5E8SA

Tgf-beta receptor type 1 kinase domain (wt)
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
301
structure length
301
Chain Sequence
GGTIARTIVLQESIGKGRFGEVWRGKWRGEEVAVKIFSSREERSWFREAEIYQTVMLRHENILGFIAADNKDNGTWTQLWLVSDYHEHGSLFDYLNRYTVTVEGMIKLALSTASGLAHLHMEIVGTQGKPAIAHRDLKSKNILVKKNGTCCIADLGLAVRHDSATDTIDIAPNHRVGTKRYMAPEVLDDSINMKHFESFKRADIYAMGLVFWEIARRCSIGGIHEDYQLPYYDLVPSDPSVEEMRKVVCEQKLRPNIPNRWQSCEALRVMAKIMRECWYANGAARLTALRIKKTLSQLSQQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of apo and inhibitor-bound TGF beta R2 kinase domain: insights into TGF beta R isoform selectivity.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords TGF-beta receptor type-1
total genus 102
structure length 301
sequence length 301
ec nomenclature ec 2.7.11.30: Receptor protein serine/threonine kinase.
pdb deposition date 2015-10-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5e8sA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5e8sA01
3BYOA 3HL7A 3SOAA 4FNZA 2YITA 3COKA 3CQUA 3WYXA 5C27A 4L00A 2CSNA 4UMUA 3GCVA 5FTQA 4GIIA 4RQKA 4WIHA 1R0PA 3MV5A 4FV8A 2VTAA 3VUHA 4E4MA 2XK7A 3GU8A 2OJ9A 4Q9ZA 3HNGA 1GIHA 4F9AA 4KWPA 4NIFA 2YJSA 4YJPA 3Q6WA 3OWPA 4YJNA 3G0FA 4O7TA 4OTPA 1OIYA 5DR6A 1RQQA 2QURA 3QTRA 4JDHA 4WUNA 1Q4LA 3UO4A 3R30A 3IKAA 2O2UA 4RLKA 5K4JA 2CPKE 4OAVB 5IMEA 3R1SA 2PZ5A 4EH4A 5HTIA 2DWBA 3V5TA 1JNKA 4HYSA 4J7BA 5AV4A 4F6UA 1GJOA 5AP5A 2EXMA 4NU1A 4IC8A 1H1WA 4XP3A 2Q0BA 4TL0A 1XR1A 4BTFA 5FGKA 4AZVA 2J7TA 5ANDA 1H00A 2YFXA 1P5EA 3L9MA 1CSNA 3I0OA 3NZ0A 2VV9A 2W1FA 4QYGA 2WTCA 2QOOA 4WRSA 2HY81 2PVRA 3DJ7A 4C7TA 4DLJA 4L44A 5A4CA 5FTOA 4RLLA 5M07A 1ZMWA 1QL6A 2SRCA 3BU3A 3QTIA 5E1SA 4C36A 3L8VA 4E6CA 1XJDA 5BUJA 1YW2A 5J79A 2ZB0A 2Y6MA 2OXXA 4DITA 4W9WA 1H24A 4GVAA 4JBVA 5DE2A 3OW4A 3QYWA 4CFFA 1O9UA 4GRBA 4WD5A 3AC3A 3QBNA 4XCUA 5B2LA 4IXPA 3CD3A 5JEBA 4IAKA 1IRKA 1YKRA 2J0IA 1ZYDA 3BYMA 1WBOA 3ITZA 3LFSA 5DBXA 5GZ9A 1JSVA 4DH8A 4YSJA 2E9NA 5C4LA 2XJ1A 3RCJA 3VS1A 5LWMA 4CGAA 2B7AA 5LVLA 4EOKA 3ENHA 3F82A 3OT3A 5CAUA 5JFWA 1U5RA 4LG4A 5C4KA 3D0EA 5LCKA 