3LJ1A

Ire1 complexed with cdk1/2 inhibitor iii
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
427
structure length
404
Chain Sequence
NFEQSLKNLVVSEKILGYGSSGTVVFQGSFQGRPVAVKRMLIDFCDIALMEIKLLTESDDHPNVIRYYCSETTDRFLYIALELCNLNLQDLVESYNPISLLRQIASGVAHLHSLKIIHRDLKPQNILVSTSSRFTADQQTGAENLRILISDFGLCKKLDSGQFRTSGWRAPELLEESNNLQTKRRLTRSIDIFSMGCVFYYILSKGKHPFGDKYSRESNIIRGIFSLDEMKCLHDRSLIAEATDLISQMIDHDPLKRPTAMKVLRHPLFWPKSKKLEFLLKVSDRLEIENRDPPSALLMKFDAGSDFVIPSGDWTVKFDKTFMDNLERYRKYHSSKLMDLLRALRNKYHHFMDLPEDIAELMGPVPDGFYDYFTKRFPNLLIGVYMIVKENLSDDQILREFLYS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Flavonol activation defines an unanticipated ligand-binding site in the kinase-RNase domain of IRE1.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase/endoribonuclease IRE1
molecule tags Transferase, hydrolase
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 107
structure length 404
sequence length 427
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2010-01-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06479 Ribonuc_2-5A Ribonuclease 2-5A
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3lj1A02
1.20.1440.180 Mainly Alpha Up-down Bundle de novo design (two linked rop proteins) de novo design (two linked rop proteins) 3lj1A03
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3lj1A01
5L8KA 4FTUA 3F66A 2RG6A 3AGLA 4FVRA 3U9NA 3QQLA 3BGZA 4DFNA 2XBAA 2BRHA 3EYHA 4D4SA 5CSVA 2B7AA 4KINA 5AP1A 4YHTA 4JR3A 1H8FA 4BGGA 3BEAA 5IH4A 4CFFA 3FMLA 4PX6A 4BWPA 3C0IA 3MY1A 4CYJA 5H3QA 1M7NA 5DA3A 5KBQA 4N57A 2X8DA 4I4EA 3B8QA 5AIKA 3VS3A 4ZLYA 3LCDA 5A4TA 3KN5A 4KKEA 4Z16A 3ZRLA 2ZV7A 5BNJA 5LWNA 4YTIA 3MH0A 4QP9A 3GB2A 4YJUA 3KK9A 5BMMA 4EOKA 1SMHA 5AWMA 4IVBA 4QQCA 2HYYA 2OO8X 5J95A 5CVFA 4DAWA 2JLDA 4LL5A 4QNAA 4BDFA 4UXQA 5HU9A 3EL7A 3ELJA 2QR7A 2XK7A 3QUPA 3VBYA 1FPUA 3POOA 4GFMA 3RAIA 2Y7JA 3FKLA 4ZZNA 4GYIA 4XG6A 3UOKA 4ZLOA 5L6PA 1PJKA 3R9RA 