3P2AA

Crystal structure of thioredoxin 2 from yersinia pestis
Total Genus 36
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
36
sequence length
145
structure length
145
Chain Sequence
NAMNTVCTACMATNRLPEERIDDGAKCGRCGHSLFDGEVINATAETLDKLLQDDLPMVIDFWAPWCGPCRSFAPIFAETAAERAGKVRFVKVNTEAEPALSTRFRIRSIPTIMLYRNGKMIDMLNGAVPKAPFDNWLDEQLSRDP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Yersinia pestis
publication title Crystal Structure of Thioredoxin 2 from Yersinia pestis
rcsb
molecule keywords Putative thioredoxin-like protein
total genus 36
structure length 145
sequence length 145
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-10-01
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.20.28.140 Mainly Beta Single Sheet Rubrerythrin, domain 2 Rubrerythrin, domain 2 3p2aA01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3p2aA02
3UVHA 3ZL5A 2HZEA 2J9UB 3D4MA 2LJAA 2VCQA 1K0DA 1OC9B 2M72A 2HNLA 5HFKA 1TXXA 2MZCA 4FYUA 1ERVA 2NDOA 1GSSA 3M9KA 4ZILA 3B08B 3HYPA 4EE0A 16GSA 1Z6NA 4KDUA 1YZXA 1E2YA 3DYRA 2RUEA 5DCHA 4ZBBA 5KN1A 2L5LA 3F3RA 3QAGA 4XIHA 1Q4JA 3RHBA 5A4UA 2GSRA 2I81A 5H5QA 3M8NA 3NOFA 4KAEA 3ERGA 2E7PA 2VCZA 3FZ5A 1KTEA 4TR0A 1T4YA 1TI1A 4ZL9A 1F2EA 1ACVA 11GSA 4K0NA 3TGZA 1Z5YE 4KCEA 1PL2A 4QL9A 1GRXA 3DMLA 1DSBA 3V1WA 1E6BA 2XPDA 4GCIA 3DXBA 3DEXA 4WETA 3PR8A 1KEBA 5ECPB 2CAQA 5JCUA 2GZYA 2YZHA 2X8CA 4GF0A 1HD2A 4MPFA 2CA8A 1QQ2A 3L9UA 4Q5NA 4IHUA 2PWJA 2CVKA 4DSSA 4BWSA 1THXA 1GTBA 1URMA 5IMVA 4PUFC 5J41A 2H6YA 3KMOA 2H0IA 3TJJA 4AJ8A 1V58A 5IOXA 3GURA 2L4QA 3RBTA 2IFQA 3IR4A 5IPHA 3EURA 4IQAA 2DJ1A 4I2UA 1U6TA 3HJOA 1TI3A 5DJMA 1G7OA 4JRRA 1O85A 5EY6A 4ZL8A 2WFCA 2ES7A 4N11A 4H86A 3ISOA 4F0CA 5G1LA 