2PPTA

Crystal structure of thioredoxin-2
Total Genus 39
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
39
sequence length
149
structure length
149
Chain Sequence
MMGAKMAESLRLTCLACGQANKVPSDRLAAGPKCGICGAGLITGKVAGIDPAILARAERDDLPLLVDFWAPWCGPCRQMAPQFQAAAATLAGQVRLAKIDTQAHPAVAGRHRIQGIPAFILFHKGRELARAAGARPASELVGFVRGKLG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of thioredoxin-2
rcsb
molecule keywords thioredoxin-2
molecule tags Oxidoreductase
source organism Rhodobacter capsulatus
total genus 39
structure length 149
sequence length 149
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.8.1.8: Protein-disulfide reductase.
pdb deposition date 2007-04-30
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.20.28.140 Mainly Beta Single Sheet Rubrerythrin, domain 2 Rubrerythrin, domain 2 2pptA01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2pptA02
1GNEA 1XBSA 1AQVA 9GSSA 3IPZA 2FD3A 3UBLA 1H4OA 1GSQA 3GL3A 2GSSA 1X9SB 2FWGA 1N8JA 2WDUA 3FZ9A 1DUGA 3GFKA 2B3SA 1A0FA 1FG4A 2MBTA 1RK4A 1YJ6A 1QK8A 2V6OA 2PU9C 3JCML 1GTAA 2LRCA 4XCSA 1EGRA 2I4AA 2R2JA 3BJ5A 5GAPD 2V6KA 1G7EA 4MP4A 4EDYA 1UN2A 1F2EA 2A4VA 4RI6A 1O8WA 4I2UA 5DCHA 3DYRA 1OC9A 2A2SA 1Q4JA 1GSSA 1V9WA 3GSTA 17GSA 3GTUB 6GSVA 1YKCA 2JL4A 2X8CA 3VK9A 4Z7XA 3ZVJD 3F6DA 3EC3A 4GWRA 3W6GA 3O76A 3C71A 3APQA 3I9V2 1I9DA 1EOHA 4K1FA 3ED3A 3ERGA 4MABA 2O7KA 5DAKB 2FWFA 1OC8A 2P5RA 3NIVA 1X5CA 5IM9A 3DRNA 4XTSA 3TKSC 4IBPA 2O89A 3ME7A 3HVSA 4HU9A 5LCZA 4AJ6A 1UA5A 1R5PA 2GS3A 1NSWA 3EMPA 3LORA 3IV4A 10GSA 3IBHA 4MF5A 6GSXA 1NM3A 2DJ1A 3U5RE 4IQ1A 5H5SA 1B4QA 4D73A 3L4NA 4TXOB 1XVQA 4N30A 2RUFA 1K3OA 2FHEA 1V40A 3VURA 1XVWA 3TJGA 1BG5A 2I81A 1JZOA 2LSTA 3GNJA 4WXTA 4JZQA 