1LEWA

Crystal structure of map kinase p38 complexed to the docking site on its nuclear substrate mef2a
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
350
structure length
341
Chain Sequence
RPTFYRQELNKTIWEVPERYQNLSPVGSGAYGSVCAAFDTKTGHRVAVKKLSRPFQSIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADLNNIVKCQKLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDCELKILDFGLARVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDHIDQLKLILRLVGTPGAELLKKISSESARNYIQSLAQMPKMNFANVFIGANPLAVDLLEKMLVLDSDKRITAAQALAHAYFAQYHDPDDEPVADPYDQSFESRDLLIDEWKSLTYDEVISFVPPPLD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Mus musculus
publication title Crystal structures of MAP kinase p38 complexed to the docking sites on its nuclear substrate MEF2A and activator MKK3b.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase 14
total genus 107
structure length 341
sequence length 350
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2002-04-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1lewA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1lewA01
3BU6A 3PRIA 2YAAA 3M1SA 4LRMA 4GV1A 2ZM1A 5KKRC 2PE1A 4O82A 4TN6A 1OL2A 3EN7A 3GB2A 3WZUA 3D2KA 3WIKA 2YWVA 1OGUA 3GI3A 3LHJA 5A14A 4IM3A 4ALUA 2CKOA 1YDRE 4DEBA 2XVDA 1W82A 2XK8A 4X2NA 4BFMA 3PJCA 4RLLA 2G15A 2R3RA 3HV3A 3TN8A 1SM2A 2XYNA 2WEIA 5D7AA 2X7OA 2AC3A 3OBJA 5DRDA 4AGCA 4AS0A 2JDTA 2IJMA 3PJ3A 3MSSA 4PTGA 2V7AA 4QYGA 3PIZA 4W4YA 3NYOA 4X2JA 4S33A 2C5VA 4KIKB 2Y6MA 4E6DA 4RJ7A 4XOYA 5KHXA 3R63A 4YR8A 3OT8A 1DI8A 1XH5A 4I22A 4PRJA 4XX9A 4O7LA 4CYIA 3HX4A 1TVOA 1T45A 2BMCA 4WG3A 2BAKA 1KE8A 2HY81 1GIIA 3EJ1A 4I5HA 4FT0A 4BKYA 2WU7A 3ATTA 3N9XA 4D2PA 4UWYA 1YXVA 4WG5A 3IW6A 3ZTXA 4D58A 4DGMA 4E26A 2UZOA 3PLAE 1Y91A 3F66A 5AP5A 3UBDA 2JAMA 2BHHA 5CEOA 5EYDA 5LCKA 2ACXA 1HCKA 1H1PA 3FMLA 4FL1A 3TACA 4FTCA 3OWJA 1R3CA 4ZY5A 4MXXA 4MYGA 4N6ZA 5EKOA 3ZLWA 2QKRA 3LZBA 2YIWA 2WTVA 2V55A 2WU6A 2W1ZA 3H30A 3FLYA 3NUYA 4MXAA 3UOJA 4H3QA 3R7OA 3NW5A 5HTCA 1FQ1B 4S2ZA 3OCGA 4MBJA 3OEFX 4D5KA 2GFCA 4WBOA 4CSVA 5CXZA 1E9HA 3FEGA 5CEQA 3CKXA 1YDSE 3KXGA 4EL9A 