5DWRA

Identification of n-(4-((1r,3s,5s)-3-amino-5-methylcyclohexyl)pyridin-3-yl)-6-(2,6-difluorophenyl)-5-fluoropicolinamide (pim447), a potent and selective proviral insertion site of moloney murine leukemia (pim) 1,2 and 3 kinase inhibitor in clinical trials for hematological malignancies
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
274
structure length
273
Chain Sequence
PLESQYQVGPLLGSGGFGSVYSGIRVSDNLPVAIKHVEKDRISDWGELPNGTRVPMEVVLLKKVSSGFSGVIRLLDWFERPDSFVLILERPEPVQDLFDFITERGALQEELARSFFWQVLEAVRHCHNCGVLHRDIKDENILIDLNRGELKLIDFGSGALLKDTVYTDFDGTRVYSPPEWIRYHRYHGRSAAVWSLGILLYDMVCGDIPFEHDEEIIRGQVFFRQRVSECQHLIRWCLALRPSDRPTFEEIQNHPWMQDVLLPQETAEIHLHS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Identification of N-(4-((1R,3S,5S)-3-Amino-5-methylcyclohexyl)pyridin-3-yl)-6-(2,6-difluorophenyl)-5-fluoropicolinamide (PIM447), a Potent and Selective Proviral Insertion Site of Moloney Murine Leukemia (PIM) 1, 2, and 3 Kinase Inhibitor in Clinical Trials for Hematological Malignancies.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase pim-1
total genus 81
structure length 273
sequence length 274
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5dwrA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5dwrA01
2GNGA 3L9PA 4DLJA 3EN9A 1BI7A 3KMUA 5I9XA 1VYWA 3COIA 1JPAA 4Y8DA 2X4ZA 5JFWA 3RPYA 4NIFB 4F09A 5JT2A 3OW3A 3PRFA 2ITXA 4RC4A 2J51A 3A2CA 3OCBA 1AD5A 3BELA 1H00A 5AP2A 3KRJA 2QG7A 4I94A 4C36A 4WO5A 3TKHA 4H1JA 1PKDA 3QL8A 4EWQA 3LAUA 4FI1A 5AIKA 2IW8A 5AV4A 3FXZA 2HWOA 4XBRA 3P7BA 3EFJA 4G34A 3CS9A 3DTCA 4I4FA 4K2RA 4WIHA 4O2PA 1JKTA 2YCRA 4EUUA 4QOXA 3F61A 4QMWA 4D1XA 4QTDA 3F3TA 4EEVA 4F4PA 5EKNA 2XRWA 3I5ZA 4EOSA 5GZ9A 1OM1A 4ERKA 1Z57A 2WQMA 4FTUA 2B55A 5M4FA 5AUYA 4XG3A 5AP1A 3DA6A 4KWPA 2RFNA 3OTVA 4M69A 4M8TA 3ZZEA 3OXTA 3QCQA 4O0WA 3VUDA 4I4EA 1KE7A 2X6DA 3UOJA 3B8QA 4USFA 3UPZA 5HO6A 4ALWA 3TNWA 5CYIA 3CGFA 3Q9XA 2XNNA 4EH9A 5FEEA 3VULA 3OXZA 4NZWB 3FXWA 2C3KA 2EXCX 2HIWA 4FKGA 4BBMA 3FZRA 3FBVA 4YBKA 4FIHA 3WF6A 3QQHA 2PMLX 2ITNA 3KXZA 4KBAA 3UMXA 5IEYA 2VWYA 4P4CA 5CEKA 2RSVA 3QD0A 3FQHA 2QG5A 3QTXA 4QTAA 4DA5A 2XIKA 