3NYNA

Crystal structure of g protein-coupled receptor kinase 6 in complex with sangivamycin
Total Genus 169
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
169
sequence length
556
structure length
553
Chain Sequence
ELENIVANTVLLKAREGGGGNRKGKSKKWRQMLQFPHISQCEELRLSLERDYHSLCERQPIGRLLFREFCATRPELSRCVAFLDGVAEYEVTPDDKRKACGRQLTQNFLSHTGPDLIPEVPRQLVTNCTQRLEQGPCKDLFQELTRLTHEYLSVAPFADYLDSIYFNRFLQWKWLERQPVTKNTFRQYRVLGKGGFGEVCACQVRATGKMYACKKLEKKRIKKRKGEAMALNEKQILEKVNSRFVVSLAYAYETKDALCLVLTLMNGGDLKFHIYHMGQAGFPEARAVFYAAEICCGLEDLHRERIVYRDLKPENILLDDHGHIRISDLGLAVHVPEGQTIKGRVGTVGYMAPEVVKNERYTFSPDWWALGCLLYEMIAGQSPFQKKIKREEVERLVKEVPEEYSERFSPQARSLCSQLLCKDPAERLGCRGGSAREVKEHPLFKKLNFKRLGAGMLEPPFKPDPQAIYCKDVLDIEQFSTVKGVELEPTDQDFYQKFATGSVPIPWQNEMVETECFQELNVFGLDGSVPPDLDWKGQPPAPPKKGLLQRLFS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Molecular basis for activation of G protein-coupled receptor kinases.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords G protein-coupled receptor kinase 6
total genus 169
structure length 553
sequence length 556
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.16: [G-protein-coupled receptor] kinase.
pdb deposition date 2010-07-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
A PF00615 RGS Regulator of G protein signaling domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.167.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Regulator of G-protein Signalling 4; domain 2 Regulator of G-protein Signalling 4, domain 2 3nynA03
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3nynA04
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3nynA01
