5EI2A

Rapid discovery of pyrido[3,4-d]pyrimidine inhibitors of monopolar spindle kinase 1 (mps1) using a structure-based hydridization approach
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
sequence length
279
structure length
256
Chain Sequence
QSMSVKGRIYSILKQIGSGGSSKVFQVLNEKKQIYAIKYVNLEEADNQTLDSYRNEIAYLNKLQQHSDKIIRLYDYEITDQYIYMVMECGNIDLNSWLKKKKSIDPWERKSYWKNMLEAVHTIHQHGIVHSDLKPANFLIVDGMLKLIDFGIANQMQGTVNYMPPEAIKDMKISPKSDVWSLGCILYYMTYGKTPFQQIINQISKLHAIIDPNHEIEFPDIPEKDLQDVLKCCLKRDPKQRISIPELLAHPYVQIQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Rapid Discovery of Pyrido[3,4-d]pyrimidine Inhibitors of Monopolar Spindle Kinase 1 (MPS1) Using a Structure-Based Hybridization Approach.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Dual specificity protein kinase TTK
total genus 74
structure length 256
sequence length 279
ec nomenclature ec 2.7.12.1: Dual-specificity kinase.
pdb deposition date 2015-10-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5ei2A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5ei2A01
3I79A 3VNTA 3PTGA 1JNKA 5I9WA 4M7IA 1UWJA 3NWWA 4AX8A 2VX0A 2XK6A 5HLWA 5DBXA 4KA3A 2C0IA 1TQIA 5CEPA 2ERZE 5LVLA 3KY2A 3TL8A 2GHLA 1W8CA 3W16A 4FUXA 3OF0A 4C59A 4QP3A 2E2BA 4RJ7A 3D5WA 4XOYA 3GFEA 5GIPE 4RG0A 4RMZA 3D83A 4E1ZA 2J4ZA 4FIEA 2HENA 3LXKA 4TT7A 5HVYA 4DGMA 1IAJA 1SVHA 1Y6AA 3I6WA 5H3QA 5AFVA 3JY9A 5EM7A 3EKKA 3KREA 1MUOA 2GSFA 3WYYA 3V5WA 2DYLA 2YA9A 1DI9A 4RZWA 1KE7A 1IR3A 3W2CA 2VWIA 4I21A 4PL3A 4U3ZA 4GCJA 4YJSA 3ZLYA 1ZY4A 2XA4A 3L9PA 4M84A 3LFAA 1Q99A 5CEKA 2R3RA 5AR4A 3ORXA 3NUUA 3ZO2A 4UZHA 4F0IA 4FKGA 5JZNA 3NGAA 3U87A 4BB4A 4D2VA 2QR7A 4ALWA 3A7HA 5AEPA 4MD7E 3VRZA 2A19B 1RE8A 3WF5A 1YI3A 4TPTA 4KS8A 3AQVA 2VWZA 3EQFA 3H10A 2GNHA 4MF1A 4MWIA 3ZBXA 4BCOA 4BF2A 3PDTA 2HIWA 3B2WA 5FEQA 2QOCA 4OUCA 2PVKA 5CU3A 2R3KA 4KBCA 2WEIA 4MH7A 4ZTMA 4TYHA 3OW4A 3R9OA 1WBTA 4Y5HA 3BBWA 2AC3A 3DPKA 4FVQA 5IEXA 3G6HA 3DV3A 1JSTA 4JDHA 3ZSIA 4FV2A 4GW8A 2G1TA 4NTSA 1H0VA 1KE5A 4YO4A 3WZKA 4BWPA 3GNIB 1KUTA 3E3BX 3C0GA 3DU8A 4E5AX 4KAOA 5L6WL 4LG4A 5A4TA 3R1YA 4ZTQA 