3F4SA

Crystal structure of wolbachia pipientis alpha-dsba1 t172v
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
sequence length
199
structure length
199
Chain Sequence
TSNELLLPLPNDKLLGDPKAPILMIEYASLTCYHCSLFHRNVFPKIKEKYIDTGKMLYIFRHFPLDYRGLKAAMLSHCYEKQEDYFNFNKAVFNSIDSWNYYNLSDLTLLQRIAALSNLKQDAFNQCINDKKIMDKIVNDKSLAINKLGITAVPIFFIKLNDDKSYIEHNKVKHGGYKELKYFTNVIDKLYGKAIVKLE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural and Functional Characterization of the Oxidoreductase alpha-DsbA1 from Wolbachia pipientis
pubmed doi rcsb
molecule keywords Putative uncharacterized protein
molecule tags Oxidoreductase
source organism Wolbachia pipientis
total genus 74
structure length 199
sequence length 199
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-11-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13462 Thioredoxin_4 Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.40.80 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Ribonucleotide Reductase Protein R1; domain 1 Ribonucleotide Reductase Protein R1; domain 1 3f4sA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3f4sA01
1X9SB 3ZYWA 1ZOFA 2LS5A 4HZ4A 1R4WA 4F03A 3TRXA 1X5DA 2FA4A 3LORA 5H5QA 1JZDA 2K8VA 3KM6A 1QQ2A 1M2AA 2KP2A 3DVWA 2HZEB 4MH2A 3NZNA 4LLRA 1K0BA 5DJLA 1YJ6A 5D96A 3GL3A 1EEMA 4E8HA 2H30A 2C80A 3WD6A 2X8HA 1CQGA 4OO4A 4K7IA 2HZEA 3N9JA 4ML6A 1CQHA 2C0EA 4CHSA 1LU4A 5HFIA 3GKNA 3KP8A 1K3YA 4GLTA 2V1MA 4JBBA 1PRXA 4WBRD 4IJ3A 2DJKA 2D2ZA 1NM3A 11GSA 1YF0A 4FYCA 4IW9A 4TOPA 1YKAA 2P31A 3KMOA 1GLPA 2YJHA 2WCIA 2DJJA 3EINA 3J7Yb 4J57E 2O8VB 3M9KA 4EXJA 5F07A 3M3MA 1ZYQB 2H75A 3FK8A 1J08A 1V57A 1YEXA 3EU3A 5DVBA 3W6GA 2MMAA 4ECBA 3ZIVA 1R5AA 3WT1A 3D5JA 2YNXA 4ZBAA 3UIWA 2H76A 3KTLA 