5CT7A

Braf in complex with raf265
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
273
structure length
257
Chain Sequence
DWEIPDGQITVGQRIGSGSFGTVYKGKWHGDVAVKMLNVTAPTPQQLQAFKNEVGVLRKTRHVNILLFMGYSTKPQLAIVTQWCEGSSLYHHLHIIETKFEMIKLIDIARQTAQGMDYLHAKSIIHRDLKSNNIFLHEDLTVKIGDFGLAGSILWMAPEVIRMQDKNPYSFQSDVYAFGIVLYELMTGQLPYSNINNRDQIIFMVGRGYLSPDLSKVRSNCPKAMKRLMAECLKKKRDERPLFPQILASIELLARSL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Discovery of RAF265: A Potent mut-B-RAF Inhibitor for the Treatment of Metastatic Melanoma.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase B-raf
total genus 78
structure length 257
sequence length 273
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2015-07-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5ct7A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5ct7A01
4BDFA 1QPCA 2OJGA 4FKJA 4WD5A 3GXLA 5HGIA 4ACGA 4YJUA 4F7JA 2GFSA 3C4FA 3KXHA 2R0IA 3VW8A 2B0QA 2ITUA 3DFCB 3FKLA 3FI8A 1SVEA 2X9FA 3LMGA 2YIQA 4IEBA 4E6DA 5IDPA 3KRXA 1JVPP 1WCCA 2ONLA 5ETCA 4O96A 2C5YA 4ENXA 3ZO2A 3NNVA 3OXIA 4CZTA 1FQ1B 2YIWA 2XYUA 4JXFA 3RGFA 2J0JA 5BVOA 3VIDA 3VUKA 1Z9XA 4FTLA 5CX9A 2IJMA 4UMPA 3OW3A 4YJVA 3UIUA 1PJKA 4R3RA 3UTOA 3LHJA 3UP7A 5HCYA 3QRIA 4BGHA 2VTPA 4QP3A 4LGDA 1PXPA 2VO3A 3HL7A 2VX3A 4DGNA 5BVDA 3FZOA 4FV8A 2JDRA 3FPQA 5CLPA 4ZS0A 3O23A 3L1SA 5HG5A 4BKYA 3K5VA 3CTQA 3HA8A 2WTKB 5HIDA 5HKMA 2CLQA 3TL8A 2XEZA 5FXSA 5FM2A 4R6VA 2JBPA 4UEUA 3MH1A 2C3JA 1Q8WA 3R7IA 4IM2A 3QQFA 2I40A 3UG2A 4XG9A 3EYGA 3P1AA 5EQPA 2EXCX 3LFEA 3TIZA 4CFFA 4EHGA 1UU9A 3HKOA 4LI5A 2X2KA 2VWXA 3P4KA 4MF1A 4U9AA 4YGAA 5DN3A 2W5HA 4RX5A 3PA4A 4EWHA 2PK9A 3EN6A 1XH7A 4A9TA 5IG1A 3A2CA 1T45A 3GC7A 3NUSA 3PA3A 1XBAA 3EFKA 3W10A 4D0WA 4QPAA 2NNWB 2I1MA 2GCDA 3CC6A 4PPAA 5T3QA 2BIKB 5D1JA 3DAJA 3UG1A 2BRBA 5C9CA 2B53A 5A4CA 3V6SA 4F6UA 1M7NA 1PMNA 4YHJA 4FSTA 4JIKA 2OKRA 4O0YA 4EBVA 5I9ZA 3NIZA 4XRLA 4RBLA 4RIWB 4E6CA 4AN9A 4FTKA 4R3CA 4RIXA 1I44A 4IE9A 4DN5A 1REJA 2XBAA 3QTXA 1KOAA 4X2KA 4XLVA 3VRZA 1YI3A 3A7GA 3ALNA 3GCQA 3QD4A 4U81A 5E8UA 