4GS6A 4I5MA 4R3PA 2OF2A 4UB7A 3ZCLA 4CG9A 4RIOA 3COMA 1NVQA 2VWVA 5FXSA 4O81A 1PXNA 4K6ZA 5FTQA 5GIOE 2G1TA 4ZS0A 3FI3A 3KXMA 3BYSA 2P3GX 2PMIA 3R83A 2XCHA 2AC3A 2QG5A 3NS9A 3EQBA 1OL6A 3NUSA 3MWUA 3VQUA 1Q8TA 3VULA 3V51A 5CEOA 2YFXA 3R8ZA 1H1SA 4XV1A 3BKBA 2PULA 3NYVA 4EZ5A 4L01A 2WEVA 2C5YA 3DJ7A 4RJ5A 3UG1A 2IVTA 2OXXA 3K5UA 2GTMA 4M84A 4IIRA 2BTRA 3D5VA 4GL9A 4WRGA 3HMPA 3SX9A 3ET7A 4GG7A 4H3BA 4AAAA 2Q0BA 4RFYA 4AFJA 4K8AA 1MUOA 4C4EA 3U4UA 3FZOA 4C3RA 3POZA 4O2PA 4F64A 5E8VA 4ZZMA 3KC3A 3WF8A 4O0SA 4FEXA 2BRBA 4DC2A 4QMZA 5CNOA 3VNTA 3W2RA 4J8NA 4ASEA 2CDZA 2C6TA 4FTNA 5LCJA 4PL5A 4D55A 3TWJA 5IZFA 3R0TA 2R3RA 1FVVA 3LJ1A 2C6IA 4OUCA 3HP2A 3FKNA 3UC4A 4AZTA 2XIYA 3D0EA 4PPAA 4FC0A 3UQFA 1ZMUA 5E92A 2R0UA 2X39A 1LR4A 1O9UA 2R3GA 4HCVA 3ORPA 4OTFA 2R3IA 1WMKA 4BC6A 4C02A 3ID6C 5E1SA 4XLIA 3WZDA 4YU2A 3UVRA 3NX8A 1APME 4FV5A 3L8VA 3ALNA 3E7VA 3E3BX 4R1VA 2IN6A 3CEKA 4TYIA 4FODA 4ZZOA 4BY9E 3VBWA 2RIOA 4XOZA 2XYUA 3CS9A 4KBKA 3PWDA 2R3QA 3ZTXA 3O2MA 2W9ZB 3AC3A 4ZSGA 3DXPA 3GXLA 4TN6A 4JDKA 4J7BA 2QKWB 2ITYA 2UVYA 3WZKA 4CT2A 3OROA 2LGCA 2REIA 2QQ7A 4BCMA 3DAKA 4LV5A 4IB0A 5HKMA 3E62A 4HVDA 1YI4A 5M08A 4JQ8A 2DWBA 1WCCA 3L9PA 1YWNA 5IPJA 5AEPA 4X2FA 2EXEA 1IA9A 2UW6A 5CAOA 2CNVA 3G51A 4K77A 2C5XA 5CEIA 4HYUA 5JEBA 2EWAA 3FQSA 2HWOA 4YTHA 2CKOA 1SNUA 4TYHA 5GNKA 4FKJA 5JFSA 3LMGA 5AV1A 4XEYA 1YW2A 1XH6A 4FKWA 4D1SA 1G5SA 3DNEA 4HZRA 3ZXZA 5CWZA 3GNIB 3WYXA 2QO7A 2J50A 4DCAA 3QRUA 3KEXA 4X21A 4B8MA 2F7XE 4M8TA 3SRVB 3U51A 4RIXB 5CSPA 2UW5A 3GGFA 2R0IA 2YM3A 4RX8A 3TJCA 3I0QA 3OZ6A 2FA2A 3DDPA 4H3PA 2BAJA 3QWJA 3UP2A 4CD0A 4D2VA 5M53A 1W83A 4RWJA 3SV0A 3PWYA 3SOAA 4AZWA 4OGRA 4F09A 1Y6BA 2BKZA 4FG8A 4CNHA 4QPAA 3FLNC 3QL8A 3M11A 5HD4A 3H9FA 4DGNA 4TXCA 4L53A 3BV2A 5CEQA 3CTHA 3L9MA 4K2RA 3E87A 5CAPA 3VHKA 3DGKA 4IZAA 5AJQA 3AC8A 5B2MA 4E7WA 2I0EA 3VIDA 5J1VA 4NH1A 3DXNA 3FI2A 4YC8A 3W2SA 5HE2A 4QYEA 5K0XA 4JLCA 4I21A 4I5PA 4QYHA 4QP1A 3UTOA 1KWPA 