5KZ0A

Structure of human anaplastic lymphoma kinase in complex with 2-[(1r)-1-{[2-amino-5-(1,3-dimethyl-1h-pyrazol-4-yl)pyridin-3-yl]oxy}ethyl]-4-fluoro-n,n-dimethylbenzamide
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
309
structure length
293
Chain Sequence
NPNYCFAGKTSSISDLKEVPRKNITLIRGLGHGAFGEVYEGQVPLQVAVKTLPEVCSEQDELDFLMEALIISKFNHQNIVRCIGVSLQSLPRFILLELMAGGDLKSFLRETRPRPSQPSSLAMLDLLHVARDIACGCQYLEENHFIHRDIAARNCLLTCPGPGRVAKIGDFGMARDIGGCAMLPVKWMPPEAFMEGIFTSKTDTWSFGVLLWEIFSLGYMPYPSKSNQEVLEFVTSGGRMDPPKNCPGPVYRIMTQCWQHQPEDRPNFAIILERIEYCTQDPDVINTALPIEY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Discovery of (10R)-7-amino-12-fluoro-2,10,16-trimethyl-15-oxo-10,15,16,17-tetrahydro-2H-8,4-(metheno)pyrazolo[4,3-h][2,5,11]-benzoxadiazacyclotetradecine-3-carbonitrile (PF-06463922), a macrocyclic inhibitor of anaplastic lymphoma kinase (ALK) and c-ros oncogene 1 (ROS1) with preclinical brain exposure and broad-spectrum potency against ALK-resista
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords ALK tyrosine kinase receptor
total genus 89
structure length 293
sequence length 309
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2016-07-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5kz0A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5kz0A01
1STCE 4AA4A 2I1MA 4O21A 3HNGA 3LFCA 4O1PA 4O83A 2Y6OA 5TKDA 4JT3A 2CHLA 3FZPA 2BAKA 2E9VA 3RK7A 3OG7A 4NKSA 5CF8A 5FLFA 4D4SA 1XBBA 3HAMA 3KK8A 4FTCA 4OBPA 5BVOA 1T45A 3QCSA 3TKHA 1VYZA 5IA4A 2H6DA 1S9IA 4HNFA 2BRNA 4FT3A 4OBQA 4XJ0A 1V1KA 3NUXA 5KO1A 5JN2A 2YCQA 5A4QA 4YURA 4PP9A 3VAPA 3BV3A 1UU7A 3Q9YA 3DCVA 2G1TA 3FKOA 4PF4A 3ZXZA 4I5PA 5HU9A 2W0JA 4O86A 3SRVB 3RWPA 4KINA 2XEZA 4NM0A 3D7TB 4U79A 4F9AA 4MCVA 3WOWA 1WAKA 1YXTA 2QOKA 3E8EA 4PMMA 4YJPA 2R3NA 3REPA 3V8WA 4ASDA 3FZSA 1BX6A 3GUBA 3QRUA 4DH7A 4ONAA 5M55A 3D2KA 3RPSA 3QL8A 4RC3A 3OP5A 5JZJA 3R73A 1PW2A 2W96B 3HUBA 4KIKA 3D5VA 3EQDA 2BKZA 3OBJA 4MHAA 5D41A 1JAMA 4O1OA 5J9LA 3AT3A 4TYHA 2YDKA 4I5HA 2J9MA 1URCA 2BDFA 4C4IA 1JWHA 3ATSA 4YJSA 5IUGA 4YBKA 5M53A 2VTPA 4FIFA 4O81A 1XQZA 4E93A 4FKGA 3WYXA 5HX8A 3AQVA 2OG8A 4D0XA 4L00A 3KL8A 