5JZJA

Crystal structure of dclk1-kd in complex with amppn
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
275
structure length
271
Chain Sequence
EVSEEGFQIPATITERYKVGRTIGDGNFAVVKECVERSTAREYALKIIKKSKCRGKEHMIQNEVSILRRVKHPNIVLLIEEMDVPTELYLVMELVKGGDLFDAITSTNKYTERDASGMLYNLASAIKYLHSLNIVHRDIKPENLLVYEHQDGSKSLKLGDFGLATIVDGPLYTVCGTPTYVAPEIIAETGYGLKVDIWAAGVITYILLCGFPPFRGSEVLFDQILMGQVDFPSPYWDNVSDSAKELITMMLLVDVDQRFSAVQVLEHPWVN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Biochemical and Structural Insights into Doublecortin-like Kinase Domain 1.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase DCLK1
total genus 78
structure length 271
sequence length 275
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2016-05-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5jzjA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5jzjA01
3EN7A 2PE0A 4HPTE 5CI6A 3DOGA 5CVGA 2W9FB 2FH9A 3GGFA 3O8PA 3TUBA 3P7AA 5HORA 4QMMA 4QP3A 3TZ7A 3V51A 3PWDA 4NUSA 4EOKA 2UW7A 3VBVA 4CKRA 2UZDA 2WMRA 3QWKA 4FTRA 2HYYA 4G6LA 4GG7A 2Z7SA 3VQUA 4QMPA 5KZ0A 4DG2E 4Y8DA 4HVIA 4YBJA 4RQKA 3MIYA 4YLLA 3OG7A 3DLSA 4GT3A 5DBXA 4QRCA 4H39A 4O6LA 4ALVA 2UUEA 2I7QA 2BZIB 3HUCA 4ALWA 3W2OA 2VTRA 3E63A 1ZY4A 5AP4A 5AAEA 3HRFA 4O1PA 2O2UA 3UVRA 5IQAA 1KE7A 1YDRE 1R3CA 3K54A 3V5QA 4YC6A 3QQJA 4KKGA 4GFGA 3D9VA 3BWFA 4JQ7A 3COHA 5EHLA 3R83A 4KIKB 2Y6OA 2YM3A 3EMGA 3PA4A 3S3IA 5HO8A 2BDJA 3EH9A 4TWPA 2YHVA 3EQBA 3HV5A 3VHKA 4FZ6A 3ORKA 3TNWA 3FKOA 4V0GB 4E4NA 3Q5ZA 4OTIA 4RJ8A 3N51A 3FY2A 4GYIA 5F9EA 1M7QA 1ZMVA 3ET7A 3BHTA 5A3XA 3D2KA 1VJYA 1YOLA 2X9EA 3NNUA 2OIDA 2GQRA 3ORNA 3VJNA 5KKRB 3F6XA 1BLXA 3KXGA 4MF0A 2WEVA 4FTCA 4DG0E 2WMVA 3KB7A 1FMKA 2IJMA 2VWIA 3V5PA 1YDSE 4IB1A 2C0TA 4FF8A 4GJ3A 4R3PA 2QO9A 1J91A 1YOMA 4V0GA 5HOAA 4M67A 5IG1A 3FZTA 4F09A 2B9IA 1Q97A 2B52A 2VGOA 2VTQA 3GFWA 1QCFA 3OW3A 4FKUA 5CU6A 4ANQA 3LXNA 5CVHA 5KBQA 4HNFA 4NEUA 4FKSA 3UIMA 4ITIA 4NT4A 3KVWA 4BCOA 4XMOA 1ZXEA 4IIRA 5JGBA 3MSSA 3W18A 4F4PA 2I6LA 3ID6C 1OUYA 2WPAA 3QYWA 5FP5A 2J6MA 1SMHA 5F95A 