5E1EA

Human jak1 kinase in complex with compound 30 at 2.30 angstroms resolution
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
290
structure length
279
Chain Sequence
VDPTHFEKRFLKRIRDLGEGHFGKVELCRYDPEGDNTGEQVAVKSLKNHIADLKKEIEILRNLYHENIVKYKGICTNGIKLIMEFLPSGSLKEYLPKNKNKINLKQQLKYAVQICKGMDYLGSRQYVHRDLAARNVLVESEHQVKIGDFGLTKAIETDKETVKDDRDSPVFWYAPECLMQSKFYIASDVWSFGVTLHELLTYCDSDSSPMALFLKMIGPTHGQMTVTRLVNTLKEGKRLPCPPNCPDEVYQLMRKCWEFQPSNRTSFQNLIEGFEALLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Identification of azabenzimidazoles as potent JAK1 selective inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Tyrosine-protein kinase JAK1
total genus 88
structure length 279
sequence length 290
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2015-09-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5e1eA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5e1eA01
4MAOA 1H01A 2XCKA 5EI8A 3SHEA 2WTIA 1WZYA 2W05A 4BDDA 2NPQA 5HORA 5HIDA 5DVRA 2YITA 5EKOA 4CNHA 3DJ5A 3SX9A 4OGRA 3LFCA 2BFXA 3P79A 4F1TA 2J90A 5HU3A 3SW7A 3Q04A 2HY0A 3FC2A 4K77A 3GP0A 3VW6A 3UODA 2PUPA 4F0GA 1Q8UA 4UEUA 1R0EA 3V3VA 2OLCA 3ZZWA 3AMBA 4CVAA 2XMYA 3MY5A 4B0GA 3LMGA 3FBVA 4X3FB 1GOLA 2W4OA 2F2UA 3R1QA 3UG1A 5A54A 3FEGA 1BKXA 3ORMA 3EQBA 4KD1A 5JEBA 4OTGA 3AC4A 3PY1A 1X8BA 4LV5A 5KMJA 2BIKB 2F7XE 3E7OA 4RBLA 3DY7A 2IWIA 1GAGA 3PG3A 4Y46A 4NUSA 3KKVA 3DXNA 3FL5A 4QQ5A 3R1NA 4C33A 2HOGA 5FBNC 4C8BA 4TPTA 3DQXA 4USEA 3AD5A 2RSVA 4FTIA 3VUTA 4IX4A 1SMHA 2XNGA 2QR7A 4DEAA 1PYEA 2OIDA 1REKA 4RJ4A 5HG9A 5HX8A 4F6SA 5LVMA 1XH7A 3TUBA 4IC7A 2Z7SA 2GTNA 1AGWA 3DGKA 4F9CA 4TWCA 4C2WA 2PL0A 3F61A 3P4KA 2IVTA 3GCPA 3BRBA 4I6BA 3WF9A 4AN3A 1V0OA 4G5PA 4W8DA 3I0OA 3R9RA 3R02A 4YJPA 5DGZA 3HGKA 3NUPA 3AGMA 3OXZA 4GFMA 3ZBXA 3BYMA 5E8TA 3C4ZA 4FL3A 4D2WA 3LPBA 4V0GA 4LOOA 5LVOA 1IA8A 1XQZA 2R3JA 3NS9A 2PUNA 3W18A 1YWNA 3O0GA 4S32A 4ANOA 3R8UA 5K5NA 2X4FA 4FBXA 4QMYA 4XV1A 5AX3A 3W2SA 3ZOSA 2QU5A 3R8VA 2QOCA 5FTOA 5JH6A 2VNWA 3ORIA 4N4SA 5IUIA 2IZSA 4J99A 1P2AA 3QZFA 4JX3A 3SW4A 3AD4A 3E7VA 