2PPT | Genus

Total Genus 39

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	39
sequence length	149
structure length	149
Chain Sequence	MMGAKMAESLRLTCLACGQANKVPSDRLAAGPKCGICGAGLITGKVAGIDPAILARAERDDLPLLVDFWAPWCGPCRQMAPQFQAAAATLAGQVRLAKIDTQAHPAVAGRHRIQGIPAFILFHKGRELARAAGARPASELVGFVRGKLG

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Crystal Structure of thioredoxin-2 rcsb
molecule keywords	thioredoxin-2
molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Rhodobacter capsulatus
total genus	39
structure length	149
sequence length	149
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 1.8.1.8: Protein-disulfide reductase.
pdb deposition date	2007-04-30

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
2.20.28.140	Mainly Beta	Single Sheet	Rubrerythrin, domain 2	Rubrerythrin, domain 2	2pptA01
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	2pptA02

3TB2A 2L5OA 3DVXA 2I1UA 3WT2A 1XWCA 3D0ZA 4J56E 1PKZA 2IMFA 5IMDA 4MLYA 1T4ZA 9GSSA 4DSRA 1CQHA 1X9SB 3CTFA 5ECIB 2DJ0A 3QOUA 3EMPA 2OE3A 3HJPA 2WGRA 1OVNA 3C73A 4YAVA 4H86A 1GWCA 2OE1A 5DQYA 2OACA 4XHMA 5DALB 1RK4A 5DJLA 4K0NA 4ECIA 2JZTA 3FYGA 2PERA 2B1LA 1TKDB 2DIYA 1GLPA 3GHAA 4ML1A 4MF6A 1VF4A 3Q74A 1NSWA 1ZOFA 2CZ2A 5HR3A 2NPBA 3QMXA 1GUMA 3GL3A 3ZL5A 4NMUA 1JHBA 1GSSA 2O85A 3F0IA 4HU7A 2C8UA 3ZIVA 1ACVA 4KB3A 3D5JA 4PNGA 4MJBA 3EWLA 3D6IA 3FHKA 2WULA 4MK3A 1ON4A 2LS5A 1NM3A 1SKWB 4PQ1A 5B6NA 4BA7A 4ZB6A 3TKPA 4GQFA 5GAPD 2H6YA 1A8LA 4KCAA 2F8FA 3H1NA 3APSA 5D93A 1W89A 2LEGA 2VCQA 3EE2A 2EIOA 4WBRD 4IP1A 2CV4A 5C00A 2IL3A 4ID0A 3MWHA 5IOXA 5GSTA 2H76A 3DYRA 1AQVA 2C0DA 2R3XA 1T4YA 1QK8A 5EPFA 1UC7A 5HFKA 1FB6A 2J9UB 3KIJA 2HT9A 3G9BA 3GIXA 2LNTA 1TJDA 1F3AA 1QFNA 4TXOB 