5KMKA

Trka jm-kinase with 2-fluoro-{n}-[2-(4-fluorophenyl)-6-methyl-3-pyridyl]-4-(trifluoromethyl)benzamide
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
315
structure length
304
Chain Sequence
SGLQGHIIENACVHHIKRRDIVLKWELGEGAFGKVFLAECHNLLPEQDKMLVAVKALKESARQDFQREAELLTMLQHQHIVRFFGVCTEGRPLLMVFEYMRHGDLNRFLRSHGPDAKLGGEDVAPGPLGLGQLLAVASQVAAGMVYLAGLHFVHRDLATRNCLVGQGLVVKIGDFGMSRDIYSTDYYRVGGRTMLPIRWMPPESILYRKFTTESDVWSFGVVLWEIFTYGKQPWYQLSNTEAIDCITQGRELERPRACPPEVYAIMRGCWQREPQQRHSIKDVHARLQALAQAPPVYLDVLGHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Structural characterization of nonactive site, TrkA-selective kinase inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords High affinity nerve growth factor receptor
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 90
structure length 304
sequence length 315
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2016-06-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5kmkA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5kmkA01
1JKSA 3H30A 4IM3A 2W9FB 3ORIA 5J95A 4FSQA 4BZOA 3Q5IA 5JSMA 4ZSEA 1H28A 3ROYA 2PE0A 3EQGA 3E8CA 2F7ZE 3TZ7A 3QKLA 3F3VA 3GOPA 4ZS4A 5BYLA 5J7HA 3TNIA 3D5WA 4BYIA 1VJYA 1YHVA 1BKXA 3Q60A 4BHZA 3SXFA 2C6IA 2XK7A 3WIKA 4L01A 2ITQA 4Y72A 2OF4A 3VW6A 4AF3A 5LOHA 4L53A 5B2KA 2R3NA 3MI9A 2XK6A 3ALOA 3VUKA 5GNKA 4CRLA 1OMWA 5C8KA 3I81A 4XV9A 4FTTA 3ZZEA 5T6KA 4S33A 1KE7A 1R0PA 3P86A 1GZNA 2HIWA 3H9OA 4FV4A 4E4LA 3RPVA 3DTWA 5IQIA 4R6VA 3PRFA 2WQNA 3JY9A 4XH6A 4USDA 3QWJA 2WEIA 5AP1A 4DEAA 4O91A 4FT7A 4YO6A 5C4LA 3F3ZA 2GQRA 2NRYA 4HGEA 4O7NA 4X7QA 4LGGA 2YM6A 4IAAA 4DC2A 5HQ0A 1KE8A 1REKA 4H39A 5L2IA 5I5ZA 1H24A 2KULA 4EQUA 3MGYA 5HX8A 2VTAA 5JFVA 2VTPA 5IQEA 2F9GA 3R71A 3H9FA 4P7EA 2WO6A 4H3QA 4BDEA 3H10A 5HTCA 3FHRA 3ORMA 4APPA 3LFEA 4BCKA 5CSPA 3RCDA 3DNDA 3GB2A 5FGKA 3PPKA 1OL1A 4AA4A 4X3FB 3VHEA 1BUHA 3NNXA 4RFZA 5B2MA 5E90A 5JFSA 4PPCA 2GNLA 3SGCA 2OSCA 3WARA 2B0QA 5LMKA 2C5NA 5AX3A 3I7CA 3HV7A 3FQEA 3IW5A 1GAGA 4FVRA 4TTHB 1K3AA 2CGWA 4IDVA 4QD6A 4ZJVA 4EWQA 4JG6A 4LMUA 5DN3A 3T3VA 3A7JA 5M4CA 3HZTA 