3NYVA 2VTSA 5HCYA 3VC4A 4CZTA 3D7TA 3G9LX 1ZYLA 2W96B 2Y4IC 3JVRA 4GUEA 4YBKA 4YPDA 4NM3A 3FL4A 1GZOA 2NRUA 1H1RA 3MESA 5EDPA 2R2PA 5D10A 4O1PA 3RCDA 4N57A 3PXRA 1E1XA 2HZ0A 3QA8A 4XX9A 5LQFA 4D2SA 3V3VA 1WZYA 5KZ0A 3UPXA 2O5KA 2DQ7X 1NVRA 3ZLWA 1P4OA 3PJ3A 4JBPA 2QQ7A 4U3ZA 4A9RA 3LFFA 3ID6C 2IHDA 3ZSGA 3JPVA 1XJDA 3BHUA 4CG9A 2AYPA 1UU3A 4FUYA 1EMUA 1SVEA 3IG7A 5AUYA 4TTHB 3WOWA 2IHBB 4OT6A 2EB3A 3NYNA 3FSKA 2C3LA 3FWQA 3OWKA 4U0IA 5JH6A 3BV3A 5CAQA 2PMOX 5HNBA 1CM8A 2C6EA 3QX4A 2XEYA 5DA3A 4BDKA 2WKMA 3T8OA 3PXQA 4RQVA 3CQEA 3RZBA 3W2CA 4ITIA 3RHKA 4CKRA 3VS0A 4D2VA 4PTEA 1TQIA 4PRJA 3FZOA 2JGZA 2VO7A 4UMUA 2CKPA 4C4IA 4J99A 2E9VA 5CQUA 4Z7HA 3VN9A 5BYYA 2ITOA 3UYTA 4JVGA 4KIKB 2W4OA 2IN6A 5EI8A 4P2KA 3GT8A 1ZYJA 3CP9A 5F4NA 5JFXA 5IQIA 4G5PA 2FYSA 4LM5A 2VTPA 3BE2A 4C38A 2X0GA 2XP2A 3GXLA 5LCKA 1PKDA 4KSQA 2GQSA 1M14A 2E9UA 4G6OA 4QPAA 5GHVA 3FMNA 4TW9A 1RW8A 4RLKA 3A61A 3D5XA 2A0CX 4LGHA 4M84A 3DFAA 3MFRA 3E92A 4YSJA 4RLLA 4RIWB 3JR1A 4ZK5A 3OWJA 3VO3A 1ZOGA 3MH3A 4Y83A 3THBA 4AXAA 1QMZA 2XRWA 4IVCA 1FBNA 4MXCA 3R1NA 3BWFA 3HMOA 4CT1A 3BPRA 4HVIA 5I9VA 3KXNA 4YZ9A 1F0QA 2GHGA 1Q8UA 4TPTA 5AIKA 2OXYA 4ASDA 4AW5A 5I9UA 3VRYA 5KHXA 4FC0A 4P4CA 1E9HA 3LMHA 3UO6A 3KFAA 3ELJA 3WF6A 1TQMA 1YWRA 3C7LA 1UWHA 3QQFA 4PL3A 5EDQA 3SAYA 3W1FA 4D1XA 4EK8A 1G8SA 3KULA 4A07A 4MNEB 4GJ2A 5HO6A 3FY2A 2PWLA 4QO9A 2H9VA 5JRSA 4EZ5A 1V0BA 3BYUA 3FY0A 3VUMA 1NT2A 1GNGA 4C4EA 1EZYA 4JXFA 1K3AA 3U6HA 3CD3A 1H25A 4XP3A 3AGMA 3V5LA 3I6WA 3K3IA 4FTRA 4RT7A 5EK7A 1PXPA 3PJ8A 4O0SA 4Y72A 4ASXA 2VTIA 1ZXEA 2ETMA 2A19B 2HK5A 3F3ZA 2ITZA 3AGLA 4HZSA 4KWPA 4PDOA 4KBAA 5E8WA 5HESA 5DBXA 4BYJA 4EJNA 4DFYA 3EB0A 5GIPE 4FKWA 3F9NA 3DXNA 3SXSA 3VUTA 3AD6A 2CKEA 3AC2A 5AV0A 2BIYA 2NRYA 3BV2A 4QNYA 4JBQA 3R22A 3BZ3A 3IO7A 3PZHA 3LFNA 4QPSA 3QKKA 2WEIA 5M44A 3BGPA 2YCFA 4CKIA 3O8UA 3CY3A 4JBOA 4RC3A 2UZEA 4EUUA 4RX5A 3FC2A 4NKAA 2QHMA 2NNWB 5EQEA 1GIJA 2PL0A 5KMKA 2VWWA 5I4NA 3H3CA 3MB6A 4NIFB 2YEXA 3HV6A 5HE3A 2EUFB 3AQVA 4O7TA 4YZMA 1L8TA 1MQBA 2DUVA 4UMRA 4C58A 5AP0A 4QTEA 