4YZCA

Crystal structure of pire1alpha in complex with staurosporine
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
sequence length
402
structure length
382
Chain Sequence
SVVIVGKISFCPKDVLGHGAEGTIVYRGMFDNRDVAVKRILPDREVQLLRESDEHPNVIRYFCTEKDRQFQYIAIELCAATLQEYVEQEPITLLQQTTSGLAHLHSLNIVHRDLKPHNILISMPNAHGKIKAMISDFGLCKKLAVRHFRRGVPGTEGWIAPEMLSCKENPTYTVDIFSAGCVFYYVISEGSHPFGKSLQRQANILLGACSLDCLHPEKHEDVIARELIEKMIAMDPQKRPSAKHVLKHPFFWSLEKQLQFFQDVSDRIEKESLDGPIVKQLERGGRAVVKMDWRENITVPLQTDLRKFRTYKGGSVRDLLRAMRNKKHHYRELPAEVRETLGSLPDDFVCYFTSRFPHLLAHTYRAMELCSHERLFQPYYFH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
publication title Long-Range Inhibitor-Induced Conformational Regulation of Human IRE1 alpha Endoribonuclease Activity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase/endoribonuclease IRE1
total genus 105
structure length 382
sequence length 402
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2015-03-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
A PF06479 Ribonuc_2-5A Ribonuclease 2-5A
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4yzcA02
1.20.1440.180 Mainly Alpha Up-down Bundle de novo design (two linked rop proteins) de novo design (two linked rop proteins) 4yzcA03
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4yzcA01
5JQ8A 5DMZA 5EDPA 1P4FA 1QMZA 5FBOA 4DCEA 5CEOA 5K5XA 4OTDA 5LWMA 5EH0A 3F2RA 4WSQA 2ITYA 3UBDA 5AP2A 1UWJA 3E62A 3P0MA 1H00A 4QYFA 2OBJA 4UMQA 2FSMX 2YFXA 3D94A 3LQ5A 4TWNA 4WBOA 2VTRA 5A3XA 4BYJA 4HNIA 2A2AA 4AZEA 4EQMA 2YM5A 3BYUA 1U5RA 4X7QA 3EZVA 4FT7A 3VS6A 4BZDA 1IG1A 2W99B 3KN6A 3LMGA 1KOBA 3R71A 4UALA 4CMTA 3UPZA 2X39A 5M07A 1H28A 3R30A 3RJCA 3V5PA 3BBTB 4I5PA 3S2PA 2XK7A 4ZXTA 1MRYA 1TVOA 4G17A 3DJ6A 3CIKA 4FL1A 4G6OA 4HYHA 4USDA 2VO3A 4YMJA 1QPCA 3LCKA 4XG6A 2Y9QA 2C5XA 3O96A 3JY9A 1K2PA 4QMSA 2XNBA 4K11A 2PK9A 5CY3A 3EYGA 2XJ1A 5AR4A 4BTJA 3SHEA 1ZZLA 3Q2JA 1A9UA 3DJ5A 2I6LA 3FY2A 5DR2A 