5JZJA

Crystal structure of dclk1-kd in complex with amppn
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
275
structure length
271
Chain Sequence
EVSEEGFQIPATITERYKVGRTIGDGNFAVVKECVERSTAREYALKIIKKSKCRGKEHMIQNEVSILRRVKHPNIVLLIEEMDVPTELYLVMELVKGGDLFDAITSTNKYTERDASGMLYNLASAIKYLHSLNIVHRDIKPENLLVYEHQDGSKSLKLGDFGLATIVDGPLYTVCGTPTYVAPEIIAETGYGLKVDIWAAGVITYILLCGFPPFRGSEVLFDQILMGQVDFPSPYWDNVSDSAKELITMMLLVDVDQRFSAVQVLEHPWVN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase DCLK1
publication title Biochemical and Structural Insights into Doublecortin-like Kinase Domain 1.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 78
structure length 271
sequence length 275
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2016-05-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5jzjA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5jzjA01
5DVRA 5K3YA 4IX6A 5FTGA 3E5AA 3UZPA 4I5PA 3KCKA 4CFFA 4XV9A 2EXEA 3DK7A 2JAMA 4FV6A 4ACDA 4BY9E 3AC8A 3F5GA 2YFXA 3FSKA 4E8AA 4A4OA 3R7VA 5DFPA 3QA8A 4QMLA 1K9AA 4OTGA 4UZDA 2CCHA 2OU7A 4MXOA 4I0RA 4YC6A 2ITYA 3ZH8A 4ZMEA 1KV2A 4U7ZA 2P3GX 1OMWA 2REIA 3PLSA 4RG0A 2EB2A 3VBVA 3UVPA 3VS5A 4ZLYA 3ZUTA 4TZRA 1OUKA 3F3WA 3HV5A 4E7WA 3QQUA 3PIZA 5JN2A 3U9CA 5AP2A 1PXPA 3C4XA 2FSMX 5HLPA 3ZXZA 5IQFA 3ZO1A 3OCTA 1OBGA 2W99B 3OBGA 4BHZA 1U5RA 3EN4A 3H3CA 2FSTX 4HW7A 3GC8A 4O38A 3E7OA 2HYYA 3R28A 1Q4LA 1AD5A 3QRIA 2JDRA 1V0OA 2W0JA 2ZM1A 5CQWA 5J79A 5FXSA 3BIZA 3NZ0A 4OTRA 3RPOA 3NR9A 2X39A 3I6UA 4V01A 3ZBFA 5KBQA 2R3NA 4O27B 4XEYA 4ZEGA 4ASXA 2IPXA 3GQIA 5HKMA 4R1VA 4X6RA 5LVLA 3Q2MA 2OF2A 1Q3DA 3A7HA 3QRUA 5HE3A 5C4LA 1JWHA 4QQJA 4TYIA 4MKCA 3EIDA 1PXOA 5FBOA 3FMEA 4XHKB 4EOJA 5CEPA 5LOHA 4X2JA 5J9YA 2IG7A 4JIKA 2PE2A 3HRFA 4FIJA 5KE0A 5JRQA 3SA0A 3EQBA 1UU9A 3PSCA 3AGLA 2PMIA 3BEGA 4IC8A 4K1BA 4OTQA 4BYIA 4Z7GA 3DXPA 2DWBA 3ZRLA 2F7XE 3N4VA 4HJOA 4HCTA 5CEIA 3PJ1A 3GU8A 4EOLA 1Q8TA 1U5QA 1JBPE 3FY0A 4ZTQA 5HVYA 3R7IA 3UGCA 3KRLA 4NK9A 4FSMA 3ET7A 2O3PA 3QX2A 5J5TA 1Q99A 4O6EA 3CD8A 2WO6A 4FT5A 4KB8A 3SAYA 4C35A 3G9LX 