4DBNA 3CGOA 2XK9A 3D2IA 2PE2A 4WNKA 3RAKA 2YJRA 4RJ8A 4E5WA 4M68A 4CFWA 4L8MA 2ESMA 5ACBC 3KMWA 3OWJA 5E8ZA 3PJCA 4EOMA 3NAYA 3N9XA 5I9UA 3ZBFA 3I7BA 4QTDA 2JBOA 3REPA 2Q0NA 2CGVA 4QMYA 2VTMA 2ERKA 5BYLA 5K4IA 2BPMA 3SD0A 3NNUA 1AQ1A 4MD7E 5CU4A 3VJNA 3LLTA 3OG7A 1JBPE 4KIOA 2BFXA 4ANBA 2B53A 4ZTMA 4D9UA 4DLIA 5CU0A 2R3MA 3BQCA 3NIEA 3C4FA 1Y91A 2HZNA 4XG7A 1B6CB 4QMTA 3BBWA 4WUNA 5CF4A 4E6CA 1BI8A 3F9NA 3QQUA 2YCQA 3MB7A 1ND4A 4OTQA 5GZ8A 3N4TA 2WFYA 1K9AA 5DR9A 4RIWA 3UZPA 3ZZEA 5HU3A 4H1JA 3TUCA 4O7RA 4NCTA 4L44A 3DB6A 1H1RA 1RDQE 5F4NA 4TNDA 4BDJA 2GNGA 4OT5A 4I5HA 4XUFA 2VTIA 4GT3A 4DFZE 1QCFA 4CRLA 4Q2AA 4L7FA 3PPZA 2C6DA 3FZPA 5LWMA 3NZ0A 5HTBA 1MP8A 4M67A 1HCKA 5JGAA 4AACA 3E3PA 4BYIA 5HQ0A 5JH6A 3C5UA 1LEZA 3L1SA 3D83A 1RJBA 5L2SA 4YUQA 4JRVA 2VZ6A 4JIAA 4AX8A 2B0QA 5A3XA 3QU0A 5HTCA 1G3NA 4MWHA 3DT1A 1BUHA 4MWIA 3P9JA 1PXMA 4U44A 5DRDA 2B55A 2GS7A 4V0GA 4AZSA 4RC4A 3DK3A 3JVRA 5HLPA 3Q4ZA 3ZRMA 2WGJA 5B2KA 2WMBA 3N4VA 4RLKA 3UIUA 4RC2A 2QC6A 4YJQA 5L2QA 4KBCA 4YJSA 3S95A 5CSHA 4L9IA 2I40A 3CQWA 4WO5A 2KULA 5M07A 4D2RA 3EQCA 1BI7A 5LMAA 1OKZA 5IMXA 5KUPA 3DQWA 4DF3A 4FVQA 4MXYA 2HAKA 3ZHPC 3ZEPA 4B0GA 2GHMA 2OJFE 3CD3A 3FMKA 4TWPA 4Y46A 3RHXA 3PA3A 5FXRA 4G5PA 4NCTC 3GU4A 3OP5A 4M3QA 4E26A 3TKUA 4BDEA 4I22A 4JG7A 4JVGA 4NTSA 5EKOA 4YHJA 3OFMA 4ASXA 4LI5A 3W18A 3RCJA 1IR3A 4NWMA 4TTHB 4BI1A 4CT1A 4ONAA 3PJ1A 2JAMA 2WAJA 3D7ZA 3QUDA 3BGPA 3GUBA 3RK9A 4KIQA 2GHGA 2GPHA 5DRBA 2J2IB 2Y9QA 1FMKA 5EYDA 4AA5A 3D9VA 1GZNA 3CKXA 4O2ZA 4N4SA 5CX9A 2Y6OA 4PWNA 3TEIA 3R2YA 1U54B 3O8PA 4TPTA 3V8WA 5IEXA 2I0VA 5AUUA 4Z55A 3MPAA 4GV1A 1UVRA 3QAME 3E7OA 5HORA 3ORXA 5A9UA 4OBQA 1H28A 4GK2A 3PA5A 3FXWA 3HAMA 1IAJA 2RFEA 4MXZA 4R6VA 4FKLA 3NRMA 1JNKA 4WA9A 4LQMA 3UOLA 4EKLA 2W99B 4EH2A 4O21A 4E73A 1DI8A 3C9WA 4AT3A 5EW9A 4I93A 4NM0A 3L9NA 1K2PA 5AP6A 5JFVA 3QQFA 5A46A 5DPVA 3OOGA 3SG9A 2VO7A 2X2LA 3FMNA 3RPYA 5IKWA 2BTSA 5FTOA 2X9FA 1OECA 3BWJA 3ORZA 4CFUA 