2IN3A

Crystal structure of a putative protein disulfide isomerase from nitrosomonas europaea
Total Genus 63
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
63
sequence length
208
structure length
204
Chain Sequence
EKPVLWYIADPMCSWCWGFAPVIENIRQEYSAFLTVKIMPGGTNTPLLPEKRAQILHHWHSVHITTGQPFTFENALPEGFIYDTEPACRGVVSVSLIEPEKVFPFFAAIQRAFYVGQEDVAQLAILKKLAVDLGIPESRFTPVFQSDEAKQRTLAGFQRVAQWGISGFPALVVESGTDRYLITTGYRPIEALRQLLDTWLQQHG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of a putative protein disulfide isomerase from Nitrosomonas europaea
rcsb
molecule keywords Hypothetical protein
molecule tags Isomerase
source organism Nitrosomonas europaea
total genus 63
structure length 204
sequence length 208
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-10-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.472.60 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Cyclin A; domain 1 putative protein disulfide isomerase domain 2in3A02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2in3A01
2FLSA 2DJ2A 5F06A 1K0BA 1PSQA 9GSSA 5FWGA 5ECOB 2H74A 3IDVA 2OE1A 1J08A 4LA1A 1F37A 4EL1A 2JSYA 4G19A 5LNKe 2L4QA 2LTKA 1WE0A 5FT3A 2PVQA 1DE1A 1ILOA 1Z6MA 3IOSA 4K0GA 1GUMA 1R5AA 2IMKA 3BOAA 1OAZA 1K0CA 2AAWA 1NHOA 2ALBA 2DJ0A 1ML6A 5CREA 4CDOA 5ID2B 1Z6NA 4EUYA 1YEPA 4AJ6A 5DJLA 3A2WA 5DCGA 1M2DA 5F05A 2VOCA 1X0RA 3H79A 4L0WA 3ZFBA 2E2MA 4XS4A 3C1RA 1WWJA 4ECJA 3UBLA 3HY2A 5LD0A 3EVIA 4IKHA 3D6IA 1M2AA 4JR4A 3CSJA 3HXSA 4F2IA 1GSSA 3HVSA 2ZNMA 3M9JA 3KCMA 5GSSA 4BA7A 3TKSE 1YF1A 4DEJA 1T3BA 4DSRA 2C0DA 4O32A 4MDCA 4MCUA 2H72A 2FNOA 1QQ2A 3IRAA 4ECBA 2L5LA 3HDCA 2XBQA 3F6DA 2L59A 4DSSB 11GSA 3EC3A 2FGXA 1X5DA 4PUFC 1Y25A 1PQNA 3A3TA 3UVTA 4D73A 1G6WA 18GSA 