3F4TA

Crystal structure of wolbachia pipientis alpha-dsba1 c97a/c146a
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
200
structure length
200
Chain Sequence
ITSNELLLPLPNDKLLGDPKAPILMIEYASLTCYHCSLFHRNVFPKIKEKYIDTGKMLYIFRHFPLDYRGLKAAMLSHAYEKQEDYFNFNKAVFNSIDSWNYYNLSDLTLLQRIAALSNLKQDAFNQAINDKKIMDKIVNDKSLAINKLGITATPIFFIKLNDDKSYIEHNKVKHGGYKELKYFTNVIDKLYGKAIVKLE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural and Functional Characterization of the Oxidoreductase alpha-DsbA1 from Wolbachia pipientis
pubmed doi rcsb
molecule keywords Putative uncharacterized protein
molecule tags Oxidoreductase
source organism Wolbachia pipientis
total genus 75
structure length 200
sequence length 200
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-11-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13462 Thioredoxin_4 Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.40.80 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Ribonucleotide Reductase Protein R1; domain 1 Ribonucleotide Reductase Protein R1; domain 1 3f4tA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3f4tA01
4N11A 4LL4B 2YJ7A 2BTOT 4MJCA 1N2AA 1YDKA 1PSQA 2C8UA 2VIMA 3ZIVA 2H6YA 4TR0A 4HS1A 1K0AA 1HD2A 5FWGA 4IN0A 2HRNA 3KGKA 2FA4A 4IBPA 2KUCA 2LRTA 2XBQA 3ZRDA 1GLPA 2KOKA 4DSSA 1VGLA 1O85A 3KEBA 2REMA 5KN0A 4EDZA 1ZOFA 4XCSA 2LJRA 2OA7A 4POLA 1EGRA 1GTUA 1GSFA 3LXZA 1TRWA 3NIVA 1TRVA 3W6GA 1A2MA 2IIYA 4FO5A 4V2NA 3KJYA 1SU9A 2H72A 2OBKA 3GSSA 5KEJA 7GSSA 4HQZA 3HDCA 1VF2A 2GSRA 2YWIA 2WCIA 2DIZA 2FWFA 12GSA 3KTLA 5J4UA 1JZDA 2VL2A 3KP8A 1WWJA 4KH7A 2KP1A 3EMPA 3QOUA 1EEJA 3P90A 5IMVA 1XBSA 1ZCPA 3ZMLA 3IE3A 1HNBA 4MJAA 2I3YA 2YV7A 4EUYA 1QMVA 4KW6A 5F05A 2H71A 2GQMA 2DMMA 3ME8A 4GSSA 1YKCA 