5JZNA

Crystal structure of dclk1-kd in complex with nvp-tae684
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
270
structure length
268
Chain Sequence
GFQIPATITERYKVGRTIGDGNFAVVKECVERSTAREYALKIIKKSKCRGKEHMIQNEVSILRRVKHPNIVLLIEEMDVPTELYLVMELVKGGDLFDAITSTNKYTERDASGMLYNLASAIKYLHSLNIVHRDIKPENLLVYEHQDGSKSLKLGDFGLATIVDGPLYTVCGTPTYVAPEIIAETGYGLKVDIWAAGVITYILLCGFPPFRGSDQEVLFDQILMGQVDFPSPYWDNVSDSAKELITMMLLVDVDQRFSAVQVLEHPWVN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Biochemical and Structural Insights into Doublecortin-like Kinase Domain 1.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase DCLK1
total genus 77
structure length 268
sequence length 270
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2016-05-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5jznA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5jznA01
4ITJA 4L8MA 5EYCA 1R3CA 4F9AA 2B9FA 4WNOA 4YNOA 3SXFA 5EDPA 2UW0A 3VS1A 1P14A 5HD7A 4DH3A 4CMOA 5KCVA 5FUTA 3OXZA 4CG8A 5H9BA 2OFUA 1BL6A 3F5PA 2ZB1A 5B2MA 5CQWA 4V01A 1KOBA 3DPKA 3TKUA 5TR6A 1DI8A 1BLXA 3ZUVA 2OJIA 3Q2MA 3WYXA 2QU5A 2VTAA 5EG3A 3VIDA 4C0TA 4E26A 4ZLZA 2ZM3A 3THBA 5TT7A 3RNIA 5LXMA 3DXQA 3N4VA 2BFYA 3MH0A 3O7LB 2C6DA 3OC1A 4KD1A 3ULIA 4EHVA 3IW5A 4FKGA 5AUVA 4OBQA 4ANBA 4NUSA 4G9RA 3WF5A 4BDEA 3DAKA 2F7EE 4X2KA 3LJ1A 4RVMA 5M08A 4HGEA 4GVJA 2YM3A 5HG5A 2QR8A 4OTRA 2J5FA 5J1VA 3HKOA 1Y6BA 2OZAB 1PXMA 2BZHB 2QHNA 4EH8A 3UOJA 4C4JA 3KK8A 4TN6A 3MSSA 4GT3A 5CZHA 2BROA 4M97A 2XK9A 4LV5A 5DRBA 4OT6A 4C3FA 3SX9A 2ITYA 3FLYA 2OK1A 4XYFA 3N9XA 4JG7A 3Q32A 1JKTA 3KRJA 4DH7A 4AS0A 3S3IA 3MA3A 4EYJA 4ZY4A 4AW1A 1MP8A 5CSVA 4O27B 4IC8A 4XRLA 4EOMA 5IH4A 3PDTA 4FSUA 2WKMA 4K9YA 2PVHA 3R21A 2VNYA 3T3VA 3TZ8A 3TV4A 3N4UA 1PMNA 3I7CA 1H4LA 2BHEA 3PXKA 5BNJA 5L8LA 1Q8YA 2UZTA 4XV3A 3FI4A 3DNDA 3EQCA 5E8WA 3LM5A 3L9LA 2WTDA 1ZOEA 1PHKA 4WG4A 5BVFA 5JRSA 4R1YA 2EXCX 4FEQA 5IQAA 3GU6A 1FQ1B 4KRCA 1Q3WA 2QOQA 5IQCA 2WO6A 3KK9A 4CT1A 4ZS0A 3D5XA 4CT2A 3QCXA 3UVRA 1ZYSA 4FKIA 4KRDA 4C4EA 4F7NA 2OH0E 3MVJA 1KE5A 1JAMA 