1LEWA

Crystal structure of map kinase p38 complexed to the docking site on its nuclear substrate mef2a
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
350
structure length
341
Chain Sequence
RPTFYRQELNKTIWEVPERYQNLSPVGSGAYGSVCAAFDTKTGHRVAVKKLSRPFQSIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADLNNIVKCQKLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDCELKILDFGLARVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDHIDQLKLILRLVGTPGAELLKKISSESARNYIQSLAQMPKMNFANVFIGANPLAVDLLEKMLVLDSDKRITAAQALAHAYFAQYHDPDDEPVADPYDQSFESRDLLIDEWKSLTYDEVISFVPPPLD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of MAP kinase p38 complexed to the docking sites on its nuclear substrate MEF2A and activator MKK3b.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase 14
molecule tags Transferase
source organism Mus musculus
total genus 107
structure length 341
sequence length 350
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2002-04-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1lewA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1lewA01
3UQGA 2QU5A 2ZM3A 3NUPA 4FKQA 5DI1A 1GZNA 2OIQA 5M06A 4DYMA 3P7BA 5I0BA 4ZTQA 2W4JA 3QGWA 3NEWA 4YJNA 2GHMA 2C0TA 4KINA 4RVKA 5ANKA 4AWIA 4ITJA 3TV4A 3VNTA 2UW7A 1WBWA 2JLDA 2VTIA 1SVGA 2ZV8A 4YLKA 4O0YA 3QZHA 2QOBA 2JFMA 4QP4A 4X21A 4BDFA 4UX9A 3LXPA 4QMVA 4S30A 2R3OA 2FH9A 4QP3A 2IZSA 2VTNA 2F7ZE 4I0TA 1F5QA 2HXLA 5CZHA 5DT4A 4BWKA 3KRRA 3QQGA 3FI8A 4IC8A 3OFMA 2GTMA 3E8EA 3F66A 3ZHPC 5HE2A 4BTMA 4DTKA 4IWPA 4U41A 5KBRA 1JSTA 2QOLA 4YJOA 1O6KA 3UVPA 4GFOA 3KRXA 4J1RA 4O1OA 3IDBA 2BILB 3QQHA 4UMRA 4RWLA 5A54A 1J7UA 3DBFA 3LCDA 2XNPA 4AGDA 3D5VA 2P4IA 4IHPA 4USFA 3F3UA 3QL8A 4J99A 3ZO4A 2BIKB 4IM0A 4FODA 3ROYA 3UZTA 4W9WA 3P08A 2GNFA 5LCKA 3EJ1A 3FLNC 3LM5A 3DLZA 2P2IA 2UZLA 3Q3BA 5FEEA 4BKYA 2WMSA 1OKYA 2IW6A 4H39A 4AXAA 5HD4A 4DT9A 4CV9A 5J1VA 