1U6TA 2LJRA 3S9FA 3UBLA 3IPZA 4KSMA 1G6WA 2H0GA 2AJQB 1T8EB 1U3IA 4OMVA 4EKZA 3GSSA 1X0RA 2GS3A 5D96A 1GSFA 4K7NA 3LGCA 3LG6A 5AIXA 1V57A 3FZAA 4MPGA 4HZ2A 4YQVA 3UBKA 3QCPA 1Z5YE 3NOFA 1YF1A 2IMIA 2V6KA 1Z6MA 3EU3A 5CP1A 4GF0A 4D73A 2VAFA 2H1GA 2ZUPA 1X9WB 3ZFLA 5ABRA 2YZUA 2VD1A 4F0BA 2GSRA 5CRWA 2LQQA 1B9YC 1B4QA 1SENA 2HSHA 14GSA 2KP2A 1QUWA 5H5SA 2YWOA 3F9UA 1TU7A 2CX4A 4V1Ap 4IP6A 2M46A 2HZEA 4F82A 3PR8A 1EP8A 2RM5A 4PGTA 5E4WA 3FR3A 4LMVA 2VCZA 1O7UA 4PX1A 3VWVA 4XS6A 3M9JA 3I69A 1F2EA 2ES7A 3NIVA 2IMDA 2GT5A 1A2LA 2CX3A 1WE0A 4IVFA 3LWAA 4PUAA 3ZLPA 1BYEA 1SK0A 3BOAA 4EXJA 5J9BA 2FWEA 1QQ2A 5FHIA 3A3TA 3BCIA 2MMNA 1LBKA 1XWKA 4EDYA 6GSSA 2YWNA 1MD3A 3GA4A 4TR0A 2GSQA 3ERFA 1A0RP 2JSZA 3HDCA 1Z6NA 2FA4A 2LQOA 4MDCA 2H1AA 5H5RA 1THXA 2C0GA 3FZ5A 1ST9A 10GSA 1DSBA 3LORA 5IOWA 3LQ7A 3KGKA 1J08A 22GSA 2DC5A 2EC4A 2BMXA 4PQHA 3IRAA 1X9MB 2JL4A 3CMIA 1UA5A 3W6GA 3HZ4A 2IFQA 4PUFC 1N8JA 4EL1A 4YQUA 2PMTA 3TJGA 2HRFA 3QR6A 4XS4A 1U88A 5E59A 2YN1A 3FR6A 1GUKA 4ZBAA 2YWIA 1A24A 4MMMA 2J23A 2MZCA 4LL4B 3ZZXA 2WJUA 3GTUA 3LJRA 1SKSB 4J2FA 3ZIJA 2GT6A 3LXZA 1MTCA 5IMAA 3RDWA 3ZFBA 3KMOA 1FVJA 1F37A 3TJKA 1YEPA 1YJ6A 1GRXA 5ELAA 3GL5A 2LRTA 5CRDA 3EINA 2L5LA 3APOA 3D22A 1XVQA 3EVIA 1GSYA 4KGIA 2H72A 2CVDA 4KDXA 4OO5A 2CA8A 5H5QA 5G5FA 3GFKA 2EIQA 3L0HA 2RUEA 1EZKA 5DCGA 4KDYA 1R26A 3DMLA 2N5BA 5F06A 3L9VA 3RPNA 5HFIA 2V1MA 3L78A 3N9JA 2O89A 4NWYA 1BQ7A 2GLRA 3O6TA 1K0MA 4DVCA 1U3AA 4ILFA 2I3YA 5CRHA 5CO3A 2CVKA 2O8VB 3EYTA 2XC2A 2FHEA 2VCWA 1MEKA 4GCIA 1AC1A 2ZNMA 3J7Yb 1LU4A 4PURA 2P5RA 4QL9A 1K0BA 2VL9A 1OKDA 4RI7A 4ECCA 1JFUA 4MPFA 4N30A 2PN8A 2WB9A 4O92A 4GSSA 3A2VA 1GULA 3IC4A 4K6XA 4POLA 2B5EA 5ECNB 1BJXA 4HU9A 3H93A 3GKMA 1TRWA 4I2UA 1SU9A 