5BX0A

An automated microscale thermophoresis screening approach for fragment-based lead discovery
Total Genus 97
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
97
sequence length
344
structure length
315
Chain Sequence
ELELDEQQRKRLEAFLTQKQKVGELKDDDFEKISELGAGNGGVVFKVSHKPSGLVMARKLIHLEIKPAIRNQIIRELQVLHECNSPYIVGFYGAFYSDGEISICMEHMDGGSLDQVLKKAGRIPEQILGKVSIAVIKGLTYLREKHKIMHRDVKPSNILVNSRGEIKLCDFGVSGQLIDSMANSFVGTRSYMSPERLQGTHYSVQSDIWSMGLSLVEMAVGRYPIPPPDAKELELMFGCPMAIFELLDYIVNEPPPKLPSGVFSLEFQDFVNKCLIKNPAERADLKQLMVHAFIKRSDAEEVDFAGWLCSTIGLN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title An Automated Microscale Thermophoresis Screening Approach for Fragment-Based Lead Discovery.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 1
total genus 97
structure length 315
sequence length 344
ec nomenclature ec 2.7.12.2: Mitogen-activated protein kinase kinase.
pdb deposition date 2015-06-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5bx0A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5bx0A01
5IF1A 3DAJA 3MVJA 3BELA 3QBNA 5M4IA 3R22A 4KBCA 4NCTC 5ITAA 4CKRA 4Z55A 1CKPA 5M4FA 3RCJA 4R1YA 4ANMA 4PMPA 5ETIA 2JDRA 1JOWB 2XK8A 4YHTA 3VRYA 4BWKA 3FHIA 4ASXA 1J3HA 3ACJA 3BQCA 3QQHA 2W17A 3TZ9A 4L43A 4CRSA 3W2OA 4D2RA 4EQMA 2XEYA 4IAIA 4IJ9A 2P4IA 4K8AA 4F9WA 3QFVA 4NM0A 2HW7A 5IQBA 4NEUA 4EUUA 5GZ8A 3CE3A 1A48A 5CQUA 4QPMA 5EYDA 3DGKA 4BDJA 4W8DA 1PYXA 5HLNA 4AT3A 4YJUA 3OWLA 2PHKA 3R8VA 2Z02A 4ZY6A 3GOPA 3TWJA 4BBFA 5DR2A 2J5FA 2VO0A 3SV0A 4FV8A 3QYWA 4YC8A 2JITA 1WMKA 4YLKA 3IECA 3A4OX 5DT0A 4H3QA 4BL1A 4XV1A 4ZSJA 3H3CA 3NWWA 5DEWA 5AUXA 1KE5A 3UJGA 5TOZA 4DC2A 5LCJA 3Q04A 4H3BA 3RINA 4KIQA 1FVVA 5JEBA 1MUOA 3LFNA 2FH9A 3R6XA 3R71A 4M12A 5CSVA 4EHVA 2VWIA 2WGJA 3GCQA 3PXKA 3FZSA 3HP5A 3QD3A 2JFMA 5GJGA 5E1SA 2UW0A 5AP3A 3HECA 4TYIA 3ZEWA 2YZLA 4TPTA 3CPCA 1ZOGA 1Y8YA 3DOGA 3QTXA 3CTQA 1H07A 3POZA 3G2FA 4OAVB 3TI1A 2NRYA 5ACBC 4WUAA 2BRNA 4E5WA 3LQ5A 5LCKA 3KQ7A 4PPBA 1OKZA 3CQEA 5EDQA 3UOLA 1URCA 3MFUA 3HUCA 3PVGA 2QR7A 4MQ1A 3F9NA 2B9JA 2Y4IC 3I5ZA 5JMSA 4E8AA 3TUCA 3TDWA 3OEFX 