5L8KA

Aurora-a kinase domain in complex with vnar-d01 (crystal form 2)
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
267
structure length
266
Chain Sequence
RQWALEDFEIGRPLGKGKFGNVYLAREKQSKFILALKVLFKAQLEKAGVEHQLRREVEIQSHLRHPNILRLYGYFHDATRVYLILEYAPLGTVYRELQKLSKFDEQRTATYITELANALSYCHSKRVIHRDIKPENLLLGSAGELKIADFGWSVHAPSSRRTLAGTLDYLPPEMIEGRMHDEKVDLWSLGVLCYEFLVGKPPFEANTYQETYKRISRVEFTFPDFVTEGARDLISRLLKHNPSQRPMLREVLEHPWITANSSKPSN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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connected with : NaN
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Allosteric inhibition of Aurora-A kinase by a synthetic vNAR domain.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Aurora kinase A
total genus 89
structure length 266
sequence length 267
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2016-06-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5l8kA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5l8kA01
4V0GA 5KE0A 4BCJA 2UW7A 3R9HA 4FTKA 5CF8A 5KX8A 3ZZWA 3EN6A 2FGIA 5L2WA 3R9NA 3W8QA 3QYWA 3PA3A 4EH8A 5IEYA 4EOKA 4C61A 3UMXA 3PRIA 4KKGA 4RWIA 3CJFA 3GU7A 1U46A 1ZMUA 2V7OA 2YIXA 5I9YA 4F6UA 3QRJA 5T3QA 4YTCA 4QTCA 4FBXA 5C27A 4D1XA 4I5CA 2ZV8A 4DEAA 4FR4A 1GIJA 4FC0A 1YI4A 3FHIA 4LGHA 5CZIA 5CI7A 4FTTA 2OIBA 2IVSA 4QYYA 2V0DA 4U42A 5DR2A 4BDKA 4YUQA 3SW7A 5J8IA 3ZH8A 2YLFA 4CKIA 5CSPA 4OAUC 3TL8A 2IN6A 2WMQA 4BCGA 2VTAA 5ETAA 5K4IA 5AIKA 4E4XA 4EHZA 4UYNA 1YHSA 3OT3A 3PFQA 4I0RA 5C8MA 3KMMA 4XV2A 2HZ4A 3A2CA 3TNIA 1IAJA 3FI4A 1UVRA 3AMBA 3QTIA 3UZTA 4KNBA 4FIHA 2XYNA 4L9IA 1YWRA 3MFSA 3LJ0A 2VTLA 2IW8A 2F7EE 5BX0A 2A4LA 2X4ZA 3NUPA 4XUFA 4EOMA 3LQ8A 1OIQA 3VW8A 3ZLWA 3MY1A 2NO3A 2PVYA 3QCSA 4LV5A 2X7OA 3H10A 4ALUA 2I40A 1ZZLA 3BPRA 3UMWA 2CCHA 3OP5A 3CP9A 3V5WA 3FEGA 4J99A 1Q3WA 4QMOA 4AA0A 4XMOA 3SXSA 3NRMA 3DB8A 4DH5A 4DCAA 3KULB 2V55A 3OY3A 2C5OA 4V0GB 5C8KA 3LFQA 3C0IA 3V01A 1ZOGA 4JQ7A 3OCTA 1W0XC 4FKGA 4BWPA 4C36A 4CCUA 2X9EA 3DFCB 3ZEWA 5ICPA 4QNYA 3OXIA 2GNIA 4XP0A 4E5BA 1SVHA 1FMOE 4PTGA 4ZZMA 2W17A 3WILA 