5A14A

Human cdk2 with type ii inhibitor
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
296
structure length
284
Chain Sequence
MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRLDTEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Type II Inhibitors Targeting Cdk2.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords CYCLIN-DEPENDENT KINASE 2
total genus 81
structure length 284
sequence length 296
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2015-04-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5a14A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5a14A01
3OROA 4O82A 3NUAA 3LFCA 5CEQA 4Y5HA 3UIBA 5ETAA 3DCVA 3NW7A 4GL9A 4H3BA 2BALA 1ZOGA 4JX7A 4S34A 5LWNA 1OMWA 2WTIA 5ANOA 5L6WL 1Q8TA 3D7TB 3VS4A 4LYNA 3R7VA 3OXIA 4BIDA 4F7NA 3SLSA 4RX5A 4V05A 3DK3A 1P4OA 3G15A 5JT2A 3MIAA 3MJ1A 3BBWA 4CFMA 4PWNA 3ZEWA 3VW8A 1OIYA 2XK4A 3AOXA 3CBLA 2VTQA 3FY0A 4MQ2A 3F6XA 5IA1A 5I9ZA 4O1OA 3KC3A 4J53A 4USEA 2XIZA 4FSYA 5EYDA 2UZVA 3HMOA 2O8YA 4J97A 3PJCA 4BDEA 4E8AA 5EI2A 1PHKA 3TNHA 2OZAB 3AT4A 4I5HA 5TOZA 3QTSA 4CSVA 4ASZA 1PYXA 3OC1A 4KA3A 3EN4A 4FV6A 5BMMA 2OXXA 3NNWA 4AA0A 5IA4A 1K3AA 4C7TA 5J1WA 1YWNA 2R7IA 3PZEA 4FVPA 4X3FA 3V51A 2OWBA 2X6EA 4BC6A 5JEBA 2BHHA 2X7FA 3QQKA 3UYTA 4E5BA 3NPCA 3SG9A 2XJ0A 3TJCA 4NJDA 4YZBA 3VW6A 2IVVA 1OM1A 2VTNA 4MBLA 1YXSA 2XRUA 4XG4A 3OEFX 1JKLA 3ROYA 5K0KA 4CQGA 5CEKA 1CSNA 2KULA 3O50A 5HX8A 5E8YA 4EOMA 4FEUA 3FLSA 2J4ZA 4H1JA 4DG3E 2WQOA 5D11A 3FQHA 4DG0E 5HCXA 4YMJA 5F1ZA 2W1IA 5KE0A 4CKIA 3CTJA 3ENHA 2GS7A 3PSDA 5FM3A 3VRYA 5AR3A 4IZ7A 4PP7A 5CALA 1PJKA 4NU1A 5FEDA 5ACBC 5C03A 2C47A 1PYEA 2XEYA 3MY5A 2XBJA 5DR6A 5ANJA 4QP8A 5BYZA 4GYGA 5AJQA 4HCTA 4HZRA 1CMKE 4QP9A 4ANBA 4TL0A 2WTKB 3OF0A 1NW1A 4LOQA 3R8ZA 3SG8A 4I0SA 5KZ0A 4TN6A 3UODA 4II5A 4GFMA 5G1XA 2WELA 3QTXA 5EHOA 3NDMA 3PP1A 3G51A 1YWVA 4WUAA 3OCBA 4QOXA 4AE9A 4NM3A 1PF8A 4DN5A 4HVHA 3EFKA 4IACA 5GZ9A 4FYOA 4IAZA 4FE2A 3GT8A 4GT5A 4B7TA 3FXXA 1DAYA 2O63A 3FMNA 3IGGA 