5AX3A

Crystal structure of erk2 complexed with allosteric and atp-competitive inhibitors.
Total Genus 71
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
71
sequence length
349
structure length
329
Chain Sequence
GPEMVRGQVFDVGPRYTNLSYIGEYGMVCSAYDNVNKVRVAIKKISPFEHQTYCQRTLREIKILLRFRHENIIGINDIIRAPTIEQMKDVYIVQDLMETDLYKLLKTQHLSNDHICYFLYQILRGLKYIHSANVLHRDLKPSNLLLNTTCDLKICDFGLARVAFLTEYVTRWYRAPEIMLGYTKSIDIWSVGCILAEMLSNRPIFPGKHYLDQLNHILGILGSPSQEDLKARNYLLSLPHKNKVPWNRLFPNADSKALDLLDKMLTFNPHKRIEVEQALAHPYLEQYYDPSDEPIAEAPFKFDMELDDLPKEKLKELIFEETARFQPGY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Identification of allosteric ERK2 inhibitors through in silico biased screening and competitive binding assay
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase 1
total genus 71
structure length 329
sequence length 349
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2015-07-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5ax3A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5ax3A01
1YDSE 3PE1A 3OROA 1PXMA 4D0WA 3RM6A 2UZLA 2XIKA 4RVKA 3NIZA 3NSZA 3VJNA 3IGGA 2X6DA 4DCEA 3PRIA 4O81A 3ODYX 1FVTA 5AUTA 2IZUA 4BI0A 1RE8A 3DAEA 4OTRA 3DB6A 5EM8A 4EWHA 1A9UA 3UE4A 3FMKA 3FZRA 4G5JA 4QTAA 4YMJA 1XJDA 1BYGA 2WQNA 3OW3A 2PZIA 5AR2A 4LRJA 2X39A 2B55A 4MF1A 4AAAA 3RWPA 5GZ8A 3IW5A 2Z02A 3JYAA 5F94A 2ZM3A 3GU5A 4FR4A 4PRJA 3AMBA 5E1EA 3DQWA 2PHKA 4PV0A 2XS0A 4P90A 4JRVA 5CAUA 2GQSA 4ZY4A 3G2FA 4J52A 1OM1A 3NGAA 1Y6AA 4X3FB 4FODA 3H0YA 2J90A 3E92A 4FL1A 1H8FA 4I6BA 2I6LA 3SOCA 5IEXA 3KXZA 3BQRA 3ORPA 4DH3A 4ZTMA 1TKIA 2VWUA 4PPCA 3QGYA 2O2UA 4XG4A 3NCGA 1Y6BA 5DT4A 4FTJA 3QF9A 3O7LB 4BZNA 3BBWA 5DR9A 2QR8A 3UC4A 2UW9A 3R02A 3R7IA 1O9UA 5E92A 4M68A 3RHKA 4DEEA 4BCIA 5EI6A 5ANOA 2C6LA 3C4XA 3WE8A 3LQ3A 2OXDA 5GNKA 3EN7A 3PJ8A 4ITIA 4CQGA 5JFXA 4DA5A 3A8XA 4X2FA 3WZDA 1Y91A 2BRHA 4P2KA 5IA3A 