1PJKA 4G2FA 1OIYA 5IMXA 2OXDA 4CZYB 3SQQA 5DEWA 5DIAA 1CDKA 4I94A 4Z7GA 1GJOA 4G16A 3P5KA 3QBNA 5HZNA 2C3JA 3OCBA 3PWDA 3HV6A 4KIOA 4WIHA 4MXXA 5DNRA 2B9FA 3GFWA 3SG8A 3AC1A 4RJ3A 4ZTLA 4FV8A 2VO7A 4KSPA 4PWNA 4E5WA 5DRDA 3UE4A 4H3BA 3FUPA 5EKOA 3EFJA 3BYMA 3U9CA 3DS6A 2IZTA 1G5SA 4IZ7A 1SVEA 2O0UA 4M14A 4IADA 4CRSA 3QZIA 4C4JA 4R3PA 4EJNA 5E8ZA 3RPOA 4D9TA 4BB4A 4EHVA 3QZHA 4C4GA 2ITQA 4JAIA 4F7LA 1PHKA 2YIWA 1MQ4A 3FYJX 4JS8A 3FMJA 3R30A 3PSCA 3ORIA 4QMXA 5CEIA 3RINA 3OCGA 3PDTA 4EONA 3SGCA 3PJ3A 4DGGA 3NYNA 5BVOA 3ODYX 3TZ7A 2PMLX 2F2CB 2Y8OA 1W98A 1OKWA 4XG8A 4FE2A 3C51A 2CGWA 4PPAA 5EDPA 1ZYCA 5FP6A 4V04A 4AOJA 3VUKA 2CKEA 5FRIA 4O0YA 2OXXA 3ZTXA 5CAUA 3OCSA 3SLSA 4R3CA 1V1KA 3QKKA 4M69B 3TUBA 3VULA 1KE8A 4EH4A 1HCLA 2ZDUA 3G0FA 2QKRA 3D2KA 5GIPE 4FV6A 1IA8A 3DNDA 5J1WA 4OBOA 1YOJA 2QCSA 4OGRA 3EQIA 1BUHA 2ETRA 3NR9A 1TKIA 5FM2A 4A9SA 1JOWB 1M2PA 3QD3A 1SVGA 4IWDA 5AV4A 3C0HA 5JRSA 2WQBA 3OXZA 2CNVA 2HWOA 4AP7A 5EYMA 4J97A 5A46A 4O6LA 2RIOA 3DA6A 3D7ZA 3U87A 2Z8CA 4PV0A 5EHOA 4DHFA 3QWKA 4LGDA 2JDVA 2OFVA 4J71A 2X0GA 3PJ8A 3PZHA 4ZP5A 5LARA 4PP7A 2QO9A 4TW9A 4R7IA 3WIGA 2QURA 3BU3A 3G2FA 3KCKA 4ANMA 3H3CA 3GU4A 2VTHA 3ZDIA 5GNKA 3MIYA 4FIEA 1E1VA 1SNUA 3AXWA 4C34A 4OTQA 3WYYA 5JZJA 2W9ZB 3KEXA 4L3PA 5LWNA 4FKQA 4NJ3A 4BI0A 3C0GA 3ZBXA 3FLQA 1W8CA 3KRWA 2O5KA 3PLSA 4FTCA 3GCQA 5FEQA 3KXHA 3W2OA 5CAPA 5EG3A 4BDFA 4U41A 4UN0C 4EK6A 2I0HA 3Q6WA 4BHZA 3QA8A 2OJGA 2ZAZA 5EHYA 4TL0A 3LW0A 3FE3A 2DS1A 3MY0A 4D28A 4JBPA 4ACDA 5IA4A 3P7BA 4RWJA 1NXKA 5JGAA 1Y8YA 4R5SA 3CC6A 3FC2A 2ITNA 4U8ZA 1GOLA 4PL5A 3Q32A 3EN4A 5DA3A 4D9UA 2BHEA 3KMWA 3SW4A 3BLHA 4OUCA 2RL5A 2W5AA 5CEQA 3NNUA 1P4OA 3TKHA 2IVTA 5C01A 3VJNA 4PDSA 3RPYA 3BE9A 4K8AA 3BLQA 4H36A 3TNWA 4GYGA 2Y9QA 1FBNA 5AFVA 2HELA 2PVNA 4YLJA 1YDSE 3ORKA 3RZBA 1JKSA 4TY1A 2KTYA 1KOBA 4EYJA 2JDTA 4ZY5A 5JKGA 3TM0A 3HL7A 4NW5A 4IBMA 4FSMA 5KKRB 2G2IA 4BC6A 2B52A 4MBIA 3R22A 5DHJA 3R9DA 1DS5A 4JDJA 3CR0A 5CXZA 2YLEA 3LFCA 3IOKA 2JLDA 2Q0BA 2CCIA 2HY0A 1ZLTA 3GQLA 3NMUF 5CLPA 4CRLA 1U59A 3P1AA 3SRVA 4EH5A 4QMLA 2OJJA 5KMKA 3P7CA 4USDA 4I6QA 