5KMNA 3MFUA 3DJ6A 3E7OA 1GAGA 2RG6A 2I0VA 4G31A 2X9EA 4DHFA 2A4LA 2PMNX 3AGMA 3ID6C 3MB7A 4KKEA 4IMYA 4J71A 3W2OA 4AZVA 4E26A 2BRBA 3AMBA 1NVRA 3PTGA 5HTIA 1PXMA 3SXSA 4NU1A 3QUEA 4BCHA 1F0QA 4G9RA 3R8UA 3H0ZA 3TZ8A 4AGWA 2CHLA 5JZNA 4RBLA 4EQCA 1W8CA 1DM2A 2BRNA 2C6KA 2W1FA 3QKKA 2QKWB 1E1VA 1GNGA 3S3IA 1PMNA 3R63A 3DK6A 2JFMA 2WMUA 3Q4CA 3QRUA 5K9IA 2YIYA 3WF8A 4G2FA 4TN6A 5FTOA 1W84A 4MHAA 4I1ZA 3H0YA 3OHTA 2BKKA 2PVJA 3BLQA 3KU2A 3R28A 1FPUA 2E9NA 3Q32A 4RZVA 3A7HA 3AC3A 3VBWA 4D0XA 2C47A 2J0MB 5CSXA 3ZS5A 3P4KA 4MXZA 4AW1A 2QOBA 3B2WA 4X6RA 5AR4A 4O0VA 1XH5A 3D7TB 5KMLA 4B4LA 3KXGA 3KA0A 1RDQE 4EUTA 5IMXA 3CQUA 1P14A 4ZZNA 5IQAA 3QTWA 1RJBA 4B99A 4USEA 3E63A 3POOA 4E93A 3AC4A 3V5PA 3W1FA 1BI8A 1KWPA 3HV5A 4NYEA 2X2LA 3VQHA 1H24A 5CVHA 3P23A 5LVLA 3UIBA 2FYSA 5E8UA 4O21A 4WBOA 5T3QA 5B2LA 3HDNA 3NCZA 4H58A 4PQNA 1T46A 3PUPA 4BBFA 3HDMA 4TYEA 2C5NA 4JQ8A 4UEUA 3TKUA 4CVAA 4NM5A 2J4ZA 4BFMA 1ZLTA 3EN6A 2C3LA 4WOVA 4BBEA 3T9TA 2UW4A 3ULZA 4L6QA 4WKQA 5KMJA 4IQ6A 3WI6A 3MPAA 1O9UA 5EK7A 4A4XA 5BNJA 3R8VA 2VTLA 1Y8YA 3DBDA 4HZSA 3LQ3A 3DAKA 5HVJA 3ZFMA 2RFSA 4ZTLA 2W1IA 3R02A 4GCJA 5JKGA 3R7GA 4GU9A 4FV2A 3WE4A 4Z55A 2ITTA 4AS0A 3RAIA 2EUFB 1S9IA 2IVUA 5AUUA 4YLLA 2Z60A 4OLIA 2B54A 2BFXA 3KC3A 3SVVA 2XP2A 5HE1A 3AD5A 5BUEA 3FI8A 4I0SA 2XK3A 1ZARA 3QRTA 4ITHA 4PUZA 2GNFA 2BCJA 3QKMA 5E8ZA 4ASXA 4HVSA 1ZZ2A 4PDYA 3O8TA 2JEDA 4NM3A 4EOJA 4PPAA 3VS4A 2PMOX 5BMSA 1UNLA 4YO6A 2V62A 4AFEA 1XQZA 3DLSA 2VTQA 2BZIB 4H05A 2VWWA 3UPXA 5FXSA 2Y8OA 3MFTA 1WBPA 2WU6A 2VWBA 4HGEA 4IWPA 5ANGA 5AX3A 5L2QA 3I5NA 2R3JA 2OJFE 2CN5A 2QODA 4HNIA 1J91A 1PJKA 5J7HA 4CZUA 3ELJA 4CFXA 4EH4A 3HVCA 2ZDUA 1HCLA 2B0QA 1VR2A 5AMNA 4OBQA 3MS9A 3RWPA 4QMTA 4X3FB 4BKYA 5DHJA 4ZSAA 2UZUE 5HD4A 2BTSA 3OOMA 3GCUA 5CQUA 5M51A 5GIOE 2F2UA 3NMUF 1Z9XA 1Q61A 3UP7A 3ZSHA 2WQOA 3NW6A 2WHBA 1CM8A 4JT3A 4MX9A 4LV8A 2WZJA 4EH7A 3FUPA 1H01A 5IKWA 4RIWB 3R9OA 3FMEA 3R7IA 2PE2A 4KB8A 3F3VA 2RG5A 2OJ9A 2OU7A 2OXXA 5TT7A 2W4KA 2Y4IB 3EB0A 5IUHA 4D28A 1O6LA 4H3QA 1L3RE 4NW5A 2VRXA 2Y4PA 3LZBA 3GOKA 1GIJA 3FMMA 2QOQA 5K5NA 2R3NA 4QYEA 2PL0A 4BDHA 5BQ0A 2Y9QA 3H9OA 4JQ7A 1WCCA 5CF5A 5IQHA 1BKXA 