1J7LA 3HRFA 2YDJA 1WFCA 4BCNA 1V0PA 1A48A 2Q0NA 3EZVA 3K3JA 2C5YA 4DGGA 4FTLA 4L53A 2YIYA 3UO5A 3PXFA 1K9AA 3LQ3A 3CR0A 3V51A 4EK6A 5C8NA 2BALA 3F88A 2XCKA 3G2FA 1NY3A 2J0KA 3LHJA 4UYNA 3RPOA 1UNGA 5DGZA 4H39A 3LCKA 5LMBA 3LLAA 4R5YA 3PIZA 4BWPA 4EKKA 3ZLYA 1Q3DA 3I1AA 1GOLA 3CS9A 4C37A 3AG9A 2BRBA 2FA2A 2XCHA 2F49A 2XP2A 5CNNA 3V04A 2VTNA 5AP2A 5J1WA 4I6FA 1PMEA 4FKJA 4L44A 5FXRA 2EWAA 2UVYA 5CT0A 3QFVA 4UWBA 4FKRA 4B99A 3BV2A 5DT4A 1ATPE 4C02A 3VBXA 5M06A 3TNHA 3IW7A 5JT2A 5CU0A 3Q52A 4QMVA 4R7IA 3VS4A 4QMQA 4FV8A 5IQEA 4X3FA 3COHA 5F4NA 3ODZX 2PZYA 5B2KA 2W9ZB 4QQ5A 1WVXA 4IM2A 5GHVA 3VUKA 2YA9A 3E7VA 2ITPA 4DHFA 1KOBA 3FXZA 4AFEA 4F63A 5HIBA 2I0VA 2YCSA 2R7IA 5IA5A 5FXSA 3C4EA 4K77A 2IZTA 3ORMA 1YWRA 4APPA 4ZTQA 3DDPA 4ZEGA 2C0TA 5M57A 3QX2A 4Z7HA 2X39A 1OECA 2X9EA 4CZYB 2I0HA 5GZ9A 2HYYA 4DG0E 1OGUA 2ZAZA 3R22A 3ZYAA 5HEZA 3DXPA 3UQCA 3TUCA 4FV5A 5M4CA 1KE5A 1PXIA 3WZUA 4F64A 4C58A 3L8VA 5BMSA 1ZYDA 5HLWA 4I0SA 3QQLA 5FP6A 3MH2A 1ZXEA 3WZKA 1G5SA 1OIUA 4MTAA 4J8NA 5E8UA 2BCJA 3HYHA 1Y6AA 5HLPA 4FZAB 4RFMA 3FSKA 1Z9XA 2IN6A 2WTVA 3GCVA 3VUTA 3AC2A 1M2RA 3R7YA 4E26A 4ZLYA 1H01A 2OKRA 2OU7A 5E1SA 5BVWA 3L8PA 4E6DA 2R4BA 2WTJA 4JJRA 5L8LA 4D2TA 2W06A 1P2AA 5ANOA 5IQDA 5HVKA 3HV3A 3P78A 3GEQA 5DR9A 4XLVA 2FSMX 4K33A 4EH4A 4IWQA 1OL1A 5E8WA 3A8XA 4BDHA 3E88A 3MDYA 4WT6A 1XBCA 2P33A 3BHVA 2X6EA 3GC7A 4BCIA 4TL0A 3D9VA 5CAVA 4O7VA 3Q04A 1SVGA 4QP6A 2JDRA 2Z7QA 3DXNA 5BUEA 3VC4A 4QYYA 3PIYA 1R39A 2BPMA 3TNQB 1WBWA 4FTUA 4ZTSA 2UW4A 3FLZA 4G34A 3ULIA 4RX8A 4RZWA 3W8LA 3RJCA 2HENA 2RGPA 2B9IA 3A4OX 3W10A 4TRLA 3MH0A 4E6AA 3PSDA 3QQKA 5KMJA 4YTCA 4GH2A 1OKZA 3GGFA 4LGGA 5FBOA 1OL6A 2OH4A 3DTWA 3FPMA 3JVRA 4BICA 1RDQE 2OJFE 2X6DA 3F2NA 3JY0A 3OY3A 1MQBA 4BWXA 5ICPA 4XX9A 5FEQA 4ZS4A 4CGAA 2O0UA 3F3ZA 4V0GA 1OBDA 2GQGA 3LFSA 4WSYA 5E8TA 2Z7SA 4FKWA 2E9PA 2VNWA 4KABA 3DKGA 4O6LA 2JDOA 4YNEA 3KRWA 5ANKA 3WF6A 5TF9A 5E9EA 3K5UA 2Z7LA 2EU9A 4PPAA 1E1XA 1CDKA 4R3RA 4XBUA 4RIWA 4YJOA 2W4KA 4HGEA 5CENA 5EM8A 3KU2A 4JX7A 3OCTA 4FG9A 3RINA 3HMMA 5LVPA 3QWJA 5AUYA 1G8SA 4YC3A 5JH6A 5FGKA 3NUPA 4IZYA 4DITA 3EN7A 3HA6A 2R2PA 5FD2A 2PVKA 1O6YA 4IX6A 4O7YA 4F4PA 5IQFA 5CXZA 