5G2ZA 2E2MA 1PX6A 3DEXA 3TOTA 1PKZA 1YY7A 3US3A 1HNCA 2N5FA 5LD0A 2VD1A 1BG5A 2LV3A 3ZMKA 1V40A 3ZLPA 1PX7A 2WDUA 3IXRA 2EIOA 4TN8A 4IP6A 4N11A 4GSTA 2ZNMA 1JZRA 4XS1A 4DSSB 4OO5A 1E6BA 1HNBA 3ZZXA 1PL2A 1SD8A 3F8UA 2H1BA 5ECLB 4V1Ag 5FT3A 4DSSA 4GXZA 4DSRA 3IK7A 2K6VA 4TRXA 4TR4A 2LRCA 3QFBC 5HR1A 2FWGA 1FVJA 5B8AA 2TRCP 2GQKA 1SL1B 1Z6MA 4DEJA 2MBSA 3UAPA 3UOMA 5ID2B 5AGYA 5DCGA 5J4UA 1XBSA 4PGTA 4WF5A 1H75A 3PGTA 2ON5A 4MF7A 3HVVA 3DYRA 3KIJA 4IGJA 5ID2A 4GCIA 3CSJA 4HZ2A 17GSA 3MWHA 3FR3A 3OR5A 6GSVA 5G5EA 2QC7A 2PUKC 5B7CA 3F3QA 3TUEA 5KN1A 4JR6A 5CP1A 4KX4A 1AQWA 1S3DA 2HSHA 1THXA 2LUSA 3TKSE 5GSSA 1A8YA 2B5EA 5J9CA 2AAWA 2VM2A 1SJZA 5GAND 2YV9A 3GTUB 2LRTA 4MF6A 4PNFA 3F0IA 2IMDA 4MLYA 4O5RA 1TOFA 1ERTA 1TK8B 3QMXA 4F9ZA 1XOBA 2VL2A 2NTOA 1M0UA 5A4WA 3GTUA 5HR0A 1K0OA 3HVSA 2KHPA 3QD9A 5D93A 2PPTA 3A3TA 1HNAA 3ZL5A 3IA1A 4AF2A 1FO5A 3DMLA 5J41A 2KP1A 1F2EA 1ZL9A 2MBTA 5ECKB 3TOUA 3K8NA 1EOGA 4PNGA 4EKZA 1PKWA 3ZFLA 3RPNA 5JWQB 2RUEA 1B8XA 1IYHA 4V2LA 2HNLA 4ECJA 2YPMA 2RIIA 5KN2A 2DSAA 1ML6A 3DWVA 4KA0A 1X9WB 1T7PB 4V2NA 3G7JA 1QGVA 1EP7A 1SK0A 2VIMA 4TXVA 1DBYA 2KLXA 4L0UA 3UMAA 4K9ZA 4HUAA 3UVHA 4XTSA 4ZILA 3AY8A 2FD3A 4ZL7A 2H1DA 1SKSB 4DVCA 1G0TA 1TXXA 3D21A 3NIVA 3M1GA 3I6AA 1JFUA 2I81A 1WMJA 3ERWA 1T1VA 3TKQA 1F6MC 3O6TA 2V6KA 2H66A 2JU5A 5HFKA 3UARA 2RLIA 3ED3A 4MA9A 2CZ2A 1TW9A 5KN0A 1TJDA 1G7EA 4F0CA 2GQLA 3QDNA 1K3OA 1S3AA 3IOSA 4WR4A 2GZYA 3VLNA 4TVEA 4J2FA 2VCZA 3LFLA 2CAQA 1THOA 4WXTA 5ECIB 2ALBA 4V1Ap 1Q4JA 1X5CA 4MF5A 5IMVA 2GSSA 3ZFBA 1IYIA 5ECPB 5EPFA 3EYTA 2VCWA 3EURA 3KGKA 3C7MA 1XPVA 4N0ZA 4K0NA 1GSFA 3VPQA 1XFLA 2LQQA 4BWQA 3J7Yk 2QSIA 2C8UA 4G9HA 2KOKA 1U87A 4RI7A 1K0AA 4YQUA 2GTUA 3IAM2 2OE3A 1O8WA 16GSA 3IRAA 3F4SA 4ML1A 3F4TA 3ZTLA 3CSIA 