3EQPA 4M67A 1I09A 2EXCX 2W17A 1YVJA 4AF3A 1SVEA 3LW0A 4UZDA 3OW4A 4G17A 4AU8A 3GQIA 5I3RA 1A48A 2BIYA 4UMPA 4K0YA 3JY9A 4KKEA 2CJMA 4WG5A 3OBJA 4WKQA 3NYOA 3CKWA 4KRCA 4I20A 3BYMA 3MY1A 2VN9A 4XMOA 2YCQA 4I3ZA 3FKNA 3ORXA 1FPUA 5AP0A 4DEGA 2R2PA 2FGIA 2XS0A 3Q6WA 5DIAA 2FH9A 5GJFA 1AGWA 4RJ6A 3VBTA 4MXOA 3P1AA 2HIWA 1FINA 3A60A 2PULA 2C69A 4R3RA 4YTCA 2GNGA 5C9CA 5CASA 3I7CA 4EYMA 2VU3A 3S00A 3IK3A 1H25A 4TYEA 5D7VA 4ARKA 1NXKA 1YOJA 3U51A 4MD8E 4QNAA 5K0XA 1R39A 2C6IA 1OZ1A 1PXKA 4HNFA 3F3TA 3FL5A 1U5RA 3EOCA 4FOBA 5CAUA 5IEYA 3KMWA 3NUXA 3KEXA 3PFQA 2B9HA 3PZHA 5AM7A 1H27A 2X2KA 3MBLA 4HPUE 4TZRA 4YJQA 3ORPA 3DQWA 4K11A 3SXFA 3Q60A 5F9EA 2FSLX 2ETKA 2HZNA 2R3NA 5KZIA 3MFSA 4QD6A 3TIYA 1DI8A 3RK9A 3ZH8A 4PMTA 2WAJA 5CSPA 3CC6A 1YI6A 3G6GA 4AX8A 5IPJA 5JMSA 3G5DA 3Q4CA 3TCPA 3GC0A 3FSFA 5CU3A 3D0EA 4P2KA 5C4LA 3DZQA 4AW0A 1Z5MA 4M13A 2BAQA 2QOHA 3VULA 3Q2JA 5ITAA 4GKHA 1U59A 2JAMA 2VTPA 1JAMA 2W1GA 4FTIA 3DXPA 2WIHA 3SGCA 3TV6A 3R7YA 4BBEA 2W05A 4KWPA 4EH7A 4D2TA 4EHEA 2B53A 2FO0A 3DAJA 4NTSA 3G33A 1JVPP 3ORNA 3ATTA 4JDIA 1IG1A 3MPMA 2X39A 4LOOA 3MA3A 4V0GB 3LXLA 5EM6A 2PUNA 5HHWA 4AW2A 2CHLA 4O6EA 4KABA 1YXUA 4XLVA 2OLCA 3SDJA 3QGYA 4G9CA 4XV9A 4J71A 3R9NA 3CY3A 1KE6A 1YDTE 2YWPA 2HZ0A 3DY7A 4LRJA 1O9UA 5FXSA 3EN9A 2UW7A 2ONLA 2UZBA 3E8CA 1Q97A 2WTDA 3PA4A 3O8UA 4QYEA 4I0TA 5EW9A 3ETAA 4AFJA 5DWRA 4TRLA 4HGSA 2SRCA 2PMIA 4IWQA 5KMMA 3EFWA 2Y6OA 3C4XA 3DOGA 4IDVA 2BILB 3MFTA 4DINA 4O22A 4QMUA 4FSQA 1Y6BA 4GMYA 4XG9A 2DYLA 4QYFA 3UIXA 3VBYA 4AE6A 3GC7A 4WG4A 3TNIA 3U4WA 4FSUA 3H9RA 4HPTE 4BTFA 1F5QA 3VBQA 5FBOA 3FSKA 1OITA 1JKTA 3M42A 1FOTA 3RPOA 3VBVA 2XYUA 3TZ7A 4J95A 3RTPA 2RFDA 3G0EA 3D2KA 4USFA 2Z7QA 5DRBA 5EM7A 2X81A 2WMSA 1YHWA 5HEZA 5HG5A 2YCRA 2IZSA 3QFVA 2VTHA 2YM6A 1H1RA 1RDQE 4NEUA 1Q41A 3O17A 4MF1A 2JBOA 3L8SA 5IUIA 3OY3A 2W7XA 1PKDA 4JLCA 3RWPA 4KUJA 1JQHA 5B2LA 2UZNA 5HIBA 4NSTA 4MK0A 4FL2A 2PMNX 4C35A 4D4RA 4C61A 4CFXA 4FV4A 4XG3A 4E4MA 4YP8A 1W84A 4BGQA 2O2UA 1NVRA 3BV2A 