1Q8ZA 1TQPA 4HGSA 4CGAA 3BHTA 5M44A 4BGHA 3SKCA 4XRJA 4W9XA 3THBA 4FEWA 3HUBA 5LARA 1LEWA 4J8NA 2X8IA 1S9IA 5CVHA 3C4FA 5AV2A 4CXAA 3PSBA 5TF9A 5FUTA 2UW7A 4M66A 2JDVA 5AIRA 4JXFA 4ZK5A 4EKLA 1SVHA 5AUUA 3VIDA 5KMOA 2VO0A 1TQMA 3AT2A 3V5LA 4AT5A 1WBVA 3KVWA 2XKFA 4LM5A 4CYJA 3Q2JA 4ORKA 2EU9A 4F9YA 4NIFA 4AAAA 4BDBA 2R3GA 3N9XA 4YJVA 1ZYLA 4GKHA 4E93A 3OWPA 5CASA 3MTLA 5EI8A 3GFWA 2UZDA 3KXGA 3ZBXA 3OXTA 3ZUUA 3TNIA 5AUTA 4OBQA 2C0TA 5JQ5A 4BTMA 4FL2A 5I4NA 2OICA 1FBNA 2DS1A 2O5KA 3DBCA 3E3PA 1SNXA 4ERKA 2W17A 3QZIA 3OCGA 1W0XC 3SXSA 2F2UA 5C8NA 4IVBA 3KB7A 2OJIA 1J7IA 4J99A 3RP9A 5IA1A 2JKMA 3O17A 2CGWA 3PXYA 4PDPA 3CD3A 4GK2A 3RALA 1BLXA 5HU3A 3II5A 2C5XA 3EN5A 2VTPA 3MVHA 4AF3A 1W98A 3QTXA 3TDVA 2FYSA 4BDCA 4IZAA 4JG7A 4PPBA 3RM6A 3TWJA 2BCJA 2WTDA 2C69A 3GNIB 3GUBA 2BRBA 3DBDA 3U8WA 5IA4A 2JBOA 3OD6X 4JOAA 3AD4A 5TT7A 5KKRB 3FMMA 3E92A 5TR6A 3SV0A 3WILA 4FX3A 3LM0A 5I0BA 5CALA 2QI8A 4EUUA 3ZO4A 2BRGA 2WPAA 4GU9A 5AV3A 5JGBA 4Q2AA 4L3PA 3EL7A 3FQHA 3KCFA 3P0MA 3S95A 3QWKA 1M7QA 3DAEA 4GFGA 3R9OA 4BZOA 5AFVA 4EWQA 2RF9A 4B6LA 4IQ6A 3RAKA 3NIZA 4IDTA 4GV1A 3RKBA 5BVWA 2CGVA 2WQMA 4V0GA 4YSMA 1XR1A 3O8UA 3RAIA 3TUBA 4BBMA 4IM2A 3C1XA 4CVAA 2IO6A 4ANMA 3I7CA 3OW4A 2ITWA 4FT7A 5IUGA 4I24A 2VTMA 3BI6A 4C36A 2ESMA 4IWOA 3HV3A 3HX4A 4CG8A 5AV4A 4FZ6A 5FM3A 2OLCA 3T9IA 1W84A 1O6KA 2XIRA 2G9XA 1XH4A 1H07A 3MFSA 1Q3WA 4RA5A 1DS5A 2IJMA 4G2FA 4O0WA 1I44A 5HO8A 5TE0A 3RZBA 3UDBA 4ASEA 5AIKA 2OO8X 5CAVA 1XBAA 4RWIA 4S33A 2YEXA 2BIYA 3NAYA 3QD2B 4HGTA 1KE5A 1OB3A 3FI2A 3ZXTA 4J95A 3D7ZA 2NRYA 3LQ8A 3Q4UA 4IMYA 4X3FB 3D2IA 2B4SB 3TZMA 3GCVA 1ZYCA 1ZYJA 3ZZEA 3SGCA 5IQDA 2W9ZB 3CKWA 3MV5A 4UX9A 3QD0A 1WZYA 4XV1A 5CX9A 1UNGA 3FL5A 3M11A 4CZTA 2HW7A 3WI6A 4QYEA 3PDTA 2JIUA 2YDJA 2R3MA 3FMNA 2JAVA 3LHJA 3P79A 2PWLA 1ZMWA 2J9MA 4XP3A 5F94A 3WARA 2NRUA 3PY3A 4BTFA 1U54B 2VUWA 2JKOA 4A06A 4C58A 2I0VA 3E93A 4YZ9A 3ORPA 5L2WA 5GINE 2WTJA 1JSUA 4I4FA 3Q6WA 5EM6A 2B0QA 4CQEA 4MHAA 4AW5A 1J1BA 4MD8E 1CKJA 4AN2A 3HV4A 4QYHA 1JLUE 1REKA 2V55A 2XVDA 3BWFA 2PHKA 2CN5A 1SZMA 