5K9IA

Crystal structure of c-src in complex with a covalent lysine probe
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
275
structure length
258
Chain Sequence
AWEIPRESLRLEVKLGQGCFGEVWMGTWNGTTRVAIKTLKPGTMSPEAFLQEAQVMKKLRHEKLVQLYAVVSEEPIYIVTEYMSKGSLLDFLKGEMGKYLRLPQLVDMAAQIASGMAYVERMNYVHRDLRAANILVGENLVCKVADFGFPIKWTAPEAALYGRFTIKSDVWSFGILLTELTTKGRVPYPGMVNREVLDQVERGYRMPCPPECPESLHDLMCQCWRKDPEERPTFEYLQAFLEDYFTSTEPQYQPGENL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
molecule keywords Proto-oncogene tyrosine-protein kinase Src
publication title Broad-Spectrum Kinase Profiling in Live Cells with Lysine-Targeted Sulfonyl Fluoride Probes.
pubmed doi rcsb
source organism Gallus gallus
total genus 78
structure length 258
sequence length 275
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2016-05-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5k9iA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5k9iA01
2QOLA 3EQHA 4CYIA 3JYAA 2YDIA 5CYIA 4ONAA 2XUUA 3LFSA 3OBJA 1PXPA 5B7VA 3BLQA 2I7QA 4YJPA 4C7TA 4QTBA 4AQCA 4PL5A 2WTDA 4EOLA 4O96A 4UYAA 2C6TA 3C7QA 1VR2A 5ANJA 3LKMA 4L3LA 3VUTA 2UVZA 3R2BA 4MXOA 3NVKI 1SM2A 4RC4A 5EHYA 4QP1A 4CLJA 3PY0A 4UV0A 4Y72A 3UO4A 3BHYA 2BVAA 5LQFA 1M52A 3WF9A 1JSUA 3H0YA 5DRBA 2W1DA 3G15A 2BKZA 3OROA 3UIBA 4IB1A 1BUHA 1XBBA 4AG8A 4ZAUA 4F1OA 3MPTA 4FTMA 2YJSA 5JQ8A 1KE5A 3T8OA 3WZDA 2GS6A 4V05A 2X4ZA 2X9EA 4HYIA 4ACCA 3O51A 3UNKA 3TNIA 3ROYA 1ZY5A 2QODA 2GQRA 3OTUA 3NWWA 3R63A 4GV1A 4JDJA 3BRBA 4CTBA 2W9FB 3AMAA 4R5YA 2GSFA 3GC8A 3FI4A 3ZLWA 3VS3A 2XZSA 2BRBA 4NFMA 2QLUA 3NNXA 4L6QA 3MFRA 4MWHA 1JSTA 4XJ0A 5DVRA 5EQYA 3W2CA 3TNQB 3LAUA 4EH3A 2ITNA 5EDQA 2C4GA 2XA4A 1W0XC 5AV1A 3SXRA 5KO1A 2C5OA 4RX5A 4WSYA 1XQZA 3LPBA 5IUGA 1JVPP 3ANQA 3OT3A 1QPCA 4H3QA 5L6PA 4IHPA 2W06A 4F0FA 3PY3A 1ZYJA 4HCUA 4NH1A 2GTNA 5EI2A 4XOYA 4EH5A 4EH9A 4JG7A 2IWIA 2HY0A 5E8ZA 3ZSIA 2WPAA 2VTSA 4R3RA 4RBLA 2JAMA 4E73A 3ZOSA 2ZAZA 4AU8A 4A07A 5LJJA 5IQCA 1KE6A 3BQRA 4FSQA 2BDFA 1TQPA 3RK7A 5L2SA 3QWJA 4DEAA 2VTJA 4MF0A 4CYJA 1ZMWA 3Q9WA 5IKWA 3EL8A 