3TNWA 5IQEA 2OJIA 3TUBA 4N0SA 5CSXA 4FIIA 5DRBA 3UOLA 3C5UA 3IO7A 4D5HA 2BRBA 4RA4A 5EW9A 4OW8A 5DGZA 3R00A 1ZMUA 3V5JA 5CAQA 1MP8A 4AN9A 2UW3A 5EOBA 3VHEA 4M13A 4FBXA 4PMPA 4I5MA 4RIOA 4BN1A 1H4LA 5K3YA 2JEDA 3GU6A 4FZDB 2W5AA 2EUFB 3RPSA 4FV5A 5IEXA 3LQ8A 1O6KA 3QCSA 1WVXA 4QP3A 5AJQA 5HLPA 4DBNA 4EEVA 3UZTA 3OXIA 4I0SA 3U9CA 3PY3A 3KK9A 2XB7A 4FT3A 4DFBA 5EQYA 5D41A 5EK7A 5IH4A 5H9BA 4EJNA 4Z16A 1ZAOA 4U42A 3R04A 2B1PA 3DJ5A 3DBCA 4YNEA 5CXHA 5L8LA 3FHRA 4P5QA 4JAJA 2JKKA 4PMSA 2OSCA 4QMQA 2C3LA 2UZEA 4M12A 4EI4A 4QMUA 2BKKA 5KUPA 3TZ8A 1GIJA 1H1QA 1U46A 2O63A 3FEGA 3BLRA 3HV7A 3NX8A 3V6SA 1FINA 1Q5KA 2A0CX 3OS3A 4FNYA 4FTJA 3CJFA 2ITQA 3PSBA 3MYGA 4O0WA 5CLPA 5ETIA 3TTIA 5J8IA 5FQDC 5IUIA 2GPHA 2YABA 3UNJA 1CDKA 4O7ZA 2VUWA 2A19B 3PG3A 4BCHA 5JH6A 3ZS5A 3D7TA 5JT2A 3MDYA 4O6LA 3PY1A 4II5A 2QOIA 4PQNA 4P90A 5ANJA 5L8KA 2R3GA 3BYUA 2YWPA 2W4JA 2XIXA 5BUIA 5JZNA 3KCKA 1URWA 2QONA 3R22A 4WNMA 5CU6A 3UBDA 3PP1A 5AWMA 1U5QA 5HVYA 4H3BA 2PVLA 3VF8A 2OIBA 4FTTA 3FZ1A 4QMXA 5HI2A 4E7WA 2GHMA 4NW6A 3I0QA 2VO6A 4WUAA 4ZLYA 3A7GA 3PFQA 4S2ZA 3ATTA 1H08A 5E8SA 2QODA 2V62A 4RGJA 3IGGA 4FODA 4BDKA 5AP6A 4AX8A 3DKFA 4FSUA 3IW5A 2BTRA 3OEZA 3QU0A 3VW8A 2WIPA 4USEA 3KRXA 2XK3A 3TN8A 3RTPA 4EHVA 3BI6A 1WBVA 1Z5MA 5IQFA 2RFEA 4JBOA 4OBOA 4RJ7A 3BHYA 4U9AA 4HCTA 4NKAA 4TRLA 2C5NA 4IDVA 3HRBA 3PA5A 3R7GA 3GI3A 5CF6A 2WMRA 5J5TA 2RGPA 5BYLA 2CLXA 2WMTA 3GCQA 2Q0NA 3CS9A 4KS7A 2JBPA 2BIYA 2VTRA 3OBGA 4LL0A 4Y8DA 3UO5A 4QD6A 1L8TA 4M0YA 5CX9A 4IIRA 4H1MA 3MY0A 3CP9A 4DFYA 3BV2A 5KMOA 4BFMA 2BPMA 5M4CA 3NUNA 5IG1A 2R3MA 5AR3A 2R3RA 4I0RA 3V5WA 2YCRA 3VIDA 4CD0A 1YDSE 2VWVA 4RVTA 5E8WA 3UTOA 3LJ2A 5M4IA 4D1SA 3SXFA 4CTBA 3R0TA 1MQ4A 4RIXA 3ROCA 4GG5A 1J7LA 4W8DA 2F2UA 2QO7A 3MWUA 3PIZA 4FKGA 3SVVA 3E7VA 2X81A 3PLAE 2QI8A 5LMKA 3EZRA 3DFAA 3GFWA 4QTBA 1OL5A 3RNYA 4IM0A 4AU8A 4EKLA 4C58A 4PPBA 3FC1X 5FM2A 1BI7A 3VUIA 1SMHA 5HQ0A 4NYEA 3BHUA 2ZAZA 4JG6A 3CQEA 1OL7A 2DUVA 3MI9A 4S33A 4TN6A 4PUZA 2ETKA 5DEWA 3DQWA 5T3QA 4LOPA 5I9YA 2J0MB 2W0JA 5H8GA 3C4XA 4AAAA 4ACDA 2R3IA 2YM6A 3DAEA 4RWJA 5CZHA 3V6RA 