3OSRA

Maltose-bound maltose sensor engineered by insertion of circularly permuted green fluorescent protein into e. coli maltose binding protein at position 311
Total Genus 191
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
191
sequence length
621
structure length
603
Chain Sequence
RWGSKIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELGGSHNVYIMADKQRNGIKANFKIRHNIEDGGVQLAYHYQQNTPIGDGPVLLPDNHYLSTQSKLSKDPNEKRDHMVLLEFVTAAGITKGEELFTGVVPILVELDGDVNGHKFSVSGEGEGDATYGKLTLKFICTTGKLPVPWPTLVTTLVQCFSRYPDHMKQHDFFKSAMPEGYIQERTIFFKDDGNYKTRAEVKFEGDTLVNRIELKGIDFKEDGNILGHKLEYNFNNPAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEDLKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title A genetically encoded, high-signal-to-noise maltose sensor.
pubmed doi rcsb
molecule tags Fluorescent protein, transport protein
source organism Escherichia coli o157:h7
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein,Green fluorescent protei
total genus 191
structure length 603
sequence length 621
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-09-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.155.10 Mainly Beta Beta Barrel Green Fluorescent Protein Green fluorescent protein 3osrA03
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3osrA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3osrA01
2DSFA 4DXUA 2IB5A 3MVXA 3SSYA 3DQOA 4R9GA 3ST0A 3V83A 5KDTA 3Q26A 1JW1A 4IK4A 5KCJA 2AH8A 1JW4A 4KYDA 2O29A 1UQWA 3K1MA 3DQ6A 1B58A 4W7AA 1A40A 1FTKA 2Z8EA 4PPKA 3T9XB 2O2BA 3THIA 2Q6PA 3SEXA 1H4UA 1Y3PA 1B5IA 4ELRA 4R9FA 4AB6A 4GLIA 4TLMB 4O3AA 2VD2A 3W9WA 3LF3A 1AMFA 4NMYA 4H48A 3VXCA 2NOOA 3SSKA 3VHTA 5DYHA 4J88A 3ED8A 2DUGA 4BDUA 1NNPA 5AA4A 3DQMA 2RC8A 2VZXA 3KJTA 4ZECA 4OYVA 5AA1A 5HZTA 4ELPA 4BLAA 2QLIA 4NWSA 2G6YA 2NVUB 4TLLB 1YCJA 4MF3A 1GR2A 2ALUA 2I3WA 4P76A 4KGEA 3LVAA 4RYWA 3K1NA 3GJ2A 2V3TA 3CFXA 5DVFA 5TP9B 3MP8A 3E9XA 1B40A 3KEIA 4H1XA 2I58A 1URDA 3T22A 