5E90A

Tgf-beta receptor type 1 kinase domain (t204d,i211v,y249f, s280t,y282f,s287n,a350c,l352f) in complex with 3-amino-6- [4-(2-hydroxyethyl)phenyl]-n-[4-(morpholin-4-yl)pyridin-3-yl]pyrazine-2-carboxamide
Total Genus 103
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
103
sequence length
303
structure length
303
Chain Sequence
GHMTIARDIVLQESVGKGRFGEVWRGKWRGEEVAVKIFSSREERSWFREAEIFQTVMLRHENILGFIAADNKDNGTWTQLWLVTDFHEHGNLFDYLNRYTVTVEGMIKLALSTASGLAHLHMEIVGTQGKPAIAHRDLKSKNILVKKNGTCCICDFGLAVRHDSATDTIDIAPNHRVGTKRYMAPEVLDDSINMKHFESFKRADIYAMGLVFWEIARRCSIGGIHEDYQLPYYDLVPSDPSVEEMRKVVCEQKLRPNIPNRWQSCEALRVMAKIMRECWYANGAARLTALRIKKTLSQLSQQE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of apo and inhibitor-bound TGF beta R2 kinase domain: insights into TGF beta R isoform selectivity.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords TGF-beta receptor type-1
total genus 103
structure length 303
sequence length 303
ec nomenclature ec 2.7.11.30: Receptor protein serine/threonine kinase.
pdb deposition date 2015-10-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5e90A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5e90A01
3ET7A 4RX5A 4XRLA 3HUCA 4AN3A 3EQBA 4BCOA 2YZAA 3QRUA 2WTCA 4BZDA 1WVYA 4GIIA 4X0MA 3ZYAA 4JQEA 4NL0A 4BWKA 3FXZA 4FEUA 2VTNA 2YM6A 3KA0A 5HHWA 4A9SA 1B39A 2BFXA 2WTKC 1IAHA 4BIEA 2O5KA 4FTNA 4X2GA 3WE8A 3DLZA 5H8GA 4LGGA 2JDVA 3PP1A 2W1EA 3K5VA 5CI7A 3UDBA 4PNKA 3ZO4A 2X8IA 3NYOA 2W17A 4ALWA 3AD5A 3ATSA 4L53A 2O8YA 3OXTA 3ZM4A 2BR1A 5DFPA 3EB0A 2PVYA 1KOBA 4W9XA 4Q5EA 3B8QA 2W9FB 5CU3A 3VIDA 2QONA 3LXNA 4BBMA 3GI3A 4LGDA 4NIFA 1NT2A 3K3JA 5KMMA 3CJFA 4EKKA 3JR1A 4YC8A 3C4FA 3ZUTA 3QRTA 4ITJA 2I1MA 4JBPA 5FD2A 5LARA 4DTKA 4EL9A 3QQJA 4IAKA 2C6MA 4H39A 4P4CA 4DBNA 5BVNA 3OFMA 3VJOA 3ACKA 4AA4A 2Y4PA 4QYEA 1KE9A 2VTQA 3COIA 3UO4A 3OT8A 1BUHA 5I9VA 1Z9XA 3L9LA 4MXZA 4PPCA 2GNJA 3DBFA 3H30A 4I94A 3I60A 4NSTA 4WNOA 4O2ZA 5C8MA 2PE0A 3OCTA 3VS2A 3BKBA 3FMLA 4RVLA 5TT7A 4YSMA 3C1XA 3Q9WA 4Z55A 4WNMA 2W1GA 3NYVA 4J71A 5IDPA 1W84A 1IG1A 5LMBA 5C8NA 3QX4A 4J53A 4CKRA 3F88A 4GIHA 2WMRA 2XNEA 4IWDA 3O2MA 