2JIIA 4CCBA 4E73A 4BCJA 3AT2A 1PXOA 2P33A 3AXWA 4D55A 4YMJA 3AMYA 3O8UA 4DT8A 2BZJA 4IDTA 2XA4A 4FI1A 4KIKB 3BU5A 4BICA 5D10A 4LFIA 3CC6A 2LGCA 4QMMA 3QUPA 3C4CA 4IZAA 4GV1A 5F94A 3UG1A 4BCMA 2W1HA 2PVHA 2WQMA 5FLFA 3R7VA 3SD0A 5DEYA 3UNZA 2R3KA 4X2FA 5AIRA 5KE0A 1QCFA 1Q99A 4ZJVA 4P5ZA 3C7QA 4IB3A 1OUYA 5GJFA 2BAKA 4EQCA 1QPJA 3QC4A 4ALUA 4F9BA 3P78A 3QHRA 3QQLA 1UU3A 2QU6A 3QCYA 4RVKA 3OY3A 4CKRA 4FL3A 3ZFYA 2JFMA 4BDCA 2YZAA 3TZ9A 5DT4A 1IR3A 4ZS0A 1IA9A 5CEOA 1DAWA 3ETAA 4C34A 5EI8A 2WMSA 4FIEA 3ZU7A 4CFUA 4D1XA 3OZ6A 3DKGA 1MRUA 2ITTA 3PUPA 4PRJA 5FEQA 3ZMMA 4TYHA 3TKIA 3RINA 4JQ8A 4NT4A 4BCNA 3G0EA 4CSVA 3LMHA 1WBWA 3W2SA 4J71A 4JT3A 3GCSA 1WAKA 1OI9A 4IWPA 4BHNA 4ZEGA 3LAUA 3P0MA 3FZRA 3V8TA 2JIVA 3QD2B 4X3FA 3QX2A 5DI1A 2QOLA 4EOIA 3MVHA 4WG3A 3U55A 2A2AA 1GNGA 3UOKA 5A46A 3R21A 5DNRA 4M8TA 5L2IA 3R9HA 5IEYA 4F1OA 2J0JA 3V04A 2RFNA 3FI2A 5M55A 4DCEA 4AT4A 4ZMEA 3RCDA 4AG8A 2BMCA 1REJA 4QPAA 2JDVA 2V55A 1VR2A 3IDPA 4LM5A 5IMXA 4U8ZA 4M15A 5AUZA 4ANOA 3FSFA 4CZUA 3TKHA 4W4WA 3DZQA 4FOCA 4G5JA 3FKNA 4EH2A 4UMPA 4J96A 4BDIA 4V04A 2ERKA 3MSSA 3V5QA 4ZS4A 2QQ7A 2VX0A 4C02A 3GOPA 3T9TA 3NWWA 4TWOA 1U54A 4DH5A 3MPAA 2W1ZA 1M52A 2HWPA 1KE6A 4ID7A 4EH5A 3UQFA 4YJVA 1W84A 4FUYA 1GOLA 5B2KA 3LCSA 3VS7A 2YM7A 2QG5A 4BWXA 2WPAA 2QR8A 2XM9A 5K4IA 1SVEA 1W98A 1PKGA 3C4ZA 3LIJA 4IVBA 4D2PA 4WNOA 2JDOA 1W82A 5J87A 2FB8A 4KUJA 1WZYA 4ZJIA 2IO6A 4YURA 4FKIA 3L8PA 1FVVA 4GYGA 3QQFA 2GDOA 5HU9A 1GZNA 4ACGA 1H27A 3P7CA 2VU3A 2B9JA 4NIFB 3RAHA 4KA3A 3FMEA 4TXCA 4YTFA 4I5HA 4NL0A 4MQ1A 3AC4A 2VWXA 4FSWA 4G3EA 4S30A 3VRZA 4MD7E 5IA4A 2OXDA 5AA8A 2B9HA 4IHPA 1S9JA 3UVQA 3RZBA 2HOGA 2VZ6A 3CEKA 2UZVA 3EFLA 3QX4A 4LMUA 4WO5A 4NZWB 3VS4A 3W33A 4BL1A 3RM7A 4BKJA 4CV8A 3F3WA 3Q3BA 2EB3A 4TY1A 4U7ZA 1OB3A 1R39A 3UC4A 5BMMA 4L43A 1UNGA 3CCNA 3A99A 5CI7A 3U9NA 4C3PA 1SZMA 5AR5A 4FIHA 3FLQA 2I40A 3GQIA 2AUHA 3E92A 4MQ2A 4CYJA 5BVFA 5CASA 5GZ8A 4ZP5A 5IQAA 3L9PA 3VS0A 5A3XA 5HIBA 3PIYA 2JLDA 4ANMA 4HVGA 5BQ0A 3EQCA 4RX7A 3WE4A 4ZTNA 2VNWA 3BEAA 4XRJA 2RFSA 3GCPA 4CKJA 3NEWA 4BTKA 3E7OA 3W32A 3ODZX 3ZXZA 