3OSRA

Maltose-bound maltose sensor engineered by insertion of circularly permuted green fluorescent protein into e. coli maltose binding protein at position 311
Total Genus 191
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
191
sequence length
621
structure length
603
Chain Sequence
RWGSKIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELGGSHNVYIMADKQRNGIKANFKIRHNIEDGGVQLAYHYQQNTPIGDGPVLLPDNHYLSTQSKLSKDPNEKRDHMVLLEFVTAAGITKGEELFTGVVPILVELDGDVNGHKFSVSGEGEGDATYGKLTLKFICTTGKLPVPWPTLVTTLVQCFSRYPDHMKQHDFFKSAMPEGYIQERTIFFKDDGNYKTRAEVKFEGDTLVNRIELKGIDFKEDGNILGHKLEYNFNNPAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEDLKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title A genetically encoded, high-signal-to-noise maltose sensor.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein,Green fluorescent protei
molecule tags Fluorescent protein, transport protein
source organism Escherichia coli o157:h7
total genus 191
structure length 603
sequence length 621
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-09-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.155.10 Mainly Beta Beta Barrel Green Fluorescent Protein Green fluorescent protein 3osrA03
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3osrA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3osrA01
4PFYA 4LUBA 3NT9A 2QLIA 3DQAA 4W74A 3SV5A 3PUZE 4C1UA 3LVAA 1P1OA 3IR1A 3SRYA 1OQHA 3SDFA 4U22A 3G3HA 5H8NA 3H7MA 5DQMA 2CMOA 4I62A 3PJ5A 1H45A 4LONB 2VAEA 1J1NA 4R72A 2QJEA 3DELB 3PPNA 4R9GA 5DVFA 4XL5A 1JETA 5FTHA 4LVQA 5ITOA 1GTKA 3VDFA 1Y9UA 1M5EA 3FD3A 1FQEA 1IIWA 2V4EA 1HSLA 3Q29A 1IXGA 3SG2A 3E5TA 3CFAA 3GJ2A 2HRSA 4Z4KA 3PD9A 3HHFA 3SVUA 3TTLA 4ZS9A 3IOUA 1SVXB 3SERA 4EN1A 1Y4CA 2HCGA 2XXTA 4JC2A 3BFUA 2A52B 3MC2A 5JTYA 4ZIOA 1US5A 3K6WA 3GBAA 4F3SA 2DWJA 3KEIA 2UVHA 3SETA 1B1HA 3IB2A 4AB5A 2E1SA 3PMWA 1UIVA 3SESA 4W7EA 3G3JA 1XMZA 1MQJA 4LP2B 4MH5A 1PB7A 4NTLA 3R26A 4G8MA 4GWOA 1MQIA 1A8EA 1DTGA 1BP5A 3CSGA 2A5TA 3FJMA 2R6GE 4KPIA 1LAFE 1LAGE 4GL8A 3DP4A 1DSNA 3R7XA 4TZGA 2VHAA 1LCFA 4P76A 2YE1A 4HTGA 5CMMA 5ELVA 3RT6B 2DD7A 4F22A 4NEDA 2XX9A 5CBRA 4EXLA 4F2OA 4LJCA 