5HICA

Egfr kinase domain mutant "tmlr" with a imidazopyridinyl-aminopyrimidine inhibitor
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
323
structure length
302
Chain Sequence
EAPNQALLRILKETEFKKIKVLGSGAFGTVYKGLWIPEGEKVKIPVAIKELATSPKANKEILDEAYVMASVDNPHVCRLLGICLTSTVQLIMQLMPFGCLLDYVREHKDNIGSQYLLNWCVQIAKGMNYLEDRRLVHRDLAARNVLVKTPQHVKITDFGRAKLVPIKWMALESILHRIYTHQSDVWSYGVTVWELMTFGSKPYDGIPASEISSILEKGERLPQPPICTIDVYMIMVKCWMIDADSRPKFRELIIEFSKMARDPQRYLVIQGDERMHLPSPTDSNFYEEDMDDVVDADEYLIP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Activation Mechanism of Oncogenic Deletion Mutations in BRAF, EGFR, and HER2.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords Epidermal growth factor receptor
total genus 91
structure length 302
sequence length 323
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2016-01-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5hicA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5hicA01
2R3LA 4QMLA 4WD5A 2YDIA 4YMJA 5GJGA 1MRVA 4E7WA 3HMMA 5JFXA 3R8ZA 2HZ4A 4RIXB 2JAMA 5ANJA 4HGEA 2JDSA 3EJ1A 5DEYA 5M57A 3DK6A 4B99A 4D4VA 5GZ9A 5J1WA 2VO6A 4KSPA 4GS6A 3HRFA 3RAKA 3R0TA 4HYSA 3FXWA 3O8PA 4UYAA 4BI0A 4DYMA 4H3BA 2G1TA 3FLQA 3G0FA 4E4MA 4YZCA 2OGVA 3BE2A 5EI8A 4ORKA 2QO9A 1PXLA 4EJNA 2XCHA 4QTAA 4XG2A 3IECA 3HV7A 4QTEA 3TNPC 4ANQA 4QMZA 5BUJA 4X3FC 4ZLYA 5M56A 3MS9A 1JQHA 3DLZA 3D14A 3A2CA 4NM7A 5LQFA 2QU5A 3QHWA 3WYXA 4EZ7A 3UOJA 3U54A 5BVOA 4YURA 3NIZA 5A54A 4YHFA 5ETFA 1GOLA 5F4NA 3RPSA 4BCNA 5ACBC 2QO2A 3TJCA 4KBKA 1KSWA 3N4TA 5H8BA 1E1XA 5KHWA 3QA0A 4C59A 4D4RA 2IPXA 4QNAA 4AX8A 3E8EA 3CTHA 4IWQA 4A9YA 5FP5A 2V55A 1KV1A 4GVAA 4I20A 1PMUA 3SXRA 1A06A 1OPKA 2J2IB 3QALE 3R7YA 5DT4A 5KMOA 4JS8A 4RWKA 5ETCA 5A4CA 5EDRA 4QQTA 2Z7RA 3FKNA 4ZZNA 3P0MA 3U6JA 3ZBXA 3LE6A 5C4LA 1JWHA 1FMOE 3NW7A 4GW8A 2BTRA 3KA0A 4LUEA 3LFCA 4F7SA 4L52A 4ZXTA 4Z7HA 2XIXA 2CKOA 3SGCA 4PWNA 3LFAA 4BGHA 1H1QA 2F9GA 2WMVA 3HZTA 3T3UA 3VS6A 3GOKA 4DEAA 5I9XA 4EYMA 4YJOA 4YZMA 1P4OA 1R1WA 2H96A 2B53A 5HTCA 1OL7A 3OOGA 2Y9QA 4RX8A 4U40A 4IVCA 3DPKA 3QD0A 5AEPA 