3RHCA 2PVOC 2YWIA 1TOFA 3FRCA 4LL1B 1ZYEA 2OE0A 4DVCA 5CRGA 4NWYA 3Q19A 1FO5A 4L5LA 1XVWA 2BTOT 3DGQA 2TIRA 2LRCA 7GSSA 1TRSA 1AUCA 2VL2A 2DMMA 4IN0A 3IV4A 3TKQA 3EWLA 4LA1A 3EU4A 4PUAA 1K3OA 4LMWA 1GLPA 4EDZA 4MP4A 2X8GA 1SJIA 4ECIA 3L0HA 1OVNA 3FR6A 3F8UA 3TRQA 5IMZA 1FB6A 2IPAA 2DMLA 2QKEA 3W6GA 1G7EA 4TXOA 3DWVA 3D21A 1M0UA 2K6VA 2LV3A 4HS1A 3FHKA 1GUHA 3B0AB 1X9SB 1K3LA 2HLSA 4ZB9A 5ENUA 2AUVA 2VCWA 4FH8A 3HVXA 1GUMA 1PSQA 2H74A 3GX0A 4BA7A 4V1Ap 2IL3A 2R3XA 4F2IA 1RK4A 1GWCA 3ZYWA 4MDCA 2QC7A 3LWAA 3SWLA 3TJBA 5HR3A 3ZFLA 2MMZA 1OKDA 2VO4A 14GSA 1HNCA 2F51A 1XCCA 2VL3A 3LJRA 3GKKA 5HQPA 4O92A 1ZYQB 1A23A 3TRPA 1X5EA 1X9WB 1EP8A 2CZ3A 1QUWA 3EC3A 3C7MA 1BYEA 4HJMA 3NZNA 3A2WA 2AHEA 2YJ7A 5ELAA 3QD9A 4XCSA 1EOGA 2YCDA 3IC4A 4GSTA 4IGJA 1TP9A 3HVSA 3EINA 1PMTA 2LJKA 4GSSA 3C1SA 2C4JA 6GSYA 1U88A 5DAKB 3D6IA 2LNSA 3C71A 2VLUA 4TVEA 4MPGA 1XW9A 3ZRDA 2GVPA 3G9BA 4KGIA 2FWHA 4KSMA 3CRUA 4XS1A 1O7UA 5H5RA 4GQFA 4ZXGA 4XS4A 3P7XA 1YKAA 2VM2A 3APSA 3IDVA 3UIWA 2PU9C 2C6BA 2LTKA 5CRDA 1U3IA 2ON5A 3QAWA 2V2GA 2PUKC 3Q18A 4FYBA 2YANA 3WD6A 4K6XA 1GLQA 1T7PB 3FYGA 4MH2A 5B7CA 2XHFA 1AC1A 2VIMA 2O89A 2DIZA 2N5BA 3IK9A 1YJ6A 1MD4A 3GNJA 4FYCA 1O8WA 2O85A 2RM6A 1JZOA 2B7JA 3ZITA 3HDCA 4AGSA 3R2QA 1V98A 1VRSD 3FKFA 1HNBA 3HZ4A 1T4ZA 5D73A 3F9UA 2GZPA 3O3TA 4KB3A 2IMKA 2DJ0A 3KXOA 4NV2A 5EPFA 3GSSA 4FO5A 4HEA2 2RIIA 3QFAC 4WBJA 2VL9A 3D0ZA 2GT6A 5ECIB 5D8IA 1G6YA 2IWTA 3GIXA 3GN3A 3UBLA 4GLTA 4I8BA 5J5NA 3KM6A 5G31A 3A2XA 2ZNMA 2F8FA 1K0OA 2GTUA 3L4NA 1W89A 5LD0A 3N5OA 2PGTA 3E9JB 2C3TA 1SKSB 5DDLA 2R4VA 2MMNA 2ZCTA 4JZQA 1BJXA 4PQIA 1YY7A 3RDWA 2AYTA 4PX1A 4AF2A 1B48A 2VL2C 1HQOA 1ILOA 1ST9A 1AQXA 3KGKA 4RUVA 1PX7A 3F4RA 5DALA 3BCKA 5JWOB 