5KX8A

Irak4-inhibitor co-structure
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
297
structure length
285
Chain Sequence
TRFHSFSFYELKNVTNNFDERPISVGGNKMGEGGFGVVYKGYVNNTTVAVKKLATTEELKQQFDQEIKVMAKCQHENLVELLGFSSDGDDLCLVYVYMPNGSLLDRLSCLDGTPPLSWHMRCKIAQGAANGINFLHENHHIHRDIKSANILLDEAFTAKISDFGLARASEVMRIVGTTAYMAPEALRGEITPKSDIYSFGVVLLEIITGLPAVDEHREPQLLLDIKEEIEDEEKTIEDYIDKKMNDADSTSVEAMYSVASQCLHEKKNKRPDIKKVQQLLQEMTA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Efforts towards the optimization of a bi-aryl class of potent IRAK4 inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords Interleukin-1 receptor-associated kinase 4
total genus 98
structure length 285
sequence length 297
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2016-07-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5kx8A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5kx8A01
3COIA 2IZSA 3Q6WA 2BILB 3ZXTA 4LQMA 4OAUC 1MQ4A 4OTQA 1OMWA 2CCIA 2XKFA 4HCUA 5EYKA 2NNWB 4RWJA 5BYLA 2NPQA 3GEQA 2JIIA 5TF9A 5DA3A 4F6WA 4H3PA 3IDPA 5M51A 2NRUA 1OIRA 3PPJA 4JVGA 5CI7A 4ACCA 3H0YA 1JSVA 4WKQA 4IWOA 1MRVA 3ENMA 4FG9A 4EUUA 5HBJA 3TEIA 3PLSA 3SX9A 4BGGA 4XRJA 3UYTA 2F7EE 4EOKA 5KMOA 4E93A 3NRMA 4FG8A 2JDSA 4FODA 2P4IA 3MDYA 3IW8A 2VTHA 1Q8UA 3OT8A 4DFYA 3N4VA 4TY1A 4EH5A 4D2RA 1JKLA 1VJYA 4DGLC 4O86A 4TWPA 4IB3A 1NA7A 4X6RA 3DLSA 2Q83A 4D1SA 5H8EA 1BL7A 1Q24A 5CEIA 4XX9A 3BZ3A 4FSZA 4QPMA 5HTBA 2V62A 4TN6A 4J53A 3W2QA 3BX5A 4FIIA 5E90A 2EXCX 4JRVA 2C3LA 3L8VA 4F09A 4FZ7A 2ZV9A 3KY2A 1H1SA 1YHWA 2X0GA 3POOA 2YDJA 2J0MB 4XG3A 3RPRA 4AW2A 2XK8A 4XLVA 1W98A 1TQPA 4F08A 4JJRA 5IMEA 2VWXA 4XJ0A 3CEKA 4FT9A 4XCUA 2OFUA 5GIPE 5LVPA 4Z7HA 3TCPA 3EOCA 2PE2A 2JITA 3OF0A 3I0OA 4C4JA 1QPJA 3FUPA 2OF2A 4EH3A 3QCXA 4U45A 5HGIA 3FYKX 4YPSA 3D15A 5L6PA 1I44A 4ENYA 3SVVA 2HY81 4NIFA 4FTUA 4RA5A 2ITNA 5ETIA 5FM2A 4CLIA 5CEOA 1Q41A 1ZYJA 3A61A 1WAKA 3C4WA 3ERKA 5CNNA 3OY1A 4BWKA 3UODA 3A60A 1KV1A 4EH7A 1YHVA 4O2PA 3G6GA 2QO9A 2EXEA 4KNBA 2WQOA 1BI7A 4F9YA 2WTJA 3F5UA 4YMJA 3R9NA 5AP5A 4LUEA 2GFSA 2CLQA 3HDNA 4HGSA 3WF7A 3IONA 4DLJA 3OWKA 5JFVA 