3LJ2A 5IH5A 4ZTSA 2WXVA 1H25A 3UG2A 4IC8A 2C0IA 4APCA 5HCXA 4FEQA 1Z9XA 4K33A 4M84A 2PTKA 4N0SA 2E9PA 2VTNA 2X6DA 4IAZA 1WAKA 4ITJA 3DQXA 4RIXA 5D1JA 5HCYA 1URWA 4RBLA 1IAHA 3PRIA 4U97A 5GNKA 4DCEA 4ZS0A 2P33A 4I22A 4CYJA 2CLQA 1JKLA 1M14A 5FDXA 2W1IA 3GP0A 2X6EA 4EH2A 1YVJA 3NYOA 3AXWA 3DGKA 3R83A 4ZSGA 2WTCA 3BGQA 1GIHA 2IW8A 4DLIA 3II5A 3V8SA 4DLJA 3V5QA 5E8SA 2A4LA 4I5HA 5TF9A 3PG1A 2VWWA 3A7GA 1NW1A 4YP8A 4CKJA 3GT8A 2I6LA 4EH5A 3LOKA 2JDVA 4D2VA 1H1RA 4KIOA 5BNJA 3OZ6A 4IAAA 3JUHA 3D5WA 1GAGA 2XK9A 1M7NA 3MJ1A 4RJ6A 5KX8A 2ITPA 2GSFA 5K4JA 2R3MA 3O7LB 2PMIA 1IG1A 4XV1A 3CSVA 2W5AA 2ONLC 3DKCA 4OTDA 5BMMA 3WILA 3K3IA 4JBOA 4ARKA 3U6IA 1OUKA 3PXQA 2CPKE 4S33A 3VS7A 2F2CB 3F3WA 3REPA 1F5QA 2UVXA 2W96B 1YDSE 4JLCA 4QMSA 4XCUA 5GZAA 5JMSA 4CT2A 4UMPA 5H8EA 3UOKA 4ACHA 4BHNA 4O0YA 1PXMA 4U44A 4DFXE 4FEUA 2GCDA 2OH4A 4F64A 2OG8A 1CKIA 3THBA 4K11A 4IAFA 4CTCA 5D9HA 3UQFA 5CVHA 2ZOQA 4D5KA 5IQFA 4R8QA 5DEWA 2W1GA 1P2AA 3BWFA 4OLIA 3GBZA 3QTIA 3UPXA 4NKSA 5J7BA 3ZSGA 5C8MA 4I5PA 4IIRA 4O84A 4F4PA 3HMPA 4CLJA 4B9DA 5K0XA 5HGIA 5LVPA 4RRVA 3G9LX 5IDPA 2VWVA 4FTUA 1PF8A 2XRWA 4RSSA 3MVLA 1W7HA 1UV5A 2PVNA 4EHVA 2QKRA 2J0KA 3QU0A 3U55A 2WNTA 3E92A 3LCSA 5C8KA 3IS5A 1OL1A 4MBJA 2C69A 3R9RA 2XP2A 1XH5A 2VTQA 5CU3A 5HI2A 4KRDA 5I3OA 4S30A 4U8ZA 1KWPA 4EOPA 4UMUA 3ODZX 4CKIA 1YRPA 4CNHA 1OIRA 2PYWA 5DNRA 2C3JA 1NY3A 2YIYA 3MJ2A 5HCZA 4K9YA 4BCQA 3ETAA 1Q8UA 4FKIA 2UW8A 4YZNA 3A62A 2C3IB 4H3QA 4CLIA 3OP5A 4IB3A 4IWPA 4RPVA 2C30A 3HA8A 3NYNA 3G33A 4QQCA 5DE2A 4P90A 2B1PA 3R9HA 2SRCA 4QMQA 3I7CA 2W7XA 5FXSA 3C1XA 4FV0A 3W2OA 1OBDA 1IEPA 4EH9A 1HOWA 2Y6MA 3O8UA 4TT7A 3BHVA 4BZDA 4KUJA 3BE9A 3LXLA 5JRQA 3NUUA 5DR6A 2W5HA 5LOHA 3GEQA 4ZJVA 1VR2A 5IMEA 2BAQA 4QTBA 3W2RA 3C13A 4AGWA 3FXXA 2ZV2A 3Q5ZA 2J9MA 2WTWA 5DLSA 4DT8A 3I79A 3U9CA 3CEKA 5CLPA 2NNWB 2X81A 2VNYA 3AC3A 4M15A 2YIQA 1RE8A 2R3OA 3OWJA 3MPMA 5IA5A 4DINA 4F9YA 5AM7A 5HEZA 3ZONA 2YABA 1JSVA 4EH8A 2A2AA 2BZKB 4GFOA 2OIBA 5C4KA 4BBEA 4IX6A 3E8DA 4EOKA 3HGKA 1R0PA 3CY3A 3GOPA 2NPQA 4FT5A 4GU6A 3R7OA 1JKSA 5CI6A 1PXJA 4MNEB 1SVEA 