5BX0A

An automated microscale thermophoresis screening approach for fragment-based lead discovery
Total Genus 97
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
97
sequence length
344
structure length
315
Chain Sequence
ELELDEQQRKRLEAFLTQKQKVGELKDDDFEKISELGAGNGGVVFKVSHKPSGLVMARKLIHLEIKPAIRNQIIRELQVLHECNSPYIVGFYGAFYSDGEISICMEHMDGGSLDQVLKKAGRIPEQILGKVSIAVIKGLTYLREKHKIMHRDVKPSNILVNSRGEIKLCDFGVSGQLIDSMANSFVGTRSYMSPERLQGTHYSVQSDIWSMGLSLVEMAVGRYPIPPPDAKELELMFGCPMAIFELLDYIVNEPPPKLPSGVFSLEFQDFVNKCLIKNPAERADLKQLMVHAFIKRSDAEEVDFAGWLCSTIGLN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title An Automated Microscale Thermophoresis Screening Approach for Fragment-Based Lead Discovery.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 1
total genus 97
structure length 315
sequence length 344
ec nomenclature ec 2.7.12.2: Mitogen-activated protein kinase kinase.
pdb deposition date 2015-06-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5bx0A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5bx0A01
5FP6A 4JDHA 2PMIA 4RX5A 4QMZA 4QMNA 3GEQA 4GVJA 3GUBA 3P5KA 5HICA 5BNJA 4DBNA 4GK3A 3C13A 1LEWA 1YHSA 3BQRA 3DPKA 5GZ9A 3F3ZA 4QPMA 1S9IA 2HXQA 2WXVA 4LGDA 2R3KA 2PU8A 4ACHA 2YLEA 3MDYA 4R5YA 4BCPA 5LVNA 5H2UA 3WYXA 4MF0A 3FAAA 3WZUA 2RL5A 5DYJA 4OTDA 3HKOA 4BR3A 1NVQA 1PXOA 2VX1A 3MJ1A 4N6ZA 4O2PA 2CGWA 3UOKA 3ZRLA 2F7ZE 5AUYA 3ZHPC 3R7GA 4RJ4A 3SKCA 4DITA 3UZRA 4AG8A 3DB6A 3UQGA 3GC0A 5T68A 3KCKA 1OI9A 4G6NA 2C3LA 2VWBA 4IADA 4I6BA 3G6HA 5CU4A 5JGAA 3Q96A 5J7BA 5GINE 1BX6A 4JVGA 4DGGA 1CKIA 4XP0A 3QRTA 3ORNA 3GI3A 4WG5A 4CGAA 4G34A 3CPBA 1E1XA 5CSHA 2GQSA 2PVRA 3QTIA 3ZTXA 2BR1A 3TG1A 4TRLA 3F69A 3G9NA 3RZBA 5IF1A 2UVYA 3AGMA 4FSRA 3F5XA 4ZTMA 2FSMX 5HNBA 5LOHA 4I23A 2YIQA 4NTTA 4QTDA 2ACXA 3VJOA 3EJ1A 4ZY6A 5HU9A 3ZLYA 4AX8A 1I44A 1SVGA 2C5VA 5J95A 2UW3A 3O2MA 3PG3A 4ANNA 2XMYA 3NUPA 2RIOA 4FTMA 1B38A 3E3PA 2XEZA 1RJBA 2PZYA 3KKVA 4IWPA 1JSUA 1H07A 4IWQA 4EC8A 4O86A 4EQMA 4BBMA 1Y8GA 3B2WA 4F1OA 5J5TA 3SOCA 3NYNA 4X0MA 4FKWA 3ORKA 4IIRA 4BTKA 2LGCA 4O7LA 4C4HA 1FOTA 1U46A 3IGOA 5GIOE 