3TKQA 1GH2A 4BWQA 4K2DA 1TRVA 3M3MA 4O5RA 3KH9A 4TW5A 1XBSA 4OFNA 1FO5A 4LMWA 4MZWA 2N5FA 3UOMA 2H0HA 4WR5A 4IQAA 3UL3A 1E6BA 2B5XA 1I5GA 2AUVA 2H1BA 4XXBB 2FWFA 3EURA 1ZYEA 2I4AA 1SK2A 1VF1A 1SKRB 1XWBA 1K0OA 1A2JA 2ZCTA 1CQGA 3DEXA 4F0CA 3I6AA 2GSSA 3Q19A 3I43A 3ME7A 4AGSA 1M2AA 2DJJA 2G2QA 1GNWA 4FH8A 5F8BA 6GSWA 4WBJA 2QSIA 3QFAC 4JZQA 4FYBA 5J9CA 1NHOA 5JCWA 3Q18A 4NV2A 3QPMA 4K9ZA 2P31A 5ID2A 1T00A 5G2ZA 4RQRA 4HJ2A 3ZREA 2GVPA 4XS1A 2VM1A 1EV4A 5F07A 3ZTLA 5A4WA 1OE8A 4IHUA 1AXDA 4DEJA 3GH6A 1PA3A 5HR0A 3HD5A 11GSA 2A4VA 2RUFA 1AQXA 2IMKA 3D4TA 4IKHA 1M7TA 3HXSA 2XPEA 4N11A 3MSZA 4XS4B 4HUAA 2PGTA 1HD2A 3H8QA 2VCTA 3QFBC 3HJOA 3E0UA 4WF4A 5DDLA 5ECRB 4WF5A 3GTUB 5CAXA 2H8LA 2VL3A 4ACSA 4EF0A 3LSZA 3R2QA 2RLIA 4TR1B 1G7EA 2TRXA 3VWWA 3WGDA 3VI7A 5J5NA 1ZZYA 4ZB9A 4BVXA 2PU9C 1BG5A 1DE1A 4KDUA 3RAZA 1XW5A 2V6OA 1RQMA 2E7PA 3FY7A 1FW1A 1GTBA 2KUCA 2NDOA 4F9ZA 4N10A 2L59A 3TJBA 2FLSA 2XHFA 2XPDA 5A5KA 1XZOA 3EMXA 2AHEA 3V1WA 2V2GA 1ZL9A 3WGXA 1DBYA 1TRUA 3GKKA 3P8WA 3WT1A 1KNGA 4NHWA 4EO3A 1U87A 2AV4A 1PRXA 1WMJA 1TI3A 2CAQA 4GSNA 4LLRA 4OFMA 3LEFA 3HVSA 4IELA 2LSTA 5D9WA 3TDGA 4G2EA 4FYCA 2C6BA 3L4NA 2F51A 1AW9A 1SYRA 2K6VA 3J7Yk 5ENUA 1A2MA 1B9XC 4NHZA 6GSYA 4I8BA 1OYJA 3KMNA 2HSYA 2DMMA 4L5OA 1KBNA 2A2RA 3QAGA 1A8YA 4X0XA 1V9WA 2P0GA 4WEYA 3PINA 4KNDA 1YKCA 3ZVJA 1DE2A 1A23A 1G7OA 3M0FA 3VLNA 1O85A 3B0AB 2DJKA 3VWXA 2AB6A 5AISA 5EY6A 4K1FA 1O8XA 4IJ3A 1XIYA 5JCUA 1USBA 3ZITA 5L71A 5G31A 1IYHA 2L6DA 3MAKA 2ON5A 3F6FA 4IBPA 2VOCA 1S3DA 3U6VA 2MMAA 2PVQA 4IJIA 5GZZB 2TIRA 5G1KA 4JRRA 1YY7A 13GSA 3FRCA 2X64A 1OC9A 4KUNA 4IS0A 3ZVJD 6GSTA 3O76A 1DUGA 1Y6EA 3BJ5A 1XW9A 3JCML 2C0EA 4AJ8A 1V2AA 4KSOA 4PNFA 1KTEA 3APQA 4Q5QA 3HVXA 2YANA 5HR2A 1THOA 