5E8WA

Tgf-beta receptor type 1 kinase domain (t204d) in complex with staurosporine
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
303
structure length
303
Chain Sequence
MTIARDIVLQESIGKGRFGEVWRGKWRGEEVAVKIFSSREERSWFREAEIYQTVMLRHENILGFIAADNKDNGTWTQLWLVSDYHEHGSLFDYLNRYTVTVEGMIKLALSTASGLAHLHMEIVGTQGKPAIAHRDLKSKNILVKKNGTCCIADLGLAVRHDSATDTIDIAPNHRVGTKRYMAPEVLDDSINMKHFESFKRADIYAMGLVFWEIARRCSIGGIHEDYQLPYYDLVPSDPSVEEMRKVVCEQKLRPNIPNRWQSCEALRVMAKIMRECWYANGAARLTALRIKKTLSQLSQQEGI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of apo and inhibitor-bound TGF beta R2 kinase domain: insights into TGF beta R isoform selectivity.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords TGF-beta receptor type-1
total genus 102
structure length 303
sequence length 303
ec nomenclature ec 2.7.11.30: Receptor protein serine/threonine kinase.
pdb deposition date 2015-10-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5e8wA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5e8wA01
2G15A 3HP2A 2VNWA 4EOQA 3LE6A 5FXRA 3I60A 3CP9A 4L53A 5AUZA 3WIKA 1KE7A 5JMSA 2V22A 3PPKA 3LMHA 5JZJA 2PZYA 2X8IA 4O0RA 2X4FA 5EYMA 5K0KA 4K6ZA 3M11A 5ANDA 4KIQA 3U55A 3QXPA 2XYNA 2CLQA 3RPYA 4BBEA 4QNYA 3TZ8A 4IQ6A 2IZSA 5M51A 3ZM4A 4RGJA 2OI4X 3WZEA 1YDSE 4N4SA 3F5GA 3EB0A 3NAXA 3DAJA 3EJ1A 1W84A 3BE9A 2XK7A 3BV2A 4WG4A 1LPUA 3FMJA 3OG7A 3RJCA 2EWAA 3AC8A 3TCPA 2JDTA 3WYXA 4AZWA 3SOCA 4PWNA 3GEQA 3F9NA 1UV5A 5M55A 5M4FA 5DA3A 5H9BA 2VTQA 2W1EA 3F2NA 3LQ5A 4XV2A 5F95A 5HX6A 3F3WA 3GU5A 4LL5A 3AC5A 3V5WA 2B52A 2VWBA 5IUHA 3EQRA 3F3UA 4YPSA 2WTIA 3IONA 5J9LA 2UW6A 3UDBA 1SVGA 3MFUA 3CKXA 1H1QA 3RKBA 2WTVA 2HZ4A 4FSYA 2XNEA 3QTSA 3DFAA 3M1SA 3PG1A 5CSXA 3RGFA 4BDDA 2PTKA 4WHZA 4S34A 1H25A 3COKA 3FZOA 3NEWA 3R83A 4CFMA 5BNJA 1UU8A 5KNJA 4ZTHA 2SRCA 3ENMA 3KRJA 4GFGA 3TM0A 4DEIA 3MH3A 4F6UA 4V05A 4HJOA 2A4LA 3A61A 3RP9A 3ZYAA 3G2FA 2ITVA 3I79A 4EH2A 5L6OA 1CMKE 1J7IA 4BDKA 1H07A 3UVRA 4C0TA 3VF8A 3ZLSA 2UZTA 4D28A 3C13A 3OEZA 5IUIA 1RQQA 4YJRA 2QOFA 2I6LA 4UXLA 3IDCA 2XK6A 3NW7A 3COIA 3KL8A 4G16A 4IAFA 4M84A 1PMEA 