5AIRA

Structural analysis of mouse gsk3beta fused with lrp6 peptide.
Total Genus 101
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
101
sequence length
358
structure length
353
Chain Sequence
MKVSIGSKVTTVVATPGQGPDRPQEVSYTDTKVIGNGSFGVVYQAKLCDSGELVAIKKVLQDKRFKNRELQIMRKLDHCNIVRLRYFFYSSGEKKDEVYLNLVLDYVPETVYRVARHYSRAKQTLPVIYVKLYMYQLFRSLAYIHSFGICHRDIKPQNLLLDPDTAVLKLCDFGSAKQLVRGEPNVSYICSRYYRAPELIFGATDYTSSIDVWSAGCVLAELLLGQPIFPGDSGVDQLVEIIKVLGTPTREQIREMNPNYTEFPQIKAHPWTKVFRPRTPPEAIALCSRLLEYTPTARLTPLEACAHSFFDELRDPNVKLPNGRDTPALFNFTTQELSSNPPLATILIPPHAR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural Analysis of Mouse Gsk3 Beta Fused with Lrp6 Peptide
rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Low-density lipoprotein receptor-related protein 6,Glycogen
total genus 101
structure length 353
sequence length 358
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2015-02-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5airA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5airA01
2CGUA 4Y46A 3V51A 1CDKA 2W17A 3LAUA 4ZTNA 3EQGA 5M08A 5BYYA 5AUWA 4NWMA 4I41A 4WO5A 2V62A 2NRUA 2XNPA 4AWIA 1R39A 4UMPA 3U6HA 5I3OA 4EWQA 3QQUA 5IEXA 3LCTA 4QTBA 4U45A 2Y0AA 2ZV8A 4FICA 4G17A 4Y5HA 3DTWA 4YJRA 4GU6A 4BBEA 4BCQA 3O17A 4QPSA 5AA8A 3W33A 1VR2A 4S31A 4LGGA 4TNDA 4FV5A 2B52A 3QKLA 2XRWA 3UC4A 1QPDA 1H8FA 1TQMA 2I0HA 4FR4A 4U42A 5D12A 2IW8A 4H3BA 4FODA 5TOZA 3R7UA 5K5NA 4YC3A 1ATPE 2WGJA 5HKMA 1MRYA 3EQRA 2WMSA 1ZY5A 4LOPA 3IG7A 4FV6A 4IVBA 4TKSA 5FGKA 3U51A 4BKYA 4CZUA 4M66A 4QMSA 1WVXA 3LFSA 4HOKA 2ZB1A 4Y72A 1Q62A 5HORA 4NTSA 3RP9A 4GYIA 4D5HA 4G6OA 5GZ8A 4O27B 4QOXA 2XVDA 3W18A 3F2RA 4HVDA 2ERKA 2CHLA 2WTWA 1CKPA 3K3JA 3ODZX 3QKKA 2X7GA 3Q6WA 4NUSA 4AW5A 4BDHA 4V01A 4M0ZA 2XH5A 3SXFA 4GH2A 4XBUA 2HWOA 3FHRA 4ZTMA 2PVJA 3OMVA 2ACXA 1LUFA 3K5UA 4BI2A 1Q41A 1XWSA 2ZV7A 3GCSA 3ORXA 4JBPA 2XCHA 1WMKA 2F9GA 2YJSA 3OUNB 2C5XA 4FV9A 3VIDA 5I3RA 4CZYB 3MI9A 4PTEA 3GC8A 4C57A 5DGZA 3UP2A 2O2UA 3N9XA 3GCQA 3O8UA 1JKTA 1YHVA 4IB0A 3DXNA 1H00A 3QTSA 4QP1A 5CEOA 4W4YA 4KIKA 2UW5A 4RX7A 4XRJA 4ACMA 4JJRA 4LRKA 