2H01A 1Z6MA 1ZL9A 1YKAA 3F63A 1PKZA 2FHEA 4I6XA 1J08A 3DVWA 3E9JB 1M0UA 3DMLA 4L8EA 1VF1A 2CZ2A 3IBHA 1AQXA 2LJAA 3LXTA 1FHEA 3HA9A 2WJUA 4CDOA 4JU5A 5GAND 4KSMA 6GSYA 3EINA 2VD1A 4IHUA 1U3IA 3F0IA 1FG4A 4MPGA 3GRXA 2YCDA 4QL9A 3FW2A 4HQSA 3ERFA 2MYGA 2LNSA 2HLSA 2J9HA 3FR9A 4POKA 1A8LA 8GSSA 1V9WA 2LQQA 4I2TA 4HJMA 1ILOA 2IL3A 3F4SA 3EWLA 2K18A 3CMIA 3LORA 4XS4A 2C80A 1XPVA 3UVTA 3IHQA 1QQ2A 4EL1A 5J9BA 3VK9A 1WIKA 4JR6A 3I69A 3HZ4A 3GKKA 3V1WA 2FUG2 4XS6A 4FH8A 4TVEA 3EVIA 1PQNA 3L9UA 1X9SB 4TRXA 4WBJA 2VLVA 2DJJA 1YY7A 5J3RA 4JBBA 5IMFA 4XHMA 5G31A 1K3OA 3BCIA 2O89A 4PQ1A 4OFMA 2GGTA 2NPBA 2GT6A 3CRUA 1GSUA 4PNGA 2IMKA 5ECLB 5HQPA 4PUFC 4D73A 2WULA 5E59A 1SYRA 1V40A 3H1NA 3CSIA 16GSA 2H6ZA 2P5QA 4F0BA 3M9KA 2M80A 3EE2A 3UEMA 3TJGA 2C1YA 5D9WA 4MJBA 2XBIA 2FWGA 1HNAA 4OO4A 1GNWA 3L4NA 3BOAA 3Q74A 5IMCA 4WEYA 2XC2A 3TJKA 5CNWA 1C72A 2V1MA 5IM9A 2H75A 1T8EB 3C1SA 2CVKA 4HI7A 1A2LA 1SYXA 3TUEA 4GWRA 4GSTA 2X99A 2LV3A 3UOMA 3HJMA 2N5FA 5DAKB 2WRTA 1A0RP 4BWSA 1X9WB 4GQCA 1TTZA 2H0HA 4KUNA 1ZYQB 3TKSA 2L59A 1ERVA 5IQYA 1AW9A 2B5EA 2ES7A 4MLYA 2K9FA 2C0EA 1O7UA 1KTEA 3C7MA 4XTSA 2LJKA 2BJXA 1THOA 3RHBA 10GSA 1T3BA 5DJMA 3CSJA 4RI6A 4GRFA 1WPIA 3EU4A 3GL3A 3M8NA 1V98A 3ZMKA 3TKPA 1OAZA 5ECKB 2MMAA 4ZL8A 2KHPA 2OKAA 4KE3A 1R4WA 1XWBA 3D5JA 4K8MA 4YH2A 3LEFA 2HZFA 4KX4A 11GSA 1T4ZA 3I6AA 3BBYA 1XWKA 1DBYA 3UIWA 5KN3A 1OE8A 2RUFA 3CRTA 3ERWA 2LTKA 4AJ6A 2GDRA 2B1LA 5AIXA 1Z7PA 3ZITA 3GMFA 5JWRB 3J7Yb 2WS2A 1S3AA 3FR3A 2HSHA 4TXOA 1N8JA 4IQAA 3EU3A 4ECIA 1A0FA 2CAQA 2NBSA 1YZXA 3KMNA 1PX6A 2EIQA 3AY8A 5JCWA 3G7IA 1AQWA 4IW9A 4WR5A 1J0FA 1EOHA 1F3BA 3W8SA 3CYNA 3DWVA 5A4VA 1I9DA 5DDLA 2OE3A 1RW1A 2H1AA 4YAPA 3DVXA 3D0ZA 4WR4A 5IPHA 3VI7A 5A4WA 3QAVA 4WF4A 2EC4A 4L5OA 3LYKA 