5A4LA

Dyrk1a in complex with fluoro benzothiazole fragment
Total Genus 111
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
347
structure length
341
Chain Sequence
KVYNDGYDDDNYDYIVKNGEKWMDRYEIDSLIGKGSFGQVVKAYDRVEQEWVAIKIIKNKKAFLNQAQIEVRLLELMNKHDTEMKYYIVHLKRHFMFRNHLCLVFEMLSYNLYDLLRNTNFRGVSLNLTRKFAQQMCTALLFLATPELSIIHCDLKPENILLCNPKRSAIKIVDFGSSCQLGQRIYQIQSRFYRSPEVLLGMPYDLAIDMWSLGCILVEMHTGEPLFSGANEVDQMNKIVEVLGIPPAHILDQAPKARKFFEKLPDGTWNLKKTEYKPPGTRKLHNILGVETGGPGGRRAGESGHTVADYLKFKDLILRMLDYDPKTRIQPYYALQHSFFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords DUAL SPECIFICITY TYROSINE-PHOSPHORYLATION- REGULATED KINASE
publication title Probing the ATP-Binding Pocket of Protein Kinase Dyrk1A with Benzothiazole Fragment Molecules
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 111
structure length 341
sequence length 347
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.7.12.1: Dual-specificity kinase.
pdb deposition date 2015-06-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5a4lA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5a4lA01
5CT7A 4HZRA 4B6LA 5CQUA 4WBBB 5AV0A 3A60A 1MRUA 3F5UA 3Q4UA 4IX4A 4IVBA 4QP4A 3SA0A 3UPZA 1AQ1A 3ZEWA 1V1KA 5HQ0A 2J9MA 4MQ2A 1R1WA 4GVJA 2WAJA 4R7BA 2PVKA 5CF5A 3EN6A 3DJ5A 1JSUA 2ZAZA 4AXAA 3CR0A 4BZOA 4MBJA 4Z3VA 4O7YA 3H4JA 4DEBA 5JQ5A 2YCFA 2JEDA 4CRSA 3QGYA 2YDKA 2XIYA 3ZC6A 4O7ZA 4FT5A 3ZBFA 3NNXA 4DTBA 4JLCA 3VUTA 2OLCA 4ZEGA 2GTMA 2H9VA 4HOKA 4BDKA 3FXWA 4YC3A 3R1SA 3E8CA 2YA9A 2X9FA 3QCXA 4EH6A 1QCFA 5I9ZA 5LMBA 2OZAA 4G9CA 1LUFA 3OUKA 3QQLA 3Q32A 2YABA 4B8MA 3LZBA 2QOFA 4MD7E 5CAPA 5AP0A 4FSYA 2JIIA 4FIIA 3UMXA 4CG9A 2YM7A 2XIZA 2W17A 4KS8A 3V5TA 1YDTE 4DG0E 5HX8A 2VNWA 2J4ZA 3KKVA 3GUBA 3LXNA 4L3PA 3G6GA 4I1ZA 1UU8A 4RVMA 4O81A 3EN4A 3O50A 4GIIA 3OY3A 5EW3A 4O7SA 4HCTA 3NAYA 4GK2A 2XM8A 3GFEA 3OTVA 5CSHA 4FKWA 3DTWA 2XVDA 4RFZA 3OTUA 4QTCA 3E93A 4N70A 2IVVA 4X2FA 3VHEA 2RG5A 3ZLXA 4IVCA 3LKMA 5JFVA 2ONLC 3MJ1A 1H27A 1HCLA 4PDOA 5IH4A 3QC9A 1YDRE 2I0HA 5CU2A 1P4OA 3ZFYA 2CLXA 4EWHA 1FVRA 3A4OX 4YR8A 4PTCA 4IM2A 3TJCA 2IPXA 4DC2A 1YXXA 1YHSA 