1LEZA 2PVRA 3ZO4A 3UG1A 1SMHA 2RSVA 3PXRA 4EKLA 1K9AA 5HNIX 5KMMA 5M08A 4J95A 2VUWA 1RDQE 2ITUA 3CD8A 4L7SA 3MPTA 5IPJA 4PMPA 3QQKA 2UVYA 4Q9SA 3WI6A 3UGCA 4F08A 4MQ2A 4PDOA 1YDRE 2IVSA 5FP6A 1FGIA 3H0YA 5K3YA 5M4UA 5AX9A 4FI1A 1YHSA 2XUUA 2IJMA 2VGOA 3DAEA 4L7FA 3WZDA 3EL7A 4CSVA 4C35A 4P7EA 1JKTA 2Y8OA 5HBJA 5ICPA 4EWQA 5E92A 4OAVB 3W2CA 1U46A 3EKNA 2Y6OA 5TOZA 4R5SA 4RVKA 2GTMA 3OT3A 2GQRA 4QPSA 3ZLYA 2QNJA 2IZRA 4R7HA 3HA6A 4D5HA 4FIHA 2HELA 3TNWA 1SNXA 3UODA 4EOSA 1VYZA 5IQAA 4PPAA 4DH8A 2VTOA 1XH6A 1ZYLA 3B8QA 4R1VA 2VD5A 5EQEA 4XP2A 4BCHA 4EHEA 4C4HA 2IW6A 3RAWA 4MTAA 3BGPA 2WTJA 4Q2AA 5IH6A 2WHBA 3F3TA 3OMVA 1O6YA 5CWZA 2CHLA 3QLFA 4LGHA 3QUPA 4FKRA 5FEEA 5I9YA 5I4NA 4YC8A 1PJKA 4FV7A 3LZBA 1BI7A 3V5JA 3MW1A 3OTVA 2PZRA 4MXOA 1PHKA 4FVRA 3DCVA 4AT5A 4MAOA 1A9UA 4R7IA 3G5DA 3EHAA 3EH9A 3UOHA 4UYNA 3K5UA 4HVIA 1OL2A 4FZ7A 5L2SA 5AR4A 3OY1A 4HYHA 3C4XA 4LMNA 5I9VA 3FSKA 2XS0A 3E7OA 1DAYA 5HICA 3HV5A 1KV2A 4YTHA 4MF1A 2IZSA 4S31A 3MA6A 2OF2A 4F9AA 1OKZA 3OG7A 3VJNA 5IA4A 2XJ1A 3R01A 5JGDA 4AAAA 5HNBA 2RIOA 2RF9A 2NO3A 3QQGA 4PDPA 2YM5A 1ZZ2A 1IASA 3OXIA 4MNEA 4ZS4A 3BRBA 4M69B 4YU2A 4UXQA 5DT0A 3LQ8A 4U45A 4ID7A 1YWVA 1QPJA 1GIIA 3SLSA 2QC6A 1KE7A 5E9EA 4I0SA 3MB6A 5H3QA 4H39A 3BV2A 4JDKA 4BR3A 4MK0A 2HXLA 5M09A 3GU7A 4JDJA 2XM8A 2CJMA 5BYZA 3VUMA 4F1MA 1REKA 3KXGA 3ORLA 4M13A 4O7LA 4X2FA 4LRJA 4JRVA 4QYYA 3F66A 2PVJA 4QTCA 4RQVA 2VTAA 3SW7A 1F3MC 4I24A 3VBYA 2Q0BA 3FMJA 4BTJA 4F1OA 3R28A 2QOOA 3BU5A 2GS6A 4V01A 2BIKB 4XLIA 5AR5A 4X7QA 1Q8ZA 3PTGA 5DT3A 3ZM4A 4EORA 3MESA 1T46A 1PMNA 4II5A 4ZMEA 2YLEA 4KABA 4Y5QA 4RWJA 1YDTE 2E9OA 3F7ZA 4J1RA 4FSTA 3D7TB 1YXXA 2W1DA 3Q96A 3QCYA 1GZNA 3D5UA 4FYNA 3JVRA 4FKPA 3LPBA 3I6WA 1I44A 4LYNA 1Q99A 4TNDA 3R00A 4G5JA 4FNXA 2ZJWA 3DFAA 3TACA 3VBVA 1M52A 3Q9XA 1Y8GA 4M3QA 2VTTA 2EB3A 3ATTA 5KUPA 2QONA 1WFCA 1A48A 3PXZA 2XK3A 4EI4A 3HRBA 1VJYA 4QMXA 5AIRA 4EBVA 5DRDA 4A07A 1WBVA 3BIZA 3VUKA 2CGWA 2YJSA 4WUAA 3WBLA 1TQPA 3I1AA 3PSCA 3FMMA 3QKLA 4CRSA 1NT2A 5A9UA 4IHPA 1WBOA 3NAXA 4FTKA 2BTSA 3D4QA 5EYDA 5DI1A 3TG1A 5HG5A 2W4OA 1PMVA 