4TZAA 4KEXA 2NXOA 2PT1A 4GFRA 2A53B 3SRYA 3UGWA 3G3KA 2DDCA 4TQUQ 3GBBA 4ZZAA 3UIFA 4P0GA 2HQKA 2GW4B 2GW3A 1JBZA 3TZAA 2Q57A 4IGRA 1UIVA 5HBCA 3MVZA 1EMLA 4J89A 3C4MA 2DP8A 5DVJA 4RNSA 2G16B 4IK8A 4PFYA 4Q9WA 4W73A 4R74A 5EHMA 3G3JA 3Q27A 4F3BA 3IB1A 4E0XA 4LJDC 2POXA 4OXVA 4ZEBA 2LAOA 4DLDA 1BKAA 3OO6A 4EF1A 5ISUA 4H8JA 2B65A 4Q0CA 1EMCA 3H03A 1MXUA 5HGEA 4YB6A 4W6PA 5L9OA 4ZE9A 2FYIA 4JBZA 4C1UA 3VICA 3AKOA 3MZBA 2B3FA 2V4EA 4X1BA 1DOTA 4KAGA 5EBJA 5AQBB 2C9IA 1N04A 3SVDA 4NF5A 4ND9A 2F6PA 4G8MA 1B3EA 1B3HA 3VV5A 4ISUA 2Y84A 1OXFA 2ZMBA 1MOVA 3RT8A 3EK4A 1VFEA 4RY1A 3KCSA 3N5LA 5I84A 1B3LA 4FEBA 1MG1A 5LTPA 3DQKA 3CFFA 3TTKA 4OEVA 3O97A 1B32A 3T9UA 4GESB 3P28A 2P4MA 2Q88A 2X26A 2RCBA 3TFLA 3DQUA 3TELA 3A3UA 1SQYA 1PB7A 4YMAA 1EMAA 1P1UA 2G2SB 4YKJA 2F8DA 1XVYA 4OFJA 1M5BA 3DQNA 2ZNUA 3FUZA 4RYAA 3WAEA 1FTOA 2GH9A 2XXPA 3MZ1A 2WSOA 5AA2A 4HQ8A 1LB9A 4U2RA 1NNFA 1Z1PA 3K1KA 1A55A 4AR7A 5EB6A 1MYWA 2DWIA 3KJ7A 2OZZA 2I49A 3FZVA 5DU0A 3FXUA 3G3FA 4IO6A 1R1NA 2O84X 4W6GA 2AWMA 1M5DA 5CMMA 1A54A 4C0RA 2UXAA 2BTJA 2D5WA 4FEDA 2UYFA 1P1OA 3CSBA 2HGYA 3EF7A 3E4RA 4R2FA 1A8EA 3K4UA 4ZIOA 2OJTA 3TTLA 5BUUA 3SG5A 5H8FA 5K2XA 1SW4A 3PV0E 1Y3QA 3VXBA 4XOWA 1O64A 4Q7RA 3RQTA 1XT8A 1OLCA 4GVOA 1FTMA 4FECA 3CFLA 1NKXA 1WDNA 3PJ5A 3IP2A 3KZGA 3RN8A 3HHFA 4JC2A 4EQ9A 4YKPA 2QL3A 4LONB 1D3KA 1PBPA 2F78A 3KN3A 3BFUA 2DQVA 1YFPA 4KPIA 3DQ5A 4P1QA 2O6AA 3AXFA 5DVIA 2WHTA 3IB2A 1H44A 4W6CA 1B0LA 3CRBA 4JRBA 3SVBA 3CGLA 4W6MA 3VVDA 3E13X 4DXNA 3U8QA 1R9QA 3M22A 4N13A 4XTCQ 3I3VA 5CM6A 4QRZA 3O77A 2YLNA 3Q25A 5H87A 2DE2A 4RPNA 3B6QA 3QXMA 1A7LA 4ZF3A 3ZUJA 4R6YA 3RPWA 1H76A 3M3LA 2KLFA 1OIBA 1S6ZA 4IK1A 3IAZA 3USDA 4EDSA 2DYXA 4EDPA 1DTGA 3KOTA 3K02A 1B05A 3V5AA 3PPQA 1MXYA 2Q8JA 5KZTA 4Q30B 2QS4A 1I69A 1R6ZA 3H6TA 4KI0E 3FATA 4NF8A 3DQ3A 2F97A 4XKRA 1B1XA 1UTHA 1B5JA 1Z1QA 2RCAA 4QSDA 4ZDMA 1LAFE 3H6UA 2DUEA 2XD3A 3LBSA 2PXWA 3HPIA 2OCUA 3U8AA 4ORNA 3SEWA 4TZGA 3OELA 3P7IA 1R9LA 4AQ4A 4ZEFA 