5IIZA 3FZ4A 4NPBA 4MF5A 1HNAA 4KA0A 1HQOA 5DQSA 4Q5NA 2V41A 5IO0A 1ZGNA 2ON7A 3TRXA 1QXHA 2TRCP 1HNBA 4V2MA 5GAND 2X8HA 3RPPA 1WP0A 1UVZA 1R5PA 3WYWA 5FT3A 4OD7A 4I6XA 4OCFA 1EWXA 5ID2B 4L0UA 4ZL8A 3TKSA 2C3NA 1K3LA 4KAEA 4DSSA 2B7KA 1TI1A 2JZSA 3GKXA 5DAKA 2H19A 1VGLA 4AJ6A 4TVEA 2JACA 3CSHA 4BL7A 5JWOB 2JSYA 1HYUA 5LCZA 1GNEA 3CSJA 3F4RA 2WS2A 1XW6A 5FWGA 4Q5FA 5D9VA 3TRPA 3A5WA 1SJZA 4IGJA 3TKSC 3UJ1A 5LD0A 1YF0A 1K0AA 4E8EA 1AUCA 4AF2A 4QQ7A 4XRAA 1ILOA 2GQMA 3H79A 3HVVA 4I97A 1UN2A 3F63A 2YPMA 2I9HA 2GZZA 2F9SA 3QD9A 4KX4A 2PUKC 3QDNA 3KP9A 2DBCA 3UAPA 2YP6A 3KEBA 4KCEA 4O7HA 1ZYQB 1F9MA 3F8UA 1QMVA 2YNXA 3VPQA 2VM2A 3LYKA 1ERUA 4G19A 4ZBBA 3QAVA 3UIWA 2WRTA 2CVBA 3FW2A 1ERTA 2GZPA 1YQ1A 2OA7A 3TJJA 4L5LA 4YQMA 2PWJA 3Q6OA 4POMA 1FHEA 1PX6A 1R5AA 2GSTA 5ECHB 4O32A 4V2NA 1SL2B 4HEA2 3VK9A 1GP1A 1OKTA 3CYNA 3GURA 3IHQA 3TUEA 4TOPA 2YV7A 17GSA 4XCSA 4ML6A 1XVWA 5COHA 2GZYA 1JZOA 4PQIA 2CQ9A 1EP7A 1M99A 2K9FA 5DALA 4CW9A 4EDZA 2X8GA 2B1KA 1M2BA 2B6MA 3GV1A 2KHPA 4MP4A 16GSA 4DSQA 3DWVA 2LRCA 2MBSA 4G9HA 3TKRA 2MMZA 2WFCA 3WGEA 2I81A 2YJ7A 5DJMA 2RM6A 1S3CA 1SK1A 1VF3A 3D21A 1X5CA 5KEJA 3C1SA 3UARA 4E8HA 3TGZA 1EOGA 4WR4A 5HQPA 2OADA 2WZ9A 4K7IA 2JADA 1X5EA 4RQXA 2YWMA 1M2DA 3P90A 2R37A 3LFLA 2O7KA 2VO4A 2RIIA 1N2AA 3VPTA 5IQYA 2EIRA 2L57A 2VUPA 4KW6A 2GDRA 3EC3A 3TOTA 1Z7PA 2F8AA 3IV4A 3CBUA 3F3QA 4MJEA 3VURA 1OC9B 2H66A 2N5AA 4JBBA 5IM9A 3SBCA 2E2GA 2C6AA 5C04A 3C71A 4ZBDA 1MDKA 2CT6A 1T7PB 2ALBA 2E0QA 3OR5A 4F03A 5KN2A 3L9UA 1TTZA 4D73B 1S3AA 2R4VA 3KZQA 4V1Ag 1GL8A 3SWLA 4KE3A 2X8CA 3IBHA 3N5OA 2LRNA 2QGVA 3IK7A 1G0TA 2HZFA 4GTUA 3VWUA 3U5RE 1BAYA 3CRTA 5KN3A 2HZEB 4CHSA 2YV9A 3DD3A 2VLVA 1Z3EA 4BVYA 4MH3A 2K8VA 3C1RA 2H71A 1SL0B 4MF7A 