2P2HA 3COMA 4FOCA 5DEYA 5EOLA 3LVPA 1GZ8A 4R1YA 2R3KA 4YO6A 3A4OX 4Y46A 2QD9A 3ZM4A 4BHNA 4EORA 3NEWA 3MBLA 3NWWA 3WBLA 5A4LA 4O86A 5H2UA 3MIAA 3MFTA 3QF9A 4RQKA 4JDJA 2FSOX 3FHIA 5IZFA 2XNEA 2BZIB 4CZUA 3MY5A 3HMPA 2WMQA 3LJ0A 4BCKA 3CQWA 1M52A 1OPJA 4DEAA 1OBDA 2GPHA 1JPAA 2YITA 3BU3A 3Q52A 4DEDA 2R9SA 2C3JA 3BYUA 3DB8A 4MTAA 1IAJA 3CP9A 5EYCA 1FPUA 3D5UA 4PUZA 1Y57A 4EHGA 5LMKA 4NKSA 4EJ7A 4ANLA 2BZJA 2IWIA 5C1QB 4MH7A 4O82A 1YOJA 5IH4A 2XK3A 1CM8A 3KMMA 5JQ8A 4MEDA 3F61A 4U79A 3K5UA 3OROA 4AX8A 1OUYA 4IVDA 3WYXA 5HBHA 1ZRZA 3VUKA 2CLXA 1G5SA 3KXZA 5EK7A 4O1PA 4AZFA 2WEIA 2HZ0A 4G3DA 2ZV7A 4G5PA 5DGZA 3A7JA 4EH5A 5L6OA 4QQCA 3MB7A 4B8MA 1STCE 3AC5A 3KEXA 3A99A 3G90X 4L67A 4RX7A 5E9EA 3CXWA 4EHEA 4M0YA 3ZOSA 3ZSHA 5L2SA 4CCUA 5HGIA 1FOTA 3U9NA 4FTRA 3MSSA 2QU5A 5K4IA 3UBDA 4RFMA 4KAOA 5AP1A 4ID7A 3H4JA 4XCUA 3W8QA 4G9RA 3GU7A 5LMAA 2XIXA 4ZTRA 2QHMA 4YTIA 4Y95A 4P5QA 1XH9A 5HG5A 2ITTA 3QALE 4X2FA 5DA3A 4F7LA 4FIIA 5T68A 4UYNA 4OAUC 1J7LA 4O7ZA 2F4JA 4RJ7A 5JFXA 2BR1A 4WIHA 3GC9A 3TZ7A 2PZIA 2VGOA 3I5NA 4BR3A 2YIRA 3IG7A 2RFNA 4GVAA 4QP2A 2WQNA 3L8XA 4GMYA 4E26A 4M8TA 3OWKA 1FGIA 3O0GA 3BE9A 3IW5A 5ITAA 3COHA 1KE9A 2J0IA 3Q04A 4IZ5A 3HUCA 4HCVA 1YXSA 5HCZA 3TNWA 3NUXA 5B2MA 2YJSA 4G6NA 4S32A 1WBPA 2XS0A 3AT4A 3R00A 3QYZA 3DK6A 3PA4A 3QTUA 4MNFA 4DG3E 5I9XA 3G9NA 4M7IA 3QX4A 2HIWA 2YM8A 5TKDA 5I9WA 1H1PA 2J5FA 4D0WA 3ZONA 4PY1A 5HCYA 4CT1A 5E8WA 2GQSA 3OC1A 4FTJA 3LQ3A 2B55A 3IW4A 3C13A 4ZXTA 4XYFA 4PWNA 3ZLSA 2IVVA 2CMWA 4B4LA 4FEQA 2XJ1A 4XMOA 3ZO3A 2EVAA 2XJ0A 3EZRA 1YRPA 5HO7A 2ZVAA 1PY5A 2VTSA 4E4XA 3BWJA 2QKWB 3DBQA 1H0WA 1P5EA 2PE1A 2QOFA 2WU7A 2WOTA 3I7BA 4GUEA 5KMJA 1W7HA 1ZXEA 3F9NA 4QMVA 2GCDA 4CCBA 4YPSA 4EONA 4IM3A 2Y4IB 4YURA 1DI9A 2JBPA 3LCTA 3NYXA 3DLZA 3A8XA 2W5HA 4RVTA 4AA4A 3CE3A 3H30A 3K3IA 1LEZA 2BIKB 3DJ6A 4FT3A 3BGPA 4XX9A 4C02A 3VF9A 5LMBA 2ETKA 3VS4A 4EOKA 3ERKA 4PDOA 3KC3A 1A9UA 4QQTA 4M12A 2Q83A 2XNPA 4RLKA 4O0SA 3Q9YA 4XG9A 3A8WA 4C8BA 3REPA 1CMKE 5H3QA 2XM9A 4D5KA 3ANQA 1BL6A 3HGKA 1NVSA 2FB8A 2W1HA 2WMAA 3RWPA 5M08A 4BCFA 