4IVAA 4IWPA 5DT0A 3FZTA 3QRTA 4FK3A 2XNNA 2JFMA 4OAVB 5KBRA 5EQEA 3CGOA 5CVGA 4GRBA 4EHZA 2C3LA 2W05A 4W9WA 4CFUA 4D1SA 3H9FA 5IUGA 2QR7A 2F49A 4QQTA 3ZZEA 4NJDA 3EQIA 4DEDA 5J5TA 4AU8A 4OTFA 3BYOA 1YWNA 2JIIA 3QD0A 1H26A 4CRSA 3BHUA 4FTMA 4FV1A 1DAYA 3HV7A 4V01A 2WMSA 2OZAA 3KXMA 3DB6A 5AJQA 4O2PA 4HOKA 3BIZA 3HUBA 1FVVA 5FQDC 5G1XA 5BUJA 5DYJA 4Q2AA 3ALNA 3PP0A 3HV5A 2G9XA 4DT8A 4IFGA 3Q2JA 3P23A 4MXCA 1H0VA 4BBFA 4OGRA 3F7ZA 3QTZA 3NYOA 4FTCA 4U43A 5CAVA 3U87A 1YI6A 2CNVA 3UODA 4C58A 3DAEA 3EZRA 5BVOA 3O8PA 4UALA 3FMMA 3EKKA 4NZWB 3RVGA 4NJ3A 2R3IA 4O1OA 1TQPA 4QD6A 2W9FB 5A4TA 4YC8A 3C0HA 4JL9A 2QCSA 1OKVA 3UE4A 5HTCA 4NW6A 5A6NA 3I7BA 1PXIA 4O2ZA 4IJPA 5FUTA 3MV5A 5F94A 1WMKA 3GU6A 5HBJA 3FYJX 1I44A 4QP3A 4EOOA 2WTKC 3FMHA 4FTOA 4FKOA 3C1XA 3DKOA 4YSMA 4IDVA 4NUSA 4C7TA 4CZYB 5AUXA 2F4JA 3MTFA 3OMVA 2VWYA 3D15A 4JS8A 5BYZA 3R04A 2RFNA 5E90A 3Q4UA 5J8IA 3MVMA 4QQCA 2VWZA 3MVHA 4XG6A 2ZB0A 4DH8A 3HAVA 3ORLA 5EFQA 4FODA 4J97A 2ZM4A 1PKGA 2WFYA 5GJGA 3EFWA 4O84A 4G1WA 5HEZA 5CQUA 4CTBA 3FQSA 3FSFA 4K11A 4K8AA 4B6LA 2IVTA 4BCJA 4U9AA 4QP1A 3WBLA 3MY0A 1Q8WA 1S9IA 4UWYA 3LXNA 4BN1A 5EW8A 2QOIA 3BELA 4HYHA 4UZHA 3VNTA 5D11A 4BCKA 4G3FA 4XNEA 4NKSA 1H1SA 4OR5A 5HO8A 4FKIA 4F64A 5HQ0A 5HG9A 3HDNA 1DAWA 2I0YA 5HU9A 5E4HA 4BI1A 3P1AA 5AM7A 4I5PA 3RAIA 3FZPA 2W5HA 1XH5A 2PHKA 3LCSA 3PP1A 2OZAB 3UOHA 4CKIA 2LAVA 3IW8A 2V62A 4IX5A 2X8DA 2QOCA 3PWYA 5M07A 2F9GA 3AC2A 4EH8A 4X7QA 5HZNA 2CNQA 2UW8A 3TZ7A 1ZMUA 3GFEA 4DG3E 3OTUA 3SA0A 4ITIA 3D7TB 3V3VA 4AP7A 3MESA 2GQRA 1ZOGA 5FTQA 4AAAA 4ZMEA 1E9HA 4QT1A 4U5JA 4TKSA 1U54A 4LI5A 2JGZA 4XG3A 4MWHA 4P7EA 2R3OA 3DTWA 3F5UA 4HYIA 4W8EA 2R3JA 2BTSA 5GZ8A 5EHOA 3QD2B 4FIFA 4QTDA 4WUAA 4C2VA 3R0TA 2QOKA 3Q5IA 5LWMA 4W4YA 4B4LA 1ZY4A 4YC6A 4KINA 4KNBA 3A7FA 1OPLA 4RVMA 5M53A 3QQGA 5K3YA 4FEQA 3E5AA 4YZMA 3VC4A 2Z02A 3QLGA 4L46A 5FBNC 1WBSA 2XRUA 5AEPA 4FT7A 3TIZA 4IAYA 3FLYA 2W17A 4S2ZA 4YLKA 5DEWA 2WQEA 2UVYA 3T3UA 3HYHA 4LUEA 1H28A 3RI1A 5AX3A 3HECA 4IB1A 3GC0A 3ZUVA 2YAKA 2O64A 2NRYA 4XJ0A 5BMSA 5JQ5A 4MNEB 3U9CA 5HLWA 4YSJA 4MXYA 5LWNA 4FIGA 2HWOA 