4I6FA 2CCIA 3NEWA 2PK9A 2XEYA 3C0IA 4JDIA 2PUIA 2R7IA 1ATPE 5BPYA 1E1XA 4RJ6A 4ZK5A 5A4TA 4BWKA 4AE9A 5C8NA 1GIJA 5I9VA 3RPSA 2J0MB 2CCHA 4IH8A 2ZV9A 4FR4A 2WXVA 2C6KA 3FLWA 4IB3A 4I5PA 3CE3A 5ANGA 2WTIA 3CD8A 2WGJA 3GCSA 4BCMA 3ID6C 4HCVA 3H30A 4RVTA 4ERKA 3HDMA 1YXXA 4KKEA 3W2QA 4FSRA 2Q83A 1Z57A 4FX3A 3CXWA 4PDOA 1UU3A 3V04A 4IJ9A 1UU9A 4D55A 2R5TA 4EK6A 3R8VA 4RJ5A 3VF8A 3GU7A 3OT8A 2V22A 3OOGA 5L2QA 4MD9E 4ZLYA 5AAEA 4DGLC 1WCCA 2PVRA 3HMMA 3UGCA 5E9EA 4AZEA 4BKJA 4BZOA 4MVFA 4ZIMA 4FZDB 3CQWA 5IEXA 4XV1A 4EK3A 2W1IA 4X3JA 1W0XC 3DBDA 4MCVA 4I92A 1NW1A 2OZAA 3JPVA 2OH4A 3NUUA 4JDHA 4DEHA 4BDGA 3E3PA 1ND4A 5FXQA 3HEGA 3C4WA 1H00A 1WZYA 5H8EA 4BR3A 3P1AA 3RZBA 3TTJA 3LXNA 3EMGA 5J7BA 4CMTA 1Q5KA 2B53A 4G5PA 5TF9A 3UG1A 4H1MA 3UTOA 3RHKA 5ANEA 4ALWA 4AOTA 2BZJA 3VS7A 4BCQA 4C33A 5AUTA 4CFXA 2RIOA 4HW7A 3HGKA 3QQLA 4L01A 3R04A 3ANRA 3HRBA 5HEZA 4IVAA 2C6TA 5L2WA 3WF6A 1KWPA 2Z7SA 2CNQA 1JSVA 4FSTA 4NKAA 4EEVA 4O84A 5I4NA 3OUNB 1PKDA 5J95A 4B6LA 3DZOA 3DK7A 1DM2A 2ERZE 2IZTA 3TUBA 2YDJA 1JQHA 3GU4A 2OF2A 4M7IA 4WBOA 4WSYA 4YJQA 3ZLSA 3BKBA 4N57A 4A4OA 4CLJA 4P5QA 4DT8A 4JX7A 5B7VA 3MH1A 3BQRA 3HZTA 1KE9A 4D2RA 3Q5ZA 3PIXA 3ORKA 5AIRA 5FM2A 5ITAA 5JSMA 4EJNA 4OTIA 5CU6A 5KUPA 2HXLA 1UKHA 3JXWA 3CKXA 5DFPA 3HVCA 3CTJA 3TNIA 2EB2A 1X8BA 5BVWA 3U8WA 2PZRA 4FL1A 5TE0A 4I1ZA 4RFMA 2HELA 5ICPA 4Q5HA 5E91A 5DT4A 3IK3A 4FKVA 2XS0A 3U6JA 3T9IA 4O1OA 5C4LA 5CWZA 3I4BA 5HE2A 4D4SA 1TVOA 1J1BA 2LGCA 1Y57A 4GK4A 3FQSA 2VO7A 3QTQA 3VWAA 2R4BA 4AGCA 3BWJA 4H3QA 4KUJA 4O7TA 4UEUA 3VUMA 5AX3A 4FKJA 1SM2A 4ASDA 2DUVA 4P5ZA 5EKNA 4PTGA 5GJFA 1JLUE 1ERKA 3GI3A 5JEBA 2VD5A 1H1RA 2A4LA 3O8TA 4YBJA 1CTPE 2ESMA 2YIRA 3ZMMA 4ZOGA 5CU0A 5CX9A 3LCTA 4UWBA 5ANIA 3ZS5A 3FC1X 3HA8A 3R02A 4DFXE 4IB5A 3VQUA 4NZWB 5EHOA 2YDKA 2PE2A 4Z16A 4MWHA 1J7IA 4M69B 1JWHA 4MAOA 1R1WA 2NO3A 4UZDA 1H26A 3R7UA 2ITNA 2YLEA 2X6EA 4RIXB 3DZQA 4W9WA 1IRKA 5M55A 3RWQA 2XNGA 4QQCA 3VULA 4DFBA 2WMSA 4BDIA 2J50A 2CMWA 1WBSA 2H96A 5AR2A 3F5UA 3NAYA 3A2CA 4GIHA 4LOQA 5LVMA 1KE6A 4NJDA 2JDSA 1XH4A 4CFVA 2VZ6A 