3HZ4A 3C1SA 5ECHB 1PRXA 3TKPA 6GSVA 1M9BA 3Q6OA 2IPAA 3GH6A 1ERTA 3EMXA 3ZLPA 1X5EA 2FWFA 2G0FA 5ECLB 3EINA 5H5QA 1K3LA 2IMEA 1J0FA 3CSHA 2VLVA 3F9UA 3QCPA 2X8CA 5F07A 3VPQA 1TRVA 4ZBBA 3IPZA 4I2TA 5A5KA 1FAAA 1YKAA 4HQSA 3ZFLA 4NV2A 1ZOFA 3CMIA 4O5RA 1O8XA 1GSUA 2HE3A 5IMVA 5G5FA 2OKAA 1ZZYA 3O6TA 5HFGA 1RQMA 1SU9A 3EYTA 4FO5A 3KGKA 1C72A 3WT2A 4E8HA 3C7MA 3ZREA 1GLPA 3IAM2 3CXGA 1PKWA 1TDIA 2RM5A 5IOWA 1TP9A 4XRDA 1G7OA 4TR0A 5J4UA 6GSUA 1B4PA 1A2JA 5IMFA 4JZQA 3TJBA 4K2DA 3TKRA 4KB3A 3APQA 2O8VB 2HRNA 2IL3A 4EXJA 2M46A 2DBCA 2B7JA 5HR0A 1XZOA 4KSOA 1URMA 3E3EA 1TU8A 1M0UA 3M0FA 4HJMA 4GF0A 1Z5YE 1QGVA 2DJ3A 4POLA 1QFNA 3ISOA 4XCSA 2L57A 13GSA 4V2LA 4OO4A 2R4VA 2REMA 2H71A 2C0FA 3GKXA 2GQLA 2P5RA 2H6YA 4TVEA 1IYHA 2H1BA 5ECQB 2VD0A 3KMOA 2GVPA 2OE0A 4FH8A 3WGEA 4E8EA 5DDLA 2R3XA 1ZL9A 1E6BA 3TCOA 3ZZXA 3O76A 3LORA 4G10A 2J23A 2WDUA 3R2QA 4JRRA 2LQOA 1BEDA 4KE3A 1U3IA 1KEBA 3VI5A 2P5QA 4X0XA 4H86A 5ELAA 4OFTA 3KH9A 5KN0A 1TRWA 4XS4B 4MJAA 3GKKA 5H5SA 2CA8A 1USBA 1OYJA 1T4YA 1ERWA 4MZCA 1JFUA 4NPBA 1V40A 2F51A 1SK1A 5AIVA 3BD2A 5ECPB 4QL9A 2HLSA 4TR1A 5ECSA 2YV7A 3UBKA 3ZIJA 4WR4A 5ELGA 3D4MA 22GSA 2RUFA 1JZRA 5GZZB 5IOXA 1HQOA 4AJ8A 2HT9A 1GSQA 5ID2A 1A2MA 4OMVA 2R6KA 3FR9A 2GSSA 4FYBA 4BWSA 2LJRA 4MK3A 3TRPA 5JWRB 3L9SA 1BAYA 4JEDA 4D73B 4EF0A 2FWEA 3LQ7A 3ERWA 5IIZA 2DIYA 4MMMA 2X8GA 2YPMA 4BL7A 3WGDA 3GX0A 4HJ2A 5J41A 1R7HA 1AAZA 4ML1A 1SJ6A 2R37A 1SD9A 5J9CA 1T7PB 4YH2A 3JCML 4ZL8A 2YZUA 4OCFA 6GSXA 1TK8B 6GSTA 5JWOB 4IGJA 1ST9A 1FB6A 2NTOA 4L0UA 2VUPA 4HUAA 2WZ9A 1FVKA 4K8MA 4IW9A 5B7CA 4EE0A 4N30A 2YJ7A 4ZB8A 1GNWA 2HRFA 1UC7A 3RPPA 5J3RA 1GL8A 1K0DA 4RI6A 1I5GA 5ENUA 4L5OA 2DMLA 4HOJA 3KXOA 2MMAA 5ABRA 5AN1A 5D8IA 5LCZA 1TW9A 2KP2A 1HD2A 2O85A 