2QO2A 5CAVA 4DFUA 2EWAA 5ANDA 2GTMA 4IZAA 4KIPA 1Q62A 3F6XA 3LFNA 4NFNA 4P4CA 1KSWA 1DM2A 2AYPA 2YCRA 5TE0A 4DYMA 4ALWA 4WO5A 3FE3A 3FWQA 5JH6A 1JKKA 4BF2A 4PPCA 1B38A 4G16A 3QCSA 4D1SA 3KU2A 5AJQA 4ZTMA 2PVFA 3PIXA 3KRRA 4WA9A 4ITJA 2JKQA 3QC9A 2VTOA 3BHHA 4J97A 3F88A 4MF1A 4EHZA 4CT2A 3IW8A 2FGIA 4G3DA 5HCZA 4ERWA 4QMQA 2PUNA 3NX8A 4BDIA 3BV3A 3BWJA 4O81A 2A27A 2J2IB 1JSVA 2WMBA 5LWNA 5HE2A 5EDQA 1F3MC 2VX1A 4GMYA 3GCPA 4FKUA 2BAQA 4BN1A 4D2WA 1UWJA 2BKZA 5AR4A 3FZSA 5HE1A 2UV2A 4FTIA 4OR5A 4R3RA 4GG7A 4GKHA 3OXZA 4M97A 4DEEA 3ZM9A 5T3QA 4ZY4A 3ACJA 3R71A 4GUEA 4G2FA 4L68A 4FNZA 4ARKA 2F49A 1MRUA 3DQXA 4RIXB 4MXCA 4FKPA 5BVEA 3LFQA 4JS8A 4JNWA 3UPXA 4CLJA 1YOJA 4L9IA 4NFMA 2J0JA 5JKGA 5E90A 4XG4A 4J95A 2QOLA 4CFMA 5AP0A 1QPEA 1ZARA 3I1AA 2GCDA 4DH1A 5CALA 4E93A 5CSVA 4L44A 4OTQA 4EOKA 2FSLX 3KC3A 4DLJA 3SDJA 4EZ3A 2W1FA 3DKGA 2V5QA 4PP7A 1YI4A 2YM3A 4FTRA 5IKWA 4EQMA 3TDWA 3A8WA 1FOTA 4FV1A 3QTWA 4R1VA 3E7OA 3ZZEA 5CASA 3EQIA 3O23A 5IEXA 3BYUA 3D0EA 4ANNA 2GS6A 4HYIA 2BRGA 2VX0A 1VYWA 3PE1A 4OGRA 4UYAA 2HIWA 4C38A 5DBXA 3W8LA 2OBJA 4XG6A 3PXYA 4J99A 2GSFA 2DS1A 4GFMA 1CKPA 2XRWA 3DTWA 5DYJA 2XNBA 3HRFA 5JZJA 5IF1A 3ZLXA 3F7WA 3NNVA 3QA8A 4A4LA 2CGWA 4IC8A 2YIXA 4LFIA 2VO7A 4IANA 2H8HA 4QP8A 2UW0A 5HLPA 4BDBA 2P33A 5IQEA 2VTJA 3BU5A 3IG7A 3LCSA 3CY3A 3ORPA 3C50A 3VS2A 5DR2A 4R7BA 1S9JA 2BHEA 4F1MA 3D94A 4MWHA 4C2WA 5JFXA 3TI1A 1AGWA 1YW2A 1ZZ2A 2XEZA 2HY0A 5FEEA 2B53A 1JKTA 5IQIA 3F2NA 5GJGA 3NMUF 4PL3A 4FSNA 2PUUA 4ZTHA 4EC8A 4YTHA 4GL9A 3BKBA 4DLIA 4BCHA 4JQEA 4LGGA 2C47A 3BIZA 3E3PA 4FZFB 4WOVA 4ZSAA 4FZAB 3PTGA 2YITA 2BILB 4U80A 5GJFA 3D14A 3MBLA 2WMVA 4CTCA 4F0FA 2DUVA 5DH3A 2OSCA 3A4OX 3A4PA 2R3QA 2IW9A 4QQJA 3EYHA 4E4NA 3EQBA 3NDMA 5CZIA 1OBGA 3UO6A 3BQCA 1P4OA 4GIHA 4GVAA 4MBIA 3I81A 4BBEA 3CS9A 4BCIA 2ZMCA 3WF9A 2HZIA 4KIKA 3NEWA 4NIFB 3PXFA 5L8JA 4AOJA 4RIYB 5TOZA 4YBKA 3R7VA 1IEPA 3ORTA 4FZ6A 4FSWA 2WQMA 5ACBC 4FV6A 4ZTSA 4IDTA 3BPRA 3QLFA 4PWNA 3F5GA 3RNYA 4BCQA 2V0DA 3VUHA 2OFVA 4ASXA 1OITA 2HELA 3IKAA 3HUBA 3VRZA 4ENYA 3GU6A 3LCDA 4QNYA 1XJDA 3F82A 5AIKA 3G9LX 4FUXA 3K5UA 2WKMA 1BKXA 1ND4A 