5KHWA

Crystal structure of jak1 in complex with adp
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
287
structure length
276
Chain Sequence
PTHFEKRFLKRIRDLGEGHFGKVELCRYDPEGDNTGEQVAVKSLKHIADLKKEIEILRNLYHENIVKYKGICTENGIKLIMEFLPSGSLKEYLPKNKNKINLKQQLKYAVQICKGMDYLGSRQYVHRDLAARNVLVESEHQVKIGDFGLTKAIETDKETVKDDRDSPVFWYAPECLMQSKFYIASDVWSFGVTLHELLTYCDSDSSPMALFLKMIGPTHGQMTVTRLVNTLKEGKRLPCPPNCPDEVYQLMRKCWEFQPSNRTSFQNLIEGFEALL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Development of a high-throughput crystal structure-determination platform for JAK1 using a novel metal-chelator soaking system.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Tyrosine-protein kinase JAK1
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 90
structure length 276
sequence length 287
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2016-06-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5khwA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5khwA01
3O8PA 3U6IA 1WVWA 3D14A 3ET7A 3DQXA 4O7YA 1XKKA 4IAIA 2X81A 1NVRA 1YDTE 3Q52A 5DMZA 4AP7A 5L3AA 3QTXA 5AIKA 2P2HA 3A61A 3R8UA 3MTFA 3NYNA 3MW1A 2YAAA 2ZDUA 2BZIB 3RNIA 4BDBA 3MPAA 3EQDA 4E4MA 2JBOA 4BTJA 5EHOA 4ONAA 2BR1A 4YHTA 4RJ7A 4M69B 3VF9A 5BVNA 2XK9A 1W7HA 4QMLA 4E6QA 2I0EA 2X0GA 1XBCA 3W16A 4YJOA 2UVZA 3EH9A 4M7IA 3CEKA 1BYGA 4MXAA 3VULA 4C7TA 4QYEA 1CDKA 4H39A 1PHKA 2R0UA 3RCJA 3ZMMA 3LFEA 3T3UA 2G2HA 4DEGA 4M13A 3DTWA 5B2LA 4K9YA 5L8JA 3EL7A 4OW8A 5FTQA 3C4CA 2BHEA 3KXMA 2JGZA 3SC1A 4P4CA 4YHJA 5HI2A 4L6QA 2YM5A 3CBLA 1PYXA 4D5KA 3QYZA 3FLSA 5AV1A 2E2BA 3HGKA 3OWLA 4BKJA 5BQ0A 4OAVB 2I1MA 3JXWA 1O6LA 4RMZA 5F20A 4BTMA 2V0DA 3L8VA 5BMSA 1OPKA 5BVWA 4BBFA 2C0IA 4PNKA 5I3RA 5J9LA 2HENA 4QP9A 3CY3A 2IVSA 3BBTB 3BPRA 4L44A 4FTQA 4L42A 3VS3A 2JKQA 4C4HA 4R77A 2R3IA 3R8LA 1XH6A 3BBWA 1ZYDA 4XG4A 2XIYA 3A62A 4PWNA 4BZOA 5K3YA 4ACMA 