2XIKA 1M14A 4FOCA 2IVUA 3SOAA 4CEGA 4F6UA 5CAUA 1MQBA 3QYZA 4O91A 4H36A 4KBCA 1SVHA 3FI2A 3EYGA 2ITQA 3LFCA 4FG7A 1OITA 5H9BA 3U4UA 3MVMA 5DIAA 3U9NA 4YURA 1H1QA 2ZV8A 3MH2A 2BVAA 2WOTA 2X8IA 2WOUA 3PXKA 5DG5A 2O63A 2A19B 2B7AA 2VO0A 1KE8A 2OZAB 4FT3A 4DH5A 1NT2A 2IVVA 2BTSA 3FYJX 3KL8A 4QP2A 4J1RA 4BIDA 3BHUA 2FYSA 1WVXA 3QKKA 1R1WA 3A4PA 3DBQA 4MVFA 4CNHA 2PHKA 4PMMA 4U6RA 5HVKA 4G3DA 3ANQA 5L6OA 1IG1A 5AV1A 3GC8A 4XV1A 4D55A 1O6LA 5K0XA 2HAKA 4F6WA 4D5HA 1OIRA 2J9MA 2RG6A 4WOVA 3QKMA 2LAVA 4WT6A 4XG4A 4F6SA 1B6CB 4GS6A 4YJTA 2BDJA 4C38A 3FZOA 4F9CA 4DN5A 5CAPA 4QRCA 3DNDA 5BVNA 2I0EA 2E2BA 5ETFA 5A46A 2ZM4A 4L9IA 3EQCA 5D12A 5ICPA 5DT4A 3I5ZA 4DG2E 4QPSA 2QODA 2QOHA 3IW8A 5AJQA 3W16A 3WARA 3ZO1A 3S0OA 5IQHA 4YGAA 5FBOA 1ZOGA 4DINA 3VBVA 4F70A 2BUJA 4RJ5A 3CPCA 3LCSA 4PPCA 2ZV9A 4V0GA 4G6OA 4BDAA 2XNGA 4GUBA 4BKYA 3R83A 4CMTA 2IZSA 4FV6A 3W10A 4EOJA 5AR3A 4QMMA 1PRYA 3LXPA 2J0IA 4IM0A 4R1VA 4UZHA 4KKGA 3PJ3A 4WG3A 3MTFA 1OIYA 3N4VA 3JUHA 4O1PA 3WZJA 2X7GA 2Z7SA 4BDEA 3EOCA 4YJUA 2CNUA 3WILA 2IN6A 3V3VA 1DS5A 3O23A 4IX5A 3UTOA 3FKNA 5L2QA 2R3MA 2G2FA 4W4WA 3QA8A 2GHGA 5HOAA 1OM1A 4CLJA 4QMLA 2UW6A 3FPQA 2VX3A 3OOMA 3H9OA 4Z7GA 3D5VA 2ITWA 3R71A 5ETIA 4BRXA 2XM9A 3R01A 3D94A 4ACMA 1IAJA 3UG2A 2VTMA 1YDSE 2HZNA 4G6LA 5K5NA 5AUWA 5J1WA 3ZYAA 5BYLA 2OU7A 3PIYA 2WMRA 4R5SA 5JGDA 3Q52A 4NM5A 3FMHA 2ZDTA 3VS0A 2BDFA 2R3PA 2R5TA 5E8SA 3NX8A 4BYIA 4IBMA 1U59A 4EHGA 3VAPA 3Q4CA 1HCKA 4B8LA 4NWMA 4RRVA 4WNKA 4FNYA 3M11A 4EHVA 4LI5A 1DAYA 3CXWA 5BMMA 5FDXA 5C03A 2W06A 3KF7A 3AC8A 2XYNA 3BWJA 5I9XA 5E90A 5LVLA 3KEXA 4U7ZA 4CMUA 1ZYCA 3FZPA 1YRPA 5D7VA 2VO3A 3ODYX 4TYHB 4DFLA 2X81A 4LG4A 4J97A 2C47A 3GQIA 4UWBA 4Q9SA 4UYNA 4C36A 1NW1A 3MVJA 5HKMA 4C3FA 1WAKA 2CGVA 3WF8A 2X4ZA 3ORIA 2X8DA 4FKLA 5E8UA 3PTGA 5DOSA 2HCKA 3BGZA 4FKGA 2OXYA 3VS1A 3POOA 5EYMA 4ZLYA 5IEVA 2RSVA 2IJMA 4FL2A 4QYGA 3KY2A 5CNNA 2OF4A 2QG7A 3NW5A 2VTIA 5I9YA 4RZVA 4XMOA 1WMKA 3GCUA 4D9TA 2R3NA 4P2KA 3TKUA 1XBBA 5DR9A 4G3CA 3VUMA 5BUIA 4I6HA 4BTFA 1JKLA 2VNWA 4FSZA 3HUCA 4E4MA 1H4LA 2XK3A 4Y83A 3MY5A 4TZRA 3FBVA 3GP0A 3LXNA 3TTJA 2YM5A 