1V1KA 3MJ2A 3TG1A 3MH0A 4YZNA 5JZNA 4DC2A 5LJJA 2GS7A 4USEA 1M14A 1W7HA 3QD0A 3A7IA 3W2OA 5BVDA 1V0OA 3G6HA 2PVLA 3DNEA 5JN2A 5HKMA 3SG9A 3ZZWA 5CWZA 5DT3A 2I0HA 1TKIA 3KXZA 5DEYA 4DFXE 3FL4A 3EN9A 1UV5A 1PYXA 4FNXA 2IG7A 3DBQA 3ZYAA 3LJ1A 3R1QA 3H10A 3DCVA 2PVJA 2Y7JA 3U54A 5T68A 2ZB1A 2C6LA 3FHIA 4I5PA 3AD6A 3VULA 4O7ZA 3ODZX 3KF4A 1T46A 4OT6A 3AC8A 3UP7A 4ANLA 1VEBA 3IW4A 3UZRA 5HIDA 1PXPA 1ZOGA 2CHLA 2UZDA 3UC3A 5HU9A 3EFKA 3C5UA 1A48A 2RFSA 4EK4A 1YHSA 4V04A 4UMPA 2HWPA 3U4UA 4FIFA 4O21A 5HQ0A 3KVXA 3OT3A 4ZMEA 5KO1A 3RCJA 4ACMA 4AZSA 1YVJA 4L43A 4B6LA 1ZYCA 2G2IA 3ORZA 4XG2A 2NP8A 4ZAUA 2JC6A 2PVHA 3FMEA 4EK3A 2UW5A 5KUPA 4E6AA 4FVRA 4FV9A 3COHA 3P7BA 4CZYB 5AA8A 3FZRA 3DLSA 1EH4A 5AFVA 3ZO2A 4O0VA 5CSHA 3V5LA 3LFEA 3H0YA 4K33A 2ZOQA 4IAKA 5EOBA 2YHVA 2BKKA 5KMKA 2VNWA 1OUYA 4JAIA 1A06A 4CYJA 3FHRA 2X39A 3V04A 3NR9A 5ANJA 4X2GA 5EM7A 3PJ2A 1FPUA 3W55A 2W9ZB 3D5VA 5KZ0A 4O7YA 3DDPA 2C6OA 4JAJA 2GQSA 3DA6A 4BCKA 2VZ6A 2X8DA 4Q5EA 3RZBA 3W16A 3NYNA 4TYIA 4EHGA 3KRWA 3RAWA 5IDPA 3H3CA 3S1HA 3FJQE 4IJ9A 1IA9A 2OICA 2WXVA 4K18A 4FNYA 2OFUA 5DPVA 5EM8A 5AX3A 5C1QB 5KMIA 4IAYA 4KAOA 5FRIA 4BGHA 4DFYA 1J1BA 5CU2A 2WTCA 3POOA 4GW8A 4FOBA 4KRCA 4ACGA 5EI8A 4MQ1A 4M7IA 4D4RA 4M12A 3R9OA 2BFXA 4CVAA 2VTQA 3VBYA 3VQUA 3L9NA 3O96A 5KCVA 3VHKA 1Y6AA 3Q6WA 4YZBA 3QXOA 2R3GA 4FSZA 4BC6A 4BCNA 4MAOA 5L8KA 4GK2A 2QVSE 2G9XA 5HLWA 4D5HA 1O6YA 3EHAA 4IWOA 4PPAA 5CQUA 2W17A 4CCBA 3FC2A 4G5JA 3LM0A 4GK4A 1QPCA 3LFSA 1H1RA 1OKZA 3C5IA 2G2HA 3KF7A 4OTHA 4FR4A 5HZNA 1PYEA 3ORIA 1ZWSA 2VO6A 3WE4A 3DB8A 3CQUA 5K5XA 5IH5A 4FKOA 5E92A 3EQPA 5L2SA 4K6ZA 2RFEA 5FGKA 2B9IA 4L7FA 2JKKA 2W5BA 3BZ3A 3VC4A 4RG0A 1SVEA 5LCJA 2WOUA 2YERA 1H24A 2ITPA 2OXDA 3A61A 4I92A 4AQCA 4BICA 3F2RA 3VS6A 1W98A 1YXTA 2VRXA 3HMOA 4KS7A 4MHAA 4D0WA 5JEBA 4OTDA 4YJNA 4QMTA 3TEIA 2FSMX 2ITVA 3FPMA 3KULB 2I40A 5CT7A 2ZYBA 4EKLA 5EQYA 4H05A 2OIBA 2WMAA 5G6VA 3P4KA 4A9YA 4Y72A 3UYSA 3CD8A 4GU6A 2IVVA 2VO3A 2CKEA 4F9CA 3FXWA 2XIYA 4NEUA 2XJ1A 4XLIA 3DFAA 3S95A 3UIUA 1H0VA 3QC4A 4I93A 3NZ0A 4QP1A 4CRSA 4M14A 4S34A 4NIFA 5CF6A 3EKNA 2Q83A 4RJ6A 4FKRA 2QCSA 