5HG8A

Egfr (l858r, t790m, v948r) in complex with n-[3-({2-[(1-methyl-1h-pyrazol-4-yl)amino]-7h-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl}oxy)phenyl]prop-2-enamide
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
300
structure length
300
Chain Sequence
NQALLRILKETEFKKIKVLGSGAFGTVYKGLWIPEGEKVKIPVAIKELREATSPKANKEILDEAYVMASVDNPHVCRLLGICLTSTVQLIMQLMPFGCLLDYVREHKDNIGSQYLLNWCVQIAKGMNYLEDRRLVHRDLAARNVLVKTPQHVKITDFGRAKLLGAEEKEYHAEGGKVPIKWMALESILHRIYTHQSDVWSYGVTVWELMTFGSKPYDGIPASEISSILEKGERLPQPPICTIDVYMIMRKCWMIDADSRPKFRELIIEFSKMARDPQRYLVIQGDERMHLPSPTDSNFYR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Discovery of 1-{(3R,4R)-3-[({5-Chloro-2-[(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)amino]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl}oxy)methyl]-4-methoxypyrrolidin-1-yl}prop-2-en-1-one (PF-06459988), a Potent, WT Sparing, Irreversible Inhibitor of T790M-Containing EGFR Mutants.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords Epidermal growth factor receptor
total genus 92
structure length 300
sequence length 300
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2016-01-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5hg8A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5hg8A01
4FR4A 4TY1A 3NZ0A 4C38A 4KB8A 4C8BA 3KN6A 3HV7A 3PXFA 5FWKK 1FQ1B 4OTFA 4R3PA 4DFYA 4RFZA 4USEA 4PMMA 4NM3A 2BILB 1YOLA 2OZAA 4GK2A 4L01A 3SLSA 4CRLA 2O5KA 4D2RA 4JNWA 2ZJWA 3NNWA 4U42A 1V0OA 4IWOA 2PMLX 3QTQA 4QQCA 4D5HA 3ZRKA 3R6XA 4E4LA 1J7IA 3UIMA 3NYOA 2VTJA 5AA8A 4XS2A 2X8IA 4W4VA 1PKDA 1JKSA 1R78A 2UZWE 2VWUA 2VGOA 3PIZA 3A7FA 3H9OA 3MVJA 4FMQA 3KREA 1JPAA 5KMKA 5BNJA 4K11A 4NIFA 2RSVA 5AUTA 4DEAA 3UYSA 4LQMA 3W8QA 1H08A 4FKRA 3KXGA 4BCGA 2UZUE 2JBOA 5I9ZA 1GOLA 3KVXA 5D9HA 4X2FA 4AT3A 1ZMVA 5I9VA 4YPSA 4GFMA 4GYGA 4RIXA 4LOOA 4C62A 4E5BA 4RIWA 4J8NA 4EYJA 5E1SA 3HEGA 2VNYA 3DU8A 4D2SA 2WO6A 3EKKA 3RALA 4GKHA 4EOQA 3OXTA 5FEEA 3F5UA 3EQRA 2RFSA 3VNTA 4J99A 3SC1A 5LQFA 4L67A 3TEIA 1GAGA 2RFDA 3CTQA 4EK3A 1W8CA 2Z7QA 4WRGA 1ZOGA 1UV5A 4GG7A 1L3RE 3EYHA 2ITUA 1HOWA 3F3VA 4C33A 4X3FB 4Y83A 2ITYA 5G6VA 3UBDA 3OC1A 