3F4RA

Crystal structure of wolbachia pipientis alpha-dsba1
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
199
structure length
199
Chain Sequence
TSNELLLPLPNDKLLGDPKAPILMIEYASLTCYHCSLFHRNVFPKIKEKYIDTGKMLYIFRHFPLDYRGLKAAMLSHCYEKQEDYFNFNKAVFNSIDSWNYYNLSDLTLLQRIAALSNLKQDAFNQCINDKKIMDKIVNDKSLAINKLGITATPIFFIKLNDDKSYIEHNKVKHGGYKELKYFTNVIDKLYGKAIVKLE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural and Functional Characterization of the Oxidoreductase alpha-DsbA1 from Wolbachia pipientis
pubmed doi rcsb
molecule keywords Putative uncharacterized protein
molecule tags Oxidoreductase
source organism Wolbachia pipientis
total genus 76
structure length 199
sequence length 199
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-11-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13462 Thioredoxin_4 Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.40.80 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Ribonucleotide Reductase Protein R1; domain 1 Ribonucleotide Reductase Protein R1; domain 1 3f4rA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3f4rA01
2OBKA 4EC0A 4V1Ag 2RIIA 1EOGA 1J9BA 4JR4A 4KDYA 5GSSA 2LQOA 3C1SA 4F2IA 2KOKA 5HR1A 4JEDA 2K9FA 1LU4A 2LQQA 5HR0A 1HQOA 2AB6A 2CT6A 1U3AA 4EKZA 1M2AA 2F51A 3SWLA 1F37A 2PPTA 2L6CA 1R5AA 1THXA 1F9MA 3KP9A 1EGRA 2JZTA 1GNEA 3VWXA 5DAKA 2H1BA 1DE1A 1PD21 2PERA 5JWRB 4MP4A 1VRSD 4MJEA 5F8BA 2FLSA 2C1YA 2OADA 4F82A 2P5RA 3KTLA 1B9YC 3F4TA 5ABRA 4MMMA 3LYPA 1A8YA 1XFLA 3UARA 2H74A 4OCFA 2L4QA 3ZRDA 3FY7A 1E6BA 3QPMA 2HNLA 3ZMKA 4YAPA 3P7XA 4CHSA 1GSEA 4GTUA 3A2VA 9GSSA 2CAQA 3CYNA 4XS4A 1T3BA 2H1DA 3GNJA 4K0GA 2JZSA 4KW6A 1GSUA 4AJ8A 2DJJA 5F0GA 2AHEA 3TJFA 3F3QA 2GSRA 1T4ZA 4PGTA 4NMUA 3VWVA 2L6DA 