1P14A 4R5YA 4RWIA 1PMEA 4W9XA 4XP2A 4BF2A 5AP7A 3V5JA 5HICA 5CF6A 1Z57A 2W96B 4M69A 3LXLA 4QPSA 2YDKA 2CMWA 4C02A 3C0IA 3R7EA 4C59A 4CV9A 1P4OA 3HA8A 1XR1A 5FM3A 3I5ZA 5HIBA 4IVDA 4TXCA 3OOMA 2YIYA 2Z7SA 3PP1A 2WMAA 1YHVA 2XS0A 1IASA 3E3BX 4IWQA 5EM6A 3R1SA 4B0GA 4EOIA 4EQCA 4EOMA 5AR7A 5LVPA 2CJMA 3C5UA 2J5FA 1UKHA 2P55A 5DR6A 2CKPA 1R0EA 4GUEA 5CS6A 4RJ8A 4GU9A 3QFVA 5AUVA 1LP4A 5AX3A 4ZTRA 4J7BA 2CLQA 3GOKA 1PF8A 4XMOA 3CD3A 4TT7A 4XV9A 4A9SA 4FKLA 3PZHA 4NTSA 5IEVA 3QQJA 5M57A 3WE8A 4UYAA 4XCUA 4YSMA 1XO2B 2XJ1A 3BV2A 4PDOA 4QQ5A 5AP3A 4LGHA 5C8MA 3HEGA 3DCVA 3KRWA 3UODA 5HU9A 4KKGA 4LOOA 5B0XA 2XK8A 3CGOA 4AACA 1B6CB 3HZTA 5CXHA 2X8DA 4GFOA 1OL1A 4I0TA 4ZXTA 3KREA 5KHWA 3GVUA 4L46A 2VGPA 4CZUA 3QRTA 4D1SA 3BHUA 2G01A 5H3QA 2XCHA 3DXNA 3H30A 4IZ7A 1OPLA 4TZRA 3NWWA 2IZSA 4NKAA 2C6EA 2X4FA 5JT2A 4F99A 3EQCA 4UWBA 1OB3A 4RIOA 2I7QA 3AMYA 4A9YA 3W33A 4OT6A 1HCLA 3KQ7A 1OITA 3Q9YA 4YZ9A 2UZEA 4LYNA 4LOPA 4RX9A 5KX8A 3W55A 4O6LA 2UW7A 2E9PA 4ACGA 1QPJA 3LVPA 3PA3A 4ZSLA 2VUWA 2F57A 4H3PA 3OXZA 5I9WA 4M8TA 2JFLA 3LQ5A 4CRSA 1WVXA 4FKOA 5AP6A 1MRYA 3FZSA 5HE0A 3ZEPA 3G6GA 4I1ZA 3AG9A 3ZO2A 5AIRA 2EXCX 3P7CA 4ZP5A 1PKDA 1V0PA 4N4SA 4U8ZA 3D2KA 1Q3DA 4FOCA 3ZRMA 5IA2A 1YHSA 5JFVA 3KRLA 2KULA 3Q5IA 2CPKE 2HAKA 5CNOA 5HORA 5DA3A 4TNBA 4MX9A 4QMUA 3SXFA 5AR8A 4CD0A 2VX3A 1MQBA 5DRBA 4FX3A 5A3XA 4TWPA 3VS4A 4YC3A 4O86A 3MH3A 3RALA 1H0WA 2R5TA 2CGWA 3CIKA 3GFWA 4G3EA 4IANA 3U4WA 2REIA 4J1RA 4X3JA 3PPKA 4A7CA 4IXPA 3HYHA 5ETAA 1KV1A 3Q60A 3CE3A 1JKLA 4R7HA 2C6TA 4EOJA 2UW8A 4U79A 5CQWA 4LRKA 5J5SA 1SVEA 1X8BA 2YN8A 3VWAA 2Y4IC 5ANJA 1K3AA 4OTPA 3I0QA 1YKRA 3R2BA 4PMSA 5EM8A 3A99A 2PVNA 2C6MA 5DRDA 4CNHA 1ZMVA 3JVSA 5M56A 2XIKA 5CEMA 1R1WA 4MBLA 4MTAA 2UUEA 4I5MA 3WZKA 3DXPA 3LXNA 3G0EA 4FZAB 4RLKA 1TQIA 3BYSA 3QA0A 1YXXA 5KMIA 4DYMA 3OD6X 1V0BA 4BC6A 2GHLA 3QZIA 5FXRA 2OG8A 4DH7A 3DDQA 2BTRA 