4V2NA 5IMDA 5KEJA 2RM6A 2VLUA 3PGTA 4KSMA 2HNLA 2C1YA 2IMIA 3HVVA 1Y6EA 2YWIA 3VWUA 2B5YA 4ZBDA 3G7YA 2OA7A 1AW9A 1PX7A 1VF1A 1SJIA 2EIQA 2E7PA 3UAPA 1DUGA 3GYKA 2GGTA 3WT1A 1AXDA 3L78A 1GSYA 17GSA 3IHQA 5KN1A 4XRAA 2AHEA 4WBRD 1WOUA 5B6MA 3CRUA 2H6XA 3GURA 3C8EA 2VL2C 3APOA 4N0VA 3LXTA 2H0IA 2VL2A 4MZWA 5IMCA 4IBPA 2VAFA 3CYNA 5ECNB 2H1DA 1O6JA 4X1UA 3TJGA 2CX4A 4Q5NA 2GS3A 2KOKA 3GL5A 1XW9A 5INYA 2IMFA 3KZQA 3L9UA 1IYIA 3TUEA 1HNBA 2PVOC 5JCGA 1OC9A 2HI7A 2H76A 2HFDA 4MZBA 3HHVA 2GQMA 4ZB9A 4BVXA 3KTBA 20GSA 1QMVA 2LUSA 5HR1A 2N5BA 2CVBA 3UOMA 4ULXA 1SK2A 1B9YC 3F0IA 3HJMA 8GSSA 4KGIA 2MZCA 3ME7A 4MH3A 1FW1A 1XW5A 3DRNA 4O7HA 1XWAA 1K0NA 1U87A 1HYUA 5CRGA 3TJKA 2L4CA 4F9ZA 2K8VA 4TR1B 4I6XA 1FO5A 3LXZA 3WYWA 3M8NA 4MPGA 4LLRA 1Z7PA 5CO3A 5ECMB 1F2EA 5HR2A 3BBYA 4IP6A 4KA0A 4F0CA 1Z9HA 2B5EA 3F3RA 5D96A 3D21A 3QAGA 3QAWA 5J5NA 2NVLA 1V2AA 4CW9A 2FY6A 3CRTA 4KCEA 2H19A 5AISA 2KP1A 3A2XA 5AGYA 3VPTA 3EU4A 1EP8A 2DSAA 2CZ3A 3TOUA 2VD1A 3F3QA 4ILFA 1O73A 4ISDA 2P0GA 2VM2A 4G9HA 5B6NA 4N0ZA 2H75A 3QAVA 1SL2B 1AQXA 4XIHA 6GSWA 2MMZA 4NAXA 3HJPA 1FOVA 3G7JA 4OFMA 3U6VA 3SWLA 4PX1A 1OC3A 1NW2A 5DCHA 5IM9A 3IXRA 4OWYA 4XHMA 5IPGA 4AGSA 4J2FA 3EMPA 3NZNA 4MJBA 2WGRA 3GX8A 4IN0A 3DD3A 3TOTA 5EVOA 1OE7A 2LNSA 3IAS2 3C71A 1K3OA 4BVYA 2MYGA 1QK8A 4OFNA 3VWWA 1O8WA 1Q98A 4HI7A 3NIVA 3L0HA 3IA1A 2GLRA 3HCZA 1M7TA 1XWCA 1T8EB 4JBBA 5ECIB 2CAQA 1CQHA 4ZB6A 2K6VA 4Q5FA 1T4ZA 3PH9A 1JZWA 3LGCA 3HVXA 1N8JA 3N5OA 4WBJA 3HD5A 5A4VA 1MDIA 4IQ1A 4F0BA 3BJ5A 1EGRA 3TRQA 3MDKA 4IP1A 2N5AA 1EEJA 3DVXA 4KUNA 5EPFA 3M9KA 4K7IA 1PL1A 2VIMA 2ZUPA 1PA3A 1MD3A 3FZAA 2VM1A 3H8QA 1EOHA 2RIIA 5CP1A 4YAVA 3VK9A 1ZCPA 4NV5A 4YQMA 2QGVA 2WB9A 3FHKA 1HNCA 2JL4A 1SYRA 3I43A 2VCZA 3ZTLA 1A0RP 