2PPT | Genus

Total Genus 39

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	39
sequence length	149
structure length	149
Chain Sequence	MMGAKMAESLRLTCLACGQANKVPSDRLAAGPKCGICGAGLITGKVAGIDPAILARAERDDLPLLVDFWAPWCGPCRQMAPQFQAAAATLAGQVRLAKIDTQAHPAVAGRHRIQGIPAFILFHKGRELARAAGARPASELVGFVRGKLG

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Crystal Structure of thioredoxin-2 rcsb
molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Rhodobacter capsulatus
molecule keywords	thioredoxin-2
total genus	39
structure length	149
sequence length	149
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 1.8.1.8: Protein-disulfide reductase.
pdb deposition date	2007-04-30

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
2.20.28.140	Mainly Beta	Single Sheet	Rubrerythrin, domain 2	Rubrerythrin, domain 2	2pptA01
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	2pptA02

2VAFA 3KP8A 3DXBA 5DAKB 3M0FA 2PN8A 3WGDA 5DVBA 3QOUA 4YAPA 3TKPA 2MMZA 3DWVA 3DD3A 3KJYA 2VIMA 5HQPA 1H4OA 3GHAA 3QDNA 2OADA 2E0QA 3HVSA 5IPGA 2YCDA 3RPPA 2OE0A 4GF0A 16GSA 3IC4A 2CAIA 1GSUA 1DE2A 1KTEA 4F82A 1MTCA 2QSIA 5A4UA 2IN3A 4KB3A 2DC5A 5JWOB 2I1UA 2LRTA 3ZIJA 2LJRA 1T1VA 2X8CA 3TKSC 1TI3A 3CTGA 1ERWA 4HZ2A 2PU9C 5IOXA 4IQAA 4JRRA 3LXTA 2HNLA 3KMNA 5EPFA 2H66A 4V1Ap 1M9BA 2YWOA 3FW2A 3N9JA 3RAZA 2GTUA 1TK0B 3BBYA 4LLRA 1IYIA 3TRQA 1A24A 4GQCA 2C80A 5G2ZA 2JU5A 1AQXA 4WBJA 4X1UA 3LWAA 5CNWA 1U6TA 4IN0A 2VL2C 3C1RA 3GKKA 3UBKA 3ISOA 4I6XA 4EF0A 4F0BA 2FLSA 3V1WA 1DSBA 4ZL7A 4WXTA 3BOAA 1GUHA 4XRDA 2VLTA 3QFBC 2MMAA 3HA9A 2H6ZA 1MDJA 4WKWA 1PSQA 4N11A 2R3XA 3A3TA 1W4VA 4TXOB 1EGRA 3G7JA 2N5FA 2VLVA 4J56E 3BD2A 4ECCA 6GSVA 2FCHA 2AHEA 2VM1A 1K0BA 1ERVA 2GSQA 