3O8UA 3IKAA 3ZC6A 1H26A 3PA4A 4I6FA 4LOPA 4KNBA 5KKRB 3OFMA 1JKLA 3VQHA 2OICA 3WILA 3QD3A 1PW2A 3MV5A 1Q8ZA 2CSNA 3BPRA 1RJBA 4LM5A 4BTMA 4FV3A 3PDTA 3D5VA 2JAVA 3FY2A 2BIYA 2Y4IC 4BBMA 3ORTA 4D5HA 4E4MA 4F08A 3E88A 4BDFA 3ATTA 3EKKA 3EQGA 1IRKA 3I6WA 4TYJA 4BTFA 4DYMA 2R0IA 4S32A 2P55A 2YIQA 3C51A 4NT4A 2R3PA 3LMGA 4U0IA 2WMRA 3CGOA 4ZTRA 3H0ZA 3H4JA 2Y0AA 5AA9A 3KKVA 4K2RA 5E1SA 2VTQA 3DZOA 3KK9A 5EH0A 2ETKA 4O96A 1UNLA 4IJPA 1CKJA 4QQCA 5KMNA 5LMKC 4CMTA 3U54A 3GXLA 3KA0A 2VUWA 3RZFA 2W9ZB 3BI6A 3FPMA 3JPVA 5EI8A 2PTKA 2Y7JA 5T6KA 3V51A 4KSPA 1OKWA 3ZDUA 3VJOA 5CF6A 1IASA 3IS5A 3LFCA 2G15A 2UZWE 4YLJA 4BR3A 3KXXA 4IZ7A 5E8VA 1ZYSA 5M53A 2JFLA 1FQ1B 4XP0A 4S2ZA 4FZ7A 5JFVA 2AUHA 1ZYDA 2XKEA 4KINA 4JQ7A 4B7TA 4U44A 4MWIA 4R1YA 4Y8DA 3KN6A 3R04A 2HYYA 1XH4A 3MN3A 3IDBA 2JDSA 3AXWA 1Q5KA 2PULA 4BY9E 3RP9A 4IVAA 5EQPA 3GCPA 3R7YA 3U51A 4XOYA 4EC8A 3ZLSA 2HOGA 3R83A 2FYSA 2GNGA 2PVHA 3PTGA 3K54A 2Y9QA 1K9AA 3FXXA 3QYZA 4B0GA 4FKPA 5HU9A 2XIRA 2J4ZA 3EOCA 2WTKC 2R3OA 3HL7A 4PPBA 2RFDA 1RDQE 4WD5A 4USFA 3SOAA 1OBGA 3SAYA 2XBAA 4EH4A 4MNFA 3MI9A 3CJFA 1H0VA 2R3GA 2R7IA 4QP4A 5CXHA 5D11A 3PY0A 2G9XA 3HVCA 3DBDA 3GCQA 3MW1A 1WBOA 2G2HA 2R64A 3MH1A 2ETRA 5IEVA 5B2MA 1PXJA 3ZTXA 3QUEA 4F7NA 4BYJA 4NM3A 4CFNA 3U8WA 5M51A 3DNEA 3SQQA 4XG8A 1Q4LA 3FUPA 3LE6A 3V5WA 4EH9A 4TZRA 5AV0A 3D14A 5KX8A 4D4YA 2R3MA 3Q4TA 2PE2A 4ENXA 4F1OA 4FSWA 2QOBA 3FLNC 2PUNA 2PU8A 5D12A 5FBOA 1NT2A 5EM5A 2QG7A 1J7UA 1BX6A 4L3LA 3D5WA 2VTPA 3EN5A 4FMQA 4KD1A 3CPBA 3DLSA 3ZONA 4EC9A 4EZ3A 5K5XA 1M7NA 1XWSA 3DBFA 3HAVA 3UVQA 4Y83A 4C2WA 4F6UA 3M42A 3KGAA 2FB8A 2PY3A 1OIUA 3FMDA 2XRUA 3PXYA 1AGWA 4G6LA 4J98A 2JKMA 4Q9SA 3FQHA 1GIJA 1H1QA 4C3FA 4QMLA 3R9OA 3D9VA 3LQ5A 4FUYA 4YJRA 3ZFXA 2JDOA 3C4FA 3W8QA 3IDPA 4AE9A 4X2GA 5DRBA 4DFNA 4GVJA 3PYYA 4MD9E 4Z55A 2IZRA 4D4SA 3T3VA 4IB1A 3V01A 4G31A 1PMUA 4JG6A 4KRCA 4WNMA 2HIWA 1URCA 