1PMEA 4OBQA 3LXKA 1OPLA 4DH1A 2QOFA 3IW6A 4PTCA 2GNFA 2ZV7A 3DXNA 5EDQA 4FTNA 3KL8A 1PJKA 3SLSA 1XH7A 1BKXA 2PK9A 3MY5A 3FAAA 5HTBA 3C9WA 5IU2A 3LLAA 1ZXEA 2XBJA 5DR2A 4DBXA 1BL6A 1CMKE 3BBWA 4WBBB 3ZONA 4F0FA 4EORA 5EQEA 2PL0A 4DGLC 1GZOA 2QVSE 3T3UA 4CVAA 3JYAA 3F7ZA 4BDBA 2XIKA 4W9XA 3U87A 3Q60A 5IA3A 5FXRA 1G3NA 4FEXA 5EI6A 3E5AA 3EQIA 2REIA 3UJGA 3QUEA 4F9CA 2XNBA 2VGPA 3P4KA 4CLIA 2Y0AA 5AV1A 4RX8A 5M44A 5EHYA 1MRYA 5BNJA 3EKKA 5C26A 3ZEWA 3EZVA 4I20A 3PTGA 4EH9A 2WZJA 2F2CB 4MXAA 4NTTA 2WNTA 2WMQA 5FG8A 4KIOA 2C6OA 3PDTA 3VUKA 4RG0A 2Z8CA 1PRYA 3EN7A 4P7EA 4UX9A 2PULA 3PYYA 5AX9A 4YO6A 4BIBA 4FZ7A 5AUYA 4AN2A 3BWJA 5F20A 4APCA 5LOHA 5FTGA 5CU3A 4YHJA 4IX5A 4D9UA 2VNYA 2XIYA 1Z57A 2VO3A 2Z7RA 3EYHA 3S0OA 4AACA 1F3MC 1UU9A 3F2RA 3E8NA 2XVDA 3PSCA 3PVWA 3LXPA 3PXYA 4MWIA 3ACKA 4XS2A 4LL5A 4WSYA 3WBLA 3MH2A 2HXQA 3EN6A 3NVMB 4R7BA 4MXCA 4ASZA 5ETCA 3I6UA 3I7CA 3R28A 4RWKA 4O38A 1WVYA 2PWLA 4QO9A 3QTXA 5AUVA 4LOOA 2IW9A 2HK5A 2W5HA 4DH3A 5DR9A 2XK6A 1NA7A 4RIWA 4ENYA 4BCQA 4O7SA 3R8PA 2ITPA 3NUUA 2GQRA 3M42A 1YWVA 3D7TB 2CCIA 3IW7A 5EHOA 3TTJA 4AS0A 4D2RA 4O0YA 4XX9A 4JDJA 4M68A 4QYFA 3OTVA 4BBEA 2C5YA 2UVXA 2W1IA 1UWHA 3KF4A 4QP6A 4BDFA 3H30A 4TKSA 4W8EA 3KQ7A 4D58A 1X8BA 2ZJWA 2QLUA 2JBOA 1YXXA 5GIPE 4AE6A 3R02A 1JOWB 2C30A 4LRMA 2WO6A 4G9RA 4J97A 4CMTA 2Z7SA 1XO2B 2XEZA 4OLIA 3IOKA 3RGFA 4AOTA 4AGWA 3LPBA 2XIRA 2I0HA 2PSQA 3BCEA 3NUSA 2W4KA 3ZLYA 2R7BA 3POOA 5IQDA 2G2FA 4IX3A 3TIYA 5L4QA 1M2PA 4JJRA 3TDVA 5AUWA 3QF9A 4AW5A 3QUDA 4QMPA 2YDJA 2UZNA 4X2GA 4DF3A 1Q24A 2PMIA 4XEYA 1OZ1A 2ZB1A 3RMFA 4EYMA 2CKEA 3WYYA 3WZDA 2YHVA 4U43A 3F69A 3D5UA 4JRNA 3QQKA 4ERKA 3CXWA 3O2MA 4DT9A 5KCVA 4RC3A 3A7FA 2GS7A 5L6PA 3GENA 2RG5A 5TE0A 4C4HA 1H28A 4LV8A 4EQUA 5JK3A 3EYGA 2JAMA 4QTEA 1E9HA 1LP4A 3F61A 3KN6A 2FVDA 4RQVA 4V01A 3RPVA 3QQGA 3ZSHA 4C4GA 2OO8X 3HV4A 2W96B 4MX9A 3E3PA 4CKIA 5AV0A 2HYYA 4NTSA 3R1NA 2BALA 4KIQA 2X8EA 2OW3A 4M67A 4ZSJA 2QR7A 1KE9A 4RIXB 3IGOA 3TNPC 2GHLA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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