5HFKA 2DJJA 1GTUA 4I5QA 5IIZA 1WIKA 2C8UA 4MZWA 4ZILA 3W8SA 1PX6A 1UVZA 3GNJA 1TTZA 2J9UB 1OKDA 1K0DA 2V32A 4LL1B 2WRTA 3OR5A 4MA9A 5ECMB 1A2JA 3W6GA 4NV2A 1KNGA 3ZVJD 3ZRDA 1VF3A 2FUG2 4AGSA 1QFNA 2C3TA 2NTOA 5JCGA 1R7HA 3DVXA 4GSSA 4GSTA 5ELAA 4I2TA 1LBKA 4HQZA 5COHA 2YZHA 4TR1A 4PNGA 1SENA 1YF0A 2M46A 3IK9A 3ZMKA 1BQ7A 3TRPA 5D8IA 2J9HA 1G6WA 1YDKA 4MP4A 1QXHA 5FT3A 3APOA 3EWLA 3IE3A 2IMFA 2RM6A 2XPDA 3FZ9A 3HVXA 5J9BA 3TKRA 3LG6A 1J08A 2DJ0A 4JR4A 1FG4A 3QAWA 1ERTA 4EUYA 5IOWA 1FOVA 1OKTA 3TKQA 1A0FA 1EV4A 1G6YA 4HDEA 4L5OA 3LORA 4PGTA 4NXIA 5LNKe 2FHEA 3EMPA 1PQNA 1PD21 2J23A 3EU4A 3KH7A 4OFTA 3L78A 3EVIA 4MH2A 1QGVA 3FR9A 1SK2A 1USBA 5ECLB 3HXSA 4MF5A 2F51A 3IK7A 3IV4A 3KZQA 1X9MB 4I2UA 2FD3A 2LQOA 3LXZA 4G19A 3QFAC 4I8BA 1GSYA 2P5RA 1JLWA 1BAYA 2L5LA 4HOJA 4IBPA 4POBA 5IMCA 3FY7A 2TRCP 2VCXA 2YPMA 3D4MA 3KTLA 2FWEA 2X8HA 1XIYA 1SJ6A 5B6MA 1TW9A 3J7Yb 3GL3A 2NDOA 4HQSA 4OO4A 3ZTLA 3KM6A 5J9CA 2MMNA 5JCUA 1DUGA 3UVHA 4XCSA 5AIXA 1J0FA 3CSHA 11GSA 3HKRA 2YN1A 3DEXA 2IMDA 1OYJA 1EP8A 2C0FA 3FEUA 1HQOA 1T4ZA 1WJKA 4K8MA 2LJAA 3MAKA 5DAKA 4G10A 1E2YA 4GTUA 3G7IA 1ZL9A 4Q5FA 1X0RA 2V1MA 2DJ1A 5A4VA 5DDLA 2O89A 3F4TA 9GSSA 3A2VA 3CRUA 4V2LA 1Z7RA 4NAXA 2CZ2A 2QC7A 2P31A 3F4RA 4E8HA 2R37A 2L4QA 2YNXA 3TCOA 3HHVA 2H19A 3GKMA 3CRTA 2AB6A 4ZBAA 3D21A 4JZQA 1FHEA 4KH7A 4TR4A 2LKUA 2HSYA 2VCWA 1PX7A 3TRXA 4HS1A 2P0GA 3H4KA 1S3CA 2A4VA 3C71A 1NHYA 3L9VA 1S3DA 3GFKA 2FA8A 1JLVA 4GLTA 3EURA 3R2QA 2JZRA 1ZYEA 2IL3A 4NWYA 5G5EA 1SK0A 3SBCA 4YH2A 5IO0A 3I6AA 1M2BA 4TVEA 1WWJA 2DJ3A 3FKFA 2FY6A 2B1LA 2B6MA 3KH9A 1AXDA 1XVWA 1X9SB 1GSQA 3LFLA 4I97A 5CP1A 2H0HA 3M9JA 2H71A 3PH9A 2XHFA 4FYUA 2X8GA 2RUEA 4GCIA 4BWSA 4MPGA 5GAPD 3WD6A 2MMOA 2FWGA 