2EIOA 4MF6A 4MJEA 4OD7A 1VF3A 3EWLA 3QDNA 4EO3A 3QOUA 1MD4A 5KN3A 3W6GA 1OC9B 3CTGA 4NWYA 2V32A 5JCUA 3ZRDA 2F3MA 2JZSA 2H1GA 2CAIA 4O92A 4K9ZA 1XIYA 2B5XA 4KCAA 2WCIA 4HS1A 3IBHA 3MWHA 3GFKA 1GTAA 2G2QA 2ON7A 1M9AA 2H1AA 5GAND 5GSTA 1NSWA 4G2EA 3EE2A 4POMA 4J56E 2JSZA 1MTCA 4FYCA 2NBSA 2RUEA 1VGLA 1M2BA 2BTOT 1ERUA 1GTUA 3ERFA 2LRCA 1A0FA 3EU3A 1SJZA 3MNGA 4DVCA 2Z9SA 3GSTA 2MMNA 2L6DA 1SKSB 2YCDA 1PGTA 5ECRB 2H70A 2OACA 2GZYA 3I69A 3RHCA 2LQQA 1PMTA 4HEA2 4KW6A 4J57E 1F3AA 7GSSA 4GWRA 4LMVA 4Q5RA 4IS0A 4NHZA 3HKRA 2YP6A 12GSA 5FHIA 2R5GA 1JHBA 2CVKA 2RLIA 3QR6A 5DBQA 2P31A 2JZTA 2N5FA 1SL1B 2JACA 2C4JA 2HYXA 4MF7A 4EDYA 1MDJA 2DIZA 1EOGA 3BCIA 3ZYWA 2PPTA 1RW1A 4K7NA 1XWKA 1BJXA 1BX9A 1S3AA 3KTLA 3P8WA 2V6OA 3TGZA 1GTBA 1GH2A 3VWXA 2VCQA 3M1GA 1FG4A 3TRXA 2XPDA 2FWHA 2YV9A 4ZL7A 1TRSA 4TKYA 1TKDB 3RBTA 1AQWA 5CAXA 2XBIA 2CVDA 5G2ZA 1KTEA 4GLTA 4WF5A 3GH9A 3D5JA 4ZBAA 1H4OA 1SENA 1H75A 2TIRA 2FHEA 5F8BA 3I6AA 4KH7A 3UEMA 2O89A 5D9VA 1EV4A 1W89A 5G1KA 3LYPA 1SL0B 4PNFA 4V1Ag 4YQVA 2DJJA 1F6MC 2WS2A 2YWOA 2H8LA 1A23A 1UN2A 1GWCA 4GQCA 2IWTA 1B8XA 3UL3A 3AY8A 3WGXA 3QFBC 1AIUA 4N10A 2CV4A 4GSSA 1XVWA 1X9SB 5DJMA 1U6TA 3ZVJA 2C3QA 3KH7A 3F4SA 4YAPA 4QL7A 3GHAA 4I2UA 2X8HA 3CBUA 1T00A 1TXXA 2C3NA 1X5CA 5HR3A 1MDKA 2WULA 3VURA 3GTUA 3TKQA 1TK5B 4TW5A 4TOPA 14GSA 1XVQA 4I5QA 4XS6A 5HFIA 1WIKA 4HU9A 4ID0A 5B8AA 4P3YB 5IO2A 1DE2A 4ECIA 2JZRA 5DQSA 1EGOA 3ZMKA 3RAZA 4V1Ap 5COHA 1YQ1A 5D9TA 4WEYA 5D9WA 2FD3A 3D0ZA 2GTUA 1OE8A 3KM6A 2LSTA 3APSA 5EL8A 1XBSA 4YQUA 1Q4JA 1V98A 1YDKA 2MBTA 2H30A 10GSA 2M80A 1TOFA 2O7KA 4ZXGA 1ZYQB 2FCHA 1E2YA 5F0GA 2E2GA 1QUWA 3FKFA 4PURA 1MEKA 3H93A 3GSSA 1EEMA 3H4KA 3DYRA 3ZIVA 3A2VA 3KJYA 2GZPA 1O81A 3ZVJD 2K18A 4HZ4A 2L5OA 1AC1A 