3KRXA 3ORZA 3O50A 2OLCA 2CMWA 2RG6A 4MXYA 3D7ZA 4JBOA 4ZY4A 3LFDA 1TQMA 4RX7A 2FO0A 2ZM3A 4M13A 1H4LA 3SXRA 4CTCA 4D2WA 4Y5HA 4WD5A 3QBNA 4F9AA 4GRBA 5C9CA 4F65A 4QMWA 4R3RA 4G3FA 4BCNA 3QKLA 2ONLC 4AW2A 3UOJA 1YXUA 3P9JA 3WZDA 5HG8A 4BDBA 4G9CA 3ZSIA 2WTVA 4NIFB 4FIIA 2BALA 4FZ7A 4DEHA 1WZYA 2QOHA 3IKAA 5BX0A 2R4BA 2W96B 3EL7A 4IB0A 1UWJA 4ASDA 3FDNA 3K3JA 4BZOA 3NUUA 4DGLC 2HXQA 4C2WA 3R63A 3CS9A 2ZAZA 2VO3A 4U6RA 4D4SA 5FXRA 5A46A 2CGUA 5DLSA 2GCDA 5A14A 4IBMA 5AIRA 4AW1A 5K3YA 3R8UA 1IAHA 4BI0A 4XRLA 4HGTA 4LI5A 5KNJA 3U6HA 2QKRA 4ACCA 3IECA 2C3KA 4KINA 5L2IA 3Q9XA 4LRMA 3MN3A 4FGBA 4FT7A 1DI9A 4L01A 5E8TA 3ULIA 4JLCA 4NM5A 4KD1A 1JNKA 3HRCA 3N9XA 2I0HA 4GSBA 4OLIA 5C8MA 2F2CB 2PVKA 4EZ7A 1Z5MA 5AR8A 4ANNA 2KULA 4M84A 4X3FB 4EWQA 4O7RA 2VO0A 1OUKA 4RJ7A 1U5RA 3EQPA 2C1AA 4I23A 1SM2A 4QP8A 5H8EA 4BGQA 4JR7A 2O8YA 3QLFA 1IAJA 4G1WA 3OXZA 5FBOA 2VTIA 4CYIA 3QX2A 4XBUA 1IRKA 2EXMA 5DRBA 4IWDA 2RIOA 4D1ZA 4BDGA 4AG8A 2IVUA 3D83A 5FRIA 4O2ZA 3FC2A 4L8MA 3AMAA 2ZYBA 4FNYA 4RC3A 4C7TA 5K5NA 4G17A 2VWZA 3P08A 4X3FA 4L44A 2VWUA 4KRDA 4N4SA 5DN3A 2XEYA 5ETIA 5GJFA 3VS0A 4K33A 4DTKA 4ZMFA 2G2HA 5D10A 3NCZA 3R9OA 2CGWA 2WZJA 4XLVA 4C0TA 4ZXTA 5CAUA 1JQHA 3HKOA 4MNEB 4AQCA 1XH6A 4FV9A 4CZTA 3BQRA 3W8LA 4EQMA 5IF1A 1PMUA 4DFXE 5AUXA 3ALNA 3HDMA 3ZEWA 3FPQA 3KVXA 4X2KA 5BQ0A 3SHEA 3ZUTA 3F5GA 1L8TA 3EFWA 3AC5A 5M08A 2J51A 3FKNA 4FR4A 4KS8A 2PMIA 4H1JA 3V8WA 4FT0A 4IFGA 2XRWA 1QPCA 1FPUA 1P2AA 4QMQA 2BAJA 4C8BA 1W7HA 2XK9A 3ZC6A 3UQCA 3KMUA 3C51A 4KIPA 4B0GA 4QPSA 5BUEA 1Y57A 5EM8A 3HMMA 3OY1A 5LCKA 4LL0A 1O6YA 5IQEA 1PYXA 2H8HA 1CSNA 3NYOA 1V0OA 3RCDA 2Z7LA 3IGOA 4GCJA 3TZ8A 3MVMA 3UVQA 3UNKA 4KRCA 3PVBA 4AZSA 3NCGA 3DQWA 4E93A 4CFWA 1OIRA 3PXZA 4D9UA 5IEXA 2G2FA 3IO7A 3DFAA 3BLRA 4AWIA 5D41A 1JKSA 2RKUA 3FAAA 4GU6A 2B54A 2UW8A 4DA5A 3ENMA 2YAAA 4FT5A 4MAOA 4C4EA 3A8XA 4N57A 4DEGA 1OIYA 1PKGA 4WT6A 4OTDA 4C4JA 4D5KA 4DINA 5BVFA 4WRGA 3RK7A 3JVSA 3DT1A 4BVUA 2BKZA 5IEYA 1H08A 3IOKA 3WBLA 4I21A 3OOGA 4ZLYA 3JY9A 3Q32A 5AR7A 1PXNA 4X2FA 3OUKA 4MEDA 4QPAA 2IVVA 3UOHA 