5L2IA

The x-ray co-crystal structure of human cdk6 and palbociclib.
Total Genus 68
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
68
sequence length
292
structure length
260
Chain Sequence
DQQYECVAEIGEGAYGKVFKARDLKNGGRFVALKRVRPLSTIREVAVLRHLETFEHPNVVRLFDVCTKLTLVFEHVDQDLTTYLDKVPEPGVPTETIKDMMFQLLRGLDFLHSHRVVHRDLKPQNILVTSSGQIKLADFGLVTLWYRAPEVLLQSSYATPVDLWSVGCIFAEMFRRKPLFRGSSDVDQLGKILDVIGLPGEEDWPRDVALPRQAFKSAQPIEKFVTDIDELGKDLLLKCLTFNPAKRISAYSALSHPYFQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Spectrum and Degree of CDK Drug Interactions Predicts Clinical Performance.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Cyclin-dependent kinase 6
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 68
structure length 260
sequence length 292
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2016-08-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5l2iA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5l2iA01
5CNOA 4NFMA 3W2SA 4ASEA 4EOIA 3EQCA 3ZRKA 2KULA 4XMOA 3D14A 1MUOA 3Q04A 5HVJA 4PRJA 1XH8A 5AP5A 5LMKC 3VW6A 3P86A 3EOCA 5ANOA 5CVGA 4U9AA 4IVAA 3DTWA 4B4LA 3EFWA 3A4PA 3FQEA 4L6QA 5J79A 4O7WA 4IBMA 4NT4A 1XH6A 3CTQA 3D2KA 3QYWA 3CJGA 4AGDA 4FYNA 3LCSA 5HHWA 4IVDA 3OBGA 5ACBC 3RPRA 3VJNA 4F63A 3GC9A 3FXXA 1LEWA 3JY9A 3F7WA 1CDKA 3MESA 4H1MA 3ZU7A 4FKUA 1UNLA 2ITXA 3CGFA 3FLQA 1JKSA 2XKCA 4BCGA 4I6FA 3DKGA 4U7ZA 3IPHA 3LFEA 4FSQA 3Q5IA 3R22A 3DT1A 4XOZA 4YJSA 4BDIA 5DWRA 4KIQA 3RALA 3AC1A 4DFLA 3SKCA 1L3RE 3V8WA 4I4FA 4PTCA 3TACA 3LQ5A 1ZZLA 4XJ0A 1GZKA 2F9GA 2VTOA 4QD6A 5AFVA 1I09A 4RIYA 1ZARA 3DLSA 3EYHA 4QP3A 2XJ1A 2BZIB 4FL2A 3OT3A 4JR7A 4ZY4A 5CASA 5LXMA 4DFYA 4LRKA 4FE2A 4ZZMA 4HZRA 3NYOA 4NIFB 4WA9A 1QMZA 4G6OA 4MBJA 4R8QA 4ITIA 2VTRA 3RWPA 2BCJA 3NUAA 3ZM9A 4ZZNA 2PULA 3E3PA 2HOGA 4UALA 2WTVA 1RQQA 4RJ8A 3GC8A 4CRLA 1PXLA 2BRNA 5FXRA 4OTHA 4U3YA 4FBXA 1BLXA 3PRIA 4TYHB 4IIRA 3TV7A 2WEIA 3M11A 2VTPA 1ZMUA 3HUCA 4H36A 2P0CA 5CAVA 4QTCA 4QOXA 5I3OA 4O7SA 3ZSGA 5IH5A 4PQNA 3FMEA 1BI8A 4RX5A 4M0ZA 3QAME 5A4TA 4ASZA 3DDPA 2BDWA 4O0RA 3KRJA 2OGVA 