4YPDA 2YIYA 4FA2A 3DKCA 3H10A 4JDKA 4ZSEA 3ROYA 4A07A 4DFUA 2FO0A 3OUKA 2BR1A 2E9VA 3TL8A 4DTKA 2Y4PA 4I24A 3IOKA 2XK3A 2I0HA 2X6DA 4FEVA 4FTJA 1U54A 5CF5A 3FMNA 4IZYA 1YXVA 2PULA 4IE9A 4R5SA 5FBNC 4P5ZA 2QOFA 2WTDA 3GCSA 5DR6A 3ZONA 5KBRA 3ORNA 4I41A 3ZXZA 3V04A 3UO5A 4PTGA 5HHWA 2B9JA 3R7VA 5LVLA 4UXQA 4Q5EA 4EBVA 2C3IB 3OXIA 3UP2A 2V22A 3NVKI 3O23A 4AE9A 2IVTA 5J5TA 3KXNA 2XS0A 4R1YA 5IDNA 3VJOA 4D4SA 4CZTA 2ZM4A 4RBLA 1VJYA 4FVQA 2IZTA 2BFYA 4XS2A 4FEWA 4S30A 3GU4A 3JYAA 2CNUA 4IAZA 4M12A 4RIYB 2XJ2A 2YABA 2YJRA 4EOJA 1M52A 4KS7A 4U44A 4F7LA 1MQ4A 2VAGA 2YCRA 2A27A 2YLFA 3KXHA 4AT5A 5C26A 1Q62A 1WVXA 2BRGA 4MBIA 2CKOA 3MIYA 4IW0A 4O86A 4KIKB 5M09A 4D55A 1E1VA 3C1XA 2XM8A 4I0SA 4J7BA 4S34A 3W2QA 5L8LA 3E92A 4FKPA 4DEAA 1Z9XA 3UP7A 4GRBA 3OFMA 1BI7A 4QTAA 3OZ6A 4FZFB 4FKIA 4U3YA 3TG1A 4U5JA 1WBSA 3PPKA 2W5AA 4RIWA 4DG3E 4F6UA 3VS1A 2VO7A 2J5EA 4RWJA 3VS7A 3JPVA 1JLUE 4AN2A 2JITA 2HWPA 4CMUA 5BMSA 3R02A 3NRMA 3JXWA 4K9YA 2O8YA 4QRCA 4IAFA 3ZHPC 5HE2A 3RK9A 1ATPE 2ZMCA 3PA3A 4FIGA 4HVSA 1YOMA 2C6DA 5HG5A 3TIZA 4F64A 4ZLZA 3KVWA 4EK6A 4EH5A 4TWOA 3EN5A 4JAIA 2WTVA 3FKLA 2NRUA 3NUSA 3D0EA 4GK4A 4GW8A 4ARKA 3PLAE 1CM8A 3UODA 3LXKA 3TKUA 4J1RA 4PF4A 4FKQA 4R3RA 4U0IA 3ZRLA 3V8SA 5TT7A 3ZXTA 4ZMEA 4FL2A 5TE0A 3TTIA 4L46A 3DY7A 4D2SA 5IMEA 3MWUA 2WTWA 4QMOA 4PL4A 2J4ZA 3LW0A 3O7LB 4IHPA 4O6LA 2XB7A 5A14A 4DEHA 1PW2A 1R39A 1VZOA 1YRPA 2VWWA 4IX5A 2Q0NA 1XO2B 2PVMA 3HL7A 4IZ5A 3TTJA 2V7AA 3AC1A 2VN9A 4TKSA 4PDSA 4XCUA 4OLIA 5LMAA 1IASA 1F0QA 3F5UA 4JT3A 2P2HA 3LOKA 2JDSA 2P33A 2C5YA 3ZSGA 5FUTA 4K6ZA 4XG8A 5I3RA 3OCGA 3C0HA 1WBTA 3P4KA 4G16A 3ZC6A 2W1DA 3MN3A 4LV8A 3W33A 3QCXA 2PMLX 3MH3A 3UVPA 1W82A 1WBOA 4G9RA 4L6QA 4DEEA 5JSMA 5FTGA 1EH4A 3KKVA 2O0UA 4O22A 3FQEA 2C0IA 2Z60A 3ORXA 3HV6A 5CF4A 5DRBA 2Y6MA 3NYXA 5BVKA 3GFWA 2ZB1A 2EB2A 3D7TB 4YZDA 2BZIB 4FTCA 3UDBA 3KXGA 3BLRA 2Y7JA 3OEZA 4FNXA 4DCAA 3GC7A 1YI6A 3KN5A 4JNWA 4GIHA 3M1SA 5BVEA 5F4NA 2PUUA 