4C35A

Pka-s6k1 chimera with compound 1 (nu1085) bound
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
340
structure length
337
Chain Sequence
EQESVKEFLAKAKEDFLKKWENPAQNTAHLDQFERIKTLGTGSYGRVMLVKHMETGNHYAMKILDKQKVVKLKQIEHTLNEKRILQAVNFPFLVKLEFSFKDNSNLYMVLEYLPGGEMFSHLRRIGRFEPHARFYAAQIVLTFEYLHSLDLIYRDLKPENLMIDQQGYIKVTDFGFAKRVKGRTWLCGTPEYLAPEIILSKGYNKAVDWWALGVLIYEMAAGYPPFFADQPIQIYEKIVSGKVRFPSHFSSDLKDLLRNLLQVDLTKRFGNLKNGVNDIKNHKWFATTDWIAIYQRKVEAPFIPKFKGPGDTSNFDDYEEEEIRVINEKCGKEFSEF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase/inhibitor
molecule keywords CAMP-DEPENDENT PROTEIN KINASE CATALYTIC SUBUNIT ALPHA
publication title The Discovery of Potent Ribosomal S6 Kinase Inhibitors by High-Throughput Screening and Structure-Guided Drug Design.
pubmed rcsb
source organism Bos taurus
total genus 107
structure length 337
sequence length 340
ec nomenclature ec 2.7.11.11: cAMP-dependent protein kinase.
pdb deposition date 2013-08-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4c35A01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4c35A02
5FEEA 2X81A 2ZV9A 3LFFA 4F9AA 5M56A 4I5PA 4F09A 5J5TA 3QXPA 3BWFA 3E87A 3BV2A 3AC8A 1ZY5A 2YCQA 4TYJA 3EL8A 1H1RA 2YAKA 3FMNA 3RPOA 5GZAA 3PWDA 5CF6A 4X3FA 1QPEA 2BDFA 5IKWA 5LWNA 3SAYA 3ETAA 1W82A 3LFCA 4L9IA 5TT7A 4DG0E 2ZM1A 3DZQA 3EKKA 4WRGA 4NTSA 3AD6A 1KE5A 4XEYA 2JBPA 3E88A 3CS9A 1PXJA 4FSYA 3ZUUA 3OEFX 3JS2A 3TTJA 5IQEA 4BY9E 5EKOA 1E1VA 2PTKA 2PYWA 2LGCA 3IW4A 2YEXA 4LOOA 1WVWA 5DR6A 4M66A 3WOWA 4ANQA 5LQFA 1V1KA 4Y5HA 3TG1A 4IQ6A 2W4KA 4KIKB 3NEWA 4ENYA 4BBMA 4DLIA 2X39A 5G6VA 4C37A 2WOUA 2BCJA 2HWPA 3QF9A 4H3QA 3FYKX 3R7GA 1T45A 3E7OA 4NW5A 4D2PA 4WRSA 3ZEWA 2YITA 4C2WA 3VBQA 4FKQA 4AE6A 3VUGA 4F08A 4CRSA 5K0KA 4DA5A 4D4VA 3BQCA 3QGYA 4X2FA 2ZYBA 4HGTA 1U46A 3R9HA 1PW2A 3DXNA 4W4XA 1CSNA 3UYSA 2JKOA 1Z5MA 2V0DA 3DJ7A 3D7ZA 3KMMA 5JQ8A 2C6EA 4RJ3A 5KKRB 3EHAA 3OY3A 4Y95A 4F70A 3PJ3A 4K11A 4U6RA 4Y73A 5J87A 3NYNA 3GNIB 4I5HA 5AUZA 4A4OA 3N9XA 3SGCA 5KMJA 2ITZA 4GT3A 2XNNA 4QP2A 4X2GA 2PUNA 4A9YA 5EI8A 3QUEA 4EOIA 2R3KA 3LM0A 1K2PA 3DKCA 3OXTA 