5A4LA

Dyrk1a in complex with fluoro benzothiazole fragment
Total Genus 111
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
347
structure length
341
Chain Sequence
KVYNDGYDDDNYDYIVKNGEKWMDRYEIDSLIGKGSFGQVVKAYDRVEQEWVAIKIIKNKKAFLNQAQIEVRLLELMNKHDTEMKYYIVHLKRHFMFRNHLCLVFEMLSYNLYDLLRNTNFRGVSLNLTRKFAQQMCTALLFLATPELSIIHCDLKPENILLCNPKRSAIKIVDFGSSCQLGQRIYQIQSRFYRSPEVLLGMPYDLAIDMWSLGCILVEMHTGEPLFSGANEVDQMNKIVEVLGIPPAHILDQAPKARKFFEKLPDGTWNLKKTEYKPPGTRKLHNILGVETGGPGGRRAGESGHTVADYLKFKDLILRMLDYDPKTRIQPYYALQHSFFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Probing the ATP-Binding Pocket of Protein Kinase Dyrk1A with Benzothiazole Fragment Molecules
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords DUAL SPECIFICITY TYROSINE-PHOSPHORYLATION- REGULATED KINASE
total genus 111
structure length 341
sequence length 347
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.7.12.1: Dual-specificity kinase.
pdb deposition date 2015-06-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5a4lA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5a4lA01
3IK3A 3SA0A 3NCGA 4FKGA 2GNIA 1T46A 3JY0A 5AP3A 4F1TA 4QMNA 2H34A 1F3MC 3CC6A 2ZVAA 4AACA 4IC7A 5M57A 4BYIA 1JVPP 3DQWA 4R7HA 4BKJA 4F6UA 1ZYCA 4EBWA 3DDQA 4PV0A 4I5PA 4AG8A 4EWQA 4TTHB 1P5EA 2JITA 2JIUA 3F6XA 4QD6A 5AWMA 2W17A 2IVVA 4BGGA 3I7BA 2YIRA 2J9MA 4YJQA 5FGKA 3FQSA 3PA3A 2Y4IB 3BEAA 3MGYA 4AGDA 3QYWA 3N4UA 3FSFA 4W8EA 5K5NA 3EZVA 5J7BA 3EL8A 1H28A 4ITJA 4U41A 5CQUA 3ZMMA 3QUPA 4O0WA 5CAUA 2RFSA 2WEIA 3I4BA 1REJA 1YHSA 4F4PA 4FV3A 2BUJA 4U40A 5FBOA 4XHKB 4RJ4A 4UY9A 4CFNA 2CNQA 1SZMA 2W99B 4EHEA 4FSMA 1ZYJA 4D4YA 2XA4A 4JR3A 3TZ8A 3ZUVA 4FIJA 4QP8A 1FVVA 3PYYA 3CKXA 3DKCA 4DFNA 4RG0A 4UMTA 4WIHA 2QOQA 4FL2A 3RBWA 1WBVA 3OT3A 5ACKA 3BYUA 3QFVA 3SRVB 5ANDA 3R1NA 3UMWA 4F7JA 5ANIA 5I9ZA 1Q5KA 2ACXA 3IW7A 3OWJA 2FGIA 4JRVA 2W1GA 3DAJA 2WAJA 4YNEA 2BKKA 3NUPA 5K0KA 3QWKA 2I1MA 4RSSA 5AP1A 4ANLA 3BGZA 2OWBA 3QRJA 4O7RA 2XKFA 4X2GA 3UTOA 3W2PA 4BRXA 1M7NA 3ALOA 3EQGA 3GU4A 1T45A 1K9AA 3KRWA 3OP5A 4RJ5A 4XRLA 1RDQE 2C3JA 4ZK5A 2QOLA 3HX4A 2OZOA 3BBTB 2UZUE 