1IA8A 5IQAA 4U80A 1H1WA 4ZSGA 3DB6A 3C4CA 2GNIA 1YXUA 1JQHA 2XCHA 2ITYA 3RAHA 4BDHA 1H01A 2VWVA 4EUTA 2C0OA 2REIA 4V04A 1BKXA 3R8ZA 5AUZA 3HGKA 3THBA 4B9DA 5HVJA 2C5OA 3A2CA 1GZNA 3MH3A 4D55A 3VO3A 2YCFA 4YP8A 2BZHB 3FZRA 5FEQA 3VUDA 2CGUA 4OTRA 4NUSA 2RFNA 3DDQA 5H8BA 3ZLSA 4RIYA 4X7QA 2XNEA 2Y9QA 4NSTA 2XYUA 3AG9A 3OWJA 2P2IA 3GI3A 5AP7A 4BCIA 2ITZA 4EOJA 3EJ1A 1B6CB 3LFDA 3S3IA 2XJ2A 5FTGA 3PPZA 2IW6A 4IANA 4ZTQA 4KIPA 5CEMA 5HX6A 1CKIA 2WMQA 3GB2A 2YIRA 4NEUA 3TJCA 2JKQA 3VBTA 1R3CA 3QYZA 5LVLA 3A7HA 3LLTA 3RMFA 5JFWA 4I22A 1XH5A 4QYFA 5DN3A 4HW7A 4ZY6A 4YUQA 5KNJA 3NZ0A 2WTDA 5EKOA 3AMBA 2AC5A 3CIKA 4IB0A 2QR8A 1Z5MA 4IHPA 3PLAE 2XVDA 4EOSA 3FI8A 1O6YA 1U5QA 2PVYA 3O7LD 3LFNA 4K18A 2X2KA 4A9YA 1F5QA 3QKKA 4D58A 2VGPA 2JIUA 2HOGA 4EJNA 4BIEA 3RPYA 3PXZA 2IG7A 4FT0A 2F7ZE 2FVDA 4IAYA 3GCVA 5DG5A 2VO7A 3UBDA 3VUGA 5LQFA 1F0QA 4NW6A 3GP0A 4HYIA 2PVRA 2WMTA 4Q5HA 5AR7A 4M69A 3CQUA 4ZXTA 4FEWA 3QRTA 5IEVA 4FNYA 4Z9LA 3V8TA 4W4XA 4O82A 4E8AA 2ZV7A 3E88A 3KULB 4C62A 2WB8A 3DPKA 4BWXA 2YITA 2PVNA 3K54A 5CX9A 4DTKA 2OXXA 4I5MA 4UXLA 1J3HA 4KRCA 1NY3A 2UW5A 5DNRA 3A4OX 4FV4A 4O0WA 5HO7A 2YWVA 4ASXA 5KMMA 5CT7A 4J96A 2GHGA 2QOBA 4G17A 3QD0A 1U4DA 2ITWA 2W4JA 3L9PA 4XNEA 3ZFYA 3ZLWA 2PHKA 4D4RA 4F99A 4LFIA 1XWSA 3DJ7A 5EHOA 3ZZEA 3UIXA 2FSLX 2RFEA 3R2BA 4L46A 4PV0A 5GINE 4QMUA 4NTSA 3ZRLA 1R1WA 1SVHA 3KN6A 4RX5A 5CU6A 3WARA 1IR3A 5EDPA 3VQHA 5KKRB 5A14A 3F3UA 3QCSA 2CDZA 4CZTA 3DXNA 3UVRA 3B2WA 5D12A 5EOLA 5CENA 4EOMA 3UO4A 4ORKA 2C5XA 4CV8A 2QHNA 2BIKB 2C30A 3BHHA 4YPDA 2VWUA 4F1MA 5CSPA 3QKMA 4EH4A 3HMOA 4JAJA 2CN8A 3VNTA 4A4OA 3LCDA 1PF8A 3QD2B 4I41A 4K0YA 4UX9A 2J50A 2GNFA 4UZDA 5HORA 2R3FA 2R3IA 4IIRA 3HEGA 5HNIX 3BI6A 3KU2A 4AGCA 3I7CA 2IVVA 2ZAZA 3UO6A 4KWPA 5IPJA 4ZSEA 2Z7LA 4X2NA 4O7LA 3VW6A 4IX5A 2PL0A 1FPUA 2ZM4A 3EQHA 5AAFA 4CFUA 4LV8A 3BQRA 3IW5A 2B9HA 4RC3A 3UP7A 5L4QA 1A48A 3ZOSA 1J7IA 3TL8A 4M0YA 2VUWA 3DAJA 3R04A 3SQQA 2O2UA 3WZEA 4CFWA 4U3ZA 4GKIA 3SRVB 4WUAA 3HV7A 4FTRA 5BYZA 2R5TA 4CZUA 5B2KA 4FYNA 5HQ0A 5CASA 4CKRA 4KIKB 4EZ7A 3R7EA 3E64A 5KO1A 2JFLA 3H9RA 1JKKA 4PTCA 4BBMA 2PMOX 2HW7A 