3ORLA 3P86A 4O38A 3KXHA 3QKKA 3KRXA 4CFFA 4UMRA 3GGFA 5AUZA 2WMVA 2R3QA 3WF7A 2XJ0A 2C6EA 3PVBA 4NM5A 5AR8A 3PPZA 4BCFA 2G2IA 4PTEA 4CGAA 3DNEA 2CN8A 4USEA 2ITVA 2VRXA 4C57A 5IMXA 2PUPA 4UV0A 3KRRA 4EKKA 4RQVA 4IWQA 3NUNA 3KRLA 3EWHA 1CSNA 1B39A 3AC8A 5KMOA 1HCLA 5DEYA 4H58A 5KKRB 5HVJA 5CNOA 4BWXA 3OTUA 4JLCA 4C3PA 1XH9A 4MD8E 3I81A 4JR7A 3D15A 2R3KA 1PMVA 1WBNA 2FA2A 1YXSA 4RFZA 4YC3A 4YTFA 3F9NA 3F82A 2ITUA 2YERA 3A62A 5CSXA 4BYIA 1QPEA 4DEDA 2UVYA 5E8TA 3V5JA 1M17A 2PMLX 2GU8A 3A7HA 2R3FA 4FTRA 2QONA 4WA9A 4FTMA 2PMIA 3L8XA 4CLIA 4E20A 2OWBA 3PA4A 1J1CA 4MBLA 3LXKA 4UWYA 5DGZA 4OW8A 4W8DA 2G01A 3TZMA 3BE9A 3PSBA 3TM0A 3AC3A 3PE2A 3O8PA 5AEPA 5J79A 3GCQA 2R2PA 4K1BA 5EI2A 2ZYBA 3ET7A 4FTOA 3EIDA 5BYYA 5IUHA 2WQOA 5L6OA 4IW0A 1JOWB 4ZTLA 3ZUUA 3OBJA 3QYWA 5L3AA 4FTAA 4D9TA 4RJ4A 1IA8A 4BDHA 5HTBA 2CPKE 2ZDTA 3OF0A 2W96B 4FV4A 4HYIA 4MH7A 3SHEA 3GOPA 3IGGA 5DVRA 3PPKA 2QO2A 1XKKA 5HOAA 3F3UA 3HUBA 3OCBA 4QTDA 4QMQA 3VS6A 5KO1A 4G16A 4YZMA 1V0BA 5EHLA 3MPAA 4RA5A 3OY1A 4RIXA 4YMJA 1B6CB 3KXNA 1AQ1A 2AC5A 2VO0A 2PZ5A 1OL1A 4JI9A 5ETIA 4YTIA 2PVJA 3NWWA 3Q4ZA 4FE2A 4PPAA 5LWNA 3BLQA 1WVWA 4FYNA 4FIFA 2HY81 4PQNA 3UIBA 4YHFA 5IG1A 4F9CA 5IA1A 3KC3A 4FK3A 4A9TA 2VTTA 3DOGA 4IVCA 3QZGA 4KKHA 4RRVA 3BGPA 5IQGA 3U9CA 3NZ0A 5CI6A 5FXSA 2YIWA 5ANDA 1YWNA 3O96A 4DFZE 5KMNA 2C3KA 1PYXA 4JRNA 3GEQA 3Q4TA 3JYAA 3SLSA 3KL8A 4D2TA 3HP5A 1PF8A 4XG8A 5A3XA 4K11A 5A14A 5IUGA 3HLLA 4K33A 4LOPA 1ZLTA 1H08A 1OPJA 3PZEA 1GZOA 2G2HA 3MDYA 3KN6A 4II5A 3BCEA 3FMEA 5CSWA 5HIBA 1OKWA 2PVNA 3E3BX 2YCQA 3G6GA 3ZYAA 5CAUA 5KBQA 3P78A 5HIDA 3PA3A 4EYMA 2WMAA 1FBNA 2CN5A 2F2UA 4UMTA 2X0GA 4YJUA 4A4XA 4FVPA 3A8WA 3E88A 3PJ1A 4ERWA 2CKEA 3OFMA 2B7AA 4U3YA 2NPQA 3R00A 4ZY6A 5HU9A 2KTYA 4NU1A 4C61A 2C3LA 2YCRA 2W1GA 5FQDC 3ZO1A 3D2IA 5JFXA 2QKRA 4FV6A 2WHBA 4AA4A 3U4WA 3QRUA 2RG5A 1VR2A 4FKSA 4WNKA 2YCFA 5HD4A 4R8QA 3ZXTA 4YLKA 5HTIA 5FWKK 3O2MA 1VEBA 3UVPA 4I4EA 4F9BA 3NGAA 5EDRA 4XBUA 4BDFA 4CQGA 5EW9A 3PXYA 4BHNA 2WTJA 2JIVA 5CYIA 3ZHPC 3JY9A 1PYEA 3W8LA 4K77A 3UZTA 4NW6A 4FODA 