5DG5A

Crystal structure of the tyrosine kinase domain of the hepatocyte growth factor receptor c-met in complex with altiratinib analog dp-4157
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
297
structure length
297
Chain Sequence
TVHIDLSALNPELVQAVQHVVIGPSSLIVHFNEVIGRGHFGCVYHGTLLDNDGKKIHCAVKSLNRITDIGEVSQFLTEGIIMKDFSHPNVLSLLGICLRSEGSPLVVLPYMKHGDLRNFIRNETHNPTVKDLIGFGLQVAKGMKYLASKKFVHRDLAARNCMLDEKFTVKVADFGLARDMYDKEYYSVHNKTGAKLPVKWMALESLQTQKFTTKSDVWSFGVLLWELMTRGAPPYPDVNTFDITVYLLQGRRLLQPEYCPDPLYEVMLKCWHPKAEMRPSFSELVSRISAIFSTFIG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Altiratinib Inhibits Tumor Growth, Invasion, Angiogenesis, and Microenvironment-Mediated Drug Resistance via Balanced Inhibition of MET, TIE2, and VEGFR2.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords Hepatocyte growth factor receptor
total genus 88
structure length 297
sequence length 297
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2015-08-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5dg5A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5dg5A01
5CI7A 5EI2A 1XH4A 2F7EE 4XX9A 3R7VA 1OIYA 2VTAA 2CGWA 3LMIA 3E8CA 1PKGA 5KMJA 4LGDA 1H25A 4E5AX 2R3FA 2WQMA 2C3JA 3GI3A 4OTHA 3VS1A 4AG8A 4GT3A 4O7RA 4O0XA 4RG0A 1PYXA 3AC3A 2PY3A 3O7LB 2O2UA 4MKCA 4U43A 3ZEPA 4JLCA 3THBA 4OTPA 3DS6A 4H05A 3E62A 2J51A 2RFSA 1M7QA 2JBPA 2X4FA 3Q2MA 2CPKE 3ORTA 4HGEA 2A2AA 4FEQA 5DWRA 3ZC5A 4CFNA 2QG7A 3TZ7A 4B9DA 4WO5A 4F08A 1PY5A 3JVSA 4GJ2A 3TDWA 3FJQE 4JVGA 5KMKA 5KNJA 3NX8A 3O7LD 4IHPA 2YIXA 3TV7A 2R4BA 4QQTA 2KTYA 3DZOA 1TVOA 1KE8A 3CS9A 4L68A 4HNFA 4EOQA 4JAJA 4DH1A 3NYVA 1KV2A 4OTGA 4I6QA 4S2ZA 3KFAA 4X3FA 5A4TA 2RL5A 3SQQA 3O71A 2XNOA 3BWJA 4FBXA 5IISA 3FMEA 4D5KA 2WO6A 3FC2A 3FI4A 3HMPA 4I3ZA 1UNLA 4J96A 1YXUA 2V7AA 2YDIA 5CXZA 4F99A 3VS2A 3PSCA 5HNBA 5KUPA 5EOBA 4G1WA 2HXLA 4S32A 3UBDA 5D9HA 4CKIA 1H00A 3OG7A 5DMZA 2DS1A 3BKBA 1G5SA 4EZ7A 4YTHA 2ITOA 4MX9A 4FGBA 1O6KA 4AAAA 4RIYA 4D1SA 4AX8A 3CKWA 2R5TA 3F3TA 4FTCA 1Q8ZA 4KBAA 4X6RA 3QHWA 4XYFA 2XIKA 4EZ5A 3BU3A 2VX1A 5EW9A 5M55A 5I4NA 4EH6A 3IW5A 