4MXZA 3VRZA 3UO4A 5HESA 2F49A 4O7TA 2X2MA 5DOSA 3FI2A 5L6PA 4D1ZA 3BGQA 4BICA 1B39A 2PMOX 3CJFA 4OW8A 4TXCA 2RG5A 4YJNA 5ANDA 2OJ9A 4RIXB 4ZSJA 4LL0A 4BHNA 2PVRA 5M53A 4I23A 5T68A 3BBTB 1XH5A 5CENA 4R3CA 3ZU7A 4LYNA 4BL1A 5T3QA 5EI6A 4X6QC 4B7TA 4FVQA 3BZ3A 3HP2A 4XBRA 3ZLSA 5ETFA 4R6VA 5E1EA 4ZSEA 5AAEA 3ZM4A 3QU0A 5CU3A 2W5HA 4ASDA 3C51A 3A8WA 3GFEA 2OG8A 4JRVA 5HVYA 4QP9A 4JX3A 3ZFXA 1KSWA 3O8TA 4FEUA 5I4NA 2FB8A 1YXXA 3KULA 5FM2A 4RIWB 3OTVA 2F7XE 3IQ7A 3QZFA 2C68A 2WIHA 1Q8TA 2FO0A 4YPDA 5EYCA 5C8NA 4BDJA 5KHWA 2OJIA 5HQ0A 2WMSA 3PUPA 1UV5A 3KRLA 4IHPA 5E92A 3KVWA 2NO3A 2XCKA 3BELA 2WMXA 3HMOA 2A1AB 4F9BA 3COIA 4XOYA 3G0FA 3CBLA 3ELJA 4X3FB 4A4LA 4M12A 3FE3A 4M97A 2ZVAA 1FOTA 1JPAA 1SM2A 1ZXEA 4NJ3A 3S00A 3IG7A 3LFSA 2CKOA 1OKWA 4DG3E 3H3CA 1YWRA 2VU3A 1FINA 2UW5A 3IOKA 2NNWB 4AA0A 4C4HA 4FT5A 3JYAA 5D12A 4DEEA 4I0RA 3DQXA 4FV4A 5JFVA 3GC7A 1H1WA 4I5CA 4PL5A 5AR5A 5C9CA 4M8TA 1G8AA 3O96A 2C3KA 4I3ZA 4ZTSA 4ZSGA 3BU5A 3F7WA 2LAVA 2R64A 4NFMA 3ALOA 4QMWA 3W2QA 2C6MA 3Q60A 3U6IA 4RWIA 3ULZA 4MCVA 4G3FA 2G2FA 3UODA 3AGMA 3W33A 3AMAA 3MA6A 4ACHA 1KE7A 2WO6A 2YA9A 3VW6A 3ZUVA 3WF6A 2R0IA 4OTFA 4BRXA 1IRKA 3ORTA 3EN5A 3FZPA 3C9WA 4R1YA 2IVUA 1UU9A 3MY5A 4MQ2A 4RRVA 5CU2A 3FZTA 4JL9A 3UE4A 5C1QB 5LJJA 4F0IA 4GKHA 4BKZA 3GOPA 5JK3A 5DGZA 3OC1A 3FMJA 3IECA 4HVGA 2WQEA 4Y83A 2XYUA 4DBNA 3P1AA 3QZHA 2W1ZA 4FV7A 4YC3A 2PVNA 4CQEA 3EN4A 5CAQA 5IMEA 4ORKA 5J1VA 4NTTA 5EM6A 3IW8A 1PYXA 5KE0A 5L8KA 3UZTA 3U55A 3G6HA 4FSWA 2H34A 4S34A 3PP1A 2HY0A 4BFMA 3U51A 1LUFA 3OW4A 4EH2A 2Y8OA 3QTUA 4FNZA 3SG8A 1M17A 3NWWA 3OFMA 3QLFA 4HGEA 4YZMA 3R9DA 4EEVA 4CKJA 2XKEA 2ACXA 2C5NA 5HG9A 4QTBA 2BFXA 3NUYA 4DEAA 1S9IA 3EIDA 1ZARA 3ORXA 4FIGA 3MN3A 4FKVA 4JVGA 4QP3A 3VBYA 3IK3A 2OICA 5B0XA 4RX8A 1UWJA 5HNGA 4CXAA 3LQ8A 4XS2A 1NXKA 3R7IA 4WBOA 1JNKA 3BYSA 4PWNA 2OF2A 5HLWA 2I7QA 3LMHA 4G17A 4DEBA 4YSMA 2PPQA 3BPRA 3NUSA 3QD3A 3SOAA 3VBTA 4PL3A 5FWKK 2Y4IC 2IWIA 5DRBA 1KE9A 3P7BA 3I7BA 3V5LA 4C59A 5CU0A 1R0PA 3PXKA 3DDPA 5HE0A 3QXOA 4MX9A 3A61A 5KMNA 2GS7A 4FZ6A 4LRMA 1IA8A 4J96A 2GCDA 2G1TA 1OL2A 3G2FA 4BTKA 1UNGA 4V0GA 5DE2A 5EHYA 