4PP9A 4D2SA 4TL0A 2IW6A 3TI1A 3AT2A 4JBPA 1L3RE 4MXAA 4ANQA 3HMPA 2J51A 3VUDA 4FTIA 1PXNA 4M84A 4HNFA 2PVKA 1NT2A 3DBCA 4PL4A 5CNNA 2ZB0A 5FP5A 1SVGA 2OJ9A 1JSTA 2VWXA 3A61A 3R28A 1IEPA 3FLZA 4ALVA 4J53A 1ZY4A 2WPAA 1YI4A 3CEKA 2Y6OA 3PY1A 4DEBA 4CZUA 4EBVA 3CIKA 4U0IA 5AUUA 3NRMA 4J96A 1ZY5A 4YO4A 3FLQA 5KMMA 3EQIA 4LL0A 4QMOA 2P2HA 4QPAA 5DT3A 2UZNA 1MQBA 4C4FA 2CNVA 2R3JA 1M52A 2OI4X 2I1MA 2PE1A 3EQHA 3FXZA 4BCOA 3UNKA 2ZM4A 2BZKB 3ZO3A 4JJRA 3B2WA 5TO8A 5KE0A 2BTSA 4PNKA 3TV6A 5KMIA 4RWKA 3NDMA 3C4CA 4XLIA 1JNKA 4RC2A 3K5VA 4GW8A 4XMOA 3GOKA 2J0KA 3HX4A 4RJ7A 2XIYA 4QP8A 5KHWA 3QKLA 1BI7A 1WAKA 3QCQA 3W55A 3EYGA 2BRMA 2VTOA 5HVKA 1JKLA 3O51A 3ZUTA 5LMBA 1FINA 3ZONA 1SMHA 1KUTA 2QOCA 4MF1A 4L45A 2I0EA 4M67A 1OM1A 2VTHA 5JGDA 3UP2A 4J8NA 3UDBA 3ORTA 3G33A 3DQXA 2OGVA 3QXOA 5F20A 3OMVA 3GFEA 4YZDA 3FZPA 1YXUA 2AYPA 4IAZA 4AA5A 4BHZA 2ITWA 3RAHA 1U54B 1GIHA 1S9JA 3DBEA 4RX7A 4ZP5A 3EN7A 1B38A 2YIXA 4MXOA 2R3MA 3DK6A 2H8HA 4JNWA 3RVGA 4EI4A 3FE3A 3VW6A 4ORKA 2PVLA 3GC0A 4KNBA 3PJ3A 1ZMUA 3QD4A 4GYIA 4YJPA 3DBFA 4WD5A 5HO7A 5DT0A 1PKGA 2ETMA 2YISA 2BDFA 2V55A 2GQRA 3SG9A 2I0VA 4D2PA 3KFAA 3LVPA 4CTCA 4DITA 1S9IA 4IAFA 3FDNA 4DT9A 3DJ7A 2QVSE 4BBEA 1R78A 2FSMX 2YFXA 3SAYA 4TWNA 1W8CA 3WF8A 5LQFA 3I5ZA 5IKWA 4AACA 3DV3A 4GG5A 3GENA 2CGVA 2GMXA 4IZ5A 2CKOA 2X9EA 3GBZA 3KXMA 3Q5IA 4NK9A 3UMWA 1OKYA 2CGXA 4GFMA 2YACA 4LV8A 5CSPA 4R7HA 5C4KA 3GU8A 2VWWA 5DBXA 4IMYA 2HK5A 4ZJIA 4PDYA 3D9VA 3HMIA 4FTQA 5BVEA 2O3PA 2ITOA 4F08A 3KCFA 4WUNA 3NW6A 3HMNA 2RFSA 3RP9A 4XUFA 2C3JA 2C47A 1CDKA 3LXLA 4FV8A 3DU8A 4U3ZA 2G2FA 4WNMA 3QD0A 4RC3A 2W0JA 1O6KA 4MF0A 5EOBA 3SXSA 4BCHA 3BX5A 4DYMA 4ID7A 5IQHA 3O0GA 4MBJA 4AFEA 2G9XA 4AG8A 5CY3A 4FUYA 4RJ8A 5FGKA 3VJOA 4XJ0A 4D4YA 5CEKA 2V5QA 5AP3A 4FV3A 2CKPA 5IQEA 4R6VA 5E8YA 2HY0A 5M4FA 4FKWA 2OLCA 5HCZA 3DTCA 3ORXA 2J0JA 5DR2A 4TYHA 4HJOA 4D1XA 4Z7GA 4V05A 2JD5A 1HOWA 4H36A 3LPBA 3QF9A 4F9WA 2GQSA 3KREA 3CD3A 3OOMA 1UWJA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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