3O7LD

Crystal structure of phospholamban (1-19):pka c-subunit:amp-pnp:mg2+ complex
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
338
structure length
333
Chain Sequence
ESVKEFLAKAKEDFLKKWETPSQNTAQLDQFDRIKTLGTGSFGRVMLVKHKESGNHYAMKILDKQKVVKLKQIEHTLNEKRILQAVNFPFLVKLEFSFKDNSNLYMVMEYVAGGEMFSHLRRIGRFSEPHARFYAAQIVLTFEYLHSLDLIYRDLKPENLLIDQQGYIQVTDFGFAKRVKGRTWLCGTPEYLAPEIILSKGYNKAVDWWALGVLIYEMAAGYPPFFADQPIQIYEKIVSGKVRFPSHFSSDLKDLLRNLLQVDLTKRFGNLKNGVNDIKNHKWFATTDWIAIYQRKVEAPFIPKPGDTSNFDDYEEEEIRVINEKCGKEFTEF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Dynamics connect substrate recognition to catalysis in protein kinase A.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Mus musculus
molecule keywords cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit alpha
total genus 88
structure length 333
sequence length 338
ec nomenclature ec 2.7.11.11: cAMP-dependent protein kinase.
pdb deposition date 2010-07-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
D PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3o7lD01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3o7lD02
4K9YA 5CVFA 4S30A 4N4SA 3O7LB 4QYEA 3QTUA 4XV9A 4E93A 1F0QA 2J0IA 2O64A 1OGUA 3BLHA 4EK5A 1QL6A 4NIFA 1QPDA 2QG7A 2IZSA 5GIPE 3RP9A 4GT5A 5M57A 2I0HA 4J96A 4RIXA 4DE4A 2YM5A 3W18A 3BV3A 4C62A 3V5WA 2ZV9A 3ZLYA 4FZ7A 2W9FB 4AU8A 4HVIA 4RG0A 4X2JA 4FR4A 1JWHA 4MCVA 4DEGA 4ZLYA 3VS6A 3ODZX 5AADA 5M4FA 3QQFA 3QXOA 5CS6A 5FQDC 3D94A 3ENHA 2XRUA 3QU0A 3T3VA 4OAUC 4EKKA 3UYSA 1VEBA 4AOTA 2W06A 3ZBXA 3DBQA 4QTEA 4TYEA 2OLCA 1Y8YA 1YI6A 3BBWA 5DR2A 4BTMA 5BX0A 2JIIA 2GMXA 5E4HA 3L9LA 4O1OA 4BDEA 4NJDA 3NWWA 2YISA 5AP2A 3TIZA 4BICA 3PA3A 2H8HA 3UC4A 1TQPA 3BLRA 2GHLA 3EOCA 5HESA 3ZCLA 2XJ1A 5GJGA 4PMSA 4DLIA 4H58A 2JKKA 4FICA 4FTIA 3DJ7A 2XYUA 3BIZA 4FKTA 4FSYA 4K6ZA 2X6DA 3AGLA 1TVOA 4J97A 3E93A 4ZMFA 3D0EA 4GJ2A 4IB3A 4KSPA 4KS7A 1RDQE 5D7VA 2PULA 4YPDA 4WO5A 3A4OX 3VUDA 3E62A 4F99A 2BRNA 2XK7A 4IAAA 2PUPA 4U3ZA 5E8UA 1V0BA 4JBVA 2PZ5A 2UZDA 4K1BA 4UZHA 4WBBB 4NFMA 3PSDA 3TEIA 3BEAA 1XH4A 4V05A 3F82A 3ROYA 4TZRA 1H25A 3OWJA 2UW4A 5CNOA 