3PLSA 4A06A 4ASEA 4BTMA 3K2LA 4DG3E 5K4IA 3KCFA 1LUFA 3L8VA 5HLPA 2WNTA 1U59A 5J9LA 3OCBA 2E9OA 4FKLA 3QCXA 4HYIA 3BEGA 3C1XA 5TOZA 2PVMA 2ERZE 3BU6A 3CJFA 2ITWA 1YQJA 4IZAA 4IWPA 2DQ7X 4W9XA 1URWA 3IDBA 3OP5A 4QMVA 4YGAA 5BVDA 4EKLA 4FSTA 4BCJA 4F70A 4U8ZA 3VS3A 1H25A 5BPYA 4AOTA 4O21A 4FGRA 1XQZA 1HOWA 2WELA 3RINA 5LWNA 1P4FA 2WQOA 3NUSA 4D4YA 2P33A 5FTQA 2W05A 4A9UA 3UJGA 2IW6A 2YERA 3BE2A 5AV4A 3R9RA 3WE4A 4LUEA 4ACDA 2I0YA 4HVHA 4OTHA 2ZDTA 1W84A 3TL8A 4X2JA 4E6QA 4XV2A 3U51A 3FKLA 4BCIA 4E5BA 3CC6A 3MGYA 2X4FA 3GU5A 5GJGA 3A61A 4FVRA 4TWOA 4BWPA 1OKZA 3U9CA 3NPCA 3MH3A 2WOUA 3BKBA 2F7ZE 2YIWA 3FMEA 3CTQA 4FKTA 1GAGA 4R7BA 1SVHA 3UNJA 4AOJA 1FVRA 5JH6A 4RX9A 5IH4A 2WIPA 3V3VA 2QLQA 4IB3A 3QHRA 5CEPA 2XYNA 3LFNA 4A9YA 4DH3A 1ZOGA 3I79A 5M44A 2GS2A 2IVTA 5IMXA 3QD0A 4U0IA 4ZSLA 5IUIA 2YIRA 3UOLA 2VUWA 3AGLA 2YM5A 2XK4A 1H1QA 2W1DA 4IC8A 4ZTHA 3FL5A 3RGFA 3U6IA 3H4JA 4E4LA 1NXKA 4AFJA 3EWHA 3O96A 2GDOA 1MP8A 3C5IA 3RTPA 3GENA 2ERKA 2XNMA 2XM8A 4D5HA 4C35A 4EH6A 4QMNA 3UG2A 2C6OA 3QRIA 5EW9A 4FYOA 2XK3A 5E8VA 3VUMA 5BVEA 4O22A 3VRYA 1AGWA 4FSQA 3L8PA 4QYEA 5FTOA 4RIYA 1R78A 1ZWSA 4YP8A 3ZSGA 3MY5A 5GZ8A 5M4IA 3EQGA 4RWKA 5TKDA 5CF6A 1U54B 4X3JA 2WMWA 4RZWA 3ZUVA 4A9TA 1UNGA 4R8QA 1OL7A 1BI7A 5BYLA 4UEUA 3BRBA 4BDFA 5A4LA 1JSVA 3C0GA 3MFRA 4O91A 5TT7A 5KO1A 3V6RA 4PQNA 4G16A 2NRYA 2V0DA 3B2WA 3WZUA 1Z9XA 4JI9A 4XX9A 3G9LX 3I4BA 5IA0A 5B2MA 4FYNA 5AJQA 4ZS4A 2Z02A 5T6KA 4LMUA 4IAFA 2OFUA 4B9DA 4CG9A 4TW9A 5AEPA 4DGNA 3GT8A 3S4QA 2ZV9A 5IH6A 4AACA 4HNIA 4U3YA 5IMEA 2XF0A 1B39A 1W83A 3G6GA 3I7BA 3WZEA 5M09A 2C6LA 3KEXA 2WD1A 4S34A 4YZ9A 5G6VA 1H0WA 3CP9A 4O0VA 4D2SA 4IJ9A 3RKBA 1F3MC 4V05A 2W1GA 1STCE 2VWBA 2XMYA 1Q3WA 5EQEA 4ONAA 2QODA 2C5VA 5AX9A 5J5SA 3SW4A 2YLFA 2Y4IC 3A7FA 5DEYA 5AA9A 4F99A 4W4XA 3GXLA 4TTHB 2HZ4A 2RFDA 3PVGA 3ZO1A 3UC3A 4BHNA 4YSMA 3VUTA 2RL5A 3CPCA 5DR9A 5CZHA 3ANQA 3QQFA 1JLUE 3ZHPC 3EFJA 4ASZA 4UYAA 2X8EA 3NEWA 3A60A 1YDTE 2UZTA 5AP2A 3U54A 3TTJA 4I20A 5J79A 3TZ9A 2BRGA 2BAKA 5M57A 3EIDA 3RZFA 2XJ1A 4ASXA 1OECA 4I94A 4YJRA 