5M56A 4ZXTA 3L8XA 2WXVA 3Q5ZA 5GJFA 2E9VA 3W1FA 4FGRA 5CAPA 3AMYA 4G3EA 4YP8A 4BCIA 4D58A 1FGIA 4MH7A 1YXUA 2CN8A 1RJBA 4PQNA 5IA5A 5J8IA 3ENHA 4WNOA 3ATSA 3G51A 4I23A 1QPDA 4JQEA 5E8TA 3MB7A 5IQCA 4V05A 4HCTA 4XX9A 4Z55A 5BVDA 4FIJA 4GJ3A 4C3PA 4QQTA 3P23A 2CGXA 3VQHA 4MBJA 1XH5A 3QCQA 4BTJA 4APCA 3ZDIA 2YM7A 3FQEA 2YIQA 3GC0A 4TPTA 5DWRA 4YZCA 1MRYA 3HECA 3ZBFA 4I3ZA 3V8SA 3ZLXA 1Q61A 2OBJA 3ZTXA 3RAWA 5B2MA 3LW0A 2BAJA 4C57A 5BVOA 5FDPA 4H3QA 2QR7A 4FBXA 4IM3A 4P5QA 3SHEA 3DLSA 3U9NA 3VQUA 4B9DA 2XH5A 3DNDA 4MXXA 3NIZA 5KMKA 3CTQA 4FTLA 5EKOA 3LFSA 4EH2A 5LVLA 3I0OA 3W2CA 4GIHA 4BRXA 2BDWA 5AUTA 5IISA 3NCZA 5AM6A 3QU0A 1FVRA 2YDIA 4EKLA 2FB8A 2FGIA 5HX6A 5CU2A 1J7LA 2ZAZA 3O2MA 3O50A 4O0VA 3PVWA 1WBVA 3UOJA 4V01A 3EZRA 2QKRA 4CEGA 3UOLA 3BV2A 3E7OA 2FSMX 2OXDA 4Q9SA 2HCKA 5LVNA 2BDJA 2X1NA 3R1QA 3QUPA 2J2IB 3L9LA 3COIA 3LFEA 4TNBA 5T6KA 3FLWA 1H8FA 4CT2A 4FTJA 4QMWA 2WTDA 3CJGA 4QMUA 2PUUA 2W0JA 3TV6A 4BTKA 1VEBA 3I5NA 5KCVA 3BQRA 4W8DA 5J7HA 4AZFA 4MXCA 4RPVA 5AAFA 1SVEA 4YZNA 1YKRA 5DG5A 2GQRA 3DV3A 1UU3A 5ICPA 4Y46A 5L2WA 3NVMB 3I79A 4FKVA 4GG7A 2ERZE 3I0QA 4M8TA 4HCVA 5AR3A 1FVTA 3PE2A 4ID7A 3KXGA 4PDOA 3CPCA 2ZDUA 4DG3E 4QYYA 4YPSA 2GFCA 2ETMA 4YHFA 1Q4LA 1Q41A 3A4PA 3MIAA 4GFMA 4IVBA 3ZS5A 4D2SA 4I4EA 4X7QA 2YA9A 1IA9A 5IUGA 4EHZA 2R3RA 3I7BA 2VTHA 2W05A 5DFPA 3VUGA 3G6HA 3F5PA 3O8UA 1PMNA 4O7ZA 4LOOA 5DBXA 5BX0A 4IX5A 1ZMWA 4UN0C 5M53A 4KWPA 1XHAA 4NU1A 5KBQA 2CN5A 1ZYLA 1R3CA 4JOAA 4BC6A 1Q8YA 3OMVA 1XH4A 2XVDA 4FZDB 4C58A 1ZY5A 2Z7LA 4XCUA 1PY5A 2XIRA 1Q5KA 3GGFA 4GK4A 4LV5A 5HOAA 3VS5A 4EH8A 3F7ZA 3LXLA 3EQGA 3IG7A 4EZ5A 4FEXA 1XH7A 4U0IA 4ASZA 3ALNA 2JIIA 2IW8A 1KWPA 3B8QA 2JFLA 3VBYA 4JXFA 3D94A 4BYIA 3GCSA 3QLGA 2ACXA 5DEYA 3H10A 1GOLA 4AE6A 5AV0A 1NXKA 4QMQA 1OI9A 4ASEA 5A4EA 2JDVA 2Q83A 3V3VA 3IQ7A 5DA3A 3BLRA 3F5GA 5H2UA 4HYSA 3GU5A 4L68A 3R8UA 2PULA 1OIQA 5IMEA 3NAXA 3TCPA 3UVQA 2OGVA 