1MUOA 1TQIA 1TVOA 3KMMA 4OTGA 3G5DA 4XOZA 3IECA 5M51A 2NNWB 1M2QA 5CT0A 4C02A 3GOPA 4NZWB 4YZBA 5M06A 3QWJA 4FIEA 2QOLA 1OUKA 3QLGA 1YWRA 2BRNA 4UZDA 2ITPA 1YWNA 3CQUA 3BU6A 4MXCA 5CY3A 2W4OA 3COKA 2CGUA 3DFAA 4FT0A 4FTCA 4IAZA 3UNJA 4L67A 4RT7A 3UIBA 2Q0NA 1Q8UA 4IAYA 5DE2A 3ZEPA 5M4UA 5IA0A 4NKSA 1GZ8A 4YBJA 2XNMA 5EW8A 3QQHA 3UYSA 5K4JA 4O7ZA 3EL8A 3FXZA 3R8UA 4F9YA 2OW3A 4ZTQA 2WTJA 3BWFA 2UW5A 1UVRA 2DWBA 1JPAA 4G5PA 3ZDIA 3ZEWA 3QCSA 2UZEA 4RPVA 5AFVA 4GG5A 1OKZA 4O0UA 4FL3A 4BI0A 2GS2A 3EQDA 2O3PA 3L8PA 4GUEA 3BYSA 2X7OA 4S31A 3HRFA 3M2WA 3BHHA 2XKFA 3NLBA 4IAKA 4KD1A 5DNRA 3V5TA 2IO6A 2RF9A 3HV5A 2XH5A 4DGOA 1YI4A 5FRIA 4NYEA 3AT3A 4RIWB 3SG9A 4P4CA 5EW3A 1P14A 3VUDA 2OJFE 3FZRA 4HJOA 4V05A 2PZPA 3G0FA 2Z02A 5IMXA 3DJ7A 3V8WA 2EVAA 2OXDA 4J71A 4LQMA 4KS7A 3ZUVA 2IW9A 2QR8A 1JVPP 3IGGA 3PXQA 5EYCA 3TIYA 1R0PA 4ENYA 2CKEA 4W9WA 3QKLA 4U3ZA 2R3LA 4WRGA 4BZDA 5EW9A 3A62A 3QXOA 3ZO3A 5A4TA 5HVJA 3V6SA 3MESA 4NH1A 3LCDA 4EBWA 1K9AA 2I6LA 4RJ8A 1H1PA 3CJGA 3ZCLA 3TNPC 4ITJA 2YHVA 3DAJA 5HTCA 4XP3A 4BHZA 5TO8A 3NCZA 4RGJA 1AQ1A 5I9WA 1OMWA 5HGIA 5HORA 3UMXA 4TYHA 4YZ9A 4CG8A 4AW1A 4FIJA 3TIZA 4NFMA 1UWJA 4QQJA 4J98A 5CF5A 1G8AA 2HXLA 3MH0A 4FZ6A 3S2PA 2A2AA 4ZIMA 3WYYA 2JC6A 4ZSAA 3RGFA 5JFSA 2YFXA 5IQIA 2XNBA 2XJ1A 3FL4A 5KZIA 3AQVA 3QTWA 2PVHA 1KUTA 3JYAA 3QZHA 3OXIA 4O2ZA 4PMPA 3C5UA 3RM6A 3O8TA 4XHKB 3S95A 2OZOA 2V7OA 4AZWA 2GTNA 2C6TA 2B4SB 5FEQA 2XS0A 3R28A 2YCRA 3KVWA 2WIPA 4UWCA 1H25A 2UZTA 2RKUA 5FM2A 5KX8A 3FLWA 5BMSA 3F88A 4NUSA 3R63A 3D15A 2WZJA 3DAKA 5FTGA 4F09A 1H08A 2J0MB 4UMUA 3I0OA 2C6OA 3VBYA 3GGFA 3I81A 5FGKA 3W2QA 3ZC6A 3EQBA 4F7SA 3ORXA 2HZIA 3OEFX 4PDPA 5BVFA 3RJCA 2OICA 4KNBA 4FNWA 2FA2A 2ITOA 5JZNA 2PY3A 5FTQA 3LVPA 1ZLTA 4QTBA 2WMQA 2ZV7A 1ZOEA 5HESA 1Y91A 3SX9A 4BDJA 1G8SA 4DEDA 3VUTA 5CU0A 3P4KA 2UZBA 5JN2A 3ZDUA 4UEUA 3PXZA 3R6XA 3PA3A 4BDHA 2FH9A 2WTVA 3CLYA 4FKQA 1XH7A 1H1RA 3QGYA 2W1GA 3DQWA 3COHA 2UZVA 1GOLA 3IO7A 4DFBA 2JBPA 3MB7A 3QQKA 2G01A 4U97A 2WQOA 3V8TA 3K54A 5GIPE 4OBQA 2C5OA 5AP1A 4M12A 3RWPA 4UY9A 4M84A 5F94A 2BKKA 4USEA 5JMSA 4FEWA 2PVMA 4FT7A 