5BVNA 4CQGA 4BWXA 3NYOA 5FWKK 3RNYA 3F2RA 1WFCA 4PF4A 3H9OA 4FL3A 3PJ2A 5L2WA 4FV2A 5FM3A 5HNGA 2OXYA 2OZAB 4EOQA 1MRUA 4CTCA 2X4FA 4BTJA 5M56A 2R2PA 4GUBA 3Q5IA 4CQEA 4MQ1A 1BL7A 4PTEA 2P2HA 4YGAA 2IZSA 4J97A 3QZFA 1DAWA 5IUHA 2B52A 3MJ1A 3NVKI 2XF0A 4E1ZA 3ZO1A 5JFXA 4BTMA 4E4LA 1OUYA 4B4LA 4E20A 3BHUA 5F9EA 3F3TA 4BGHA 2WTJA 5BVDA 2ZMDA 3CXWA 3GU8A 3D7TB 4U81A 4Y83A 5HZNA 1CM8A 4XP0A 3CGFA 4XS2A 3VF9A 1T45A 4HYHA 2HIWA 5JQ8A 4L67A 2W1IA 3F5PA 3QTZA 3FMEA 4FV6A 4TYJA 4I6HA 4LYNA 4QMXA 5A4EA 3GVUA 3FHIA 2GNFA 3P5KA 4YLLA 5T68A 3V3VA 3DTCA 2ETMA 3QRJA 4E93A 2OJJA 4L46A 3VO3A 3A60A 3MJ2A 3OY3A 5CZIA 4E8AA 5DG5A 1FGKA 3H3CA 3F3VA 1CSNA 2F4JA 1O6KA 5CI7A 2YAAA 3P7CA 5CF5A 4YNOA 2F2UA 5IQBA 3DFAA 3EWHA 2WOTA 2Z60A 5EQYA 2RSVA 3HECA 2QNJA 4YJPA 2NRUA 4YJNA 5CSXA 2O64A 3AC1A 4RFMA 3MVJA 3NUYA 4RVKA 2X9EA 5AUXA 5C26A 4CG8A 2F2CB 1ZARA 5CSWA 4ZK5A 3SXRA 4IX4A 5FDPA 1ZZLA 4IB5A 2R3LA 4ALWA 5M4IA 3LAUA 3PY3A 4RJ4A 5EG3A 4QMOA 4RBLA 2QU6A 4HZSA 3OBJA 3QZIA 4I20A 3HP5A 3LKMA 3S4QA 3LJ0A 3BEGA 3QYWA 1BLXA 1FGIA 4NW6A 5HCZA 3MPMA 5CQUA 1XHAA 3GEQA 1DS5A 2R3KA 4OR5A 5F20A 4BB4A 3MBLA 3B2WA 4RWKA 3UODA 3DY7A 5LOHA 3VS7A 4CMUA 3ZLSA 4EK5A 1YHWA 3EQIA 4AGDA 1H4LA 4LM5A 5JFWA 2R5TA 2HY0A 2W4OA 4OLIA 1OZ1A 2YWPA 3PFQA 4IWQA 3TZ7A 4F7LA 4EJ7A 1PW2A 2GHLA 1BYGA 2UW7A 3GOKA 2CN5A 3CCNA 5CQWA 4AT4A 5LMKA 3PTGA 2VO6A 3EIDA 5GJDA 3ZZWA 3LLAA 2BR1A 5I4NA 5TOZA 3UC3A 5BUJA 5E1EA 3BV3A 2ONLA 5EQEA 4ZSLA 3OCBA 3SW7A 4FSQA 3HGKA 3DOGA 5G6VA 4MBIA 2PZ5A 1SYKA 3FMMA 2E9NA 3W10A 4FTIA 2QLUA 1FOTA 4HGLA 5DNRA 5ETFA 4JX3A 1S9JA 4C0TA 2PWLA 3C13A 3EMGA 2A19B 3NLBA 4Z3VA 3D15A 4TZRA 4Y73A 4OAVB 1OM1A 2G2FA 2PVMA 3G90X 4E4MA 1LP4A 4TL0A 3FYKX 3C50A 4MXAA 2VTSA 3F61A 2XM9A 4TWNA 1YDSE 4PUZA 4EQUA 4ZAUA 2Z8CA 3U6IA 2PVNA 1OITA 3QTSA 4F70A 4QP7A 3RJCA 2H96A 4FTOA 4IVDA 3PP0A 4YC3A 4FNZA 4IWPA 4CFMA 4UWYA 1Q62A 2UVXA 3TG1A 4ASDA 4A9RA 4C4HA 1UKHA 3QGYA 2A1AB 2O3PA 4UYAA 4E4XA 4AQCA 2Y4IC 5LMKC 