2CCIA 2XK9A 3R71A 4WRGA 4E26A 4E20A 4EOLA 2W4OA 4RBLA 3KVWA 4WUNA 2QURA 2VX0A 4F63A 5HIEA 4WG5A 2ESMA 2PVJA 3FJQE 4X2GA 3NYOA 5HTCA 4IACA 5HHWA 3VW6A 4AOTA 4MXAA 2WEVA 5A6NA 3VF8A 3F6XA 4O7WA 5E8XA 4UZHA 3ACJA 4I24A 5F1ZA 2W7XA 3GB2A 2XK4A 1LR4A 2R3MA 3HX4A 5FBOA 4C4JA 3QTWA 4DLJA 2OWBA 5HVJA 2Z02A 5M44A 4PDYA 4E4NA 3OT8A 2VGPA 5L2TA 4RGJA 2W9ZB 4L52A 5AUYA 2JDOA 3P5KA 3MB6A 4TW9A 5EYKA 3FEGA 1OKVA 4G6OA 4M12A 2X4FA 4JQ8A 1ZZLA 4D9TA 4PDPA 4I5CA 3NIEA 2A2AA 2I0VA 4NM3A 3U4UA 2WTJA 2XF0A 2PVLA 2E9UA 3I81A 3TWJA 2F7EE 3EL7A 3QRUA 3UIXA 4A9SA 3LMIA 5EM6A 2UW0A 3R6XA 4JQ7A 1J3HA 5CU3A 2HZ0A 4QMLA 4KKGA 3WIGA 2KULA 2WTKB 3R8PA 4CXAA 1OZ1A 1S9JA 4EL9A 4K33A 4IMYA 5C4KA 2A0CX 4BI2A 4F9YA 2WB8A 3R8MA 3NW7A 4RX5A 1JSUA 1PYEA 3FMKA 3CD8A 3IOKA 4RZVA 1NT2A 4X2NA 3DDQA 4P5ZA 4R7IA 3A8XA 5L8KA 4WBOA 3QTUA 4YR8A 4IW0A 3KB7A 3KXMA 1IA8A 2HWOA 2ITVA 3ORPA 5T68A 1JVPP 1T45A 4FIHA 2HAKA 3R73A 3S95A 1G5SA 5DRBA 3QC4A 3AD5A 4NH1A 3QX4A 3U6JA 4MNEA 2HY0A 3FMJA 2C1AA 3G2FA 1MRVA 5I5ZA 4QYGA 3FKLA 4MBIA 4FSZA 3LAUA 4I6QA 4QNAA 4XUFA 2VN9A 5AUVA 1K2PA 4QPMA 4PPCA 5ETIA 4AOJA 1M2PA 2I7QA 5IQIA 4N57A 5CX9A 3AC2A 3KL8A 3QTRA 5DR2A 4QQJA 3HAVA 2UZVA 4GU6A 4QMNA 5CF5A 1O6YA 3T3UA 1M2RA 4W8EA 3CY3A 5EM8A 4EC8A 3BIZA 3H9RA 2UW4A 2VTMA 4L8MA 3EQFA 5GJGA 3UPXA 5EW3A 2BALA 3GUBA 5D11A 4CMTA 5CI7A 3LPBA 3ZRKA 4ANOA 3GQIA 1KV2A 4F7NA 3KU2A 3LXNA 4FUYA 3OWPA 4DAWA 3ANRA 3TG1A 3PA4A 1JWHA 4O7LA 4J98A 2Z7QA 4AW5A 4F6WA 3PRIA 3HAMA 4WKQA 4MYGA 3F3ZA 5HO8A 2XBJA 4WNMA 3CR0A 5CSXA 2OXXA 3KMUA 4JX7A 3U51A 5J9LA 2W96B 3KF7A 3HUCA 3KULA 3V5JA 1CKPA 5E90A 4JT3A 4Y95A 5CT7A 2OSCA 3VUDA 5A14A 2XBAA 4XRLA 3IDPA 2VWYA 3EH9A 4YC8A 4ZTMA 3OWLA 4IAZA 4IFGA 2YIWA 3PJ3A 3NSZA 5CVGA 1YWNA 3LZBA 5ANJA 3BBTB 4K18A 3QF9A 3ZUTA 3KRWA 4P4CA 1XH9A 3RK9A 2BKZA 4FYNA 2ZMDA 5AP2A 5K5NA 4BIBA 1ZY4A 2X8EA 3DTCA 3E3PA 4A07A 3SGCA 4ZSLA 4Q5HA 4EH7A 3KN5A 4G31A 3RWPA 