4QMMA 5EYCA 5IF1A 1ZY4A 4ACDA 2NNWB 5TO8A 5IISA 1GIIA 1R0PA 2WKMA 1UA2A 2R3LA 3CS9A 4H36A 3WZJA 1QPCA 4E5AX 5TE0A 4IBMA 5FTGA 4FK3A 4LFIA 4DEIA 3UQGA 2PMLX 3DNDA 2WQOA 3ERKA 5ETFA 3EN5A 4HOKA 3NAYA 2XYUA 4F7SA 3DK7A 3V5QA 5FEEA 4WBBB 3VBVA 1FMOE 3S2PA 3NGAA 3QTRA 3LZBA 4O7ZA 3O8TA 1UV5A 2XK3A 4OTRA 5HG5A 4DTBA 5KHXA 3UDBA 4AU8A 4USFA 2PZIA 5HTIA 4HGSA 5AR3A 3SW7A 4R3PA 3UJGA 4XRLA 3ZUUA 3KRJA 4AZWA 3BKBA 3LMHA 4G5PA 3RGFA 2G9XA 4QP1A 3LAUA 2VAGA 4C4FA 5LMKC 5KMNA 2V7OA 3SVVA 4KABA 2CKOA 2GQRA 4BDJA 4KAOA 1OL6A 2VN9A 3JVRA 2PMNX 3H9RA 3LM5A 4BI1A 2Z7RA 4D4SA 3MVHA 4FSTA 5E4HA 4EI4A 2VNYA 4PRJA 2JDTA 1FVRA 4NM3A 1GAGA 3QD3A 4X2KA 4YZNA 5KZIA 4QP7A 4NIFB 3O7LB 4DITA 1GZNA 3F3VA 2HK5A 1UNHA 2CHLA 5TKDA 4CLJA 4DFUA 4DLJA 3E87A 3GCUA 5JK3A 4O2ZA 5CU2A 1KSWA 3UYSA 5EKNA 3F2NA 2ZM1A 3EMGA 3W10A 4YO4A 1PXNA 3E8EA 4C33A 4QMXA 3SXSA 2B52A 4XG9A 4J52A 4O21A 1FVTA 4FOBA 1R39A 2EVAA 3Q4UA 4RJ4A 2H8HA 2NP8A 3POZA 4RC4A 5JGDA 2QOFA 2VO3A 3GOPA 4C35A 5BVFA 2W1FA 2DQ7X 4TN6A 4BDHA 3DBEA 3KVWA 3GT8A 3NUAA 1YDRE 3C9WA 3IGOA 2BKKA 4GVAA 4U5JA 4O0UA 2VWIA 1OBDA 1OGUA 1U5QA 3EJ1A 2CCHA 3SW4A 2FSTX 3A7JA 3F5UA 1LEWA 3AXWA 3DY7A 4CQEA 3QUDA 5M4FA 2P2IA 3LCSA 3GEQA 4YJVA 3UIMA 4UZHA 4O0VA 2J51A 5J87A 2OJJA 2WHBA 1WCCA 3MN3A 3R9RA 3I81A 4LUEA 4U80A 5CEPA 5JKGA 4DE4A 3R8ZA 2Z60A 4QPAA 1JOWB 3MTLA 3PRFA 4FKQA 4C2WA 1A06A 5CAVA 2W1IA 5CX9A 2W1ZA 4DG0E 3RNYA 3C4XA 2I40A 2NRUA 3GUBA 4AA0A 3U54A 3ORTA 2YM7A 4BIDA 1VR2A 3AOXA 3PPZA 3RCDA 4ZTHA 1Y91A 5E8UA 2CKQA 3LJ1A 3KU2A 4NT4A 4KKHA 4KBAA 2OICA 4M0YA 3QQGA 4BBEA 4D1ZA 3R9OA 3WF9A 2W1HA 3KVXA 4DLIA 4UWYA 4DEHA 4AGDA 5GNKA 1ZYCA 3CXWA 3LLTA 3FY2A 3D5VA 3EFJA 3ZZWA 4CQGA 2EB2A 4DINA 4OTWA 3ZXTA 5L2TA 2C6DA 4AZEA 2O2UA 2BZKB 5CT0A 2CN8A 4APPA 1RW8A 3LXPA 5IU2A 5EG3A 4D28A 2XRWA 4EC9A 4C8BA 2C30A 5L2QA 5HG7A 3V3VA 3QKLA 3ZFMA 3WF8A 3PE1A 4QMVA 3D4QA 4WKQA 3O71A 