6GSVA 5D73A 3GRXA 3K8NA 1EOHA 3RHBA 1Z7RA 1YKAA 1C72A 1MDJA 2VIMA 3ZRDA 3A2XA 4ECBA 1PN9A 1WJKA 1WIKA 2WDUA 2L6CA 2GQKA 2DMLA 5AGYA 4ISDA 5IO2A 1MD4A 2VD0A 2HRNA 1Y25A 3GYKA 2CAIA 1QGVA 4F2IA 2REMA 4X43A 1AAZA 1ML6A 1ERVA 1JZRA 4WKWA 3ED3A 2DJ2A 4EVMA 3G7IA 2KOKA 6GSXA 2MYGA 5IMVA 1YZXA 5ECMB 4MABA 4I2TA 2IFQB 1PSQA 2FWHA 1JLVA 5IMZA 1X5DA 3HCZA 3F4SA 5DCHA 5J41A 4I5QA 1VF2A 3DVWA 1TU8A 3MNGA 8GSSA 4IQ1A 1XWAA 3CSIA 5CNWA 4PXOA 3IAS2 2R5GA 1M9BA 4FYUA 2H1DA 1PL1A 2H73A 2R6KA 4BWSA 1AIUA 5ELGA 2K8SA 1EGOA 2MMOA 1O8WA 2JZRA 1LJRA 4RUVA 4K0GA 5G5EA 3GX0A 1OC3A 4K8MA 5INYA 2OBIA 4JU5A 2C3TA 3ZMKA 2PPTA 5EVOA 3H4KA 1M0UA 1K3OA 2YCDA 5JWRB 1R4WA 1BX9A 4GSTA 3FKFA 4QL7A 1EEJA 3G7YA 6GSUA 1HNCA 5GSSA 3KTLA 1Q4JA 3KD0A 1H4OA 2C0FA 5F0GA 3C7MA 5D9XA 1O6JA 2LNSA 4KH7A 4AJ7A 1SYXA 4ZL9A 4HDEA 3ERWA 5ECQB 1H75A 3ERGA 3IR4A 4HS1A 4FO5A 2FCHA 1TOFA 4TR4A 1GSEA 2B5YA 3TRQA 3UEMA 4TR3A 3US3A 4LA1A 2YOIA 1ZMAA 1WWJA 2HYXA 3CRUA 3IOSA 4J57E 2J9HA 1G6YA 2LUSA 1OE7A 5AN1A 4TRXA 1EEMA 1MDIA 3KH7A 1GSQA 3NZNA 5CYYA 4ZL7A 2VCXA 2G0FA 4GXZA 3C8EA 5CREA 3L9SA 2IWTA 3E3EA 2HI7A 3DGQA 4XIHA 4JEDA 3KP8A 2KLXA 4ZXGA 4ULXA 3M1GA 1TW9A 1GTAA 3A2WA 18GSA 2AYTA 4TXVA 4YAPA 5HFGA 2IPAA 1I9DA 1AQWA 1V98A 4GWRA 3HJMA 3HKRA 4ZB8A 3GNJA 2BTOT 3KM6A 4OWYA 3W8JA 1O73A 2GQLA 1JZDA 1KEBA 2OKAA 3DKSA 2AAWA 1A0FA 4HOJA 4HZ4A 2FGXA 5F05A 1PMTA 1WPIA 2VLUA 5D8IA 1SD8A 1TRSA 3FR9A 5A4VA 2C4JA 1XFLA 1TK5B 3IXRA 3EU4A 3IDVA 2DJ1A 4JR6A 2XBQA 2LJAA 2H74A 4WXTA 1R7HA 3TKSE 3O3TA 2FA8A 1GUHA 1TK8B 1OAZA 2GGTA 3GSTA 4Z7XA 1SD9A 4K7OA 4L8EA 1FB0A 2DLXA 2L4CA 2H70A 3CXGA 5LNKe 4MH2A 1TXXA 2XBIA 3GMFA 5CRGA 5HR1A 2LKUA 3FK8A 3LXTA 1SJIA 2VLTA 4N0ZA 3HHVA 1GTUA 5G30A 3ME8A 4MJCA 2E2MA 3P2AA 5IMFA 