3F3WA 3JS2A 3L8XA 5FXSA 4QP9A 2CNQA 1NT2A 3WZJA 2H96A 5AIKA 4E26A 5DMZA 2A27A 3HV6A 5EYKA 4BB4A 3RTPA 2YIWA 3AD5A 1OM1A 1YI6A 3FE3A 5HLPA 3R83A 5CALA 1TVOA 3GCVA 4ACDA 1E9HA 4L00A 4QNAA 5CU2A 2F2UA 3CSVA 3EN4A 4OTDA 3F5PA 2O0UA 2QG7A 1P2AA 3UQGA 4V01A 2X2MA 1P4OA 3BHUA 4V0GB 3VBYA 5IUHA 3WF7A 2XUUA 3OCSA 3ZFYA 3EFJA 4X3FB 4XMOA 5HO8A 1JLUE 2WZJA 3MN3A 3FZRA 3L9NA 3PWYA 3ZS5A 2DS1A 5J1WA 2BZKB 2ITQA 4KNBA 3NYNA 2J51A 5CENA 3P7BA 1U54A 3E5AA 2ZOQA 2H34A 4GUEA 4NFMA 4XP2A 3TNQB 2ZJWA 4J96A 4YO4A 3FHRA 4AGUA 2V22A 5EOLA 3S00A 3TZ8A 4ITJA 1VJYA 3U55A 4FG9A 4R3PA 3B2WA 3WI6A 3ODZX 1U5QA 4FTAA 3T9IA 1PKDA 2PVYA 4O7ZA 3A4PA 2WHBA 3MA3A 4FNXA 5B0XA 3U9CA 1XHAA 2VUWA 4MF0A 4JNWA 2XNOA 4UMUA 5HD7A 2ETRA 4KRCA 4JVGA 3A7JA 3QXOA 4P90A 3E64A 4WG3A 3LFCA 3BEGA 1PW2A 2UW9A 2VTMA 3VF9A 5H3QA 4NIFB 1LP4A 4ZSLA 4BHNA 4GKIA 4A9YA 1JKKA 5AV2A 4F0IA 1OL2A 4I20A 4IX5A 2I40A 3KULB 3C4ZA 3DCVA 5CEIA 5BNJA 4RWKA 2W1EA 2OJ9A 4G9RA 3NX8A 2GQGA 4MBLA 4OBQA 4ZOGA 4HZRA 4UV0A 2YIQA 4JOAA 3Q9YA 4LG4A 3ZZEA 4O27B 4BTMA 3VW8A 2UZUE 3DS6A 3OXIA 4MWIA 2XYNA 5HICA 4XG6A 2O63A 5D41A 3MGYA 2YABA 3FMDA 2ZMDA 4QTCA 3VW6A 4ASDA 2BRGA 4EH9A 4H39A 2DQ7X 3C0IA 2P3GX 2XMYA 3N51A 4TWCA 4IVCA 4JI9A 3DNEA 4V04A 3MI9A 3VO3A 1BKXA 5JGBA 4K9YA 2BAKA 4O81A 3MH2A 2BKZA 5LQFA 4PTCA 4BDBA 3QALE 1UKHA 3I79A 2HAKA 3F2RA 1QL6A 3BU3A 2C47A 3NS9A 2F4JA 2BROA 4CV8A 5L2QA 1U54B 2UZEA 4GIIA 1YOJA 4AZFA 2Q83A 3FXXA 4HVSA 3GU6A 2XNPA 2CGWA 4ZZMA 4D0WA 4USFA 2W1IA 3RNIA 4MXCA 2QC6A 5HE2A 1FINA 4TT7A 4JS8A 2QQ7A 3I5NA 2VTAA 1XBCA 3EYGA 3C4EA 2H9VA 5TT7A 1NA7A 2IZTA 1LEWA 4YPSA 3ROCA 4BF2A 5CU6A 4CFNA 4QO9A 1XJDA 3O71A 3L8VA 3G5DA 3VBQA 1L8TA 2EXMA 2JBOA 2WQNA 4OTGA 2GNHA 1I44A 3PRIA 4JBOA 5FP6A 5C01A 2W5AA 4PDSA 2O2UA 4RMZA 3FKOA 3BZ3A 4IAYA 4M0YA 5E8TA 4JXFA 3RZBA 4HPTE 1DI9A 4U3YA 4C7TA 4MHAA 3HLLA 3T8OA 4DLJA 2E9VA 3UVRA 4FT9A 2GS6A 3H9FA 4Z3VA 3GENA 4TYEA 4RGJA 4Y95A 3IDPA 4YMJA 4G3GA 3ZLXA 4GRBA 1IASA 4NM7A 3E3PA 5FRIA 4RX9A 4IW0A 1JBPE 4PNKA 4ZTRA 1WBWA 2W5HA 3L8SA 4CYJA 1UNLA 2VO3A 3F69A 3RPYA 4CYIA 4DF3A 3LCSA 4C2WA 3CY2A 3GCSA 3EN5A 2B9IA 3LXKA 2YEXA 