3V5PA 3UO5A 3VS1A 3C4CA 5EYCA 2J0KA 3LFCA 4L68A 5B2LA 2WQNA 3U87A 5KBRA 5K3YA 4AE6A 2JITA 5FRIA 4N4SA 4IB5A 4DAWA 4DCAA 1UV5A 3FY0A 4GYIA 4XYFA 3W1FA 4GK3A 2B9FA 4QQJA 3HDNA 3IK3A 2W1DA 2ITVA 2WEIA 3KRLA 4XG8A 1Q8YA 4YBKA 5AM6A 5E8SA 3WF8A 4GT3A 4DEGA 5AAGA 4WG4A 1IG1A 2QKRA 2YM7A 4FOCA 3Q4CA 4PL5A 2G15A 4DA5A 1GIIA 3K3IA 4M13A 2QOQA 3PWYA 1M2RA 2VWIA 5J1WA 1OECA 3N51A 3PJ1A 5C4KA 2R9SA 4IAIA 4AOJA 4RFZA 3R7GA 4D1ZA 3R1QA 4PV0A 4O7NA 4V05A 5E7RA 4G9RA 5AR4A 3EOCA 3DT1A 4F70A 2F2UA 2PVNA 2ZM1A 2XRUA 3FZ1A 4FV2A 4ITIA 2R7IA 3ACKA 3Q96A 4RVLA 4GKIA 4FNYA 4FL2A 4UMQA 1B38A 3KK9A 4LMUA 5CU2A 2ACXA 4O0RA 4EH2A 1KE7A 3LXPA 4G3DA 5HIEA 5H3QA 5LMAA 3ZO1A 4DEBA 3EQDA 3AMBA 3QTRA 4MD7E 4ITJA 3ZSHA 5CWZA 4ACCA 2OK1A 5I9VA 2WMTA 4EKKA 4W8DA 2GNIA 3D9VA 3GU4A 3LPBA 3MVJA 3I79A 4N6ZA 4USDA 1W0XC 3ZO4A 4A9UA 1H0VA 5IISA 2VV9A 3EFWA 2W0JA 1URWA 3E87A 3H9FA 3HMPA 3VBXA 5CU3A 5FXQA 4S30A 1OIYA 1ATPE 3AMYA 3P78A 3O8UA 4U44A 4HNFA 5JMSA 4D4SA 2UZVA 2OU7A 2DS1A 4GFOA 4NFMA 3R7YA 5M53A 3UGCA 3DTWA 3LCKA 1XH5A 3DJ6A 2OXDA 2Y6OA 3C0IA 3LFBA 2YERA 3FLSA 3F69A 3MH3A 3PP1A 2CDZA 2ESMA 5L2TA 3N4VA 5DVRA 5HO8A 3CJGA 3Q4UA 2PVFA 4E3CA 3FLZA 4AW1A 4YU2A 3ZBFA 2PVJA 5KZIA 4FG7A 4J95A 2C6LA 3ZDIA 4MBIA 5E91A 3QX2A 2PVRA 5JSMA 3VBQA 5L8JA 3UOJA 3P7AA 4BRXA 2QOKA 1SNUA 4O81A 4XOZA 3P9JA 3TTIA 4PMPA 3DBEA 3NYVA 5E1EA 3VJOA 4D58A 1HCLA 4F0GA 4CKRA 4EUTA 2H6DA 2B1PA 3BU6A 3TACA 5DEYA 3VUGA 4FVRA 3BLHA 2XJ0A 4JNWA 4W9WA 3U9CA 1YOLA 1OL1A 3OWJA 2HZIA 4AF3A 4JI9A 3PXRA 5G1XA 2PVKA 4ITHA 1KE6A 1R39A 2OH4A 2W9ZB 3ZRLA 4GJ2A 5JFSA 3V8TA 4QRCA 4PDYA 1OKWA 3RNYA 2Y7JA 3UJGA 3UVRA 4KRCA 3FQSA 2VTRA 2R64A 5EI2A 1NA7A 3R9DA 1ZMVA 4WA9A 5KNJA 4X3FC 4BI0A 3GEQA 3O8PA 3A4OX 4TYGA 5HICA 4RLKA 3MPMA 2JIIA 3PSDA 4H05A 3F3VA 5HTBA 5HTCA 2UZLA 3R71A 4CSVA 1B6CB 2YCFA 4FTRA 2R3IA 3KMMA 3R83A 3N9XA 3Q32A 2BHEA 5LVLA 3RCDA 3UYSA 3AOXA 5FGKA 1MQ4A 5DRDA 2R3PA 3PVUA 2C0IA 3UBDA 3FKNA 4HVIA 3RMFA 3KRJA 3ZDUA 3FZPA 5E8YA 5EHYA 4UALA 2VRXA 1LEZA 4IZ7A 4AGUA 3W2CA 1GZKA 3EQCA 2JDTA 2YCQA 1W84A 4BN1A 2WOTA 4JS8A 4RG0A 5G6VA 3PZHA 