5AIVA 1A8YA 4MJBA 1EEJA 5F07A 4QQ7A 1OC8A 1SJZA 1ZYQB 1V58A 2LEGA 4TXOA 4TW5A 4ZBBA 3ZITA 2JADA 4NPBA 2PPTA 2EIQA 5F06A 3VWWA 1XBSA 3FK8A 1Z5YE 1K3LA 5D73A 1BG5A 1O8WA 4MJEA 4D73B 1LU4A 2RM5A 2KP1A 2VCQA 3B08B 2HYXA 3QD9A 4FIWA 4OMVA 1J9BA 3IBHA 1VF1A 3UOMA 4EDYA 2CAQA 1RK4A 2V6KA 2VCZA 4RQRA 1I9DA 1HNAA 1PA3A 2R6KA 2H1AA 4IP1A 4MABA 1NHOA 4JEDA 2L57A 4JE1A 3TDGA 4J57E 10GSA 2HSHA 2H0IA 3UVTA 3A2XA 3TB2A 1A2MA 4ECBA 3GYKA 2VD0A 3GL5A 2NBSA 1LJRA 3GN3A 1XOAA 3F3QA 3DYRA 3IOSA 1VRSD 1GL8A 1XXUA 3IRAA 2LUSA 1GTBA 4N10A 1PMTA 4POLA 18GSA 1T4YA 1F37A 2MYGA 2LS5A 3O6TA 1ZZYA 4KSOA 1T3BA 5EY6A 3TOTA 2WS2A 3WT2A 4X0XA 5IPHA 2R4VA 5B8AA 4RI7A 2H30A 2JSZA 1TXXA 2XBQA 2C0EA 2LRNA 2LNTA 5HFIA 4KE3A 3C73A 5HR1A 5DQYA 2ZNMA 4O92A 2R5GA 3D6IA 1YY7A 2HZEB 5D96A 1FO5A 1TRSA 1GNEA 2K6VA 3UJ1A 2I4AA 4JR6A 4HI7A 3ME7A 2ALBA 1W89A 3L9SA 4MF7A 4P3YB 2OBKA 4ULXA 2C0GA 2G0FA 3VWXA 3F4SA 3TJKA 1SKRB 2HT9A 5D9VA 1OE8A 2ON7A 3VWUA 2JACA 2FWHA 1SL0B 1PKWA 2V6OA 4WBRD 3H1NA 3C7MA 5HR3A 3I69A 2GT6A 2L4CA 3GTUB 5INYA 2IJYA 3P2AA 1FAAA 3M3MA 1FB6A 6GSXA 5DQSA 4DSSB 1PKZA 4MDCA 1B4PA 13GSA 5KN0A 4OCFA 2PWJA 1F9MA 3F9UA 1YKAA 4HUAA 1XWKA 3E3EA 4TR0A 1BJXA 1AIUA 4KX4A 3L0HA 2F8FA 3P90A 4OFMA 3S9FA 3SWLA 1GH2A 1RQMA 1A23A 2AJQB 2VD1A 2QKEA 2JZSA 2CVDA 3UBLA 3J7Yk 3GUSA 3KD0A 4O5RA 4KDXA 3NZNA 3KEBA 4BVXA 3B0AB 2I9HA 3VFIA 1SJIA 2JL4A 3US3A 3HDCA 4ZIJA 3D4TA 4G9HA 3ZFBA 2DJ2A 1A8LA 1YJ6A 3U6VA 2CQ9A 3KMOA 5EVOA 4G2EA 4V2MA 4YQVA 2DIZA 3D0ZA 3GH9A 2CT6A 1TP9A 2VUPA 4ISDA 4RUVA 4EO3A 5GSSA 4EKZA 3FR6A 2I81A 1B4QA 1XCCA 3A5WA 2X64A 5ECRB 1T8EB 2K9FA 4HEA2 5KN2A 2HLSA 2MBTA 5AN1A 1XWGA 4IHUA 3GRXA 2V41A 4BA7A 3IDVA 5H5QA 3FRCA 4ML1A 1PGTA 4TOPA 4H86A 1V9WA 4IVFA 1SU9A 2YJHA 