2BALA 3CCNA 4U81A 3I79A 3DBEA 4KBCA 1SNXA 2UZEA 4BCJA 4FNXA 2OWBA 3IDBA 4U45A 4NYEA 5C4LA 5M57A 1H26A 4Q5HA 4PWNA 2VO7A 2W5BA 5LARA 3BIZA 3AC3A 3QD0A 1BMKA 2WFYA 3A2CA 3I60A 3HMPA 3IOKA 3I5ZA 1IAJA 5M09A 1FPUA 1IR3A 2C6IA 3BI6A 4C4IA 4H3QA 4AF3A 1Y6AA 3CP9A 1J7UA 2QVSE 5CF6A 3NUXA 4YBKA 3DLSA 4ANLA 4D4YA 5FUTA 1ZOEA 4LUEA 2PVRA 4I92A 3Q52A 3LAUA 5AP1A 1PW2A 3NYOA 3Q2JA 3DT1A 3OCSA 4N6YA 3RNYA 5DG5A 4BCPA 3G0EA 4BDHA 4E6DA 2JC6A 4GG7A 1FMKA 1YOLA 3ATSA 3VF9A 2IZUA 3P0MA 3UZTA 1RE8A 3IW4A 3SRVA 3VO3A 3B2TA 3ZONA 2QR7A 1GIIA 5J5SA 4EKLA 3KXMA 4EBWA 4YO4A 1H08A 4FTJA 4PDYA 3G9LX 3W2QA 3CXWA 4EUUA 4G5JA 4IFGA 4E6CA 3E8NA 1K2PA 3LCSA 2ITYA 5HOAA 4FEVA 4TN6A 4ZLZA 1PMVA 3MA6A 4D2WA 2P2HA 3GC7A 2VTJA 4X3JA 4DH3A 4RC4A 3AXWA 3NYNA 1XWSA 3CSVA 4LG4A 3R8UA 4BKJA 2BRNA 3LFQA 5EI6A 3GU6A 4KIKA 4W8EA 2JFLA 3IW5A 3QZHA 3GOPA 4JDKA 3R63A 4FSTA 2QO7A 3ZDIA 4O22A 4Y95A 4D4VA 4IX3A 3QHWA 4YZBA 3DXPA 4J96A 3IO7A 5HGIA 4NW6A 2RFSA 3LLTA 2P55A 3R8MA 1GZKA 3AC1A 3E92A 4FGRA 2GS2A 4X2JA 4G17A 4U80A 5C8NA 3LJ2A 1OKYA 3GC8A 4FTNA 4IQ6A 3H30A 3FZOA 2PYWA 2OFUA 4G6LA 4D2TA 3CGFA 2XKCA 3R1QA 2OF4A 4CTBA 3MESA 4DEHA 5A4TA 2BDJA 2UW7A 4ZSGA 4OGRA 3BZ3A 4PMPA 2Q0NA 2G2IA 4QP2A 1CDKA 3ORNA 1RJBA 4NWMA 4QMWA 3KB7A 3F66A 3FC2A 1BI8A 3QTZA 1DI8A 4TNBA 3RI1A 2BDWA 3GC0A 4AN2A 2BPMA 4UV0A 3I81A 2X4FA 4NEUA 3KULA 4YSJA 5LWNA 4KA3A 4FYOA 3KY2A 3OOMA 4FTIA 4JQ8A 2JFMA 3PIYA 5CI7A 5ANJA 4UMRA 4E4XA 3DAKA 2A4LA 5TT7A 5FQDC 1WBSA 2GS7A 5EDRA 4CT2A 3I6WA 2FGIA 4JQ7A 4HYUA 4LL5A 3UG2A 4EH5A 2BRGA 3FMHA 3DLZA 2BKZA 2HCKA 3P78A 5EM5A 3LM5A 4A9UA 4IAIA 2GHGA 2NPQA 1J91A 3OW4A 5FLFA 2VZ6A 3K3JA 3UC4A 1M7QA 3LCOA 1OKVA 4EHGA 4MXYA 4JL9A 1UA2A 4D5HA 3MIYA 4U9AA 4XMOA 4DEAA 1QPJA 1P4FA 2NRYA 4IAYA 3QQKA 1Y57A 4FKIA 4LL0A 3V5JA 4CCBA 4YTCA 2UZUE 4IAKA 4NW5A 1ZAOA 1GIHA 3D14A 3NLBA 4FV4A 3VJNA 4CCUA 4D4RA 3CQWA 1MP8A 3MVHA 4FX3A 4MWHA 3E87A 2OICA 4XRLA 3NZ0A 2IG7A 4IZ7A 4P7EA 2ZDTA 3NUPA 3DOGA 3GU8A 3S2PA 1GZNA 4QMUA 1NVRA 1F5QA 2V0DA 3ORPA 4IJ9A 3UBDA 3ORXA 4RJ7A 3D5VA 3ROYA 3UNKA 4RPVA 4B9DA 5CY3A 4EOJA 4NM5A 5A4CA 1B38A 4PQNA 4BIDA 4QMTA 4AA4A 4ACCA 