4XKQA 3O2AA 4DXBA 2HZLA 2H5QA 4QHQA 2A5TB 1IIWA 3S4UA 4RPOA 5AA2D 1YTVA 1VFDA 3CG1A 5F9GA 4QFKA 3FVKA 3AI4A 3ST2A 1N76A 5KDTB 3B7DA 2RINA 4DXIA 3MP6A 4M4GA 3IO4A 4OETA 4F18A 3H6WA 5DRGA 1GGGA 3FJMA 1QXTA 5DPGA 3KN8A 5I2KB 4F3PA 2V84A 4FATA 3ILUB 2O7IA 1NNTA 3PD8A 2Z6XA 3SEYA 3EKHA 1CV7A 2H5PA 1H45A 2WISA 2Q2AA 2H9BA 3G7WA 2H5RA 3HV1A 5B7DA 1DPEA 3GLBA 4O3BA 4J8AA 4OGSA 2Y7IA 3PPPA 4LJCA 2PT2A 3SV5A 4JWYA 3DP6A 1B5HA 1IXCA 1JVXA 4H65A 3BXCA 4MBPA 5F7VA 3OGOA 3VHTB 1RMPA 3C31A 1MY3A 1URSA 1RMMA 3E3KA 4JEOA 4I2YA 1SYHA 1ANFA 4OJ0A 1WODA 3OO7A 2H5OA 3VVEA 1EH3A 4PP0A 3CR9A 3HHGA 3EVRA 2DDDA 4LQUA 3UP9A 4X48A 2NWJA 3V89B 5LTQA 3G3GA 4NEDA 4W7DA 5CMCA 4UTSA 4OFLA 1IITA 3O9PA 4F1UA 2XX7A 3ODBA 3ST3A 2OKWA 2QT2A 5I59B 3LSLA 3QSLA 3M8UA 3SG4A 4DKNA 4E0WA 2ONSA 5FVIA 3VLVA 2Y7PA 3P8UA 2XD2A 4G68C 4NWDA 2PXSA 4ZF4A 2YE1A 4I8CA 3RTWB 5IKBA 4X9TA 5H8NA 5DTXA 4KCCA 4KF5C 3TEPA 4W7EA 4KYEA 4W6RA 1MOUA 2XXHA 5DT6A 1SVXB 3A8SA 4BDLA 5I57A 1NMUA 4PFWA 5EHUA 4W76A 1LCTA 3S9MC 5H8QA 5EXUA 5F1QA 3D4GA 2X7PA 1S7YA 4W74A 4BDQA 3TAJA 2NUVA 5EYFA 3DPWA 4IO4A 3SSLA 1NH8A 4N6PA 1Y4TA 2V4EB 2DWJA 4MFIA 4W6JA 1UTBA 1F0BA 3I6VA 4L17A 2V3UA 4ELQA 3EVVA 3JV9A 3M3KA 3RLFE 2Z8FA 2QS2A 4G68A 2PBWA 4G8HA 2YPNA 3PGFA 4ESXA 2UVHA 4LATA 4NF5B 1QULA 1Z7NE 4OVJA 4WEDA 4YKKA 4P11A 1MM7A 1NH7A 3RGYA 3U8PA 4HE4A 2RKMA 4XGYA 4OY4A 2X7QA 3Q29A 2G29A 3IORA 2G5ZB 4KGFA 3PMWA 1P1WA 5H8HA 4F1VA 2Z6ZA 3IL1B 3OEMA 1M5CA 1QYQA 2DXYA 1RMOA 3U0NA 4NF4A 4W6NA 1B6HA 4MH5A 1AH5A 4IO5A 2I4CA 3QUJA 5L9MA 2XXYA 4XL5A 4EF2A 1A99A 1OMPA 1TFAA 2YFPA 3TMTA 1N0TA 2HFCA 1OQHA 3ZULA 1SBPA 4JFGA 2AL5A 4FE8A 2VD3A 3PJ7A 4GL0A 3G9AA 2GX2A 2AIXA 2H99A 5AA2B 1XOCA 2EMOA 3ZS6A 1IZ1A 3GB3A 3VLUA 3QAXA 5HZUA 2C9JA 2A46A 3MZ9A 5J1DA 3GZGA 4B5YA 3VVFA 1ELJA 4LZ5A 3FJGA 3BFTA 3M24A 2I6EA 2PVUA 1URGA 3TUSA 4OMBA 3N26A 3DQDA 2I0BA 4U21A 4OERA 3OSQA 4B30B 1G7KA 1KWHA 3PPOA 3MQ9A 4GF6B 1MXXA 3JZJA 4QSCA 4KW8A 1Q4BA 2HJOA 2VP1A 4W6HA 4FAJA 2H98A 4ZB1A 