3FBVA

Crystal structure of the oligomer formed by the kinase-ribonuclease domain of ire1
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
418
structure length
415
Chain Sequence
LKNLVVSEKILGYGSSGTVVFQGSFQGRPVAVKRMLIDFCDIALMEIKLLTESDDHPNVIRYYCSETTDRFLYIALELCNLNLQDLVESKNVSDENLKLQKEYNPISLLRQIASGVAHLHSLKIIHRDLKPQNILVSTSSRFTADQQTGAENLRILISDFGLCKKLDSGQFRNLNNPSGTSGWRAPELLEESTKRRLTRSIDIFSMGCVFYYILSKGKHPFGDKYSRESNIIRGIFSLDEMKCLHDRSLIAEATDLISQMIDHDPLKRPTAMKVLRHPLFWPKSKKLEFLLKVSDRLEIENRDPPSALLMKFDAGSDFVIPSGDWTVKFDKTFMDNLERYRKYHSSKLMDLLRALRNKYHHFMDLPEDIAELMGPVPDGFYDYFTKRFPNLLIGVYMIVKENLSDDQILREFLYS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The unfolded protein response signals through high-order assembly of Ire1.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase, hydrolase
source organism Saccharomyces cerevisiae
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase/endoribonuclease IRE1
total genus 112
structure length 415
sequence length 418
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J, K, L, M, N
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2008-11-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06479 Ribonuc_2-5A Ribonuclease 2-5A
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3fbvA02
1.20.1440.180 Mainly Alpha Up-down Bundle de novo design (two linked rop proteins) de novo design (two linked rop proteins) 3fbvA03
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3fbvA01
2C5OA 4TWNA 5AJQA 4QYFA 4HZRA 4KA3A 5KE0A 2JIUA 2JFMA 2PVYA 2RG5A 1UU7A 4BIBA 1PXLA 2XNGA 2GTNA 3KF7A 4QYEA 5AR5A 4IBMA 4AF3A 3VS3A 4IAYA 1KWPA 4BCGA 4FE2A 4DH5A 1NA7A 5HCZA 3TCPA 3OW4A 3NLBA 3PA5A 3Q4UA 4F64A 2VTQA 3BHUA 3MH0A 3DBQA 2G01A 4FIGA 3TJCA 2WD1A 3TNIA 4EOQA 4YSJA 2F2UA 5E4HA 3QTSA 3KFAA 3BKBA 3R7EA 5ANKA 3E88A 4EUTA 4CRLA 4YJNA 4AGWA 1U59A 4L9IA 4ANQA 1R1WA 2EXMA 2EUFB 4PQNA 5E8YA 4CYJA 2C6LA 2XIXA 1W8CA 3U87A 5D9HA 4RC2A 4TN6A 5HIDA 4ZJIA 3UIXA 1M2PA 4BDAA 