1ZYCA 2UW5A 3V51A 4EOQA 4WG3A 4WO5A 3ZRKA 4B8LA 4JIAA 4I20A 3TZMA 3IW7A 2JAMA 2VZ6A 1Y8YA 3R7IA 3JR1A 1J7LA 4FSMA 2QQ7A 4YZMA 5LVMA 3PJCA 3CJFA 2AYPA 3LFSA 3QQHA 3KULB 4GEOA 4PY1A 3VC4A 2HAKA 3E8NA 3VN9A 1UKIA 3BELA 3QX4A 3WZEA 2R3HA 1OL7A 4UX9A 3BLHA 3RBWA 2QOKA 4O0UA 3FMDA 3FXZA 3R9DA 3WI6A 4U42A 3OWLA 4FNZA 2QR7A 5DT4A 4GYIA 3SD0A 5FP5A 3I81A 3QXPA 5DRDA 4BKYA 2VWVA 2VO0A 3RWPA 4CSVA 3SC1A 4F0IA 2HW6A 2O3PA 4DG0E 1OBGA 5BPYA 5HX8A 1FINA 1IA9A 1VR2A 3K54A 4NCTC 2J7TA 1A48A 3BHVA 4FTKA 3GT8A 3CTJA 2A4LA 4ZEGA 3NUNA 4FSRA 4EZ7A 3A60A 5GINE 3VAPA 4D4VA 3RTPA 2X7GA 3KREA 2P3GX 2QKRA 3MJ1A 3OT3A 3QA0A 2CMWA 3D2KA 3O50A 4QP6A 3ZO4A 4BGHA 3VS0A 3F5GA 2CLQA 4XG4A 4CT1A 3DZQA 4ACDA 3G0EA 3NAXA 4D2WA 3G90X 4FTIA 4IJPA 3FYKX 4G34A 5J9ZA 5JGAA 5HKMA 4IQ6A 1ZRZA 2ACXA 5HIDA 3F61A 4H36A 2R3PA 2Y6OA 3MA3A 3Q9WA 3QLFA 4NEUA 4OR5A 3FDNA 4M68A 3ATTA 4CTBA 2HZNA 1QCFA 2WFYA 5F9EA 4AW0A 2GSFA 4RIXA 4X2FA 2VWYA 4AW2A 1YHVA 2XIRA 4U6RA 2GTMA 4L67A 3H30A 4L45A 3DKOA 4RC2A 4ZSJA 5KE0A 2JLDA 3HMPA 4CD0A 5J1WA 1P14A 4W4YA 1FMKA 2WMWA 3F69A 3MGYA 4FSZA 4ONAA 3ZEPA 5I5ZA 4H05A 3FI3A 3VBYA 4AS0A 2J51A 3H4JA 4TNDA 4DBNA 2W4JA 3WF9A 5AR8A 3N4TA 5IISA 3TDVA 3QTQA 2V7OA 4EZ5A 1H07A 4HOKA 2PZYA 3ZH8A 4J98A 5JFWA 5GHVA 1SNUA 5AX3A 4FTAA 3UQGA 3IONA 2SRCA 5CF8A 4CGAA 4CFMA 2FSLX 3F3WA 4QQTA 2JIIA 1G3NA 1PYEA 2BRBA 2EB3A 3EKKA 1PYXA 3QCYA 3V5QA 3ZUTA 1R3CA 1UU9A 4ID7A 4C3FA 4G3GA 4FYOA 4N4SA 4QMPA 4EWHA 5M56A 4W9WA 3THBA 3MVJA 4EH9A 2OH0E 2OLCA 3QAME 4YLLA 4BR3A 4I5MA 4XJ0A 2CN5A 4C38A 4IBMA 2X2LA 5L2QA 4YJPA 4EJ7A 4MWIA 2RSVA 3GBZA 4TNBA 3WOWA 3VBTA 4TWCA 4UN0C 2PZRA 5IEYA 3QTRA 5EM7A 2VTMA 3F5PA 3UVRA 4EQCA 4DINA 3ZM9A 4YGAA 4HCTA 4ANQA 5IQBA 3FXWA 5IQHA 2OU7A 4F9AA 3N51A 1OKWA 2C47A 3FLZA 2DS1A 3KMWA 2BROA 2ZM1A 3PVBA 4MXXA 2WQMA 4ACHA 4RIYA 4LRJA 4EOOA 3L9PA 3CQWA 3ZM4A 4E1ZA 3FXXA 1J3HA 2QOOA 1LR4A 3PPJA 3VW8A 4XP2A 3E93A 3SOAA 3W55A 5E1SA 3OTVA 4BZNA 5IG1A 4BY9E 3ZU7A 3Q96A 1FMOE 