1A9UA 2W1EA 4E3CA 4M15A 2UV2A 1OECA 3PUPA 3CE3A 2FSTX 4JG7A 3PXYA 2VTSA 4DYMA 4L6QA 2W1CA 5M07A 4GK2A 3ZHPC 4CLJA 3NWWA 3QQUA 2XNGA 4FSUA 4AW0A 1YRPA 4BYIA 4C3PA 4NL0A 1KE5A 2PTKA 3H9FA 3ZM9A 1Y6BA 2XP2A 3SHEA 1AGWA 1RDQE 3LMHA 3RZBA 4ID7A 5IU2A 3F2RA 3BHUA 3LHJA 3SOCA 4U3YA 4OBPA 3C5UA 3C5IA 3GCSA 3BYSA 1OIQA 3HMMA 2BAQA 3EN6A 3RHXA 4AZVA 3UPZA 5I4NA 1KE8A 5D41A 2VTIA 2E9OA 2VX3A 3PIZA 3VS3A 3NW5A 1W7HA 3QAME 3F2NA 3W8QA 5FQDC 4CGAA 3MWUA 3A4PA 3HA8A 4DBNA 2VZ6A 1GJOA 2I0EA 4JS8A 1V0BA 2WHBA 4V0GA 2QU6A 4DN5A 4GU9A 2R3OA 5A54A 2CJMA 4A07A 4FV1A 3WZDA 1TVOA 3CD3A 4I24A 5HCYA 4XP0A 2CKPA 3I79A 3Q60A 3QTQA 3NNVA 1FQ1B 3HP5A 4JR7A 2JAMA 3ZXZA 4BDFA 1REKA 4J97A 5C9CA 5KZIA 4R77A 3HAVA 3BYMA 3NYXA 5DHJA 3TI1A 2GU8A 4EK6A 3ALNA 5HEZA 5CNOA 3PPKA 2XRUA 3HV6A 4DA5A 3BU3A 5J7BA 3TV4A 3F3TA 4X2JA 5E91A 5J5TA 3KCKA 4AGDA 4I4FA 2J0IA 2CLXA 4BBFA 4Y73A 4IM3A 4WNOA 3UG2A 3JY9A 2HXLA 2QHMA 3OW4A 4QMXA 5ANOA 4MBIA 4KIOA 4ZY4A 5JN2A 4KBKA 5EFQA 4USFA 3WF8A 3Q9XA 4NH1A 4IDTA 5KX8A 4FEUA 3I6UA 1E1VA 5JQ8A 4F9CA 4GUEA 3KB7A 4O7TA 2J7TA 3FI2A 3PZEA 4AFJA 5BVEA 4O38A 3UNKA 2BKKA 3M11A 4KABA 4BDCA 5CZHA 5FRIA 3LJ0A 3BIZA 2YM8A 4AGWA 2OZOA 4FSYA 4GCJA 2JKOA 4CG9A 3LFAA 5ANDA 1YWRA 3PYYA 2R64A 2FGIA 2BUJA 3AC3A 4IM2A 1BMKA 3NUSA 1S9JA 4MQ2A 1IASA 2VAGA 4YJUA 4FUYA 3MH0A 4I20A 4BCHA 4X3FA 3JS2A 3DK7A 5JGDA 1YHSA 3MY1A 2X7OA 3EH9A 3MBLA 1JKTA 3WILA 4IVDA 3EN9A 4QP1A 2G9XA 2P3GX 4BHNA 2H8HA 4RRVA 1PXIA 4OLIA 1GAGA 4LG4A 2YIQA 5CALA 3R00A 3ODYX 3SC1A 2HK5A 4DC2A 4H58A 1P4FA 4EOOA 4ZIMA 3HUCA 4LYNA 3OTVA 3ZM4A 4E4MA 3Q96A 3UMWA 4ZLOA 4R7HA 4IJPA 4U6RA 2JAVA 2G2FA 2QOFA 1TQIA 3TNPC 4FE2A 4JX3A 2ITQA 3R73A 3MY5A 1HCKA 4QNAA 1J7UA 5EDQA 4TW9A 1YKRA 3C4FA 2QLUA 3BYUA 1OL5A 4NKSA 2VX1A 4IACA 4FV9A 4LV5A 2YIWA 4R3RA 3FHRA 4ASDA 4AU8A 4D0XA 5JRQA 2UZTA 3HRBA 2LAVA 1GIHA 4J95A 2XEYA 5E8WA 3UMXA 3NNXA 4F1TA 4G3DA 1ZYDA 1XBCA 3SOAA 1FOTA 3QD4A 4Q2AA 4GK3A 4XG2A 2Q0NA 3F6XA 3PA4A 4PRJA 3OC1A 2C6LA 1FVVA 3KXHA 5CLPA 2YM3A 5IQGA 4X2KA 5AP6A 1LPUA 5CSVA 5J1WA 2WQEA 4D0WA 3ORTA 4AOIA 4EZ3A 2BDWA 3P1AA 3UOHA 1VYWA 3G51A 5F20A 3NW6A 4WG5A 3RPSA 