4BDEA 4V01A 3KRRA 4ZMFA 4PY1A 3FMEA 3A99A 4FSYA 4LRKA 2PVKA 2E9VA 4CYIA 2GQRA 3U55A 2UW7A 3N51A 3RAIA 1OIYA 3ZFYA 4FZAB 4PDSA 2YM8A 3FQSA 1OI9A 3JVSA 1REKA 4R6VA 3LAUA 5I9VA 3HMNA 2V7OA 3LLTA 3RCJA 2EVAA 2OGVA 5FDPA 3CIKA 2GHMA 3Q4ZA 3ZOSA 4U80A 3GT8A 3L8XA 2RFSA 4C38A 1FMKA 2ZV7A 2FA2A 3G15A 1OZ1A 2OSCA 4PMSA 3RI1A 4OT5A 3F5XA 4C35A 3H9OA 4WSYA 4WUAA 3I1AA 5JGBA 3PSDA 4GUBA 4WRGA 2R3FA 4J95A 2GQGA 3BBTB 3BX5A 2CGUA 2W4KA 4EH6A 5BUEA 3P9JA 4C57A 5DFPA 1SMHA 3BHVA 3R8MA 4YLKA 4IZAA 3NX8A 4U81A 4BKJA 2GCDA 4OBQA 4DBNA 1JKKA 2IVUA 4BFMA 5TF9A 2B9IA 3ZZWA 3VUKA 1H1RA 5E8UA 3LXNA 4IWOA 2YM6A 3IW4A 3ORIA 4FG9A 2FSLX 4JX7A 5BYLA 2R5TA 3NDMA 4IDVA 1OL2A 5HD7A 3W18A 2UZOA 3QTQA 4K1BA 3D15A 5I9UA 1Q3WA 4J8MA 4XLIA 4ZSEA 4D2WA 2ESMA 1PF8A 2PVMA 3Q9XA 4RPVA 5LVPA 3VRZA 1M7QA 4OTPA 1P2AA 4R7IA 2WB8A 3DKFA 1KE6A 2QOKA 1OB3A 2UW8A 3TUCA 2F2CB 2W4OA 2YM4A 1FVVA 1T45A 4FYNA 5KMLA 1ZMVA 1CTPE 4HZSA 4X7QA 5HIBA 5KO1A 4I0RA 3BZ3A 3COMA 1PXPA 4B9DA 2QR7A 3C50A 3WE4A 4JR3A 3H3CA 1U4DA 2QONA 3GENA 4K11A 4R5YA 3E5AA 3Q6WA 4IAZA 1O6YA 4QTBA 5CNNA 4RQKA 4DGMA 2GS7A 2BDWA 4RIWB 4E20A 4FEVA 3DBCA 3CEKA 4RZWA 5AIKA 3TNWA 3VS0A 4FYOA 3PP0A 5KNJA 5LWNA 2YFXA 3G33A 4ZZNA 4EI4A 2IW8A 4DG2E 2UUEA 4Q9ZA 2J6MA 3FI3A 4BCKA 3ATSA 1OGUA 3RWQA 4BCQA 3EFJA 5E8XA 1PYXA 5A4TA 2JIVA 2YIYA 3DDQA 2WZJA 2HZNA 4L46A 4NW5A 4RWJA 4DEHA 3UOJA 3OY1A 5H2UA 2Y6MA 3L8PA 3V8SA 4L67A 3HDMA 4J71A 3RM7A 4H3BA 3OP5A 4DHFA 2C5YA 4F7SA 3NWWA 4JQEA 3NNUA 4BGGA 4GSBA 3E8NA 3LFSA 3QHRA 4KIQA 4UALA 3D7TB 3R1YA 3OT8A 5AX3A 4CSVA 2I1MA 2VU3A 3OWPA 3C4CA 1GZOA 2RFEA 3KVWA 4FKLA 4FKOA 4QMUA 3P7CA 3VBVA 4D2RA 2C5NA 3KCFA 2W1HA 4GFGA 5CLPA 2OFVA 2WMSA 4GJ2A 4RFYA 4UXLA 3VVHA 5JGAA 3O7LD 2YDKA 2PVJA 3BRBA 3D2IA 5FXRA 4YJTA 3DKGA 3O51A 5DT0A 4ZZOA 4ANOA 3ET7A 5G1XA 4LV8A 2W1EA 5AFVA 1UV5A 2G2IA 2WEIA 1B39A 1W84A 2QI8A 3FZTA 2BILB 4XG9A 4YHFA 2BKZA 3LW0A 2F4JA 