4L67A 4DFUA 3F3WA 3AXWA 5L4QA 3I5ZA 3KRLA 1G8AA 4LOOA 4AAAA 4DYMA 3UBDA 3C5UA 4FIEA 4MD7E 2UW0A 4PY1A 4XHKB 3M1SA 4A4OA 2B0QA 4FMQA 4TN6A 2J7TA 2XM9A 3C50A 4FI1A 1XWSA 2OFVA 3MH2A 4J95A 4BI1A 5BNJA 3C0HA 5EH0A 3DGKA 3NWWA 2QO2A 4F9AA 3IDPA 1NA7A 4R1VA 4RLLA 4XH6A 1Z5MA 4G9RA 4EYJA 4DEDA 3TZ8A 4UXLA 1JKLA 5FTQA 4G3GA 3F2AA 5K5NA 2YCFA 2CGWA 2XZSA 3FUPA 5BVKA 3GCQA 4C35A 1V1KA 2ITNA 1JNKA 1Q8TA 4RSSA 4XEYA 2CN5A 2PVRA 4A4XA 2REIA 4J71A 4K6ZA 3VBWA 5HICA 3SW4A 2CCHA 5HO7A 3AC2A 3W2PA 2BFXA 2CNVA 2GHMA 2WO6A 1M2RA 5K3YA 2W1DA 1TQIA 3MIYA 2YFXA 2QC6A 5BMSA 4Z16A 4MWHA 2IVTA 4Y85A 4ZLOA 4ZTNA 3VUGA 4DH3A 1JSUA 4YHTA 4WHZA 4A06A 4JLCA 3F61A 3KVWA 4X3JA 4ASDA 5LVNA 4MK0A 3GNIB 4K77A 2W5AA 3MVLA 4TL0A 4P5ZA 3PIXA 5EI2A 4PWNA 4L68A 2XIYA 1OGUA 5CX9A 4BC6A 5EM6A 4DFNA 3GU8A 3W1FA 3QWKA 5AAGA 3O17A 5L6OA 2UW3A 4QMNA 3VBTA 3PVUA 2EB3A 3DAJA 3H3CA 3ORKA 3S3IA 3ZLYA 2GMXA 4EH4A 3D5XA 4OTFA 2PUUA 4UYAA 4F6UA 5HE1A 4G3DA 2JIIA 3HVCA 4Q2AA 3ZUVA 4ZTSA 5J9LA 4ALUA 2I0HA 2YWVA 3QQHA 1PXIA 1WBWA 3LJ0A 4IAAA 4NJDA 4BCFA 4QTEA 1KV1A 1XH9A 3E93A 3U9NA 4D58A 3NUNA 2XJ0A 4I6QA 2X4FA 2XJ2A 4RWJA 5IEXA 2QURA 4C4EA 4AN9A 3RZBA 5CALA 2NPQA 5IA4A 3E8DA 3QTZA 1P2AA 3RNIA 2H34A 3QCXA 3N4UA 3DAKA 4CYJA 3A7IA 3OEZA 4ZMEA 1UA2A 2CSNA 2HZ4A 5DT3A 4EWHA 4U6RA 2HZNA 4NIFA 5DBXA 4EK6A 4O1PA 4IXPA 4ZZOA 2XK8A 4QNYA 5E4HA 4XG2A 4C59A 5HD4A 3SC1A 3ATTA 3C4FA 4DGOA 1CSNA 3QD3A 4CFWA 2FO0A 4C34A 3SV0A 2XBAA 2J0JA 3NEWA 4OBOA 3V3VA 4PNKA 4UMUA 3KEXA 4C0TA 3F9NA 3SOAA 4YC3A 5IQDA 4I3ZA 4E8AA 4MXYA 4RX8A 4FVPA 3SX9A 1PHKA 4TYHA 3R2BA 1YDSE 3W8QA 3ACJA 4F0IA 4IM3A 2GDOA 2X9EA 2X2LA 3QQLA 4RLKA 4CYIA 2JEDA 4EJ7A 2J4ZA 4FIJA 3WF8A 5JQ5A 1OIQA 4PUZA 1H4LA 2UW9A 4CFUA 5AR4A 3I1AA 4PTEA 3HV4A 2BVAA 2OZOA 2J90A 1RDQE 3FBVA 4M67A 3AOXA 5KUPA 4J7BA 3UVRA 4FG7A 1R39A 3MY0A 4FIFA 1YW2A 2WMBA 1XBBA 3F5UA 4FTIA 1H07A 5F4NA 3S2PA 4JX3A 3VHEA 4E4MA 3LKMA 2JKKA 4YLLA 4K1BA 5LWMA 2RSVA 1OL6A 4C4FA 2JITA 2B7AA 1DAWA 3E8EA 2DWBA 5HU3A 3LW0A 3ACKA 3PXRA 1K9AA 3D83A 4X21A 4FKGA 4O7YA 3EFJA 2C3IB 5FWKK 5GNKA 3Q2JA 1URCA 2X7GA 3L8PA 4YJTA 