4AT4A 2AC5A 2WQEA 3GU4A 4RJ8A 2QONA 5J1WA 3BHVA 5DR9A 2C5VA 1MQBA 2GNGA 3G9NA 3OCBA 4ERKA 4JBQA 3PG3A 3BBWA 3C0GA 4MF0A 4C4EA 3B2WA 4F9BA 3D2KA 1F3MC 5BMSA 1WAKA 5BMMA 2G2HA 2VTTA 4H1JA 4NJDA 4CKRA 4YC3A 2VWZA 4FV6A 2VZ6A 3LFDA 4QTCA 4C3FA 3GCVA 3FMLA 3CGOA 3HP2A 3TXOA 4AW1A 3JS2A 1CKJA 4NKSA 4I6BA 5A4LA 1HCKA 1YOJA 3MTLA 3QTXA 4ZY4A 5GNKA 3GT8A 5HU9A 2IWIA 4KA3A 3FXZA 4CFWA 2WU7A 4HYHA 3DK3A 4A9RA 1W98A 4EYMA 5CXZA 4GKHA 2VO0A 3I60A 2EXEA 1B39A 1JLUE 4ZK5A 4BIEA 4FNWA 1ZWSA 4MQ1A 3EFKA 2IN6A 2R2PA 3O0GA 3QQFA 4FL1A 3P1AA 2JAMA 4RWKA 4V0GA 2OICA 3HMOA 3UYTA 1H27A 4XG8A 3AT3A 2UZBA 3C4ZA 1FMKA 3LCTA 3IKAA 4A4LA 2HZNA 3Q6UA 5K5XA 4FEVA 4OW8A 3O51A 5E9EA 1Q8UA 3CGFA 3G5DA 1Z57A 3MVHA 3IGGA 4KIKA 3SAYA 3CC6A 3PJ8A 3QQUA 3UZRA 3TACA 3FC2A 3NW5A 2GCDA 2CHLA 4Y5HA 3OW3A 1E1VA 3RCJA 3F3VA 4MNEB 2UZEA 4YJRA 5HX8A 3OF0A 3LQ5A 4O84A 4BCKA 3DT1A 3FDNA 5FP5A 3COMA 2V7AA 1WBTA 5CTPA 5J9YA 4EOPA 3W16A 4G3DA 4FI1A 3RK7A 4PY1A 4B0GA 2ITUA 5AEPA 4R78A 4LG4A 4QO9A 2VTQA 2J51A 2R9SA 2VX3A 4IB3A 2B0QA 4GS6A 3QA0A 4FKPA 5I3RA 3ODZX 4AZTA 2W99B 3RAKA 1OBGA 3RVGA 2ONLC 3POZA 4FT9A 2VO3A 3MH1A 4UB7A 5IUHA 3HVCA 1DI8A 3FPQA 5K4IA 3WE4A 3I4BA 4HNFA 4NFMA 1MQ4A 3D15A 4O22A 5HI2A 2WMQA 1XBBA 3IW8A 4O81A 4DEAA 3CS9A 3VBQA 5DR6A 3H9OA 4FZ6A 3C0HA 4FVQA 5CEKA 1BI7A 2UZNA 4BCGA 4LMNA 4S31A 4BDJA 5BUIA 2UVZA 4QPSA 3UYSA 3T3VA 4U97A 4BDIA 4OAVB 4WT6A 4JG6A 2V62A 3QYWA 2X4ZA 4EK6A 5E8WA 2OJIA 2B54A 4QMMA 4YJVA 3ZCLA 1GY3A 4RIOA 2R0IA 3TIZA 4NJ3A 3QBNA 4XV9A 4WOVA 3TJDA 3KULB 1M2QA 3PVUA 5B2KA 5IZFA 5J9ZA 4YJPA 1A48A 1F0QA 5CSWA 3GBZA 2WIPA 2CNUA 3FBVA 4ZLOA 3PSBA 5E4HA 1ZMVA 3SA0A 2BROA 3P79A 1ZOGA 3KREA 4XV2A 3Q32A 3R02A 4FV7A 2OU7A 4U80A 4W4YA 3VAPA 4F7SA 3GU8A 5AV2A 4GG5A 3ZMMA 4PMSA 4C59A 5KO1A 4UYAA 2WMAA 4QP2A 4AACA 1ZAOA 3OOMA 3GCUA 2IVUA 4E93A 2R4BA 3FI2A 2IJMA 3KMWA 4H1MA 5AJQA 4HVGA 5C8KA 3U6IA 2OLCA 4FL2A 2E9OA 2PVNA 5J87A 