4AGUA 3I1AA 5AV1A 4LL0A 4DAWA 4Y5HA 2RFNA 4O82A 4M0ZA 3SOCA 3HEGA 4JXFA 3R9DA 4DG2E 1YXUA 3N4VA 5E1EA 2CCIA 3PZHA 4EQCA 3OCSA 4W4YA 5HD7A 4PUZA 2OJJA 5AV4A 2R0UA 4AFEA 2Q83A 3L8XA 2W06A 2WMAA 3SXSA 2IZUA 3PA5A 5C03A 2W1IA 4CG9A 1VYWA 5EK7A 5IQCA 2NNWB 3TUCA 1W83A 4MBLA 2OJ9A 4DE4A 2BRNA 3QTXA 4QMVA 4RMZA 3UPZA 4JAIA 1FINA 3C5UA 3TZMA 2IPXA 5ETFA 3PJ2A 3VS5A 3OD6X 4TYHB 3QQLA 4GFOA 2I0EA 3V8TA 4DLIA 3CKXA 5LVNA 4L45A 1B6CB 3R7IA 2XEYA 1J7LA 1HOWA 4O6LA 1MQBA 4KIKB 4F64A 4F0FA 2QOKA 3ZYAA 3NUNA 2JITA 2BAQA 3NNUA 5K5NA 3BE9A 4B8LA 3E93A 4FV2A 4QMPA 5BPYA 3SDJA 2PSQA 3R2BA 4QMOA 4ZP5A 1NXKA 4PDYA 4J52A 4AN9A 1IAHA 3JVRA 4ID7A 1O9UA 3O7LD 2QI8A 4QYYA 2R9SA 3RK9A 3LJ2A 3GU6A 2GHGA 4FKLA 4QTCA 4D5HA 4GG5A 4O38A 4IB1A 3PVUA 4YC6A 4AZFA 3WI6A 4AT4A 2OH0E 3LFNA 3ZMMA 2RGPA 3P78A 2R3LA 3DA6A 4PMPA 3PXZA 1H07A 2ZAZA 1IG1A 5CU3A 3C1XA 4FTOA 1YQJA 2FB8A 3HDNA 3UTOA 2UW4A 2RL5A 3ZO3A 1G5SA 4EKKA 4USEA 4XEYA 4G5PA 2CMWA 4LRJA 2VGPA 4O0RA 3V5WA 2WGJA 2QURA 2XK4A 4E4NA 2VTQA 4PQNA 3MYGA 2P4IA 3LJ0A 4ANOA 4IFGA 5HTIA 2GHMA 4EUUA 4PTCA 3NAYA 4AW2A 4HCUA 1GY3A 3Q9XA 3QC9A 3KCFA 4QQCA 2PUPA 4E7WA 5HLPA 2XKEA 2LAVA 4JQ8A 3UMXA 3W8LA 1WBNA 5BX0A 5HNIX 2PTKA 3KRXA 3VS7A 5CF6A 3LFFA 4RX8A 3I60A 3KRJA 5KKRC 4KIQA 4BTJA 3UE4A 3UQCA 4NM7A 3FPQA 4M15A 2YITA 4BKZA 3E7OA 5BVNA 5E8UA 2PVMA 2VV9A 4ITHA 3KXZA 2OICA 3EN5A 1H1WA 2UZBA 3MV5A 4I93A 5EDQA 5FDXA 3VVHA 4BCPA 4DCEA 4FL2A 4D2RA 3NW5A 3D2KA 4GS6A 4ITIA 3N4TA 3HMMA 2XS0A 2YIRA 1QPCA 4F08A 3JPVA 4U44A 5JH6A 2R3HA 4JQEA 4YJNA 4I6FA 2B4SB 4K9YA 1R1WA 4D28A 1Y57A 5HIEA 5CI7A 2WEVA 3WILA 3WZUA 3ACJA 4NCTC 4U79A 4DHFA 4F4PA 1H00A 3R7VA 4IANA 3EQHA 4BHNA 5AIRA 2IZRA 4M13A 2F2UA 4XJ0A 3UG1A 2RFDA 1R78A 3TKHA 2VX0A 5CU4A 5H8BA 5IISA 2QKRA 1WBOA 2XKCA 5ANDA 3D5VA 2YDIA 2XYNA 3R21A 5DEWA 4BWXA 2J0JA 4O0TA 4WRSA 3UODA 3QCXA 4ZTNA 3LQ5A 1FPUA 1KV2A 4FMQA 3L1SA 2GS7A 4MBIA 5AAEA 5KO1A 5KUPA 5AR3A 3WIGA 4IACA 4UEUA 4NM0A 4WKQA 3PLAE 3ANRA 3GNIB 3UQGA 2IG7A 3BLRA 4IZ7A 2ERZE 3MWUA 3MY0A 2OBJA 5JQ8A 3SVVA 3HP5A 4CKJA 5IQBA 5FXSA 4DTAA 5ETCA 4C59A 3MFRA 5J5SA 3G0EA 4LYNA 2ZM3A 1GIIA 