1ZLTA 1ZZ2A 4M67A 1BL7A 4EH7A 4QYFA 4NU1A 5IG1A 3UJGA 4DBXA 3KQ7A 3QC9A 5H2UA 4ANOA 3TDWA 4YZBA 3DS6A 5CASA 1W7HA 3EIDA 1XH6A 3V5JA 4DAWA 2ONLA 1JQHA 1U5QA 2YJRA 2BFXA 5T3QA 4I24A 3W10A 5IISA 4FKGA 4JI9A 1W83A 4JBVA 1GNGA 5EOLA 3VAPA 4ANMA 2X9EA 1WBPA 1IASA 4CZUA 5CSPA 2VTJA 2CGUA 4PDPA 4D4VA 4FV8A 4J53A 3ZM9A 3ZSIA 2HELA 2WPAA 4IWQA 4C61A 3FE3A 3OCSA 3U8WA 4F9WA 2XBAA 3JXWA 4R1VA 4YJUA 1F5QA 3FKOA 3V8WA 3HGKA 4A4OA 4AZSA 4O7RA 3TJDA 3UYSA 2QODA 3UC4A 4PMSA 4NCTA 2VTHA 2QONA 2ZV8A 3QX4A 4JRVA 4R77A 5LCJA 4L7FA 4CMTA 4CMUA 3O8TA 3HMPA 3ZO2A 4G3DA 2OKRA 5JFXA 1REKA 4HNIA 4M14A 3FMEA 2WTJA 3TTIA 3HZTA 3EFJA 1KSWA 4CMOA 2PPQA 4BWPA 1YQJA 2XJ0A 5H8BA 2YM8A 4AA4A 1Z5MA 1TVOA 3D7ZA 5HE2A 1U54B 4AOIA 2I0HA 1SVEA 5HG8A 3CSVA 4XG4A 5CANA 1FGKA 3NVMB 4YJPA 4UN0C 4EJNA 3MPTA 5IEYA 4G6LA 3PUPA 5EDQA 4MNFA 5E92A 4UX9A 5JRQA 3DBDA 3HMNA 2XKFA 3SRVA 3RZBA 2PVMA 1YXSA 4DT9A 4II5A 3SLSA 1G8SA 4I6QA 3VS2A 2J6MA 4JG7A 4WSQA 3PDTA 3GVUA 2GNJA 5E8UA 3KGAA 4ZSEA 2QG5A 4DBNA 4L42A 4KSQA 3NX8A 2J0MB 2YDJA 4EWHA 4CTCA 3MH2A 1FGIA 1PXNA 2OJIA 4OT5A 3FMNA 4EKLA 4IH8A 3GI3A 1H8FA 1YHSA 2PMNX 4FV5A 4IB5A 3QRKA 5CLPA 4AWIA 5H8GA 1QL6A 2VX1A 4Q9ZA 4JQ8A 5B2MA 2XS0A 4ASXA 4BIBA 2O3PA 4QP8A 1FVTA 2FVDA 2OIQA 3FC2A 3FLZA 1H24A 4RFZA 5CU6A 4O22A 1XBCA 3CIKA 4X2KA 4FTKA 1NY3A 1BI7A 3D5UA 2ITXA 3NW5A 3BBWA 3V8TA 4FOCA 2C47A 3ORXA 4MQ2A 1JSVA 2OK1A 3CLYA 3PE2A 4KA3A 1JKTA 4AQCA 3NZ0A 2FSTX 4PRJA 4RJ8A 4U97A 3S4QA 5F9EA 4JQEA 4FV9A 3DLSA 3QQKA 2JBOA 1PMNA 4PL4A 4QMYA 5E1SA 2QKWB 5EM7A 3S0OA 1KV2A 3Q60A 3O7LB 3EQPA 1JKLA 5C8KA 4V04A 4C8BA 4USEA 4DFZE 4RPVA 4BFMA 4NIFA 2Z60A 4QMVA 1H1PA 2WZJA 3IO7A 3NVKI 4U7ZA 4L52A 1OUKA 2Z8CA 4C4GA 4IACA 2Z2WA 1Y57A 4EOKA 4OBPA 4BDFA 2JBPA 4BR3A 3PY3A 3L9PA 3QD3A 4FNWA 4EWQA 4HW7A 5CNOA 3O50A 2EXMA 5K5XA 2YERA 3SOAA 3PLSA 4I5MA 4G34A 3QQFA 3QX2A 5CALA 4TYEA 4YBJA 4MYGA 5AUUA 5AR8A 3LFDA 1UNLA 4ZOGA 5E8YA 3JPVA 4XX9A 4BGQA 2C6LA 5IDNA 2FSMX 1NT2A 4W8DA 5E8VA 3W2SA 3KF4A 4AA5A 3DKFA 1NVSA 4JT3A 4LOOA 4KRCA 5I4NA 3UIXA 1GIIA 3KXHA 3OOMA 2FSOX 4MH7A 4OTHA 1LEZA 2OXYA 3S1HA 4O6LA 5AUWA 1NW1A 