2C5VA 4XG4A 3ZLWA 4C62A 2BAKA 1YKRA 3EQHA 4QP7A 4Y46A 4YPDA 1P14A 3C51A 1YOJA 3OP5A 3U6IA 4U81A 5DIAA 2UW8A 3AC5A 3IW4A 4C4HA 5DMZA 2OLCA 3TZ9A 4KIPA 4FSNA 4RZWA 3DA6A 2BRHA 3PG3A 5HNGA 4XV9A 5ICPA 3U54A 4YTIA 4AP7A 4AWIA 4TNDA 5C03A 1JOWB 3BHYA 3EHAA 4AZSA 5A46A 1H1RA 5IQEA 4RVKA 3IW7A 2RIOA 3PPJA 3PZHA 4L43A 3L8XA 4ANSA 4OUCA 5ETIA 1F0QA 3NIZA 4G3FA 2PHKA 4IJPA 4IH8A 3VS2A 1IEPA 4CD0A 4YSJA 4CKJA 4C37A 4CQGA 4BDJA 1EH4A 2VRXA 3QL8A 2WELA 5IQCA 2UVXA 3IQ7A 1H1SA 5CT7A 3R9HA 1YVJA 4PX6A 1QPJA 4BDFA 3LLTA 4IZ5A 4K18A 1H01A 3LFAA 1O6YA 4GU6A 5LMAA 4YMJA 3WF6A 3H0ZA 5IU2A 2E9UA 2BRMA 5CXHA 5CNNA 4EI4A 2R9SA 3AMAA 2CDZA 4I5HA 3ZO4A 3R21A 4W4YA 3VQUA 2Y7JA 3VBXA 3BYMA 4KB8A 4MXAA 3F5PA 4NM3A 3PYYA 5FGKA 2HENA 4RJ3A 2B1PA 2YM5A 5AR8A 3K54A 3QTWA 2A4LA 4O7LA 3OFMA 5IDNA 4RZVA 1WZYA 3G51A 2SRCA 2C30A 4AE6A 4D5HA 5IA2A 2X0GA 5JGDA 2ITTA 4CFMA 3CC6A 4FKVA 3WZEA 3F7ZA 2VTLA 2DS1A 3K5UA 2R3GA 2WMQA 3BYSA 3R6XA 4L00A 4FSYA 1QPDA 5CS6A 4FKOA 4JQEA 3RJCA 3QKLA 5CI7A 4WG4A 1M2PA 3RP9A 4RIWB 3F3UA 5DE2A 4P4CA 3RMFA 3U4UA 2ONLC 2HXLA 3MB6A 4FR4A 4QP8A 3V5JA 3COHA 4PDPA 1FGIA 4N6YA 4YGAA 2GU8A 2ZAZA 4KINA 5DT0A 2PMNX 4GEOA 4EHVA 3DK6A 3QTRA 2IVUA 3GQLA 5DG5A 3P7CA 3EQGA 3PE2A 2WEVA 2WMWA 3OXIA 3FY0A 3GCUA 2JDSA 2FSMX 4W4VA 4XG6A 5CF5A 1PMEA 4FTJA 5GZAA 1PXKA 3DQXA 3FDNA 2ETKA 3CSVA 3E62A 2PYWA 3SG8A 3HECA 2HELA 5HIDA 5A4EA 3TTIA 1KUTA 3VULA 2ONLA 3KK9A 4YJQA 4Y8DA 4D4RA 4DTAA 3VS4A 3OOMA 5AP2A 3R7VA 5FTGA 1YWNA 5ETAA 4RWLA 1O6LA 4GV1A 4JDJA 3MPAA 5FEEA 1V0OA 2ZOQA 5EKOA 1JSTA 1KE9A 4GVAA 3R8MA 2PVKA 3NYXA 3ORZA 3O51A 4BCQA 3KFAA 2F49A 3KCKA 1S9JA 2PMLX 1FQ1B 3NS9A 2XBJA 5HLPA 5LVLA 1JPAA 2XYUA 2I0YA 3Q4UA 1BL6A 4N4SA 3WILA 4IX3A 3R9NA 4G16A 5AA9A 2JFLA 2W4KA 2WZJA 3Q52A 5C8NA 4CMOA 2R3MA 5EYCA 4BKYA 3SW7A 1U5RA 2XS0A 3OCSA 2WPAA 4D2TA 4B8LA 5CQWA 4CKRA 3IK3A 2XNMA 1XO2B 4ZTQA 1WBTA 1IR3A 4EOKA 1GZ8A 2XNGA 4WO5A 1Q8YA 3LJ2A 3BGQA 3TT0A 2VTQA 3QHWA 4KSPA 3UNZA 3LFQA 2VX1A 4AT5A 5CSHA 3CQWA 3KU2A 4EZ5A 4A7CA 1IASA 5AR7A 3SG9A 3IONA 1Y6AA 4FT9A 2W4JA 5E1SA 5G1XA 2CGVA 2GNJA 3LE6A 3EL7A 3PVGA 