3C5UA 5AIKA 4BCQA 4WD5A 2R3FA 3R04A 3LCDA 2YAKA 4FT3A 4J99A 4QNYA 3RAIA 5KHWA 5DI1A 3VBVA 3HRCA 3AD6A 4XG8A 3EJ1A 4M97A 5IUGA 4MX9A 5C8KA 3VULA 4JIAA 2WD1A 3E8NA 2JEDA 3A8XA 1U4DA 5EDPA 4PPCA 4ZSEA 3Q3BA 3FQEA 4JX7A 3OVVA 3LMGA 4IWPA 3FMKA 3CXWA 5H8BA 4FSYA 3ZZWA 3C4ZA 5CF8A 3KMWA 1NVQA 3MJ2A 5HICA 2I0EA 5LMAA 4CMTA 2J50A 4HGLA 4PP9A 3P78A 3R8VA 1J1CA 3C4XA 3CGFA 5TOZA 1W0XC 2Q83A 4CRSA 4DEDA 3NMUF 1AQ1A 4PQNA 3NLBA 3KULA 4CMOA 3Q4UA 3D7ZA 3HV6A 3UIUA 3G33A 3TNWA 1PMVA 1Y57A 3FMMA 1PMNA 3ZTXA 3AC8A 4KAOA 4PMMA 3DAEA 3FPMA 4NEUA 1H1QA 2YDJA 4Z55A 4I0SA 2WTDA 3ZO3A 1URWA 4FC0A 3LFFA 3GC7A 5KMJA 3MVMA 3SW4A 2UZOA 3U6JA 4YR8A 3MH2A 5EHOA 5KZ0A 5JGBA 2OIQA 2ITPA 4NH1A 4O82A 2HZ4A 2IZTA 3Q9YA 4AW2A 4CFFA 2B4SB 3QC9A 4FEXA 4NYEA 1UKHA 4M15A 1IRKA 5F9EA 2J6MA 2RFDA 4IACA 2ZDUA 1CDKA 4R6VA 5C01A 2OKRA 4PP7A 2VGPA 5AUXA 5GNKA 5C8NA 4MNEB 4DTBA 3L9PA 4RC4A 2IJMA 5AUTA 4F99A 4J8MA 2BMCA 5IISA 2C5NA 2ITTA 3VS5A 3RWQA 3ZRMA 5HE2A 3MN3A 2CSNA 2WHBA 5HVYA 1JSVA 3COMA 2R2PA 3Q5ZA 3DS6A 3VUTA 4D4SA 1AGWA 3O96A 4E7WA 5L3AA 5FEEA 5CEMA 3A60A 3O2MA 5J8IA 4BF2A 5M56A 4QTEA 4GYIA 2UVZA 3P7BA 2XK9A 4D2WA 4RZWA 5HX6A 4FVPA 4L6QA 3IDCA 4OT6A 3ENHA 2UW5A 5JRQA 4MYGA 3FE3A 3BYMA 4KIKA 4FSQA 4NL0A 4O27B 3R8PA 2C0OA 5DYJA 5E8UA 1UU3A 2VTJA 4S34A 5LMKA 4QYYA 4BDEA 4BFMA 5LVOA 3U55A 3KC3A 4PY1A 3ET7A 4RC3A 1PW2A 4G34A 3PZEA 5CEKA 3DZOA 3SOCA 3GC0A 4DITA 5KMNA 3BX5A 5FDXA 1VEBA 3RWPA 3DNEA 4JBPA 4JAJA 4C37A 4C36A 4IEBA 5AV0A 5CSVA 4EWHA 2Y9QA 4FKIA 4XMOA 4XLIA 4RIWA 4CTCA 2ZV2A 4C58A 3EB0A 1GJOA 5ETCA 4AT3A 4EK4A 4KKGA 4DFZE 2FO0A 3G51A 4O0TA 2ETKA 3R1SA 2UZNA 2I0VA 5EI8A 5AUWA 5C26A 4BR3A 4YTCA 1SVGA 3MY5A 1YRPA 1OM1A 5CI7A 4A4OA 5KHXA 2RFEA 3D15A 4FKLA 1KSWA 3H9RA 4PNIA 4LL0A 5CSPA 4DH1A 4I5HA 3FYKX 5HNGA 2XB7A 2WTWA 1XH4A 5L6WL 2VUWA 4YPSA 3VUDA 3IOPA 1Q99A 3T9IA 3ZO2A 4DLIA 1IA9A 4KIQA 4YZNA 2UZEA 3TV6A 4HGTA 2W4JA 3MS9A 4WSYA 3VUMA 4BTFA 5IG1A 4EH5A 1W98A 3MFTA 4J52A 4X3FB 2F7EE 4NWMA 3DGKA 3TNHA 2X2MA 5HE0A 5C4KA 3IW5A 3DJ7A 5CTPA 4TYEA 4AS0A 3AMBA 2YAAA 4HPTE 3QQJA 5CANA 2X9EA 4D9UA 1JKSA 5EYKA 5HNBA 5CAVA 4BCIA 3FL5A 3GCVA 