3P7AA 5J95A 4UYAA 4RIYA 4DF3A 3P78A 3CKWA 4AZFA 2Q0BA 4I5HA 2YN8A 3KCKA 2VTAA 2W1ZA 3ZU7A 1GZNA 4BCFA 3DOGA 3RZFA 1ZYLA 4O7VA 3S00A 2PULA 4IBMA 4M97A 5HOAA 4E4MA 4D5HA 4IE9A 2ITUA 3R63A 3TI1A 3ZH8A 3N51A 5IMXA 3BYUA 3A62A 2CHLA 4FC0A 1M14A 2EB3A 5LVOA 5HE1A 1YI4A 4PDSA 5EYKA 2YIYA 2R64A 4KKHA 3TNPC 3CD8A 1L3RE 1PW2A 4CEGA 3RWPA 2XCKA 2HW7A 3Q9ZA 2J90A 2Y6MA 2QOLA 3ELJA 4TL0A 5KMLA 4DC2A 1YXTA 4U3YA 3KC3A 5I5ZA 5JK3A 1Y91A 3VF9A 3CJFA 5KUPA 1VEBA 4PQNA 3ZXZA 2BAQA 4RRVA 4C57A 5DNRA 1TQMA 5I3OA 2XK9A 3R73A 5K5NA 1UNGA 5FEDA 3QF9A 3FI2A 5HTBA 3O96A 1PMUA 5FD2A 5H3QA 4IC7A 4EQUA 3U54A 3IQ7A 5EM5A 3B2WA 4WT6A 1X8BA 5JN2A 3MYGA 4BDAA 1W8CA 2YITA 4TTHB 5AR4A 5A46A 1J7UA 4UWBA 2WMRA 1WFCA 1NVRA 2GNFA 3EHAA 4BTKA 2UZBA 4D9UA 4F08A 3GCUA 1V0PA 4CGAA 4I22A 4NIFB 4JBOA 1VYZA 4FSUA 4JDHA 4B8MA 5CQWA 5BUEA 5FTOA 4DYMA 2JLDA 4I93A 2CGXA 1TKIA 3C7QA 3RNYA 3AXWA 4KBKA 5LOHA 5CU0A 4XH6A 3CD3A 1GY3A 4PNKA 3PXQA 2XK4A 3B8QA 3F6XA 3HV3A 4RIXB 4RVLA 4RZVA 3NNVA 2ITYA 2PUUA 1SNUA 1ZOEA 4DE4A 4MBJA 4ZAUA 4UZDA 2O2UA 2G01A 3LOKA 4D4SA 4RJ5A 1UWJA 2XNMA 3UO4A 4JX3A 1OMWA 1Q61A 3II5A 5AAEA 1U4DA 3FBVA 4LFIA 3BYSA 4QTCA 5AM6A 5AR3A 5L8LA 3F3ZA 2B0QA 2C30A 4ASDA 3EYGA 2DUVA 4XRLA 3S95A 2CKPA 2BRNA 3OWKA 5FWKK 4BCNA 4IWDA 3IGGA 2I40A 5FM2A 5GIPE 5C4LA 4F9BA 4H3PA 4FV7A 4BCPA 1YKRA 2GU8A 3LFSA 5HLPA 4QMWA 5TT7A 2H8HA 1Z9XA 3PIXA 1KOAA 3TEIA 5IH5A 2BIYA 1YI3A 2E9VA 2WQBA 5AIRA 5EYCA 1CDKA 5KMMA 3QCSA 2YIRA 1UU3A 2RL5A 4FGBA 1Q4LA 4QPMA 4AE6A 4DFLA 3COHA 2WOTA 5F1ZA 2QOQA 3LW0A 2OJJA 5ANJA 5C01A 5C1QB 4JDIA 3LVPA 3SDJA 2BRHA 2OJFE 3EYHA 4AN2A 2I7QA 3NNUA 5HCYA 3F61A 3PY1A 4YHJA 5IH4A 3E88A 4OBOA 1JNKA 2PUNA 5J1VA 4QOXA 1H01A 3PY0A 3D94A 2VTSA 3LFCA 3KREA 2BUJA 2J2IB 2YACA 5DHJA 2B9HA 2HXQA 1O9UA 2IW9A 3VWAA 3KRRA 4X2GA 2B1PA 1R0PA 2DQ7X 4JXFA 3R28A 4F0FA 5M4IA 3LJ2A 5A4CA 3EQCA 3ZDUA 5EDPA 4MAOA 4RX5A 2WMVA 3F3TA 3UMXA 1OECA 3ENHA 3VRZA 3FXXA 4UMUA 4AFEA 2B9FA 2I0EA 3UIUA 3DB8A 3TTJA 2WTKB 3W1FA 3NNXA 4C4JA 3RK7A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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