3U4WA 5J5SA 3UO5A 2R3GA 5ANEA 2CN5A 3MV5A 3WZDA 3HUBA 4XCUA 2EUFB 4C61A 3LFAA 4GH2A 3KVWA 5HNBA 4ANMA 4GVJA 4MNEB 2JGZA 1P4OA 4Y83A 3C50A 4RVMA 4Z16A 1OKYA 4IJPA 3G33A 2WQNA 1O6LA 1BI7A 4CZYB 5CSVA 1OIUA 1ZWSA 3P23A 3ZC5A 3PDTA 5IEYA 4OAUC 4CRLA 1MUOA 3L8PA 3R9NA 2IVUA 2OFVA 2YN8A 4IZ7A 4BKZA 4D2SA 1FINA 4GYIA 5CX9A 1DAWA 3VAPA 4A4OA 4O7ZA 5GIOE 5D7VA 1XKKA 4EC8A 5K5NA 2B9HA 2BDJA 3FZTA 2XNOA 1F0QA 3ORZA 1PXIA 3R8PA 2BKZA 4M84A 4UZDA 4MXXA 5JKGA 4O86A 4CFNA 3FPQA 4I20A 5D9HA 3TIYA 4O7RA 2R64A 3JXWA 4BCMA 2Y9QA 3GU4A 4NM7A 4QQJA 3Q2JA 2XKCA 4PTEA 5G6VA 4G3FA 3MFRA 2XRWA 1H01A 3NAYA 3LCDA 1V0BA 3E5AA 4UALA 5EM8A 5LCKA 4C58A 2BCJA 4FSZA 3F7ZA 3EYGA 1UKHA 5CXHA 3R7YA 1CDKA 3HA6A 3KKVA 3QQGA 2VGPA 3CR0A 4AZTA 5JFWA 4BKJA 5HO8A 2GDOA 1PMNA 3DK6A 2YACA 2ZOQA 4IW0A 4R7HA 3BLRA 3ZUVA 3EQCA 1H28A 3CGOA 3IDPA 3FMJA 5KMNA 3BHYA 5JFVA 2BTRA 3OXZA 3T3UA 4M14A 3BU3A 5FRIA 4EONA 5HNIX 4WRSA 4MF0A 3I6UA 4FSNA 2ZB0A 2C6KA 2VU3A 3BE2A 4H3BA 1H08A 1XHAA 3FI3A 3EN4A 4E3CA 3OT3A 3QQKA 4LQMA 4BDGA 5AA9A 5E4HA 1PHKA 2A4LA 5FLFA 3ZHPC 1ZYJA 3KRJA 4RIWB 5FXSA 5IMEA 3RCJA 2A1AB 5AP4A 3TKUA 3OG7A 4LUDA 1O6KA 4G3GA 4U9AA 3DZQA 1JKKA 1HCLA 2ZDUA 4UY9A 3FZPA 3NYXA 4QP8A 3PJ1A 3R63A 4C02A 3U54A 4HYIA 5AV3A 5HE3A 2E9UA 5M53A 3SRVA 2ITVA 4WUNA 5H8EA 3HMPA 4W4XA 3ZXTA 5L2IA 3DNDA 3TN8A 3V5PA 4UMUA 4KIOA 1H8FA 1YOMA 4AN9A 3HECA 5CAPA 4HYSA 3OY3A 4CFXA 3MH1A 1JQHA 3VQUA 4CLIA 4HVIA 2J9MA 2BAKA 2WTWA 3MIYA 3E93A 2BAQA 2ITUA 3QUDA 3U8WA 2FO0A 3PE1A 4M69B 1GOLA 4BCHA 3TNQB 2YIYA 4UXLA 4TPTA 3Q60A 2VTLA 3NX8A 3OTUA 4FIIA 3QD3A 1V1KA 4R1VA 2ZV7A 1AQ1A 3MY5A 4IXPA 2CKOA 4HGLA 2YLEA 4FKVA 3DJ7A 3KRWA 2W96B 3HMMA 3TJDA 5CU2A 2JIIA 1Z57A 2R5TA 4QYGA 3AC8A 3U51A 3ORLA 4BI2A 2HY0A 5AV4A 4Z9LA 5GZ9A 5BVEA 4M8TA 3DA6A 4JAJA 5IQEA 2YM5A 4KBCA 4YTFA 4XP2A 3RHKA 4YNEA 3HMIA 2GQGA 5EI8A 3S2PA 3WI6A 2GHLA 3DOGA 3H10A 2YAAA 2XS0A 3ZEWA 2HENA 3V3VA 3B8RA 1OKZA 2X4FA 2P3GX 2VWIA 3FQHA 2BRGA 4OT5A 2E2BA 3G0EA 3F3VA 3WF7A 4NM5A 4QP3A 2R3RA 4I0TA 3TIZA 4JDKA 3HGKA 3KK9A 5KZ0A 3N4UA 4QP7A 1VYWA 1J1CA 4C35A 2RG6A 5GJDA 4LRKA 5DA3A 4C8BA 1ZYCA 3HX4A 3QRIA 2VX0A 2BUJA 2XCHA 4RJ5A 3O96A 