3AT2A 5HCXA 5ETIA 1Q8YA 3N51A 5J95A 3GC9A 3L8XA 4BIDA 4M3QA 4BI2A 5HLNA 4Q9ZA 2E9NA 1NVRA 3L8SA 3VHKA 3DXPA 4FT9A 4V05A 3ZONA 3R7YA 4BDEA 2B9IA 4QTAA 4C02A 3TACA 2UW8A 3WF7A 4PP7A 3SRVA 4DFXE 2JFMA 3RWPA 4EZ7A 2YABA 4U44A 5J9LA 1PW2A 3BHTA 2JIVA 3R2BA 4V04A 1KUTA 2ETRA 3LCOA 1Z5MA 4F9BA 4ENXA 4CYIA 1KOBA 3HKOA 4RC3A 3ATTA 3MPTA 3CEKA 4FKUA 2PZRA 4JQ7A 1YVJA 4X2KA 4DH7A 2VU3A 5CVHA 4EOQA 3KGAA 4D4RA 4ZJIA 4CMTA 3C5IA 4NTSA 3DBEA 3IK3A 4MKCA 4J71A 5IUGA 1MP8A 3W2CA 3R7OA 3O7LD 1K9AA 5TR6A 3H9RA 4N6ZA 1VZOA 2IZRA 4KINA 5AR8A 3D5VA 4RG0A 5E8YA 3KQ7A 2QOHA 5BVKA 1WVWA 2YM6A 4JDIA 3VC4A 4JDKA 4D58A 4DH5A 5EI6A 4YR8A 4DH1A 5AP4A 2EB3A 3NX8A 3P0MA 2VWWA 5EM7A 5B0XA 3LM5A 5HTBA 3R9DA 5EG3A 3OHTA 3QWJA 2W5AA 4CZUA 2ZM3A 5C8KA 3TKHA 3KF7A 2R64A 4J52A 5J1WA 2C47A 4EH8A 4QT1A 4EOKA 5CF6A 5HNBA 3FQEA 3VUGA 4TKSA 3RGFA 3D4QA 3V5TA 3BLRA 2UZTA 4IE9A 5CSVA 1OI9A 4J98A 4GSBA 3ZMMA 5JFVA 5C9CA 3C13A 3E64A 3ENMA 3ODZX 3QWKA 4FKPA 4NM7A 4MNEB 3ZRKA 2ERZE 3DS6A 3MBLA 3ZFYA 3OXTA 2XK4A 2BTRA 3Q96A 5CU0A 3QZGA 5J5SA 4EH9A 3RMFA 4TYJA 2XKCA 3CJFA 4HPTE 3L9NA 3F2AA 3L9PA 2C5OA 4I6QA 3RAIA 5AAFA 1RQQA 1PJKA 2UZOA 3OS3A 2QOOA 3PXFA 4AGWA 3I6UA 4JT3A 4KA3A 3VS0A 5CS6A 5BVOA 1I09A 3CIKA 2PE0A 4K8AA 2P55A 3G2FA 4AUAA 3JUHA 4EOMA 3B8RA 4U79A 4A4LA 2CLQA 4EL9A 1J7UA 3SOCA 3ZYAA 4U42A 3R7VA 3A62A 4NZWB 4P90A 4E1ZA 3PSDA 2WFYA 5E8VA 5AR4A 2VX1A 4C2VA 1WVXA 2J4ZA 2R3FA 4LUDA 3BWFA 4TWNA 4BB4A 4FSYA 1UA2A 2WGJA 3NYXA 5AV1A 4PRJA 5CZHA 1LEWA 4I0SA 4MQ1A 5HLPA 4RGJA 3VHEA 1JSTA 3TG1A 4UWCA 3E93A 4M97A 5AV0A 5M09A 3RALA 2XVDA 3RAWA 4CKJA 4CFVA 5LJJA 4WNPA 1ZYDA 3ROCA 2XKEA 3GGFA 4EOLA 1Y6BA 2ZM1A 4FC0A 3VW8A 3VAPA 5EHYA 1F3MC 4FV1A 3BKBA 5TOZA 3V5JA 1WBNA 2HELA 4BDFA 5ANJA 3A8WA 4DBXA 2QOIA 3HECA 2FYSA 4KUJA 2BROA 3ALOA 1QPCA 1ZYLA 3PJ1A 4FG7A 5T3QA 4HVIA 3EL8A 1H1WA 5JGDA 3AXWA 1V0BA 5LMKC 5HE3A 4O7RA 2OWBA 2HIWA 3MSSA 2PVHA 2PE1A 2PK9A 4NK9A 2IVUA 2VWZA 4U3ZA 2IO6A 4IXPA 3FY0A 2JBOA 4GL9A 4ZMEA 2FGIA 4R78A 3MV5A 4BDJA 5CAQA 4YZNA 3IOPA 4NM3A 3C7QA 4DLIA 3SC1A 4ERKA 4ACGA 2ONLA 1J1CA 1PY5A 4GU6A 