2B1KA 1K0OA 1BEDA 5IMFA 2LNSA 1V2AA 1JZRA 8GSSA 3CMIA 5CAXA 4CHSA 4MZBA 3HY2A 4CDOA 4XHMA 4L8EA 1EGOA 5G1LA 5JWQB 2PVQA 1B8XA 2PBJA 2C0DA 3EU3A 1XZOA 3CSIA 1SL1B 4ZXGA 1U88A 5ECOB 3VK9A 2BJXA 3VI7A 5ABRA 5J41A 2E2MA 2HRNA 4F0CA 2PGTA 2C1YA 2K8SA 4D73A 4FYBA 2C3NA 3GKNA 5ELGA 5J3RA 3M8NA 4MH3A 5IMAA 3EINA 2E2GA 3P8WA 4DSQA 4POMA 2L6DA 3IR4A 2PVOC 3M9KA 1NSWA 1XW9A 2M72A 3LJRA 1R5PA 5IM9A 1YKCA 2OJLA 2DJKA 3F0IA 4ECIA 1YZXA 5F0GA 4O7HA 4Q5NA 1GRXA 4WETA 2H1GA 2O7KA 1M99A 5IMDA 1TI1A 2DIYA 1SYXA 4K6XA 2KP2A 3NOFA 4QL9A 2GQMA 3FHKA 4NHWA 2DMMA 3KGKA 4PUFC 4BWQA 2HI7A 1O73A 1QUWA 1HD2A 2YJ7A 4XS1A 4EDZA 3Q74A 2YOIA 4XIHA 1CQGA 5G5FA 1AUCA 3LYKA 1Z7PA 4EXJA 4EVMA 6GSUA 3HZ4A 1EZKA 2DSAA 5KN1A 3G7YA 1ZCPA 3F63A 4PXOA 3F8UA 5ID2B 4N30A 1XPVA 2IWTA 3APQA 1GLPA 2NVLA 3GMFA 3Q19A 3C1SA 4PQ1A 5ECQB 1WRYA 3H93A 4KA0A 3BCIA 1GSEA 4MLYA 3RHCA 4NV5A 3GKXA 1PN9A 1R5AA 1ACVA 1JHBA 2HFDA 4ML6A 4L0UA 5DCGA 2FNOA 1QQ2A 3BJ5A 2PERA 4RI6A 5G1KA 1GUKA 1YEPA 2GT5A 4ZL9A 3IA1A 5EL8A 3UARA 3FYGA 2GZZA 4IGJA 1RW1A 3ZREA 1F3AA 1GNWA 1THOA 2GSTA 1TU7A 4K7OA 2WDUA 2HE3A 3H79A 5JWRB 4V2NA 5C04A 3ZFLA 3ZMLA 2GZPA 1FVKA 1X5EA 4XTSA 1TDIA 3DRNA 3ZIVA 5CYYA 2EIRA 1EWXA 3GTUA 2V2GA 3CYNA 2KHPA 2X99A 1K0AA 4MJAA 3I9V2 3QPMA 2R2JA 2O85A 1O85A 1OC9B 4KCEA 4AJ7A 5G30A 2HRFA 5IMZA 1FB0A 4IJIA 4OCEA 2KUCA 5CRWA 2MBSA 3VWVA 2AAWA 5A4WA 5ECNB 5ENUA 1HNCA 3VLNA 5ECKB 1T00A 4Q5QA 4BPYA 2FWFA 2WCIA 1TOFA 1GSFA 3KCMA 1NW2A 2N5AA 2AUVA 5E59A 2YP6A 4WR5A 1SK1A 1MEKA 1TRUA 2L6CA 3IAS2 4E8EA 4HJ2A 5LD0A 2KOKA 1XFLA 3ZL5A 1SD9A 4V1Ag 3BCKA 2WZ9A 3PGTA 1JFUA 3FZ4A 20GSA 4ZBDA 4N0VA 5ECHB 1DBYA 1GWCA 1K0CA 2OKAA 4ID0A 5C00A 1K0NA 3UIWA 3VI5A 2IFQB 2E7PA 3HJMA 2VM2A 3MSZA 2GVPA 1AAZA 