1H25A 4EYJA 4KABA 5AP0A 4FEUA 4GJ2A 4BCOA 3AOXA 5KMOA 2FUMA 5D7VA 3KCFA 3BYOA 3DXQA 4O83A 1SM2A 3ZFYA 5JGDA 5FRIA 2XIXA 2CNQA 3R7OA 3C0HA 2OJGA 3FHRA 5KKRB 1KE5A 5KE0A 1CTPE 3PIZA 5CENA 4GYGA 3R9OA 2PUPA 4RSSA 4BI2A 4OTRA 1K3AA 2FB8A 2ZVAA 1JSTA 2BDWA 2BRMA 3K3JA 1Q8WA 5GZAA 4BDBA 4KS7A 4BZOA 4IFCA 2C3JA 4DTAA 4QMLA 3KULA 1WVXA 4LOOA 4YLJA 5KMIA 1URWA 3V5PA 4IAFA 3MPTA 4EUTA 3ANRA 2QONA 3UQCA 2IJMA 2VWYA 1JKSA 1X8BA 4CLJA 3R7EA 1M7QA 2I7QA 1WBTA 3MFTA 4XV2A 4FT0A 3RPRA 4L68A 4AA4A 3NR9A 3S0OA 4ITIA 2P0CA 1J7IA 5JN2A 3RAHA 5AADA 3KXXA 3Q96A 3R7UA 2R3JA 3QWKA 2ETKA 2WXVA 4MNEA 4XP3A 5E8UA 4HPTE 3QCSA 3KVWA 3RP9A 3EQDA 4ZP5A 4X3JA 4BVUA 1G8AA 1OMWA 1LEWA 3E92A 3TN8A 5CAQA 5HBJA 3E88A 5E8WA 5TE0A 1PMUA 4QTEA 5DT0A 5HVJA 5M51A 5K4JA 4F9YA 1H1WA 2JAVA 3COKA 3FQEA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5L8K A;  4FTU A;  3F66 A;  2RG6 A;  3AGL A;  4FVR A;  3U9N A;  3QQL A;  3BGZ A;  4DFN A;  2XBA A;  2BRH A;  3EYH A;  4D4S A;  5CSV A;  2B7A A;  4KIN A;  5AP1 A;  4YHT A;  4JR3 A;  1H8F A;  4BGG A;  3BEA A;  5IH4 A;  4CFF A;  3FML A;  4PX6 A;  4BWP A;  3C0I A;  3MY1 A;  4CYJ A;  5H3Q A;  1M7N A;  5DA3 A;  5KBQ A;  4N57 A;  2X8D A;  4I4E A;  3B8Q A;  5AIK A;  3VS3 A;  4ZLY A;  3LCD A;  5A4T A;  3KN5 A;  4KKE A;  4Z16 A;  3ZRL A;  2ZV7 A;  5BNJ A;  5LWN A;  4YTI A;  3MH0 A;  4QP9 A;  3GB2 A;  4YJU A;  3KK9 A;  5BMM A;  4EOK A;  1SMH A;  5AWM A;  4IVB A;  4QQC A;  2HYY A;  2OO8 X;  5J95 A;  5CVF A;  4DAW A;  2JLD A;  4LL5 A;  4QNA A;  4BDF A;  4UXQ A;  5HU9 A;  3EL7 A;  3ELJ A;  2QR7 A;  2XK7 A;  3QUP A;  3VBY A;  1FPU A;  3POO A;  4GFM A;  3RAI A;  2Y7J A;  3FKL A;  4ZZN A;  4GYI A;  4XG6 A;  3UOK A;  4ZLO A;  5L6P A;  1PJK A;  3R9R A;  4GS6 A;  4I5M A;  4R3P A;  2OF2 A;  4UB7 A;  3ZCL A;  4CG9 A;  4RIO A;  3COM A;  1NVQ A;  2VWV A;  5FXS A;  4O81 A;  1PXN A;  4K6Z A;  5FTQ A;  5GIO E;  2G1T A; 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