2VUPA 3EVIA 1A8LA 3SWLA 4GQCA 5F0GA 3FY7A 1R4WA 1RW1A 4FO5A 1EP7A 3UIWA 2LUSA 5JWQB 2AV4A 18GSA 1S3CA 2XBQA 12GSA 1YQ1A 2JU5A 2VCTA 1B48A 1PL2A 5HFIA 2H0HA 1BEDA 4LA1A 4GTUA 4HJMA 3ZITA 3VPTA 1V98A 3GKXA 4HJ2A 3GV1A 2N5BA 2FCHA 1HQOA 3D5JA 4L5LA 1YDKA 3CXGA 3VFIA 1EEJA 4POKA 3E9JB 3PR8A 1FVJA 3LYKA 1G0TA 1K0CA 5ECPB 4MJBA 1G7OA 4RI7A 2DMMA 1X9WB 2PERA 3A2WA 3M8NA 2MMAA 8GSSA 1EWXA 4IN0A 4QL9A 1SL1B 1TU8A 4KAEA 1M9AA 2WGRA 4WETA 4PXOA 2MMZA 16GSA 2FNOA 3B08B 5J4UA 4QQ7A 3DD3A 3UEMA 2EIOA 3GH6A 2NBSA 3F3RA 5A4VA 4IS0A 5CREA 5G5EA 3GKNA 4JEDA 3M3MA 3V1WA 3ZZXA 4MA9A 5HQPA 3E0UA 1F3AA 13GSA 2IN3A 2H0GA 3US3A 1X9MB 1T00A 3KCMA 5CAXA 3RPNA 5JCWA 2GQKA 1ST9A 20GSA 2LJAA 2AYTA 1GRXA 4N0VA 3C1SA 2NPBA 2V1MA 3CBUA 3H93A 1AQXA 3TKPA 2JZRA 2OJLA 1F3BA 4TR4A 3APOA 1YKAA 19GSA 2DJ3A 3TOUA 2H1DA 4LLRA 2BTOT 4POBA 4E8HA 2IIYA 5E59A 1O85A 5A4WA 4X43A 3TKRA 1A23A 2DBCA 1SYXA 3IR4A 2RLIA 5ECHB 4GSTA 2IPAA 2FWEA 4WR4A 3TJJA 4O7HA 2HSHA 5EPFA 4V1Ap 3D6IA 1TP9A 4YAVA 4F0CA 2C0EA 3TKQA 2LJKA 2GQLA 4L5OA 4TXVA 1XIYA 4MLYA 3C73A 2H30A 3QMXA 1VF2A 1SJIA 1TKDB 4BVXA 2LKUA 3UOMA 1A2MA 4KE3A 1M99A 4WBJA 2MZCA 3CMIA 1PGTA 1YEPA 4DEJA 2XBIA 2HSYA 3BCKA 1SL0B 2H74A 3A2VA 5AISA 4YAPA 2OE0A 3F4TA 2H1AA 2YP6A 1VF1A 3GUSA 4K9ZA 3IAM2 3TCOA 4ECCA 3F63A 4G19A 2L4CA 5JCGA 2B1LA 1DE2A 4OO5A 3GX0A 3FYGA 3KEBA 22GSA 3RAZA 2JZSA 1TRVA 3PGTA 1Y6EA 1A2JA 3H4KA 1K0OA 4XS4A 2YANA 1V58A 4EE0A 2M80A 1BX9A 2O8VB 4ZL9A 1K0AA 3D4TA 1T4YA 3QD9A 4AJ7A 3DMLA 3CSJA 2VCQA 2QKEA 4NPBA 3QAWA 3LSZA 1T7PB 4YQMA 5J9BA 4DSSA 2H0IA 1O6JA 2FUG2 3A5WA 4HQZA 3RHBA 1FB6A 2G2QA 1K3YA 3A2XA 2HFDA 3W8JA 2GSQA 4PQHA 2DJ2A 1QGVA 5IIZA 2LRNA 4GXZA 3ZLPA 4LMWA 2EIQA 1AAZA 3D4MA 3TKSE 3KMOA 2PGTA 5D9XA 