3QXPA 4DGLC 4E20A 3ZUTA 3OP5A 4C35A 2E9VA 3F2NA 4A9RA 4MWIA 3BGPA 5BVNA 3JYAA 2HZ0A 3VBQA 4RA5A 4YLLA 4D4RA 1ZZ2A 2W1CA 3MY1A 4W9WA 4JG8A 3LJ2A 5EYMA 4FVPA 4EH8A 3EB0A 3F5UA 4L9IA 2QOFA 5DGZA 3FLQA 5BVWA 4CVAA 5I5ZA 3CJGA 5AR4A 3UZRA 4D55A 3KRXA 3VNTA 4EOMA 1SYKA 1UKHA 2GS6A 4FGBA 5HICA 5JQ5A 3VUGA 2QG5A 5HE1A 4AA0A 3OWPA 3LCTA 4LL5A 4RIWB 1XH7A 5CANA 3QKLA 2CNQA 2BAJA 1LEZA 3FXWA 2XP2A 3FZPA 3FC1X 4YC6A 5FGKA 1PY5A 1KOAA 5CEIA 4R3PA 1FVVA 5KMJA 3O50A 4M0YA 3A7FA 3TKHA 3Q5IA 5JRQA 1IRKA 2CPKE 5CEMA 4TNDA 3AC5A 4QQTA 4EOLA 5EDRA 2JDOA 4BI1A 4NKAA 2VX3A 5I3OA 2GHMA 3BPRA 3GC9A 3I6UA 3ZEPA 4AT5A 4O83A 3OVVA 4IANA 1XBCA 3EMGA 2GHGA 4QTDA 3A7IA 3R9NA 4DH1A 2C6TA 2R3LA 4FL2A 4WG5A 5HTCA 3NUUA 5C4LA 2BHEA 2VWVA 3W1FA 2E9PA 3WZDA 5ANKA 4AFEA 3ERKA 1B38A 3R6XA 4CTBA 3LFDA 4G17A 1R0EA 4ASZA 2WB8A 3KRRA 3V6SA 3OT3A 3R71A 4CNHA 4F0FA 4O7VA 5L6OA 2WTDA 3SA0A 5HVJA 3DKOA 3Q4ZA 3UQGA 2JIVA 4YJOA 3MFSA 2QOLA 4RX5A 2JDRA 3PJ1A 4DG3E 2SRCA 2J0MB 3P23A 4Y73A 3NUXA 4O7TA 3QUPA 2C3KA 3FI3A 4MH7A 5DR6A 4WSQA 1K3AA 4YU2A 2Z7LA 3FMNA 4Y46A 2R3NA 1KE9A 3I81A 2UW0A 5IG1A 3FBVA 3KK8A 2PTKA 2QKWB 1H1WA 2IW6A 2EVAA 3OY3A 5E92A 1OBDA 1H00A 3SRVB 4RJ6A 5AV0A 4AGUA 1IA9A 1FVRA 2PVKA 5EDPA 4A4XA 2VO3A 4XEYA 2YIXA 5EG3A 2R0IA 3CSVA 4XH6A 4ZK5A 4C8BA 4AAAA 3V5LA 1U54B 4ALUA 4H1MA 4FTNA 2JKOA 3PXRA 1I09A 2CMWA 1Q41A 4XUFA 3WOWA 3FWQA 1U5RA 3R28A 1R3CA 4DA5A 3MDYA 4GT3A 1K9AA 4FZAB 4MBIA 1P2AA 5DH3A 1ZYCA 3PLAE 2QHMA 2GU8A 3PE2A 4G3DA 4JVGA 3LCDA 4C2WA 3DV3A 1M7QA 3AMBA 3BBTB 4WT6A 4QNYA 3M11A 5L4QA 3L8PA 2HZ4A 4IM0A 4YP8A 3ZLWA 2YLFA 5IU2A 4YHJA 4YC3A 2YM6A 2XJ2A 4PMTA 5E8VA 3A4PA 3LXLA 3U9NA 3AC8A 3C4WA 3WF5A 4LV8A 2WOTA 3PPJA 5ANJA 3UNJA 4MWHA 3UIMA 2HXLA 3AT3A 4QP9A 3SOAA 4LRJA 5KKRC 4EH2A 4FX3A 3AXWA 4BZNA 2WMSA 4CD0A 4RX7A 1M2QA 1J3HA 2QCSA 2XB7A 3E8NA 3IW8A 3A99A 3R0TA 4L52A 4QYYA 1L3RE 1M14A 2J90A 1NT2A 3IDPA 5EHOA 4RVLA 4O0TA 4X3FC 2X39A 4JDJA 2VX1A 3DBFA 3W16A 3COMA 3PA4A 3NS9A 3E7VA 3OEFX 5AM6A 3KGAA 5FP6A 4U41A 4NU1A 2BRMA 3GU7A 3JS2A 1Q62A 4LFIA 2WMVA 2VO0A 4CFVA 5ANDA 5EM6A 5IDPA 4HCUA 3UNKA 3C0IA 4QP2A 4XOZA 5CASA 5CX9A 3MB6A 4F9WA 