3T9UA 3U92A 5HPQA 4I2YA 1TWYA 4NWSA 4ELQA 1RYOA 2F34A 3ST2A 3OELA 3M8UA 4E0WA 5H8HA 5I2NB 3MWBA 1XS5A 1FQCA 1Q4EA 2ICRA 4L13A 3MGFA 2DDDA 4ND9A 1KWHA 4I9DA 4U23A 4UACA 2UXAA 3K6VA 4N13A 5EHSA 3S9NC 3ST0A 3O66A 4M4GA 4LQ5A 1O7TA 1B7UA 1LCTA 1HCJA 3SS0A 3DQ5A 4JF9A 3O6HA 3CG3A 2HCAA 2DUHA 5DYHA 2RCBA 3BFTA 3TELA 2OLBA 4EUOA 1WVJA 2G93A 5H8QA 5I84A 1NNPA 3VXCA 3MZBA 4W6CA 2IE2A 4H3NA 3EPEA 4NF5A 2REGA 3D4GA 3E13X 3DQUA 3IK6B 3N94A 5HBDA 3OO7A 2IA4A 1D4NA 3KZGA 3QYTA 2A5SA 2XD2A 4YKIA 2Y7KA 5LTQA 2XXWA 5FVIA 3QXMA 3JZJA 3VVEA 2ZYMA 4ZF5A 3C36A 5FHVA 3FJGA 4K3FA 5EB6A 4DDDA 3FVNA 1B3FA 2O84X 4GESB 2AIXA 2B65A 1I69A 3IO4A 3GL4A 5DT6A 2G3OA 3U72A 1EMFA 5DPGA 4ZF4A 2FL1A 1EZOA 4Q9XA 3H1OA 4W6MA 3K2DA 1FTOA 3TDJA 1B58A 2ZMWA 3U93A 5LTPA 3SVOA 4QSCA 4H67A 1USYH 3Q27A 4NMYA 1MQHA 4QRZA 1AMFA 4QHQA 4U2VA 4UTSA 3LBSA 1I6AA 4N6PA 2QRFA 4YMBA 4GF8A 3IAZA 1G7KA 5LOMA 2GHAA 1XAEA 3C4MA 4W6IA 3MZ9A 4ZF3A 4HVFA 4KF5A 1GR2A 2QLHA 2DVCA 2O7IA 5M2VA 5EHUA 3W1DA 5FVFA 2G2SB 2OK2A 2R71A 4DLDA 3CFFA 1DPPA 3DPWA 2X7PA 4F39A 3ADFA 1DTZA 3VV5A 2Z1OA 2OTEA 2PXWA 1VFEA 4GIZA 4POWA 2XXUA 1SW1A 1RM9A 1N7XA 4N3DA 1RMPA 2FZUA 4FEBA 3SVCA 1B46A 3V89B 1T0KA 5DTYA 4HQ9A 1Y20A 4DXQA 4AS8A 2F8DA 4MBPA 4NF6A 4BDLA 2CZLA 2O24A 4JDFA 4Q0CA 1IQ7A 2H5OA 2Q89A 4OFOA 4KA9A 4PFTA 2HAVA 2V4EB 3U1OA 2Q6PA 3SVDA 3MZ1A 1R9QA 3MPKA 4W73A 1UTHB 3DP8A 4RK2A 3CI8A 4PPKA 1O63A 4OVJA 2HQKA 1IXIA 3MVYA 4MLQA 2PVUA 4F1YA 5CBSA 5K2YA 1LFIA 1XHYA 4LQ2A 2QMWA 1PB9A 4L1IA 2Z23A 3BKIB 5H89A 1L5TA 5ITPA 3Q28A 4FECA 4W6HA 1B5IA 1PDAA 1ZBMA 2O6AA 4XXUA 4AR7A 4X9TA 2WISA 2QSXA 1O64A 4IO7A 4FATA 3C31A 3HPIA 3VXBA 1M5BA 2X26A 1A54A 4GLIA 1ATGA 3S9LC 4ISUA 5I2NA 1IITA 2AL5A 4G77A 2AL4A 3L6GA 2DSFA 4BDRA 2QS1A 4P1QA 4J8AA 1S6ZA 2A5TB 3K6UA 5AA3A 1B6HA 1N3XA 5CC2A 3OEKA 1PB8A 1QYOA 3UGWA 3V8XB 4BDUA 1LLSA 2F7AA 1A40A 4XVPA 4I8CA 3KG2A 1Y3NA 2V84A 2ZNSA 4DXUA 4GFRA 4F19A 2ZYOA 3W1CA 3ONMA 5AA2A 2F78A 1MY2A 1AIVA 3PPRA 2F35A 4PP0A 2H98A 3MP8A 1PBQA 5BUUA 5H8HB 4O3CA 1URSA 4KQPA 3TTMA 2ESNA 3M3FA 4W6RA 3RNNA 3MP1A 3DQ6A 2VADA 4POXA 4XKQA 2OWTA 3GBBA 3NEDA 1QJMA 3UN6A 1YHIA 1B40A 1JC1A 3TMRA 3T93B 3A3UA 2OCUA 1EMGA 1YAEA 4HQ8A 4LJDC 