5IA3A 3ROCA 3TTJA 2B1PA 5AWMA 3DNDA 3Q4ZA 3UC3A 3SW7A 2BZIB 5IZFA 3G2FA 4U42A 3MVLA 2UVZA 4EKLA 5M44A 5EQYA 4QMNA 2BROA 3AT2A 4FIGA 1FINA 3FQEA 2YABA 3ORLA 3WI6A 1OKZA 5FP5A 3ZU7A 4L53A 3QF9A 5CY3A 3LM5A 4UZHA 4JBQA 4DBXA 3AOXA 4YJSA 4HGLA 3UC4A 2VTPA 2IZTA 4BZOA 1OB3A 5AAGA 4IAKA 3IOPA 4TXCA 2X2MA 3IQ7A 3PJ2A 4MXZA 3IDBA 5AR3A 5AR5A 1DI9A 2GS7A 3CJGA 3FPMA 3R02A 3LXNA 3QC9A 5DR2A 4EORA 3OCTA 2UZWE 4IWDA 3P4KA 4L52A 1JWHA 4W8EA 3V5QA 4HVHA 1UNGA 2GCDA 5LCKA 4QP8A 3V8WA 4B0GA 4PL4A 3CTQA 4K6ZA 3V5JA 2WEIA 2BHHA 5IA0A 1WBPA 3CP9A 4F63A 3HP2A 2RL5A 4F6SA 4N4SA 3NIEA 1CSNA 3OXIA 1ZLTA 3KVWA 4U41A 5L8KA 2BALA 2EB2A 3QRIA 3NVKI 2Y6MA 1OKYA 4M14A 4XBRA 3LMGA 1PXMA 2PZPA 3I7BA 5E8UA 3OZ6A 2JDTA 1ZARA 4C4GA 4ZS4A 3EB0A 5AR2A 4QNYA 5AMNA 1OPJA 2WOTA 2QOKA 5A4CA 3FXZA 4CD0A 4XMOA 2OI4X 2CHLA 4YLLA 5BPYA 1HCLA 4UYNA 4YJOA 4QMTA 3DDPA 2GSFA 3D5XA 3IPHA 5DRBA 4C38A 4K33A 3TJDA 1PRYA 1M2QA 1WVXA 5IH6A 3HYHA 2BR1A 3ZS5A 4NM5A 4WA9A 4GSBA 5H9BA 1FVTA 2JDVA 4P7EA 5A6OA 4G3FA 5L8JA 1KE6A 3OEZA 1URWA 4UY9A 3FL5A 5IQHA 2OW3A 2PVJA 2OJFE 3FMDA 4BDIA 4I4EA 4XYFA 3PG1A 3R63A 1ZAOA 2P33A 3KREA 2XIXA 5HO8A 4ACGA 4UWBA 5FBOA 2UZUE 4WSYA 4PY1A 4I94A 4I93A 3OMVA 4ANBA 4XP2A 5LMAA 3N9XA 3TDVA 4P4CA 5ETFA 2XKEA 3P78A 1Y6AA 2EU9A 3CPCA 3QLGA 1R0PA 3TNQB 4L3LA 4ZSLA 3MFRA 2QOQA 1OL1A 3OT3A 2R7IA 5EI6A 5J1VA 3LJ2A 2BRGA 3OOGA 3RZFA 3ATSA 3AD6A 3PSDA 4FIHA 4O22A 3UO5A 3P7CA 2BAJA 3QQFA 4GFOA 5M06A 5HHWA 3LCOA 4M7IA 1WFCA 3R8UA 4TWNA 4CT1A 1JBPE 2Y6OA 5IH5A 1APME 4H36A 3LM0A 3N4TA 1WBTA 3D7ZA 5AR8A 3A7JA 2PUNA 5C27A 1BUHA 3PVWA 1OUYA 2XF0A 4K9YA 3QUEA 3MS9A 1WBWA 4DITA 3MH2A 4LGHA 1YXXA 4IE9A 1B38A 1PMUA 3W2OA 4A9SA 5IUIA 1XBBA 4FV0A 4J99A 3MA6A 3QUDA 3OXTA 3EHAA 4QTCA 4RQVA 4GJ3A 3W18A 1NT2A 2PVFA 5A4EA 3SAYA 5CF6A 1OPKA 4IZ7A 1H00A 2XA4A 3ZMMA 2XK9A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2OF4 A;  4JR3 A;  1JVP P;  3ANQ A;  3CY3 A;  3KRR A;  4GL9 A;  2PSQ A;  2ERZ E;  3ORP A;  4G1W A;  4M97 A;  2BZK B;  4QMV A;  4W9X A;  5I3R A;  5JH6 A;  2X2L A;  4RZV A;  3SDJ A;  3RK5 A;  2A27 A;  3RVG A;  2YM7 A;  3JR1 A;  2YHV A;  2R3J