1TKDB 1TW9A 4TN8A 1YQ1A 2KP2A 1XWAA 3O76A 3QCPA 2FWGA 2JU5A 5B6NA 4N30A 3MNGA 3H93A 1AAZA 4I6XA 4JR4A 2F8AA 1Z3EA 2H72A 2C0FA 2HRFA 1XIYA 1BG5A 3H8QA 1SKRB 2DJ2A 2FWEA 1ZCPA 4N0ZA 2MYGA 2DLXA 3U5RE 3BBYA 5HFGA 3HKRA 1YF1A 4ML6A 4Z7XA 2VCXA 1FVKA 1XVQA 3LGCA 2WJUA 4X43A 1N8JA 5F05A 1WJKA 3OR5A 2B6MA 4L0UA 3D22A 4LL4B 2I4AA 5IMCA 3TRXA 3GSTA 1A0RP 4IW9A 2GS3A 2P5RA 3A3TA 2GLRA 1GSYA 4JE1A 5AIVA 3GH6A 1HYUA 2JL4A 2HFDA 8GSSA 2I1UA 1R5PA 5F06A 2X99A 1WIKA 4WF4A 2FGXA 3KH7A 4NMUA 1PD21 2YZUA 2VD1A 4TXVA 1AIUA 1TRWA 3I6AA 1ABAA 1XOAA 2L57A 3ZVJA 2A4VA 4ECBA 4TRXA 2R5GA 3IBHA 1A8YA 4ZBDA 5F8BA 3ZLPA 4X0XA 20GSA 5F07A 4HI7A 1UVZA 3GFKA 17GSA 1ZGNA 4MJAA 5GZZB 3KIJA 2V1MA 4EXJA 1M7TA 1G0TA 3VWUA 4POBA 5C00A 2YV7A 3IHQA 3IAS2 4IELA 4IVFA 1XWBA 1IYHA 1EGOA 3TOTA 1OC9A 2LSTA 1V40A 4RQXA 4MZWA 2WDUA 5CRWA 3N9JA 3LYPA 1PRXA 3IAM2 1BX9A 2LUSA 3H79A 5ID2B 2C8UA 4TR3A 5AISA 1R7HA 4BVXA 1Q98A 1PX6A 1F3BA 3J7Yb 1M2AA 3ZMLA 2NTOA 4IQ1A 4LLRA 5FT3A 3LEFA 2HT9A 1FG4A 4ZBAA 3GKNA 1Z6MA 2CAIA 1A0FA 2OBIA 5CNWA 4OD7A 2IMIA 2K9FA 1O8XA 4K8MA 3ZFBA 4XRAA 2FNOA 1PL1A 4QQ7A 3GRXA 4TW5A 3VWXA 3VPTA 1JFUA 1FW1A 2CVDA 4V1Ag 3KMNA 2WS2A 2HI7A 1XW5A 3FZAA 2H70A 2GQMA 4DSQA 1NHYA 5HR2A 2X64A 3P2AA 2B1KA 2LQQA 2H76A 3KZQA 3UVTA 2H1BA 1M9BA 5AGYA 5ELGA 3HA9A 5J3RA 4KUNA 1PKWA 3E0UA 3GV1A 5JCWA 5GAPD 3IRAA 2H0GA 1S3CA 2WZ9A 4ZIJA 3BJ5A 2E0QA 4PQ1A 3W8SA 5G30A 5AIXA 2H66A 2FLSA 5IMAA 2F9SA 3P8WA 4FIWA 3L9SA 2QGVA 3IA1A 5ECRB 4K9ZA 3KP8A 4KH7A 5E59A 3LG6A 3BCIA 1GL8A 4OWYA 1NM3A 1SYRA 5G5EA 1M2BA 4OCEA 1GTUA 4O5RA 4CHSA 2JACA 4Q5QA 1UA5A 3WT1A 4TOPA 4BPYA 13GSA 4D73B 5ECMB 1YEPA 1BAYA 1J9BA 2J9HA 2H75A 2LKUA 5KN2A 1MEKA 3PINA 3VPQA 5F0GA 3LORA 4OO5A 4DSRA 4GWRA 