3IK9A 2M80A 2KP2A 4K7OA 2GQKA 4GSNA 2DSAA 1JZWA 3GL3A 5ECPB 5EY6A 3HJMA 3GURA 3RBTA 3TKSA 4P3YB 4KAEA 1BAYA 3IK7A 3BJ5A 1EV9A 3CTFA 2HZFA 2H70A 5FT3A 2VOCA 3BD2A 1KEBA 1M0UA 4IELA 4ZBDA 2DJ0A 4XTSA 4PQIA 2YP6A 2RUEA 3FRCA 2FWEA 3GIXA 1NW2A 2CQ9A 2X8HA 3PINA 5IOXA 3IRAA 5IQYA 3I43A 5LD0A 4WEYA 1GTAA 2C4JA 2XC2A 1SYXA 2GSQA 5AIVA 3FKFA 4HEA2 3QR6A 2VLVA 4K2DA 3A3TA 1SK2A 4ZL8A 3UEMA 4WBJA 2GQMA 1QXHA 3MDKA 2FY6A 2GVPA 2F9SA 1T7PB 3C8EA 2OBIA 2LNSA 1IYHA 2YANA 3DWVA 1V58A 2QKEA 4MF5A 4E8EA 3KTBA 5G5FA 3TKSC 3EMXA 2C3TA 2VCZA 20GSA 3UL3A 2FHEA 3C73A 3HKRA 1YF1A 3TB2A 1SK0A 5G5EA 4MPGA 1TXXA 1LJRA 17GSA 1BQ7A 2ZCTA 4I2TA 1M7TA 2XBIA 1XVQA 2CX3A 1FVJA 3IBHA 2AUVA 2IN3A 2YWIA 4EVMA 5CRHA 2X8CA 4MZWA 5C00A 1FHEA 1F2EA 1SKRB 3QFBC 2ON5A 3FYGA 5E59A 3L9UA 4MA9A 4I97A 3DMLA 2E0QA 2HE3A 3HJOA 4MCUA 1GL8A 1U87A 3V1WA 2B1LA 2C0EA 2P5QA 5IPHA 4L5LA 1JLWA 4GSTA 3KD0A 2GT6A 4V2MA 1OC8A 4RI6A 2QC7A 4ILFA 2O85A 2B6MA 3ZFBA 3ZL5A 1O81A 3FZ4A 5DBQA 2MZCA 4EO3A 2H1AA 1RQMA 4Q5FA 2TRCP 3W6GA 2LRNA 3GKNA 3ZTLA 2GT5A 2MMOA 3HZ8A 3D6IA 2DJ1A 5D9WA 2O8VB 1Y25A 4ZILA 2DBCA 3KZQA 2LTKA 4V1Ap 5B7CA 1AUCA 2HYXA 3DKSA 3I69A 4GQCA 2PVQA 2LJKA 4GQFA 5CRGA 3NIVA 4TOPA 2H71A 2H0IA 2JL4A 1Z6MA 1K3OA 3ZMLA 1PKWA 5L71A 1DE2A 3LXZA 1B9XC 3F8UA 1Z5YE 3O3TA 4HDEA 2CZ3A 3D4TA 1KBNA 2O89A 1GLPA 1RW1A 3GMFA 2BTOT 5CRWA 16GSA 1YEPA 1Z3EA 2CVDA 3MWHA 3ZIJA 5ECLB 4WBRD 1F3BA 4LA1A 4ECBA 1ZYEA 1KTEA 2V6KA 2B3SA 4MZBA 2HXKA 5ECNB 2GDRA 2P31A 5AIXA 3CTGA 1K0CA 2L4CA 5EL8A 1BJXA 3P2AA 2H0HA 2DJ2A 2K18A 4CW9A 5JWOB 4DSSB 1XOAA 1WPIA 4NV5A 3FR3A 2B7JA 5ENUA 5JCWA 5ECHB 4TN8A 4TRXA 4FO5A 1GP1A 4F0CA 1EZKA 2ES7A 3HZ4A 1PL2A 2OE0A 4BL7A 5G2ZA 4HUAA 11GSA 5KEJA 4LLRA 2YWOA 4BA7A 4FYCA 4AGSA 3UOMA 1UA5A 2QSIA 4RQRA 4V2NA 1QGVA 