A;  4YJV A;  4DLI A;  2BFY A;  3GNI B;  4K1B A;  5BVK A;  4S34 A;  4CTB A;  4ZTR A;  5IEY A;  3DKO A;  1NVR A;  3GCU A;  4ZP5 A;  2XCK A;  2QU5 A;  4ZOG A;  1NXK A;  4LMU A;  4O0U A;  4E4L A;  3HV5 A;  4AFE A;  2WPA A;  4AF3 A;  4ZK5 A;  2BVA A;  2XJ0 A;  2EVA A;  4ZJJ A;  3L8S A;  3F5X A;  3FLN C;  4CMO A;  4FYO A;  3H0Z A;  1KOA A;  2OFV A;  1PJK A;  4CFX A;  1BX6 A;  1TQM A;  5KBR A;  2QI8 A;  3I5N A;  5A4L A;  3R7Y A;  4YNO A;  4L3P A;  4PTG A;  4FOC A;  4U9A A;  2CCH A;  4C2V A;  4E6D A;  5M4F A;  5CSX A;  2BTR A;  2YJS A;  4OT5 A;  4D4V A;  3EFJ A;  2NO3 A;  2G1T A;  4N0S A;  5IG1 A;  3F2A A;  2I0Y A;  2VTA A;  2IVS A;  3GBZ A;  4JDJ A;  4O7S A;  2X4Z A;  4APC A;  3Q04 A;  2JBO A;  5E8Y A;  4YR8 A;  1J1C A;  4DTA A;  3H9O A;  2WMB A;  1QPC A;  3TZM A;  3IW4 A;  3VRZ A;  3U9N A;  4C0T A;  2J9M A;  3FMK A;  3ZDI A;  4AGU A;  2F9G A;  3VUI A;  3OHT A;  3CTH A;  2WTV A;  2G2H A;  2BAK A;  2X7G A;  3P7A A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 3COI A;  2IZS A;  3Q6W A;  2BIL B;  3ZXT A;  4LQM A;  4OAU C;  1MQ4 A;  4OTQ A;  1OMW A;  2CCI A;  2XKF A;  4HCU A;  5EYK A;  2NNW B;  4RWJ A;  5BYL A;  2NPQ A;  3GEQ A;  2JII A;  5TF9 A;  5DA3 A;  4F6W A;  4H3P A;  3IDP A;  5M51 A;  2NRU A;  1OIR A;  3PPJ A;  4JVG A;  5CI7 A;  4ACC A;  3H0Y A;  1JSV A;  4WKQ A;  4IWO A;  1MRV A;  3ENM A;  4FG9 A;  4EUU A;  5HBJ A;  3TEI A;  3PLS A;  3SX9 A;  4BGG A;  4XRJ A;  3UYT A;  2F7E E;  4EOK A;  2A98 A;  5KMO A;  4E93 A;  3NRM A;  4FG8 A;  2JDS A;  4FOD A;  2P4I A;  3MDY A;  3IW8 A;  2VTH A;  1Q8U A;  3OT8 A;  4DFY A;  3N4V A;  4TY1 A;  4EH5 A;  4D2R A;  1JKL A;  1VJY A;  4DGL C;  4O86 A;  4TWP A;  4IB3 A;  1NA7 A;  4X6R A;  3DLS A;  2Q83 A;  4D1S A;  5H8E A;  1BL7 A;  1Q24 A;  5CEI A;  4XX9 A;  3BZ3 A;  4FSZ A;  3W0N A;  4QPM A;  5HTB A;  2V62 A;  4TN6 A;  4J53 A;  3W2Q A;  3BX5 A;  4FII A;  5E90 A;  2EXC X;  4JRV A;  2C3L A;  3L8V A;  4F09 A;  4FZ7 A;  2ZV9 A;  3KY2 A;  1H1S A;  1YHW A;  2X0G A;  3POO A;  2YDJ A;  2J0M B;  4XG3 A;  3RPR A;  4AW2 A; 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