1VYWA 3D5UA 1G8SA 4J1RA 4NW6A 3P78A 4FZAB 4TYIA 5CASA 2WQNA 3D94A 3F2NA 5H3QA 4ZY5A 4AT4A 4QP4A 1RW8A 3P5KA 2P4IA 3E8DA 3QUPA 5CS6A 3V6SA 5AX9A 3BHYA 4L3PA 3V8SA 4FBXA 1YQJA 3GCVA 4FNYA 4MQ1A 3EQFA 3LAUA 3PA3A 2ZDTA 3LLAA 2YISA 1Q61A 4FV2A 4G3CA 4M14A 5HHWA 4BC6A 1ZYLA 3F9NA 2GNGA 4CZYB 4BF2A 5JFWA 4GG7A 2XK6A 4D2VA 2AUHA 3L9LA 4KSPA 4IACA 3EN6A 4DGNA 4KS8A 3MY0A 4K8AA 5FBNC 5BVKA 4LI5A 2OKRA 1BL7A 1WVXA 5I3RA 5J79A 3MI9A 1G5SA 3RAKA 3IDBA 4DINA 5GNKA 4Y72A 1RQQA 3QC9A 5J9ZA 3GOKA 1SYKA 4IMYA 4B99A 4K77A 2WKMA 2J5FA 4FK3A 4U41A 3RWPA 5IQHA 5AP0A 2WPAA 3PG3A 2O65A 3AMBA 5K9IA 1URWA 2VX0A 2F57A 5EHOA 4D4RA 3B2TA 4K1BA 4YNOA 4HVIA 2HZ4A 1G3NA 4LM5A 4L6QA 1WBNA 4LOQA 5IA5A 4U80A 3MA3A 5A4CA 2BDWA 2CPKE 3A4PA 3QRTA 4QT1A 5AMNA 4RFYA 4FGRA 4FGBA 5AUWA 2XJ2A 5I9YA 4C35A 2R3IA 3QWJA 4OAVB 3KC3A 2O63A 4D5KA 1ZYJA 5DEYA 3G9NA 3JXWA 4FTMA 3UMWA 3FEGA 3ORZA 5LWMA 3RP9A 5AIKA 3ZC5A 5FP5A 3UJGA 3PSCA 2CDZA 4M7IA 1U59A 4MBJA 4EHEA 3DGKA 2X8DA 4Z16A 5L3AA 4CLJA 4A9RA 5H2UA 4AW5A 3TKIA 3KMUA 5JRSA 4AZWA 4TWNA 2G15A 3EN9A 4TZRA 2JKQA 2VTMA 5CNNA 3ZLWA 4HVDA 5M51A 2J0KA 3NIZA 4FOCA 4G2FA 3UVPA 5LCJA 3O71A 4YHFA 2GTMA 3IDCA 5IA3A 2ITNA 5L6OA 3E8NA 1L8TA 4M69B 4KKHA 2QI8A 3ENHA 2VTJA 4OTPA 3DS6A 4D0XA 4XV2A 5A54A 2RFEA 4G5JA 3VUKA 3QRIA 3HV3A 5E91A 3F6XA 4IM3A 5GZ9A 3QX2A 2WTDA 1M2RA 4D2RA 5CF8A 5J7HA 4ID7A 4X2NA 2QNJA 1MP8A 4UEUA 3ATSA 5IUGA 1OKVA 2XNPA 3AC3A 4HYSA 5AAFA 3ZDIA 5CI6A 2PUPA 3O23A 4FA2A 3HA6A 4XRLA 4BZDA 3KK9A 3DB8A 4PP7A 4QTEA 4CZTA 4V0GB 3MH1A 1GZOA 4BI0A 4MD7E 4RWJA 5M4UA 2XBJA 2C4GA 3R83A 3H10A 4IZ5A 3R7OA 2CHLA 5FG8A 5DVRA 4NCTA 3HA8A 2C0TA 1SNUA 3FL5A 4IAAA 3UPXA 1MRVA 1W7HA 3JY0A 1PXNA 1GJOA 1PMEA 2V7AA 4RVMA 4DEHA 4H39A 4F99A 4H58A 3MB7A 5JSMA 3RAWA 4O2PA 5CEQA 4J98A 4D0WA 3TJCA 1LP4A 3PJCA 2W9ZB 2XB7A 2GNJA 3SQQA 2J6MA 3UGCA 4H36A 5DEWA 3WYXA 4K9YA 3QA0A 2H96A 5E8WA 3QTIA 1WMKA 2PUUA 3H30A 3FLYA 2XVDA 4OT6A 3EOCA 3FKLA 3REPA 4J8NA 3FWQA 2WGJA 2C3JA 4E93A 2QVSE 3L8PA 4BDBA 2W4OA 3PFQA 4FEQA 3Q5IA 4AE9A 1YWVA 2QR7A 4QNYA 4RT7A 4QMSA 4RZWA 1XBCA 4UY9A 4ZEGA 3C0GA 4PQNA 2GQSA 3ZHPC 4ZTLA 2BTRA 4DGMA 