4FICA 3F2RA 4YJPA 4PPCA 2O3PA 2IVUA 4FG7A 3VW6A 1Z5MA 1CKJA 2XP2A 1ZLTA 4TW9A 3TZ9A 4L7FA 3OZ6A 3C0IA 4QMYA 3QRTA 3NIEA 3MY5A 3MY1A 4BDDA 5FQDC 3FMNA 4EQUA 5AP0A 2C6DA 3EQGA 3MFUA 4LRKA 4MD9E 3GC0A 3C1XA 3Q9YA 4FT9A 5JFXA 2JDSA 1BYGA 4OT6A 4TRLA 1A06A 1CTPE 4FK6A 4DTKA 3C5UA 2PMIA 1YDSE 3VVHA 2CCHA 3GFWA 3LFCA 4I3ZA 2ZB1A 4TYJA 4IAZA 3UNZA 3UIXA 5KMNA 3NZ0A 2GQGA 2R2PA 5BVFA 5DRDA 3TUCA 1NY3A 4AT5A 5IUHA 4RLLA 3O71A 4K77A 3SRVB 4BIBA 5AR2A 5J9LA 2XYUA 3BGQA 1BMKA 4ZOGA 5IH5A 1OM1A 2WZJA 3WARA 2JKQA 4KIKA 2GU8A 5TT7A 5HO6A 5J9YA 4L3PA 3KVWA 4AGWA 1P4OA 2HXQA 3JR1A 4WG5A 3RTPA 4AT3A 4QMQA 2IPXA 1OBGA 3KA0A 3ORZA 3PPKA 4FT5A 3CBLA 4RIOA 4FV7A 1OI9A 2EU9A 3E8CA 3EJ1A 3R8VA 4LV5A 3KRWA 4L8MA 4UYNA 2UW7A 3DZOA 3Q6WA 2XNEA 3Q4CA 2J5FA 2RF9A 4RIWA 5B0XA 5DHJA 1XR1A 3MN3A 3Q60A 4C4JA 3KXNA 5K3YA 2PE2A 3U4UA 4O7ZA 5LOHA 3OWJA 5HQ0A 4YO6A 2XIRA 4HYUA 3R7OA 4JQ8A 2X8DA 4L68A 1Z9XA 4HPTE 5LMBA 4FVPA 1ZXEA 2QOLA 2YDKA 2PVNA 2YIWA 4E8AA 4QYEA 5B7VA 4AWIA 4WBBB 3FLYA 4U97A 3DGKA 1GOLA 1Q8TA 4AOTA 5D1JA 3UQGA 3POOA 5D10A 3T8OA 3E5AA 2A0CX 3FLNC 2QOIA 4DG2E 1YW2A 3FKOA 4EOKA 4ERKA 4C8BA 3OWKA 4JNWA 3R73A 3EFJA 5EI8A 4QMLA 3OEZA 1PXKA 2B9HA 1M7QA 2LAVA 1OKZA 4LI5A 3ZZEA 3JY0A 4IB5A 4LMNA 4ZZOA 5DT0A 4ZLOA 1WZYA 4CD0A 3IW5A 4JAIA 5FBOA 3NYVA 5ACBC 3V6RA 4A07A 4C7TA 4QMVA 3R7IA 4D1XA 2B54A 4J95A 4J98A 4F7SA 3QD3A 4OTRA 5GNKA 1UKIA 1VZOA 4IZ7A 2VWVA 3RAHA 2WIHA 5KX8A 2J2IB 5HESA 4FI1A 5IH4A 2JGZA 1H1SA 2YM7A 2GS7A 4HPUE 2G2IA 4RX7A 5L6OA 5IQFA 3AD4A 3UG1A 4O86A 2JKOA 4KIOA 5CSPA 1WBOA 5KKRB 1Y6BA 2UZTA 3H4JA 4FGBA 3VJOA 4KKEA 3DQXA 4OTQA 4TWOA 4R3CA 4EHVA 2W1IA 1WCCA 3HV6A 3OOMA 4FZ6A 2BUJA 3UODA 2XK4A 5CS6A 4DH7A 3PRFA 3W2SA 2ZAZA 1M14A 4ITIA 4D58A 1J7IA 3LLAA 3FAAA 4BDCA 2QQ7A 4EH3A 4BGGA 4GMYA 4PDYA 4FTTA 5H9BA 1U54B 4S30A 2Z60A 1MQBA 2E9NA 3R9NA 3RAWA 4DLIA 2RG5A 3GI3A 4AZSA 4YZNA 4BCKA 4D5HA 4D0XA 2F2CB 3V5JA 4EUTA 3IGOA 1WFCA 4OTFA 4KSQA 4GG7A 3PLAE 3CTQA 2X1NA 4PX6A 1XHAA 4FG9A 3N4VA 2IN6A 4F4PA 2BTRA 3G0EA 3QL8A 1H28A 1JAMA 3GCVA 2YJSA 3QTZA 1P5EA 2I1MA 4QYFA 4HVDA 4IM0A 4YPSA 4MQ1A 1URCA 2VTMA 4X2KA 4Y46A 