3AC5A 3CIKA 5LVMA 5HLWA 4ZTHA 2IPXA 1RJBA 1BUHA 3L8VA 5IUHA 3RPOA 3Q9YA 3EZRA 3HRBA 4MK0A 2CKOA 3Q52A 3L1SA 4LRJA 4UMUA 5A14A 3LKMA 1PXLA 2XNOA 2BRBA 4YTCA 4OTWA 3IONA 1WAKA 2FYSA 3O23A 2UZVA 4BDEA 3T8OA 1OL5A 4AZSA 5CEPA 3S95A 5DT3A 1KE6A 2HY81 5EYDA 5HKMA 4XG3A 3VUMA 4RX7A 5AUWA 3UMXA 4ZEGA 5IDNA 2W06A 1WVXA 2IO6A 4EOOA 2PHKA 5M4FA 2HZNA 2JGZA 1BMKA 3MDYA 3QTZA 3MPTA 4KS8A 2E9UA 3BGPA 4ENYA 4DN5A 3Q04A 4GJ3A 4WUNA 1VEBA 2UW4A 1QPDA 4EZ7A 4EI4A 2J4ZA 4GVJA 4IVCA 4BCHA 2A1AB 3U6HA 5CAQA 3HZTA 4PDPA 4QYHA 2XJ0A 4IVDA 4IQ6A 4XHKB 4G5JA 5J87A 4EH4A 3LM0A 1KV1A 4Y95A 5AUZA 1LP4A 4L7FA 2FGIA 4LMUA 3WZUA 2V5QA 3HRFA 5HD4A 3LFDA 1Q41A 3VVHA 2GNJA 3L9NA 1R1WA 1MRYA 3PE1A 4FGRA 4RJ3A 2XNNA 1ZAOA 4BKYA 3MB7A 2Z7SA 3QCYA 1H4LA 4CQGA 3BU6A 3THBA 3T9IA 4B6LA 4BZDA 5CVHA 2WTIA 3PY3A 3A60A 3Q9WA 2R5TA 2BRHA 2R3IA 2BDJA 3C0IA 5DOSA 3Q4CA 4KINA 5JEBA 5EKNA 3ODYX 4AGCA 4UMTA 3OCBA 4C4EA 3Q4TA 4PPCA 3MY0A 4QP7A 2ZVAA 5J8IA 4JR3A 4QO9A 2B9IA 4BDAA 4FYOA 3DBFA 4I6HA 3E3PA 3QC9A 2GNFA 4DA5A 1R39A 3L9PA 4QP8A 3V6RA 2BIYA 4IZ7A 4JJRA 5HTCA 3MFUA 4BTKA 2C30A 1SVHA 4GMYA 4AUAA 5CF6A 2GFCA 4UV0A 4C35A 4K8AA 5M51A 1A9UA 5AV1A 1ZYJA 4DG3E 4H36A 3UE4A 4J53A 4JRNA 2DS1A 2YWPA 4FIJA 3RVGA 3UVQA 5IH6A 3IW4A 2ZYBA 4J52A 3LAUA 3JY9A 3OROA 4ZMFA 1XH5A 3A62A 3G9NA 3ANRA 4QMSA 5DI1A 2JIIA 2CPKE 4ORKA 4MNFA 2GTNA 4EK4A 2W1DA 4Y5HA 4O27B 5E90A 2YZAA 4FF8A 4RIYB 3H9RA 1YDRE 4I4EA 4QMXA 3GXLA 4QOXA 3UODA 1IR3A 5AX9A 4WSYA 2A2AA 4O38A 3FQEA 5FDPA 5M56A 3KCFA 4FTJA 5DT4A 4ZK5A 3NIZA 1YKRA 4TL0A 4FKJA 4LRKA 5AP5A 2OKRA 3RCJA 5FTQA 4OAVB 3VBWA 5A4LA 3O96A 4H39A 5E8WA 1CMKE 5CT7A 2WGJA 3R0TA 3IKAA 4UZHA 4Q5EA 4CYIA 2GCDA 2QU5A 3ACKA 3E93A 3M42A 4G34A 1QPJA 3KC3A 3R2YA 2ZV8A 2XYNA 4RZVA 4DBNA 3P78A 5EHYA 3E92A 2C6IA 3POOA 2C1AA 5LWMA 5CXZA 2AC5A 2W05A 4XV2A 3UP2A 5DG5A 3UP7A 3JYAA 4RWIA 2WMUA 4NSTA 1DI8A 4FV9A 3FXXA 4QMOA 2RFEA 2XNGA 4PL4A 1DAWA 2EUFB 3C1XA 2Y8OA 1SYKA 4BWXA 3KMUA 3EQHA 2GHLA 4GFGA 4XG2A 2XYUA 3FPMA 4FV2A 3V5JA 2BKZA 3EQIA 4KIPA 5CASA 2CGXA 4O83A 4FSRA 3ODZX 3OEZA 4AOJA 3CD3A 3GBZA 4I94A 2OXXA 2WQOA 3ZH8A 1M2QA 3QUDA 4RIOA 3E7OA 3ZLYA 3HECA 3LCDA 2IN6A 4RLKA 4QNYA 4WG5A 1NT2A 