4JVGA 2XKDA 3G5DA 4IX6A 4ZTSA 2ZOQA 3GC7A 3UVPA 3EZVA 4D9TA 3RJCA 5L6PA 5LMBA 3JS2A 2WMRA 3FMHA 4W4WA 5FP6A 2PZPA 2VTLA 3PVUA 4NH1A 4EONA 3PIYA 5HNBA 3IECA 5HCYA 2X2LA 4NK9A 3VUDA 5IH5A 2XVDA 1YXSA 4BCGA 3DK3A 3F3ZA 2ZB0A 4IE9A 4J95A 4UMPA 1V1KA 2GQGA 5HX6A 4EZ5A 3GFEA 3K5UA 3QAME 3VBWA 5EQEA 2J0JA 3NNVA 1M2PA 3V04A 4NM7A 4LM5A 5FQDC 2QR7A 3NR9A 5EYKA 4IFCA 3WF6A 3FV8A 5LWMA 3PUPA 3HRFA 4HNFA 2BRNA 4NCTA 4CSVA 4NJ3A 1K2PA 4CLIA 4FL3A 4UMRA 3KFAA 2JBPA 4FEWA 4RFMA 2RF9A 5ANKA 4F1TA 1H07A 2QOQA 2X4ZA 4YTIA 3VJNA 5EQPA 3PYYA 4OBOA 3IG7A 4YBKA 4E8AA 2P3GX 4RA4A 3NS9A 3FWQA 1YWVA 2B7AA 4K6ZA 4L01A 3PLSA 3DOGA 3QUPA 4DFYA 2ZYBA 3PWDA 3UOHA 2Y8OA 2HWPA 3DJ5A 2VTTA 3CCNA 4IX3A 4EK5A 2ONLC 4IB1A 2B9HA 2W4OA 2WTCA 3VS2A 4O0XA 4WNKA 4CKIA 2WMXA 3IK3A 4KIKB 2WAJA 4PL5A 4C4JA 4UN0C 4BR3A 3FEGA 5L2SA 3L1SA 4UY9A 3FLNC 3U4UA 3OCSA 3W1FA 4MBJA 4RJ3A 4UB7A 5BVKA 1OIYA 4JT3A 3DBQA 3L9LA 3I4BA 4YZBA 3TZ7A 3I5NA 5GIOE 3UGCA 2F7XE 1V0OA 3IW8A 4NWMA 3KMUA 1LEZA 4FKIA 4BCJA 2OU7A 3KCKA 2BMCA 3DZOA 4O7NA 1IA9A 2R7IA 3NNXA 4YJPA 2O63A 2UZBA 3LCOA 4BTFA 2QO7A 4FT0A 3SLSA 2PY3A 4GCJA 2PUPA 4NEUA 2PPQA 4RZWA 3AQVA 4PTCA 1DAWA 5EHLA 3QRJA 2OIDA 5LXMA 2R3NA 4CG9A 3BE9A 3ENMA 1XJDA 5E8YA 5FBOA 4BN1A 3AMBA 2UZVA 3Q4TA 4IIRA 4O1OA 3ZOSA 3JY9A 1OECA 3F82A 2ITTA 3PZEA 3TL8A 4EHZA 2A4LA 4WG4A 5KMJA 2X2MA 4EH7A 3RZBA 3ZTXA 2ZM4A 2F7ZE 3IOPA 4GT5A 3S3IA 4UMUA 4ZTMA 4XH6A 4FTTA 4ERKA 4KIKA 4OUCA 5A4QA 4FT5A 2H96A 3E62A 1E1VA 3F69A 4FV8A 2UZOA 4B7TA 4CMOA 5FG8A 4B4LA 1YQJA 4S31A 4TYHB 2UZLA 5FLFA 4JG8A 4ITHA 3MGYA 4KWPA 5HESA 3R21A 4ANQA 3V6RA 1FMKA 4QP8A 4R78A 5DT3A 3VIDA 2B4SB 4ENYA 3HKOA 3TI1A 1IEPA 4JQEA 4F70A 1W8CA 4GG7A 1U54B 4G3GA 3L8XA 4K77A 2E9VA 1PXPA 2W4KA 4XLIA 2FSMX 3KA0A 4F0FA 5F9EA 4DT8A 1BKXA 3FQEA 3G90X 3TZ8A 5BPYA 3TNIA 4DN5A 2VNWA 1PXJA 1OL2A 2F2UA 4G3DA 2RG5A 1ZOHA 2W5HA 5HE3A 4CT2A 2X9EA 2JIVA 4O0WA 