2BTSA 2X0GA 3AT2A 3KF7A 1BL6A 3A60A 3UPZA 5ETIA 5IQIA 3R71A 4FIHA 1YXVA 2WTVA 3ZO1A 3FQEA 3ODYX 5CASA 4I6FA 2QD9A 3QTQA 3K5UA 1DM2A 3DAKA 4H3BA 4BDGA 2BHEA 4GT5A 2VTIA 2JFLA 3DB6A 4WSQA 2PY3A 5DMZA 2CPKE 4EOPA 3CCNA 3WBLA 4I4EA 4FTCA 4GFOA 4MXAA 4CEGA 4CG9A 3T9TA 5IQAA 4BDBA 4O0UA 2ERKA 4FEVA 2P2IA 3HV7A 2YM6A 5E8SA 4C3RA 5L6PA 3U9CA 4KD1A 1Y91A 3ZUUA 3UVQA 4ANNA 4EOLA 5IEYA 3L9LA 4O7SA 3IW7A 3I6UA 3ZOSA 1MRYA 3AC8A 3DFCB 3UVPA 5HVJA 2PK9A 3DLSA 4EOSA 4YPDA 4PPBA 2FSOX 4M14A 1V0BA 4FV8A 4U41A 4O0SA 3SAYA 3SXFA 5HX6A 5LJJA 4IAKA 5DVRA 4JBVA 2H6DA 3L9NA 4KIQA 1UVRA 1ZWSA 3IDBA 4BTMA 5J5TA 3BELA 3GC7A 3C51A 4O0TA 4RA4A 4QQ5A 4QT1A 4FF8A 4TNDA 3GXLA 2UW9A 4NEUA 2YLFA 3DTCA 3FZSA 5M55A 3SVVA 4JR3A 3CIKA 4PY1A 4CSVA 1VR2A 3P78A 3N4UA 2B1PA 3PJ1A 4FV3A 5AUVA 3E7VA 2XK7A 4QP6A 1ZY5A 4U0IA 4LV8A 3UTOA 4YC6A 3ZLXA 3EQRA 3V04A 4NM5A 5B2KA 3EIDA 4D9UA 2JIUA 4C57A 1IA9A 2ZM4A 5CSHA 3L8VA 1WBPA 4FKOA 5FDXA 2FSLX 2VWWA 1YDTE 3PFQA 3FXWA 4ANBA 3K54A 3DBEA 4QMUA 5CI7A 2XIKA 4BI0A 4BTKA 1FMOE 3KGAA 3P23A 5FWKK 5ANOA 2BZHB 5FXRA 4YGAA 2VV9A 5CT0A 5L8JA 2I7QA 4X3JA 3LM5A 4DC2A 3LIJA 3BLHA 4KBKA 4F0FA 4QYGA 5FUTA 2CKOA 1REKA 4EONA 5EOLA 4U43A 5JMSA 5IG1A 4IDVA 4DITA 3Q9WA 4F70A 3NVMB 4B7TA 4ZMFA 4RIXB 5ITAA 5M07A 4FKUA 4EQMA 2OFUA 2W96B 4EBWA 1PYXA 4OTGA 4WRGA 4LM5A 4V0GB 3H0YA 4OTPA 5CAQA 4IJ9A 4IADA 1WVWA 4IBMA 4NWMA 3MH0A 1YXSA 4QYYA 4FTMA 4GV1A 3QBNA 5JKGA 5HI2A 3VUGA 4CRLA 4UMPA 3U6IA 2VTPA 3KXZA 3EYGA 5IA1A 3ZLSA 4EZ3A 4RSSA 4U6RA 1H8FA 2ITOA 4I6QA 4XP0A 2OH4A 4ZS0A 5DH3A 4HZSA 4YBKA 3OHTA 1F3MC 4M67A 4QMZA 3V5QA 4M97A 4HJOA 4ZTRA 3R9DA 2XVDA 1OIYA 1ZRZA 2FA2A 3RALA 3D5VA 4DFXE 1TVOA 4BZDA 3HP2A 2PUPA 4NL0A 3EQHA 2X2KA 1G3NA 1QMZA 4APCA 4EH4A 2B9FA 3Q9ZA 4GU9A 3LZBA 2W0JA 3BHYA 3UMXA 2IW8A 5IMXA 4TZRA 2YWVA 2IVSA 2YIRA 1O6LA 2W9FB 4HGSA 4C3FA 4CQEA 2YN8A 2CHLA 4FOBA 4GT3A 5KMKA 5DI1A 3MYGA 4G17A 4DGOA 4Z3VA 3EFWA 2VTRA 4G6LA 5HKMA 4XH6A 4IACA 5CAVA 2CNUA 4H36A 3L8XA 3ZRMA 2V62A 2Z7LA 3BZ3A 2BKKA 4XMOA 4UMUA 1ZYCA 5M06A 2PVLA 5CF5A 4LRMA 1UA2A 3EQIA 3QXOA 4W4VA 5CF6A 2BZKB 3ZH8A 4DF3A 4FYOA 5BVEA 5IUIA 3SV0A 4C36A 