4S30A 1PMVA 3PVUA 3R1QA 2UZBA 1I09A 3Q52A 4G34A 5F95A 3ZH8A 4D5HA 4D4YA 4P5ZA 4M0ZA 4DA5A 2W05A 4NJDA 1CM8A 2J2IB 3E64A 3RK7A 3TV4A 2WQEA 2I7QA 2O3PA 2G1TA 4PP9A 2HZIA 4YJVA 2CCHA 4IW0A 3BEAA 4RC3A 3SW4A 2XH5A 1H28A 4H05A 4I5PA 4EZ3A 2OWBA 3REPA 2XM8A 5EK7A 2QO7A 5HGIA 4FKQA 4EKLA 1G8SA 3O7LD 5L2WA 1OPLA 3FHIA 3ACKA 3E8DA 2P33A 4MKCA 3ZC5A 4A9UA 4TXCA 2FB8A 4QQJA 4LGGA 4P5QA 4Y85A 4XV1A 2W9ZB 1J1BA 4WHZA 2WTKB 3NRMA 3PYYA 4K77A 5HNGA 3VQHA 2Z7SA 4OTQA 2QOIA 1Q8ZA 3CTHA 4DCEA 1KSWA 2X7OA 4AW2A 3FYJX 1DAYA 3R30A 3MV5A 2ITWA 4FKWA 4PL3A 3FJQE 3RPYA 4EOKA 5CU0A 1XH9A 2GNLA 3ZC6A 5IMXA 2YFXA 3NUSA 3G51A 2SRCA 3K3JA 1Y6BA 3PIYA 4EHGA 2R3RA 4G16A 4QP2A 3F5GA 5L6PA 5BUEA 1OITA 2R7IA 2FUMA 2ETRA 5GJGA 4O27B 1UA2A 2X9EA 1RDQE 4QOXA 4I5HA 4X2GA 1PYXA 5B2LA 2Z7LA 3LFAA 4FL3A 2ONLC 3TKUA 4X3FC 3QCSA 3D15A 2H96A 3GC0A 4ARKA 5J9ZA 4XRJA 5BNJA 3V5TA 4ENYA 2JDTA 2BCJA 4G3CA 1QCFA 3UODA 4C37A 1ZARA 2G9XA 4FICA 4YU2A 4ZZOA 3C4EA 2BDFA 2Y0AA 1OKWA 2W1CA 4GUEA 4L8MA 3SKCA 4KBAA 4U8ZA 4BTJA 3AQVA 2XIKA 4F7JA 4CEGA 5M4FA 3FV8A 1OECA 3I5NA 5M51A 5JSMA 2WTJA 5C01A 2C6OA 3B8QA 3W2RA 2JIIA 4DEGA 4PPAA 3TNQB 2ZVAA 2WHBA 2PMLX 2IW9A 4WG3A 3A2CA 2WTIA 2XNEA 3FMMA 4KRDA 2IJMA 2W4JA 4YBKA 5GIOE 5M07A 2WO6A 4RPVA 4DEIA 4IJPA 3BE2A 4X6QC 4ZTQA 2BR1A 2B52A 2IVTA 4K33A 2VO3A 4C4IA 4XG7A 4NEUA 3R9OA 4F9BA 2RKUA 2GMXA 1JLUE 4QMXA 5IA1A 3UIUA 3KRRA 3CKXA 3ZDUA 3MY1A 4QYHA 2XEZA 4AP7A 4WG5A 1UU9A 5GIPE 3F7WA 4IZYA 4FF8A 1ERKA 3LIJA 2OICA 4I0TA 4WD5A 5FP5A 5AADA 4BDDA 2XNBA 4IC7A 2QOOA 3R7IA 1TQIA 2VWXA 3ZRMA 3ODZX 4IE9A 3PXKA 2GS7A 4OTIA 4RX7A 5EOBA 1Q3DA 3FMJA 5J8IA 3RHKA 2BHHA 2BVAA 4M13A 1Q61A 3GEQA 5HVYA 3RMFA 3NR9A 4C3PA 3DNDA 3W8QA 3ZLWA 4WSYA 5FD2A 1V0PA 3OCTA 2OBJA 1W84A 2UUEA 3HMIA 3R02A 5DR9A 4E73A 3FBVA 4E3CA 5E9EA 5C8NA 4JAIA 3MPTA 2C6TA 3IDPA 2DYLA 1BMKA 2QD9A 3GNIB 2ETKA 4CT2A 3I0OA 5JT2A 4YJUA 5L2QA 3GU5A 3N4UA 3WZDA 4ACMA 3IDBA 3MA6A 3ZONA 2O0UA 3VW8A 1OPJA 2P55A 2VTLA 3R73A 4I5MA 3C1XA 2ZM3A 3R7GA 5A4TA 