1HYUA 2YWNA 1SL2B 1YF1A 1EEMA 1KEBA 3LYPA 4MK3A 2TIRA 5FWGA 2LQQA 2DLXA 2GLRA 2A2SA 3IHQA 1XWBA 3DIEA 4WEYA 3TGZA 3Q6OA 4Q5RA 1NM3A 2LTKA 2WFCA 5IQYA 3H8QA 4LMWA 3KIJA 2LJKA 2IPAA 5F8BA 5GSTA 5AISA 4KUNA 5H5SA 4BL7A 1O6JA 17GSA 4IELA 3HVVA 1M2DA 5A5KA 2VLUA 1U3IA 2LRCA 4IQ1A 2NPBA 2B3SA 2H1BA 2QGVA 1OE7A 1S3AA 1I5GA 4DEJA 4MZCA 3AY8A 2GDRA 1M0UA 5CRHA 4CW9A 5IO2A 3QAGA 4K0GA 2XC2A 5DCHA 1AQWA 2O8VB 5GAND 1F3BA 2H0GA 1YQ1A 2VCVA 1WPIA 3P7XA 5D9WA 3WGXA 2MZCA 2H75A 1ON4A 3MWHA 4RQXA 1X5DA 3TKSA 1Q4JA 5FHIA 2DBCA 1EOHA 4OO5A 5GZZB 2GSSA 1EOGA 4HU7A 4J2FA 2H73A 1N2AA 1F2EA 2WULA 2CVBA 1K0MA 3LQ7A 5CRDA 2YV7A 3E9JB 3RHBA 1MD4A 5HFGA 5CREA 3GX8A 2TRXA 4PUAA 2C4JA 2AV4A 1F6MC 4X43A 4TN8A 4ILFA 1JZOA 2VL2A 2G2QA 3PINA 3VURA 1O8XA 4KW6A 4DVCA 3M1GA 4KCAA 3WT1A 2FGXA 2A2RA 1ZMAA 2P5QA 4LA1A 1R4WA 3UL3A 4TR3A 2GZYA 4QL7A 5KN3A 4KNDA 3VPQA 5HR0A 3ERWA 5KEJA 4N0ZA 2F8AA 4NMUA 1K3YA 1PRXA 1ERUA 1V98A 2L59A 4K1FA 2PUKC 4PQHA 5ID2A 4OD7A 1K3OA 3IAM2 3F3RA 2ES7A 4BVYA 1SKSB 3GA4A 2YV9A 1TRVA 5ECSA 1SKWB 3RDWA 1GUMA 1UN2A 2F3MA 2D2ZA 2I3YA 2IMKA 1IYHA 2RLIA 2K18A 4PNFA 3TJBA 5IMVA 2GQLA 2VOCA 1HNBA 4MPFA 4GRFA 3ZYWA 4L0WA 5DJMA 3W8JA 4ACSA 3RPNA 2OACA 3PR8A 3EC3A 5E4WA 1GULA 2VCTA 3VPTA 3CXGA 4POKA 3DVWA 1UC7A 4KSMA 1YEXA 5AGYA 5L71A 5JCWA 3LSZA 12GSA 1QMVA 4KDYA 3O3TA 4K0NA 5DBQA 2H6XA 2OA7A 1X9WB 1T7PB 2BTOT 2C6BA 3MDKA 1G0TA 1MD3A 2FA4A 1AW9A 3D22A 3ERFA 1M7TA 2CA8A 4WR4A 1OC9A 1XVQA 1XWCA 1H75A 1Z6NA 3F6DA 1TU8A 1ABAA 1GSDA 2OE3A 2EIOA 4GQFA 3WGEA 4XS4B 1E6BA 1Z6MA 3HYPA 4IW9A 1FW1A 3QR6A 2H70A 3DKSA 2ZUPA 1V40A 1BYEA 3HCZA 1XW6A 1U87A 1XOBA 1XWAA 1Z3EA 4ZB9A 3TUEA 1V57A 3UEMA 3QCPA 4K2DA 1URMA 4FH8A 3HD5A 2XBIA 3HZ8A 2HXKA 3TJGA 3UAPA 3CTFA 4PX1A 