5F8BA 3IK9A 5G1LA 2C3QA 3FKFA 2OACA 2OA7A 2K6VA 3VWVA 1Z6NA 5CRGA 2CX4A 2VD1A 2FLSA 5CRWA 1VGLA 1M2BA 2CX3A 1HNBA 2CT6A 5DALA 1PKWA 3FZ5A 2GTUA 1XW9A 2E2GA 1PX7A 2B6MA 4OFNA 4MPFA 5A4UA 2FA4A 2LQOA 3EE2A 2IMFA 1UC7A 4F03A 2DMLA 5KN2A 4ZB8A 3TB2A 1TW9A 3GHAA 2YN1A 3BD2A 4ZBDA 1Z7PA 1ZOFA 4MH3A 2XPEA 4EXJA 1GSYA 3KMNA 2KP1A 4Q5QA 2HZEA 2D2ZA 1M9BA 1TXXA 5AN1A 2H1BA 3EINA 3HXSA 4K6XA 2VLUA 4MDCA 4O32A 2ON7A 2R3XA 4FH8A 2DSAA 1K0MA 4O92A 5IMAA 3RDWA 3FR9A 2FGXA 1ZZYA 4MZWA 2CZ2A 4K0NA 1NHOA 3TRPA 1XZOA 4HOJA 2B5YA 3H1NA 2EIRA 1M0UA 1WIKA 5CRDA 4DVCA 3DWVA 1U88A 1XXUA 5DQSA 1LU4A 2VD0A 2RM5A 2TRXA 1SKRB 5IO2A 2GZZA 1EV9A 1X5EA 1O73A 2L4QA 5ID2A 5IPGA 2LQQA 3L9SA 3ZREA 3KIJA 3NOFA 1W89A 4WF4A 1BJXA 4GQFA 4EUYA 2I3YA 3CYNA 3G9BA 2IWTA 3L78A 1PMTA 2OADA 4KB3A 4EO3A 5FWGA 1GNWA 4YQUA 3F8UA 1ZYEA 3WGXA 2GT5A 1HYUA 2AAWA 4ML6A 2OE3A 1OE7A 1QUWA 1URMA 5KN1A 1SU9A 5J3RA 3IOSA 2DC5A 2PPTA 4K7NA 3LG6A 5H5RA 1MTCA 4OO4A 2J9UB 1SL2B 5DCGA 2RM6A 4G9HA 3MWHA 3M0FA 2PN8A 3CRUA 1B9XC 3ERFA 1KNGA 2QC7A 5J9CA 1NW2A 4KDYA 4IQAA 1KTEA 3VPQA 4KDXA 5HR0A 3IAS2 2V41A 3FR6A 4MJAA 2VL2C 2LV3A 3P90A 1YEXA 3FZAA 1IYHA 2VCVA 1EV4A 3CTFA 4PUFC 2WRTA 1O8XA 3VI7A 1TRWA 1OAZA 3GX8A 5IMDA 4PNFA 2AUVA 4X0XA 2C4JA 3HDCA 5CRHA 3GSSA 2LS5A 4NV2A 5IOWA 4MPGA 1QMVA 1XPVA 3F6FA 4Q5NA 1K0DA 4FYCA 3GTUA 4JR4A 2VM1A 1ERWA 4WEYA 2B1KA 4G10A 2CV4A 2F8FA 4ZB6A 3KP8A 5CP1A 1O7UA 3LWAA 3EYTA 3IA1A 5DAKA 1K3LA 4XS6A 2B5XA 3LXZA 2KP2A 5AIVA 1GSDA 1WOUA 5AGYA 3E3EA 2KUCA 4IJ3A 1JZDA 3KTBA 3APSA 2IJYA 1UVZA 3GYKA 1E6BA 4OFTA 1F6MC 3TJFA 1QXHA 3VWXA 3QFBC 4HZ2A 4I97A 1N2AA 3R2QA 4F82A 1ACVA 1WPIA 3RBTA 4XRDA 4DSQA 4TXOA 3G7JA 3G7YA 3GN3A 3LEFA 3DGQA 3GIXA 2E0QA 2L5LA 3ZIJA 2YZUA 3DIEA 