5DCGA 2CVDA 2H30A 1QUWA 4MP4A 4PUAA 1SKWB 4JRRA 1SENA 1ZGNA 2GZYA 3N5OA 3IC4A 5FT3A 3DYRA 1GH2A 4TR1B 2VD0A 4KCAA 2CVBA 2I4AA 4K7OA 4HZ4A 2HNLA 3A5WA 3VWUA 14GSA 3IOSA 2VCQA 5A4UA 3QDNA 5F06A 4WBRD 4DSRA 2EIRA 3ZIJA 4ZL9A 2FGXA 2H1DA 2WFCA 1T4YA 1OC8A 1Q98A 1SJIA 1ABAA 3A2WA 3WGDA 2ALBA 3F4RA 4K7NA 2YZHA 2PN8A 1NHOA 5B8BA 5J5NA 1LJRA 1M9BA 3HYPA 4Q5RA 4IQ1A 1R5AA 4MMMA 3GYKA 4LLRA 3Q19A 4O7HA 4PQIA 1XWGA 2WDUA 3L9VA 4BWQA 19GSA 4MF7A 4PXOA 2L4CA 5IOWA 1TJDA 4NHWA 1S3DA 5CO3A 4RUVA 4YQMA 2LKUA 5JWQB 3GUSA 2L5LA 5DBQA 5EL8A 1V2AA 1CQHA 5JCGA 4HU9A 2VAFA 3G7JA 4OCEA 5DJLA 2IFQB 3O6TA 2GQKA 2F8FA 1ZYEA 1GSSA 1KEBA 3F9UA 5HR3A 1GP1A 3E0UA 2HI7A 5E4WA 1XW9A 1JHBA 3IRAA 4GQFA 4O32A 5F07A 6GSVA 1Z6NA 4WF5A 4J57E 1OC9A 3GHAA 2H1BA 2H70A 4MABA 3DXBA 1NM3A 2DBCA 2LRNA 2RUEA 2X64A 1X5DA 1FVJA 4IELA 2RM5A 2C3QA 4LL1B 1K0OA 3TOTA 5B8AA 2OE1A 3QCPA 4GCIA 4POBA 3J7Yk 3SBCA 1SK2A 3D4TA 4LMVA 1RQMA 4RI7A 1XCCA 3DRNA 1TKDB 4BL7A 3QMXA 3UVHA 22GSA 3GA4A 2CZ3A 1BYEA 2JZTA 1YEPA 3FR6A 1UVZA 1JZOA 3VWXA 5ID2B 4I5QA 1SD8A 3CSHA 3GTUB 2L6DA 2DJKA 4TN8A 5IMDA 2O85A 1GSDA 3ZZXA 3ERGA 1FO5A 1Y25A 5HR0A 3I9V2 2WGRA 4OFTA 2VL9A 2L5OA 2F3MA 1GRXA 4V2MA 1BQ7A 1R5PA 5ECIB 4MK3A 1GUHA 2X8HA 5IO0A 1TDIA 3TB2A 5DQYA 3KZQA 1FOVA 2H8LA 1VF4A 4RQRA 4GTUA 3F6DA 3L9SA 4ECJA 4JZQA 1NW2A 5B6MA 1VRSD 4XIHA 3M3MA 20GSA 1HNCA 4F82A 2N5BA 2QC7A 4MJEA 2B7JA 2V6KA 4K0GA 2B1KA 1ACVA 4BPYA 4FYUA 2R37A 2LUSA 4XS4B 4WKWA 1GSEA 3G9BA 4KGIA 1JZWA 5IMAA 2VL2C 1G0TA 2OACA 3IDVA 3APQA 4OMVA 4K0NA 2YZUA 4G19A 4BA7A 2H0GA 4KSOA 2GTUA 1DE1A 2F9SA 2B3SA 3HKRA 5G5EA 3ZFLA 4K1FA 3GURA 1WOUA 3DGQA 1XFLA 1KBNA 3EYTA 2L57A 3PH9A 5CP1A 5IMZA 3IV4A 1O6JA 3TJBA 2JZSA 1SKRB 3EMXA 4ML1A 1EP8A 4NXIA 5AGYA 1WRYA 4I8BA 1K0DA 5G1LA 2K8VA 1M7TA 