5FLFA 3B2TA 5GHVA 3KY2A 3L9NA 4IZYA 4W4VA 4W4YA 2OJGA 4O83A 4FYNA 1H28A 1KUTA 3ORNA 1F3MC 3FLSA 4HJOA 3ZXZA 2XYUA 5ICPA 2F57A 3CTJA 4BGQA 1M17A 3KVWA 2PVKA 3NLBA 2W5AA 3G51A 2WHBA 4GU6A 1SVHA 3HDNA 4L7FA 4WBBB 3ZRMA 1WBNA 5HU3A 1LPUA 2GQGA 4YJQA 4K8AA 4B99A 4A9RA 4D5HA 1XHAA 1BMKA 2UV2A 4WA9A 3ZO4A 3L8XA 5CF8A 3Q4UA 3QF9A 3P4KA 5I9WA 5HLNA 2IG7A 4DT9A 4BICA 1H8FA 2JEDA 3LCKA 4GIHA 2WNTA 5GJGA 5AR4A 2XP2A 2OI4X 4AN9A 1RE8A 3CP9A 4V05A 3V5LA 5IUHA 3W2CA 3ZH8A 4U3ZA 4PF4A 4MBJA 4AACA 4Z55A 1Q4LA 4TWOA 3R9DA 4IX6A 4RRVA 1OBGA 3F2NA 3OZ6A 3E93A 3HLLA 4QMZA 2BKZA 5FBNC 1F0QA 4J71A 4BDAA 5J7BA 2UUEA 2VV9A 4D9UA 5IZFA 3KK8A 2BAJA 2OWBA 4ID7A 2JITA 3TV4A 3E8DA 4CFFA 3PJ3A 1YDSE 1ZYDA 2IVVA 2XIXA 4K2RA 4BTMA 3NVMB 4IWQA 5J87A 4YJTA 4JBPA 5F1ZA 2BZHB 4TKSA 2PVLA 3IG7A 2BRNA 4FK6A 3EN6A 3KXMA 3MA3A 3VUHA 3V01A 1QCFA 2A0CX 3I4BA 3LJ1A 4CCBA 2BDFA 2REIA 3QQGA 3SW4A 3W2SA 3DBCA 3GP0A 5EDRA 4AA4A 4XV3A 4GL9A 5AP1A 1HCLA 4F9WA 4KABA 1SMHA 2BIKB 4IB3A 4ZTNA 2X8EA 3N4UA 4FIJA 1JAMA 3GUBA 2B0QA 5L8JA 4RX7A 4ZY6A 4E20A 1B6CB 3NR9A 4IQ6A 4BTJA 1L8TA 3S00A 3FL5A 3R8LA 3I7BA 3Q60A 4LFIA 3UP2A 5DHJA 2OXXA 4WOVA 1ZYCA 3QCQA 4QMYA 3D7ZA 1H4LA 2WTKB 5E8TA 4KKGA 4FNZA 4RIWB 2XK6A 2W1ZA 4D4VA 4QNYA 2W9ZB 3S3IA 1OI9A 4ZAUA 2YABA 3IDPA 1UKIA 3ZSIA 2QOOA 5JZNA 5KMMA 4GYGA 5DFPA 3BWFA 4RA4A 1X8BA 3AMBA 3DJ5A 2J9MA 1L3RE 3QQKA 4KUJA 3SG9A 2V62A 1FPUA 3P1AA 3BGZA 3BHUA 3DK7A 5IH6A 4MWHA 3UVQA 3PVGA 2VWYA 4K6ZA 5LMKA 3DAEA 4D4SA 1JKLA 3R2YA 5LVNA 5J1VA 2OZAB 3PXYA 3M42A 1WVYA 4IVAA 5CAUA 4BWXA 5EK7A 4YGAA 2XIRA 3ODYX 2RFDA 4FTUA 4WNKA 5DE2A 2CHLA 4YHTA 3ZO2A 3R0TA 2QC6A 2WB8A 4NWMA 1ZAOA 5M06A 3OEFX 2R0IA 1U59A 3CEKA 5D7VA 4RLKA 4D0XA 4EOKA 4G3GA 1BKXA 4IB5A 5AA8A 3EQFA 3W2OA 5KKRC 5KZIA 1R1WA 2B9FA 5HGIA 1MP8A 3W2PA 2PUUA 5I3OA 4ZZMA 1XBBA 2R3QA 5AX9A 3WOWA 4EUUA 5A46A 3CQEA 5HO6A 2YAAA 4EKLA 3QHRA 2OJJA 4FTTA 1E1XA 2VTOA 3DDQA 4BYIA 4CT1A 2BROA 3WARA 1H07A 3ZO1A 2OW3A 4KIQA 2ZAZA 3DB8A 3FKOA 4QTDA 5H3QA 3H0ZA 4S33A 4YBJA 3AD5A 4AW0A 3LVPA 3MA6A 1IAJA 3Q6WA 3EQCA 4ANOA 4ORKA 4FG8A 5TF9A 3R04A 3NNWA 3P79A 4IWOA 2VZ6A 3W1FA 