4NYEA 2WMWA 3KXNA 1XBAA 4E20A 3GCSA 3VC4A 2R5TA 3CKWA 4A9RA 3WZUA 2HYYA 3IW6A 4K6ZA 5FDPA 4OTWA 4FEVA 2CCIA 4WG5A 5G6VA 3TV4A 3OXTA 2XBAA 4M69A 1O6LA 3GVUA 5JFVA 3IW4A 1UA2A 2CMWA 4HGSA 2W17A 4QMVA 4U43A 5CAUA 4JBVA 4FV6A 2CN5A 4HCTA 4PY1A 2YCFA 1RW8A 2R4BA 3O7LD 5HX6A 5ACKA 4O0WA 2HW6A 3UO4A 3MH2A 3Q4ZA 1BMKA 3AC8A 5CNOA 1J3HA 3H30A 5IF1A 2VWIA 2Y4IC 3R1QA 2V62A 4O2PA 1QMZA 3M42A 4IWOA 4DH7A 3SX9A 2XZSA 3P08A 5FTGA 1R39A 5AWMA 3DZQA 1M2RA 2QKWB 4X3FB 4BDCA 4EQCA 2P0CA 2I7QA 5L6OA 2QCSA 4O7ZA 4ZZOA 5FQDC 4TYEA 4G9RA 4FG9A 3SVVA 2UZLA 2YITA 1ZMWA 3QCQA 4K2RA 4XG9A 3PY3A 3CP9A 5DBXA 5L2QA 4E6QA 4R3RA 2IZTA 2YN8A 1JSUA 3C0IA 5HG8A 5D41A 2UZTA 2YHVA 3BPRA 3EQRA 3HECA 3D7TA 5FM3A 3D5XA 3RAIA 4C38A 4C58A 5C1QB 2PUUA 1PXPA 3LCTA 3KRRA 2HY0A 5HD4A 5CEIA 2X8IA 3B2WA 3ZRMA 4O7NA 3FPQA 4LG4A 4USEA 4JL9A 2A19B 2QR7A 4Z3VA 4NCTA 1ZOHA 4F9WA 2JKOA 3TNHA 2I0EA 4JVGA 1OKVA 3GQIA 3I5ZA 4UWYA 4EH7A 3FKOA 4BZNA 4OBPA 2QOHA 3KC3A 5HZNA 2R3QA 4W4VA 3RNYA 5BMSA 3HYHA 3N51A 4ACMA 4QP7A 2I0YA 3TNIA 2YWVA 2PUPA 1WBWA 2QODA 3NLBA 4I0TA 3PG3A 4O7YA 1VEBA 4WBBB 2WQNA 4EK5A 3C4CA 4IZYA 2X0GA 3W2QA 5KHXA 5IA3A 3Q2MA 4HZRA 2YLFA 4Y73A 3MA3A 3ODYX 1OL5A 2R3FA 4NM0A 5FD2A 2XMYA 3R22A 4FKUA 1CMKE 2ITOA 2UW7A 3AT3A 3A7JA 4R77A 3DV3A 2PMLX 1NXKA 3VS5A 1H24A 4FIGA 1JNKA 4FK6A 3RJCA 2ZM1A 3A61A 4KA3A 3OW3A 5ANGA 3RPYA 5AM6A 2QLQA 4IE9A 3T8OA 5B2LA 3O8TA 5CAVA 5IEVA 3UPZA 4GT4A 4BTFA 2CGUA 4PPBA 4JI9A 3G0EA 3SXSA 3Q60A 3C4ZA 5IQCA 4ACGA 1J7LA 3I7BA 3A60A 4DTBA 2X8DA 3HL7A 2WMBA 3FLWA 3LW0A 3EYHA 3EQDA 4PL4A 4X3FA 2YCRA 5HG9A 4BIDA 3R7IA 3FHIA 3GNIB 3R8UA 3AD5A 4EOMA 2WFYA 1SVGA 5IQDA 3ZEPA 4G6NA 4AZTA 2FGIA 3R1SA 4I3ZA 4UY9A 1XH7A 5CF4A 4UZHA 4QP6A 3WF8A 5IA2A 5EFQA 4B8MA 3G51A 2ITXA 3R8MA 4FSMA 4XEYA 3F2NA 3NVMB 3ZCLA 1XH4A 5M44A 3OW4A 5FLFA 3Q53A 2C68A 3MN3A 3H3CA 3NYXA 4FSZA 4C4FA 2KTYA 1Y8YA 4RJ8A 4DTKA 3CS9A 4G3FA 5DWRA 5JK3A 2C5OA 4DA5A 1EH4A 2BRGA 4K1BA 2HCKA 3BI6A 2ESMA 4KD1A 2X9FA 3QC9A 3QTXA 3QTWA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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