3DOGA 2HAKA 4XP2A 3HDNA 2DQ7X 5HHWA 1JSTA 4I93A 3WF7A 3K3JA 2XIKA 4C37A 2RFEA 1FQ1B 4F0GA 3TNQB 2YCRA 1UA2A 4E1ZA 5LWMA 1Q8YA 3GT8A 3RPRA 4AS0A 4DTKA 1KSWA 3GI3A 4RIYB 4F7SA 5JK3A 3CSVA 2X6DA 3LCKA 3RZFA 2ITZA 3TIYA 1YW2A 4F6WA 3U51A 3FC2A 3F2NA 4IFGA 3UO4A 3S00A 2J0KA 2GS2A 2YCFA 2FO0A 1WVXA 3QXPA 3BLRA 4I1ZA 4PNKA 4PMSA 4JRNA 2PSQA 4EHZA 2YHVA 3OTVA 1SMHA 3GP0A 4C38A 3VBTA 4BCHA 2VWUA 3BV3A 4L01A 5FTOA 4C61A 2YZLA 4DAWA 1IASA 5I3RA 5IQHA 2C4GA 2RGPA 4K6ZA 2V7AA 3EB0A 3LCDA 4NU1A 4ZSLA 3PG1A 4YJUA 3DQXA 4JBVA 4CSVA 4CMTA 5E8YA 2C0OA 1Y8GA 4PMPA 1LR4A 2KULA 4MD7E 1WBNA 4UMTA 2ETRA 5KZ0A 1WMKA 1OIYA 1I09A 3I4BA 3R7OA 5ETIA 2VRXA 3UIBA 3HV7A 4BWXA 5FLFA 3BHVA 3F3VA 4NTSA 2GU8A 3E8EA 2YIYA 3D7TB 2W1GA 2C1BA 3ALOA 3EJ1A 4KIQA 3U4WA 4F70A 4O7VA 3Q5ZA 3VQHA 3TM0A 1YI4A 4R3RA 1YDTE 5A4EA 2QCSA 4RPVA 3ZMMA 3TDWA 4DGOA 4RRVA 3ID6C 2QO7A 1JSVA 4FSYA 4FG9A 4QP4A 4RVLA 3SXRA 3NUSA 3EQHA 4OTPA 5E90A 3D5VA 3PXRA 4LRKA 4O7YA 4O2PA 4NFMA 4BDGA 3RM7A 3CTQA 2QOOA 2EWAA 2BDJA 2R3PA 2WELA 3D4QA 4NJ3A 5E7RA 5FXQA 4UB7A 4I4EA 3MDYA 5GZ9A 5HO6A 4AA5A 2JKQA 3F6XA 3NYNA 3CGOA 2UVXA 2XKEA 2GHLA 4Y5QA 3WF5A 4EQUA 3FMHA 3R8LA 3QCSA 3PG3A 2C5OA 5H8EA 3QZHA 4FZFB 4ACHA 5HZNA 3FUPA 1U54A 2ZV8A 3H9RA 3PY1A 4UXLA 3DA6A 3PPJA 4JAIA 4X7QA 5GIPE 5H8BA 3P5KA 5F9EA 4PMMA 3PY0A 2YLEA 2NPQA 4ZP5A 1XH5A 2JKKA 3UNKA 3G5DA 3CY3A 4NM3A 3U87A 3FQEA 5AP3A 1Z57A 4IZ7A 5K5XA 4EH7A 3GC7A 3QTQA 4LGDA 2YIXA 1X8BA 1Y91A 1LUFA 4LV8A 3HA6A 4UXQA 1OKYA 2VWWA 3LXKA 3FEGA 1WBOA 3FZ1A 3MI9A 3PIYA 3QKLA 5F4NA 5AP4A 5CU0A 4K18A 3QQGA 1YWNA 1GZOA 3KGAA 2CCIA 2C6TA 1ERKA 4AUAA 2OIBA 3U6JA 1QMZA 4Y73A 1APME 3RCDA 4XBRA 4FEVA 2O0UA 3SG9A 2XNBA 4FTQA 3DXQA 2ITQA 2ZV9A 2XIZA 3BU6A 3EQFA 3RPVA 2GFSA 3ZLYA 4H3PA 2PL0A 2Z7RA 2HW6A 1CSNA 2WAJA 2WZJA 3VHKA 4AW1A 4AZVA 3DFCB 1RW8A 4K77A 3RJCA 4AGDA 5M09A 4DTAA 5DRDA 3UVRA 4QTEA 5L2IA 2ONLA 3UNJA 3EQIA 5DBXA 1RJBA 3PUPA 3I0QA 2HXLA 3LQ5A 5DHJA 5HVKA 1P14A 4O7TA 1PKDA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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