2ZO6A 3SVNA 2ZMWA 4ZZEA 2AHAA 1F09A 2ABHA 3GJ1A 1B2HA 4LA9A 3SDFA 2JADA 4JGEA 1EZOA 1MPBA 5DTZA 4AS8A 1OXDA 3L6GA 2QLGB 4ZBLA 1Q4CA 3OXNA 2AWKA 4GF8A 3IR1A 4KW4A 1MH3A 3U92A 4W6UA 1ZMGA 3SVCA 1USYH 2F34A 1SW5A 3IB0A 5AA3A 1TXFA 4W6DA 5LOMA 4W72A 4R72A 1XQMA 1Y4CA 5ICQA 5BTTA 1SW2A 4QFPA 2QU1A 2V25A 3ZKKA 3KG2A 3UG0A 4ZE8A 4DXPA 3TODA 1F9BA 1JW5A 3HO7A 3KN7A 3SSTA 4LJDA 3IR8A 1RYXA 4KQPA 2VVIA 1N3XA 1JNFA 3PMVA 2HGDA 2ARLA 2O1MA 5I2NB 1LLSA 5FTIA 4DXCA 3LSFB 1POTA 4U1OA 4K3FA 1N3WA 3TQLA 3SG2A 3DQ1A 1S9TA 4L13A 2XXIA 4EMQA 2FZUA 4KCDA 3EHTA 4YB7A 3LA1A 4GOBA 2ZYOA 4TOZA 3VDFA 1KYRA 3ONMA 2W7YA 3LVCA 1JEVA 5B70A 1GTKA 3U94A 2I4BA 3NT9A 4WXJA 3EHSA 1OQGA 1MY4A 3DLNA 3AI5A 3KGCA 3O6HA 5TPAA 1XAEA 3VK1A 2DD7A 2ANJA 3SETA 4W77A 3SKPA 4JDFA 5FHMA 4ZEDA 3S05A 5CMBA 1B7ZA 2QRYA 3C9HA 5JTYB 3VLWA 2GRVA 4EQBA 1B7HA 1QUJA 1SW1A 3MUQA 3S9EA 2A54B 3UN6A 2YE0A 1OXEA 3ST4A 3OENA 2H4IA 2HCGA 3UK4A 2OKYA 1LFIA 1PEBA 1LB8A 2FL1A 1RKMA 4KR5A 5A5XA 1OLAA 2F36A 4F29A 3OO8A 2YJPA 2XX8A 2O24A 4EN1A 3DQLA 2H5YA 2WKYA 2O7UA 3S2VA 1ZJLA 2CZLA 4W7FA 4Q7UA 4LZ7A 1NFTA 2DOJA 1USYE 4QFNA 2E1SA 1LFGA 3V3DA 1LBCA 3OEKA 1EMBA 1VR5A 4ZF5A 4I62A 1ZKBA 3DQEA 1LSTA 5I58A 1GGXA 2H6VA 1LBBA 2XXTA 2AWLA 1M5FA 2HAVA 5DEXA 1BIYA 3C36A 4HCYA 3CD1A 2GX0A 2Y7RA 1MY1A 4PETA 4EQ7A 1PB8A 3DPXA 1DSNA 3ZTFA 4LVQA 2ZYNA 4IK9A 2UYEA 1W7UA 4G4PA 2XX9A 2ICRA 3LSXA 2ZMUA 3QIMA 4GIZA 2REGA 1MRPA 3LSWA 3C33A 2A50B 2V3QA 4OZ9A 4JWXA 3SSPA 4AB5A 4FIMA 4C1TA 2OWTA 4DXOA 3PUVE 4XXUA 1Q73A 1Y3NA 3H6VA 1B4ZA 3EQ1A 4NWCA 2G3DB 4MLQA 3U0KA 1B46A 3S9LC 3T93B 4IO2A 3PPNA 3SSVA 4U1ZA 4W6KA 2D21A 2G6XA 3DQ4A 4IK5A 3T96B 5JEIA 3FJ7A 1OVTA 3N6TA 4JSDA 3EK7A 2VGQA 4XVPA 4RA1A 1QYFA 3T9VA 3MVWA 1Z7ME 3LS3A 4O3CA 4GRKA 4W7XA 5I56B 1BLFA 2R71A 3DQJA 1B1HA 4PFTA 2QJEA 5HBDA 2QPQA 1WVJA 3CVGA 3FASA 1NL5A 1JQFA 3MVYA 3MW0A 5FTHA 2G93A 1UTBB 3SVRA 4GWOA 3CSGA 4R73A 3Q28A 1H6RA 2OBGA 2A48A 4ZEIA 3TMRA 1FCKA 3R26A 1XSSA 3MJNA 2QS3A 4NF6A 3MP1A 5KCJB 1US5A 