4GVAA 4D1ZA 3PUPA 3PY1A 4HPTE 4BCMA 4C02A 4U42A 2Y6OA 1ZARA 4FV2A 4NFNA 3KC3A 1R3CA 2F7XE 4H3BA 3F3ZA 3G90X 3UOKA 2Z8CA 3UP2A 1OVEA 3EQRA 3NMUF 3C4CA 1GZ8A 4ITJA 4C58A 3GCQA 1P5EA 4AW1A 5L2IA 1IA9A 3A62A 4NCTA 4M67A 4PMSA 3CBLA 4OT5A 4RWLA 2C3JA 2BRHA 2HAKA 3BBWA 5DEWA 3GI3A 4I0SA 4KRCA 5FXQA 3DDQA 3WE4A 2PE1A 5KHWA 3OZ6A 2R3JA 3FZTA 4FGBA 3VF8A 3OXZA 1LR4A 5BVOA 3H9OA 3TKIA 4EJ7A 3CE3A 4FKOA 4UBAA 3FLNC 2QOKA 4FV0A 3V5LA 4MF1A 3CJFA 4HYIA 4TWCA 2VO3A 1U54B 4NU1A 3P08A 3FDNA 4CYJA 3R9OA 4ANMA 5L2WA 2R3RA 3G0FA 4BDEA 4L00A 2QLUA 2JIUA 1CM8A 4C36A 2J6MA 1BI7A 2VTTA 3ROCA 3C13A 1LEWA 2YAKA 3G15A 2SRCA 3MFUA 3RP9A 5K5XA 4XP3A 5HO7A 4AFJA 2O64A 2V5QA 3QLGA 4KAOA 5FP6A 1K3AA 3F61A 4RSSA 3D5WA 5EHYA 4FTCA 2EB2A 3BWJA 3HX4A 3LM0A 3PVWA 4K1BA 3DK7A 4O0SA 3QGWA 4D9TA 4FNZA 3TXOA 4FL3A 3WILA 2BTSA 3CQUA 4CXAA 4FSNA 3V01A 3ZMMA 1FBNA 3MN3A 4XV2A 3GGFA 4DEEA 3UP7A 1ZOGA 5KCVA 2J0MB 3Q53A 3HMIA 4RIXA 2YM6A 2OJJA 5L2SA 4QYYA 3LXLA 1DAYA 3N4TA 4J53A 2XM9A 3R7GA 4S30A 4RVKA 5DA3A 5CEPA 1Q8UA 1ZRZA 2WMUA 1H1QA 2QONA 2ZB1A 4P2KA 4CGAA 2XRWA 1PHKA 4ZS0A 3DPKA 2OJGA 3FMMA 4FL1A 5KMNA 3FMJA 4ZS4A 3ERKA 1KOBA 4LGDA 3WF7A 4UYNA 2I7QA 2PMIA 3O8PA 4I5CA 2GNLA 4HNIA 4MNFA 5E4HA 3OHTA 5AAEA 4C4HA 4EOOA 2B52A 4C38A 3AC5A 3SW7A 2WTDA 4RWJA 4O7TA 3K5VA 4F7JA 4E5WA 3RCJA 3ORMA 4CRLA 4XG9A 5F95A 3TIYA 4O0VA 4BL1A 3KXXA 3E8DA 3OBGA 2HZIA 4AE6A 2A1AB 3L8SA 4FYNA 4G6OA 4OBQA 3P9JA 2ITOA 4LYNA 2XB7A 2YCSA 4AP7A 4C34A 1HOWA 5L2QA 3FXZA 3ULZA 4Z16A 2XK9A 5E8XA 4D55A 4ID7A 4PMMA 3MVLA 3CQEA 4PV0A 2C6MA 3MFSA 2VTLA 4C2VA 2E9VA 1L3RE 3QTXA 4II5A 1Q8WA 1Z57A 3FE3A 3OBJA 3P79A 4IBMA 4YTFA 5JSMA 5AAGA 1B6CB 2PUIA 3WIKA 3CPBA 5IEXA 2PZ5A 1UNHA 5EYCA 2XS0A 4LM5A 1OL7A 4DCEA 4J95A 5IQBA 4I6QA 4IEBA 5EI8A 3F7ZA 3KMMA 4BBEA 3FKOA 3D9VA 5HICA 3LFNA 1H4LA 2AC5A 3BHUA 3RCDA 3U8WA 4XG6A 2XEZA 5FG8A 1OBGA 4DINA 1J7IA 2G2HA 2R64A 3O71A 1TQIA 4HZSA 4ZTLA 1REKA 2Y9QA 5AFVA 4EC8A 3JXWA 4JDJA 3CD8A 3LMGA 1OKZA 2J0LA 4PPCA 4LRMA 1PYEA 3TTIA 1YWNA 4J8MA 4CEGA 4E3CA 2BFXA 4AUAA 3OCTA 3QWKA 5EKNA 4B7TA 4NKSA 3F69A 2XBAA 2VTRA 3VNTA 3U6JA 4HVDA 3MB6A 2PVJA 3PJ2A 3R28A 