2QODA 3EFWA 1OUYA 3ORXA 1DAYA 2XJ1A 3C4WA 4ID7A 3THBA 1DI9A 2GFSA 3VJNA 3ZH8A 2VZ6A 5KMNA 4M67A 5DFPA 2A2AA 3A2CA 5LVOA 3EKNA 3CBLA 4S2ZA 4XOYA 3V6SA 3EQGA 4F6WA 3NW7A 4U80A 3DOGA 2VWWA 4MEDA 5TO8A 3Q2MA 2ZM4A 4J97A 4UMPA 4N6YA 2HZNA 3OROA 3FYJX 5EYCA 4EI4A 3P7BA 4GJ2A 4CFUA 3PVGA 2A27A 3MVLA 4RJ3A 3ZMMA 3RMFA 4BYIA 1Q62A 2B0QA 4LOOA 5FQDC 2ZDUA 4OAUC 3LAUA 2B1PA 3RZFA 1JKKA 2YWVA 4I5CA 5F1ZA 3RK5A 4LGDA 4N0SA 3MPTA 4MWIA 1ZRZA 3RAIA 2R3RA 3UJGA 2V0DA 2PZRA 2VX1A 4KBAA 3ZO2A 5HVJA 2GNGA 3UOLA 2XF0A 3Q9XA 2J4ZA 1YOJA 1KE7A 2WELA 5B2LA 4NUSA 1FPUA 3ZM9A 4CT1A 2IO6A 4J96A 3L9LA 4M69A 5HICA 2ZV7A 3DBCA 2HIWA 3IOPA 2WMAA 4TW9A 1Q8YA 2XK9A 4ZK5A 3MH1A 3ENHA 3ZUUA 4IZAA 1Q4LA 2VO3A 4I24A 5AX3A 5CEKA 3CKWA 3GCPA 3I6WA 3R1NA 5DT3A 5LCJA 4FE2A 4S34A 5CALA 3DTCA 2W4OA 2QOQA 1ZOGA 3O96A 5D7AA 3UDBA 4C4FA 4GMYA 2QG5A 3U51A 3D2IA 4ASEA 2A0CX 2VO0A 3Q5ZA 2W1ZA 2FGIA 4RZVA 4Z7GA 5KHWA 2ITVA 3FWQA 3LPBA 2GS6A 3NYOA 3SDJA 3ZUTA 2ZM1A 3AD6A 3UP2A 4L8MA 4DGOA 3F5XA 4N6ZA 3TV4A 2XBAA 4BZOA 2VTAA 3O7LD 2YAKA 3ALNA 3QD4A 4JQ7A 4JR3A 3UIBA 3EQBA 3AT2A 1L8TA 2BDJA 3DBDA 5C1QB 1O9UA 4R77A 4OGRA 5AUVA 4DEEA 4DGMA 3QUPA 5KMKA 4C62A 2I40A 4EHZA 3EKKA 2X2KA 1BMKA 2A19B 1U54A 1XH7A 3MB6A 3W32A 4BCJA 3QGWA 4TPTA 2J0IA 5M56A 5CF5A 5T3QA 3SKCA 3FQSA 4KRCA 4EK3A 4KIKB 4HW7A 2C1AA 3MFRA 5FM3A 3MBLA 2GU8A 3MVMA 4O7RA 4K8AA 3P7CA 3DFCB 4U81A 5D7VA 3RKBA 4YPDA 2VO6A 2E9UA 4TYHB 2E9OA 4RX5A 3QXPA 4BCGA 4AF3A 5D9HA 4ANLA 3R28A 2UW7A 4XH6A 4D1SA 4AT4A 2OXXA 4RLLA 1R3CA 2JAMA 1OL7A 5DRBA 4BCKA 4ERKA 4E20A 5DRDA 3BKBA 3HKOA 3LMGA 2J50A 3OD6X 3FXXA 4AW2A 1RJBA 1W83A 3CGOA 4XOZA 4ANBA 4PDSA 4F6SA 1YW2A 1BYGA 1J3HA 5C9CA 3QUDA 3HECA 3U6IA 3HRBA 1H4LA 4QMOA 1JKSA 3F9NA 5AR3A 4ANOA 4A7CA 1SVEA 5IDNA 5AP1A 2LAVA 2PMOX 2P55A 2PVHA 4G5JA 4D9UA 4IWPA 3BGQA 4Q5EA 4L46A 3PY1A 3W2CA 3GT8A 4U40A 3UODA 1PYXA 4O0VA 1PRYA 3CQWA 4JQEA 4Q9SA 3OF0A 3ZHPC 1LR4A 3LOKA 2W1EA 3A7FA 2ZJWA 3FY2A 4NTTA 3ZXTA 3EN5A 3OMVA 4AN2A 5AA9A 1VEBA 4HZRA 1MP8A 4OTQA 1PMNA 1S9JA 2JDSA 3I6UA 1NVQA 2R9SA 3E64A 4O0SA 1OITA 4RVMA 2VO7A 4CV9A 3JPVA 3QA8A 4UMUA 1PHKA 4CG8A 4HPTE 1BI7A 3PXRA 4YZNA 1O6LA 3C0IA 3S2PA 5IQBA 2OW3A 2QD9A 2CKPA 2W9FB 