4O3BA 4BDMA 2A48A 3TCHA 4OQWA 4YICA 1XVXA 2DP8A 4G8NA 3W9VA 1KYRA 1OQGA 2I4CA 2A53B 3VVDA 1QULA 3FIRA 3SSHA 4PFUA 1EU8A 2D21A 2B3BA 3K1MA 1QYFA 3N6TA 2Y7IA 2DUIA 3RTWB 3CGLA 3OD7A 2W7YA 1H44A 2RKMA 4YB5A 2XXYA 4F3BA 4DXPA 3IX1A 3FXRA 3K1NA 4EULA 2RF1A 5CRYA 4DXIA 1A8FA 4ESWA 2Z6XA 2VD3A 4JBZA 3FATA 3AXFA 3DM0A 4LATA 1GGXA 1LB8A 3PJ7A 2DYXA 3VLUA 2I3VA 4U4XA 5KTGA 2HFBA 5H88A 1KYPA 3KN8A 3UA8A 3OSQA 4I1DA 4Z0IA 4DXOA 3QUJA 5I2KA 4IK5A 3EK4A 4OESA 5JK4A 4JWXA 1KP5A 1ZGPA 1SD3A 3WLDA 2Z8EA 5EJUA 4KR5A 4G4PA 4EF2A 2QLGB 4TLMB 5BQLA 2AYSA 3MPLA 1QVSA 1IXCA 3SG7A 1B9CA 2AH8A 1ZKBA 4MF3A 2Q57A 4F3PA 2ZMUA 3EF7A 3CVGA 3QK6A 3K01A 2Z8FA 2I6EA 4EDOA 2B3QA 3B6WA 1DMBA 1UTBB 3IOWA 2IB5A 2EMOA 2H5RA 3RGYA 4EXKA 2FNCA 4XIGQ 1H6RA 2I4BA 3DQMA 1AL3A 3UFZA 2B3PA 4U21A 4EDSA 3AI4A 1SW5A 1MYWA 4IO6A 5DY6A 1UTHA 2XX7A 5HM4B 3KCSA 4LZ8A 2WSOA 2C9JA 2RINA 4BDQA 4OHSA 2DDCA 4IK3A 1SW4A 2Y7PA 3ODBA 4R75A 3VICA 3K02A 5L9MA 4NF6B 1MOUA 2Q88A 3WAFA 3SEUA 3WAEA 1Q35A 2Q2CA 5J2OA 1TT1A 4W72A 1B7ZA 3SEYA 2POXA 1EMCA 3PD8A 4Q30B 5EYFA 4IO3A 1NL5A 4DIGA 3FGSA 4YMAA 1MPDA 3OMBA 1IUDA 1MDQA 4ESXA 4P11A 3PV0E 3M24A 4EQ7A 1NNFA 4U1OA 1M5FA 2ZNUA 3K1PA 3RQTA 1JW4A 1B3GA 1Q4BA 4H48A 1QY3A 4MLVA 3SEWA 1OLAA 1C4FA 3VK1A 3CFXA 5DTLA 1MXWA 4OY4A 4NF8A 4HQCA 1XA9A 2DXYA 4YB6A 1YFPA 4BDNA 3UIFA 4OXVA 5DTZA 3EVRA 3Q25A 4P0GA 5J1DA 3CBEA 1MRPA 1XQMA 3H6WA 4OGSA 2BTJA 3IR8A 3U0KA 2XXVA 5FVGA 4G68C 2ONRA 2UVGA 2Z8DA 3TCGA 3IJXB 1S50A 4BLAA 3T66A 4KYEA 2G3DB 4DCXA 2D3IA 4PPJA 3QUFA 3KSXA 4H6DA 4JWYA 1M5CA 5CMCA 1FTKA 2RC9A 4KD5A 4OETA 1DPEA 4IY6A 3FXUA 4ELPA 1R9LA 2DOJA 1D9VA 4OFJA 4F2QA 5DPJA 5AA2B 1MXXA 3QAXA 1JBZA 3M22A 2VGQA 3HSTA 4DZ1A 1MQDA 2ZMBA 5HZUA 1GV8A 3I6VA 3DQDA 4NWDA 3DQOA 1MXVA 2HFCA 1OMPA 2FA7A 3D4CA 3P7IA 5L9SA 3K0VA 4WXJA 5H8FA 5F1QA 2QMXA 1CV7A 1B32A 3GLBA 1A99A 3FUZA 2KLFA 2AWKA 4ZEFA 2Q2AA 1YCJA 4J89A 3IB1A 2O2BA 1VFDA 4OZ9A 1ZUXA 3BX9A 4W7AA 3MVZA 2HJOA 1YHHA 4W6KA 3OEMA 5TU0A 4LQTA 2Y7RA 1A7LA 1AOVA 2DWHA 3KOSA 4GQOA 3EQ1A 1Q4DA 3LC8A 3DQ2A 4ZZAA 4R74A 4KW8A 1B51A 3AKOA 3OXNA 3H1RA 1Y3QA 1NNTA 4R6DA 4FEDA 4WEDA 1LFHA 1RKMA 4ZB1A 2RC8A 4R2FA 3IP2A 3SG4A 2HQZA 1FQDA 5HZTA 3U0MA 4DKMA 4U1ZA 