5IF1A 4DF3A 1OIUA 2BFYA 4TYEA 2CN5A 2R3PA 3SW4A 4DG2E 4MBIA 3T9IA 4ZOGA 3F69A 4IB0A 5TO8A 4AXAA 2BRGA 3MYGA 3OOMA 4EQUA 2REIA 1P2AA 4XH6A 1KOAA 3Q9XA 4TT7A 3OOGA 4C3PA 4O84A 4ERKA 2QONA 4IDTA 4UB7A 4IC8A 3DAEA 3RAHA 5L2IA 4FI1A 3QBNA 1Q62A 2GFSA 4XMOA 3QYZA 3PIYA 3MESA 1R78A 5AUUA 3MVHA 4APPA 4EJNA 4ZXTA 5HZNA 2GNIA 4I93A 1A9UA 4B4LA 3NPCA 5FXRA 2EU9A 3DNEA 5L2TA 2WIPA 2CKEA 2I0EA 4WNKA 5KCVA 5HE3A 4C4JA 4E20A 1JOWB 4BI1A 4ITJA 3OROA 1NT2A 4HZRA 4HGLA 5HI2A 5IG1A 4CYJA 4DT8A 4FE2A 4MEDA 3A99A 4EHGA 3E3PA 3OCTA 4C4IA 3KRWA 3PLAE 5I9ZA 2FSLX 4O38A 2X4ZA 3VBVA 2UZDA 4OTGA 3PPJA 2JDTA 4OLIA 2VNWA 5K3YA 5HLNA 4AN3A 2Q83A 2GFCA 1CKPA 5AIRA 5DH3A 2DQ7X 3PG1A 3TUCA 3NYOA 3DQWA 4WG3A 5JMSA 2XIZA 4RZVA 3FLNC 3QUDA 1NVSA 4RC3A 2VWWA 5AP4A 4U40A 3GU4A 1PHKA 4EYJA 4O7WA 2ONLC 3R8MA 5HU9A 4EBVA 2QCSA 2XZSA 3C4EA 1PY5A 3E64A 2VWVA 1URCA 3KEXA 3BEGA 3GFWA 3DB6A 4YJPA 4F6SA 4O81A 3S3IA 1YHVA 1I09A 3R1QA 5AADA 2O5KA 4WG4A 5JRQA 2C1AA 2VX3A 5I3OA 2JAVA 3R0TA 1BMKA 3FC2A 3AD4A 4B0GA 4BGGA 5E9EA 1VZOA 4WNOA 1FMKA 1Y8GA 4YJSA 2BRHA 1JVPP 4AOJA 4PMMA 3NUPA 4FT0A 3FUPA 2OZAA 4YHTA 4UX9A 4MWHA 4CG9A 3D2KA 2J0MB 4EONA 4TWPA 4BBEA 4KINA 3ZRLA 2OWBA 2E9PA 3LCSA 4AU8A 4ASZA 3EFLA 2E9OA 4KBAA 4AA5A 5HNIX 1Y8YA 2UZOA 3CD8A 4FSTA 5CSPA 1WBVA 1ZOEA 3AT3A 3COKA 2GNLA 4L45A 5AP6A 1DAYA 3HKOA 5FLFA 5IA1A 1ZMVA 3A7GA 4X0MA 3G51A 4DFYA 2R3MA 2XRUA 1JSVA 4GUEA 4QTAA 2OSCA 4M15A 3CQEA 1OITA 4GRBA 3QYWA 4EQMA 4K6ZA 3R73A 5AR8A 3AT4A 5ITAA 2HY81 1JSUA 4QPSA 4L7FA 4OTRA 2W96B 3T3VA 2WD1A 5AWMA 2YZLA 3EFWA 5FXQA 4IJ9A 1TVOA 3GCSA 4YSJA 2R9SA 2YCFA 4FTRA 2DUVA 3DT1A 3MFRA 4EBWA 2WB8A 2XNOA 4JDJA 2OXYA 2PU8A 3C4WA 2XK4A 1PMVA 3MTFA 2EXMA 5AFVA 4P4CA 3BE9A 4NUSA 4BCGA 4KIQA 4UN0C 2QG5A 2F9GA 3MSSA 3NNWA 3AC1A 4DTAA 1YKRA 2OH0E 2V55A 4QQ5A 4FC0A 3S0OA 5L8JA 3RALA 4EOJA 4CCBA 4FSZA 4FEWA 2P33A 3AC2A 4CRLA 3KRJA 3UOLA 4FYNA 3EB0A 4HCVA 2C5YA 4PTEA 2XCHA 2VD5A 5AR7A 2FSTX 3IDPA 4DFLA 5IMXA 2YACA 3DBEA 3KXXA 3UOKA 4I22A 3S4QA 2QKRA 4AZSA 3DJ6A 4USEA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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