2VWXA 4FSRA 4I5PA 3FSFA 3UIXA 3M2WA 3BYVA 5BYZA 2QOBA 5JGBA 2W1ZA 1UNHA 3NLBA 4G6NA 3RJCA 5LMBA 4JT3A 4LGHA 1JNKA 4FGBA 4RX5A 3UG2A 3NWWA 4EZ3A 4FTNA 4BICA 4GK3A 5C8NA 2XBJA 2XH5A 3F2AA 2ITNA 4YHTA 1OPJA 3BU3A 1H1SA 1F3MC 3AC1A 4ZZNA 1PMVA 4TRLA 3GBZA 4FNZA 2VN9A 3VJNA 1MUOA 5IDNA 5EYMA 3QQJA 4J1RA 1ZWSA 2BRMA 3FLSA 3HDMA 4G3EA 4G17A 3SLSA 5L2SA 4KKEA 2QOOA 3CPBA 3AMBA 5GZAA 3GFEA 5TE0A 4D2WA 5HU9A 3TV4A 2OK1A 3QTIA 2YFXA 2ZV8A 4KAOA 3Q52A 3R1NA 4ASZA 3U51A 5HOAA 3LMHA 1CKJA 4FGRA 4GKHA 5E8YA 3UDBA 2C3KA 3CBLA 3QRJA 4I6BA 3LFSA 5T3QA 3EN7A 3GXLA 3S95A 5HBJA 4XMOA 1XBCA 5FTGA 3EH9A 1XH9A 5FEEA 4RLKA 4FG9A 1M7QA 1KUTA 3QXOA 4I6QA 1P4OA 3C4EA 1DI8A 2XBAA 4YTHA 3MESA 4RC3A 3DKGA 3ROCA 5K9IA 1QPDA 4DBXA 2XZSA 3RHKA 4M3QA 4OW8A 1ZMWA 4NIFA 1UNLA 4A9TA 5A4QA 5I3RA 1M52A 5EDPA 1W84A 1YRPA 4B6LA 1BL7A 3FXXA 5EW3A 2B9JA 2BTRA 2ZV2A 4BTFA 4OTDA 4HVSA 2W4JA 2J5FA 2BZJA 2YM8A 3Q4TA 5AUXA 3EYGA 3TM0A 3VS0A 5E92A 1ZXEA 3BLHA 2YIYA 2V5QA 5JGDA 2B7AA 4RBLA 4FV8A 4XRJA 1PKGA 5DGZA 3OROA 3PIZA 2VTSA 1I09A 2CKEA 1JVPP 1PXKA 2YJSA 5DT3A 1YHWA 3DZQA 4JDKA 4GV1A 5HBHA 4NTTA 1OL7A 2XNOA 4IEBA 4FODA 3QZIA 5CF8A 4RRVA 5FD2A 4FOBA 4FIEA 3C7QA 1GOLA 5AADA 2C6MA 3GC0A 3VF9A 3AGMA 2BDFA 2VTJA 3LW0A 2AC3A 2CGVA 5A46A 4XV3A 4KNBA 3NYOA 4C34A 1J1CA 2W17A 2QG5A 1OB3A 2X8EA 4BDHA 5JMSA 1PXOA 3FZRA 4E6QA 3F69A 4HVHA 1IA9A 4BYJA 2XNMA 1SZMA 2ITUA 2VO6A 4I5CA 4JDHA 2I7QA 4ASDA 3HA6A 2UZEA 3FI8A 3CD3A 2RFSA 3RNYA 3CEKA 3I7BA 4AA0A 1P2AA 5F20A 2JGZA 5AM7A 4CSVA 4IWDA 3DXQA 4YZ9A 4EQMA 4W4XA 2VNWA 4EUTA 3LFAA 4KUJA 2C3IB 2E2BA 3CQEA 4MNFA 3KK9A 4KINA 4Z3VA 2UW7A 2A0CX 4M68A 3FY0A 4RZWA 5AUVA 4OAVB 4QMXA 5L8LA 2QG7A 1W7HA 4ACDA 3QKMA 4DGLC 3DAEA 3P1AA 2QQ7A 5FLFA 3BIZA 1ZLTA 4Y83A 5IA0A 1P14A 1XR1A 4A7CA 2RSVA 4BDJA 4EH5A 3BEGA 3FLNC 3R8PA 4I23A 1UV5A 3ZEWA 4TWCA 4JLCA 4X3FC 5H8GA 2R3GA 4CV9A 2O65A 4NFNA 3PE2A 4YZCA 2BUJA 2BFYA 3ULIA 4BDGA 4D1ZA 4GMYA 3ZC5A 3VN9A 4DTKA 1GIJA 1LEZA 4YBJA 4N70A 4HW7A 2OZAB 3EN9A 2PVJA 3V01A 1RDQE 2Y8OA 3VHKA 3MDYA 2BRHA 1XKKA 2B9FA 2R0IA 2UVYA 3AT3A 3E8EA 3GQLA 4V05A 3W10A 3ZDUA 3ZH8A 4DG0E 4NW5A 