4ZTNA 3PPZA 4XEYA 5EOLA 1XH7A 4Y95A 3HAVA 5I5ZA 4O38A 2BROA 4AOIA 5AUTA 4F7NA 3EQRA 2BMCA 4GU6A 5K9IA 2ITVA 3S95A 4HGTA 3V3VA 4GFOA 5D7AA 3MFTA 4BTFA 3KC3A 3R1YA 1FMKA 1XH4A 2PSQA 4CTBA 1CKIA 5CF8A 3WE4A 2WGJA 5EKNA 2X7FA 2FA2A 4K6ZA 4QMTA 4S2ZA 5CSHA 1WFCA 4MX9A 4EK5A 4IZAA 2GFCA 5AP2A 2VTNA 2Y6MA 3BYVA 3NIZA 4E5WA 4MEDA 2UV2A 3Q4ZA 4LOPA 3C9WA 3DBDA 4MQ2A 4RLKA 2Z7QA 3W55A 3MH2A 3A7GA 4FV3A 3WARA 4BDBA 5CI6A 5BVWA 3R7UA 4OTRA 3BLRA 3PXYA 4OBPA 2XKFA 4EOSA 3A62A 2ERZE 4IWQA 1JSVA 3HAMA 4EH2A 1UNHA 5IUIA 3LJ1A 2A27A 4IAFA 4JR7A 5DA3A 4FOCA 5IQCA 5J87A 5LVLA 3FSKA 5FTGA 4EQCA 4B6LA 2HY0A 5EW8A 1WBPA 3AT4A 4J71A 4NW6A 4GYIA 4WNOA 3U6HA 3VF8A 3MTLA 5CXZA 4U3ZA 4G17A 4EH7A 4O22A 2B55A 3QTRA 4J98A 2XCKA 5KMOA 1EH4A 4AT3A 3DLZA 2PVLA 4JVGA 4FEXA 4WIHA 4FYNA 3DK3A 3H0YA 5C8KA 4R77A 4OTWA 1JOWB 3EFWA 3UIMA 3PZHA 1S9IA 3R21A 2JBOA 3UIBA 5EYKA 1WVYA 4I41A 4QMVA 1PF8A 4KIPA 4FEQA 1PY5A 2RG6A 4QMYA 3LQ5A 4QMPA 2CLQA 1GIJA 3OY1A 4OTPA 1OKVA 4KS8A 3AMAA 4R3PA 2DWBA 1XR1A 2BALA 4MVFA 3KXHA 1WBNA 4JNWA 4C4JA 3LMIA 3LPBA 3VW6A 5IEXA 3ZXTA 2VU3A 3H10A 4LRMA 1DS5A 4Q5EA 3BELA 4L44A 3B2TA 4JG7A 3CIKA 3FZPA 3ZO1A 2C6MA 4U43A 5HX8A 5BMMA 4FA2A 2XKCA 2IVSA 3B2WA 4PDPA 3VS5A 1T45A 3L9PA 3A61A 3CBLA 3FLWA 2A2AA 4JDIA 4F9YA 3A7HA 5HU3A 3C5UA 3LFNA 4QMSA 5KKRB 5L8LA 4GVAA 1ZLTA 4HNIA 3KN5A 5FEDA 5HO6A 3DV3A 5IUHA 4HZSA 3ZLYA 2HENA 5B0XA 2UW3A 2YM3A 4LMUA 4EOIA 5HD7A 5CLPA 5HVJA 5KX8A 5LVPA 4C57A 2ZDUA 3NYXA 4UWCA 4ZMFA 4U80A 4UZHA 2H34A 4PTEA 4RGJA 5AIKA 4FSTA 4F0IA 5K5NA 4MF1A 4BHNA 4FG7A 3SDJA 5A9UA 3QTZA 4QTCA 3UYSA 3VBVA 3R8UA 3Q4CA 2VX1A 3FZ1A 3GUBA 4OTGA 5DH3A 4JAJA 3WE8A 3NSZA 4EH4A 4I92A 4Y73A 3R9DA 4FZFB 4LUEA 1YHVA 3IW8A 4M97A 5I3OA 5K0KA 4ZAUA 3UQCA 2OFUA 4ANMA 3KB7A 2IZSA 5JRSA 1IG1A 4BBFA 2GFSA 1YWRA 2ZV8A 3HP5A 5AA9A 3RAIA 3Q6UA 2J5FA 5EM6A 1YWVA 3A7FA 4ZSEA 5A6NA 2QC6A 4GK2A 2R3QA 5D11A 4FEVA 2UZOA 4RC4A 4RIXB 1NY3A 1ZYLA 3MA3A 4IB5A 5CI7A 4Q2AA 2PY3A 4RLLA 4DFLA 2PE2A 2W5BA 4TYHA 4Z16A 5DRBA 