1ZCPA 5FT3A 1MD3A 2VLVA 1A0RP 4EC0A 5B8BA 4BWSA 2IMDA 3HD5A 4OD7A 5D9TA 2X8HA 1THOA 3HA9A 2VAFA 3IHQA 1U6TA 4ISDA 1GULA 4J56E 4PX1A 2GVPA 1GSFA 1PD21 2IL3A 3FK8A 4Q5RA 4GRFA 2J23A 2P0GA 2YZHA 2HZFA 3PINA 5LNKe 2MMOA 1JLVA 1TDIA 3P2AA 5B8AA 3VLNA 1R5AA 4KCAA 1XCCA 3QFAC 5G1KA 1C72A 4G2EA 1BAYA 2N5FA 2CVKA 3HKRA 3EU4A 1ILOA 1JHBA 5EY6A 1AQWA 2O87A 2Z9SA 5B7CA 3F9UA 4KW6A 1SYRA 2ON5A 1A8YA 2DIZA 2DLXA 1SKSB 5F06A 4KCEA 4HU7A 5ECMB 2NTOA 3IK7A 4TN8A 4N0ZA 1ON4A 1K0BA 2H8LA 3GH9A 5ECSA 3MAKA 5JCUA 1EGOA 3Q6OA 2AB6A 1GUHA 1S3AA 1XOBA 5G31A 2R37A 2CAIA 4LL4B 1TTZA 4J2FA 2JZTA 3WGDA 1SJ6A 4ZXGA 1M2DA 4EVMA 4MZCA 1ZMAA 2RUEA 4TR1B 4O5RA 4YQVA 1WMJA 3F3QA 5IO0A 3F4SA 2MYGA 4IGJA 1EZKA 1PN9A 4NWYA 3WYWA 1QFNA 5GSTA 2YCDA 1WP0A 7GSSA 3RPPA 3QDNA 1B8XA 4KSOA 1WJKA 1WWJA 3GRXA 5CNWA 2VLTA 3M9KA 3N9JA 2IMEA 2YJHA 3HCZA 4KDUA 4PQIA 4TKYA 2GSRA 3HJOA 4X1UA 4ID0A 2YV7A 4MF6A 4K0GA 1EOGA 3ZFLA 4F2IA 2QSIA 5J41A 3D0ZA 4HUAA 1V2AA 2KHPA 4E8EA 1ABAA 1F37A 2P31A 4IP1A 3SBCA 3O6TA 4IP6A 3QR6A 1VF3A 4GCIA 4PQ1A 3D22A 4LMVA 1XWAA 1RQMA 4GSNA 2HNLA 4ILFA 4TOPA 3HY2A 2H71A 2GLRA 2C8UA 3Q74A 3F0IA 1K0NA 2H1GA 1BYEA 3GA4A 2GQMA 5B6MA 4JBBA 1FVKA 3ZMLA 3Q18A 4MJEA 2TRCP 5DQYA 3TDGA 3GKKA 1KBNA 2VOCA 1T3BA 2PMTA 4Q5FA 1GL8A 4EF0A 1PL1A 4BVYA 4WBRD 5L71A 3RHCA 1R7HA 4KSMA 1GLPA 2HZEB 3UL3A 3UJ1A 5ENUA 2FA8A 3KGKA 4P3YB 2C3TA 5IMFA 4NHWA 5CYYA 5IMVA 4BA7A 2L6DA 2HE3A 3HYPA 3TKSA 3L9UA 2C0DA 3IXRA 2X8GA 4K7OA 1WE0A 2LTKA 2R5GA 2XHFA 3QOUA 4I2TA 1USBA 5DVBA 4GF0A 4OCFA 4L0WA 3M1GA 3M9JA 5ECRB 4DSRA 4L0UA 2F51A 1PRXA 3GKMA 5G30A 3TRXA 3HJMA 2F8AA 1BQ7A 1MEKA 2PWJA 1X5DA 1ZL9A 3WT1A 5EVOA 3L9VA 4NV5A 4CDOA 2I1UA 2A2RA 3FEUA 1ZGNA 3J7Yk 2IMIA 2VCWA 6GSUA 3KD0A 4WF5A 