3G7YA 1PQNA 5ECQB 2OADA 2PPTA 1GSFA 2H19A 1B9YC 2H1DA 4OCFA 1VF2A 3EMXA 4HDEA 2VCTA 4I2TA 3ZIVA 5IO2A 2VLTA 2A2RA 3M0FA 1KBNA 2M80A 4J56E 2NVLA 4XXBB 1WWJA 5IM9A 3HHVA 5ECNB 3VWVA 1F6MC 4E8EA 2H01A 4WR4A 2GSTA 3A2VA 1TK0B 3FZ4A 3A5WA 3VI5A 3UOMA 4AJ6A 1V2AA 2FWFA 3VI7A 1WP0A 1EV4A 3MWHA 4PNGA 5COHA 2BJXA 3IOSA 5IOWA 3ERFA 3QOUA 2DJKA 5FWGA 3TKSE 2JSYA 5IQYA 5EVOA 3L9VA 5JCGA 1OE7A 3TOUA 3FY7A 4MF6A 4MZCA 4HU9A 1SL2B 4K7NA 2R2JA 2YV9A 3KP9A 4PXOA 1JHBA 2WRTA 1XOBA 3KH9A 6GSWA 2IN3A 5DCGA 2IIYA 3DIEA 3CMIA 5D9XA 4K7IA 1K0NA 2FD3A 1SKWB 4YAPA 1NW2A 2R37A 3E3EA 3MAKA 3TJKA 1M99A 5DAKA 5INYA 2HYXA 3F3QA 1SJZA 4PGTA 1F9MA 3HVVA 2G2QA 3MSZA 4HZ4A 3D4TA 1JLVA 3IXRA 4JR6A 1DBYA 1DUGA 2GQLA 2CVBA 3G7JA 2DSAA 4XTSA 1SK1A 1Z7PA 4KDXA 1MDIA 5G1KA 1CQHA 2YPMA 1LBKA 3LFLA 4ZL7A 3TKPA 2XPEA 1EEMA 1ML6A 1BEDA 2LRTA 4HJ2A 4XS4B 1K0CA 5KN0A 4ISDA 4WXTA 2C80A 4NPBA 3AY8A 4PQHA 3I69A 2CQ9A 4KCAA 3ZIJA 1DE2A 18GSA 2KLXA 2FA4A 4ZB6A 5J9CA 5D93A 1WMJA 1VF1A 1MTCA 3F4SA 1EGRA 3HZ8A 1T1VA 2HSYA 1OC8A 5CYYA 3ZZXA 1R5AA 1VF3A 4IBPA 3WT2A 3ZMKA 5AN1A 3DKSA 5G5FA 2VLVA 4EDYA 3DVWA 2YJHA 3CTGA 3FZ9A 5IO0A 1A2LA 3KTBA 2K8SA 3F6DA 1XWGA 1MD3A 2KOKA 3WYWA 1SENA 3ME8A 4K1FA 1GP1A 1R4WA 2EIRA 1GH2A 2EIOA 2C1YA 2NBSA 3FW2A 4PNFA 1GNEA 3CSJA 5EL8A 3W8JA 3M9JA 1XBSA 3US3A 1IYIA 1AQWA 3F4TA 4MK3A 4PURA 1H4OA 1W4VA 4MA9A 4HZ2A 3WGXA 2R6KA 3KCMA 2GT5A 4O7HA 1FOVA 5A5KA 3HD5A 4F03A 5GAND 2MMOA 4KE3A 3F0IA 1LJRA 2LJRA 4N0VA 3UEMA 5C04A 2H71A 1NHOA 4L5OA 1ERWA 3EU3A 4OFTA 1YEXA 5ECOB 3GTUB 4KA0A 1B4QA 4NV5A 3GA4A 2L6CA 2XC2A 3EE2A 1ON4A 1K3YA 5IMFA 1TK5B 1ERUA 3VURA 3I9V2 4TR1B 2L4CA 1EV9A 5LCZA 2IJYA 2YWNA 2XBIA 1SK2A 3ED3A 3TJGA 5HR1A 2YWMA 2VUPA 1H75A 3VK9A 3QMXA 1DE1A 