4EK8A 5C8NA 4I22A 1ZY5A 3FL4A 3POZA 4XRJA 4TL0A 1UNGA 3AD5A 4BI2A 4PMSA 4RJ4A 4F9CA 3K2LA 5CXHA 4D2SA 1O6LA 1R0EA 2BFYA 3B2WA 4ID7A 1M17A 3ZHPC 4BCJA 4BBFA 2Y9QA 3GQLA 3FI3A 4I6QA 4JR3A 3FMHA 3ENHA 1W8CA 3ORKA 5ANIA 5K0KA 3VS5A 1OPLA 1QMZA 3D14A 5IKWA 4FR4A 4F9BA 4BF2A 5EDRA 5FP5A 5IA5A 3AD4A 3UZPA 3ZLXA 4DC2A 5EM5A 5KMKA 2R7BA 3DNEA 3QALE 3F61A 3HZTA 2Z7QA 3R9NA 4CFUA 4YSJA 4L45A 4HW7A 3JR1A 2KTYA 3KULA 4JVGA 3PWDA 3G51A 4OAVB 4DT8A 3TZ8A 4JAIA 5HCXA 2OFVA 1OL2A 3QTSA 4NM7A 3ZUVA 5DI1A 4CCUA 2GSFA 2JFLA 2JAMA 5CEMA 2PWLA 5CF4A 5JFWA 3KXNA 4CNHA 4M3QA 2WTIA 3M42A 4HCTA 4DT9A 3JY9A 3ZUTA 3DK3A 5CENA 3IGOA 3E92A 4WHZA 4QTEA 5AUTA 4FV7A 4AA0A 5EW9A 4ZS4A 3RWPA 1W7HA 2C6IA 4A7CA 3RZFA 2P3GX 3R7EA 3ZFXA 4PUZA 5J8IA 3ZC6A 1K2PA 3R2BA 1H0WA 4IAFA 2AYPA 5CEOA 4FV0A 4HOKA 3AQVA 2J0IA 2HXLA 1V0OA 3ELJA 1EH4A 1WBOA 3BCEA 1H07A 4D1XA 4MTAA 3QUEA 5CAUA 2JC6A 1WBNA 4Y95A 4U6RA 3I6UA 3QAME 3KFAA 3RZBA 3U54A 1Y57A 2XVDA 3EQPA 4LV8A 4K1BA 4XP0A 5DBXA 4RQKA 2ZDTA 3O50A 3E64A 3OROA 3DXNA 4PPBA 4BZNA 3QA0A 2RGPA 2XIYA 4YSMA 5EYMA 5HE3A 2Y4IC 1ND4A 3DLSA 3NCZA 5GZ9A 4O2ZA 4AW5A 3EFJA 4I92A 4KS8A 4I41A 5AP0A 3TNWA 4FV3A 3QCYA 4TRLA 4E4XA 4YO4A 3H30A 3IW7A 2XM9A 2QLQA 3R21A 4QT1A 3UIMA 2Z02A 1FVRA 4O0VA 4DGGA 5BYLA 3WYYA 1ZYLA 5HBJA 4YZNA 3R1YA 3LE6A 3C0GA 4FTUA 2WMWA 1OKVA 3SG8A 1MRUA 1Z57A 4JG7A 4FIFA 4YURA 3SOCA 4UMUA 2J50A 3AC2A 5ACBC 3NNUA 3ZOSA 4QQ5A 4PQNA 4BCIA 1URCA 4FODA 4E93A 3O96A 4RZWA 3GI3A 3TT0A 2KULA 4R77A 4K11A 4UV0A 4AGWA 4GUBA 4O0SA 4AZVA 3KK8A 3HMNA 4R78A 4U80A 3AC4A 2PVHA 3DZOA 3RAHA 5IQAA 4AZWA 4TY1A 2X6EA 4QYHA 1U54A 3IO7A 1Q3WA 3N4UA 3HP5A 3P23A 4FT3A 4IW0A 4PPCA 3EIDA 5K5XA 4MF0A 2H96A 2WTKC 5BMMA 3V5JA 2C3LA 3MPTA 1UNHA 4O1OA 2R3QA 3DKOA 4M8TA 4UBAA 4DH5A 3BGZA 2X8DA 3PLAE 3EKKA 3QTUA 4U43A 1YQJA 4BCQA 4FSQA 1BUHA 4QYGA 3ATTA 3QHRA 1JKLA 4NJ3A 3R8UA 4X7QA 3AC1A 1FGKA 1WBVA 5K5NA 3FZSA 4YR8A 2OIQA 1CKPA 5HU9A 3OEFX 4PP9A 4C4GA 4K9YA 1AD5A 2QVSE 3PIZA 5HE0A 3BELA 3ZBXA 4RA5A 3TUBA 2B9HA 2A1AB 2VO7A 4MEDA 5AUYA 4FKSA 4BCHA 2ERKA 3KRWA 3CGOA 3LFQA 3PG3A 1P4OA 