11GSA 4V2NA 5E4WA 3F4RA 1LBKA 2IFQB 3FR3A 2MMNA 2YNXA 2JACA 4MH2A 4POMA 4BPYA 4XHMA 3N5OA 4MF7A 4N10A 4TR0A 5HR3A 2H6YA 5ELAA 3NZNA 5G2ZA 2WS2A 2HRFA 1G6YA 3QCPA 1SK0A 1JFUA 1XWCA 2OBIA 4I8BA 2C6BA 4HS1A 3D21A 4BL7A 1TK5B 3H79A 3DVXA 4OFMA 4KGIA 4RQRA 1U3IA 4EDZA 4KNDA 1SKWB 1TU7A 1QQ2A 1MDJA 1AXDA 1U3AA 3IE3A 4TW5A 2IMKA 2YWMA 2MBSA 2V32A 2YWOA 1TJDA 1DBYA 3ZRDA 2G0FA 2L57A 5FHIA 3UVHA 1OC9B 5COHA 3MDKA 4KA0A 3IC4A 3HVVA 3VI5A 1J9BA 2V2GA 2JSZA 1GP1A 2E7PA 1ERVA 3UBKA 3TGZA 1EP8A 4L8EA 5KN3A 3ZMKA 2CVBA 2VM2A 1FHEA 4IELA 2K8SA 2FY6A 5IOXA 2L6CA 1I5GA 5DJLA 5ABRA 3WD6A 4ML1A 1LJRA 2CAQA 1XW6A 4GSSA 1SJZA 1TK0B 3WGEA 2AJQB 1Q98A 2LRTA 4JU5A 6GSYA 5GSSA 1F9MA 4RQXA 5F05A 5IPHA 4D73B 5DBQA 4XIHA 1B9YC 1AC1A 3UVTA 5H5QA 3CTGA 2WB9A 5DDLA 2GZYA 5IMZA 1DE1A 2OKAA 5A5KA 3BOAA 2LEGA 4HI7A 4EL1A 2F9SA 1J0FA 4ACSA 3CRTA 5HR2A 4ZBAA 3AY8A 2VIMA 3O3TA 1IYIA 5IQYA 2LNSA 1X0RA 3K8NA 2WFCA 1GTUA 2REMA 2HT9A 1GLQA 4TR3A 1AW9A 3FRCA 2GZPA 5CO3A 1GH2A 2BMXA 2WULA 2X64A 2R4VA 3VWUA 3BCIA 4NXIA 1U87A 3KM6A 4IVFA 2FWHA 4ZIJA 3I69A 1XW5A 2DJKA 1XWBA 4MZBA 4JR6A 1T4ZA 2P5QA 3HVXA 4XS1A 4IHUA 2E2MA 4K7IA 2YWNA 4K8MA 5HFGA 2ALBA 4CHSA 1CQGA 3FHKA 1TI3A 3QAGA 2CA8A 3UMAA 1MD4A 2J9HA 5ELGA 1XWGA 4MCUA 4F0BA 2H70A 5C00A 3ZL5A 2VL3A 5HFKA 5IMCA 2H76A 3VWWA 4FIWA 3L0HA 2ZCTA 5LD0A 1HD2A 4OWYA 1KEBA 2H6XA 3B0AB 4JRRA 3WT2A 5D73A 4CW9A 2OE1A 4NMUA 5J5NA 4ZL7A 1GSUA 2CVDA 1A24A 6GSTA 2NDOA 4FYBA 4J57E 1OC3A 2DJ0A 2ZUPA 1YF0A 3ERWA 3A3TA 4OMVA 3KXOA 5ECQB 3LJRA 2H73A 5JWOB 5EL8A 2PVOC 4K2DA 3ZVJA 4GLTA 4ZILA 1XOAA 4I5QA 4QL7A 4ECJA 3ISOA 3ZIVA 5GAND 4PNGA 3TRQA 2X99A 1XFLA 2WZ9A 1H75A 3TJBA 1DSBA 2ES7A 3CSHA 1FW1A 5HR1A 4PGTA 3CSIA 3IRAA 1OKDA 2R6KA 3LQ7A 3DEXA 