1MRUA 4X3FB 4OUCA 3QKKA 3DPKA 4JDJA 5HZNA 2CCIA 2WXVA 1OIYA 2PY3A 3W2OA 4DN5A 4FTAA 2XKFA 4FT5A 5EDRA 3M11A 2YEXA 4KKEA 3FI4A 5AP7A 2PUPA 4F99A 4JAJA 3IW6A 4J98A 3C4CA 3P9JA 5FUTA 3GP0A 1CTPE 2QR8A 3PSCA 1G3NA 2C6EA 3PY0A 3MSSA 1HOWA 4PDPA 2JKOA 3BU5A 2YAAA 4WA9A 1IA9A 3BQRA 5T6KA 2B7AA 3IDPA 4P7EA 4RFZA 3CSVA 1NVRA 1UKHA 2BIYA 4B4LA 4RIYA 3LMHA 3R8VA 4CT2A 3RNYA 1UA2A 1YDSE 3ZLWA 5A4TA 2CNVA 2QONA 3I79A 1MUOA 2WMQA 2P2HA 3ZO1A 2WIPA 2YIWA 4L45A 3Q4TA 3LZBA 5LMKA 2QKRA 2QC6A 4WRGA 4F9CA 3NX8A 3OC1A 3OXTA 4FKVA 2QO9A 3HMPA 3FLNC 1LEWA 2WMRA 5AFVA 4FV4A 2CDZA 3PA4A 1YHSA 4I22A 4JI9A 5F9EA 1ND4A 3WF8A 2XK8A 1YI6A 5LVNA 2WD1A 3R63A 5EG3A 3IGGA 5K0KA 2HY81 1WVYA 3DKOA 4U9AA 2J7TA 3JXWA 3NSZA 4PY1A 2RFEA 4ZTHA 5CANA 4M97A 3BQCA 4UALA 3W2SA 3G5DA 4FKPA 4G6LA 3BHTA 5AM6A 4ZSAA 4MKCA 4I20A 4ENXA 1ZY4A 4A9UA 3PP1A 1YXSA 4IWDA 2XNNA 4KIQA 4BBEA 5CU3A 4M7IA 4DEAA 1APME 1ZMWA 3KMWA 4ASZA 3E62A 4U7ZA 4EH2A 1WZYA 3O8UA 2OJIA 3RAWA 3LIJA 4OTHA 1XKKA 3G51A 1W8CA 1PXNA 1H1PA 5HE0A 4G6OA 4ITJA 5CQWA 4FTJA 3TJCA 5CAOA 2R3OA 3MS9A 3MVJA 3BYSA 4EHGA 4UMRA 3CXWA 3C0HA 3DBQA 3OXZA 4ZIMA 3PJ3A 4UZHA 3LVPA 4IVCA 4EUTA 4CFVA 1H8FA 5EYDA 2EXEA 3DZQA 4LYNA 1P5EA 4DGNA 4ZY4A 1DI8A 2REIA 4V0GB 3QZGA 4CLJA 4TNDA 4XG9A 3TACA 5HE1A 1JSUA 3DLZA 4U5JA 4U3YA 3QCYA 3ZC6A 1ZYJA 4YTIA 5L2WA 1A9UA 3EQRA 3PTGA 4MXCA 4QMTA 4F08A 4KAOA 4GIHA 4RIWB 3WE4A 2ITQA 3EQIA 3PVUA 4WUAA 2PZIA 2GNIA 3BRBA 4AGUA 1K3AA 3RBWA 3ETAA 4IDVA 4KIPA 2QR7A 1KOAA 3U54A 3CY3A 4CEGA 2JAVA 5HG8A 4C61A 4FZDB 3NVKI 2HWPA 1ZZ2A 3SV0A 5J95A 2VTIA 5HGIA 3H4JA 1P14A 3BHHA 3PWYA 5EHOA 4FTOA 4XRJA 5BVEA 2QHMA 4YSJA 4UMQA 1P4OA 3IDBA 4YZDA 1XH4A 3BX5A 5HTBA 2VD5A 4K18A 4ITHA 3KRJA 2UW6A 4WOVA 4FUYA 2B52A 3KVWA 5CS6A 3SQQA 3TCPA 5E90A 2BILB 2W4JA 1ZOHA 2C5VA 2QG7A 5EYKA 4EH3A 1FGIA 5KMOA 1R0PA 2GQRA 3AGLA 1PJKA 4F6UA 1HCLA 4QYGA 3R2BA 2JFLA 2R3MA 3ET7A 3UC4A 4EH5A 4I6BA 4AZTA 3MY1A 5HBEA 5HBJA 2JD5A 1M2PA 1ZZLA 3NNVA 4GSBA 5CAPA 2NP8A 1PY5A 2HK5A 4DF3A 5HO7A 3LW0A 3TKIA 3ROCA 2JDTA 3V5QA 2KULA 2J0LA 4AOTA 3O71A 4IAAA 4RA5A 5HCXA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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