4RGJA 4WIHA 4C4GA 4DGLC 2PZ5A 2WMSA 4PDOA 2ONLC 1OIYA 4OTPA 4TNDA 3TJDA 5FM3A 2O0UA 3TIZA 3FL5A 4ZMFA 3DA6A 3SRVB 4XP2A 5ACBC 4RIWB 5G6VA 4HCVA 5AWMA 3RBWA 4EH8A 3CTQA 3DDQA 2J0MB 3ZUTA 3IOKA 3G90X 2W1IA 4IAIA 4BCQA 5KBQA 2J6MA 3EQPA 4BBMA 4A4LA 4NL0A 3VQUA 4O0TA 2BROA 5DMZA 3OVVA 2VTQA 2ZM1A 3K54A 5EKOA 3TJCA 3TKIA 4F6UA 2J5EA 3U8WA 1M2QA 4ZLOA 2VTTA 4NTTA 2PVFA 1LUFA 3ENHA 3VUIA 3KK8A 4UY9A 3R28A 4IZYA 4RJ8A 5LWMA 3V6SA 5HG7A 3S0OA 1QPJA 2E9PA 4QNAA 3NVMB 4HZSA 5GJGA 3HRBA 5BVNA 3BI6A 5C9CA 2O64A 3AD5A 5IU2A 4D2SA 3QQUA 3ZRKA 2YDJA 2ZV9A 3SXFA 4CVAA 2EVAA 1PW2A 3DFAA 3WZKA 4CRSA 3CJFA 5CLPA 4RWKA 2XKDA 3PPKA 4HGSA 4AN9A 5ANDA 3M42A 3PE1A 3U4WA 4BGHA 3W2OA 3TG1A 2C3IB 3QC4A 5TKDA 2BRNA 3UVPA 3KXGA 4FTQA 1YVJA 2ITUA 4O7RA 4MD7E 3V5LA 4X3JA 5A54A 4ZS4A 2OIQA 4BDBA 3ERKA 2VTAA 3QQKA 2YEXA 5C27A 3SRVA 2PHKA 3WF5A 4AFJA 1NXKA 4RIWA 4HCTA 2BFYA 1QCFA 1AD5A 2HAKA 3F88A 2W17A 2I0VA 4J95A 4Q2AA 2CN8A 3ORLA 4RJ6A 2FSMX 3R8PA 3V01A 2J0JA 3EN6A 4FV1A 4E4XA 5BUEA 5CANA 3ZFMA 2Y7JA 4CFVA 2WD1A 3LM0A 5J8IA 2F7ZE 1GAGA 3U9CA 3LE6A 4FSTA 2QOIA 5IDNA 3LFCA 2XK6A 3ORXA 1UNHA 4FT3A 4KA3A 1GY3A 3RNYA 4YSJA 5CF6A 3KKVA 4LMNA 2Y4PA 4IE9A 2XM8A 1JKLA 4Y8DA 3TZ9A 5M09A 5L3AA 4FOBA 5D11A 5HE0A 2IG7A 3VS2A 4F63A 2PUPA 4FSZA 5HORA 5CNNA 4KIQA 4ASZA 3VAPA 4FVRA 4F7NA 1SNUA 2X1NA 3NW6A 3PFQA 3PVBA 4X0MA 2XIKA 5HG8A 3ZO1A 4L43A 4C8BA 3QTQA 4E6QA 3PY1A 4AAAA 5T6KA 3F3TA 3QZFA 3W16A 4AA0A 2UUEA 4IX6A 1JOWB 1VJYA 3KQ7A 4JBPA 4CT1A 2BIYA 2YWPA 3C50A 2QONA 4MXYA 4YHFA 4C33A 4YR8A 2P0CA 2H96A 3A4PA 3FMEA 2VNYA 1OUYA 1YHVA 5HQ0A 4HVDA 3ZONA 1ZYLA 2WO6A 3BEGA 2IW9A 1JNKA 4ZZNA 1APME 2V0DA 3CQUA 5KUPA 2UZOA 4YTHA 3RWPA 3SLSA 2X2MA 4IFCA 3EN7A 2YFXA 2WMBA 4HNIA 4YPDA 4ZIMA 3UP7A 4JJRA 2XMYA 3PUPA 4K6ZA 4WA9A 4YLJA 3BLRA 3EIDA 4XG9A 5AUUA 3RZFA 1ZMVA 4G5PA 2E2BA 2HENA 3NW5A 3QWKA 3QX4A 3SG8A 2YERA 4I5MA 3R04A 4BYJA 4N57A 3QD4A 5GJDA 3KCFA 2XB7A 2X6DA 3ZDIA 3IW7A 3A4OX 4GFMA 4OT5A 1U4DA 2J4ZA 1TQMA 2W1EA 2BTRA 3TNHA 4ZTSA 4A9RA 1W8CA 3GCVA 3WF7A 4F0GA 4ZY4A 1RE8A 4GRBA 4Q9SA 4HVSA 5TT7A 3H10A 4CTCA 2WIHA 4FTOA 