3CGFA 3FQHA 4PL3A 5B0XA 2XKEA 3EB0A 5FRIA 2GFSA 3ORXA 5HU3A 4UYNA 5I9UA 5E92A 4GIIA 2CGVA 4M69A 4NUSA 3C5UA 4D2PA 3VQUA 1OKVA 4JDHA 4FT0A 2BZKB 3UG1A 4C4GA 3QL8A 4BB4A 3QWJA 3QQHA 3D7TB 3HMMA 4IM2A 4O7TA 3ORNA 4G5PA 2JBPA 1OIRA 4ASZA 1YHVA 4QP1A 3JVRA 4S30A 3RK9A 3OWKA 5LJJA 4N70A 2YLEA 5IQDA 5ANGA 5C8KA 2BTRA 5C4LA 3TV7A 3V51A 5JSMA 4NIFB 3S2PA 2VTRA 3TDWA 3GT8A 1SZMA 3ORKA 3SDJA 1CKJA 4HCUA 5EYCA 3TT0A 3DB6A 4EH8A 2NRUA 4J7BA 1JVPP 2J0JA 3ZONA 3AG9A 3ET7A 5J9LA 1DS5A 2BUJA 4RIXB 3G6GA 1PXPA 3DBCA 2X6DA 3PLSA 2ETRA 4RIWB 5CQWA 3R1QA 4XG4A 3OS3A 5L8KA 4O0TA 3DTCA 4CCUA 2PZYA 2OU7A 2RIOA 4U43A 4P5QA 4IWQA 4Y85A 1U54B 5CU0A 5FBNC 4OAUC 1O6KA 1M2PA 3D5XA 3F9NA 3NW6A 3D83A 2B0QA 2W1GA 4PDYA 3EIDA 3UNZA 5E8SA 1H1WA 2J6MA 1W84A 2VD5A 1IASA 5KMNA 3WE8A 4L52A 3U51A 2YCQA 3R01A 1TQMA 5F1ZA 3G5DA 5DEYA 2G01A 4YJUA 3PJ1A 3QU0A 3QRIA 4FT5A 3QCQA 2PPQA 4J98A 2C47A 4H3PA 4RA5A 4ZP5A 3WBLA 2G2IA 2Z7RA 3OOMA 4FI1A 4ZJVA 2VX3A 5E7RA 4RC2A 4OW8A 5M08A 4U9AA 1J7UA 4JDIA 1KE5A 4EKLA 4HYIA 4I92A 4BF2A 3FI3A 2B7AA 3QC4A 3GCSA 4J71A 5CAVA 3WIKA 2PVKA 2UV2A 3HP2A 1XBCA 1PRYA 3OCSA 3ZBXA 3KA0A 4FL3A 4O84A 2WTVA 1Q61A 3EQGA 3OTVA 2JFMA 4WIHA 1JBPE 3OWLA 4FSTA 2ITOA 4PTGA 1OUKA 4M67A 4EWHA 4EYMA 1BKXA 3AC4A 2FA2A 2HZIA 4QMMA 4FSUA 4K77A 4XV1A 4IJPA 4L9IA 1UVRA 4RG0A 2C6MA 3NCGA 3EQCA 4WG4A 3JVSA 5IQHA 3ZO2A 4CMTA 4D1SA 4FEXA 1MRUA 3W10A 1W7HA 3ALOA 2BAKA 3FLZA 2YCRA 3NWWA 4QMPA 2QOOA 3IW6A 5KHWA 5D10A 5KNJA 5HBJA 3B8QA 5AP3A 3BI6A 4F7NA 5L8JA 4AAAA 4QMWA 5AP0A 2C5NA 3ZDUA 3VC4A 5DVRA 5A9UA 3N4VA 3BIZA 2OIBA 3P86A 4DG2E 5JGDA 5H3QA 4PDOA 5LVOA 2WD1A 2UZTA 5DIAA 3DAEA 1AD5A 4QTBA 4BICA 2C3JA 4ASDA 4FTTA 3MWUA 5J1VA 5L2SA 3ERKA 4ZSJA 4MXOA 3RHKA 4AGDA 4GJ2A 2F2UA 4AGWA 1NY3A 5A4QA 3GU7A 2FUMA 1BL7A 4QYGA 5AP7A 4A9UA 1UWHA 4MEDA 4DEEA 2PUPA 3Q96A 2B55A 3W2SA 4QMUA 1LEWA 5D11A 3VBTA 4F9AA 3QGYA 4QMNA 1M2RA 2OO8X 3D94A 4YU2A 3UYTA 2BZIB 3AC2A 2PWLA 3JY0A 4FNYA 4M3QA 3R83A 3SW4A 3ZM4A 4WO5A 4APCA 4PNKA 2WQMA 5HLNA 2WQEA 2VTQA 3GQLA 3NEWA 4QP4A 3PSCA 3R9NA 1YI3A 3FKOA 4FC0A 2R4BA 1EH4A 1M7NA 5ANEA 2ZAZA 3G0EA 5ITAA 4CFWA 1WBWA 3RBWA 2H34A 3PJ3A 4IAYA 4X6QC 2R7IA 4E4MA 4IAKA 4QYYA 