3CXGA 1U3AA 2PGTA 2OBIA 2CT6A 4K7IA 2H6XA 2HSYA 5AISA 3HVVA 1FW1A 3UBLA 4IVFA 3CTFA 2LS5A 5ECPB 3IXRA 1NHYA 1E2YA 1X0RA 2K8SA 1YJ6A 4HJ2A 3ZLPA 3C1RA 4MA9A 6GSTA 5ABRA 2FWEA 3NZNA 3TDGA 3WGEA 1EGOA 2C4JA 5ECQB 1DSBA 5GZZB 4KAEA 4AJ7A 3Q18A 4MDCA 4V2LA 3GNJA 5HR1A 3GX8A 4F2IA 1EWXA 1MDJA 5ENUA 1OYJA 4KDYA 3P2AA 6GSXA 5F8BA 1PN9A 5D9TA 3TRQA 3FYGA 3D4MA 2ZUPA 5ECRB 3GKNA 4BVYA 3RDWA 2IMFA 2XPDA 1A2JA 3KH9A 2FWHA 1U87A 3PR8A 4K6XA 2HZEB 4ZBAA 4CW9A 2B6MA 1CQGA 4NWYA 2R5GA 3SWLA 3QPMA 5COHA 2HT9A 2JZRA 4LMWA 2VLUA 1QXHA 2H73A 2CQ9A 2YN1A 3GV1A 2QGVA 1PMTA 2J23A 3K8NA 2VL3A 4L0WA 2H66A 2V32A 2IWTA 1JLVA 4JE1A 3QR6A 3L0HA 3JCML 2MBSA 4JR4A 4Q5NA 1DE2A 1B4PA 4KNDA 4L0UA 1EV4A 1SL1B 5D8IA 4Q5FA 6GSWA 2D2ZA 4H86A 3FK8A 2VCTA 2H74A 2DJ0A 2C0GA 2IJYA 4O92A 3IPZA 2VCWA 1ERUA 2AHEA 1JLWA 1LBKA 4KDXA 2M46A 1O81A 3FHKA 3M1GA 2FNOA 2GS3A 18GSA 1XZOA 4OWYA 5KN2A 2PMTA 5IOXA 3ME7A 1XW5A 3HJPA 4G10A 1USBA 3DEXA 3TCOA 2YV9A 3A2XA 3GN3A 4TR4A 2MZCA 3TKSC 3UJ1A 9GSSA 3H4KA 4OO5A 3CBUA 2YWMA 2TRXA 3ZREA 4X0XA 1H75A 2L6CA 4F0CA 3VFIA 1ZZYA 1M2BA 2MBTA 3WT2A 4ISDA 5JCUA 3FZAA 2IMEA 1TW9A 5GSSA 2ON5A 1R26A 3D6IA 3FZ4A 2AAWA 3HVSA 2E2GA 2O7KA 4GF0A 1DUGA 1MTCA 2RM6A 2K6VA 3IK7A 1FB0A 1V57A 3FRCA 3PINA 5INYA 1PA3A 3LG6A 1TRSA 3IAM2 1TRUA 4NMUA 3DD3A 1EV9A 5KN1A 2HE3A 4G9HA 3A3TA 1MEKA 4IS0A 2R4VA 2KP2A 2LEGA 2DLXA 4ZB8A 3UMAA 2WZ9A 1THXA 2LSTA 1FB6A 3ZVJD 4HU7A 4P3YB 1TI1A 2QSIA 4F9ZA 1XOAA 2JL4A 5DALB 1XW6A 2DJ1A 2B7KA 1Z7RA 3LWAA 1G7EA 4NPBA 3ZFBA 2E7PA 1B9XC 1S3CA 4MPFA 2X8GA 1B48A 2LNTA 3GKXA 1WE0A 1EOGA 4XRAA 5C04A 2FA8A 1XVQA 1OC9B 1ON4A 1URMA 2AV4A 4L5LA 3O3TA 4XS1A 3M0FA 2P31A 1HQOA 2XPEA 4ILFA 1TK0B 4PGTA 5GSTA 3FKFA 1OKDA 2M72A 3BCKA 3CTGA 3LQ7A 3TKRA 2GZZA 4N0VA 1GLQA 1O8WA 1YQ1A 