2JKQA 4OTGA 1ZXEA 4BDCA 4ZJJA 4FV4A 4U3ZA 4FT0A 4K9YA 3ZEWA 4DBNA 3NUXA 2Y4PA 3E5AA 2QQ7A 4KIQA 4YP8A 2HXQA 4W4VA 4HPUE 3PTGA 2OG8A 4D9TA 2J0JA 4EH5A 4JNWA 3FLWA 2FGIA 5LCKA 4EORA 3KXHA 4UMRA 4JDHA 4MK0A 2CCHA 2FSOX 4YLJA 4O91A 3D83A 4MNEB 4MXXA 5DR6A 5EHYA 3POZA 4CQEA 2W1IA 5LMKA 3UE4A 5GJFA 3BYSA 3FLSA 2XRUA 3JY0A 3F61A 4IWDA 3QUEA 4BCJA 4DCAA 4XG8A 1ZZLA 4IDTA 1T45A 4UEUA 3DNEA 5J7BA 5D11A 4MBIA 4UMTA 5EM6A 5M09A 2VTTA 1V0OA 4AP7A 4RLKA 2NO3A 3KXMA 1F0QA 3FI8A 4PY1A 2XIRA 4QTAA 3PA5A 4EOPA 1H1SA 4DEIA 2BIYA 1Z9XA 4IX4A 5CVHA 4FTNA 3A7IA 3E3BX 3VF9A 4NW6A 3FI2A 3I5ZA 3NAXA 3FMDA 3NW7A 4KRCA 4FSUA 2XS0A 2BFXA 4P5ZA 4IW0A 3TZMA 4GK4A 5DYJA 3TL8A 3ZBXA 3DJ5A 4JQEA 2A19B 1Q8ZA 4DG2E 2B9IA 2WMAA 2XEYA 2CCIA 4O38A 4H36A 4S34A 2ITQA 2X9EA 3OY1A 3ULZA 2EXMA 3ZU7A 2J51A 3UQFA 4E1ZA 4LI5A 3DV3A 2HZ4A 4I0TA 2ZYBA 2NNWB 3D2KA 4TN6A 3E88A 1ZARA 3GOKA 3MBLA 4F64A 3DFCB 4QMMA 3NUAA 4BGQA 2HZNA 3IW8A 4EZ3A 2AC3A 4QT1A 4DFLA 3OXZA 5LQFA 4D9UA 1NVQA 3R21A 1YI4A 5K4IA 3AG9A 5ETAA 3JXWA 4LL0A 3GU7A 1TVOA 2CGWA 4PMTA 4EHZA 4WNMA 5L6PA 1OKZA 4CGAA 2KTYA 1R78A 2OJIA 3HP5A 3VULA 4HJOA 1H28A 4IX3A 3OCTA 1OPLA 4HPTE 5ANJA 2YIXA 4D55A 5IMEA 3N4UA 3F2AA 5AP3A 4FZAB 4AZEA 5JZNA 4EJNA 5M07A 4Q9SA 2EVAA 4FV0A 3V04A 3IOKA 3ZSIA 4HGTA 5J95A 5FWKK 3WF6A 2V55A 3QD2B 3ID6C 5DMZA 3EN4A 3NEWA 2HZ0A 3FMEA 4FV1A 2BRNA 4K6ZA 2B53A 3ZUTA 4M14A 4YHTA 3P86A 2GQSA 4U5JA 5JRSA 4OTFA 2J0IA 5EI6A 3ZXTA 3FY2A 4C59A 3TXOA 3QCQA 3ZO2A 3OOGA 2IZTA 3V5JA 3DK3A 4EK4A 4JXFA 3R8VA 3DNDA 1CKJA 3HECA 3MIAA 4IZAA 4IM0A 3A4OX 4YC8A 4ZJIA 4BWKA 4ZLZA 4DF3A 3EQCA 3LCKA 4RC3A 4O1OA 4ZSAA 1Q97A 2VTRA 3CC6A 3LJ0A 4BI1A 1OL2A 1Y6BA 1QMZA 1H1QA 4FT7A 4J7BA 4EK6A 4ANOA 3F3UA 2XKEA 2NP8A 3UZRA 3VS7A 2IVSA 4WG3A 4CQGA 1OGUA 4C33A 5IF1A 5FM2A 4FTLA 3ACJA 4I22A 3L8SA 5AV1A 4GKHA 4OUCA 4ZIMA 5CXZA 4HCTA 4XS2A 2C0OA 1F3MC 5JEBA 3CSVA 1I09A 2R4BA 4FC0A 4JIKA 3V5PA 4XG6A 4DFNA 5CYIA 4CFWA 4DT9A 2V0DA 2YACA 4DGGA 4OTQA 3DGKA 5HOAA 2PMIA 3V8TA 4AN2A 3AXWA 3BE9A 3V01A 3VS3A 4APPA 4ZY6A 2REIA 4ACHA 4ENXA 3KXZA 5DA3A 4DGOA 2OSCA 2JAMA 5HQ0A 4FI1A 3FMKA 4N0SA 3KRWA 4X2JA 4ZTHA 4F6WA 