3E3EA 5ECRB 3GA4A 4N11A 1A2JA 1K0DA 1QUWA 3H4KA 4O5RA 1PSQA 2A2SA 4WXTA 4Z7XA 5F07A 2H76A 3P8WA 4IQ1A 4WF5A 4KGIA 4G19A 3L9VA 4N0VA 4HS1A 1C72A 5IIZA 4KH7A 3DVXA 3LYKA 4ZL7A 5J41A 3Q19A 3TJGA 1MEKA 4WF4A 1ZZYA 3VK9A 3F6FA 3Q74A 1A0RP 4MF7A 1B48A 3VFIA 3IR4A 5G1LA 1N8JA 3E0UA 5KN2A 5F06A 3TDGA 5IMFA 3A2WA 3ZFLA 1NHYA 2PN8A 2PUKC 1HNCA 1YQ1A 3M0FA 1PN9A 4K8MA 1SJ6A 3KP8A 3VPTA 1J0FA 1VF1A 3IA1A 4POLA 3KEBA 3KM6A 3NZNA 1UN2A 4FIWA 1V98A 3VPQA 4AJ6A 3SBCA 5ELAA 4I8BA 4GXZA 5B8AA 5J9CA 5G30A 5H5QA 1TU8A 2A4VA 4OO5A 4PNFA 3RAZA 2IIYA 3ZVJD 1JZRA 4TVEA 5J4UA 1ST9A 2I9HA 5EPFA 2VLUA 3UVHA 2VCVA 1A2MA 4WKWA 4JU5A 12GSA 2EIQA 3RPPA 4EXJA 4JZQA 4Q5RA 1X9MB 2E7PA 1GTBA 3LG6A 1TOFA 1X5DA 1GSQA 5CO3A 2F3MA 5LCZA 4NHWA 3W8JA 4DSSA 2HLSA 4D73B 5IPGA 1TRSA 2B5XA 5G1KA 1XXUA 2R2JA 2NVLA 2VIMA 1EOHA 2TIRA 1BG5A 1F6MC 2PMTA 4KDUA 5AN1A 3NOFA 3BBYA 3WGDA 3EC3A 5FWGA 2WDUA 4HJMA 4FH8A 4ZB9A 1GLQA 5DQYA 1TDIA 5IMCA 5D9TA 2HT9A 1GRXA 3TKQA 2R6KA 1PMTA 2RLIA 4MK3A 2GSSA 2YWMA 2D2ZA 3DEXA 1U88A 1ABAA 2XPDA 5INYA 3QD9A 2GSTA 1WP0A 3TOTA 3WGXA 4IVFA 3UBLA 1T00A 3DRNA 4TW5A 3IAS2 5GAPD 2B1KA 1TTZA 2CAIA 1ZCPA 1ERVA 5B6NA 4IBPA 2HFDA 5DJLA 3BOAA 3HJPA 5J9BA 2R4VA 1VF2A 1YJ6A 6GSYA 2AAWA 3FK8A 1GUHA 3ZREA 1XOBA 1AQXA 5HFGA 1K0BA 1TW9A 4XHMA 3LWAA 5J5NA 4BWSA 4KE3A 1OC9B 4HOJA 3LGCA 3ED3A 2H1GA 2IMDA 2N5FA 5ECSA 3KH9A 3QAVA 2LSTA 2IMEA 4EF0A 4J57E 4K1FA 1EP7A 2VL9A 2G0FA 3PGTA 1ZYQB 1XBSA 4MPFA 1SJIA 4IP6A 1O8WA 2K6VA 3H8QA 2LEGA 4CDOA 4D73A 1XW5A 2FNOA 1M2DA 2DJ3A 2YNXA 3QFAC 1I5GA 1SL1B 2VAFA 1A8LA 1G6WA 2WS2A 2IWTA 3GYKA 4POKA 4OFMA 1H75A 2CZ2A 3H1NA 3ERWA 2GZZA 1J08A 3OR5A 2PGTA 2LJAA 2PU9C 1FW1A 2YZHA 1QMVA 2WJUA 5HFIA 4FYUA 5IOWA 3LJRA 2FWHA 2YZUA 3FHKA 4OWYA 3WGEA 5C04A 6GSUA 4F03A 4PQHA 