3I9V2 3E9JB 2YN1A 2OADA 2E0QA 2GSTA 2GDRA 2LNTA 1VF2A 2V41A 1HNAA 2LJAA 5G31A 1XOAA 2HXKA 1WRYA 4PQIA 3E0UA 4IJIA 1XWGA 3GV1A 4XTSA 1XCCA 5A4UA 2AJQB 3P90A 1K0AA 2H0GA 4KNDA 3W8SA 3LWAA 3VFIA 2JADA 4TN8A 4NMUA 2X99A 4ECCA 2HZEA 4ZL9A 2ZCTA 3GNJA 3IV4A 3DKSA 1UVZA 5CRWA 5C00A 1DSBA 4K7OA 4MF5A 1WPIA 1EP7A 3TKSA 1GNEA 3FZ5A 2CT6A 4ZILA 1VRSD 5HQPA 4TXOA 1ABAA 3L4NA 1RK4A 19GSA 2HSHA 2EC4A 4WF4A 4N11A 4CHSA 2IFQA 3HZ8A 3F63A 2KHPA 3LYKA 1A24A 2OE3A 1ON4A 4POBA 3Q74A 3GKNA 4L8EA 3GA4A 4NXIA 4BWQA 3KMNA 1A2LA 1LBKA 1F9MA 4PXOA 3TDGA 5HFKA 3HA9A 3F8UA 2YWMA 4FIWA 1SKRB 3GMFA 2PN8A 1EV9A 2VLTA 5D73A 6GSYA 3GL3A 2PGTA 3VWVA 3K8NA 1AUCA 3GN3A 3UMAA 5AIXA 2B3SA 3IK9A 1OKTA 1JZDA 1ERVA 3RPNA 4I8BA 2TRCP 2IIYA 4LL1B 3J7Yk 1WMJA 5JCWA 1BYEA 4Z7XA 4WETA 2IJYA 4MABA 1A8LA 2F8AA 4RUVA 5CRHA 1OKDA 1XXUA 2QC7A 3UIWA 1SK0A 1V57A 2YZHA 3UARA 2FUG2 2MMOA 2XC2A 1DBYA 2LV3A 5C04A 1YJ6A 1YY7A 2L6CA 5B8BA 4WXTA 2PUKC 2QSIA 5D93A 2WRTA 4HU7A 5G30A 1YEXA 3GTUB 4GQFA 2KUCA 3U5RE 2LJKA 2OBKA 3IK7A 1GSFA 2LEGA 2PWJA 1PX6A 2GQKA 1GSDA 2BMXA 2NPBA 1TU7A 5L71A 1G6YA 4GSNA 2H66A 1R5PA 2GT6A 1GLQA 4RQRA 1THOA 3F4TA 3FYGA 3PR8A 1NM3A 3D4TA 2C80A 2H6ZA 4X43A 4AF2A 1V58A 5E4WA 4PNGA 3ERGA 4MJCA 3M3MA 1OVNA 4PQHA 4V2MA 4GSTA 2V6KA 2A2RA 1TTZA 2I3YA 2XPEA 16GSA 2B1KA 1EZKA 4MA9A 1TI3A 3GIXA 1GUKA 2I4AA 1GULA 4IHUA 1JLWA 4ACSA 3DXBA 5D9XA 2AB6A 1U88A 4IELA 5ECKB 3MAKA 2F9SA 1R4WA 3SBCA 1ACVA 1LU4A 2VCTA 1FHEA 1GSEA 2FWGA 4GTUA 2QKEA 3FZ4A 2R2JA 1W4VA 2VL9A 3VLNA 3P7XA 3UVHA 2PMTA 2VCVA 2DMMA 3UJ1A 1PL2A 5DAKA 2HZEB 3P2AA 1ZYEA 4K6XA 4RQXA 4TR4A 3KEBA 1NHYA 5J9BA 3GKMA 4OO5A 1AQVA 2XHFA 3FR6A 3N9JA 2H0HA 5DVBA 2YWNA 4KDUA 3HJOA 1B48A 4MH2A 1R26A 2BJXA 2D2ZA 3G7IA 4F82A 4AJ7A 1PD21 2I9HA 3C73A 