4PMPA 3GNIB 3PXZA 4FKGA 5E8UA 3RALA 4ZEGA 4WRSA 5HICA 3TUCA 1VYZA 1XBBA 5E8TA 3FXXA 4L6QA 1UA2A 1H24A 2C6DA 2QOHA 4CMOA 3IO7A 3DLZA 3Q2JA 3COHA 1PMVA 2XIKA 4IX6A 1IAHA 5EKNA 3TWJA 5L8KA 1TQIA 3PY3A 5CVFA 2BZIB 2I40A 4FKPA 3HNGA 5AP5A 3BWJA 4FNYA 3ZMMA 4DEBA 4L45A 2ZOQA 4R8QA 2J6MA 4KA3A 5IDPA 2JKMA 4G34A 2Z8CA 4BCMA 5IUHA 5LVMA 2CJMA 3LQ8A 1BMKA 2PWLA 3QCSA 4F09A 4C3RA 2UZLA 4K8AA 3U9NA 3QRKA 5CU0A 3G6GA 1W0XC 4NYEA 2OIQA 4BHZA 3QQJA 4O6EA 4FOCA 3UODA 5HLWA 4RA4A 5H8BA 1XH9A 4R7HA 3QQLA 4GFOA 4W9WA 5AR4A 2QOKA 4CYJA 2B0QA 2W1CA 3H4JA 5HZNA 4PDPA 3BQCA 4C02A 4ASDA 2CGVA 4IM2A 5C8MA 4FGRA 3Q9XA 4BWPA 2QVSE 5A46A 4DEHA 4RFMA 2UW0A 1JSVA 1K9AA 3GBZA 3QTZA 3AC2A 1FOTA 2UZOA 5FDPA 2CKPA 4YZDA 1OKYA 4GKIA 4FKOA 4FL2A 2C1BA 1KUTA 1SMHA 4BTFA 3BRBA 5JKGA 5BVFA 2J0KA 4ZY5A 3MVMA 3UVPA 4RJ8A 1PF8A 5I4NA 3D5XA 4AT5A 4DH3A 2OH4A 1YXSA 2ZDUA 3L8PA 3U4WA 5LWMA 4OAUC 3F9NA 2UW6A 2VZ6A 3K5VA 2IVTA 3ALNA 3MYGA 4UYNA 4QYFA 4V05A 3QUPA 3EFJA 3OW4A 4U81A 2BRGA 1CTPE 4KWPA 3DKCA 4MNEA 3LCOA 3RPRA 3UOKA 3BLRA 3GEQA 3BCEA 3LXPA 5M06A 3N4VA 2WZJA 3BYOA 3EN7A 4N70A 3FXWA 2OGVA 3DAEA 5D10A 3ZBFA 1UKIA 2H9VA 4EHVA 5AAFA 2YFXA 4BY9E 3GOPA 4U6RA 4H05A 2GHMA 4C62A 4MD7E 2ETMA 4QNAA 3NRMA 3GCVA 5CAUA 3O8TA 3II5A 1H1RA 3MFSA 5DOSA 2X39A 5L2WA 1M14A 4YLKA 5M4IA 3FAAA 5CU2A 2OICA 3QWKA 5AR8A 3ZEPA 4S32A 4BIBA 4RZVA 1OUKA 2JFLA 2VWXA 3A61A 4PPAA 4QQCA 5BQ0A 3OXTA 3CBLA 3OTUA 5IEVA 4PQNA 3IPHA 4RMZA 4A9RA 4ZJVA 2ONLC 5CALA 4FIIA 5HTIA 4D2VA 3VS4A 3SG9A 1HOWA 3L8VA 2A4LA 2W9ZB 2YM5A 3MIYA 1PXJA 3AMAA 2CLQA 4AZFA 2CN8A 3DPKA 3QRTA 4OTHA 4EK3A 3CKWA 1KWPA 4HGLA 4QPAA 4HNFA 4EHEA 4DE4A 4PWNA 4FKRA 1QPCA 3AD6A 3ANRA 4I6HA 3R2BA 2C5OA 1YXTA 4AA4A 5EM5A 3IDPA 5A4TA 2HOGA 3N51A 3CP9A 4L7FA 4M13A 1Q8YA 5H3QA 1QCFA 5BVOA 1FVRA 4W4XA 4XP3A 4V04A 4ZMFA 1PMUA 2WTIA 4JIAA 2W06A 4BCGA 3FSFA 3KFAA 2QODA 3IW7A 2V5QA 2IJMA 5EOBA 4L7SA 5FXRA 2IPXA 3PDTA 3MFTA 3ORIA 3QBNA 2GNJA 4FT3A 1ERKA 5KZIA 2GPHA 3BYVA 4JDKA 5EQYA 3BELA 3H9FA 4FTRA 4IM3A 4JL9A 3O0GA 4NT4A 3FZOA 4IVDA 4F4PA 1ND4A 3ODYX 2PUNA 3C50A 3PLSA 4IB3A 4X2FA 4YBKA 3TN8A 3E3PA 3H9RA 2P3GX 3UOLA 1BKXA 3GUBA 