3I6UA 1QL6A 3PUPA 4PPAA 3G6HA 1PXPA 4TXCA 3B2WA 3VJNA 3BWFA 3VNTA 3WF8A 4NIFA 2UUEA 2C6TA 3UODA 3PTGA 5HBEA 5HO6A 4DCAA 4EKLA 4RIYA 2BHEA 2GU8A 4FSNA 5BVKA 1U59A 2ITWA 4ZY4A 1U5RA 5A4LA 3RPSA 3QZGA 4X7QA 4ZY6A 4BBFA 4JI9A 3HP5A 3OTVA 4JG6A 2NO3A 3ANRA 3QTXA 4Y73A 4F65A 3UC3A 2B55A 5IF1A 4JDHA 3DJ5A 1VJYA 5FDPA 3ZZEA 1H08A 2QG7A 2R3GA 4J1RA 1R39A 4O2PA 3MB6A 4IVAA 3S2PA 3OZ6A 5FXSA 3FMDA 5AUZA 2ZYBA 3R73A 5F20A 4BDKA 3NW6A 4TPTA 1IA8A 3FI4A 3MSSA 4O81A 4D5KA 1MQBA 4O0YA 2A0CX 2B54A 3F3TA 5BMSA 4EUTA 4MF0A 3TTIA 2J0IA 1YOJA 3R71A 4RRVA 4G31A 4L68A 1U5QA 5DNRA 4IX3A 2BZKB 4PNKA 2NRYA 1UNLA 4ZLZA 4GT3A 2O8YA 4H3BA 2GHMA 2F4JA 2JDTA 4P5QA 3ZLSA 5HU3A 3R7YA 1OITA 3AQVA 3ZDIA 2B53A 4FV5A 4CNHA 2I6LA 3FZOA 1WBOA 2GMXA 5LMKC 5HCYA 2W4OA 5IQEA 3FWQA 4RZVA 1BL6A 3IDBA 4NFNA 2X1NA 3A4PA 4KD1A 4O6EA 3CY2A 4XUFA 3TT0A 3POZA 1WVYA 4MD8E 2F57A 2YDKA 3RM7A 2ITXA 1URCA 2C3KA 4AZFA 3UIXA 3ZH8A 2WB8A 4DH5A 4FTNA 3W16A 4BCNA 2CMWA 2WGJA 5A4EA 4H1MA 2C6IA 4FZAB 5AEPA 2XIYA 3Q9XA 4G9RA 3NYVA 4Z16A 5IQHA 3QF9A 4V0GB 5I9XA 4IAYA 3SD0A 1PXMA 3CTQA 4BDCA 5E8VA 4C4JA 4F09A 2HZNA 1RE8A 5GJDA 4MXCA 3W2RA 3PJ1A 4CFUA 5AP7A 4E8AA 1WBSA 4IE9A 4FTLA 3FXZA 3P7AA 3TACA 3DCVA 3RPVA 3SVVA 2DYLA 4RA5A 4Q9SA 2PHKA 2YM4A 4EOQA 3C9WA 4XG9A 3KMMA 4GT5A 3KFAA 4UALA 1PYEA 4WG3A 5M51A 5C4LA 5GJGA 3OCSA 1ZYDA 3FKNA 5HTBA 2VAGA 3MYGA 3ORIA 3R7VA 3ROYA 4DYMA 2WQNA 2AYPA 3RAWA 4B99A 3H0ZA 3GC8A 3MPAA 3TZMA 2R0IA 5L8KA 2R7BA 3R01A 1Q3DA 2WNTA 5EK7A 1UVRA 3BYSA 3IS5A 3W55A 4YBKA 3MY1A 4OAUC 3CEKA 4MBJA 5FQDC 3QRKA 4UXQA 4WRSA 4A9RA 2PPQA 1YXSA 3EOCA 3Q9WA 1JSUA 3VN9A 3OG7A 4QP2A 2W9ZB 1OIRA 4YP8A 4JVGA 4MEDA 4FA2A 3ZLWA 3I60A 2OF4A 4JAIA 3EWHA 4QPMA 3FDNA 3FI3A 3BKBA 5EFQA 1ZLTA 4YNOA 3LLAA 3HV5A 2Y4PA 4G16A 4ASZA 4PTGA 3SC1A 3OEFX 4X2KA 3WF5A 3WZDA 4D2RA 4EOOA 3IGGA 3LJ2A 3UIMA 3O50A 2WPAA 3UVRA 5TE0A 2OJ9A 2XMYA 4FKQA 3CQEA 4AZTA 4F9WA 4I4FA 2I7QA 4BWPA 4F1MA 4M68A 2OJJA 5CY3A 5D10A 2OXYA 5E1SA 4LV8A 5BVNA 4FL1A 4L3LA 4Q2AA 4RJ3A 4HCVA 4BHNA 4D9TA 3DKFA 5D9HA 4D2TA 4D5HA 5FP6A 4BCGA 2WMSA 3UQGA 3C4FA 3E87A 3P23A 3VBWA 5KBQA 4IC8A 3MFRA 2XP2A 4ANQA 