4PWNA 2F49A 4O22A 4E6QA 4P5ZA 4KS8A 4XG9A 3Q52A 1JNKA 2W0JA 5CU2A 1XH4A 3LFCA 5E90A 5TOZA 2PUIA 4RT7A 3D9VA 4UALA 1K9AA 5AWMA 2PVYA 1F3MC 5F94A 4QMLA 2ACXA 3AMAA 4XHKB 4DEDA 1YI6A 4FT9A 3QBNA 3EQBA 2NRYA 4BGQA 5EOBA 4EK4A 4L00A 5LCKA 5EQEA 1B6CB 2F57A 4ACGA 5I0BA 1WBWA 4D4YA 4BCQA 2YLFA 3HECA 1YWRA 5CI7A 4ARKA 1OPJA 2VTIA 3AC8A 4DH7A 3BWJA 4DTKA 3EZRA 3NAXA 3CTJA 4G5PA 4RFMA 2WTJA 2IZSA 3DTWA 1NVQA 3OT8A 4BYIA 2DQ7X 3HL7A 4C0TA 5A6NA 5CAPA 4D2SA 5FTQA 3C0HA 4N6YA 5HG5A 1P4FA 4C7TA 4Y83A 2CCIA 2C1BA 4IADA 4MYGA 4CMTA 2YZLA 1NXKA 3MPTA 4K18A 3V5WA 4PP9A 4DGOA 1JKSA 3MIAA 4M67A 3DCVA 5IA4A 3ZH8A 5IA2A 2OJIA 4JIAA 4WA9A 1KE5A 1OUYA 3A8XA 2YHVA 3DJ7A 2C6OA 3FJQE 3L8VA 4DG0E 1CKJA 4L9IA 3AT2A 4GFGA 4H1MA 4DE4A 3AD4A 3GFEA 3PY0A 3Q60A 4M14A 3M42A 5GJFA 4E8AA 4ZLYA 1KSWA 4JX3A 1YDRE 4FIEA 4RJ3A 3VUIA 4TWPA 2KULA 3BE2A 3ZYAA 5I9WA 3MWUA 5JQ8A 4EONA 3LCSA 4G1WA 3FLSA 2AUHA 3PXZA 1W98A 4IB5A 3A4OX 2WQBA 4O2ZA 5IA0A 4IFCA 2VO3A 2UUEA 4IC7A 3KVXA 2R3MA 4OTHA 3ZFYA 5CTPA 2CGXA 3NVMB 3OCSA 4BCMA 4QP7A 3FZPA 3HRBA 3ZMMA 3A7IA 3QWKA 4XCUA 3D5UA 4O7ZA 5BYLA 1WZYA 1TQPA 3H10A 3PSCA 2OGVA 3BGPA 2YDJA 4CFFA 2GPHA 4DT9A 2JKQA 4MQ1A 2QU5A 4CZTA 3CSVA 2WD1A 3BIZA 2ZM1A 3A7GA 1R39A 3HV7A 2EXEA 1SZMA 4FG7A 4FV9A 4WD5A 2IN6A 1VJYA 2UZEA 4YLJA 3WZUA 4BI2A 4JR3A 2UVXA 5HBEA 4CT2A 5A46A 5H8GA 3F3ZA 5FUTA 4C3PA 1IG1A 1UNHA 3N9XA 3TTIA 3TDWA 4L3PA 4O0UA 4YZDA 3QD2B 4TWOA 2ZV7A 3GC8A 4XRLA 3ZBXA 3PA4A 4GK3A 3MI9A 5IQIA 4JNWA 4NL0A 5HG9A 3IONA 4D2TA 2SRCA 5FEDA 3V8WA 3G6GA 5JQ5A 1XO2B 4GEOA 3TACA 4ANSA 4M97A 1OL1A 5CZIA 4JS8A 4XG8A 5CF6A 5H3QA 3VC4A 5A6OA 1NT2A 4PDPA 3PA5A 3I4BA 4WUAA 1T45A 4O6EA 4M68A 2EB2A 1UA2A 1GZNA 3UOKA 2OF4A 3QC4A 4Y5HA 4I6HA 5AP3A 3SHEA 4MVFA 1A48A 1MRUA 3BHUA 1L8TA 1H1PA 4DH8A 2J5EA 2Y6MA 5AEPA 5HLNA 2FVDA 3CXWA 2O2UA 1Y6BA 3EWHA 2R2PA 2VD5A 3QTUA 3KK9A 4B6LA 3ZO4A 4EOQA 4IZAA 2QO2A 3RJCA 2V7AA 2WKMA 2UZLA 4DFYA 1YHSA 2QONA 4MH7A 1CDKA 5F1ZA 4NH1A 5HNGA 2YLEA 3MN3A 3PYYA 4YTIA 5DE2A 2PVHA 4YZMA 5EQPA 2JDVA 2KTYA 2HYYA 3MJ1A 4RSSA 2GHLA 3V6RA 3ALNA 4EK3A 5EG3A 2ZMCA 1V1KA 4PDSA 3ZEWA 4A9UA 4GKIA 4J96A 3H9FA 3OCGA 5C9CA 4QMNA 2OSCA 3AC2A 3QRJA 4FOBA 3PJ2A 