4WUNA 4BCGA 5HNGA 4MWIA 2R3OA 4QMSA 5LMBA 3NIEA 4M8TA 3DBQA 2XBAA 4C38A 3Q52A 1Z57A 3HGKA 1ZYLA 4JX3A 4ZTSA 2ITTA 4N6ZA 4U9AA 4CFVA 4F6SA 4AE9A 5L2TA 4AZWA 4O0XA 4OBOA 3I6UA 4GT4A 4BTJA 3F3UA 3ZOSA 4F1OA 3L9LA 4JOAA 3Q04A 4K2RA 4L7SA 3OS3A 2CCHA 3CJGA 3FZRA 4R7HA 1PMNA 3AC2A 5BYYA 3A7IA 1M2RA 4Q2AA 3HUBA 2WOTA 4EOJA 4EBWA 3GNIB 3V5LA 4YZNA 2IZSA 3G0FA 3NS9A 2GNFA 4XV1A 4XBRA 4EH7A 4MXCA 4MD9E 2CJMA 3BPRA 1WBTA 2O63A 5ANJA 4PPBA 3RAWA 3R73A 2BMCA 4K77A 2X7OA 3QD2B 2Y4PA 4I92A 5CQUA 3R71A 5HVKA 4QP4A 4BCMA 3EQRA 3A2CA 4IQ6A 4F9WA 4QO9A 3Q53A 3FPMA 1OPKA 1Y91A 2KTYA 3EN5A 3HX4A 4I5PA 1J1CA 3MA3A 1OZ1A 3OZ6A 3BWJA 4J8MA 3VO3A 4CV8A 1UU3A 3D7TB 4FKOA 2PUIA 5HQ0A 2ONLA 3TIZA 2QG7A 3F3VA 3E3PA 3GQLA 3R8MA 4ZLOA 2PL0A 4FKPA 5EK7A 3DKCA 3C0HA 3DQXA 2HXLA 1Q8YA 3NUXA 3GOKA 2QI8A 3GU4A 5C27A 1W82A 4YPDA 4AN2A 2WHBA 4FC0A 3TNQB 4GK3A 2PZ5A 2C68A 3Q5IA 4FOBA 2OKRA 4FZAB 4C4FA 2RFEA 3DBEA 3EQHA 1QMZA 3C4FA 3PA3A 5DE2A 3Q4CA 5BYZA 5GINE 4EK4A 4FUYA 2YM8A 4IANA 3WF7A 3PE1A 3ORPA 3DU8A 5H8BA 2CNVA 3FLNC 4W9WA 4YZBA 1ZOHA 2XRUA 2ITOA 3CGFA 5AMNA 4QP9A 2ITQA 3BYUA 4AZEA 4EQUA 1JWHA 4C3PA 1CM8A 1CTPE 1A9UA 3UDBA 3PJ3A 2B53A 2YCFA 3Q6UA 3TT0A 2YM4A 4JJRA 3DAJA 3TM0A 5EQPA 3CGOA 5JT2A 4ZK5A 3KMWA 1PY5A 4S32A 1G3NA 4EYJA 4E6AA 4U80A 3ORIA 3WE8A 5IUHA 5EDPA 3QAME 5LXMA 2HZ0A 2XB7A 3HNGA 5D7VA 4CRLA 2J0LA 4IFCA 4USFA 5HTIA 5EQYA 2GS7A 5E90A 3I0OA 5AV1A 3POZA 3ZUUA 2V7AA 4Q9ZA 2B9HA 4AF3A 3IS5A 3F7ZA 3F5PA 3GEQA 5H3QA 2CGXA 3PTGA 3QQLA 3EJ1A 1R39A 2C5XA 5AIKA 4TPTA 4L9IA 4WSYA 4ANOA 5HG7A 2XKDA 4DTBA 4ZP5A 2W06A 3MIAA 4XLIA 4W4YA 2HZIA 5AR2A 3AD4A 3Q9WA 4WG5A 5FP6A 3L9PA 5CI7A 4DBXA 3QF9A 2O3PA 2FSOX 2X0GA 1LP4A 4O38A 4BIDA 4CFNA 2R3MA 4RLLA 3ROCA 3R1SA 4U7ZA 5GNKA 3VNTA 4YSJA 4CEGA 3WF6A 5L8LA 5E1EA 3D5XA 2A4LA 1PMEA 4GS6A 4WKQA 4QQTA 4HCVA 3HV4A 4TYGA 4IX4A 2UZBA 5DYJA 3I0QA 1YXVA 3PY3A 3ZC5A 1Q8UA 4Y46A 4V01A 2OFVA 5HVJA 4PMTA 4ACMA 3EN4A 4BC6A 2F2UA 1GY3A 3NMUF 3SDJA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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