4L7SA 4ASXA 4I4FA 4YBKA 5IA1A 4DFNA 5IQBA 4RJ7A 3UIUA 3TNWA 3WBLA 5CAPA 5TF9A 1IASA 3R22A 3QC9A 3QZHA 3EQRA 1UU7A 1GIHA 4FNYA 4FTTA 3U87A 4JQEA 1U5RA 2QC6A 4J8MA 2B4SB 2YAKA 5FEDA 4BC6A 1PKGA 4EH4A 5AV4A 3FMKA 5K0XA 4FF8A 1REJA 4WRGA 1NW1A 1QL6A 4ZJVA 4XEYA 4E20A 2W1HA 2FUMA 4I20A 5D41A 5HTIA 5JKGA 3SDJA 1V0PA 2PVYA 3IOKA 4RWKA 5BVEA 5M4CA 1J3HA 4QYGA 1ZYJA 4FK3A 3HP2A 2VWIA 2XA4A 2Q0NA 4O96A 2R3PA 3PUPA 5IISA 5EOBA 1ZMUA 4P2KA 4Y5HA 3GI3A 3QRIA 2PUUA 2F2CB 4LRMA 4Z9LA 3RM6A 5I9VA 3IDBA 4IX5A 4TZRA 1A06A 4JBQA 2GHLA 4AWIA 5KCVA 3OWLA 2BZHB 3F5PA 3OEFX 1NY3A 3BHUA 1UNHA 3FSKA 2ESMA 2QG5A 2BPMA 5JGAA 2YM8A 4QQCA 3PDTA 5IQEA 5J79A 2WQNA 4N70A 4F7SA 3Q6WA 1WVYA 5IQAA 2LGCA 4RX8A 1LR4A 2OSCA 4AW0A 2PMIA 4NEUA 5A4CA 1UKHA 3V6RA 2XRUA 4M84A 3ZRMA 1Q3WA 1ZMVA 2GNLA 3D0EA 5KKRB 2I0HA 4I1ZA 1J1BA 1Q5KA 1KE7A 4PV0A 3EN7A 2C3JA 3QCSA 5DHJA 4R1VA 4FVPA 3S3IA 4RWIA 4KABA 2CGXA 3PFQA 2AC3A 5IA4A 1PRYA 2Y7JA 3AOXA 2WQMA 3FV8A 2Z7LA 2O8YA 5JT2A 3GQIA 2WTWA 4EOJA 3R71A 5H8GA 3FPQA 2HK5A 4XG8A 4WBOA 4U3YA 3EL7A 3GOPA 4PNIA 4OBPA 4YNEA 5AR2A 4TNBA 4I6HA 2C0TA 2XNEA 3VIDA 4D0WA 3PYYA 4K1BA 1Y8GA 2R2PA 2Y6MA 4D2TA 3VS5A 4I5MA 3AMAA 3OD6X 4D0XA 3EOCA 4L3PA 3DU8A 5AM7A 5IQGA 2YIWA 3TEIA 4BVUA 4I3ZA 2BRNA 3W2RA 4G17A 4ACMA 3I0QA 5DMZA 3DK6A 3OW3A 1FBNA 4C3FA 3AD6A 4C58A 3O8PA 2F57A 4QMSA 1YXXA 3T3VA 3PVGA 4I22A 3VBVA 3C4WA 3KXNA 2JLDA 3GFEA 2BIYA 1ND4A 3Q2JA 1OGUA 2YIQA 3CPCA 4ZTSA 1E1VA 3BE9A 3UOJA 3V01A 4BCFA 2OK1A 4BCQA 5FTQA 2VTOA 4LFIA 3POZA 4WRSA 2OG8A 3KXZA 5FRIA 2B9FA 3MIAA 4BRXA 5E92A 3KN5A 3R73A 4ANMA 4BN1A 4JI9A 3QQUA 4K2RA 3IGOA 3WOWA 4CFXA 1RJBA 4G3GA 2WMXA 3AG9A 4O2PA 1B39A 2UW9A 4QTDA 5IA0A 2QI8A 4UN0C 1OBDA 5J7BA 3E92A 4FOCA 3P9JA 2BILB 4C4GA 4F4PA 3DKOA 3CGOA 3G0FA 4OTWA 3II5A 5BQ0A 4IAYA 1DI9A 3QGYA 4KBCA 4MXOA 2QHNA 2W0JA 3VBTA 4C4HA 4I41A 4DH3A 4BFMA 3PP1A 2Y4IB 3EN4A 3ORTA 5AWMA 3VRZA 5HD7A 4N57A 4HYIA 4AGDA 2PMNX 3PLAE 3NPCA 4QMWA 5CF5A 2O65A 2CCHA 4ONAA 4C38A 3KCKA 5CEKA 4QMPA 3QQKA 4FKVA 3OMVA 2F49A 3CSVA 1JWHA 4FSRA 3RVGA 3F88A 3HUBA 4XP2A 5I0BA 2X2MA 1WFCA 