3ANRA 1ZZLA 4FKJA 2C4GA 3R9OA 5A9UA 3S4QA 4F65A 4M0ZA 2I0VA 3GVUA 3PYYA 4IZ7A 4EBWA 3FLYA 3VUMA 4C4JA 4HVHA 3K54A 3UMXA 3FLQA 2VWWA 2G2HA 3QQLA 4LRJA 2YZAA 3HNGA 4QMTA 4BCPA 3FI3A 2XCHA 3UZTA 4OW8A 4ONAA 3ATSA 1Q3WA 2HXQA 4U44A 4WIHA 3KREA 3PY0A 3ROYA 4AQCA 4DE4A 2WTDA 4RWIA 4PMTA 4F9BA 3VBYA 4E73A 3VUGA 4NZWB 5AAEA 4DH7A 3IDCA 3ET7A 2ZDUA 3FXZA 1GJOA 4BBEA 2EU9A 3A61A 1FOTA 3DPKA 3D0EA 4O38A 3W8LA 3ULZA 5L2SA 4JQEA 3ZFXA 4AA5A 5JRQA 3HUCA 2WMXA 4GFMA 4GU9A 5HORA 2SRCA 4M0YA 3FYKX 2HY0A 2ACXA 2C68A 2E2BA 2YDJA 3ZUTA 4RX9A 1H01A 2QOHA 3D7TB 2PMOX 4JDIA 3JXWA 4ASEA 5JZJA 4C33A 3ELJA 1OPJA 4HCTA 3Q4TA 3LLAA 4AXAA 3ZRKA 2IN6A 3QKMA 5CS6A 3DBEA 4O82A 5ANDA 5M07A 1IA9A 4DFUA 2JAMA 4IAFA 4L45A 5TO8A 4CRLA 2VO6A 5CZIA 3ZONA 3HV7A 4P5QA 3PXKA 3EFKA 3G6HA 3NDMA 2E9PA 4PL3A 5F20A 5A4QA 3GCSA 4X6QC 5FUTA 3LCSA 2X7GA 1RW8A 5DLSA 1OL7A 1UVRA 1LEZA 1ZY5A 2UW9A 5C9CA 4ANMA 5E8SA 4YC6A 4F1OA 4IVDA 4FEXA 3I6WA 1PXLA 4O27B 4OR5A 2CDZA 3GU6A 4JAIA 5BMSA 2VTRA 5HZNA 3KVXA 3MS9A 2Y6MA 3IW7A 4JIAA 2X2MA 3R30A 5KBRA 1ZOGA 4K33A 4FV1A 4NSTA 3WE4A 1ERKA 3R21A 2WMTA 4I5CA 2FSOX 2YLEA 4MXZA 4E4LA 2BPMA 5EW8A 4O1OA 3G9NA 2VD5A 2JDTA 2GHGA 1KE9A 3N4VA 1JSVA 4MHAA 4UX9A 2CN8A 3Q04A 3BEAA 4FIIA 4ZTHA 4D1XA 1M2QA 5B2LA 5B2MA 1Q61A 3MTFA 3HA6A 4YLLA 5LMAA 5FQDC 3L8VA 4IJ9A 5HBEA 3CPCA 4J1RA 4IX4A 1ATPE 2C6IA 5ETAA 5HO7A 5AIKA 1O9UA 4C8BA 5M4UA 2QR8A 2C3LA 5DR6A 1M2RA 2GPHA 4GVAA 5AAFA 4BKJA 4DFLA 4YTFA 2R3KA 3AG9A 3E3BX 4WSQA 5CALA 4RA5A 3G2FA 2O63A 4GFGA 4CFXA 3AD4A 2GS2A 4CQGA 4F0IA 4IM2A 2BDWA 4YPDA 3U87A 3WI6A 5I5ZA 1YOLA 2XK7A 1QPDA 4BCNA 1OPKA 2X6EA 3F3WA 4I41A 3TT0A 2UW6A 3ZFMA 3U6JA 1B39A 1PXPA 5IQGA 5DBXA 2AUHA 3MB7A 5E90A 4QD6A 1A9UA 1SYKA 3AC5A 4FZFB 4YO4A 3DBFA 3BE9A 1YQJA 3DOGA 1OKWA 4OBOA 2Q0BA 3RPVA 1FBNA 3A2CA 4AT5A 3PG1A 1LR4A 4DCAA 5BPYA 2BVAA 4DINA 4CGAA 2ITTA 4G16A 3QTSA 3QYWA 2QCSA 3MVMA 5AP5A 3WF5A 3VS4A 3W32A 5KCVA 5EQPA 3FPMA 3FMDA 5L3AA 3SC1A 4FA2A 2PULA 5F95A 3NUUA 4YU2A 2Y9QA 2AYPA 2JDRA 3UGCA 3A99A 3C9WA 3I5NA 3ZCLA 4ZLOA 3HA8A 2WAJA 3NAXA 4I20A 3ZSGA 4APPA 3T8OA 3SV0A 2PMIA 3SAYA 3TTIA 4EHVA 