5KO1A 2OIBA 4DTBA 5I9ZA 3LMGA 2VTAA 3BGQA 2XNOA 3P78A 3G15A 5ANDA 1YDSE 3UNJA 3UO4A 3P1AA 3MJ2A 2YM8A 4XRLA 1CKJA 2I0YA 3HA6A 3ZCLA 4DG2E 3FKNA 3VS6A 3NZ0A 4R1VA 3FZOA 5DT0A 5CNNA 3SLSA 2WEVA 4S31A 2O8YA 1VZOA 3GQIA 3KCKA 3DJ6A 4IANA 4NM0A 5JMSA 3I4BA 4C35A 4GJ2A 2YIWA 2GTMA 3EIDA 4RBLA 2CPKE 2B1PA 2I0EA 2HW6A 3DU8A 3POZA 4NM5A 3ZTXA 3JR1A 3NVKI 3GU4A 1M7NA 2QODA 5EM7A 4BCIA 3HRFA 5FLFA 3EQHA 3GOKA 4BDGA 4XOZA 4D2SA 3A99A 1IAHA 2BAJA 4FTQA 4YPSA 5AV3A 4LV5A 1H1SA 3Q96A 1ZYCA 1XQZA 3V6SA 1WCCA 4V0GB 3QLGA 4FMQA 1WBVA 3I1AA 3CEKA 4CFWA 3CGOA 3O17A 3IOPA 3HA8A 2XA4A 4HYSA 2HK5A 1FPUA 2OF4A 3E93A 3OT3A 5IKWA 4FI1A 3F3WA 3BWFA 5FBNC 3H4JA 1IA8A 3HVCA 4J96A 5E8WA 2VTHA 3BU5A 2G2HA 1R0EA 1YOLA 1ZYDA 4YUQA 4R3CA 1Q5KA 4O0SA 1Q41A 3DJ7A 4FC0A 3VQUA 5HLNA 1VYWA 4FTCA 5B7VA 4MBLA 2OJJA 4F6UA 4CFUA 4TYEA 4GU9A 2XYNA 3COIA 3UZPA 1E1XA 1O9UA 3BRBA 2YIYA 3E3BX 2YLEA 5BVFA 1REJA 2BRNA 5EKOA 5EM5A 5L6OA 2VWIA 3BZ3A 2OXXA 4L00A 1XH8A 3GCSA 5HKMA 2ACXA 2Y4IB 2XUUA 3VRZA 2WMUA 5DHJA 3OXZA 2W17A 4UMPA 5IPJA 1GIIA 3L8XA 3ZRKA 3GCVA 3W2PA 1BLXA 5BQ0A 2PL0A 4KKGA 3ENMA 3U54A 2C3KA 3LFDA 4XUFA 3BGZA 3N4VA 2RGPA 3NYOA 4XLIA 4KNBA 3SD0A 4BN1A 2IPXA 4A9TA 2PUPA 4XV3A 2UVZA 4MXZA 5CS6A 3TUCA 5HICA 4ZTRA 4HJOA 4RFMA 3UP7A 2FO0A 3LW0A 3MH1A 4I22A 3F3ZA 1SNXA 3FYKX 4ALVA 3PJ1A 4L01A 2C5XA 4R7BA 5HG8A 1R78A 3NPCA 3HNGA 2IN6A 4IAKA 1OUYA 3GU6A 4CFNA 3CD8A 3KXZA 3A8WA 3UVQA 3SGCA 3AG9A 3D83A 2VX3A 4ZSJA 5I9XA 3UQGA 4CMTA 4K2RA 3G5DA 4JLCA 3WI6A 2YERA 2QVSE 3ZDIA 3V5PA 1QPJA 4QQCA 2Q0BA 4HPTE 4BHZA 5A4CA 5J5SA 1J3HA 2XNPA 4AZWA 1YDTE 3V04A 1XKKA 4MD8E 4R5SA 3R8PA 5HG5A 3LQ3A 2OKRA 2BKZA 4HGEA 4NWMA 4R6VA 3VO3A 4OBOA 1OIRA 4L42A 3DS6A 3DY7A 5KMNA 2YABA 2GQGA 4K1BA 4QP6A 2C6EA 2LGCA 4BGHA 3WF9A 5ITAA 4DLIA 2BHEA 2VN9A 2X2KA 2C3JA 2X8EA 4OLIA 5DT3A 4B0GA 2VGOA 2I0HA 5GINE 3HL7A 2OJFE 3GXLA 4XS2A 4L45A 3TIYA 4EHVA 3ERKA 3PXZA 3DKFA 4FUYA 3C0IA 4I93A 1MRUA 4D1SA 4U81A 1ZWSA 3QD4A 3R28A 3TL8A 3UO6A 4E1ZA 4RIYA 3WYYA 4RZVA 