3NAYA 2J9MA 5AUWA 3I4BA 5EI8A 3ZDIA 4QYYA 5HOAA 4XH6A 3OCTA 2XNBA 3QKMA 4K11A 4ACGA 1LUFA 3PWDA 3PY3A 3RMFA 3VHKA 4YJQA 5BPYA 3RZFA 1JKLA 3P5KA 5A14A 1S9JA 2OJIA 3A7GA 3MIAA 5KUPA 3A62A 1OKWA 3ERKA 5H9BA 4BDKA 2XF0A 5AV3A 5EM6A 2VO7A 3Q60A 2YITA 3LJ0A 4YHJA 5E8SA 3G9LX 3R04A 2KTYA 4MBJA 1ZY5A 4AF3A 5CT7A 4RRVA 5C27A 2ZMCA 3UIBA 2Q0NA 4AE6A 1UU3A 2UZWE 3CXWA 5K0KA 4F70A 5DYJA 2ZB0A 4EZ3A 4X2KA 4C59A 3P78A 1XH7A 4NCTA 3UVPA 3M42A 3SGCA 3EQFA 4R3CA 2OW3A 4YBJA 1GZNA 2R3LA 4BIEA 1BYGA 2G15A 4NUSA 2BIKB 5M55A 2KULA 3VBWA 1WFCA 5C26A 2R3KA 2X4FA 3VUHA 3DJ6A 3PLSA 3W32A 4X21A 5EH0A 5HG7A 4S30A 3NVMB 2WU7A 2XB7A 4KSPA 2QOIA 1X8BA 3AC4A 4F9CA 3R9OA 2OXDA 3U6HA 4ZSEA 4C4HA 4FL1A 2XIZA 3EL8A 3FV8A 4KWPA 4LUDA 4NU1A 5IA0A 2RGPA 5B2MA 4M3QA 2CCHA 3PPKA 4P5ZA 5CSPA 4RZVA 4HGSA 2UZNA 4YPDA 4QP2A 4BZNA 2E9UA 5EI2A 2JC6A 3UDBA 2GS2A 2QOLA 3V8SA 3NCGA 3ZO4A 3PP0A 4UZHA 3CS9A 4XRJA 1UU9A 4QMNA 4LOOA 2ITUA 1NVQA 1Q41A 2WTWA 3ZOSA 4DFNA 5DN3A 4RBLA 1DM2A 4QP4A 4K2RA 4CLIA 4QMVA 4QRCA 4HYIA 4DCEA 4D4YA 3HUBA 4DH8A 3ZMMA 2WELA 2X1NA 1ZYJA 3QL8A 4YZDA 3UIMA 2WTKB 4ANOA 2OZOA 1STCE 2REIA 4QTAA 3R9RA 2ETMA 2QNJA 1GAGA 1G8AA 1GNGA 2B54A 4L44A 2R3FA 4ALWA 3P08A 4RJ7A 3IW8A 1U4DA 3C51A 3MV5A 4JQ8A 4ZLYA 1P5EA 5CYIA 2R64A 2VD5A 4Y73A 4ZAUA 4M67A 3FLZA 3VIDA 3LCOA 3FBVA 4WKQA 2QCSA 3PUPA 4TWPA 5EM8A 3UIXA 5FUTA 3BWFA 4DEBA 4O7LA 3PSBA 4BCFA 5CSWA 4LOQA 2ZV9A 3C5UA 2ZV7A 4IWOA 5BVNA 1OL5A 2J4ZA 4O2PA 3DPKA 4G3FA 3OUKA 3TNIA 4AOJA 3ORKA 2YCQA 4XG9A 3OTVA 4MH7A 4IMYA 3TKIA 4YSJA 2ZAZA 2OJJA 5CF4A 2JKQA 1TKIA 1UNGA 2CGUA 3TTJA 2VTNA 3ZC6A 5EKNA 3ID6C 1ZOEA 4PUZA 4O22A 3PDTA 1RW8A 5LXMA 1H1QA 2X7OA 2GNGA 4U6RA 3BBWA 3QTSA 3ZDUA 5IEXA 4JQEA 3WZUA 4LUEA 3JPVA 2ZDTA 2VNWA 4L7SA 4BDGA 2I0EA 4D4VA 2W05A 2Z2WA 4JRNA 4OR5A 3ZHPC 3FMLA 4DFYA 4YZMA 2XKDA 3COHA 2Z7LA 5AA9A 3V8TA 2C6IA 4LRJA 2AC5A 4FI1A 5F95A 3BCEA 4GK2A 4HYSA 4X3FC 3VUIA 4CD0A 2QVSE 3GBZA 4IZAA 3LOKA 2XZSA 5T3QA 3V8WA 5KBRA 3IW7A 4BCNA 5HNIX 2UZVA 3R2BA 3FXZA 2ERKA 3E88A 4FIGA 3EMGA 3QAME 3FPMA 3BHVA 4IANA 4LMUA 4I41A 1H8FA 2BVAA 2F2CB 4G31A 3RALA 5JK3A 2ZB1A 3F5XA 