5H8GA 3ETAA 2W9FB 2FSTX 4Y46A 3SKCA 4EJNA 5EQEA 2WPAA 3NSZA 1OPJA 2XJ1A 3EJ1A 3FAAA 3QWJA 4XLIA 1A9UA 3VS7A 3FMMA 1UU8A 4I20A 2E2BA 3PG1A 3ROCA 4N0SA 1UA2A 2UW9A 2VGPA 2YAAA 2RFNA 4RWJA 5H2UA 3QC4A 4FTAA 4UZHA 4XP2A 3G6GA 3VQHA 4BWPA 4MD9E 2PY3A 3HV7A 4UYNA 3DY7A 3HRCA 3U55A 5F95A 4EH8A 4DFBA 4D4YA 3C1XA 4AN3A 4ZTHA 3QD2B 1REKA 2GHLA 4MNEB 4IWOA 4MKCA 4I3ZA 1H01A 3PSBA 4FKTA 2OXYA 4MCVA 4EORA 5B7VA 3UQFA 3MWUA 4CMUA 4WNMA 1M2PA 5D10A 4F7SA 4RMZA 4XG4A 3PY0A 2YWVA 5IDNA 4FTIA 2ITYA 4YTCA 4G5PA 3HEGA 2EB3A 2PMIA 4FKUA 4L42A 3GU8A 3OY3A 2ITOA 4BCKA 2UW6A 2BDWA 3VS3A 4A9YA 5AA8A 4IFCA 5CZIA 4DBNA 5CSWA 4EEVA 3UPZA 1E1XA 5EI8A 4LOPA 4U42A 2ZVAA 4R5SA 2QD9A 3WILA 4RFYA 4ZZOA 5CTPA 5TE0A 2C3IB 4MVFA 3IONA 5EW3A 4JT3A 4KKHA 3OOMA 3EWHA 5HLWA 5CEIA 5HESA 2WMQA 3ZYAA 5LMKA 3G5DA 4FEUA 5BX0A 3C5IA 3BHUA 3NUUA 3WF6A 5A4LA 3MN3A 4BGGA 4P90A 1U5QA 3G15A 3GCVA 4C61A 3VS6A 2CSNA 5AIRA 1IASA 1PXNA 3WZDA 2QQ7A 4MH7A 1Y91A 4E4LA 5ACKA 2RFEA 4MWIA 2ZDUA 4KBCA 3E7OA 1NXKA 2JEDA 4TPTA 2JBOA 2C1BA 5KBQA 2VU3A 4JR7A 3VBWA 3HX4A 4F9AA 2WQBA 4R7HA 5GJGA 4ACMA 5IEYA 2P2HA 4I6BA 4EZ7A 3Q4ZA 2R3RA 5D7AA 3FV8A 2JGZA 4OW8A 3KXZA 5IQCA 4L52A 4JBVA 4PTEA 4IZ5A 3PFQA 3ZFYA 3OHTA 1SM2A 5LVNA 1ZLTA 2AUHA 2A27A 4M15A 4NL0A 5AUVA 2W1FA 2YACA 3Q53A 4FTNA 5J7HA 5EW8A 5J5TA 5GINE 4CFVA 4BKZA 3OXZA 3V5TA 4QTBA 4FYNA 5JZNA 2HWPA 3FJQE 3QQLA 4NIFB 3WOWA 3WI6A 4HGLA 3QGYA 4G17A 3RWQA 3JXWA 4RC4A 3TCPA 3ZEPA 3KXMA 2CN8A 5JGBA 3E5AA 4CLIA 5M57A 3LXLA 4I1ZA 4PP7A 2B9IA 2BDFA 3D0EA 5JEBA 3DJ5A 4E6QA 1P5EA 1OPKA 5BVWA 2BRHA 1YW2A 2ZM4A 3LW0A 2XNNA 3NZ0A 3QQHA 1H26A 3ULZA 3DB6A 2UVZA 4YHFA 5E8XA 5F1ZA 5AV3A 4BB4A 3H3CA 4QP4A 4C3PA 4FSNA 3ANRA 3TDWA 3H0ZA 5CVGA 1GY3A 4AP7A 3LAUA 1P4FA 3GU5A 4QMXA 5C8KA 3V5WA 2OGVA 2C5NA 3HP2A 4QMMA 3EN4A 1JPAA 1E1VA 3WARA 4DINA 2CKPA 1JQHA 2XJ2A 5TR6A 4XCUA 3QQKA 4ASDA 2CLXA 3PIXA 4CYJA 2VTQA 3A7IA 2XK4A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4BDF A;  4AXF A;  1QPC A;  2OJG A;  4FKJ A;  4WD5 A;  3GXL A;  5HGI A;  4ACG A;  4YJU A;  4F7J A;  4DDG A;  2GFS A;  3C4F A;  