3IW8A 1YXTA 2NPQA 4JR7A 3T9IA 2E9OA 3QRKA 5CASA 4G3GA 2OKRA 3L8VA 5JQ5A 4PPAA 3Q3BA 1SM2A 1SVGA 4IXPA 1VJYA 2QO7A 4Y85A 2HZIA 4O7YA 5HE3A 3Q96A 3JY9A 3R9HA 1YXUA 3MVJA 4D2SA 5CY3A 3HYHA 3OT3A 3OHTA 1O6LA 5DHJA 4AT5A 5IA2A 3N4TA 4EQMA 3EFWA 3EZVA 4RIYA 1B6CB 4A9RA 4NEUA 2YJSA 5CF4A 3SXFA 4F0IA 4GS6A 2UZVA 4LQMA 4RC3A 2YLEA 1W0XC 1W82A 2OI4X 3PG3A 1ZAOA 4TTHB 1FGKA 5LVLA 2IW6A 2UZTA 5DN3A 5HCZA 3GBZA 4DGNA 3CD3A 4YJUA 2YA9A 3AGLA 3CXWA 3LJ2A 2QOFA 5IDPA 4YU2A 2GTMA 2JBPA 3EN9A 5CF5A 4BCGA 2BRNA 2X2KA 1T46A 2PVYA 3ELJA 1SVHA 4U42A 1FVRA 3WBLA 1UKIA 2XYUA 2QOOA 4M15A 4X21A 5IUGA 2RG6A 3BU3A 2P0CA 4FV6A 4L6QA 5B0XA 3ZM4A 5AAGA 3P08A 5CSPA 4LGGA 2WTKB 4BCMA 1V1KA 4ANQA 5J79A 2OH4A 4LG4A 3UIMA 2W0JA 1ZY5A 2O64A 3NZ0A 4QP6A 3AC2A 4C37A 3V6RA 2YHVA 4X6QC 3EL8A 2C0OA 4FIGA 4RSSA 3VN9A 5HX8A 4QMPA 3IECA 3ZZEA 5IH5A 2ITNA 5I5ZA 3OCGA 2P2HA 4USDA 5J5SA 5IH4A 3DKOA 4CTBA 1PY5A 2XH5A 1V0PA 2JGZA 2R3KA 3UG1A 2CNQA 3ETAA 4I0SA 5JMSA 3BE9A 4AWIA 4YTCA 4ZTHA 5AADA 3B2WA 3Q2JA 1L3RE 1WBWA 3GC9A 3PPZA 4BHZA 2BAKA 2QCSA 4EEVA 4GH2A 1MRVA 1Q8YA 2Z7RA 1OBDA 4E4LA 3ID6C 3N4VA 3VBYA 4IX5A 4CMOA 3AT2A 4TYIA 4UWCA 5E8YA 4AG8A 4CEGA 3O23A 4MBJA 2GNHA 5IQIA 4WNOA 2XNNA 3MSSA 3FSFA 5A3XA 2PVLA 1U59A 2IN6A 3R30A 4G3DA 1H4LA 3PVWA 4DN5A 1W7HA 2OBJA 2YACA 5IQBA 2V22A 2WQOA 3FE3A 2W96B 2QOCA 4S31A 2VO6A 4E4NA 3S0OA 2X8DA 3MYGA 2R9SA 4ZJJA 4NUSA 4YC3A 3RPOA 4GIIA 4CT2A 5L4QA 2QKRA 2VX3A 4H1MA 2W9FB 4U43A 1PYEA 2IZSA 3TV6A 4R3CA 2YZLA 1K3AA 5AJQA 3FZ1A 4OBPA 1JPAA 4LL0A 5DBXA 3FI4A 4IMYA 3IDCA 2P33A 2WMAA 3QX4A 4QP3A 1Q62A 5DIAA 5E8WA 5IKWA 2BFYA 3RAHA 3W2OA 1ZLTA 4BICA 1K2PA 4F1MA 4F9WA 4O21A 5I9WA 3N9XA 1YW2A 2UV2A 5BPYA 3M2WA 4D9TA 4FKSA 5HORA 1ZWSA 4HNIA 4YR8A 2WPAA 2BZJA 3O50A 3AT4A 4FSTA 3V5TA 4C34A 5IDNA 3LCSA 4RWKA 5AP1A 4QMWA 4DG3E 2C1BA 3ORLA 1J3HA 2BTRA 2Z8CA 4DF3A 1YXVA 4D4RA 3SGCA 1ZY4A 4B99A 3EZRA 3HNGA 4MKCA 