3Q9WA 1OVEA 5AP4A 3LAUA 5L8LA 3ZFXA 2W4OA 1SVHA 3Q52A 3BHTA 4XG7A 4UALA 3R7YA 5JQ5A 5A4EA 3G51A 5M06A 3TCPA 1PJKA 2VX3A 3PTGA 3HMIA 3M11A 5AV4A 5EI6A 2WNTA 1Q99A 3PJ2A 5EDRA 4F99A 4QTDA 4ZJIA 5HO7A 2OFUA 3VJNA 3OHTA 1TQPA 4O0YA 5L4QA 5HCZA 4RFMA 4ZMFA 3SOCA 4PF4A 3TJCA 3LFAA 4FV1A 4ZS4A 2PVMA 1H08A 3SQQA 3AGMA 4FKSA 3QUPA 5CU0A 1BMKA 1SNXA 3R1YA 3OBGA 5CSXA 3UNZA 4RIWA 5I3OA 2ITXA 1BI8A 2JIIA 3UE4A 3FLQA 3NZ0A 2JDOA 2OJGA 4ITIA 4C35A 5A4TA 1PHKA 4E4LA 4EKLA 2ITNA 4F0GA 3Q4CA 4XG4A 3ORZA 3UC4A 4PY1A 5ANJA 2F7ZE 3RNYA 4F9AA 4K6ZA 5EHOA 3NNXA 4N70A 5CWZA 4E6AA 2CGVA 2QO9A 3NR9A 1VZOA 4GIHA 3SRVA 2P2IA 3NW6A 3PRFA 1ZOHA 4LOPA 3NUPA 5AR2A 3NW7A 3GP0A 2R3JA 3EKNA 3AOXA 3KXHA 4ALVA 3GQIA 1YXVA 3HRBA 4ITHA 5HIDA 3UPXA 4FTTA 2PU8A 3TNWA 1CSNA 4XEYA 2FUMA 3HEGA 3DNDA 1YI4A 3R21A 3BGPA 2C30A 3U6IA 2X7GA 4DFBA 1PYEA 4UWYA 4MYGA 5CVHA 4MD8E 3W18A 5M57A 3WYYA 1H1SA 3FMEA 1CM8A 5DH3A 1CKJA 4AGDA 2B9FA 3MIYA 5GNKA 2ZVAA 2IN6A 2ESMA 4ANNA 4MXAA 3KXNA 3PG1A 2X4ZA 4FTNA 4O91A 4RJ5A 3MFSA 4FKVA 3HMNA 3MWUA 3FDNA 4WSYA 4FSRA 3SKCA 5IUIA 4DLIA 4YJTA 4FK6A 4EH3A 5HHWA 2OFVA 1J1CA 1G8SA 1JSTA 3FI4A 3DXQA 4EWQA 3QQJA 4BKZA 4APPA 4DGLC 1H25A 3LQ8A 2PUIA 3LKMA 4L46A 5E8ZA 4FSMA 5DLSA 4IB0A 1OB3A 4IWPA 4IE9A 5ETAA 4FE2A 1P4FA 5L3AA 2IZSA 1Q8YA 4E6DA 4ZJVA 4PMSA 1YWVA 3W8LA 3JY9A 3ETAA 3F7WA 1W7HA 5TR6A 5BQ0A 3LCDA 3EFKA 5LOHA 3TUBA 4I4FA 4JG7A 3BWJA 3GU5A 4WIHA 3IK3A 1WBSA 3OXTA 4KD1A 2E9PA 1GIJA 5C8NA 2FSMX 4OTRA 4NJ3A 3E3BX 3UG2A 4D5KA 4G6LA 2FB8A 5E92A 4EWHA 3MFTA 2IW8A 2YIRA 4UMPA 1W83A 4YTHA 4O83A 2CLXA 4GJ2A 4IX4A 2J6MA 2BDWA 2VGOA 4H36A 2PUNA 2FO0A 2WAJA 3Q5IA 4M13A 1NVSA 4KB8A 3TV4A 2VRXA 4DFUA 3EQGA 5IDPA 2WOTA 3E87A 4RJ8A 2X2LA 3ZU7A 2PVLA 2CNVA 4EH8A 2WEIA 3C0HA 1W0XC 2W1ZA 3O23A 2FSLX 2WMUA 3OCBA 4KIKA 2ITYA 3LXLA 3MFRA 3ZSGA 4BI0A 1KE8A 5M4UA 2RFDA 4AE9A 2WTIA 3EB0A 4C4FA 1IR3A 2W1DA 2X8EA 3UQCA 4J1RA 2VWVA 3I6WA 3ZSIA 4FL2A 2JKOA 2VTIA 4QP6A 2X0GA 1FQ1B 3ZUTA 1KE9A 1LR4A 4FYNA 2BZJA 3NUUA 4X2FA 4ENXA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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