1TK8B 5E4WA 2FUG2 4V2LA 2QGVA 3F63A 2VM2A 1YDKA 3WD6A 2JZRA 1EP8A 3BCKA 4MJCA 2REMA 2H6ZA 1V9WA 1G0TA 1XVWA 3CSHA 4YAVA 1TP9A 5ID2B 2NTOA 5D8IA 2DJKA 2KLXA 4MH3A 2VL2A 4NAXA 4ACSA 3UJ1A 1YF0A 3ISOA 1G7EA 2R37A 4L5OA 2J23A 2C0DA 1A0FA 1GTUA 1A2LA 3WT1A 3CSIA 4BVYA 3E9JB 2I1UA 3MAKA 1XW6A 1W4VA 2H19A 3QDNA 4N0ZA 1ML6A 1VGLA 3M1GA 2CA8A 3RPNA 3R2QA 4NV2A 2H6XA 3FEUA 4J56E 1BEDA 4ML6A 2ZUPA 2L59A 5IMAA 2BMXA 2AV4A 4ZIJA 4POBA 1PX7A 4ULXA 1MD4A 4IKHA 1R4WA 4G10A 1OC9A 3FW2A 2J9HA 4MJAA 3Q6OA 3KJYA 5DALB 4EE0A 1R7HA 1Z9HA 4KUNA 3A5WA 3GX8A 5IO0A 1SD9A 3F4RA 1GUMA 5IMVA 4IJIA 2IMFA 3TOUA 1SENA 1FAAA 4LL1B 4EDZA 4OO4A 2DC5A 3BCIA 5D73A 4HQSA 2TRXA 2VL2C 1HNBA 4TR4A 3H93A 2EIOA 1N2AA 3TGZA 1U6TA 4PXOA 1WOUA 1S3DA 1MDIA 4TXVA 4Q5NA 1VF3A 1YKCA 6GSVA 3FZ5A 4YQUA 4MF6A 5G31A 2ON7A 1FB0A 2YWNA 3FZAA 3IAM2 1EV4A 4EUYA 8GSSA 3PR8A 4TKYA 2H01A 19GSA 1WIKA 3ZZXA 1UVZA 4XRAA 2FWGA 3KGKA 4IN0A 1ERTA 3C71A 1T1VA 1NHOA 3TCOA 4F0BA 1WJKA 1GNWA 2L5LA 4ZXGA 4QL9A 4HU9A 1NSWA 1T4YA 2LS5A 2DMMA 5D93A 3LXTA 3UAPA 4PQ1A 2VD1A 5ECOB 1TRWA 3EURA 5A4WA 1QFNA 1GWCA 3GRXA 5ID2A 2L57A 5H5SA 1EWXA 3LSZA 4HQZA 1XCCA 1V40A 4MJBA 14GSA 1EEMA 1XW9A 3ME8A 4ID0A 1EEJA 1M99A 5HR2A 2CV4A 3GV1A 4HI7A 4HU7A 1O73A 4TR3A 3APQA 5DJMA 2F8FA 1SL0B 4I2UA 3M9JA 3TKRA 3GHAA 2VL3A 3C7MA 1X0RA 2DIZA 3EE2A 3MSZA 4WR4A 4QL7A 4OFNA 3ZIVA 5A4VA 3KXOA 3WT2A 3AY8A 5A4UA 4IQAA 4OMVA 4YQMA 2OE3A 4IS0A 2HI7A 5EVOA 2X8GA 4DVCA 3VURA 6GSSA 5ECQB 3LORA 2RM5A 4DSQA 1U3IA 1TRVA 5DALA 1JLVA 1E2YA 3KMNA 5DDLA 1R26A 1GSSA 4H86A 1ILOA 4ZB8A 2GS3A 4ZBAA 3EU3A 3I6AA 3VI7A 3F0IA 2V2GA 5B6MA 5AISA 2MBTA 2LUSA 4MH2A 1OE7A 2HZEB 1XZOA 2OACA 1R5PA 4G9HA 2N5AA 2V32A 2IPAA 5GSTA 3GTUB 7GSSA 2LRTA 4NWYA 1GSYA 4O92A 2LRCA 1TK0B 2KP1A 3ERGA 1ERUA 