4G8NA 3SEVA 4ONYA 4G2ZA 1HCJA 1FTJA 3SG3A 3O6GA 4YICA 1YJ2A 3SEUA 5H8HB 4PFUA 4PPLA 1SDXA 5CI5A 3PPRA 4OQWA 1LGBC 3W9VA 4EXKA 2HRSA 3PUWE 2PMSA 3DQCA 4NF4B 2F6GA 4W6SA 1FW0A 4U22A 2IA4A 4H5FA 4ZFSA 4DIGA 4EULA 4HVFA 3SESA 3SVSA 5CBRA 2R9JA 1QUKA 4H3NA 3PIBA 3CFAA 4F3SA 5H89A 1DPPA 2WHUA 2I48A 1L5TA 2XXRA 4Q8RA 3UFZA 3FD3A 1KYPA 2V93A 2VADA 1IEJA 3CB9A 4BDOA 4F3GA 5AA4B 2DVCA 1XS5A 1ZIUA 1GV8A 4M1VA 2GHAA 5FHOA 1M5EA 1P99A 1JBYA 2Y7WA 3FVOA 3MBPA 2O69A 5DPHA 4WEPA 3EPEA 3O29A 4RTCA 2DS9A 1Y1ZA 4PQJA 4Z7EA 3U93A 4G77A 4F2QA 2XXQA 4OEUA 4NE4A 3WLDA 2OTEA 2XXXA 2Z6YA 3BXAA 2Y0GA 1VE4A 1ZBMA 2QMWA 1QYOA 3NEZA 2E0SA 1YPNA 2VOZA 2HQZA 2EMNA 3U8CA 4IO3A 4DCYA 4OESA 3SS0A 3TKDA 4R6HA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 2F7C A;  4RYS A;  4I9D A;  2OJK A;  2FA7 A;  2P0S A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
 2DSF A;  4DXU A;  2IB5 A;  3MVX A;  3SSY A;  3DQO A;  4R9G A;  3ST0 A;  3V83 A;  5KDT A;  3Q26 A;  1JW1 A;  4IK4 A;  5KCJ A;  2AH8 A;  1JW4 A;  4KYD A;  2O29 A;  1UQW A;  3K1M A;  3DQ6 A;  1B58 A;  4W7A A;  1A40 A;  1FTK A;  2Z8E A;  4PPK A;  3T9X B;  2O2B A;  3THI A;  2Q6P A;  3SEX A;  1H4U A;  1Y3P A;  1B5I A;  4ELR A;  4R9F A;  4AB6 A;  4GLI A;  4TLM B;  4O3A A;  2VD2 A;  3W9W A;  3LF3 A;  1AMF A;  4NMY A;  4H48 A;  3VXC A;  2NOO A;  3SSK A;  3VHT A;  5DYH A;  4J88 A;  3ED8 A;  2DUG A;  4BDU A;  1NNP A;  5AA4 A;  3DQM A;  2RC8 A;  2VZX A;  3KJT A;  4ZEC A;  4OYV A;  5AA1 A;  5HZT A;  4ELP A;  4BLA A;  2QLI A;  4NWS A;  2G6Y A;  2NVU B;  4TLL B;  1YCJ A;  4MF3 A;  1GR2 A;  2ALU A;  2I3W A;  4P76 A;  4KGE A;  3LVA A;  4RYW A;  3K1N A;  3GJ2 A;  2V3T A;  3CFX A;  5DVF A;  5TP9 B;  3MP8 A;  3E9X A;  1B40 A;  3KEI A;  4H1X A;  2I58 A;  1URD A;  3T22 A;  4TZA A;  4KEX A;  2NXO A;  2PT1 A;  4GFR A;  2A53 B;  3SRY A;  3UGW A;  3G3K A;  2DDC A;  4TQU Q;  3GBB A;  4ZZA A;  3UIF A;  4P0G A;  2HQK A; 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