2VV9A 4XH6A 2HXLA 5BUIA 3PIXA 2NO3A 4AW0A 3Q6WA 4YR8A 3CKWA 1QMZA 2YIRA 4GK4A 3SAYA 4KB8A 3ODYX 4U7ZA 5M55A 4AU8A 4F6WA 4PDYA 4NCTC 4JDJA 2E9OA 4U5JA 5FGKA 3VBXA 4NK9A 5M4IA 5K4IA 4FEUA 5CEMA 1QPEA 5CVGA 4CMUA 4OW8A 3C0GA 4FTRA 4JT3A 2JAVA 2P4IA 4BTMA 4ZJJA 5HE3A 4O0UA 3H30A 4DH3A 4GW8A 4YJRA 3GP0A 4NTSA 4X0MA 1ATPE 2OIDA 4I5CA 4O7RA 3TDWA 1CDKA 4I4FA 5IQAA 2PZPA 2XP2A 5DOSA 1JVPP 4RX5A 5DLSA 2C68A 5GZAA 2YJSA 1UU8A 3BQRA 4GFMA 3OW3A 3OG7A 4K11A 3E5AA 4UMQA 3RVGA 5F1ZA 3CSVA 2WTKC 2RFEA 3I6UA 4MNEB 1W0XC 4J99A 2W1DA 3PXFA 4XG8A 4PP7A 1JKKA 5HCYA 3O2MA 3KREA 4GYGA 2ITPA 3ULZA 2VWVA 2YCQA 1KE5A 3G33A 3L8PA 1E9HA 3LXNA 2AC3A 4F70A 3GC8A 2JGZA 4BI1A 5E8ZA 3FSFA 3LE6A 5EDPA 5F20A 4GL9A 2OU7A 4WNPA 2OI4X 2WOUA 4AZEA 4J97A 2XS0A 3NVMB 4GSBA 1H8FA 4DBXA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2C5O A;  4TWN A;  5AJQ A;  4QYF A;  4HZR A;  4KA3 A;  5KE0 A;  2JIU A;  2JFM A;  2PVY A;  2RG5 A;  1UU7 A;  4BIB A;  1PXL A;  2XNG A;  2GTN A;  3KF7 A;  4QYE A;  5AR5 A;  4IBM A;  4AF3 A;  3VS3 A;  4IAY A;  1KWP A;  4BCG A;  4FE2 A;  4DH5 A;  1NA7 A;  5HCZ A;  3TCP A;  3OW4 A;  3NLB A;  3PA5 A;  3Q4U A;  4F64 A;  2VTQ A;  3BHU A;  3MH0 A;  3DBQ A;  2G01 A;  4FIG A;  3TJC A;  2WD1 A;  3TNI A;  4EOQ A;  4YSJ A;  2F2U A;  5E4H A;  3QTS A;  3KFA A;  3BKB A;  3R7E A;  5ANK A;  3E88 A;  4EUT A;  4CRL A;  4YJN A;  4AGW A;  1U59 A;  4L9I A;  4ANQ A;  1R1W A;  2EXM A;  2EUF B;  4PQN A;  5E8Y A;  4CYJ A;  2C6L A;  2XIX A;  1W8C A;  3U87 A;  5D9H A;  4RC2 A;  4TN6 A;  5HID A;  4ZJI A;  3UIX A;  1M2P A;  4BDA A;  4S30 A;  1PMV A;  3PVU A;  3R1Q A;  2UZB A;  1I09 A;  3Q52 A;  4G34 A;  5F95 A;  3ZH8 A;  4D5H A;  4D4Y A;  4P5Z A;  4M0Z A;  4DA5 A;  2W05 A;  4NJD A;  1CM8 A;  2J2I B;  3E64 A;  3RK7 A;  3TV4 A;  2WQE A;  2I7Q A;  2O3P A;  2G1T A;  4PP9 A;  2HZI A;  4YJV A;  2CCH A;  4IW0 A;  3BEA A;  4RC3 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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