1S3DA 2GDRA 3UARA 4KH7A 1TK8B 3FZ4A 3KJYA 2DIYA 3QPMA 4WKWA 4IJIA 3MSZA 1OKTA 2OBKA 2M46A 3LYPA 3TUEA 1SENA 2XC2A 4MK3A 4V2LA 1YY7A 3S9FA 3DVWA 1ML6A 3LFLA 3KH7A 2H66A 4KUNA 4I6XA 2PBJA 2HLSA 4F9ZA 3QAVA 1FOVA 3LXTA 1GTBA 4XS4B 2EC4A 1W4VA 2C6AA 2M72A 3KZQA 1SK1A 3I6AA 2F3MA 2K18A 4PURA 2N5AA 1TRUA 1A2LA 4MMMA 5KEJA 5GZZB 3U6VA 3C1RA 5INYA 4JE1A 6GSWA 5ECLB 2BJXA 2B7JA 2CZ3A 1OYJA 1SD8A 2C0GA 3DKSA 3IDVA 14GSA 3G7IA 3DXBA 1TOFA 2YJ7A 1JLWA 1OE8A 2LJRA 4BWQA 4DSSB 4TRXA 4TR1A 2YOIA 1GUKA 2YWIA 1Z6MA 3KH9A 4IKHA 4AF2A 5KN0A 4OCEA 1FB0A 4ECBA 2K9FA 2K8VA 2WJUA 2KOKA 1GWCA 2HI7A 1Z3EA 1FAAA 2KLXA 2VL9A 3W8SA 4XXBB 2H75A 2VO4A 1M7TA 4NHZA 3EMXA 1PQNA 5DALB 1Z7RA 4PUAA 1PKZA 1SK2A 3TOTA 4XRAA 2GSTA 2CQ9A 1J08A 2HRNA 3OR5A 3HJPA 2C1YA 1AUCA 4LL1B 3EWLA 2QGVA 4MJCA 3C7MA 4V1Ag 3P7XA 1OVNA 3KP9A 3BBYA 4KX4A 4ZL8A 1O81A 1ERTA 5D9WA 2B7KA 4V2MA 1CQHA 2TIRA 3LGCA 3ZTLA 5G5FA 5ECOB 2HXKA 3GURA 2VL2A 3Q19A 1FO5A 1MDKA 1T1VA 1Z5YE 4H86A 5F07A 4HDEA 3EU3A 1NHYA 3UAPA 3I43A 4AJ8A 5D93A 2ZNMA 1VRSD 3HHVA 2L5OA 1E2YA 5C04A 2XPDA 2DJJA 4AGSA 1TRSA 2H72A 1JZRA 3P8WA 1WRYA 1EEMA 2PVQA 1HNCA 4YH2A 1ZYQB 3HZ8A 3ME8A 1ERUA 2NVLA 2JSYA 5AIXA 4HZ4A 1R26A 2H19A 4FYUA 4HEA2 3H8QA 5D96A 1JZWA 2L59A 2C80A 1V57A 4ZBBA 1M2AA 2HYXA 4EKZA 2C3NA 5D8IA 4ZB9A 4IW9A 4N11A 2RIIA 5DJMA 5JWRB 3PH9A 4RUVA 3J7Yb 1TI1A 2WCIA 5B6NA 3C8EA 4POLA 5ID2B 4WR5A 3KTLA 1GTIA 1GUMA 2YPMA 2PUKC 1T8EB 2YV9A 1MDIA 3ZFBA 2GGTA 2H01A 5ECNB 3EURA 3TJKA 3GMFA 6GSSA 2LNTA 2VCZA 2C0FA 5D9VA 2JADA 1Z9HA 1HNAA 2O85A 2B5EA 3FW2A 4ECIA 2I9HA 1AIUA 4NAXA 3MNGA 1PX6A 2GT6A 1VF4A 1XWKA 2VCXA 3ZYWA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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