5I9XA 2SRCA 2F2UA 3QC9A 2QG5A 5HIDA 4Q5EA 1BMKA 4RGJA 3T3UA 2PU8A 1CKIA 2C5XA 2W7XA 2ZAZA 3KEXA 4TKSA 1M7QA 1ZYDA 4FKUA 5AAFA 2YZLA 5DRDA 2PUIA 1YWVA 4J97A 4QYEA 4FG8A 2JDSA 2YM3A 2YWPA 3QWJA 1XWSA 1QL6A 5IZFA 3FC1X 3HRBA 1XHAA 4KS8A 5E8SA 1O6LA 3V8TA 1F3MC 3EFWA 4O22A 5M55A 4CYIA 4CNHA 3UIXA 1QPCA 3WF5A 4F7LA 2W4KA 2HZIA 2OWIA 2GNHA 2W05A 3G90X 4FTKA 3FXZA 3D9VA 2X9FA 4NWMA 5HU3A 4DGGA 2OJ4A 2ZVAA 5KCVA 2YIWA 2XCHA 4FT3A 4RWLA 1T45A 3JS2A 3OTUA 3EFKA 4XOZA 3F66A 5D12A 3W55A 2PMNX 1K9AA 2WAJA 1W0XC 3FPMA 4H58A 5GJGA 5C1QB 4AACA 5CVGA 3QLFA 4BB4A 5BVOA 2CN8A 3T9TA 4EZ3A 3DA6A 4PTCA 4J95A 5BUJA 3UNKA 4ZTNA 1YW2A 4Y95A 4A9TA 4DGLC 1RE8A 3UBDA 4BKZA 5HBJA 2VTQA 5M51A 4FE2A 4P5QA 2BROA 2XYNA 3MY5A 3SVVA 3EL8A 4DHFA 4LGDA 2P33A 4H39A 5KKRB 3CJGA 4FTTA 4DEIA 3LIJA 5TF9A 3MI9A 4GH2A 4RMZA 1SVHA 1ZWSA 2UZOA 2VWUA 3DY7A 3E62A 4XG6A 4YTCA 4RZVA 3ZRKA 2XA4A 3ROCA 3Q4UA 2ONLA 3HECA 4K77A 4TNBA 4D9UA 3W8QA 4JQEA 2O0UA 4EOOA 4X21A 4MK0A 4AGWA 3KN6A 3QZIA 5M07A 2BRBA 4X0MA 4XJ0A 4AN9A 2CNVA 5AFVA 5AP5A 2YZAA 3ZZWA 1PRYA 4I5CA 2QURA 4EBVA 3F2RA 3MB7A 1XKKA 1KE8A 3QQUA 1GAGA 3QQHA 3EN9A 1PXKA 4FNXA 4QYGA 4HZRA 3Q6WA 2BFXA 3TKIA 2WTKB 1KV1A 2VO6A 4I6FA 2DS1A 2EXMA 1PXIA 4ZP5A 4ZTSA 1OITA 3NEWA 4Y5HA 3PSCA 3NUPA 1KSWA 5IQCA 3OWPA 5H9BA 1FVVA 2B9IA 2KTYA 2QOLA 3BGQA 3KMMA 4RWKA 2PUPA 3CTJA 3KXZA 4JDKA 4UWCA 3C50A 3NNXA 3T3VA 4UN0C 3M11A 3F5XA 4EKDB 2PVKA 1FQKB 3OOMA 5CXHA 4DBXA 1HOWA 3A8XA 1OPLA 3R9HA 3LFSA 4I24A 4E4LA 1PMNA 5DO9B 1URCA 2OZOA 4GJ3A 2OJGA 3QTIA 2W1FA 1CKPA 5CSHA 3LJ2A 1OPJA 4O7RA 2X2KA 3TZ9A 3TZ7A 4D4SA 2YCSA 5JQ8A 5KKRC 3R9RA 2OH4A 4KKGA 3PUPA 4LL0A 1FVRA 2BZHB 3R8PA 2CKQA 3LW0A 3GC0A 5JK3A 4FR4A 1WBOA 2VTOA 2P0CA 3E8CA 3KGAA 4HJOA 5CNNA 5IG1A 3EHAA 2HENA 2UW0A 2J0JA 1M2PA 1ND4A 1R78A 4BBEA 4FTQA 3G5DA 3P7CA 3MBLA 2X8IA 4G3GA 4K1BA 3LLAA 1J1CA 4F9CA 5FG8A 2UW6A 3I5NA 