2YWNA 2A2RA 3IC4A 1Z9HA 1A24A 2F51A 5HR2A 3CXGA 1LJRA 4TR0A 1GL8A 2N5BA 5AN1A 3RDWA 4PQHA 1SKWB 2PVQA 4KUNA 1ABAA 3APQA 1SJIA 4MJBA 5CRDA 1A2MA 1J9BA 2CT6A 1XWBA 5G1LA 2WB9A 5LNKe 4GQFA 4NMUA 1GSYA 2L5LA 3P90A 1T8EB 4QL7A 1Z7RA 4I2TA 1N8JA 5DALB 4HU7A 2NDOA 3LYKA 1PD21 3L9VA 2V6OA 1V2AA 3L4NA 1QK8A 1FAAA 3E0UA 2HE3A 1MDIA 1ZZYA 2CVBA 1TI3A 1RK4A 4P3YB 2FA8A 4KNDA 3R2QA 1SYXA 2CVKA 1ZMAA 1QUWA 5DALA 3CTFA 3GSTA 2O89A 3U6VA 3LGCA 2P0GA 2AJQB 6GSXA 3HJMA 3HJPA 1MD4A 4FH8A 5AIXA 2JZSA 3PH9A 4EE0A 1HD2A 2H0IA 3H93A 1O85A 5JWRB 1T3BA 2DJ3A 1Y6EA 1PN9A 1BX9A 5IMFA 3TDGA 5AISA 1GWCA 4KE3A 5FHIA 2DIZA 2MMNA 3ISOA 7GSSA 1OE7A 4TXOB 5CNWA 1M7TA 4O92A 4MPGA 3M8NA 5ECQB 2DLXA 3UVTA 1XCCA 2MMZA 2A4VA 4GSNA 2YN1A 2FCHA 4FO5A 1TK0B 1OYJA 2PWJA 1V9WA 3GKKA 4TXOA 1GUHA 1XIYA 2DJ0A 4YAPA 2HFDA 4BPYA 3VWXA 2H8LA 4WETA 2HYXA 4ZBDA 3TCOA 1JLVA 3BCKA 4HQZA 4KSOA 1XW9A 5ELAA 1AQVA 4RQXA 1TK5B 1O73A 1OC9B 2E7PA 5EL8A 4IN0A 1BQ7A 4N10A 5F8BA 3APOA 3H79A 3D4TA 3MDKA 1R7HA 4MZCA 1QXHA 2H6XA 3ME7A 4JE1A 2RM5A 3CMIA 4NPBA 1G6WA 2M72A 1ON4A 1GP1A 9GSSA 1QMVA 1MDJA 2AYTA 4RQRA 4EC0A 4FYUA 2F9SA 1PGTA 3KEBA 1O6JA 1OE8A 4XIHA 3IE3A 4PUFC 1YKCA 1K0MA 2L6DA 2FNOA 2H0GA 3GKXA 1QFNA 3HDCA 4YQMA 2IPAA 5CYYA 4OWYA 4MH3A 2B5XA 1KBNA 4L5LA 6GSYA 5D9TA 1V98A 5G5FA 2LJKA 3QAWA 2JSZA 5GAPD 2NBSA 4JR4A 4LMVA 4BVXA 4OFTA 5L71A 2HT9A 1SK2A 4PQIA 2BMXA 2H0HA 4G10A 4MJEA 3PR8A 5GSTA 1B4PA 4MDCA 4ZB9A 1PSQA 3QOUA 4MP4A 2IMIA 2PN8A 4YH2A 3MAKA 3Q6OA 4KDXA 5D9VA 1O8XA 2IL3A 3UBKA 2C1YA 1OAZA 2FLSA 2WJUA 1VGLA 1Q98A 1XVQA 8GSSA 5ECRB 2Z9SA 4H86A 2DMMA 2G2QA 1FW1A 1XOAA 3FKFA 4KSMA 5HR3A 1KNGA 4KDUA 2O7KA 3IAS2 2LJRA 3D0ZA 1DE1A 2YWMA 3HY2A 1U6TA 5CRHA 3G7YA 2A2SA 4F2IA 4GSSA 2X8GA 1SU9A 4I8BA 4ZB8A 2N5AA 4EF0A 1EEJA 2ES7A 