2HAKA 2XRUA 4JX3A 4NYEA 2UZNA 1H4LA 4BC6A 3QFVA 3FYKX 1GZKA 1IASA 3ORNA 4E5BA 3EFJA 3HUBA 3KMWA 3FKNA 5DBXA 5JRSA 1YVJA 2GS6A 2BILB 3Q2MA 3UO4A 3ZOSA 3D94A 4UZDA 1Q8ZA 3FI4A 4DG3E 3QZFA 1U5QA 3C5IA 2BVAA 3FL5A 4IH8A 1QPEA 3VAPA 3ZDIA 2XM8A 3DT1A 3JYAA 3PG3A 5M4IA 2C0OA 2QOCA 4FSUA 5DH3A 5AP2A 2EU9A 4Z9LA 4C35A 4B4LA 2VAGA 4HYHA 4DFYA 4UX9A 4UXLA 4YZNA 1YOLA 4WO5A 4O7ZA 4CMTA 4XP3A 4AOJA 1JWHA 3EJ1A 3UVPA 3FUPA 3VS1A 2ZDUA 3PJ1A 4ZMEA 4O0UA 4CFVA 3IDBA 5KHWA 1QPJA 4I0TA 4NK9A 4A06A 5K5XA 4F1TA 3EL8A 4OUCA 3Q5ZA 4EI4A 4GVJA 1FVRA 3ZRLA 4DFBA 2CLQA 3S3IA 4MBJA 3QL8A 4QPSA 3GC7A 5KMNA 3GU7A 5BVKA 1FBNA 2AYPA 2RG5A 1BMKA 1BX6A 3Q96A 3UNZA 3KCKA 5CU2A 4TKSA 3EQDA 2EVAA 2RF9A 3R7GA 4FT5A 5HCZA 4EH4A 3BHYA 4HVDA 2QONA 1IA8A 4MAOA 1PXPA 1DS5A 3CSVA 4DFXE 3R6XA 3HVCA 4JQ7A 2BPMA 2A19B 4PP9A 2W0JA 2C68A 4XLVA 4ZS0A 1OL6A 3VIDA 4C4FA 4DH8A 4EH3A 1G8SA 4PMMA 4RJ3A 3OBJA 3UP7A 3MSSA 4LOOA 3GC9A 3W2RA 2PVKA 4CCBA 3BLQA 1H0VA 3R2YA 1YXXA 1ATPE 1I44A 4QP3A 4HYIA 2EWAA 5CAPA 1JPAA 4OTQA 5M4UA 4GKIA 2WB8A 2V55A 2UZUE 2Y6OA 3PXYA 4F7SA 2Y0AA 1OUYA 4BB4A 3EKNA 4FKOA 3UMWA 3IDPA 2WMVA 4AOIA 4CMOA 4EONA 5IQHA 5LWMA 3R9HA 4KD1A 2O0UA 4G3GA 5FTOA 2YACA 1HCLA 3V5LA 1Q62A 3OXIA 1R0EA 3OP5A 5EM5A 4C2VA 4ENYA 4EBWA 4KBKA 3R9RA 1ND4A 5BVDA 5KBRA 1PHKA 2C69A 2XUUA 3OT8A 4LI5A 5KMJA 4YURA 3GU5A 2ETKA 1OZ1A 3MB6A 4CXAA 5M55A 3WOWA 3MH0A 4AZSA 5C4KA 4F9WA 2YAAA 3H9RA 4O81A 4FUXA 2RFEA 4UV0A 4C3FA 2BDJA 2EB3A 3ORXA 1QMZA 4X2FA 4M8TA 4TW9A 5LARA 3LXPA 2IW9A 5FWKK 3DQWA 4EK6A 3WYYA 4X6QC 4HNFA 4O0VA 3R0TA 4FKGA 4PTEA 4FT3A 4X21A 4IX4A 4I22A 4R3PA 4OTGA 4UYAA 4BCOA 4EYMA 4U0IA 1V0PA 4PL5A 3TG1A 3DTCA 2WTKB 2IZSA 3AC8A 2C6TA 2VO3A 3AG9A 1A06A 4M0YA 5HVJA 4BGHA 2C1BA 4RIYA 4L3JA 5C9CA 4DITA 4E26A 4UMTA 3HMOA 1UWHA 4C0TA 4D58A 3BGQA 4E5AX 3U55A 3FDNA 3NYVA 1OL5A 3IQ7A 4F0IA 5I4NA 4ZXTA 4AW0A 2ITPA 1PXNA 4L3LA 1FVTA 3KF7A 4E73A 3O96A 3F88A 5JFXA 4OT5A 2ITYA 4C61A 2OJFE 1J3HA 4K8AA 2XJ1A 2C4GA 3T3UA 5A4EA 2OIBA 3ZLXA 2VWUA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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