5IIZA 1XWKA 1YDKA 5D96A 1NSWA 4Q5FA 3APOA 2EC4A 5ECHB 4EC0A 4WKWA 2VD0A 6GSUA 2H0HA 1EWXA 1RQMA 3GL3A 1USBA 3Q6OA 2EIQA 5JWRB 2Z9SA 4ECCA 6GSSA 2LS5A 1O6JA 4GSNA 4IKHA 3TKRA 2RLIA 3L78A 4HUAA 3RAZA 4E8HA 4OFMA 4IP1A 4OMVA 3ZTLA 1BQ7A 4KSOA 2HRNA 3FEUA 4J2FA 5ECSA 1X9MB 1T00A 5ECKB 5L71A 2MBSA 1V57A 4K7OA 2PERA 5CAXA 3ERWA 4MMMA 5CO3A 1TTZA 2HZFA 1MDJA 1OC3A 2KP1A 1ZZYA 1SL1B 2GQKA 3VFIA 4ECJA 3LXZA 2HZEB 2KHPA 3CRTA 4POMA 2KUCA 4G19A 1GULA 1U3AA 4Q5RA 5ID2A 1WRYA 4XHMA 4N10A 4MZBA 1TK8B 1Z7RA 3QFBC 2VM1A 2VOCA 1K0BA 3BOAA 2AB6A 5B8AA 1B8XA 3C1RA 1A24A 4MF5A 1SJ6A 1XZOA 1JZWA 1TRUA 3QPMA 4YQMA 2QSIA 2H1AA 4WEYA 3CSHA 2NPBA 1M9AA 1A8LA 5CREA 4OFNA 2BMXA 1EP7A 3M3MA 3DD3A 1B9XC 3NIVA 4L0WA 1T8EB 3PGTA 4ILFA 3K8NA 1OYJA 4EL1A 4F9ZA 3TDGA 3HJPA 4MABA 12GSA 3TUEA 4JU5A 5ABRA 4EUYA 1WPIA 3H1NA 1TRVA 3TJFA 2B1LA 3I43A 4L8EA 3UBKA 1GTIA 5CRHA 3SBCA 1QXHA 1SYXA 1WOUA 2YP6A 3TKSA 1S3AA 4MCUA 4J57E 4DSSB 2GSQA 1I9DA 2GZZA 4GQCA 4BL7A 2CX3A 2C0DA 4JBBA 2D2ZA 4NAXA 1EEJA 3RPPA 3M1GA 1GNWA 3WGEA 2IFQB 5D9WA 3G7IA 3FK8A 3QDNA 6GSXA 5CP1A 2P5QA 3UJ1A 3UARA 4IJIA 1QK8A 1GTAA 1I5GA 4F82A 3KTLA 3D5JA 2H8LA 4RQRA 4P3YB 3EVIA 1SU9A 1J08A 4KDYA 19GSA 4MLYA 2TRXA 2JZTA 5DJLA 2O87A 2PN8A 4D73A 4LMVA 4HU7A 4AJ7A 3ZREA 2IMEA 1OE8A 4MH3A 2K18A 1QMVA 2GSSA 4K2DA 1QGVA 5KN3A 1GSUA 1RW1A 4EKZA 3U6VA 5D9TA 3LYKA 2JZRA 1XXUA 2O7KA 5DQSA 3GH9A 4XS6A 2H1GA 2PMTA 3CBUA 4WR5A 10GSA 3HCZA 1MDKA 2A2SA 4POKA 2B5XA 1PA3A 3HJMA 1XW6A 4TXOB 22GSA 2DIYA 2B3SA 4CW9A 2V41A 2I9HA 2HXKA 5FHIA 3P90A 1GSEA 3GYKA 1QFNA 4TKYA 4G9HA 2TRCP 1FHEA 2L6DA 2GDRA 2L5OA 4IP6A 3CSIA 2XBQA 3C8EA 2E2MA 3O6TA 1C72A 4MF7A 4YH2A 1CQGA 2CV4A 5IMDA 2WGRA 3QAVA 4ULXA 3J7Yk 4NHZA 2CX4A 4GRFA 2WULA 