3S9FA 3TKSC 2GSRA 1UA5A 5D9WA 3FZ9A 4MCUA 4MJCA 1TKDB 3LEFA 5DBQA 2WZ9A 2NPBA 1ERWA 2IMEA 3KCMA 3VI7A 1A0RP 1ZGNA 2P5RA 2C3TA 4KCEA 22GSA 2L57A 1F3AA 4O32A 1JZWA 1VF2A 5DDLA 3TRQA 1B48A 3WT2A 4KW6A 4ZBBA 2VL9A 2GGTA 2C3QA 2M80A 1U3AA 1X9MB 4PUAA 1F3BA 1B9XC 4WF4A 5G31A 3GX8A 4EUYA 4WKWA 3FZ5A 2WGRA 2RUFA 3FR6A 2IN3A 2HRNA 1X5EA 3M0FA 3L0HA 5ENUA 4NV5A 2R2JA 2OE1A 4IVFA 2JADA 3C1RA 2I3YA 3CYNA 3HZ4A 3BJ5A 1YZXA 5IMCA 2CQ9A 1ILOA 1OC3A 1WIKA 3F6FA 1OVNA 2H71A 3FY7A 1VRSD 4NHZA 2CV4A 1Y25A 1GTAA 2IMKA 1XWGA 3EWLA 1DUGA 5A5KA 1M9AA 3L9SA 4HDEA 1TI1A 1T00A 4TW5A 3A2VA 4PXOA 4KCAA 2DMLA 3TRPA 2PGTA 4JU5A 3W8JA 2VM1A 2H73A 2YV7A 3LQ7A 2FUG2 3C8EA 4IKHA 2EIQA 3W8SA 3GKMA 3C71A 2XPEA 3P7XA 1DSBA 4EDYA 1TTZA 4ID0A 5ELGA 2WULA 2LEGA 1Z7PA 4HJMA 1FB0A 4POMA 3F9UA 2K8SA 3EMXA 3QAGA 1FG4A 1M9BA 4Q5FA 1A2JA 3O76A 3GYKA 4GTUA 5EY6A 1H4OA 4NXIA 3RBTA 2M46A 19GSA 4KDYA 3LYPA 3IV4A 1NSWA 2B7JA 2HLSA 1N2AA 4G19A 1EZKA 3HVXA 3VPTA 5KN3A 4JRRA 2VLUA 4Q5RA 1I9DA 4ZB6A 1NW2A 1GNEA 2MMOA 1GUMA 5JCUA 3WYWA 1Z3EA 3MNGA 1GTIA 1XVWA 2OA7A 2E0QA 5IM9A 3ZITA 3LXTA 3ZVJD 3D4MA 2TIRA 2HSYA 2GS3A 5IQYA 1DE2A 1Z6NA 4CW9A 4DSQA 3RPPA 4BWSA 3GH6A 4I2UA 4XRAA 5IOWA 4XHMA 1M2DA 4XS6A 1K0NA 3WGDA 5DAKB 1USBA 5JCWA 2JZTA 3F4RA 5D8IA 2L5OA 1SL0B 1GSDA 4KH7A 5DAKA 3WGXA 6GSTA 2AV4A 3GA4A 2JL4A 2VO4A 1GLQA 3RHCA 4GWRA 4I5QA 4K0GA 2XHFA 1S3CA 2H19A 3ZMLA 4EDZA 2CZ3A 4XCSA 1TRWA 1WOUA 1TU7A 2VOCA 2DC5A 1G6YA 2X99A 2AUVA 1ACVA 3IR4A 2J9HA 4HU9A 5EVOA 2FWEA 1PA3A 2HRFA 2X64A 3RAZA 4IP1A 5CAXA 1VF3A 1GULA 3FZAA 1EOHA 2H6YA 4YAVA 2IFQB 1G7OA 4K1FA 1LBKA 3GMFA 5ECOB 2H72A 3UL3A 1O7UA 3DIEA 3Q74A 2VL3A 4MZWA 5D9XA 5A4VA 1ZYEA 2NVLA 3IHQA 2VCVA 2PVOC 3GH9A 2IFQA 1EGOA 3H1NA 18GSA 2L6CA 2GDRA 1NHOA 5ECMB 3DRNA 2FGXA 3KTBA 