2H8QA 5DRFA 3MAMA 1XT8A 2XX8A 3TYHA 2VZXA 4QF9A 2P2AA 4LZ7A 3DQ4A 2I3WA 3WCKA 2QLGA 1PC3A 4BDOA 3GZGA 2ABHA 2GW4B 1YJ2A 4RYAA 2A50B 4IK9A 2Q8JA 2ZNTA 4E0XA 2HEUA 3L6HA 2FWQA 4HE4A 1Y3PA 1MXUA 2O69A 2HQ0A 1P1WA 1SYHA 5AE4A 3LUYA 1OLCA 5IKBA 3DQ7A 2PYYA 4KI0E 3IJOB 1UTBA 3A8SA 5EXCI 3EVPA 1ZMGA 3EK8A 3R6UA 4YZZA 3SVEA 3T9HB 5I2KB 1LAHE 3ZKKA 4W6AA 3DQJA 1MXYA 3FVOA 4ZINA 3G3KA 1W7SA 3T22A 5I56B 3FV2A 3NF0A 4IK1A 2A54B 5F9GA 4JSOA 5AQBB 2DXRA 2RCAA 1EMKA 1QYQA 2OKYA 4ORNA 4R6YA 1DOTA 1QXTA 1H43A 2NVUB 2Y0GA 3LF3A 3CIJA 5LK4A 3FJ7A 5KDTA 1TFDA 2G16B 4ZEKA 1EMBA 5I59B 2I0BA 2V3UA 3H03A 4XTCQ 3O28A 3RUMA 3OO6A 3SSVA 3IORA 4NF4B 1ZGQA 4JWOA 3SEVA 3MJNA 3BXCA 4ELRA 2GX0A 4QFNA 2XXIA 3KBRA 5FTIA 2XXRA 4N07A 2REJA 2ZYNA 1B52A 3K6XA 4OERA 4LQUA 3USDA 3O2AA 5ICTA 1OXEA 3EK7A 4H1XA 2XD3A 3LR1A 2DUEA 3MUQA 5EHMA 2YLNA 4ANJA 4C1TA 1GVCA 3U8CA 4OHNA 2OJKA 5I57A 3CFHA 3SG3A 4WEPA 1S9TA 5AA4A 2G6EA 3V5AA 1MH4A 4RXLA 3GXAA 4W69A 2H5YA 3RWTA 1ELJA 5HZOA 4EF1A 3FASA 3TPAA 4RA1A 2GHBA 3DQ1A 1B3HA 1BTJA 3PUYE 2WHUA 5B70A 4JB7A 5DPHA 3TAJA 1EMMA 3E3KA 4QFLA 4QFOA 3DQIA 3C33A 3DQNA 4KGFA 1CB6A 3I3VA 4G8HA 3DQ9A 1OVBA 1D3KA 3TTNA 3DQCA 2O1MA 4NF8B 2GX2A 3EHSA 4OWDA 1D9YA 1Q73A 3DQ8A 1FQBA 3IOTA 1YJFA 4GXSB 4W7FA 2ZO6A 3UP9A 5KZTA 4KPTA 3CR9A 2PMSA 4KFQA 3H6TA 2Z22A 2G6YA 4YKKA 2VOZA 3VHTA 3A09A 4ECFA 3EKHA 1EZ9A 4IB2A 1PBPA 3S05A 1RYXA 1BFPA 1P1UA 4KW9A 3M3KA 4X1BA 4XGYA 2F97A 1SBPA 1SQYA 2ZXTA 1WODA 1B5JA 2WKYA 4W6LA 4PQJA 3SSKA 3UORA 3U8QA 4C0RA 1VR5A 5DEXA 2PXSA 1SI1A 4RNSA 2V4EC 2ALUA 3MBPA 1YHGA 4DXCA 4U2RA 1SDXA 4Q5TA 4JEOA 4JRBA 3G3FA 4LJBA 2QS2A 3SSTA 1VSOA 3C34A 3HCQA 3E5WA 2H25A 5DU0A 4IO4A 5BTTB 3H06B 2HXWA 3U8PA 5DTBA 3EN3A 1QKAA 4ZECA 1LBCA 3ZULA 3TMTA 1F09A 4G2ZA 4YKJA 4DKNA 2QRYA 1Q4AA 1YTVA 5H8FB 2H6VA 3Q26A 2P0SA 1BLFA 2PBWA 3RTFB 2VVHA 1B7HA 3LF4B 1N0TA 3GJ1A 3ILUB 2XXPA 3SEXA 1ZGOA 4P0IA 3CRBA 4RY1A 3T9VA 4W6TA 2BJJX 2GRVA 2I48A 4HCYA 1UIUA 2H9BA 2XHDA 2GH9A 1B2HA 2XXHA 3DQFA 3G7WA 4IGTA 1I6BA 2AWLA 3F11A 3A3CA 4AQ4A 3TZAA 2F36A 1URGA 2QZ0A 1JQFA 5T3IA 1JVXA 2R9JA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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