4IFCA 4L67A 3F3UA 4O1PA 5KHXA 1YOMA 1HOWA 3GCPA 3A8WA 4AS0A 4DFBA 3LQ8A 4NM7A 2JKOA 1QPDA 4CG9A 4BDDA 2UVZA 5F20A 3QTUA 2OJ9A 2R3PA 4UALA 2GNLA 2KTYA 4CQEA 2EB3A 1KSWA 1XHAA 2WQNA 4PDSA 2OSCA 4O0TA 4XV3A 5CEPA 5IZFA 4H58A 3COIA 3ZEPA 4BDJA 5H3QA 4MAOA 3OCTA 2CCIA 3WOWA 4ZMEA 5EW3A 1UU8A 4I4FA 3AXWA 2OH0E 3LXKA 3L9MA 4L3LA 4XLIA 4YJRA 3NVKI 4D2PA 3U6JA 1OL1A 2B9FA 3TKUA 3WZJA 4X6RA 2IG7A 3O71A 2WTVA 4V0GA 1TKIA 1YOLA 4F63A 3ZSGA 3R7EA 4EC8A 2GS6A 2YEXA 4BI1A 3PXQA 4FICA 1URCA 2BAJA 5CZIA 4D1SA 4HW7A 2OJJA 4QT1A 3A4PA 2A4LA 4M97A 4H3QA 1PXLA 4QNYA 5HTIA 5HZNA 2QOLA 3FMEA 2J7TA 3HDMA 4WNKA 2F7ZE 3BWJA 3VS6A 3MVJA 5TF9A 2XK3A 5L2WA 2YACA 4YJUA 4J96A 4UV0A 4X6QC 3Q9ZA 2VTIA 4RZVA 4XEYA 4FV5A 3DB6A 5CU2A 1IASA 2DUVA 2XIYA 4RG0A 4P5ZA 2Y7JA 5H8EA 3JUHA 5L4QA 1PMUA 4KKGA 3BYVA 2GFSA 3IONA 4PDYA 4O7TA 3LQ5A 4QPMA 3PRFA 4QQJA 5DR9A 3QRUA 1MRYA 3LHJA 4BWXA 5DHJA 2W4KA 4G34A 4D0XA 3OVVA 5IQHA 3HKOA 4WBOA 3UO6A 1O6KA 4WBBB 4YJNA 1PXJA 3GQLA 4L44A 1H01A 2A1AB 3MH0A 5HBEA 4PY1A 3BKBA 2XNEA 3FQEA 3W2RA 3GFEA 5JK3A 3DNDA 3P9JA 3AG9A 3VS5A 4GYIA 4YC6A 5LVLA 1JKKA 2W1CA 3RM7A 3AGLA 3DTWA 3DKGA 5D9HA 3VC4A 3RZBA 4GJ3A 4DC2A 5EH0A 4FV3A 4K18A 1PXOA 1FGIA 2XBAA 3FLWA 4BTKA 4A9SA 4ALVA 4EQMA 5DBXA 2H9VA 1OB3A 3F61A 2OW3A 2RFSA 4U8ZA 4WO5A 4NZWB 2PMOX 2QHMA 3PJ8A 5CSWA 1U5QA 2B0QA 3HMMA 4ZAUA 3LFEA 3ROCA 5HE3A 3QLFA 4R7BA 4DG2E 1OECA 1UV5A 2F57A 3F9NA 2HZ4A 4YUQA 4NW5A 4XH6A 4O91A 4E7WA 4RC2A 2X6DA 4G3FA 4C62A 3QKKA 4GUEA 4FTAA 1GZNA 2WGJA 4I5PA 4IM2A 1Q4LA 1QCFA 4GW8A 4EH2A 1GIHA 4UX9A 2OZOA 1OL6A 5H9BA 2CKPA 2WXVA 2AYPA 3Q52A 3EQDA 5DE2A 3KF7A 4I22A 3H4JA 4IFGA 2G1TA 5E91A 3SQQA 3FUPA 4FSNA 3NUUA 1AD5A 3TKHA 3VF9A 2JDTA 3DBFA 4FSMA 1PMVA 3NYVA 1TQMA 4CV8A 3QA0A 3B8RA 2X2MA 4WA9A 4IM3A 3NSZA 1EH4A 3POOA 2PVJA 5I4NA 4IAYA 5AUVA 5CEIA 4ONAA 3BELA 3QGWA 3T9IA 4AA5A 3BI6A 4E20A 2Y4IC 3UZPA 3BRBA 1VZOA 2YIXA 1Y57A 3CQUA 1G3NA 2YIYA 3IDCA 4WIHA 4XS2A 2V22A 4AGCA 5DRDA 2RFNA 2CGVA 5HD7A 2VGPA 3RNYA 1Q3DA 3FMKA 3RAKA 