1AIUA 2GT5A 3DXBA 2EIRA 5IPHA 4OCFA 2I4AA 3KXOA 3BOAA 3MSZA 2YWOA 3HKRA 5FWGA 4OMVA 2C4JA 2H74A 4ZL8A 4HOJA 2RM6A 1A23A 2CVDA 3IDVA 3QR6A 4ILFA 3SBCA 1WRYA 1UC7A 4HEA2 4MPFA 2JZRA 4ACSA 1A8LA 4HS1A 1R5PA 2LJAA 4N30A 2YANA 4Q5NA 4IBPA 2O87A 3GN3A 2B7KA 4RUVA 4AJ7A 4ZXGA 3EMPA 3QFAC 3TKPA 1JLWA 3FRCA 3RHBA 1GH2A 2VLVA 4G2EA 2B1LA 2CX4A 4OCEA 4F0BA 2IIYA 1K0DA 2LKUA 2YP6A 5IOXA 4XS4B 4PURA 3L9UA 2ZUPA 1UVZA 3GSSA 5F05A 5DQYA 2MZCA 4NV2A 1TDIA 3HZ8A 6GSSA 2GQMA 5JCGA 2GLRA 3CRTA 1XW5A 1AXDA 2LNTA 4XS4A 2HI7A 5HFGA 3H4KA 1O81A 2G0FA 1YDKA 3BD2A 1OC9A 4WR5A 3FR9A 3F6DA 4KB3A 3TJGA 2R3XA 4V2MA 2B3SA 3A2WA 2I1UA 2LRNA 12GSA 1GSEA 5AIVA 2BJXA 3U5RE 3GNJA 1M2BA 1KEBA 1OKDA 3TJJA 2H01A 2WFCA 2GSTA 4Q5QA 4BA7A 6GSWA 2J23A 4MABA 4LA1A 1SENA 4IELA 4NWYA 2F3MA 2XBIA 3L78A 2YJ7A 4QL9A 2BTOT 4WEYA 4RI6A 2XBQA 3LJRA 1XWCA 3HYPA 1WWJA 2F8AA 3FYGA 3EC3A 4LL1B 1OC8A 3VWVA 3O3TA 4FYBA 1WE0A 2L59A 5CO3A 3N5OA 3DVXA 1RW1A 2YOIA 1TRVA 4HQSA 1JHBA 3GV1A 1TU8A 3PINA 3GIXA 3TJFA 1SL2B 3WGEA 3VWUA 1GNWA 2B1KA 1V58A 3NOFA 4L5OA 5KEJA 1UN2A 3GURA 6GSUA 3D6IA 3P2AA 2L4QA 1XXUA 3CRUA 4KGIA 4IS0A 3HD5A 2OJLA 1VF1A 1GSSA 3ZIJA 1ERVA 1EV9A 5J9BA 3ZVJA 1EV4A 1FB6A 1BEDA 1XWKA 4GRFA 2ZCTA 4PX1A 1T4ZA 5F0GA 3APSA 4JEDA 3CSHA 3GRXA 4X43A 5IPGA 3IBHA 4F82A 2CX3A 2PMTA 1WP0A 4IJIA 3TJKA 5D73A 5ABRA 4POKA 3KH7A 1GRXA 4GF0A 4I6XA 2ON7A 1GTUA 2QKEA 2AB6A 3VK9A 3VURA 3KZQA 4WBJA 5ECSA 1T4YA 1J0FA 5IMZA 4CDOA 2QGVA 2HXKA 1M99A 1F37A 3IPZA 4TKYA 3ZREA 1BYEA 2R37A 1GSUA 5ECHB 2OE0A 3FEUA 2B6MA 2FHEA 4POBA 1TP9A 3ME8A 1MEKA 5C00A 1A2LA 2VCQA 2GT6A 4JZQA 3DGQA 4AJ8A 3GX0A 1URMA 3I69A 3KD0A 4XRDA 1I5GA 2IJYA 3FHKA 3FZ4A 1EGRA 4EVMA 5J5NA 1MD3A 2DBCA 2H1AA 2R6KA 3SWLA 3HXSA 4IHUA 3EVIA 5COHA 2P5QA 2OBIA 1TRSA 1YF1A 3I9V2 