3TJDA 3IKAA 3OBGA 3CTJA 3EL8A 4MEDA 3AQVA 3EJ1A 3FPMA 2W1CA 4LUDA 4MXZA 5A6NA 3HGKA 3D5VA 4ZK5A 3CTQA 3JY0A 3BU5A 3UNZA 4HCTA 3NX8A 4C02A 1K3AA 2IVVA 3O23A 4HJOA 2GHGA 4KIKB 5HO7A 3E62A 1GNGA 2XZSA 4TZRA 1KE7A 4JVGA 4HYUA 3JR1A 2XK3A 3L8PA 3Q5IA 3P0MA 3RHXA 4YMJA 3IO7A 1U4DA 2EVAA 4AW5A 5EI6A 4FT0A 5EYDA 1QPDA 3MIAA 5KBQA 4CMTA 4O7WA 2XKDA 5BUJA 3UOJA 4EZ7A 4O96A 4LOQA 4PMMA 3LFFA 4HGTA 1GZKA 4ZSLA 3TUDA 3D5WA 2VTPA 2DQ7X 4FVQA 2PE2A 4QPMA 2BAQA 4KABA 4R1VA 5CT0A 2QC6A 4CGAA 4JLCA 5L6OA 3BQRA 2WTIA 3E7OA 3F3VA 3HV7A 3MPMA 3QGYA 4TWOA 3V3VA 3AD6A 4KS8A 3JVRA 5AR8A 5AA9A 3K5UA 5EYKA 3I81A 2F49A 5HICA 3MVHA 4U81A 4MWIA 1Y8GA 3W33A 1S9JA 3UVRA 4ACHA 2Z7RA 2NP8A 4KKHA 3ORMA 4CZTA 4QOXA 4Y73A 2XKFA 3FZTA 5HLWA 3DKOA 5JGDA 2ZMCA 4UX9A 3HUCA 4BZOA 1VEBA 3C4ZA 1BKXA 5JMSA 3S00A 4F4PA 5DMZA 2WTDA 5D12A 4F65A 4DLIA 3L8VA 4PF4A 3DJ7A 4RX9A 4F0GA 4M0ZA 2PUPA 1L3RE 2WMWA 4QYEA 4BKZA 4FTUA 4G34A 2BDWA 5TR6A 4B99A 4PPCA 4FNYA 5IUHA 4I20A 4BF2A 1G8AA 5I3OA 3EQBA 5IQBA 3ZO1A 4BTJA 1OMWA 2QOQA 5AP4A 2WU6A 4USFA 3MA6A 2QOIA 4XG6A 4YHFA 3GC8A 2IO6A 4UZHA 3RNYA 3LCKA 4NL0A 4YC6A 3G90X 4EH6A 3AD4A 2F7ZE 3MH2A 4CV8A 2HZNA 3W2SA 1QPEA 3HECA 3Q5ZA 3ZLSA 3R00A 3EN9A 3Q52A 3DPKA 4TYEA 2GQRA 4DFYA 2SRCA 4G3DA 3UG2A 3V51A 4FV4A 3HUBA 2VTRA 3QZFA 3PG1A 4FI1A 1OECA 5ETFA 4IW0A 3VUGA 4NW6A 3VW6A 4CXAA 4MYGA 4B0GA 5IF1A 4LQMA 1OL5A 3HKOA 3RGFA 2Y4IC 4JOAA 2R3HA 1P5EA 4IVAA 4IEBA 1U5QA 1Q8TA 2Z7SA 3NUUA 4ZJIA 4F0IA 4I92A 2WQOA 4QT1A 1J7LA 4IB1A 4RWKA 4UEUA 3LJ2A 4A07A 3GFEA 3UP7A 1QCFA 4WD5A 4GG5A 3UOKA 1Q62A 2REIA 2J50A 5AAFA 4ALWA 1PYEA 2NNWB 4Q9ZA 3FMKA 4X3FA 1X8BA 3I7CA 4I23A 4EOIA 5EH0A 3HA6A 2IJMA 3UPZA 2YERA 3LCTA 5L6WL 4Z3VA 5AR3A 3BBWA 1REJA 3JVSA 3SAYA 3NIEA 3UVPA 3VN9A 2OKRA 3UQGA 3LM5A 4O7YA 2XNPA 4CEGA 3SOCA 4PTCA 3JUHA 2JBPA 5LVOA 1H8FA 3GEQA 3P86A 4XV3A 4F7NA 2VTMA 3DCVA 3EWHA 4UWYA 4X3FC 5DI1A 4PPBA 1UKHA 3KF7A 4MTAA 5HCXA 5JSMA 4O0XA 3ZM4A 5EK7A 2UW3A 3FMHA 2OU7A 5I9UA 4UMRA 4RFZA 5EHLA 2WGJA 3Q96A 3UYTA 2WMBA 4U3ZA 2VX1A 4GU6A 4NEUA 1OITA 1Q3DA 2RFSA 4DE4A 3NDMA 4QP1A 2BZHB 3ORNA 3RP9A 2FYSA 4V05A 