H1PA 4TYHB 3SA0A 2PY3A 5DI1A 3W8LA 3BYMA 2F9GA 2IVSA 2RKUA 2J9MA 4H1JA 4BGGA 3EFJA 4D2VA 3BX5A 5IA2A 3T3UA 4R3PA 4YTFA 4BCMA 5M07A 1J1CA 2R7IA 2WTIA 3PRIA 4I5MA 5H8EA 4CEGA 3GOKA 4LGDA 3LJ2A 5ITAA 5HLNA 2XMYA 5CEMA 3UQGA 3E8DA 5JKGA 3G33A 4IVCA 2X4FA 4JI9A 2CKOA 4BDAA 4EORA 4UMPA 1HOWA 5K0KA 4IHPA 3HUBA 2C6EA 1OIQA 5ANIA 4YJPA 2YDKA 3LLAA 3MVMA 5F20A 1H26A 1SMHA 4LUEA 4YJUA 4AOIA 1O6LA 3EKNA 4LMUA 4L9IA 1B39A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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