2IN6A 2XUUA 2XNEA 2JKQA 3LXLA 5EHLA 4EC9A 4IANA 1ND4A 2X6EA 2X8DA 2KTYA 4BCHA 2ZV2A 3NMUF 2WQBA 3FI2A 4WBBB 2BTSA 1ZY4A 2JLDA 5HGIA 1IA8A 2CHLA 2GCDA 4GW8A 3BWFA 4FZAB 4L52A 1WBPA 1IG1A 3QTXA 1PMUA 2XKDA 4O1OA 2XK7A 2YDJA 3V6RA 3FI4A 4FKSA 5B2MA 5HO8A 4G3CA 4AQCA 3MH3A 3OBJA 4P7EA 5HBHA 2Z7RA 4YLJA 5M51A 4LGHA 3BYVA 3EN7A 3OMVA 3QCQA 4KA3A 4LL5A 3UPXA 3ANRA 1YDRE 5BVWA 4Z7GA 4IE9A 3ZRLA 3ORLA 5L3AA 3QTIA 2UW5A 4GK3A 3NYNA 4USFA 1VR2A 3DBFA 5BVOA 4FTQA 2V7OA 2RFSA 2F7ZE 2OIBA 1KOBA 4MXOA 3NNUA 2YACA 3ET7A 5CU6A 3TXOA 4AX8A 5IISA 3A7GA 3O7LD 4YZCA 5AUYA 3UC3A 4AT4A 4FV8A 4RIWA 2XIKA 3JR1A 4QTAA 4JX7A 2NRYA 2XIXA 5HI2A 3CTJA 2C47A 3B8RA 3OXTA 4GH2A 4JBOA 2BKZA 2IO6A 4S30A 2WMSA 3LXPA 5JGBA 5HLWA 1ZY5A 2R7IA 5EDPA 1APME 2C5XA 4A4LA 2YZLA 4QQTA 1HCLA 3A99A 3EKKA 3S4QA 2PTKA 1P4OA 4C2WA 5EQEA 3MS9A 3VUMA 3A8XA 3TN8A 2Q0NA 3ZTXA 2PVNA 3HRBA 4E6AA 4AFJA 2C0TA 4GIIA 3LFCA 2C5YA 3MFTA 3DZOA 2QI8A 4M84A 1FOTA 3UG1A 2RFEA 3LFNA 2PUPA 4DGLC 5H2UA 3HUBA 3RK5A 2WMTA 5A54A 5HZNA 2ETRA 3C4WA 2VWUA 2YDKA 4FV3A 5HOAA 3A2CA 2OIDA 2WAJA 3DB8A 1AQ1A 3PLSA 4IWQA 4MVFA 3IW6A 4J53A 4TT7A 4R5YA 4BCIA 3DS6A 2XEYA 4ZSGA 1W7HA 4ENYA 2A0CX 5L2SA 4ZSLA 4BHNA 2GFSA 4RRVA 5IQAA 3CCNA 4FV6A 1SMHA 2JFMA 1G5SA 4LGGA 5IKWA 4DBXA 4O2ZA 1PXJA 4QTDA 5JH6A 2VO0A 4IQ6A 3MVHA 1Q41A 4HZSA 4DFXE 1PMNA 3FSKA 4W4XA 3O71A 4OTQA 3KXMA 2OK1A 3R8PA 4YZNA 3VHKA 3ZDIA 3FMNA 2JGZA 3A60A 3WF7A 1XQZA 2XNBA 4RC3A 3VO3A 1V0PA 4IB0A 3HV7A 4S32A 4YJOA 3PXYA 3RAIA 3DBEA 4KS8A 2B52A 3Q6WA 3VNTA 4TYEA 5D1JA 5HVYA 4I1ZA 1YWVA 4NTTA 4O0WA 5CVFA 4DFBA 4CXAA 4BI0A 4CFXA 4M69B 3QC4A 4GU9A 3FZOA 4EH5A 4M68A 4AA5A 5JFSA 1J1CA 4DEBA 5HX8A 2XK3A 5TOZA 2CGUA 4FODA 1ZOHA 5HE3A 5L8LA 3QCYA 4JG8A 4BI2A 4FV2A 3UO6A 4X6RA 2PE2A 2YAAA 3OWJA 5KKRB 3KQ7A 1PYXA 3QGWA 4DLIA 3VRYA 4ALWA 3NW5A 5DLSA 5BX0A 2XNPA 5AV0A 2VTSA 4V0GB 1OL7A 3KY2A 4ANLA 4MD9E 4B0GA 2JDRA 3DBCA 3E8CA 4AW1A 4OTPA 4FEVA 3RTPA 3N51A 2FSOX 3BYOA 5EG3A 4QMOA 5B0XA 4BWPA 4CV9A 3NYVA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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