1QMZA 3R6XA 5F94A 1ND4A 3RPOA 3LJ0A 3R01A 4PQNA 3SC1A 3UG1A 4IAYA 1ZXEA 4I23A 5EDPA 3MYGA 2JBPA 1OUKA 3LFEA 4O83A 4KSPA 4GUBA 4WSQA 2J5EA 4O6LA 1IA8A 1BYGA 2JAMA 4FTCA 2YCQA 3TV6A 5E91A 4EZ5A 4FODA 4ORKA 2WU7A 4YPSA 2BZIB 3BQCA 1TKIA 3NIEA 4H1MA 2V7AA 3DQXA 3M11A 4MXAA 3OUNB 3OWPA 5E8VA 3I0QA 1YOJA 3GP0A 1S9IA 4FV3A 2IZUA 2OJJA 4ZZOA 1SNXA 4IB0A 3FMHA 4PWNA 3WZJA 1ZYSA 2B54A 1J7LA 2F2UA 4MAOA 4AGUA 3C5IA 4R7IA 4USDA 3CCNA 1VJYA 3HRBA 4FGBA 3FHRA 1W7HA 4IM3A 4F9BA 3DKGA 4MBJA 1TVOA 2QOIA 4O0TA 3FJQE 4TTHB 2OLCA 1OPKA 2WQMA 3D14A 3BHHA 4G6OA 4OW8A 4N57A 2ITXA 3MY0A 1AGWA 4WNKA 1V0PA 3CTQA 5FM3A 4IWQA 3LJ2A 4H3QA 3ZCLA 5HTBA 2J5FA 3T9TA 2B52A 5E1SA 4DINA 5JK3A 4ASZA 4WRGA 1PXOA 3OWKA 4E6QA 4GCJA 1VYZA 4D4SA 2PVKA 3I5NA 2R3KA 2P2IA 4O21A 3VUKA 4RC3A 4MD8E 3LAUA 3NDMA 4ZP5A 4OLIA 4B7TA 1YOLA 3GFEA 4G34A 5A4EA 4KWPA 3FPMA 1RDQE 4AT3A 1H1RA 2JKKA 1M2RA 5K5XA 5CF4A 4JVGA 3VBTA 2XK4A 4O96A 2QO9A 2CLQA 2I0VA 4ENXA 4X3FC 2NNWB 3MIAA 1J7UA 3LXPA 4E8AA 1Q3DA 3DBEA 4NU1A 4LOQA 2CNVA 4PY1A 4DITA 1DAYA 4ERWA 4BCGA 4MD9E 1UA2A 4RJ6A 4ACDA 1QPJA 4NH1A 4M0ZA 4R3PA 1NXKA 4JG7A 5HTIA 4FEXA 3WIKA 1YRPA 2FUMA 5HCXA 5B2LA 3C7QA 3P7AA 4MYGA 3DGKA 4RA4A 4TWNA 4WUAA 2OJIA 2F49A 3IKAA 5TKDA 3THBA 4B8MA 4BFMA 3UQCA 3CSVA 4FKSA 5DE2A 2BDWA 1M17A 3LE6A 4O0XA 4R6VA 4BHZA 4NFNA 1G8AA 3ZLXA 3GEQA 3EYHA 1FGIA 3PIZA 1FPUA 4XG2A 3KFAA 4YJQA 1UV5A 4PPAA 3G15A 5M4CA 3HNGA 4ACHA 4R8QA 4W4WA 5EHYA 3TZ9A 3LW0A 2SRCA 2G2HA 4AZEA 2O0UA 2UZOA 3AXWA 2IW8A 4IBMA 3LFFA 4BDHA 3MB6A 5ACKA 5CVGA 3RAWA 2QOFA 3BYUA 3A7HA 1KE8A 2V55A 5HIBA 3DK7A 4ARKA 3EZRA 5L3AA 1STCE 2I40A 2PPQA 3L9PA 4CYIA 3O7LD 2ITPA 1NVQA 1DI8A 3VF8A 3POZA 1WBNA 4HYUA 3V5QA 2R7BA 3QZHA 5EH0A 3UIUA 3UP7A 4EK5A 3D94A 2X6DA 5IQAA 1YI4A 4CG9A 4I5CA 2GNFA 3M2WA 4D28A 2XK3A 5D12A 4BB4A 3JS2A 2C30A 4QPMA 2B4SB 1XH9A 2ITZA 2GCDA 1E1VA 5HU9A 1H4LA 5ANIA 1H1QA 1GZKA 4C3FA 1FOTA 3PY3A 5LQFA 3G9LX 4QP4A 3SKCA 5CWZA 5EQPA 2PL0A 1B38A 3R7UA 3Q9YA 4IZYA 3GCVA 4EK3A 2OKRA 2PZPA 2YM3A 3Q9XA 4MQ1A 5E8WA 4AUAA 3W16A 2HY81 2UW9A 3ETAA 3NIZA 4I6BA 4LYNA 3RAHA 4YURA 5CALA 3HV5A 4QP2A 5M51A 4FF8A 2PUUA 3A99A 4QOXA 1ZYDA 1U59A 