5K0KA 1UNHA 4FT9A 3C0IA 3EJ1A 2HCKA 4I92A 4MX9A 5DEYA 3A7FA 4IWQA 4EH9A 2B53A 3TNHA 3MTLA 4I5MA 3HAMA 2XK3A 4U42A 4LFIA 5IUIA 2WTKC 2DYLA 2C6IA 2X7FA 2YFXA 4RJ7A 4O0YA 3ZFMA 4NM5A 4U7ZA 2XNBA 3QYZA 3FMDA 5AJQA 5B2LA 1P2AA 2RIOA 3PY3A 4J8MA 2JKKA 2UZTA 5HNIX 1YOMA 2C0TA 3F7ZA 2IZRA 2BILB 3GCPA 4FOCA 2ITQA 2PY3A 3P9JA 4TYEA 4V05A 1XH9A 4ACHA 5L3AA 3OWLA 3F6XA 4I21A 4RWIA 4ANQA 4I22A 5A46A 4YLKA 4QMOA 3RTPA 5FEEA 4I1ZA 4C4JA 4PL5A 3F7WA 5H3QA 3MVLA 2WMRA 4FSNA 3IGOA 2G1TA 2QVSE 4QP8A 2IZTA 3AC5A 4RX7A 4BCJA 2UW3A 3S3IA 1OL5A 4JT3A 3C1XA 4CYJA 3JUHA 2I7QA 3DK6A 3WF8A 3LVPA 4KINA 4YUQA 1ZYSA 4AZTA 3UC3A 3VS3A 5KUPA 3OXTA 5HBEA 5M4IA 2OLCA 2YIXA 4DFUA 5FUTA 4HNIA 4LV5A 5EDRA 4AZWA 4FZ7A 4BCHA 2IZUA 2WMSA 4R1YA 4JQ8A 1IG1A 5A9UA 3E7OA 4H3QA 5IQBA 2BZJA 2DWBA 3LCSA 1OIUA 2WU7A 1KE6A 5FBOA 4HYSA 2OICA 2HZ4A 2I0YA 2YM7A 3BELA 2BRNA 1YI4A 4AW0A 4C7TA 5L2WA 4XV2A 1WMKA 4XRLA 4AA0A 3R7EA 4TNDA 4H1JA 4CFFA 3NW6A 2PVNA 3KXGA 2XNPA 4L3JA 5E8VA 5LVMA 4IFCA 4XP0A 1CTPE 4QT1A 3TI1A 2BAJA 3U6JA 1OKWA 1TQPA 3DFCB 4JAJA 5JN2A 1LPUA 3NYOA 4BC6A 3RAKA 5IQDA 3NCZA 4B4LA 4JG7A 2UW8A 3D7TB 2GMXA 4V0GA 4RJ5A 4RVTA 3RM7A 5C4KA 4BTMA 4MCVA 1IA8A 2JEDA 4RJ6A 2BHEA 4TWCA 2VWVA 4YMJA 3GC7A 2JKOA 3UQCA 4WBOA 3L9MA 2XBAA 5J1WA 3TXOA 2F2CB 4CFXA 4R1VA 4CMOA 4WNKA 3ZC5A 3LM0A 4ONAA 3F3TA 4ZJJA 4K11A 4B6LA 4BRXA 2WELA 3FZRA 5CU0A 4FKTA 1PMEA 5AA8A 1KWPA 2QOCA 2YABA 2E2BA 4MXZA 2XF0A 3GNIB 4I23A 3U55A 2R4BA 2B7AA 3FZSA 2VTLA 4XG8A 3Q2JA 4IAKA 3R2YA 3H30A 4L00A 4N6ZA 5J5TA 4QP3A 4X7QA 3DB6A 4M69A 5HLPA 2V4ZB 2XJ0A 5IEVA 4HYUA 2RFDA 5L6PA 4MEDA 4CFUA 3L8SA 3UIUA 4NCTA 3VVHA 2C3IB 4IJ9A 3VUHA 4KB8A 1H0WA 4YJQA 4ENYA 2YWVA 4IDTA 2RGPA 2W1GA 4I5PA 5DIAA 3KMWA 3QLGA 3MW1A 3PDTA 4MKCA 4WKQA 4R8QA 3DKGA 3Q2MA 4P5ZA 3QTSA 3E64A 3NVKI 4EZ7A 2B9FA 4H3BA 3EKKA 4FV2A 2JBOA 4AA4A 3ENHA 4E6DA 3PWDA 4YHFA 5A3XA 