4YTFA 4M84A 3EKNA 4CFVA 3RK5A 3C4FA 3QCQA 4IX4A 5AP3A 2UW4A 2XKDA 3BBTB 3NNVA 4UXLA 3SOAA 4C36A 3VUGA 4DAWA 3JY0A 3Q5ZA 4RSSA 4UWBA 4BCMA 2I0YA 3MB7A 2O3PA 5L8JA 3AT2A 3AD6A 3F5XA 3U4UA 3V8WA 4BGGA 3NUSA 4NH1A 2JIUA 4C57A 4YTHA 2UUEA 3BGPA 4NFNA 4KS7A 4B9DA 1OGUA 3EQIA 3R1YA 3TNPC 2JKQA 4AT3A 3H9FA 5HKMA 4FT0A 5M55A 2NPQA 2PVLA 2WFYA 3IS5A 4XRJA 4IVCA 4XG8A 1I44A 5I9VA 3QXPA 2ZB1A 5AAGA 3HEGA 3P86A 4U9AA 2ITTA 2EB2A 4DFZE 3S3IA 4AACA 3TN8A 4EOOA 5JFSA 2PZ5A 4RBLA 5CSXA 5HVKA 3BEAA 4O21A 3SKCA 4EWHA 5I0BA 2UZOA 3EN6A 3HX4A 5TKDA 4EKLA 2YWVA 2X8IA 5DOSA 2ZM1A 5AUYA 1MRVA 4OTRA 2R3HA 3IECA 4PL3A 2JIIA 2QOQA 2JIVA 3VHKA 4A07A 5EM5A 5H8GA 3S95A 2QO7A 1P14A 4IZAA 4XUFA 5FP5A 5TE0A 2NNWB 3L8VA 3E7OA 4YURA 5J5SA 2J5FA 3KMUA 4MXCA 1FMKA 2R3GA 3C13A 5JZJA 1JKSA 2PE2A 4JR3A 3G90X 3LLAA 1LPUA 4QYGA 3VS1A 2HAKA 2PWLA 3GC8A 3OZ6A 4BCPA 2YM7A 2JFLA 3A62A 4FZ6A 4GK3A 4HGLA 1YHVA 1H0VA 2RL5A 3C0HA 2V55A 3HMPA 3MB6A 5EDQA 3TDWA 1H4LA 3R28A 4XCUA 3FC2A 2EWAA 3MVLA 4W8EA 4BZNA 2R9SA 2UZTA 3C5IA 4OTPA 5D10A 4EUUA 1RW8A 4RVMA 4KS8A 4L53A 4OTWA 3LXPA 4ENYA 5IQFA 5EKOA 4L01A 3H0YA 4ZZMA 1ZAOA 4MXYA 2QODA 5FG8A 5M06A 3QD2B 4OT6A 4U97A 3S4QA 1M14A 4F1OA 2BTSA 3FC1X 4B99A 2BDFA 3OUKA 2H8HA 4ID7A 5DMZA 2QI8A 2C4GA 1XJDA 4MH7A 3KGAA 4TWCA 4TNDA 3ZLXA 4D2SA 4IEBA 3KULB 4ITIA 4HVDA 5HTCA 3QRJA 3RWQA 2J9MA 2UW3A 4X3FC 3LPBA 5HGIA 4LUDA 4NK9A 3T9TA 1J7IA 2Z60A 1U46A 2BVAA 3DNEA 3D5VA 5J1VA 4J52A 2IW9A 2BPMA 2P2HA 3TUCA 3PJ3A 5K5NA 3QCYA 5KMJA 4C4GA 4ALWA 4ZS4A 5GNKA 4HOKA 4L52A 1PXMA 5HNGA 2H96A 3K5VA 2C6OA 2WNTA 4FZDB 3R1QA 2YM4A 3PRIA 2OJGA 5HESA 3B8QA 1QPCA 3O51A 3WZKA 2CKQA 2WO6A 4CFNA 3SV0A 4ZLYA 5J7BA 4EK8A 1R78A 2YAKA 1BX6A 3KVXA 5LCKA 3TUDA 5E1EA 2YJRA 2C5YA 2I6LA 2BUJA 4PQNA 2R7BA 3E64A 2G9XA 4DT9A 4G9RA 3EQBA 3V3VA 4R78A 1STCE 3QC9A 5KX8A 3DT1A 5AEPA 3IW6A 1OKWA 2J0IA 4WD5A 4YR8A 3FLNC 4L8MA 1G8SA 4HZSA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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