3J7Yb 4O32A 4XRDA 2K8VA 1S3AA 1HYUA 3LEFA 4PURA 1O7UA 4PX1A 3DD3A 1Z7PA 5F05A 2HSYA 4KDXA 4I5QA 4NHZA 1B8XA 5CYYA 3CRUA 4K7IA 3A2XA 2JSYA 2PBJA 1BYEA 3J7Yk 1G6YA 1RK4A 4EL1A 3EU4A 2JSZA 4XIHA 1DBYA 1UC7A 1YZXA 4GCIA 1JFUA 4HJ2A 1QK8A 3ZYWA 4N30A 1JZOA 2DLXA 3VI5A 2AYTA 2YJHA 1PX6A 2OJLA 4LL4B 1AAZA 3DYRA 4I6XA 4ML1A 1B4PA 1ON4A 3TKSE 1XIYA 4XCSA 3HCZA 4KNDA 1TRUA 1OE8A 2M72A 1MD3A 2LV3A 5DQSA 2VD0A 3IHQA 1PRXA 2VCQA 3IV4A 2G2QA 2V6OA 4JR6A 1ZGNA 4MABA 4ZL9A 2NDOA 4WETA 5KN3A 1BX9A 3GX0A 1PL1A 5ECMB 5CRDA 1O6JA 3MNGA 2H6YA 1AC1A 4GRFA 5IMZA 4OFTA 1YY7A 3G7IA 3U6VA 1K0MA 5COHA 22GSA 2Z9SA 1KNGA 1TI3A 1H4OA 1XWBA 5ECIB 5ECKB 4AJ7A 5B8BA 3S9FA 5CP1A 2HZEA 3HHVA 1XPVA 3ZVJA 3QCPA 4K0NA 5KN1A 3KCMA 4RI7A 3I9V2 3KH7A 4GLTA 1O85A 3GTUA 4PNGA 3PH9A 3FR6A 1LBKA 4IP1A 4LMWA 2HRFA 1FVKA 4KCAA 2HSHA 2JADA 4HZ4A 1T8EB 4OD7A 5AGYA 4L0WA 1YEXA 2CVKA 1PA3A 5D9VA 1USBA 4POMA 5GZZB 3QAWA 1OC3A 2R5GA 1JHBA 3UVTA 3QAGA 3N5OA 6GSXA 3LFLA 4PUFC 2XHFA 1F3AA 4ZB6A 1GTIA 3TUEA 1K3YA 1SJZA 2C80A 2NBSA 3RHBA 4BWQA 2L5OA 1DUGA 5LNKe 4IHUA 2VCTA 1K3LA 3Q18A 1FO5A 3CXGA 1S3CA 1SKSB 1HNAA 3ZITA 4X1UA 3CRTA 3EWLA 2YN1A 2LNTA 2WRTA 2C0FA 2I81A 2O7KA 2E2GA 4YQVA 3GSSA 1YKAA 2IMIA 4E8HA 2VO4A 1AXDA 3O6TA 2EC4A 3GFKA 1FG4A 2F8AA 4QQ7A 4KSOA 3U5RE 1EGOA 1Z6NA 2RUFA 2DIYA 4GF0A 3APSA 2IJYA 1X9WB 4KX4A 1FB6A 1MTCA 3TRQA 5JWQB 3GH6A 1Y6EA 1M9BA 2GZYA 2ALBA 4ECCA 2XBQA 1PQNA 3EVIA 2V41A 2OKAA 3CMIA 3ERFA 2WULA 3HYPA 4OCEA 2I3YA 4LMVA 3GKMA 4Q5QA 4RQXA 2ZNMA 3F6DA 3IE3A 5ELGA 1G7OA 1B4QA 4ISDA 1K0NA 3KMOA 4L0UA 2VLTA 3UIWA 3DXBA 2JU5A 3F4SA 3GKKA 1XWKA 2C3QA 2WGRA 1ERWA 4ZBBA 1FOVA 4DEJA 1SKWB 2FWFA 2H73A 3JCML 2XPEA 1AQWA 3KIJA 2WCIA 5JCUA 3EINA 1M9AA 3FR9A 3TJBA 1SL2B 2YOIA 4TR1B 2GTUA 2C3NA 4KSMA 1ZMAA 