3IK9A 1V58A 3UBKA 2VCZA 4DSSB 4ML6A 1PL2A 3APSA 2MMOA 2F51A 1SL2B 4ZL7A 1TK5B 4IGJA 4GLTA 5DQSA 2MMZA 1Y6EA 4EXJA 4EKZA 1K0NA 1QFNA 1BAYA 3F8UA 4EC0A 1GNEA 4ZB6A 3LYPA 1JZRA 1K0MA 3HJOA 2RLIA 4MH3A 5H5SA 4ZBBA 2DJ2A 1X5EA 4FYCA 1UN2A 4MCUA 2YWOA 1O73A 1PD21 2OJLA 1Q4JA 2GSQA 5J9CA 1OKTA 1MDIA 4NAXA 3VWWA 1IYHA 4YQUA 4QL7A 4PQHA 3QFAC 2GQLA 1FVKA 1K3YA 1MD4A 4KDUA 5CRGA 1SL0B 3H8QA 3FY7A 2V2GA 2DJ3A 5HFGA 3KIJA 4F03A 2X8CA 2IFQA 1ML6A 1EP7A 4IJIA 1F9MA 1XWCA 1T7PB 1M2AA 2I81A 1TP9A 3QAWA 2VLTA 1G7OA 1K3LA 2P5RA 3OR5A 4XRDA 3C73A 1F6MC 5IIZA 3M9JA 1X9MB 4V1Ag 2RIIA 1PGTA 4HDEA 1AQVA 5G2ZA 3TOUA 2L4QA 3KCMA 2V6OA 2YPMA 3HXSA 3GH6A 1ERTA 3D21A 2H0IA 4JEDA 3DIEA 4K9ZA 2R3XA 4ACSA 1A23A 5H5RA 5LD0A 1VF3A 5CREA 4J2FA 3GH9A 2PVQA 4TXVA 2FCHA 4DVCA 2HYXA 2ON7A 5D96A 4ZXGA 2C3TA 1SKSB 3TKSE 1W4VA 2A2SA 4ZB9A 1TU7A 4AF2A 1BEDA 2N5AA 5ID2A 4E8EA 2PPTA 2HFDA 4NHZA 3GFKA 3GTUA 2GT5A 2IN3A 3GIXA 2PUKC 2CV4A 4KB3A 1GL8A 3VWVA 4WETA 4WXTA 3UAPA 3BJ5A 5DVBA 4DEJA 3WD6A 3RPPA 3S9FA 3RPNA 1U6TA 2P0GA 1AXDA 3E3EA 1ERWA 1QK8A 4EE0A 1AAZA 1G6YA 4J56E 4ID0A 1PRXA 2GZPA 3IR4A 1K0BA 2YANA 2WB9A 1WMJA 3MSZA 4MF5A 2MMNA 2OADA 2PU9C 3FZ9A 3O76A 3LSZA 1E6BA 4D73B 2JACA 1Z5YE 3Q6OA 2O8VB 4ULXA 3GKMA 3QFBC 4TR3A 2G2QA 4ECCA 3VLNA 3QAGA 1B9YC 4G2EA 2VOCA 4HEA2 2JSYA 2YJHA 1UC7A 4V1Ap 4X1UA 5FHIA 5CRDA 5EY6A 1BJXA 4BVXA 4MZCA 6GSSA 3HCZA 2C0FA 3WT1A 1GTIA 3US3A 1G6WA 1GWCA 4N10A 1QGVA 1EEMA 2PWJA 1IYIA 1I5GA 3MNGA 3ED3A 3KH7A 4N30A 2B5YA 3H93A 2VCVA 5L71A 2LQOA 1M9AA 3QD9A 4TW5A 3MDKA 3R2QA 5GAPD 3KP9A 5EPFA 1KNGA 3F6FA 4IP1A 17GSA 5ECHB 2G0FA 3HD5A 1LU4A 1BG5A 1YEXA 4IJ3A 2A2RA 2DMLA 2NDOA 5G30A 1K0CA 4ZILA 1ZMAA 3KD0A 2GVPA 3ZTLA 5ECOB 4EDYA 1TOFA 1TU8A 1A8YA 2JADA 2AJQB 3IAS2 5ECNB 3KM6A 4AGSA 1W89A 