1Q98A 1WMJA 5ECPB 1OAZA 5H5RA 4HZ4A 3KP9A 4TXVA 4O32A 4AJ8A 5DALB 4LL4B 2N5BA 2CVKA 2IFQA 1G7OA 2GGTA 3CBUA 1TKDB 3GV1A 4DSRA 5F05A 1SD8A 2H6YA 2VL3A 1JZDA 4MF6A 1ZOFA 2PMTA 3EE2A 1X5CA 4YQMA 3IPZA 4IKHA 4HJMA 22GSA 2B5YA 2CV4A 1KBNA 3F6FA 5B7CA 1OVNA 4ZL8A 1CQHA 2CZ3A 2CX4A 3NIVA 3DMLA 3ZZXA 3APSA 14GSA 4EC0A 1WE0A 6GSSA 1Y6EA 19GSA 2H8LA 2HZFA 2REMA 2BMXA 5J5NA 1VF4A 1UA5A 3D5JA 2M80A 3L9UA 4K7IA 3L4NA 6GSWA 1AC1A 1Y25A 1O7UA 1ML6A 1TRWA 4K7NA 2O87A 3ERGA 2VO4A 4XS6A 4TRXA 4ZB6A 5D93A 1AQVA 2F9SA 4OFNA 2ZCTA 2RIIA 2EC4A 4NHZA 2XPEA 2JZTA 3Q18A 5B8BA 1SYRA 1JZWA 1EV9A 4LMVA 2HZEA 2KLXA 1GP1A 3G9BA 3A2WA 2H76A 2WB9A 5J4UA 2RUFA 1MDIA 2K8VA 3LGCA 3UMAA 3O76A 2YWIA 3QMXA 1GTIA 4XXBB 1M9AA 3FZ5A 4YAVA 4IJ3A 1EP7A 2C3QA 5DJLA 3EYTA 3LEFA 1M2AA 3ME8A 1WOUA 1VF2A 4YQUA 2GSRA 1R26A 4GWRA 1Z9HA 3GX0A 5B6NA 4DSSA 3KTBA 4AF2A 1VGLA 4F9ZA 1B9YC 1ST9A 2OE1A 3HJOA 3ZLPA 4GSNA 4FO5A 5CRGA 3TJFA 5LCZA 1GTAA 2IMIA 1DE1A 1THXA 2H74A 3RBTA 4PURA 4EL1A 3GIXA 4KDUA 2Z9SA 2B7JA 4K9ZA 1B48A 7GSSA 4ECJA 1OC3A 1TK8B 2YWMA 3WYWA 5D9XA 5D9TA 2B5XA 2ON5A 2L5OA 2IMEA 4TR1B 3FZAA 1GSSA 2LV3A 4MJCA 3ED3A 4TKYA 2DMLA 2C6AA 2IIYA 4IP6A 2WJUA 4JU5A 2CX3A 2YANA 3TOUA 1QK8A 4WF4A 6GSYA 1GLQA 3GURA 4MMMA 3GH6A 4AJ6A 3IXRA 1B9XC 3HJPA 2OBIA 2H72A 3QAVA 2YZUA 1O81A 2H01A 3KXOA 1ILOA 2H1DA 5HR2A 3CSJA 5ECIB 3JCML 3FR3A 4JBBA 4KGIA 2VL9A 3C8EA 3MNGA 3TKSE 1C72A 2GQKA 6GSTA 1PL2A 1XW5A 4OWYA 1TJDA 3EMXA 1TK5B 2B5EA 3DGQA 5CO3A 1MDKA 1PL1A 4XRAA 2LSTA 4XS4A 2GS3A 1FVJA 3GSSA 2AYTA 4GXZA 1N8JA 4MCUA 4WF5A 1WP0A 3TJJA 3I43A 2B7KA 4F2IA 2WGRA 5G31A 3E0UA 4IS0A 1U3AA 4HU9A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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