4UZHA 3RHKA 4CKJA 4F9YA 2BDJA 2O65A 3R8PA 3RK7A 5K3YA 3LCSA 4A7CA 3VQHA 3TTJA 3C51A 3EZVA 3VW8A 4A9SA 1J1BA 5CAPA 2FYSA 3Q96A 1Y57A 4H3QA 2ZM4A 3FYKX 4II5A 5AEPA 3VF8A 4AZSA 1UKHA 1A9UA 3FMLA 5CQWA 2VTQA 4BGGA 3TKIA 3V5WA 1PKDA 3NR9A 5L6WL 1PXOA 4LM5A 3D5UA 4K33A 5E91A 5BYZA 3VHKA 3LIJA 1ZZ2A 5HE1A 3LQ3A 1ZYDA 4YHFA 3ZH8A 5BVKA 4HCVA 3UGCA 2WQOA 2BILB 3WZUA 5LJJA 2OK1A 3PA3A 4XH6A 4TPTA 1PHKA 4F1MA 4LQMA 4IZYA 4RC4A 5HU3A 1XH7A 4AS0A 4G5PA 4FT9A 3V6SA 4EZ7A 3VHEA 1UV5A 4R1VA 2VWYA 4LUEA 4NZWB 5HU9A 2JFMA 1E1VA 3BZ3A 4PL4A 2GU8A 2VWZA 3FV8A 3MH1A 5CF8A 1GNGA 5KZ0A 3R04A 3SX9A 1P4OA 5M56A 2YHVA 3R63A 1MQBA 4OGRA 5JZJA 3HAMA 1H27A 2X7OA 4IADA 3SW4A 2C6TA 3A62A 1A48A 5J7HA 4CT2A 2G2IA 4YJPA 4TXCA 1OMWA 4YTFA 4R6VA 3W1FA 3PSBA 5KMNA 4NM7A 3TDWA 1H1PA 3PG3A 2Z2WA 2VX1A 3CJFA 3QTRA 5L2QA 1ZMUA 1VEBA 3TZ9A 3FQEA 3ZLSA 3KXXA 2FSTX 3MN3A 4GT3A 4E26A 3QD0A 4BR3A 5C01A 3QD3A 1JOWB 1PYEA 4FL3A 4J8MA 2VTPA 3M11A 3W2CA 3DBQA 5IA1A 5L4QA 4MXYA 4RJ4A 4XOZA 2X0GA 1UNLA 4MQ2A 3NVKI 4AW2A 2ERZE 2X7FA 4XV9A 4JR7A 4UN0C 3MA6A 4AZWA 3PRFA 5HIEA 2VAGA 4CFUA 2GQGA 1FMOE 2BZJA 2WQEA 3HX4A 4FIEA 4RX9A 3RAWA 2W5AA 3TNHA 4F08A 4ALUA 3NVMB 1ZWSA 3LFCA 5KUPA 3G90X 3GI3A 1IASA 4U80A 5K4JA 4XV1A 3F5GA 1H4LA 2PY3A 4X0MA 5FXQA 3MJ1A 3Q32A 2JIIA 3ZFXA 3VS2A 2RFEA 2JD5A 4YC6A 5EI8A 4FVQA 3SQQA 4AE6A 4IQ6A 4EYJA 1RW8A 2Y8OA 5FBOA 2E9PA 3OWKA 4EOKA 2HW6A 4X2GA 4NJDA 4AUAA 2RF9A 1P4FA 2OXYA 4CV9A 1ZOHA 3QTIA 4FSYA 4Y8DA 5IU2A 5I5ZA 3F3ZA 4D4YA 4RLLA 5AP6A 3UYSA 4A9UA 5HBJA 5IQGA 1A06A 3OVVA 4YPSA 4YGAA 1J7IA 5A14A 5F95A 1KE8A 2WOUA 2C5VA 4TYIA 2PSQA 1G5SA 4DHFA 1FVVA 3MY0A 3KY2A 4LOQA 3O8PA 2R0IA 1J7LA 2WFYA 3OCSA 3FSKA 5CU4A 1Y91A 4I6QA 4CYIA 2EU9A 4IJ9A 4OTRA 3EQDA 3VBVA 1YOMA 2VTAA 5ANKA 4AAAA 5AADA 3W8LA 4CSVA 4ANBA 4M12A 4C38A 4USFA 3P4KA 4NIFB 4GVJA 4ZK5A 5E7RA 1NA7A 4IWOA 1PMNA 2OZAB 3ET7A 3HYHA 3M42A 4MBJA 4LFIA 3QXOA 4BZOA 3ERKA 3TV7A 2YEXA 2AC5A 4BCOA 4CV8A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3DS6 A;  4GU9 A;  2WHB A;  3EQH A;  3IK3 A;  2W4O A;  3NYN A;  2RIO A;  2IZS A;  3E8D A;  4PTC A;  3LFF A;  4XRL A;  2V7O A;  