2CNUA 2XEYA 2BILB 3NIEA 4I92A 2PVKA 4NK9A 2VWZA 2UZBA 2VO7A 3H3CA 1UU7A 4H1JA 4JG8A 1S9IA 3NUXA 4D4RA 4C4HA 1G5SA 4R3PA 3PPZA 4DH8A 2VTTA 5CAPA 3R7IA 2OICA 1H4LA 4EOLA 4YZMA 5EM6A 1YW2A 2P55A 3O17A 4I6FA 4K2RA 4IVCA 3WIGA 2QKWB 3SG8A 2BROA 3KB7A 4F64A 2XK4A 2GDOA 1ZOGA 2JLDA 2RKUA 3CKWA 1MP8A 4RIOA 1OL1A 2WTCA 4XCUA 4M66A 2EXMA 5B2LA 2CNVA 3HDNA 5DRBA 5HBJA 2WOUA 4MQ1A 1XH7A 3R7OA 4GS6A 4CKJA 3VBTA 4JDIA 5LWNA 4QMMA 3BHVA 3ZFMA 4UX9A 4IAZA 2WU7A 3TNQB 4BCJA 1JOWB 3CE3A 4XP3A 4DEIA 5M06A 2WQEA 4HPUE 3RCDA 5EW8A 3MVLA 4JLCA 2WQOA 4I6HA 4J96A 4TYHB 5DT0A 3RK9A 3UG1A 2YM7A 3LKMA 2DQ7X 1H0WA 4CXAA 4CZYB 4E4MA 3F2NA 1QCFA 4YURA 4NCTA 2YA9A 3BCEA 3TWJA 2IVSA 3ZSHA 1NY3A 5A54A 5EHYA 5J5SA 4TYIA 5ITAA 3MTFA 3LFBA 3FPQA 3WIKA 2DS1A 2JKQA 4LUEA 4FZ7A 2EUFB 2PE2A 4BIEA 5FTGA 3NUUA 4L67A 4DFBA 2PZPA 4LRJA 4EHGA 4ZZOA 3HYHA 1GIJA 1TVOA 5HZNA 2UW7A 2YZAA 4U5JA 4YTFA 3TZ7A 4FL3A 4LOQA 1TQMA 3UZTA 3COKA 2BAKA 4YHTA 2QOOA 3S95A 2OXXA 2JBPA 5JK3A 4I41A 4FEVA 3KRLA 3DDPA 4EOIA 5IPJA 3DFCB 3AT4A 5HD4A 3Q96A 5KMMA 4A9YA 3I5ZA 4AA0A 1YOMA 3PXYA 1UU8A 3R2YA 3F5UA 2ERKA 3NAXA 4XS2A 3U4WA 4XG7A 3WZJA 2HZIA 4UN0C 4YUQA 3ZRKA 2C5XA 5CXZA 3VW6A 3PDTA 4PF4A 3JS2A 4U9AA 3ZBFA 4FV8A 5F4NA 4U3YA 3R02A 4IM0A 5HG9A 3UOJA 3VS0A 1FBNA 3D5XA 4N6ZA 3IPHA 4ZSGA 2UZLA 2HOGA 3GXLA 4LMNA 4OLIA 2CGVA 4CSVA 4QP3A 4A4XA 3SGCA 3R9DA 3T8OA 2HENA 4QMZA 2R64A 2W1FA 2XNBA 1QMZA 2O65A 3CR0A 4QTBA 3ZO4A 4FUYA 4NT4A 3TKHA 3A7JA 1R1WA 4IFGA 5HOAA 3DBEA 2Z2WA 2YM6A 1P4OA 4C35A 4NM7A 5LJJA 3QHWA 4F70A 2WMBA 3KK8A 4X6RA 3LJ0A 2QR7A 3HZTA 4IM3A 3ZO1A 2GHLA 1W8CA 3WARA 3UNKA 2WTKC 4BHZA 3PIYA 3BLQA 4BKYA 4GL9A 2EWAA 5A6NA 1L3RE 2I40A 3F2AA 4IB0A 2YCRA 5I5ZA 5CASA 2O5KA 3FC1X 3FLYA 4DTKA 4UXLA 4KS7A 2OJGA 4L3JA 5J87A 4O7TA 3O51A 4QT1A 5DPVA 4D0WA 4IZ5A 4Y85A 4QQCA 2IO6A 4MCVA 4XG6A 2QOCA 4QQ5A 3BQCA 2FUMA 3FKLA 5KMLA 4JBQA 4AU8A 1V0OA 3DJ6A 4FIGA 4MXOA 3VRYA 4IADA 3K3IA 4AZEA 3KVWA 4R8QA 3QTWA 4AE9A 4CFMA 3A4OX 4FNWA 4KB8A 2J5EA 1WVXA 2XKCA 4WG5A 4YTIA 4Y72A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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