2YM3A 2YM4A 3OWKA 1GIJA 4F0FA 3FV8A 2QHNA 4QT1A 3LJ0A 1GJOA 1YWRA 2WOUA 4NT4A 4PNIA 2QG7A 4R3PA 3MY1A 3DKOA 4L45A 3RAHA 2JC6A 5EDQA 3ZC6A 5AWMA 3II5A 3LFQA 4J8MA 4I5HA 4M69A 4QMTA 2QNJA 5D1JA 3EN9A 5EI8A 4I6HA 3S2PA 4CV8A 2SRCA 4YTIA 5DN3A 2BRNA 3Q9WA 3AMAA 2OH0E 4D4RA 5HE3A 4FV1A 3DXPA 4NWMA 3Q2MA 5HD7A 5CF4A 4RMZA 2QOQA 2VTAA 4EOOA 4HGLA 3R8VA 4BDKA 3LQ8A 3OTVA 3BI6A 3ORXA 2XUUA 5GJDA 2J0IA 4O6EA 2GFSA 3G9LX 4S32A 3GC8A 1FVVA 4RX8A 4EC9A 5JGDA 4N70A 5C8MA 4DEHA 2Y9QA 3GI3A 4IIRA 4M97A 4XEYA 5AP5A 3MFSA 3QQLA 4JR3A 3NW6A 4V0GB 2XNOA 3O7LB 2J4ZA 4ASXA 5L6OA 5L2QA 4BDEA 5D12A 3W2QA 1UWJA 3ZSGA 3EWHA 3DQXA 5DLSA 2CNVA 5GHVA 4USEA 4FKOA 4FF8A 3DZQA 4EYJA 2WQMA 2NP8A 4FMQA 3DB8A 3FLSA 3W8LA 2YIXA 1JKTA 3AT2A 4KIKB 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4TND A;  4LRK A;  4L00 A;  4E5B A;  5CT0 A;  4R7B A;  4OTQ A;  5DH3 A;  1ST4 A;  3TDV A;  4ACG A;  3NLB A;  4R5Y A;  3KA0 A;  2HY8 1;  2XCH A;  4Q9Z A;  4IC7 A;  5GZA A;  3NGA A;  4DFZ E;  5KMJ A;  3LCS A;  4ZS0 A;  4X3F A;  5FED A;  4P7E A;  3R00 A;  3COH A;  3ZM9 A;  3UVR A;  2X2K A;  2CGW A;  3NNU A;  4FKR A;  4MQ2 A;  2W1C A;  5IQG A;  4TYH B;  1WMK A;  3SV0 A;  4F4P A;  4TTH B;  1E9H A;  2J6M A;  3EQR A;  4MD8 E;  4OTP A;  1Y91 A;  3C4C A;  3FZT A;  3PP1 A;  3Q9Y A;  1G8A A;  2BKK A;  2ZM4 A;  3NVK I;  4E1Z A;  3KXX A;  1PXN A;  4WG3 A;  2XEZ A;  3FKO A;  3P86 A;  4GMY A;  2DWB A;  3UOK A;  3VUL A;  5CF8 A;  5M07 A;  4G3G A;  4ITI A;  3PYY A;  5CSV A;  5CVH A;  3SW7 A;  4DHJ A;  5LAR A;  4FL3 A;  5CI6 A;  2XKF A;  4YBJ A;  1I09 A;  3C51 A;  1RDQ E;  4UZD A;  5HVY A;  3ZH8 A;  3HV7 A;  5C03 A;  5AND A;  3QAL E;  2IF8 A;  5EG3 A;  1ND4 A;  3ZSH A;  4F7J A;  2W1D A;  3U8W A;  3C5I A;  1GAG A;  4X0M A;  5HEZ A;  4E6A A;  2JIV A;  2VGO A;  5L2I A;  5L4Q A;  4GYI A;  3QC9 A;  4HYU A;  2E2B A; 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