4UN0C 2J90A 3HV3A 4FZAB 2W1HA 3DBEA 2I40A 3VJOA 4DT8A 4FVQA 3DLZA 3NVKI 4FSZA 3CD8A 4XOYA 4IM3A 4JVGA 4GUBA 1OIQA 4QYFA 5A6OA 3OFMA 1ZY4A 1ZOHA 2YDIA 3IDCA 3LMGA 5HE0A 3TZMA 5HZNA 2CNUA 1XQZA 4ACMA 3BV2A 5I3OA 4JR7A 3FYKX 4TWOA 4U7ZA 5JFSA 2YIRA 2R3PA 5GIPE 4RJ8A 3LCTA 2X9FA 4II5A 4LV8A 3ZZEA 4MXZA 4G1WA 3COIA 2BZJA 3IK3A 5CVGA 5IA5A 5C03A 5DMZA 3O8TA 5FTGA 3C0HA 1XBBA 5M57A 3VBQA 4QPSA 2JEDA 3FE3A 3IW5A 4YO4A 3PFQA 3UIUA 4R8QA 2YHVA 1XR1A 2X6EA 2YM6A 3HLLA 5AR4A 5HNGA 3TACA 4JG7A 3GUBA 5LVPA 3E62A 1UKHA 3FMLA 4FIIA 4XP3A 4D5KA 5L6OA 4BTMA 3ZUVA 4EC9A 3QD3A 4XG7A 3CTJA 3FL4A 4AW1A 4EH3A 2O0UA 5KMJA 3CEKA 4AACA 3Q4ZA 4FTMA 4X2KA 3QA0A 4GK3A 1URWA 4JQEA 5BYZA 3TCPA 3L8SA 4UXLA 4FX3A 3BEAA 4FOBA 1FMKA 3DLSA 2OW3A 2OJFE 3BRBA 4QP9A 1G8AA 3JPVA 2XBJA 5FDXA 3NUXA 3D5VA 2GU8A 3QKLA 2X9EA 3SW7A 1OL2A 4BY9E 4MYGA 2Q0BA 4JDKA 3A8WA 3RI1A 3PSBA 3WF9A 3NYNA 4DF3A 4UWBA 5KBQA 4TXCA 4H3BA 4JQ7A 4V05A 4ZY6A 3BCEA 3QTRA 4MD7E 3TZ9A 2X7FA 3KFAA 5AFVA 4TNDA 1UNHA 5DEWA 3MI9A 1OIYA 5EI6A 4D0WA 4NH1A 3R8MA 4M8TA 3R1SA 2VTLA 1Q8ZA 4Q2AA 5L4QA 3K5UA 3DJ5A 3QLFA 2VTMA 4F63A 3QQLA 4YZBA 3LFCA 3GU8A 4U81A 2G2HA 1I09A 4FL2A 1O6YA 4I41A 2QKWB 4M69B 5EHOA 5AUVA 3RTPA 5AEPA 4IC8A 2JIUA 2ONLC 1MQ4A 4ZTQA 3MJ2A 2V7OA 3ACJA 4H1JA 1PYXA 2VZ6A 2FSTX 4G6NA 4CLIA 5EQYA 4KIOA 4Z55A 3C4ZA 2VWVA 4FIEA 2Z8CA 3A7JA 5ANOA 3R7VA 3RWQA 1PYEA 4IB0A 4QMTA 2FSLX 4R7HA 2VTAA 3IGGA 2PE0A 5BQ0A 5HNIX 1V0BA 2WTWA 4M0ZA 4MWIA 4RJ5A 3DZOA 4FODA 3M11A 2C0IA 2VWIA 3IOPA 3LHJA 4F08A 2FB8A 2NNWB 4FEQA 3REPA 3T3UA 2QURA 3QUPA 3GB2A 3BYUA 3OF0A 3POZA 4CRSA 2HYYA 3DS6A 2R3OA 2ETMA 4AG8A 4C4FA 3QUEA 2QOKA 4Y46A 4D4VA 3DY7A 3ZSHA 5IZFA 3LXNA 3D14A 4XH6A 4C3FA 1AQ1A 1JSVA 1ZY5A 4EOIA 2VTIA 4EOJA 2CLXA 4AA5A 3V8SA 3CE3A 2YAAA 3PXKA 4CFUA 4F65A 5I9WA 1UU7A 4YGAA 3FZ1A 5IUGA 4DGLC 4LV5A 5FXSA 3PPZA 3PPJA 3PVBA 3EQPA 5GJDA 4F1TA 4JBPA 3B8RA 3ZOSA 2W1FA 5CVFA 1O6LA 3GEQA 2XIXA 4UY9A 4LL5A 4R78A 4PDSA 1ZMWA 5EH0A 4KUJA 3NW7A 2OFUA 5I5ZA 5H9BA 1WBPA 4UBAA 1IA8A 3ULIA 2W5HA 1V0PA 3OMVA 4RZWA 3MA6A 2BIKB 1T45A 3FKNA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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