1A24A 1XIYA 2AYTA 5ECMB 2PERA 2I1UA 3C8EA 1SD9A 3HHVA 1SK1A 4OFNA 1FAAA 6GSUA 1B4QA 1XXUA 4OD7A 5HFIA 5LCZA 5DCHA 4EO3A 4KCEA 1H4OA 4E8HA 5JWOB 4ZIJA 4PURA 5G1KA 1R7HA 2JU5A 3GL5A 4QQ7A 3IA1A 4YQVA 2YP6A 2KLXA 2LRCA 3EC3A 4N0ZA 2VCXA 1SJ6A 2CA8A 2R6KA 3WYWA 1T00A 3HY2A 4TXOB 3RAZA 2Z9SA 2VM2A 2VM1A 2HXKA 3UARA 1WJKA 2GSSA 4DSQA 1SJZA 4HUAA 1J9BA 4CHSA 4RQXA 3F4TA 1F2EA 4K2DA 3NOFA 3VI5A 3KMOA 2VUPA 2HZEA 2I9HA 3MAKA 3FEUA 4ECBA 4O5RA 2F8AA 3GSTA 1F3AA 1YF0A 2YWNA 1O8XA 2NTOA 3F3RA 2JSZA 2NVLA 1JFUA 2QKEA 1GUMA 5CRWA 3ISOA 3H79A 4IP6A 2E2MA 3U5RE 2V41A 5DAKA 2FLSA 1PL1A 4AJ8A 5CRHA 4MZWA 4FIWA 1U88A 1AC1A 4EVMA 1OE7A 3F3QA 1AUCA 4IKHA 5ELAA 2AB6A 1UA5A 5G5FA 3TGZA 2A4VA 2DIYA 3C71A 2DSAA 1M99A 2PVOC 4YAVA 3UL3A 1PX7A 4EF0A 3MWHA 5D73A 4X43A 5F0GA 1TI3A 3A2VA 3ZVJA 2BMXA 4PNFA 5B6NA 4GSNA 5A5KA 1GULA 4TKYA 4Z7XA 4ZBDA 3TKQA 4NV2A 1XWAA 2ZCTA 1TXXA 3U6VA 2CX3A 5IPGA 2R2JA 2IPAA 4NV5A 4HZ2A 4HOJA 1Z3EA 3N9JA 2H76A 5LNKe 3WGXA 1M2DA 5D93A 1NSWA 3EURA 3APOA 1OVNA 3ZL5A 3KTBA 3LJRA 1B8XA 3TRXA 1OC3A 2C3NA 1YF1A 3ZYWA 2YOIA 1ST9A 4Q5QA 4FYBA 2GLRA 3P8WA 5IO2A 3D22A 3L78A 1TK8B 1EZKA 4I2UA 5D9XA 4GXZA 3I43A 3BD2A 5J41A 2TIRA 5EVOA 2E0QA 1RK4A 5AN1A 4MZBA 5B7CA 1F37A 13GSA 1GTAA 2H1GA 3GX0A 4OCFA 1PKWA 2H19A 1Z9HA 1MDKA 3PGTA 5HFKA 2TRCP 1XVWA 4I97A 3VPQA 3TRPA 5CAXA 1BX9A 1GSQA 5ECSA 3TJJA 3DKSA 5HR2A 4TOPA 2IMDA 2HRFA 2XHFA 4TR1A 3RHCA 2B5XA 2FD3A 1GSYA 2FY6A 1X5CA 5D9VA 5AIVA 3VPTA 5C00A 2OE0A 2EIOA 2O87A 5H5QA 3VURA 2CAIA 2VO4A 1GUKA 4KA0A 3LGCA 3RBTA 3HZ8A 5DALA 3W8JA 4MF6A 2C0DA 3FZ5A 2DC5A 2GSTA 1XOBA 1WP0A 2YNXA 1HYUA 2IMIA 4PX1A 3LFLA 2CX4A 1GTBA 1AIUA 3HVXA 2ZNMA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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