4XBRA 4I5MA 1JKSA 5ACKA 4RZVA 2Z8CA 1NW1A 5IA0A 5J95A 1OIRA 1H8FA 2VNYA 3P08A 4TNDA 4QTDA 3BLRA 1W0XC 2R5TA 2XMYA 3WF8A 5CEIA 2RG6A 2FH9A 4EH4A 4DH5A 4F6UA 2PPQA 4KS8A 3Q5ZA 4PTEA 4EORA 2WTJA 2WB8A 4KWPA 5JQ5A 4MXYA 4YJUA 2IZSA 4L45A 4V01A 5EKNA 3IQ7A 3ITZA 4DEGA 5BMSA 2PMOX 3WI6A 1H27A 3R7YA 4XV1A 4F63A 3G33A 5A6NA 3ID6C 2GTNA 2QLQA 3MJ1A 4HYHA 3C13A 4U40A 3GCVA 3R1SA 1OMWA 3LAUA 1IRKA 4HVHA 3VAPA 5DR6A 3G15A 5GIOE 2QOIA 3Q9YA 4V0GA 3GC7A 1ZYJA 4O0XA 4BI2A 3GCSA 2BFYA 4QYHA 5LXMA 4BI1A 3UIBA 4IX4A 1NVQA 3ZUUA 3OD6X 2IZTA 3ORMA 4FICA 1UNLA 3CQEA 5K5NA 1W84A 1FMOE 3NUXA 3OY1A 5B2MA 3A60A 4NCTA 4YSMA 1WBSA 2I0EA 4NJ3A 1PKDA 2RL5A 3O7LD 4U8ZA 2HENA 3AC5A 5E8UA 4OTWA 4QOXA 4NCTC 4LG4A 4F9AA 3NW6A 2CLQA 4C4FA 1JSUA 4QP2A 5AR2A 5F1ZA 1ZRZA 3DJ7A 3ZSIA 4ITIA 3Q4ZA 4WBBB 4BDHA 2IVSA 4HGEA 5A4QA 3Q3BA 4UXLA 3GCQA 1H1WA 5E8VA 5IQGA 2W7XA 4ZLYA 4FKIA 3HNGA 3ANRA 1IAHA 1NY3A 4FKLA 5IDNA 4W8DA 3FI3A 2A1AB 3NUNA 1YHVA 3KFAA 4QP4A 4CFNA 2O2UA 3NNUA 3FLNC 1W8CA 3M2WA 3PXKA 2GMXA 3V5PA 3ZLSA 3Q52A 4NW6A 2R3HA 4MK0A 2FB8A 3RTPA 3UIMA 2C5YA 2WTIA 3FMJA 3RINA 4FKSA 5LVOA 3SQQA 4YURA 4FIEA 5DEWA 3GU8A 5AP3A 4AW0A 3I79A 1IASA 3JPVA 2ZJWA 4OBPA 5HVKA 3QRKA 3D9VA 4EH7A 5BUIA 3F9NA 5BYLA 4EK5A 2CN5A 2OZAB 5HU3A 4AW5A 4U79A 5HO8A 5LMBA 5JRSA 3NWWA 4BDAA 4NUSA 3DKOA 4CG8A 1H08A 1O9UA 4S30A 4DEIA 4OUCA 4EEVA 1PKGA 1OIQA 1YOLA 1KE7A 4QQTA 4WNOA 4E6CA 5CF5A 2CGVA 2CCIA 4FT5A 3F69A 4QMXA 3Q2JA 4XRJA 3FSFA 5A54A 2JD5A 2ZM4A 3MTFA 3MH2A 4YNEA 3VQHA 4QYFA 5J79A 4GKIA 3TZ9A 4UBAA 4BKZA 4BIDA 2OG8A 3AT3A 4ANOA 3KGAA 4FYOA 3F5UA 4I20A 5AUTA 4DCEA 4O7NA 3EQRA 1JKLA 3R04A 4TTHB 1PXKA 1YXUA 2P3GX 2WTWA 3QZIA 4KINA 4OW8A 2P2HA 2ITQA 2XCKA 5E8ZA 1STCE 1XBAA 2B55A 3KXNA 3OCSA 4FTUA 4IZ7A 4D4VA 3LXKA 1YDTE 2YIQA 3MVHA 3OXIA 4R3PA 4PQNA 2JFLA 2OW3A 4CQEA 4F9WA 4DGOA 4C3PA 3KMWA 3CTQA 2UZEA 3TNPC 2QD9A 3V5WA 3FUPA 4PDSA 3EN6A 4Y83A 4DA5A 2QONA 4RX5A 3LLTA 4BWPA 1VR2A 4QQCA 2IZRA 2GHMA 3TTIA 2X4FA 4LRJA 3FY0A 2RG5A 1OBDA 4IQ6A 2REIA 3K5VA 3QCXA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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