2VTNA 2XF0A 2H9VA 3R1QA 3OT8A 4AGUA 4DEGA 4M69A 5HIEA 5JT2A 3U6HA 2CGXA 4HCTA 5JQ8A 3OCSA 2HY0A 4L43A 3SW4A 2BMCA 4G5JA 2YA9A 3R22A 5CVGA 4F7JA 5T6KA 1JAMA 2JKOA 3FLQA 3W33A 3PSDA 3R9OA 1Q97A 4GJ2A 4YHFA 4C59A 3OUKA 3EHAA 2C68A 4AOIA 1PXIA 3DK7A 4XOYA 3NNXA 2R9SA 4OTFA 1Z57A 4RC2A 4K1BA 1ZWSA 3HRBA 3KRWA 2RFSA 4F99A 4KSPA 3DAEA 3IQ7A 3QD0A 3VJNA 4BTMA 4Z55A 4I0TA 5AP7A 2CKOA 1PKDA 1F0QA 2JIUA 3AC1A 4G3GA 3PXYA 2B55A 3S3IA 4APPA 5J5SA 3DBFA 1YKRA 2J0KA 3A4OX 1YXVA 4YUQA 3PY1A 4LL5A 5G6VA 1M2PA 2C1BA 3TKIA 5CEQA 3DV3A 2WMVA 3G51A 5HE0A 4EJ7A 1Q99A 4O0YA 4WA9A 2PVJA 2ESMA 3HX4A 3UDBA 4RG0A 3R1NA 4FV1A 4C35A 2AUHA 3I6WA 3BQCA 2AYPA 3ACJA 2B9IA 5CU6A 5AR2A 2XEYA 5DR6A 5HTIA 2C5NA 4AUAA 3V5QA 3VBWA 2RFNA 4RA5A 5CALA 4F63A 2PL0A 3WOWA 2WU7A 5KBRA 2X8EA 4HPTE 1Q24A 4XX9A 3KK8A 4U80A 3RMFA 1BL7A 3QAME 4ENXA 4ZTLA 3BYMA 2WQBA 5KE0A 5L6WL 4TYEA 1PXNA 3HGKA 4GSBA 4JQ8A 5CU2A 4EOSA 1LP4A 2G9XA 3LCTA 4U9AA 5AIKA 5DFPA 4RQVA 3VBQA 3DDQA 3CEKA 5D41A 5LCJA 1RW8A 4KRCA 4F08A 2Z8CA 3CIKA 1OL7A 2V5QA 2XB7A 3Q5IA 4DGMA 3QBNA 2C6MA 3F3WA 4OTHA 5ANEA 4ACDA 3SXRA 3V5JA 5K3YA 3NYOA 4YR8A 1H27A 4WSYA 5E4HA 3HMIA 3R8PA 3QHRA 4LOPA 3MFTA 3PPJA 4CZUA 2FVDA 4ASDA 4C0TA 4FG8A 2JFLA 2EU9A 5A4QA 1WBPA 4AGWA 4C4JA 4WUAA 5DPVA 4APCA 4TXCA 1OKVA 4LUEA 1RDQE 1NA7A 3RINA 3I1AA 3MPMA 1UA2A 4IX6A 4K11A 1EH4A 4R1YA 3RM7A 2V7AA 3O7LB 4WKQA 3UO4A 3P9JA 2CLQA 4OAUC 3ZFYA 4KIPA 1H01A 4FV5A 4TWOA 5LVOA 3EH9A 4MNEB 3GFWA 3VUHA 4AWIA 5B2MA 1JKTA 3JY9A 1E9HA 4OGRA 2UUEA 4FX3A 4WNMA 2XA4A 3UNZA 5FD2A 4DC2A 5IA3A 4MWHA 3F66A 1S9JA 4RX9A 4EWHA 2BHHA 3SRVA 2FB8A 3R02A 4FTKA 2W1IA 4JR3A 4I5CA 3KULA 4U3YA 4AA5A 3GENA 4YTFA 1NXKA 1PMVA 2XK7A 2GHMA 1J7IA 3PLSA 2VWUA 4G3FA 4QMVA 4F0GA 4O84A 3OT3A 4UMRA 5B0XA 4FV7A 5L2TA 1J1CA 4LFIA 1OBGA 3VUGA 2C5XA 3ENHA 4QQCA 5C4KA 3E62A 4I0SA 3IDBA 4DFNA 2W0JA 5HIDA 5L6PA 4DG0E 3VF9A 3ALNA 4DLJA 2C6EA 1ZY5A 2VTOA 5M44A 3EFWA 3KN6A 4DEBA 5KMKA 3W2PA 1LEZA 1W98A 4FF8A 3GBZA 4KA3A 4AGDA 4BDKA 4CCUA 3FHRA 4I24A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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