2XEYA 3CPBA 2Y4IB 4FK3A 1OI9A 3ORPA 3N4UA 4K18A 4RVMA 4X2NA 2BAJA 4HYSA 5D10A 3SDJA 4CFUA 2VUWA 5BMMA 2WMXA 5JH6A 2VO0A 3R9RA 3VUMA 5B2MA 3QTRA 5CS6A 2UW9A 5H2UA 4YO6A 5LVLA 3COIA 1UWHA 3PSDA 4GK2A 4YURA 2X8IA 5HD7A 2C6TA 4RA4A 1IASA 3O8UA 4AN9A 5BMSA 4EK3A 3KREA 2WIHA 4FEWA 2H8HA 4RJ6A 3ZMMA 2EXEA 4N57A 2FSTX 4DCEA 1U54B 3DY7A 2XNMA 4XCUA 2C6IA 2P2HA 5H8GA 4HCUA 4ZLYA 3E8NA 4O0VA 4JR7A 4ZTNA 4YSMA 3UOHA 4C33A 2XRUA 3LFSA 4FSTA 3C4WA 4S34A 1CSNA 5E8YA 4BN1A 3DBEA 5HORA 3F61A 3UTOA 5J5TA 3NUSA 4JAJA 4MVFA 5BVKA 5IZFA 2XVDA 3LLTA 3QRIA 1PXOA 5M56A 5HX8A 4B7TA 2UZNA 1LPUA 5LMAA 3BHVA 4LRJA 2VWBA 2WOUA 4KD1A 1KWPA 2B9HA 4EQCA 4GKHA 3DAEA 4KBCA 5HEZA 4R3RA 3I0QA 3RWQA 4M12A 3AC8A 4D2TA 3ZM9A 3QRKA 5L3AA 2J5FA 3I60A 4OR5A 5AP2A 4PDYA 4CMUA 2HXQA 5A4TA 1JLUE 4F6WA 4UYAA 1OVEA 4FSNA 3FPQA 3E8DA 4LOPA 3VUHA 4WNMA 4APCA 2YIRA 3C1XA 4C2WA 2DYLA 4D58A 4ZZNA 4KA3A 4NT4A 4YJPA 4EL9A 2WKMA 2WZJA 4TKSA 4F9BA 5A3XA 2OZAA 3RAWA 4QO9A 2QOBA 3F3ZA 5JEBA 4ZTQA 4GVJA 4NK9A 2FO0A 2ITWA 4MNEA 3DDPA 3UZRA 2HENA 1JAMA 2QKWB 3HAMA 2PVMA 5HBEA 4E73A 4I5HA 3R7VA 1KE5A 1FPUA 3DJ6A 4YJSA 3HVCA 1ZOEA 4AUAA 5KBRA 5I4NA 4ANNA 3LXPA 4C37A 1Q97A 2JFMA 3R8MA 1M52A 3CEKA 2XIXA 4S2ZA 5EI2A 4DTKA 5L2SA 4S31A 3V5QA 3S0OA 4AOTA 4J52A 4BCOA 3OOGA 2Y4PA 3UPXA 5CAOA 3R1SA 4ONAA 3WZEA 2Q0NA 2W4KA 3A60A 3TIYA 4K11A 4U0IA 2XEZA 3E3PA 3RI1A 4C59A 2RFDA 2CDZA 2CLXA 3EQRA 1FMKA 3FLZA 2R3NA 3O17A 5CALA 3CSVA 2PZPA 1H24A 4YZBA 5HE0A 1YWVA 3U6IA 2YDJA 3NUNA 5C4KA 2ZJWA 4IAAA 4BWXA 4ITHA 2X8EA 2YM5A 2C1AA 2A27A 2CHLA 4O84A 3FZRA 2FSOX 4P7EA 5E8XA 3MFRA 2C6LA 2XIZA 3AGLA 2GNJA 3BYVA 3ZSGA 4BIDA 5J5SA 1JSTA 3D14A 5AP0A 5HBHA 3ZRKA 5CAQA 5CF4A 3OG7A 2XCKA 5HG5A 5HOAA 3ANQA 3EIDA 2WU7A 4BVUA 3DBCA 4NWMA 2BRNA 3W32A 2XBAA 2FUMA 3LXKA 5DE2A 5HCZA 4QMPA 2VX3A 1S9IA 3A8XA 5H9BA 3GU5A 2DWBA 1Q8ZA 3SOAA 2J51A 3VHKA 4PMSA 4BDEA 2ZVAA 3FC1X 3R73A 4YPSA 4HW7A 4B4LA 3Q2JA 3TDVA 2X6EA 4WSYA 2P3GX 4TPTA 3VC4A 4O7SA 3OROA 3DXPA 3OF0A 2QONA 4L46A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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