3WYYA 4U43A 5DG5A 5DLSA 3F66A 3R21A 2BRGA 3D7TA 1R0PA 2VTJA 3LFSA 4DGNA 2ITOA 4EONA 2OGVA 2R3RA 1P5EA 3EQHA 4OW8A 5HBJA 2PULA 4E4LA 3BU3A 4WHZA 4XG3A 4XUFA 3A4PA 1YDTE 2PE2A 4H3BA 3ZUUA 5L3AA 5CU3A 4BDGA 1NVQA 4LG4A 5CVFA 1PXIA 1XJDA 1Q8TA 3MGYA 5FEEA 4DG2E 1DS5A 1PXMA 2XYNA 4QMQA 2XK3A 2UW6A 3FY2A 4WG4A 4M69B 4CEGA 5AUVA 3NW7A 2ITQA 3MYGA 4FT3A 3I5NA 2I0VA 4JXFA 5CSHA 4H1MA 4MD7E 3Q2MA 3TZMA 1FVRA 4X2GA 5TE0A 4NJDA 5FWKK 1Q8WA 2OI4X 3DQWA 5HICA 4NIFA 4E8AA 3D7ZA 5C03A 3ZZEA 4BCJA 3CD3A 3V04A 1H4LA 4NU1A 3I79A 3I7BA 3RPYA 4D9TA 3RJCA 4NW6A 2YERA 3GQLA 4QMXA 4QMVA 2X6EA 4IADA 4RVTA 3BU6A 3F5UA 3TM0A 4O7SA 1OPJA 2WMRA 2GCDA 4OT5A 5HZNA 1O6YA 3UC3A 5C26A 4FEUA 2IG7A 5EI2A 5J9ZA 4M12A 5GJGA 3PPZA 3W55A 3VS1A 4R5SA 5BVWA 4E7WA 4C7TA 3MWUA 2QURA 2J0MB 2WQOA 5K0KA 2JDTA 3VUMA 2PVLA 3QALE 5FUTA 1OUKA 2WZJA 3WZJA 4BYIA 4TWPA 2G2HA 3PG1A 4U40A 1UNGA 3UO6A 4AF3A 1JQHA 1Q62A 2WTKC 4ID7A 4K33A 3V5PA 4RVLA 4YJTA 3IGGA 4OT6A 1M17A 2IW6A 3BE2A 3WF5A 3MVMA 4BWXA 4I24A 4ZTHA 2VWUA 3QC4A 4KKEA 2KULA 3FXZA 3IDPA 3CQWA 2XIKA 3LCTA 3JY0A 4JX7A 3IW7A 4XG9A 1UVRA 4FYOA 3VVHA 4XMOA 2YM7A 4CMUA 1P4FA 4FR4A 4RIYB 3T3UA 4A9YA 4PWNA 5KE0A 2G2FA 4U0IA 3BV3A 4JR3A 2GQSA 3PIZA 4O38A 4MF0A 3U9CA 3DDQA 2J6MA 2UW7A 3OWKA 5DT4A 5E1EA 2C5XA 5FQDC 4GUBA 4BCHA 3UNKA 5FM3A 3FHRA 3ZO3A 4C3PA 4DN5A 3Q9ZA 3OCTA 3LHJA 4UMQA 5FEQA 4CLIA 5CEPA 2GHMA 3TXOA 1GZKA 4Z3VA 4YPSA 4O91A 3F6XA 4EHGA 4EYJA 4OTQA 1O9UA 1R78A 2Y0AA 4DFYA 3GU6A 4IMYA 3LE6A 4YJRA 3UVQA 5IH5A 3DBCA 5GIOE 5KBRA 2ZVAA 4RJ3A 4V01A 5E4HA 3RZBA 2IW9A 3UQFA 4RC4A 2Z7RA 3UGCA 3E8CA 5D7AA 4CRLA 4BYJA 3EB0A 5LQFA 1JOWB 2BAQA 4PMTA 2OFUA 4L52A 4F0FA 4XBRA 1Y91A 4IVDA 3SKCA 3B2TA 2JAVA 3DOGA 2BUJA 4X2JA 3NNUA 2W1FA 2BAKA 3GNIB 1FOTA 3JYAA 1GY3A 4QTCA 4ZK5A 1YHVA 4RJ8A 2OU7A 1OL2A 2UZNA 2IVSA 3EZRA 2OJ9A 4DFUA 3C0IA 1YHSA 3Q60A 4ZJJA 4BTFA 1GNGA 4QNYA 3UIBA 2WMBA 4ARKA 2P2HA 4HZSA 1F0QA 3ACKA 4GFOA 3NVKI 2ZV9A 2ZYBA 3KC3A 3ATSA 5IDNA 2RFSA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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