3TUDA 1BLXA 5A4TA 2W4JA 2WO6A 4D58A 4YSJA 2ZV2A 4C3FA 3M2WA 3IS5A 5HIDA 2JDVA 4P5QA 3QCQA 4KA3A 4MBIA 4X6RA 4YC6A 5LCJA 2A2AA 3C0GA 3LJ2A 1LPUA 5B7VA 2A0CX 4IWDA 3GQIA 5EI8A 3TV4A 4Y5HA 1XH8A 3A60A 4JIAA 3DJ6A 4ARKA 1G8AA 2JEDA 3E93A 3TKUA 4ENXA 4HVIA 3QC9A 4TYHA 4XBUA 1WZYA 3FZTA 4JBOA 3GCQA 2YM6A 4LI5A 5EOLA 2YZLA 1CM8A 4HGEA 4J8MA 2OZOA 3NW7A 3GU8A 4FZ6A 4FG8A 3QRIA 2VD5A 1STCE 2WTIA 3QQLA 5HE1A 1APME 4C2VA 1U54A 4EH6A 4F6WA 2BAJA 3IW5A 4KS7A 2VWWA 2GQSA 3R2YA 4G34A 3ZS5A 3U8WA 3OEFX 4FTKA 3QWJA 4U42A 4U81A 4OLIA 4HVGA 3Q6UA 4PMMA 4O91A 2QQ7A 2O64A 4QMNA 4D2PA 3OOGA 3ZC6A 4E5WA 2VTMA 3L9NA 2WMSA 5I9UA 3SOAA 1ZOEA 2BRHA 1PY5A 3AD5A 3DS6A 2QOHA 3K5VA 5AR5A 4AF3A 4X0MA 4FYOA 3N9XA 5HVYA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3O8P A;  3U6I A;  1WVW A;  3D14 A;  3ET7 A;  3DQX A;  4O7Y A;  1XKK A;  4IAI A;  2ZFY A;  2X81 A;  1NVR A;  1YDT E;  3Q52 A;  5DMZ A;  4AP7 A;  5L3A A;  3QTX A;  5AIK A;  2P2H A;  3A61 A;  3R8U A;  3MTF A;  3NYN A;  3MW1 A;  2YAA A;  2ZDU A;  2BZI B;  3RNI A;  4BDB A;  3MPA A;  3EQD A;  4AXD A;  4E4M A;  2JBO A;  4BTJ A;  5EHO A;  4ONA A;  2BR1 A;  4YHT A;  4RJ7 A;  4M69 B;  3VF9 A;  5BVN A;  2XK9 A;  1W7H A;  4QML A;  4E6Q A;  2I0E A;  2X0G A;  1XBC A;  3W16 A;  4YJO A;  2UVZ A;  3EH9 A;  4M7I A;  3CEK A;  1BYG A;  4MXA A;  3VUL A;  4C7T A;  4QYE A;  1CDK A;  4H39 A;  1PHK A;  2R0U A;  3RCJ A;  3ZMM A;  3LFE A;  3T3U A;  2G2H A;  4DEG A;  4M13 A;  3DTW A;  5B2L A;  4K9Y A;  5L8J A;  3EL7 A;  4OW8 A;  5FTQ A;  3C4C A;  2BHE A;  3KXM A;  2JGZ A;  3SC1 A;  4P4C A;  4YHJ A;  4LDT A;  5HI2 A;  4L6Q A;  2YM5 A;  3CBL A;  1PYX A;  4D5K A;  3QYZ A;  3FLS A;  5AV1 A;  2E2B A;  3HGK A;  3OWL A;  4BKJ A;  5BQ0 A;  4OAV B;  2I1M A;  3JXW A;  1O6L A;  4RMZ A;  5F20 A;  4BTM A;  2V0D A;  3L8V A;  4FRF A; 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