3FL5A 4NYEA 4I92A 4M8TA 4EOOA 1YXXA 3RNYA 1YVJA 4BGQA 5F94A 4F0IA 4F9YA 1XWSA 2WTIA 4BZDA 5M44A 5M4IA 4M97A 3KF4A 1WMKA 5B7VA 4PPCA 3DFAA 4IVBA 1OIQA 3MIAA 1R39A 2NRYA 3MH0A 4WNKA 5F1ZA 3OTUA 4KWPA 4U79A 4W4VA 5HG9A 2Z7SA 3OCBA 3VQHA 4ACDA 5LWNA 4AGWA 1JNKA 2REIA 2WMUA 4PL3A 1H0WA 4HPUE 1Q99A 5K5XA 3CCNA 3FMHA 3UO6A 3ZXTA 1IR3A 3C4FA 1YXUA 2R3RA 2C0OA 5EHLA 4UEUA 4K8AA 4E5BA 4FNYA 4FI1A 4AGDA 3LM5A 3PZHA 4Y85A 4YJQA 1LR4A 3SG8A 4DEIA 3NGAA 1H1RA 2CLXA 2G01A 2YIQA 4OTDA 5CXHA 2PHKA 5LARA 4L7SA 3OW4A 3IOKA 5K4IA 3LPBA 3IW7A 4UBAA 2RKUA 3BU6A 2IZRA 3CGFA 1E1XA 2V22A 3GCQA 5A6OA 2PVLA 4YO6A 3TNHA 5IQHA 2UZOA 4FZFB 4AZVA 4FEXA 4BVUA 5ANGA 4A9YA 3ZTXA 2ZVAA 3K54A 4FKLA 3FMEA 3MB7A 3FUPA 2FO0A 3G9NA 3HVCA 3QD4A 4QMMA 3UVRA 4ANNA 4L01A 4HVSA 1UU3A 4ZAUA 2KTYA 4EH5A 3CD8A 4H3PA 2W1DA 4H3BA 4Q5EA 4O27B 5IA1A 3UOKA 4YTCA 4U81A 3EQBA 3QQUA 1KUTA 5HEZA 4XG4A 4RFZA 5TF9A 3RK5A 3EHAA 4RT7A 5A4LA 4IHPA 1GIIA 2QLQA 2UW5A 2UW8A 4IX6A 5F95A 2C3JA 3TV4A 3LAUA 4P5ZA 1H28A 2XIZA 4ALWA 1OKYA 4JBQA 3RAWA 4V0GB 4A9UA 3FZSA 4AE6A 5B0XA 1VZOA 1SMHA 3UG1A 3ZMMA 3N4TA 3P7BA 4JJRA 3MPAA 5HU9A 4PP9A 4FTJA 3U6HA 3HDMA 2W17A 5A6NA 3UP2A 4OAVB 3H0YA 5E1EA 2DWBA 3NUNA 2XEYA 5CYIA 5AFVA 4EWHA 2JKMA 4AACA 5DHJA 5DMZA 2JIUA 4XHKB 5IH6A 4EC8A 4YR8A 2P2HA 3ATTA 2IVVA 2GS7A 4BGGA 3FJQE 2E9NA 2C6LA 4BCPA 5LQFA 4IXPA 3P7CA 5EI8A 3MI9A 4I20A 2GNHA 4LM5A 3RKBA 2HYYA 1PMVA 3IGGA 5AA9A 2OIBA 2WEIA 1TKIA 3LW0A 5B2MA 2HZIA 1JQHA 4UWBA 2I7QA 4KUJA 4AWIA 4H39A 4FA2A 4RWIA 4ZOGA 3NW5A 3D2IA 4MD7E 1JSTA 4O21A 3UQCA 2QKRA 3DBCA 4EK4A 1TQMA 1WFCA 4RGJA 4QMQA 4EK8A 3R8UA 2PVFA 1WZYA 2BAQA 2BILB 4KIKA 4ZP5A 4L68A 3UZPA 4IM3A 4LMUA 3W2SA 3UG2A 2YDIA 3WZEA 4GIIA 4FKRA 4O7WA 2NPQA 4FTLA 4FYOA 3DK3A 4C4JA 5DI1A 5LMAA 3ROCA 1UWJA 1ZYDA 4WUNA 4BCOA 5J7BA 5CAUA 4P2KA 3HAVA 3U55A 3HECA 3UPXA 5KMIA 4AA5A 4CMOA 3N4UA 2OF4A 1BMKA 3QRJA 4YJTA 3OUNB 2R2PA 4G34A 5FEQA 2JBPA 3VS5A 4WSYA 4ZY6A 4YGAA 4APCA 2CJMA 4MXCA 3RPYA 5CSPA 5C1QB 2XK9A 1ZMUA 5CAVA 3LFFA 3R2BA 2H34A 3HRCA 3C7QA 4IZYA 4WA9A 5AX9A 4I5CA 5J1WA 2XVDA 2W1GA 3Q2MA 4DN5A 4XBUA 5IUIA 5C27A 4B9DA 4YURA 3OHTA 4MXOA 4EONA 