2V0DA 5J1VA 2QI8A 3DK7A 3E8DA 4AU8A 5JT2A 4WOVA 2UW0A 2C69A 4F09A 4AGDA 4C2WA 2C3JA 5K0KA 4FEUA 4DT9A 3F66A 4MXCA 4O1PA 5ETAA 1OVEA 3MVLA 3ID6C 4RJ5A 4ID7A 3BU6A 4CNHA 4XS2A 2REIA 2VGOA 2WELA 3E63A 4C4EA 3F61A 5CTPA 5BMMA 3ATSA 2VTNA 5HU9A 2B9JA 4D1ZA 3KXHA 3VF9A 3U51A 4BKYA 3BWJA 3FZTA 5F95A 4S34A 5DE2A 3TNIA 4CFVA 4TTHB 4GUBA 2P0CA 4NK9A 2YFXA 3ELJA 3O8UA 5AR3A 4PP9A 5LARA 3BYVA 3RHXA 3OWLA 4F1MA 2JD5A 3MPAA 4GIIA 4QTCA 4JIKA 3ULZA 3F2AA 4CFMA 2WU6A 4ENYA 4YTFA 1ZMVA 2ITWA 2J50A 3BI6A 4J8NA 3BV2A 2XBJA 4BDEA 2FH9A 4GL9A 4M12A 3BQRA 2RSVA 4IM2A 5E92A 5AUTA 3PZEA 4OAVB 3PVGA 4N6YA 4FTAA 4M13A 4N0SA 4CKIA 2C6LA 2XMYA 4O38A 4EQCA 2HY81 1KOBA 3PYYA 2BZIB 3MVJA 4H1JA 2E9VA 4MXYA 1FVVA 2W05A 5CQWA 5KZIA 4FSQA 4I22A 3ZSHA 2O64A 1M52A 4IX3A 2WMRA 4XRLA 3WF6A 4P5QA 3ZYAA 4EK5A 3QTXA 3R8UA 4FZAB 5FXSA 2G15A 4IMYA 4NKSA 4U40A 3RCJA 4XJ0A 2UZVA 4GT4A 4BGQA 1H01A 2JKMA 3DB8A 3HV3A 3I5ZA 2H34A 3OMVA 4O91A 5LVPA 3NUYA 4EH9A 5KMMA 2C0OA 1QPJA 3K5VA 4TWCA 3O7LB 4P4CA 3NNVA 2QCSA 3OUKA 1ZYSA 3PY3A 4DFZE 2W1GA 2C4GA 1DAYA 4M68A 3LLTA 2SRCA 5AUXA 3ET7A 4M0ZA 4BYJA 3VQUA 2VO6A 2C1BA 2V22A 5E7RA 2VO7A 5DGZA 4FA2A 3EH9A 2CNVA 3DKFA 1WBVA 4CYIA 3UIBA 3DDPA 3OD6X 2JITA 1CKPA 4JQ7A 3QC4A 4RPVA 4FL1A 1OECA 3QXPA 2UZLA 1ZOGA 3EQCA 4JDKA 5HORA 4XV9A 5HLPA 4PNKA 3R83A 2BAKA 3K2LA 4KWPA 2UVXA 5HOAA 1M2QA 1WVYA 2AYPA 4F7JA 3IECA 4AE9A 5DWRA 2ZJWA 3BU5A 2ESMA 3NW5A 3R6XA 4G31A 4G34A 4YJOA 4DFLA 2UW6A 3R8LA 2EWAA 2W17A 3E88A 4KB8A 5JZJA 4IWPA 3HMMA 2Y4IB 4R1VA 5LWMA 3OT3A 2ZVAA 3NLBA 2XNGA 3QF9A 3WF7A 3LXLA 4Z7GA 3R7YA 2OK1A 2G01A 4IC7A 1AQ1A 2UZUE 5EKNA 4E93A 4ZSAA 4Z55A 4NW6A 2GNJA 2VTHA 2X7GA 3DQWA 4I93A 5M57A 3PA4A 1M17A 3GQIA 4GEOA 2NNWB 4IAFA 4AS0A 1NA7A 3QQJA 3DY7A 4U81A 2JIIA 4JBOA 5FXQA 2E9PA 4IHPA 2PZ5A 3R7GA 2NPQA 3FLSA 5AV2A 4UN0C 2JC6A 4XG8A 5AAFA 3L9MA 4TXCA 2IWIA 2ONLA 3FY0A 4I23A 1URWA 2NRYA 3QQHA 4AT4A 4FTNA 2F4JA 3QALE 1H08A 4JX3A 4YHJA 3F7ZA 4EH8A 2J6MA 3WF9A 4JDIA 4EJNA 3CJGA 3QTWA 5TE0A 3V8WA 3N4TA 1QPCA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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