4BTKA 3FMKA 4O0VA 3R1YA 4P5QA 2V7AA 4FZAB 1OIQA 3EKNA 2QU6A 4YC3A 5DHJA 4JX7A 4PPAA 4QMXA 4I20A 2VV9A 5IA4A 3QUEA 3SD0A 3ZUVA 4UYNA 4RJ5A 5J5SA 2JITA 3W2QA 1BL6A 2Y4IB 3SKCA 5M08A 3PIZA 3PWDA 4FODA 3C4XA 3TZ8A 3DAJA 1O6YA 4H58A 4U45A 5CT0A 4FTJA 4LG4A 1QL6A 4MBLA 4Z3VA 4L44A 5C1QB 2VX1A 4MNEB 4DG0E 4GEOA 4H05A 5DIAA 1SZMA 3HV3A 4G2FA 5CU0A 4NKSA 4AOIA 5JH6A 1CDKA 3LJ0A 3ZFYA 3HV7A 3MESA 4IQ6A 4QP6A 4TYEA 3TV6A 4E4MA 3PJCA 3LVPA 5EM5A 1UNGA 4QMMA 2Z02A 4FKWA 4K77A 2VGOA 1WBSA 4E6DA 4L00A 4QQCA 5AV2A 3KEXA 4L01A 2XK3A 1KE8A 5HLNA 3ZLSA 4B4LA 4CKIA 5C03A 3ZS5A 4F70A 5CX9A 3ORKA 1R0EA 5CS6A 4NM7A 5IF1A 5E8XA 3VHKA 4BWXA 4D1ZA 3K2LA 3E8NA 3KVXA 2WIPA 2YZLA 1ZYSA 2WB8A 5JFWA 5DFPA 4IADA 2JKMA 5JZJA 3PWYA 2XCHA 2HCKA 3MBLA 4Y85A 3DS6A 4M15A 4FV5A 5ETFA 4FGRA 2AC3A 2I1MA 5LXMA 3VRYA 5E4HA 2R3PA 4FYNA 4YJOA 4EC9A 3ET7A 4C0TA 3ZTXA 2PPQA 2WTKC 4IIRA 4MXXA 1VEBA 3IGOA 4RWLA 5HU3A 5IEXA 2QOFA 2JBPA 1XR1A 3LJ1A 3HAVA 3ZO2A 1M2PA 2VWVA 4WO5A 4QMYA 3DBFA 5M56A 1PMVA 3Q04A 2W1GA 5HU9A 4ZZMA 4RLKA 4MNEA 2PL0A 2XYUA 2ZV8A 3I7BA 4RX8A 5LMAA 2UW4A 3OP5A 4O83A 2P2HA 2J50A 3HDMA 4XMOA 5AP4A 1G3NA 4XEYA 5AIRA 2OJJA 3A7FA 2HY81 3IW8A 4D9UA 3L8PA 3V8SA 4M3QA 2PVHA 2BFXA 2G2FA 3MSSA 1JBPE 3NUPA 4OTWA 4GK4A 2JIIA 4KRDA 3HMMA 3L9NA 2ERKA 3FKNA 2G2HA 4WOVA 5EW3A 3HX4A 3OXIA 1OM1A 3EOCA 3HA6A 4I5HA 2KULA 3CQEA 3BBTB 4IVBA 4TPTA 3COIA 3DAKA 3DTWA 4FL1A 2YISA 1J7UA 3EZVA 4C2VA 4ZLZA 4FG9A 5IPJA 4FC0A 4HPUE 3OZ6A 4IXPA 3L8VA 4OBOA 4XG3A 2YWVA 2BRGA 3BHUA 3OWJA 4JX3A 3TTJA 3WF6A 2WXVA 4W8EA 3NCGA 4J96A 3F2AA 4WNPA 5A3XA 3W2RA 3N4TA 2GDOA 3DTCA 4MWIA 5E9EA 3QKKA 4BRXA 3ITZA 4HW7A 3DLSA 4XUFA 4QQ5A 5AP7A 4ZZOA 3A8WA 4FTCA 3AD6A 4G1WA 4OW8A 2QOQA 3E5AA 4QP4A 3P0MA 4NW5A 2HIWA 2JDSA 3OG7A 4ACHA 4LL0A 3Q4ZA 2ITTA 2DS1A 4E6CA 4AT4A 4GU6A 1MQBA 3VS4A 3UODA 4LFIA 3GU4A 5CZIA 4AGCA 3IGGA 2PUIA 4GMYA 4GT5A 3ATTA 3FPQA 5JRSA 2WMQA 5CTPA 3O0GA 5ANIA 3DXQA 2UW9A 4YLLA 3MA3A 2BHHA 5HKMA 4BI1A 4CZYB 4DLJA 5IDPA 4GK3A 3P86A 2I40A 4FIGA 4BVUA 4QQTA 3B2TA 3QHRA 3QQLA 3FPMA 2YCQA 4XLIA 3I6UA 4IANA 3PRIA 1H27A 3UC4A 1O9UA 