4BHNA 5EQEA 1UKHA 3ZFMA 3COIA 3B2TA 3R8VA 3TM0A 2CDZA 5DN3A 4I6FA 2PY3A 1AGWA 3IDCA 4MVFA 4AOTA 3QTIA 3DAJA 2WMBA 4FKVA 1XH8A 3GI3A 2VTIA 1BUHA 4BIEA 3NCGA 1K3AA 5HTCA 3EQGA 4XH6A 1M7NA 3O51A 3OEFX 1E1XA 3ZFYA 3DNDA 2CGUA 4EK4A 3QUDA 3AOXA 4H3PA 5E9EA 4WOVA 4LG4A 4BBMA 4FMQA 4IX6A 4DTAA 3MVMA 3EOCA 3CBLA 2PVHA 3P78A 4M66A 3QKLA 3SA0A 1SM2A 2BTSA 3HRCA 4TY1A 4Y5QA 2VWBA 3U55A 4BVUA 1BL7A 4YZBA 3W18A 3LIJA 3GEQA 4AOIA 3D5WA 4RFYA 5TO8A 2C5OA 5B7VA 4FEQA 2C6LA 4E4XA 3MVHA 5HORA 2FUMA 2PHKA 5BYZA 4KIPA 5C8KA 5LVPA 2ZV7A 5B2KA 2VGOA 4YTFA 2E2BA 2B1PA 2BVAA 2XNGA 5KKRC 3PJ8A 3G9NA 5DPVA 1Q24A 2VD5A 2VTSA 5CEQA 2XKCA 5IA1A 4NH1A 4CQGA 2PU8A 3NUAA 4J8NA 4LL5A 5EQYA 5A4TA 4L44A 1QPEA 2AC5A 3KFAA 4LMUA 4CZUA 4FGRA 3MDYA 2WU6A 2BCJA 4DT9A 2B9HA 4IWQA 3BWFA 2OW3A 3R2YA 5KZ0A 3OG7A 3F3UA 3BHUA 2WMSA 4FVRA 4PL5A 4RWIA 5E8VA 4YUQA 5A4CA 5KUPA 2Z02A 2OI4X 5EDQA 4H1JA 2J50A 4NFNA 3CCNA 4F6SA 1KV1A 3KGAA 3DPKA 2RFSA 4X21A 3RNYA 3BEGA 3ITZA 5CSWA 3C4CA 4XEYA 3UIUA 3ZRMA 3P7BA 3ROCA 4XG3A 2R0UA 3ACKA 4XOYA 2QOLA 5F94A 3UIBA 5IUHA 3HV3A 5HNBA 2OFVA 4QP9A 4XV2A 2WPAA 2HOGA 4BDFA 5AP5A 1OIRA 3UYSA 4FKJA 4M14A 3ODZX 3W2SA 4DLIA 4OTWA 5HTBA 3LQ3A 3FAAA 5CENA 3DXQA 3TZ8A 5JFSA 3F66A 3Q9ZA 3UPXA 4CTCA 4PDOA 1OL5A 2VTAA 3O71A 3OXZA 4LRKA 3BWJA 5HIBA 4WNKA 3LMHA 2PE2A 2Z2WA 2R3FA 3QBNA 5I3OA 3UE4A 1URCA 3RPYA 2ITWA 4G6LA 4CFXA 4J99A 3BKBA 2BAQA 4FYNA 1SYKA 4GJ2A 4UMUA 3ZSHA 2IVUA 4M69B 3RINA 5I9YA 3IG7A 4DFXE 5T6KA 4E6AA 3KULA 3UIMA 3QQLA 1J1BA 2Y0AA 4P5QA 3F82A 3GC0A 3Q3BA 4O2PA 4C33A 4JI9A 3DT1A 2VWIA 1Q8WA 4OBOA 3RM7A 1HCKA 4I0TA 3JUHA 2Z7SA 2W9FB 1UU3A 1J7UA 3H9FA 2YN8A 4UV0A 4IX3A 2CNVA 4NYEA 4W4VA 1IAJA 2GQRA 1U54B 2E9OA 5LMKC 2GDOA 3ALOA 3DBFA 3PPZA 2YDIA 3MBLA 3V5WA 5KO1A 4KIOA 4OW8A 5IH4A 4FV5A 3RK7A 4MQ1A 4IWPA 5BVFA 2HENA 4JQEA 5IPJA 2BHHA 2W5HA 5E8TA 4GK2A 3R7OA 3FWQA 4G3CA 4PTCA 2W1FA 1CTPE 3FMEA 4BDDA 4ASEA 5DVRA 3F7ZA 3VNTA 4YJSA 2GS6A 3VHEA 4AGWA 1YHSA 4AQCA 4R3PA 