4TXOB 3DGQA 2DJKA 2IN3A 2V2GA 2WJUA 3RHBA 2TRXA 4K0NA 4ML6A 2H01A 1EWXA 2IFQB 3RDWA 1CQGA 4RI7A 3MSZA 2B1LA 4OCEA 4QQ7A 4KDXA 3US3A 3IE3A 3IR4A 1PKZA 1JZOA 3FZ9A 1JLVA 2O87A 5H5RA 2K9FA 1A8YA 2KLXA 3FEUA 3J7Yb 3QMXA 4L5LA 2AV4A 5G1LA 5A4WA 2FA8A 1SYXA 3LFLA 1I9DA 3DEXA 4NHWA 1FVJA 2HSYA 2VCXA 6GSSA 2H73A 2VO4A 3O3TA 4XS1A 3F4RA 3TJJA 3D22A 4TRXA 5DALA 3V1WA 4F03A 1G0TA 4BPYA 2GSQA 3NOFA 3ZITA 4MLYA 1VF4A 5G5EA 1X9WB 1K0OA 2OBIA 5IMAA 1XPVA 2YNXA 2ES7A 1XWBA 1TJDA 2F8FA 4KAEA 2DC5A 1O7UA 4DSQA 4WKWA 2B7KA 4Q5QA 3DMLA 3KD0A 1BG5A 4KX4A 3FK8A 2GT5A 3VI7A 3FW2A 1KNGA 3CTFA 1Z7RA 1S3DA 4HQZA 4PQ1A 2MBSA 1YKCA 1N2AA 3TB2A 1TI1A 2V1MA 4JU5A 3FR3A 5IMZA 1G7EA 1FB0A 3FY7A 2GZZA 1YZXA 1B9XC 1GTIA 1K0MA 4FYUA 1M99A 3F6FA 1ZGNA 4JR6A 4IQAA 2PBJA 3Q18A 4JE1A 1OC8A 1T1VA 4GCIA 4EDZA 5CNWA 2C3TA 1K3YA 3G9BA 3LG6A 5KN2A 1GP1A 2DLXA 3IC4A 1V9WA 4TR3A 2PERA 3BCKA 3LJRA 3S9FA 2LKUA 3ME8A 1Z3EA 3LEFA 2I81A 3QD9A 2PU9C 3H1NA 2CZ2A 2ON5A 3FRCA 5E59A 4DSSA 2C0GA 2NDOA 3TJFA 4WR5A 2CQ9A 2DJ1A 1ZMAA 5EY6A 3L9VA 4MPFA 4GXZA 2J9HA 2M72A 2B6MA 2VCWA 3W8JA 2YJHA 3DWVA 4MP4A 3GRXA 3QFAC 4I97A 2I1UA 2X64A 1XW6A 2CX3A 3ED3A 2HZFA 4POKA 4LMWA 2WFCA 1SD8A 5IPHA 4KDYA 4PGTA 5DQYA 1QXHA 3WD6A 3Q19A 5GAPD 1YF0A 3OR5A 5JWQB 2LS5A 3EURA 5DAKB 1TRUA 3PINA 2C8UA 4IVFA 2AYTA 4HDEA 4TXVA 1SKWB 2YANA 5IO0A 1XFLA 3ZL5A 2A2SA 2GSRA 2K8SA 1F3BA 5IQYA 1LJRA 2FA4A 2LRTA 2VL3A 1WJKA 1THXA 3GUSA 4ZIJA 5CRDA 1GRXA 1PN9A 4GRFA 1BQ7A 1TK0B 2IMDA 4IJ3A 1XOBA 3KP9A 3DIEA 4PUAA 2JU5A 2A4VA 3KIJA 1U3AA 3ZMLA 4EC0A 1S3CA 3HYPA 1GUHA 4K1FA 2YOIA 1WP0A 2OJLA 3KP8A 2C0EA 1B4QA 3A5WA 3CSIA 3LSZA 5CYYA 3DVWA 4HZ2A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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