3KXH A;  2R0I A;  3VW8 A;  2B0Q A;  2ITU A;  3DFC B;  3FKL A;  3FI8 A;  1SVE A;  2X9F A;  3LMG A;  2YIQ A;  4IEB A;  4E6D A;  5IDP A;  3KRX A;  1JVP P;  1WCC A;  2ONL A;  5ETC A;  4O96 A;  2C5Y A;  4ENX A;  3ZO2 A;  4JMQ A;  3NNV A;  3OXI A;  4CZT A;  1FQ1 B;  2YIW A;  2XYU A;  4JXF A;  3RGF A;  2J0J A;  5BVO A;  3VID A;  3VUK A;  1Z9X A;  4FTL A;  5CX9 A;  2IJM A;  4UMP A;  3OW3 A;  4YJV A;  3UIU A;  1PJK A;  4R3R A;  3UTO A;  3LHJ A;  3UP7 A;  5HCY A;  3QRI A;  4BGH A;  2VTP A;  4QP3 A;  4LGD A;  1PXP A;  2VO3 A;  3HL7 A;  2VX3 A;  4DGN A;  5BVD A;  3FZO A;  4FV8 A;  2JDR A;  3FPQ A;  5CLP A;  4ZS0 A;  3O23 A;  3L1S A;  5HG5 A;  4BKY A;  3K5V A;  3CTQ A;  3HA8 A;  2WTK B;  5HID A;  5HKM A;  2CLQ A;  3TL8 A;  2XEZ A;  5FXS A;  5FM2 A;  4R6V A;  2JBP A;  4UEU A;  3MH1 A;  2C3J A;  1Q8W A;  3R7I A;  4IM2 A;  3QQF A;  2I40 A;  3UG2 A;  4XG9 A;  3EYG A;  3P1A A;  5EQP A;  2EXC X;  3LFE A;  3TIZ A;  4CFF A;  4EHG A;  1UU9 A;  3HKO A;  4LI5 A;  2X2K A;  2VWX A;  3P4K A;  4MF1 A;  4U9A A;  4YGA A;  5DN3 A;  2W5H A;  4RX5 A;  3PA4 A;  4EWH A;  2PK9 A;  3EN6 A;  1XH7 A;  4A9T A;  5IG1 A;  3A2C A;  1T45 A;  3GC7 A;  3NUS A;  3PA3 A;  1XBA A;  3EFK A;  3W10 A;  4D0W A;  4QPA A;  2NNW B;  2I1M A;  2GCD A;  3CC6 A;  4PPA A;  5T3Q A;  2BIK B;  5D1J A;  3DAJ A;  3UG1 A;  2BRB A;  5C9C A;  2B53 A;  5A4C A;  3V6S A;  4F6U A;  1M7N A;  1PMN A;  4YHJ A;  4FST A;  4JIK A;  2OKR A;  4O0Y A;  4EBV A;  5I9Z A;  3NIZ A;  4XRL A;  4RBL A;  4RIW B;  4E6C A;  4AN9 A;  4FTK A;  4R3C A;  4RIX A;  1I44 A;  4IE9 A;  4DN5 A;  1REJ A;  2XBA A;  3QTX A;  1KOA A;  4X2K A;  4XLV A;  3VRZ A;  1YI3 A;  3A7G A;  3ALN A;  3GCQ A;  3QD4 A;  4U81 A;  5E8U A;  3V5P A;  3UO5 A;  3VS1 A;  3C4C A;  5EYC A;  2J0K A;  3LFC A;  4L68 A;  5B2L A;  2WQN A;  3U87 A;  5KBR A;  5K3Y A;  4AE6 A;  2JIT A;  5FRI A;  4N4S A;  4IB5 A;  4DAW A;  1VLR A;  4DCA A;  1UV5 A;  3FY0 A;  4GYI A;  4DHJ A;  4XYF A;  3W1F A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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