5FEDA 5DN3A 2GQGA 2QOOA 3BEGA 5FXSA 4OTIA 5LOHA 1UKHA 3H4JA 3R1QA 5F20A 3QTQA 5K4JA 2PE2A 4IZAA 4FTMA 2GHLA 4QTCA 2IW8A 4AZVA 4I4EA 4FKJA 5K5XA 5HCZA 4PNKA 3KRRA 3PY1A 3KF7A 4J71A 2QLQA 4FL1A 3RK9A 4JDHA 4C59A 4EORA 2JAVA 5GZ8A 2QO2A 3GBZA 3FMMA 3BGZA 5CI6A 5BUIA 3P08A 3R71A 2XM8A 3TACA 4BIDA 2BCJA 1UNLA 3G9NA 4IWDA 1Q3WA 2BAKA 2ZOQA 4EYMA 1ZRZA 4BDDA 1Q3DA 5TKDA 2WQMA 4AN3A 4LRKA 3FDNA 4KBKA 3JY9A 2OI4X 4L9IA 5FTQA 5IDNA 2PSQA 3UPZA 4NM0A 2RFSA 4AG8A 5IQHA 2OBJA 3ZSHA 3KULB 1H1PA 1H26A 1YXTA 3HVCA 3OCBA 4RX9A 5HCXA 3ZHPC 3ZYAA 1BI8A 1NVSA 5HLWA 5JSMA 5M4CA 4DCAA 1W8CA 3C0GA 3DJ7A 3VS4A 5AUVA 3MVMA 3PFQA 4MXYA 3HX4A 4PPBA 5CI7A 2ZM4A 5CAOA 3G33A 1VYWA 4HVHA 4EOPA 4FVPA 3MFUA 4E5WA 3WZDA 4DH5A 5TOZA 2WO6A 5J5SA 2WIHA 5IQAA 4DYMA 2VO3A 4N0SA 5IKWA 3ZOSA 4PDYA 4ZZMA 5KMMA 4CLJA 3QRIA 1JSUA 1OKZA 4IEBA 3NVMB 3IPHA 4S33A 3U87A 4LOPA 5IMXA 5EG3A 3L8VA 2EXEA 3QXPA 2FSOX 3NDMA 4PPAA 4XG4A 1Y6BA 4EKKA 3EZRA 2QR7A 4YJRA 5ETAA 3C51A 2B54A 4JG6A 4O91A 2H34A 3KCKA 5CF4A 4H05A 5JFVA 3PA4A 4RQKA 2J9MA 4IAZA 3VBTA 3MFTA 3Q53A 4G3DA 1H07A 2HWOA 4FL2A 2V7OA 3P4KA 4FICA 4EOSA 1PF8A 2BDFA 5A54A 2Z02A 3KN5A 3V6RA 2Z7SA 4ERWA 4XV1A 4RJ3A 4IIRA 2F7ZE 5IDPA 5DPVA 1Q4LA 3TIZA 1AGWA 4R3PA 3DAEA 1U5RA 2JBPA 3MGYA 5AUTA 2VNYA 2WXVA 2X4FA 4TN6A 5C9CA 4F99A 1XH8A 4D1ZA 3DXQA 3DK7A 3NNWA 1DS5A 4Z7GA 3EQFA 4BF2A 3FYKX 4UBAA 4BYIA 4KIOA 4TYIA 5E1EA 2YDKA 4LI5A 5KX8A 4M8TA 2W5AA 3MN3A 4ZS0A 4F9BA 5A4QA 5IA0A 4JG8A 5AX9A 2VRXA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3NYV A;  2VTS A;  5HCY A;  3VC4 A;  4CZT A;  3D7T A;  3G9L X;  1ZYL A;  2W96 B;  2Y4I C;  3JVR A;  4GUE A;  4YBK A;  4YPD A;  4NM3 A;  3FL4 A;  1GZO A;  2NRU A;  1H1R A;  3MES A;  5EDP A;  2R2P A;  5D10 A;  4O1P A;  3RCD A;  4N57 A;  3PXR A;  1E1X A;  2HZ0 A;  3QA8 A;  4XX9 A;  5LQF A;  4D2S A;  3V3V A;  1WZY A;  5KZ0 A;  3UPX