1Q99A 1Y6AA 3CXWA 3NX8A 5CVHA 4WNMA 4BB4A 3U4WA 2PZPA 3HDNA 5I0BA 1V0BA 4DF3A 3WF7A 1Z5MA 2C3JA 1W7HA 3FHRA 3BHHA 3CY3A 5L2IA 4BHZA 4FTOA 2X9FA 4K33A 4RJ7A 5AM7A 4I4FA 4FEUA 4A4XA 4F1OA 2YITA 4AZFA 4IXPA 4LI5A 3EQRA 2PMNX 5GZ8A 3DBDA 1O6LA 4GFMA 2J2IB 1M17A 4OT5A 3UNKA 3BZ3A 4QQ5A 4GMYA 2R0IA 4FKGA 5HG7A 4PPAA 1DS5A 5IA5A 5HCZA 3F7WA 4C37A 1GIJA 2HK5A 4O91A 2VNYA 4GU9A 4AN3A 4F0FA 4Z3VA 4RIWB 1OPLA 4JX7A 5EI8A 3AC3A 3FC1X 2PE1A 5CF6A 5K0XA 3IPHA 3DB6A 4Z9LA 2E9PA 4RX9A 2P55A 2UW3A 4QP2A 1K9AA 5EHYA 4NW5A 4UMPA 2XKFA 3ORZA 4C4IA 3D15A 2UZVA 4BDHA 3S3IA 2QNJA 3QCQA 4EZ3A 4CFNA 4E26A 5A6OA 4FV1A 3D5UA 4FTLA 4NUSA 4WG4A 5FQDC 1O6YA 3DKGA 3IQ7A 4MXYA 3UMXA 5IU2A 5FTQA 2LGCA 2EXCX 3VUGA 4TYHA 2W4KA 3ENHA 2CNQA 2W05A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5JQ8 A;  5DMZ A;  5EDP A;  1P4F A;  1QMZ A;  5FBO A;  4DCE A;  5CEO A;  5K5X A;  4OTD A;  5LWM A;  5EH0 A;  3F2R A;  4WSQ A;  2ITY A;  3UBD A;  5AP2 A;  1UWJ A;  3E62 A;  3P0M A;  1H00 A;  4QYF A;  2OBJ A;  4UMQ A;  2FSM X;  2YFX A;  3D94 A;  3LQ5 A;  4TWN A;  4WBO A;  2VTR A;  5A3X A;  4BYJ A;  4HNI A;  2A2A A;  4AZE A;  4EQM A;  2YM5 A;  3BYU A;  1U5R A;  4X7Q A;  3EZV A;  4FT7 A;  3VS6 A;  4BZD A;  1IG1 A;  2W99 B;  3KN6 A;  3LMG A;  1KOB A;  3R71 A;  4UAL A;  4CMT A;  3UPZ A;  2X39 A;  5M07 A;  1H28 A;  3R30 A;  3RJC A;  3V5P A;  3BBT B;  4I5P A;  3S2P A;  2XK7 A;  4ZXT A;  1MRY A;  1TVO A;  4G17 A;  3DJ6 A;  3CIK A;  4FL1 A;  4G6O A;  4HYH A;  4USD A;  2VO3 A;  4YMJ A;  1QPC A;  3LCK A;  4XG6 A;  2Y9Q A;  2C5X A;  3O96 A;  3JY9 A;  1K2P A;  4QMS A;  2XNB A;  4K11 A;  2PK9 A;  5CY3 A;  3EYG A;  2XJ1 A;  5AR4 A;  4BTJ A;  3SHE A;  1ZZL A;  3Q2J A;  1A9U A;  3DJ5 A;  2I6L A;  3FY2 A;  5DR2 A;  4YPD A;  2YIY A;  4FA2 A;  3DKC A;  3H10 A;  4JDK A;  4ZSE A;  3ROY A;  4A07 A;  4DFU A;  2FO0 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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