4DF3A 1OL5A 4UYNA 2Q0BA 2UW6A 3UIXA 4FSYA 2VX1A 4BI1A 4BVUA 4EH2A 3PLAE 2UZUE 2GS7A 4YO4A 3BLQA 2F4JA 1PYEA 3MVMA 3SRVB 5A4CA 1XH7A 2ITYA 3OWLA 3G2FA 3R7OA 2BROA 4FTAA 3TV4A 2XEZA 4RGJA 2OI4X 1JKSA 2Z60A 5HCYA 4YZMA 4K11A 1YDSE 3NVKI 2WZJA 5IQDA 5CQWA 3SOAA 3UP2A 2WB8A 4E73A 4V0GB 4ZSEA 3BWFA 4CXAA 3SLSA 3RINA 4FKPA 4QMVA 2XUUA 2UVYA 1UNHA 2GNLA 2XKFA 4LGHA 2LAVA 4QMYA 2NO3A 3BV2A 5FEQA 2WQOA 5HEZA 5JH6A 4DGLC 3CPBA 5AV2A 2WIPA 4KRDA 4N6YA 2C6DA 3CPCA 2W99B 4TNBA 1W8CA 4RIXB 4UZHA 4FYNA 1Q61A 5EFQA 4EHZA 2BPMA 3QLGA 4S2ZA 1H1PA 5KCVA 2C69A 4HNFA 2C5XA 4TYHB 3BZ3A 4CZTA 1W83A 4YZCA 1KE6A 4AG8A 4E4XA 3TM0A 1FVTA 2BMCA 3D7TB 3LFSA 3I1AA 3C4WA 4KS7A 3R28A 5HGIA 2YA9A 3TI1A 3FMDA 3VO3A 1BI8A 4EBWA 3P7BA 5GJFA 4D9UA 2Z8CA 4QMQA 3Q9ZA 4XG3A 3GBZA 3KMUA 3UZPA 2XBJA 3RHXA 3CKWA 4EK6A 4F9WA 2HZNA 1YWNA 3C0IA 5JFXA 3KVXA 3TCPA 4DFYA 4D4YA 5AR7A 2RFSA 4NK9A 4JDJA 5JRSA 5AR3A 4DBXA 5ACBC 5CEIA 5D7AA 3D4QA 2W5HA 3KMMA 1Q5KA 1LPUA 4GK3A 1JKLA 1YXVA 3KF4A 3AC1A 2DWBA 3WYYA 4BYJA 3ZLSA 5LOHA 2G01A 4ID7A 1M2PA 2RIOA 2EXEA 3CC6A 5K4JA 4Y72A 1J91A 5DBXA 4GU6A 2GS2A 3VUGA 1U54A 1PXKA 3GC7A 1PKGA 2A27A 1NW1A 2R2PA 4YBJA 4E4MA 4XV2A 1Y6AA 5AP0A 4G1WA 4JR7A 4HZSA 2B9JA 3Q4ZA 5IH5A 5ANKA 1JSTA 4BGGA 2J4ZA 4Q9ZA 1RQQA 4GT3A 4YLLA 2X0GA 1XH4A 1RE8A 5GINE 4FTOA 2ZV9A 4MWHA 1OKWA 2F57A 3PXYA 3L9MA 3QQFA 4MCVA 2W1IA 2X8EA 4ZTLA 4ITHA 5LWNA 2JKOA 2C47A 3NCGA 5J1WA 3H4JA 3A62A 1U5RA 2VTRA 3SW7A 2XIRA 4FGRA 4PNIA 4BRXA 3UNJA 2OF2A 3CJGA 3GFWA 5DEWA 3MPMA 4RX8A 2X8DA 2JIUA 3NAXA 4NJDA 4O81A 4FV7A 4IAIA 4F9AA 4X2KA 3TTIA 3CLYA 4CRSA 2OWBA 3QQUA 1LEWA 2Q0NA 5IG1A 2QKRA 3RAIA 5AM7A 3K54A 5C8KA 4FTRA 4AW5A 4GUEA 2QOQA 3UVPA 4FC0A 3EZVA 2PE1A 3DBCA 4MNFA 4USEA 3IW6A 3R00A 3QGWA 3RK7A 4CTBA 3CY3A 5TF9A 5AUYA 3RPRA 1WBPA 3PXKA 3FMMA 2CNQA 5JEBA 2ERKA 2WELA 3A8WA 3ANQA 3SOCA 5DOSA 2BZKB 3O8UA 3Q6UA 4I5MA 4EH3A 3MTFA 5L2TA 3R9RA 5ANGA 5E8SA 5HO6A 5EQEA 3LQ3A 3JUHA 2QU5A 5CLPA 2ITWA 1WZYA 4TKSA 4PDOA 4R3CA 1H27A 2XNPA 3R02A 2XKDA 3AGMA 1DI9A 2QR7A 1CKPA 2YM7A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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