4I4FA 4FEUA 1GZOA 2YJRA 2UW5A 4JXFA 4L46A 3LIJA 4N4SA 3V5QA 4AZTA 4QMWA 4XG8A 3RNIA 2HW6A 4BDBA 2HAKA 3C1XA 4A4OA 1ZMUA 3MY0A 3FBVA 3TNHA 5H8EA 4A07A 1JOWB 1OMWA 2RKUA 4KIOA 4DA5A 4ANSA 1Q3DA 2C5YA 3OD6X 3QBNA 5EG3A 4MNFA 3WZKA 4ITIA 5DGZA 2UZDA 3AOXA 4E5WA 4M14A 2R3GA 4GK3A 2FB8A 4QTEA 2NO3A 4JR7A 4M15A 5KMIA 4FL1A 4XRJA 1ZARA 4KWPA 2IO6A 3V6RA 3Q9YA 3V5WA 5CZHA 2CMWA 2H34A 1PMUA 5CSWA 3ENMA 3ZXTA 2HWPA 5EDQA 3EN7A 4MQ1A 4IANA 2BAKA 4B7TA 5C1QB 3MPMA 2YLFA 2QHMA 3PP0A 4QMSA 3V8WA 5AFVA 2H9VA 4QP2A 3IPHA 5HG8A 4ZJIA 1YW2A 2WTWA 3U9NA 1PYEA 2ZDTA 3OP5A 3GFEA 2BRGA 4NL0A 2PPQA 3GU8A 2J0LA 4RJ5A 4Z7GA 5HTCA 5TE0A 4HCVA 1H08A 5I0BA 4O7LA 4H39A 1VJYA 4LQMA 1E9HA 2BDJA 2QLUA 5GZ9A 4AZVA 2IZSA 3KEXA 3F82A 4USDA 2WIHA 4RMZA 4WRGA 3ZZWA 2YIYA 2W99B 3F5UA 4KSPA 4RC3A 1MRVA 5M44A 3RINA 1UU8A 3DFCB 1W82A 3H4JA 3QYZA 4S34A 4BIEA 2W06A 2YM8A 3KB7A 4CT2A 4PDOA 3HUBA 1FVVA 2WMAA 2GQSA 3SHEA 1H1PA 3L1SA 1OZ1A 3DK3A 4N6ZA 3DK6A 4PUZA 4ZIMA 5KHXA 5IPJA 2WEVA 5BVEA 4DAWA 4ZMEA 2E9NA 4TYHB 3Q5IA 5CANA 1OM1A 2QR7A 3KN5A 3ORKA 3PSBA 4CG9A 4FEWA 5FTGA 4XOZA 3QALE 4PPBA 3I7CA 4JQ8A 3DBDA 4YZCA 3EOCA 2ERKA 3TNWA 3DV3A 3UIMA 3VUKA 4MXAA 4R3PA 4G3CA 4P90A 2W4OA 2UZNA 3HRFA 3FI2A 2BFXA 5HLWA 2W0JA 5FRIA 4O7VA 1PJKA 5LCJA 1NVQA 1V0PA 2EB3A 2C6OA 1OIQA 4LOOA 4W8DA 3VS7A 2WMVA 3ZUVA 3D4QA 4B6LA 2JFLA 3GU4A 3QZIA 2XIYA 4KB8A 4P7EA 3WZUA 5HIDA 1PRYA 4PTGA 5L6WL 4CKRA 1YWRA 2RGPA 4IB1A 5CSXA 4QYEA 4FSUA 3PFQA 3VS3A 2C69A 2OU7A 3EZVA 4LG4A 3D15A 4C0TA 4M97A 1PXOA 5IDPA 3ID6C 3N4TA 3RWPA 3LOKA 4RSSA 4LYNA 4J98A 4C3FA 4PNKA 2A27A 5IEXA 5DA3A 2R3LA 1CKJA 2CGVA 3G90X 3OTUA 2RG6A 3OWJA 3BHVA 3VUDA 1MQBA 3H0YA 4MF0A 4EOIA 2QU5A 2VWUA 2OG8A 4J95A 5HG5A 3Q32A 3WBLA 5KMNA 4G6LA 3R6XA 3BV3A 2AC5A 2OH4A 2BILB 2VWBA 4XBRA 2BRBA 3MH2A 5D12A 2Z7LA 4W4WA 3F5GA 5FWKK 3UC4A 1XQZA 2JDVA 5FXQA 4BKZA 5JFXA 3KXHA 3LE6A 3QD3A 4GIIA 2JKMA 4WUNA 3V8SA 3ZBFA 2PYWA 4X3FC 3FQEA 2XJ1A 4FV2A 2ESMA 3C4EA 5E8ZA 1Q8TA 1OVEA 4FG9A 4CZYB 2PUNA 3SOCA 1CKIA 2IZRA 3A60A 3F9NA 3C13A 3ITZA 3N51A 2HW7A 2YCSA 4XV2A 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