2C0GA 2WS2A 1GTBA 1K3LA 4HI7A 5DCHA 2VAFA 2C0DA 2HZFA 3KH9A 3HHVA 4TR1B 5J3RA 4IQ1A 2KUCA 2E2GA 2V32A 4I97A 1FVKA 1MTCA 3M9JA 1F9MA 2OBKA 1W4VA 2JACA 2OKAA 3KMNA 2XPDA 1ST9A 4OFNA 3KP9A 1YEPA 4TR1A 3GUSA 3A5WA 3F63A 3UEMA 3VFIA 1A0FA 2F8FA 1Z5YE 5IO2A 3EE2A 5B6MA 4NAXA 14GSA 1B4QA 1SD9A 5G30A 3G9BA 4N0VA 3ZRDA 1OKTA 2DIYA 3BCIA 3HCZA 1C72A 3KJYA 1PL1A 2XC2A 3BBYA 4ISDA 3A2XA 4BL7A 1MDKA 4ZIJA 1XW6A 1XZOA 2DJ2A 4HJ2A 3HA9A 2C0FA 3DKSA 4MK3A 4TR3A 2REMA 3V1WA 4EL1A 2GZPA 4K7NA 5CREA 5H5RA 3LWAA 2LSTA 5GZZB 4AGSA 3EU4A 3VWWA 2C3NA 2OADA 4AJ6A 2V41A 3F3RA 5IMDA 1GUKA 1HYUA 1SYRA 3GHAA 2O85A 1RQMA 4ULXA 5DQSA 5LCZA 4E8EA 2VCTA 1SKRB 3P8WA 5H5SA 4GQCA 2OACA 2VLTA 4MJAA 2IMFA 2CA8A 4D73B 1B9YC 1R26A 2PERA 5IIZA 1EWXA 3VI5A 1TRUA 2LQOA 2VD0A 4K2DA 1WJKA 4J56E 1FOVA 1U88A 2YZUA 2FWHA 5HQPA 1EP8A 1VF4A 5IMAA 3GFKA 1GSQA 2DJ1A 1AC1A 4D73A 2GZZA 1NHYA 4IQAA 2H70A 3C73A 3ERFA 4MZBA 2YWIA 2R4VA 2R5GA 2MYGA 3CBUA 3TB2A 5A4UA 1FHEA 4L8EA 4EO3A 2LNSA 13GSA 5G1KA 2GVPA 1WPIA 2L4CA 1SK1A 3ERGA 3QAVA 1PMTA 2CAIA 3DD3A 2H6ZA 5CRWA 3UBLA 1W89A 10GSA 1ZCPA 2K18A 5B6NA 2AHEA 3LG6A 3IK9A 2IWTA 5JWOB 4X1UA 3E3EA 4LMWA 4QQ7A 3LSZA 1HQOA 3GL5A 3I43A 2B5YA 4X0XA 3E9JB 2EC4A 3Q18A 4OD7A 2JSYA 5F06A 2FY6A 5B8BA 4OFMA 5CRGA 1K0CA 1SJ6A 1X0RA 1PQNA 2I9HA 2WRTA 2FWFA 1YQ1A 2PU9C 3G7IA 3UJ1A 1JZOA 5INYA 2PBJA 1XWAA 2X8CA 3C1SA 2VCXA 1ERUA 3TKSA 3QCPA 20GSA 4O7HA 4POLA 1U3IA 4K6XA 4Z7XA 2YZHA 4KAEA 4K7OA 5E4WA 2K9FA 3LXZA 3D22A 4K8MA 1AAZA 3HJOA 3JCML 2V2GA 1BAYA 2GSQA 5IO0A 1KTEA 2LTKA 2VUPA 5ECNB 1AUCA 3H8QA 3TKRA 2H1GA 4MMMA 2VL2C 3TGZA 3QPMA 3TJBA 3FW2A 4LL4B 4NHWA 4ECIA 5C04A 3Q19A 4ECCA 1BJXA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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