4F9CA 2GFCA 4Q2AA 1TQMA 3KRXA 4FIIA 3ROYA 2HWPA 3MIAA 3U9CA 4KBKA 3KEXA 4ANLA 4AQCA 4BTKA 2PPQA 1OITA 4G5PA 4FL3A 3ZLYA 4TRLA 5FGKA 5A4QA 5DVRA 3GQLA 3NS9A 3R1NA 1V0BA 5EQEA 3LFBA 4ALUA 4YGAA 3NRMA 4ZSAA 2X4ZA 4GU6A 3E8CA 3UNJA 4O27B 5D7AA 3HECA 1UVRA 4FSUA 3UZPA 2QOHA 3PWYA 3IW6A 4YPDA 4FZDB 3P1AA 2GU8A 5HO8A 3FZPA 4MK0A 5BUIA 3TV4A 3UJGA 2RF9A 4TT7A 3PLAE 3HAMA 1KOAA 2W1DA 3D4QA 4HVHA 5IEYA 3F3ZA 3OCBA 3RMFA 3QQLA 4P4CA 3QTRA 1CM8A 3PJ1A 1FBNA 2V62A 2J9MA 3UOLA 2OG8A 2HELA 5CYIA 5JRQA 4BI1A 4R1VA 4EH5A 4HCUA 5C8MA 1YQJA 2O5KA 4IZ5A 4U8ZA 4M69B 4UV0A 2B0QA 2WTCA 5ANGA 4L7SA 4WG4A 4U3ZA 3PPKA 3SG9A 2OO8X 5FXSA 1DAYA 3I81A 3HV7A 3QTZA 4XHKB 4ARKA 3S2PA 4QMVA 5CF8A 4JBPA 1YKRA 1CSNA 2OIQA 4RJ5A 1ZYJA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1YDS E;  3PE1 A;  3ORO A;  1PXM A;  4D0W A;  3RM6 A;  2UZL A;  2XIK A;  4RVK A;  3NIZ A;  3NSZ A;  3VJN A;  3IGG A;  2X6D A;  4DCE A;  3PRI A;  4O81 A;  3ODY X;  1FVT A;  5AUT A;  2IZU A;  4BI0 A;  1RE8 A;  3DAE A;  4OTR A;  3DB6 A;  5EM8 A;  4EWH A;  2ZFY A;  1A9U A;  3UE4 A;  3FMK A;  3FZR A;  4G5J A;  4QTA A;  4YMJ A;  1XJD A;  1BYG A;  2WQN A;  3OW3 A;  2PZI A;  5AR2 A;  4LRJ A;  2X39 A;  2B55 A;  4MF1 A;  4AAA A;  3RWP A;  5GZ8 A;  3IW5 A;  2Z02 A;  3JYA A;  5F94 A;  2ZM3 A;  3GU5 A;  4FR4 A;  4PRJ A;  3AMB A;  5E1E A;  3DQW A;  2PHK A;  4PV0 A;  2XS0 A;  4P90 A;  4JRV A;  5CAU A;  2GQS A;  4ZY4 A;  3G2F A;  4J52 A;  1OM1 A;  3NGA A;  1Y6A A;  4X3F B;  4FOD A;  3H0Y A;  2J90 A;  3E92 A;  4FL1 A;  1H8F A;  4I6B A;  2I6L A;  3SOC A;  5IEX A;  3KXZ A;  3BQR A;  3ORP A;  4DH3 A;  4ZTM A;  1TKI A;  2VWU A;  4PPC A;  3QGY A;  2O2U A;  4XG4 A;  3NCG A;  1Y6B A;  5DT4 A;  4FTJ A;  3QF9 A;  3O7L B;  4BZN A;  3BBW A;  5DR9 A;  2QR8 A;  3UC4 A;  2UW9 A;  3R02 A;  3R7I A;  1O9U A;  5E92 A;  4M68 A; 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