5D9TA 4OFTA 1URMA 4HQSA 1PQNA 1M9AA 2L4QA 4TN8A 5ECOB 3UVHA 1K3YA 1E2YA 2F3MA 1JLWA 3WD6A 4ZIJA 2DIZA 4JE1A 2O87A 2FY6A 2H6XA 3BD2A 4IW9A 1OC8A 3I9V2 3KXOA 12GSA 4TKYA 3G7JA 1EGRA 1XWGA 4MZBA 2FWGA 1JZWA 3IE3A 2LTKA 2NVLA 4WETA 1T1VA 1VRSD 1W4VA 4HI7A 1XOBA 1TP9A 2K18A 2KP1A 2B7JA 4MA9A 4YH2A 2IMEA 3MDKA 2DJ3A 2HFDA 2QC7A 20GSA 1ABAA 1K0NA 3UMAA 4Q5RA 2M80A 1XOAA 3GH9A 1FAAA 5ECSA 2PBJA 3LYPA 2BJXA 3AY8A 4N0VA 2MBTA 4V2LA 5KN0A 2H0IA 1NHYA 3P7XA 3IK9A 2HNLA 1PD21 2FD3A 1FOVA 4EE0A 3HYPA 4GLTA 5KN1A 2D2ZA 4TR1A 3FZ9A 3IA1A 5B7CA 3DRNA 1PX7A 5ECLB 1TK0B 4X1UA 5JWQB 2FUG2 4MZCA 1J0FA 3VFIA 2A2SA 3KTBA 1XPVA 2YZHA 3TJFA 3BCKA 3M8NA 5DVBA 5IPHA 3QAWA 2C3QA 3M9KA 2CZ3A 1FVKA 4P3YB 3CTGA 2OBKA 5J4UA 2B3SA 3HZ8A 1B8XA 4FIWA 2H75A 4POKA 5EL8A 5A4UA 3W8SA 4IN0A 5B6MA 3F6DA 1GSUA 2C1YA 3KCMA 3ZMLA 2R2JA 2IJYA 2LV3A 3E9JB 3PGTA 2IN3A 4MJAA 2WCIA 1J9BA 2IIYA 7GSSA 1ERWA 4CDOA 3PH9A 1GSDA 3HA9A 4NXIA 2H01A 19GSA 1PKWA 2VL2A 3D4MA 3KJYA 4GRFA 2P5QA 1PL2A 1YEXA 4NAXA 3DIEA 1GTIA 1WRYA 1SL1B 1RW1A 4XTSA 2YJHA 3GUSA 4NV5A 1O81A 4EC0A 2OE0A 4L0WA 3TCOA 1T3BA 3GX8A 4EUYA 1B4PA 3ISOA 4TXOA 2VL2C 2V32A 1XXUA 5J3RA 1B48A 1V58A 3GN3A 1K0CA 4BPYA 4G10A 3RBTA 5IPGA 4XRDA 5IMCA 4ZILA 4OO4A 1IYIA 1EV9A 3UVTA 2NBSA 4POBA 3GKNA 1NW2A 2HLSA 3ZYWA 2FNOA 4DSSB 4LL1B 1GLQA 5B8AA 2OJLA 5JCGA 1F6MC 4HQZA 5DAKB 4RI6A 2HXKA 2H30A 1Q98A 2HE3A 3VI5A 3F3RA 4GQCA 1K0DA 3FEUA 5DBQA 5G1LA 4JR4A 3DXBA 1ZCPA 1PGTA 2VCVA 2LJKA 1TDIA 2NTOA 3BBYA 2JU5A 4ECJA 5ECPB 5AIVA 2M72A 2PVOC 2QKEA 2DSAA 3F4TA 4OCEA 1BEDA 1F3BA 3TOUA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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Chord Diagram

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