5BPY A;  4UWY A;  4HVH A;  3GC7 A;  4LRM A;  4YU2 A;  4X6R A;  4F6S A;  1ZY4 A;  3LZB A;  4C61 A;  3PG1 A;  3NLB A;  5CEK A;  3LMH A;  3DKF A;  4RIY A;  5EYK A;  3EB0 A;  1GZK A;  2OKR A;  4FNZ A;  2QNJ A;  4QYE A;  3RM6 A;  2YZA A;  3O50 A;  4F99 A;  4DLI A;  4G3G A;  5IPJ A;  4BWX A;  3HL7 A;  4FNX A;  3P78 A;  2X2K A;  3VBY A;  2JDO A;  2VGO A;  4UXQ A;  1R0E A;  3F3V A;  3R02 A;  4ERK A;  3TDV A;  4ZSG A;  1Q3D A;  2PE2 A;  2VWB A;  3GGF A;  1TKI A;  3MA3 A;  2R3O A;  4KS7 A;  4KBC A;  5AR2 A;  5IUI A;  2YWV A;  4FEU A;  3P7A A;  1H25 A;  4E6A A;  2VO0 A;  3AC4 A;  4M84 A;  5TR6 A;  3R83 A;  3T3V A;  3UQG A;  3H3C A;  3OCG A;  1YDT E;  3F82 A;  1WBS A;  4OTI A;  1PW2 A;  4F1T A;  1IAJ A;  1OPJ A;  4GFM A;  2QKW B;  1M52 A;  5CEQ A;  4FBX A;  3BX5 A;  2WTD A;  3R71 A;  2PVK A;  4TWP A;  4X7Q A;  5M44 A;  5FRI A;  1ZYL A;  1NY3 A;  4KKH A;  3E62 A;  1JKK A;  3RI1 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4NUS A;  4AW5 A;  4BDH A;  4V01 A;  4M0Z A;  2XH5 A;  3SXF A;  4GH2 A;  4XBU A;  2HWO A;  3FHR A;  4ZTM A;  2PVJ A;  3OMV A;  2ACX A;  1LUF A;  3K5U A;  4BI2 A;  1Q41 A;  1XWS A;  2ZV7 A;  3GCS A;  3ORX A;  4JBP A;  2XCH A;  1WMK A;  2F9G A;  2YJS A;  3OUN B;  2C5X A;  4FV9 A;  3VID A;  5I3R A;  4CZY B;  3MI9 A;  4PTE A;  3GC8 A;  4C57 A;  5DGZ A;  3UP2 A;  2O2U A;  3N9X A;  3GCQ A;  3O8U A;  1JKT A;  1YHV A;  4IB0 A;  3DXN A;  1H00 A;  3QTS A;  4QP1 A;  5CEO A;  4W4Y A;  4KIK A;  2UW5 A;  4RX7 A;  4XRJ A;  4ACM A;  4JJR A;  4LRK A;  2JKQ A;  4OTG A;  1ZXE A;  4BDC A;  4ZJJ A;  4FV4 A;  4U3Z A;  4FT0 A;  4K9Y A;  3ZEW A;  4DBN A;  3NUX A;  2Y4P A;  3E5A A;  2QQ7 A;  4KIQ A;  4YP8 A;  2HXQ A;  4W4V A;  4HPU E;  3PTG A;  2OG8 A;  4D9T A;  2J0J A;  4EH5 A;  4JNW A;  3FLW A;  2FGI A;  5LCK A;  4EOR A;  3W0Q A;  3KXH A;  4UMR A;  4JDH A;  4MK0 A;  2CCH A;  2FSO X;  4YLJ A;  4O91 A;  3D83 A;  4MNE B;  4MXX A;  5DR6 A;  5EHY A;  3POZ A;  4CQE A;  2W1I A;  5LMK A;  3UE4 A;  5GJF A;  3BYS A;  3FLS A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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