4TWOA 4BZDA 4QMWA 2PUNA 5HE1A 2W99B 5KMJA 4G3FA 2C1BA 4XCUA 3FDNA 5DR6A 5FG8A 3NMUF 2XIZA 3D2IA 3GT8A 1UU7A 4GJ2A 3VBYA 2NO3A 4FV0A 5AUXA 3V5JA 2VO6A 3KXHA 3VUGA 4FZ7A 4KINA 4TYHB 2YIXA 4FNXA 3ZO4A 5FXRA 4ENXA 1GNGA 2X0GA 1Q4LA 3QZIA 1RJBA 2XIXA 3AMBA 1UU3A 3BELA 2EXMA 3IK3A 2PU8A 1WBPA 4Z7GA 3R8VA 5HIEA 4DTBA 4PTCA 4L3PA 4D2RA 1PXOA 3VUHA 4H36A 3E62A 4UMTA 4O6LA 3E3PA 2Q0BA 4ZK5A 2BRHA 2PE0A 1KE9A 4YC6A 2OG8A 3IW4A 2IN6A 3OW4A 2VGPA 4O6EA 4I3ZA 4CFFA 3DK6A 4R5SA 4ZJJA 3HDNA 1ZZ2A 4ANQA 5I9XA 4PY1A 4G16A 4LOQA 3PSBA 3U6HA 2XNPA 1JAMA 4EOJA 2SRCA 2XNBA 3Q3BA 1OKWA 3PIXA 1XO2B 3R8MA 5BMMA 4QMQA 5BVWA 2YABA 3MY5A 2QI8A 2QHNA 1NVRA 3P23A 5DT4A 4BFMA 4AW1A 2CKOA 4FTRA 4AA4A 3CBLA 4QP2A 5CSHA 2BKKA 2BDWA 5AFVA 4XG6A 1K9AA 4A9YA 3MGYA 5EH0A 5EQEA 2J7TA 5AR3A 5EM7A 2ONLA 5L6OA 4E7WA 5CF4A 3VIDA 3RWQA 1H1WA 4CMUA 3OF0A 3FZ1A 5CAUA 3FY2A 3QCQA 1FOTA 3B8RA 2XIRA 4O91A 2BTSA 1JPAA 2OJFE 4TYHA 4M97A 4FBXA 4OAVB 4FSRA 3BBWA 4O0UA 4ANOA 3R01A 3PXKA 5KE0A 1Q8TA 4AXAA 4KAOA 3D94A 2JEDA 4IBMA 4NM0A 1JKTA 4AGDA 4RFYA 3HRFA 4Y95A 5A46A 3EQGA 5DEYA 4EUTA 5CQWA 1H26A 2WMVA 3HL7A 3D5WA 3KRRA 1ZRZA 2P3GX 4U44A 5L8JA 2BAQA 2R7BA 2WKMA 1G8AA 4CLIA 3QZGA 4CNHA 3MPAA 3EQFA 4GL9A 2VN9A 2RFNA 2IVSA 4I6FA 1GZOA 2PZRA 3IKAA 4MBJA 3KXNA 3E8DA 2VU3A 3CJGA 3F9NA 4L67A 4RQKA 1WBOA 5FTQA 3RPYA 5GIPE 3R7EA 2YLFA 4S30A 2QD9A 4D4VA 4U9AA 4V01A 1ND4A 2ITWA 3NYXA 4BCJA 4BDIA 4GVAA 5CWZA 5L8LA 2X7FA 3FC1X 4YHTA 2WAJA 2R3GA 5H8EA 2YM5A 3ZLXA 5J9YA 5FGKA 3EZRA 5BYLA 3R8UA 5KNJA 3ZZEA 2VTIA 5DG5A 3R30A 1J7LA 4HGEA 5LCKA 3DZOA 2JDVA 4IAYA 4KKHA 4DEGA 4XV1A 5AP2A 3EN9A 5A4LA 5FDPA 5I5ZA 3IO7A 3FXXA 3NR9A 1TVOA 3L8SA 2BAKA 4TWCA 3UO5A 4K0YA 3QUPA 5L2WA 2R3IA 4I41A 4F7JA 4EK4A 2XNOA 3D15A 2W0JA 3MFSA 3MIAA 4JDHA 4I6QA 4MXCA 5LCJA 2OF4A 3L1SA 2IZTA 3ZXTA 5BVDA 1MQ4A 2NPQA 3A60A 3NIZA 4IDTA 2C3JA 4K2RA 2R0IA 5AA9A 4M69B 2BILB 1XH7A 1TQIA 2UZNA 3FMHA 3Q2MA 4PMSA 5JZNA 3UJGA 4E6AA 4K8AA 1WZYA 3AT4A 4A06A 3DKCA 1GOLA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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