4CFWA 5M56A 1Z5MA 3RALA 2XNEA 3PPKA 2R3MA 4O91A 3CBLA 4ITHA 3MFUA 4EYJA 4MYGA 2RG6A 3KN5A 3ZZWA 4ZS0A 2XK3A 4FTUA 3MBLA 2W1ZA 1PXIA 2YDJA 3OZ6A 4FODA 4NM0A 4A4LA 3TDWA 2BDWA 3I79A 4AE9A 3TDVA 4GSBA 5FDXA 5G1XA 3KXZA 4LRMA 4L42A 2BCJA 3AT2A 5FDPA 1OVEA 4FSZA 2G2HA 4FBXA 3DU8A 2ZM4A 3RBWA 4EOIA 4XJ0A 2C3LA 4NKSA 3HV5A 3PIYA 4GIHA 2HIWA 3RAIA 4GYIA 4F9CA 3D4QA 3Q3BA 5BMMA 3ANQA 3WIKA 4EI4A 1CTPE 4RWKA 5CZHA 4OUCA 2WTKB 3C5IA 3EQIA 4IWDA 4BZOA 4FKPA 4QP8A 4CRSA 3PSCA 2X9FA 4O96A 4ZTNA 1OIYA 2YIYA 3IS5A 3VUIA 3MESA 2XIRA 4UALA 3RM6A 5EOLA 1OPJA 3POZA 5HNBA 2QOBA 2I1MA 4PF4A 4JS8A 3Q52A 4FV6A 4NTSA 3OY1A 1SM2A 3HRFA 3A8WA 4RIYB 3RCDA 1YI3A 4D5KA 4FGRA 2YAKA 3B8RA 4E6CA 4RC2A 4N0SA 2QR8A 2EB2A 4WOVA 3NCGA 3BHYA 4J52A 4AW5A 4U0IA 1B6CB 4G3EA 2OXYA 3UTOA 4ZJIA 4FTOA 5GNKA 2ITQA 5HGIA 4GK3A 5KZIA 3T9IA 3SX9A 2AYPA 4DEDA 3R7EA 4ORKA 2E9OA 4V01A 3REPA 4EL9A 5BVFA 4PUZA 3SXSA 3AC1A 4ENXA 4B4LA 3TTIA 2J7TA 5GZ9A 2FVDA 2X7OA 4TL0A 3M1SA 4YTHA 4CYJA 5BUJA 3UZTA 3L9MA 2IWIA 4O82A 1J1CA 4IC7A 4EBVA 3LXNA 3C51A 2W0JA 2VZ6A 4BBMA 2C6IA 2CGVA 3BYOA 2QI8A 4KIOA 2VN9A 4L43A 2X2KA 3KRJA 2OWBA 3ZM4A 4AOIA 4EZ5A 1I44A 3ZC5A 2QD9A 3NYXA 4E6QA 4D4SA 4IVCA 1Q24A 3R30A 4OTPA 4AW0A 4RIOA 4HNFA 4IDTA 3KU2A 4HCVA 5JSMA 3ORPA 2P3GX 2V7OA 1WBPA 4O38A 2WIHA 3K5VA 3MSSA 4R5SA 2Y6OA 2G9XA 4IJPA 4QMUA 4DAWA 5CENA 1WVYA 2B55A 3MH3A 2ONLC 5BUIA 3FI2A 4GV1A 1JBPE 3D5XA 4OTFA 4FV2A 1M17A 4LOPA 4P7EA 2RIOA 4M67A 5IH4A 1BL6A 4ZTSA 4MNFA 5JMSA 3VS0A 3AQVA 3MA3A 3UE4A 4IACA 5L6WL 4U9AA 3TNPC 2B53A 4HVDA 1KE5A 4BY9E 2XEZA 3PE1A 4O0UA 4W9XA 4OTGA 3VUMA 5FBOA 4E7WA 4MTAA 4L67A 4M69B 3R00A 4RVTA 3CP9A 2F7ZE 4BHNA 5H3QA 4JRVA 4U43A 3TNIA 2BRGA 4NM3A 5EW3A 1JPAA 4FVRA 4ACMA 4BKYA 4JAJA 3E3PA 1J7UA 4DG2E 3ZONA 2CSNA 1BKXA 4WRGA 1ERKA 4G1WA 4FTRA 4XG2A 5J1VA 4WG3A 4IAKA 3VBYA 5IEXA 3KRWA 5LJJA 3OW3A 4GT4A 3TZ9A 3UIUA 4RA4A 3TNQB 5CXZA 3D5VA 2QO2A 2CN5A 3JY9A 4QMWA 3KXGA 3DJ6A 4O2ZA 3NRMA 3OUKA 3S2PA 4BWPA 5JT2A 4DH5A 1VYZA 3RPOA 1OIRA 3JY0A 4D2VA 4ZS4A 3QL8A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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