2FHEA 1A2JA 4MJEA 1SL0B 1AXDA 5H5SA 1FVJA 2MBTA 4DEJA 2G0FA 3ME7A 1VF4A 1X5CA 2LRNA 2OBKA 5ECLB 2JZSA 1ERTA 3UMAA 1M2DA 4V2NA 3GKXA 4YAVA 3H4KA 6GSVA 4G2EA 2ZUPA 2LEGA 3GMFA 4RI6A 1JLWA 4WF5A 3GL5A 4G10A 1X0RA 2OA7A 3UAPA 1XWCA 4GTUA 2VCVA 5D9VA 1VGLA 2B7KA 1WE0A 2V32A 3DRNA 4ID0A 1F37A 1ZMAA 1T3BA 2YOIA 1EZKA 2F3MA 5A4VA 2HE3A 2C0EA 1ZL9A 1YF0A 3GUSA 1OAZA 3BD2A 5B8BA 1R26A 2E2GA 1V9WA 1XPVA 2K8VA 3IK7A 2FUG2 4KNDA 4ML1A 3CXGA 5JWQB 4QL7A 1ZOFA 2X8HA 2RUFA 2VAFA 3TCOA 4GXZA 2P31A 1AQVA 2YN1A 1PN9A 3CTFA 3KD0A 4BVYA 4XRDA 5DQYA 2N5AA 4RI7A 2P0GA 4CDOA 1AW9A 1JZRA 3UL3A 1K0MA 4HQZA 3GKMA 3S9FA 1GUKA 4F0BA 5DBQA 3IE3A 3TKSC 3ZVJD 2ALBA 1O73A 2IMFA 1S3DA 1PKZA 2H73A 3JCML 3FR9A 2FCHA 1SD9A 4K0GA 9GSSA 2PVQA 3F63A 2H6XA 2AAWA 3LXTA 4IS0A 1TU7A 3C73A 2RM5A 1UC7A 4OO4A 2C3NA 5DVBA 2I3YA 2LNTA 1GSDA 5B6MA 2REMA 4HOJA 3QR6A 3GX8A 4KX4A 4V2LA 4BWQA 3CYNA 3TB2A 4EF0A 1TJDA 2L59A 5J4UA 4POLA 3IPZA 3EYTA 5E4WA 2WCIA 5G2ZA 4YQUA 4EO3A 1FAAA 2OE3A 2O8VB 2DJ3A 4NHWA 1J0FA 4NXIA 1YKCA 2C3QA 3VLNA 5J9BA 4JEDA 1SK0A 2IMDA 4I5QA 1O81A 1FB0A 2B5YA 2V6OA 1N2AA 1X5DA 3APQA 1TU8A 2JSZA 2WB9A 3RPNA 2OJLA 4HQSA 5GSSA 5GSTA 2AJQB 1Y25A 4ACSA 5DALB 2PBJA 4O32A 2M46A 3GTUA 2CZ2A 4TR4A 2OE1A 2V6KA 3DVXA 4WBRD 3PH9A 2DBCA 1XFLA 2JADA 1EOHA 1Z9HA 6GSTA 2C0GA 4TR1A 3HXSA 1Y6EA 2DJJA 3HY2A 1A2MA 2LQOA 1F3AA 1JZDA 2N5FA 2H30A 2OACA 1SD8A 2FA8A 2HSHA 3EMPA 1LU4A 1PGTA 2J23A 1G6WA 3FR3A 3VWWA 4KW6A 2DC5A 2MMAA 5LNKe 1TDIA 4YQVA 5IPGA 4MJBA 4MJCA 4V2MA 3MDKA 1OKTA 4EVMA 3KEBA 1B4PA 5A4WA 1HNAA 3GHAA 2GGTA 2YWOA 1GSQA 2CT6A 3LQ7A 5HR0A 3LSZA 1KNGA 3WGDA 5KEJA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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