A;  2O5K A;  2DQ7 X;  1NVR A;  3ZLW A;  1P4O A;  3PJ3 A;  4JBP A;  2QQ7 A;  4U3Z A;  4A9R A;  3LFF A;  3ID6 C;  2IHD A;  3ZSG A;  3JPV A;  1XJD A;  3BHU A;  4CG9 A;  2AYP A;  1UU3 A;  4FUY A;  1EMU A;  1SVE A;  3IG7 A;  5AUY A;  4TTH B;  3WOW A;  2IHB B;  4OT6 A;  2EB3 A;  3NYN A;  3FSK A;  2C3L A;  3FWQ A;  3OWK A;  4U0I A;  5JH6 A;  3BV3 A;  5CAQ A;  2PMO X;  5HNB A;  1CM8 A;  2C6E A;  3QX4 A;  2XEY A;  5DA3 A;  4BDK A;  2WKM A;  3T8O A;  3PXQ A;  4RQV A;  3CQE A;  3RZB A;  3W2C A;  4ITI A;  3RHK A;  4CKR A;  3VS0 A;  4D2V A;  4PTE A;  1TQI A;  4PRJ A;  3FZO A;  2JGZ A;  2VO7 A;  4UMU A;  2CKP A;  4C4I A;  4J99 A;  2E9V A;  5CQU A;  4Z7H A;  3VN9 A;  5BYY A;  2ITO A;  3UYT A;  4JVG A;  4KIK B;  2W4O A;  2IN6 A;  5EI8 A;  4P2K A;  3GT8 A;  1ZYJ A;  3CP9 A;  5F4N A;  5JFX A;  5IQI A;  4G5P A;  2FYS A;  4LM5 A;  2VTP A;  3BE2 A;  4C38 A;  2X0G A;  2XP2 A;  3GXL A;  5LCK A;  1PKD A;  4KSQ A;  2GQS A;  1M14 A;  2E9U A;  4G6O A;  4QPA A;  5GHV A;  3FMN A;  4TW9 A;  1RW8 A;  4RLK A;  3A61 A;  3D5X A;  2A0C X;  4LGH A;  4M84 A;  3DFA A;  3MFR A;  3E92 A;  4YSJ A;  4RLL A;  4RIW B;  3JR1 A;  4ZK5 A;  3OWJ A;  3VO3 A;  1ZOG A;  3MH3 A;  4Y83 A;  3THB A;  4AXA A;  1QMZ A;  2XRW A;  4IVC A;  1FBN A;  4MXC A;  3R1N A;  3BWF A;  3HMO A;  4CT1 A;  3BPR A;  4HVI A;  5I9V A;  3KXN A;  4YZ9 A;  1F0Q A;  2GHG A;  1Q8U A;  4TPT A;  5AIK A;  2OXY A;  4ASD A;  4AW5 A;  5I9U A;  3VRY A;  5KHX A;  4FC0 A;  4P4C A;  1E9H A;  3LMH A;  3UO6 A;  3KFA A;  3ELJ A;  3WF6 A;  1TQM A;  1YWR A;  3C7L A;  1UWH A;  3QQF A;  4PL3 A;  5EDQ A;  3SAY A;  3W1F A;  4D1X A;  4EK8 A;  1G8S A;  3KUL A;  4A07 A;  4MNE B;  4GJ2 A;  5HO6 A;  3FY2 A;  2PWL A;  4QO9 A;  2H9V A;  5JRS A;  4EZ5 A;  1V0B A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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