2C8UA 2GLRA 2NPBA 4JE1A 1X9SB 3ME7A 1JZDA 2PWJA 2M46A 5CREA 3VLNA 2OE1A 2YV9A 3TRPA 3M3MA 4MZCA 2N5BA 2FGXA 4MDCA 2IL3A 1SU9A 1IYIA 3CBUA 2CX4A 1OKDA 1OKTA 2H75A 5A5KA 2AJQB 2MBSA 4TR0A 3HVXA 1OVNA 4BVXA 2C0GA 4GWRA 3DGQA 4ECIA 3HDCA 3P90A 4XS6A 4YH2A 2LJRA 1SD8A 4AF2A 3D21A 1TJDA 1Z7RA 3GL5A 1ZOFA 1OAZA 1AW9A 3D22A 4NXIA 1CQHA 1GULA 1XWAA 3IOSA 1A24A 4ECJA 4EDYA 3DIEA 2WZ9A 3TKPA 3D4MA 2X99A 3G9BA 1X5EA 5H5RA 4F9ZA 2DMLA 1A23A 1ZL9A 5IMDA 4KCEA 3VWWA 5GAND 5D96A 2EIRA 3HA9A 3UMAA 1AQVA 2R3XA 1I9DA 1NM3A 2WB9A 4K9ZA 3GSTA 1DSBA 3HVSA 4GSSA 3HY2A 4HZ2A 1W89A 4NPBA 2OA7A 5D9XA 3D0ZA 3G7JA 3CSJA 4WR5A 2GGTA 6GSWA 1XWCA 3N9JA 2YCDA 3UBKA 2FCHA 4TXOB 4K7NA 5CAXA 3HD5A 2HRNA 1WWJA 2GZPA 3F3RA 1PGTA 3TRXA 3LQ7A 2H8LA 5CNWA 3IPZA 2MMAA 4FYBA 1GH2A 2IFQB 3D5JA 1Q98A 18GSA 2H0GA 3GH9A 3H79A 2B5YA 2MMZA 3QOUA 2VCXA 1WE0A 3HXSA 3TJKA 5J3RA 1AIUA 4JBBA 1QQ2A 2YV7A 3TJJA 3US3A 3IC4A 5DVBA 3RHCA 1WRYA 1MDKA 4RUVA 4IW9A 4KB3A 2K8SA 1O8XA 4IGJA 1TU7A 3M8NA 5IM9A 4TR1A 4KA0A 5JCGA 2B7KA 2B5EA 3HVVA 3EYTA 1HD2A 4JRRA 2LKUA 10GSA 1TK5B 2V1MA 1WMJA 1CQGA 1K0OA 1GSDA 1M2BA 2PVOC 2E2MA 3L4NA 4XS1A 4MLYA 3IDVA 3GN3A 5IO2A 4X0XA 1URMA 1VF4A 1GUKA 4DSRA 5DAKB 4N10A 2I4AA 4K6XA 3APOA 3G7YA 4L8EA 3ZLPA 3DVWA 3VWUA 2O87A 3L78A 2VM1A 1SYRA 2H66A 2FA4A 2MMNA 1TKDB 1V57A 2BJXA 2FA8A 3RDWA 5KN0A 3W8SA 2X64A 2GQLA 1MDJA 4O7HA 3GUSA 3IXRA 1GSFA 2YJ7A 2FD3A 1X5CA 3C1RA 2A2RA 2WFCA 5HFKA 5DCHA 5FHIA 1V2AA 3GKXA 2H72A 3FZ9A 6GSTA 2CVBA 2IMKA 13GSA 1ACVA 4XS4B 1SK1A 3F9UA 3QMXA 3L0HA 1XWGA 2KHPA 5HR3A 4TXOA 2JACA 3L9SA 5HQPA 4BPYA 1K0AA 4PUAA 1OYJA 1Q4JA 2H30A 2IFQA 3M9KA 4IJ3A 4J2FA 4X43A 3EMPA 2YPMA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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