4B8LA 3C4ZA 3GCSA 3JY0A 4HVGA 1Q8ZA 4JOAA 1SYKA 4AT3A 3U55A 3SQQA 2VUWA 3KFAA 2WOUA 4FSMA 4AGUA 2ZOQA 4R78A 4LV8A 3T9IA 4LV5A 4AG8A 2OXDA 4XHKB 3R02A 5LOHA 2WQEA 4ZJJA 4EK5A 4JVGA 4WA9A 2C1AA 2PSQA 4I24A 4IJPA 4ITIA 4PTGA 5DIAA 3PXKA 4R77A 1PMEA 4O38A 4OLIA 3NCZA 1XBCA 2OJFE 3RPRA 3JVRA 2BCJA 2JLDA 2VNYA 3I0QA 4L44A 2BAJA 3KA0A 2CKOA 1KV1A 2OIQA 1YI4A 2ITNA 3Q6UA 4F63A 2E2BA 4M8TA 3RAWA 1OBDA 4NJDA 4BDCA 4I4EA 1ZLTA 3Q4ZA 4ALVA 5M08A 3GXLA 5IA0A 3QCYA 2CMWA 4NSTA 5HI2A 4AT4A 2P2IA 2ITXA 3QQGA 5ETIA 5DYJA 5DOSA 5HZNA 1OI9A 2XZSA 2ZM4A 1Q41A 3K3IA 5EH0A 4YPDA 4RZVA 5HU3A 5JGDA 5IH5A 4P5ZA 3QBNA 3RAHA 3BE9A 2BIYA 3RKBA 2EXEA 3BQCA 3UC3A 3TDWA 5LXMA 4EK3A 3DQXA 2UW9A 4D2VA 4BVUA 1R0EA 4RIOA 1REJA 4TNDA 4ITHA 3NW5A 3R00A 5IUIA 3EWHA 3UO6A 4UMTA 3F5XA 4ZJVA 3S0OA 1PY5A 4F09A 3E62A 3MH2A 4DGGA 3QALE 3QTRA 4M12A 2CCIA 5CVFA 1IAHA 1OUKA 5HIDA 1X8BA 3AD6A 3O2MA 1KE7A 3C0GA 1O9UA 4ZIMA 3PXYA 1W84A 4EQCA 4NTSA 4I0RA 4AN3A 1IEPA 5AUZA 4YJOA 3UOHA 1YRPA 4M66A 4BTKA 4GKIA 4I4FA 4FV5A 4O2PA 3FZ1A 3SXRA 4KIQA 2WTKC 2F2CB 3RJCA 4OTGA 3H10A 2VU3A 3RWPA 5HD4A 4QMVA 4I20A 5AV1A 4XG3A 2WMTA 3CKXA 3NUSA 4HVSA 5I0BA 3F6XA 4TYGA 3RGFA 3PE2A 4NZWB 4CNHA 3Q60A 2VWXA 4BBFA 4DH5A 4M69A 1IASA 3HV6A 3DGKA 4MX9A 3COKA 4JAIA 2OBJA 5EYKA 4F6UA 2VN9A 2FYSA 1WFCA 4USFA 3LPBA 2PL0A 4F0IA 3BE2A 5IQGA 4BWKA 4X6QC 1H24A 3POOA 4FT3A 5HX6A 4N57A 2UZVA 4OTPA 5J7BA 2XK7A 2Y7JA 2DYLA 2QOQA 1OZ1A 3D5UA 3QHRA 4XG2A 4EH8A 2WMBA 5H8EA 3PG3A 3G5DA 5EG3A 4CYIA 3O8TA 3PIXA 4CV9A 3RM6A 4XP0A 3I0OA 2P33A 5CNOA 3CTJA 1NVQA 3KRJA 1RDQE 4D1XA 5IKWA 2J50A 4JBVA 5K0XA 1PMNA 1Q61A 2IW9A 3HDMA 3OUNB 3MI9A 4IACA 4K6ZA 3Q6WA 1V0OA 3EFJA 3QQJA 4EYJA 3KREA 4XNEA 3EOCA 5EDQA 4A9SA 3DNEA 3PLAE 3BQRA 4MF0A 2X2LA 1UVRA 2UW3A 2OJIA 4W4WA 1BKXA 3Q9WA 2X7FA 4RC3A 3PSDA 1U4DA 1ZMUA 4FV3A 4FKUA 4ZSJA 3DB6A 5ACBC 3EH9A 1WBPA 3PY0A 4GFOA 4I93A 2QQ7A 4U79A 4FSRA 3RZBA 2DS1A 2XK8A 5KBQA 1RW8A 4I94A 2Y4IC 4I23A 2CN5A 2G1TA 5GINE 5LWMA 3BHVA 3I5NA 3MPMA 4BFMA 3KRRA 4EORA 1XHAA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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