1Q3DA 3BRBA 2X6EA 3O8PA 2R3IA 4DCEA 3U6IA 5H9BA 2O63A 4F9CA 3L8PA 1M2QA 4CFVA 3QTZA 2W4OA 2C30A 4XV2A 3RKBA 2GNLA 3GUBA 3R83A 3U87A 5BUJA 4O7VA 4GRBA 1OECA 3VUKA 5F95A 3K2LA 3EFWA 3QZHA 3UQFA 4UWBA 2GS2A 4WG3A 5EYMA 3FL4A 1JAMA 4FKRA 4ZSJA 3SOAA 5GIPE 4J7BA 4J99A 5FXRA 2WOUA 2HELA 2X1NA 2CJMA 3EQCA 5ETAA 4PMTA 3VW6A 2DWBA 4IAAA 4GG7A 4RMZA 4XG4A 4XEYA 4EHVA 5ANJA 3U54A 4JG6A 1U54B 3KMMA 4IAYA 4O7SA 1B39A 2C0OA 4RA4A 4BDAA 1ZWSA 3RCDA 4UMRA 3GB2A 4NSTA 5A4QA 2WTVA 3WF5A 2XKCA 4UMUA 4FYOA 3O8UA 2ITQA 4MD7E 4HPUE 4O7RA 4W8DA 2VTRA 4APPA 4I6FA 3UIMA 2WTCA 3PP0A 3BE9A 1XH7A 1JKKA 2W1GA 2R3RA 3ORLA 4NIFA 2H96A 3VBQA 4B8MA 4FSQA 5CXHA 3TCPA 4FR4A 4PTEA 3H3CA 3KVWA 4BCIA 2JAMA 3UIXA 3ZCLA 4O0TA 2PULA 3UZPA 3TZMA 3A7JA 4GS6A 3TL8A 5KBQA 4EZ5A 2WMRA 1J7LA 3R7OA 4TL0A 3I81A 3JUHA 3HMIA 4MEDA 2YFXA 2QOCA 3FKLA 3OT3A 3OOGA 4WG4A 4ZSEA 3LKMA 2PVNA 4A06A 1UWHA 4KAOA 5AUZA 4KSQA 3DXPA 3E87A 5IH5A 3V5TA 2UZVA 2F7EE 3S1HA 2O0UA 4JOAA 3SQQA 4GT3A 3IECA 3MH2A 3Q5IA 1IASA 4IE9A 3V5LA 3R2BA 4O83A 4X2KA 4A9RA 3FSFA 5C26A 5D12A 4HVHA 5HZNA 3R1YA 1YQJA 2QOIA 3SGCA 4G6LA 5HEZA 4YGAA 4ZTRA 1KV1A 2VZ6A 3PXKA 3ZBFA 1BLXA 3FLWA 3R9HA 4QP4A 4WHZA 3R01A 4GIHA 1V0OA 4YHTA 5HE2A 5T6KA 5TO8A 4ITJA 3FMDA 4HCTA 3R9RA 5CNOA 3KULB 3GC7A 3ORZA 4FTCA 5HCYA 1FGIA 3VS0A 3E64A 3BV3A 3PVWA 3QCXA 4QP2A 3SKCA 1J7UA 4C4HA 4BIEA 4I23A 4A4LA 3OEZA 3RAWA 4E73A 4E4NA 4FKUA 4GVJA 4C61A 4XUFA 3RI1A 4RG0A 3V3VA 4FE2A 4NUSA 3SV0A 2J0IA 2FUMA 3N4VA 3QRIA 4U44A 2ZM3A 4YSMA 4HYSA 4IZYA 3NAYA 3ZO3A 3RM7A 2C5YA 3VS3A 4ZTQA 2JITA 4LYNA 5I5ZA 1OPLA 3DXNA 3I0OA 2B7AA 5CU3A 4FUXA 5J9LA 2WTKB 1OL7A 2W5AA 3BHYA 3VS7A 4YTHA 4O96A 4EYMA 4EWHA 2W1CA 4YTCA 2CGVA 2UVZA 2VWIA 2UW3A 3NX8A 3PIZA 4FKIA 4BKZA 4OAVB 3FAAA 2YWPA 4YZBA 3QGYA 2FB8A 2R3FA 3GCPA 2R5TA 3OW4A 3FQEA 2VNWA 2PY3A 4RIYB 5DVRA 2HZ0A 4BCFA 3NNXA 4RJ8A 4EK8A 3Q53A 4FT7A 5DA3A 3ZRMA 1PY5A 3DAEA 3GOPA 2Z7RA 3QWJA 3P9JA 4Q5HA 2VTHA 5KHWA 1XBCA 4M12A 5ETIA 2JKKA 5EKOA 4C4GA 4NW6A 3D7TA 3PIXA 3HP5A 4U7ZA 1X8BA 1B38A 5I9ZA 5K4JA 5DT0A 1ERKA 3FMNA 4XJ0A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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