2IN3A

Crystal structure of a putative protein disulfide isomerase from nitrosomonas europaea
Total Genus 63
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
63
sequence length
208
structure length
204
Chain Sequence
EKPVLWYIADPMCSWCWGFAPVIENIRQEYSAFLTVKIMPGGTNTPLLPEKRAQILHHWHSVHITTGQPFTFENALPEGFIYDTEPACRGVVSVSLIEPEKVFPFFAAIQRAFYVGQEDVAQLAILKKLAVDLGIPESRFTPVFQSDEAKQRTLAGFQRVAQWGISGFPALVVESGTDRYLITTGYRPIEALRQLLDTWLQQHG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Isomerase
source organism Nitrosomonas europaea
publication title Crystal structure of a putative protein disulfide isomerase from Nitrosomonas europaea
rcsb
molecule keywords Hypothetical protein
total genus 63
structure length 204
sequence length 208
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-10-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.472.60 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Cyclin A; domain 1 putative protein disulfide isomerase domain 2in3A02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2in3A01
4POMA 2ON7A 4KUNA 2B5YA 4KAEA 1J08A 3CRTA 2B6MA 1MEKA 3U6VA 4YAVA 1GSQA 2QC7A 4EVMA 5DCGA 4KDYA 4TR1B 1JZWA 4F0BA 1JHBA 1Z6NA 4BVYA 4IJIA 1LU4A 1O8WA 6GSUA 2DJ3A 3ZLPA 2OBIA 2GQMA 4MF5A 4NV2A 2VCTA 2LJKA 4NPBA 2E2MA 5ABRA 1THOA 3M9KA 20GSA 4ZL9A 2L6CA 4WBJA 3IE3A 2REMA 3HVVA 4NXIA 1SJZA 5D73A 1I9DA 3EMPA 17GSA 1F3AA 5IMCA 3AY8A 1BQ7A 2L5LA 4O92A 5IMAA 3Q6OA 1Y6EA 5KN2A 3E9JB 3IA1A 2OE0A 1Q4JA 3RHBA 3TOUA 1ZZYA 2E2GA 3EMXA 4K7OA 4BPYA 2JSZA 3D6IA 4NV5A 4KH7A 3ERWA 2A2SA 1A23A 1B9YC 2HE3A 3GTUB 3HZ8A 2IFQA 4GXZA 3IPZA 1F2EA 2V1MA 4F03A 3D21A 4TR0A 1PX7A 2H19A 2OADA 3IK9A 3ZMKA 5F06A 2LQQA 4DSSA 1USBA 3CTGA 2FNOA 4YQVA 4RI7A 2FHEA 5CRHA 2NPBA 5F07A 1T4ZA 1SL1B 2C0DA 1PD21 1O8XA 3FZ5A 2WULA 3KM6A 3RPNA 2J23A 3D4TA 5B6MA 4E8EA 1SKWB 5KN1A 4ZBAA 3RBTA 2VCQA 3DGQA 5ECRB 3RDWA 3IOSA 1ACVA 1TRVA 4O5RA 1SK1A 4L0WA 1WP0A 4N0ZA 3EU4A 3I6AA 1T00A 1EOGA 2H0IA 3FZ4A 3QMXA 5F0GA 1GUHA 5IIZA 5CRGA 2VCZA 1X9WB 2YANA 1YEXA 2G2QA 5ECQB 1SENA 1SKRB 2J9HA 1PL1A 3W8JA 3APQA 2V32A 3GMFA 3JCML 2JL4A 1GTIA 3QR6A 4MH2A 1GNEA 2C0GA 4JU5A 1U3AA 4JE1A 3EYTA 3LQ7A 3R2QA 2DJJA 4ULXA 1XIYA 2C0EA 1F37A 3HCZA 1ZOFA 2F8FA 2M46A 1GSSA 4D73B 3F0IA 5D96A 5E59A 4YQMA 2B1LA 2AYTA 2VCVA 1MDKA 2KOKA 1IYHA 2GGTA 4RUVA 1QUWA 2FWHA 2R6KA 3UBLA 1YF1A 5F8BA 5EVOA 5DJMA 4V2NA 4XS6A 1T3BA 5FHIA 2ON5A 4K7IA 2RM5A 3VPTA 2VOCA 1TU8A 2CA8A 3HKRA 4ZIJA 3M1GA 4H86A 1YF0A 5A5KA 2CX4A 4MPGA 1F9MA 1TRSA 4N30A 5DAKA 5HQPA 2GT5A 3RPPA 1Z9HA 3HHVA 2XBQA 2L57A 4O32A 5D9WA 2GLRA 4WR5A 1GUKA 2H1AA 2K18A 2TRCP 3GL3A 12GSA 2FY6A 4YH2A 3TJJA 4DSRA 2E0QA 1ZYQB 3TOTA 2MMAA 2OA7A 5D8IA 5L71A 4KDUA 2LV3A 1A8LA 5AIXA 4GQCA 1RQMA 5IPHA 3TJGA 1G0TA 2O7KA 2AJQB 1TI1A 2R4VA 4HDEA 1XWAA 1Z5YE 1PMTA 1K0AA 2RLIA 3VURA 1EP7A 1ERTA 3C1RA 3A2WA 4MJBA 5AN1A 2YV9A 1TU7A 1XBSA 4CDOA 3GL5A 1VF4A 4OCFA 5KEJA 1K0BA 1K0MA 2DIZA 3FR9A 3FHKA 1M2BA 3CYNA 2IMIA 3GA4A 4AJ8A 8GSSA 5CYYA 3NIVA 1PL2A 1H75A 2QGVA 4MJCA 3TJKA 2CV4A 4FH8A 1AXDA 3GKNA 2KUCA 3WYWA 2C3TA 2M72A 4J57E 4POKA 3UJ1A 1AQVA 2P0GA 1QFNA 2JZTA 2KHPA 4NMUA 5E4WA 5ECNB 2VM1A 1EWXA 4EDZA 5DJLA 1FVJA 1IYIA 1GSUA 1SJIA 2CZ2A 2H72A 3D22A 2EC4A 3L9UA 2GZPA 1ON4A 4MCUA 2O89A 1AC1A 1TP9A 2O87A 1TJDA 2K6VA 4WF5A 2C4JA 1GH2A 3O6TA 2YWNA 2HXKA 3UOMA 3UAPA 2GSTA 2R3XA 1PN9A 3FYGA 1A2JA 2HFDA 4ZL7A 4EO3A 2DMMA 2HSHA 3NZNA 1M0UA 1ST9A 3M9JA 3DWVA 3VWWA 1B9XC 3W6GA 1G6YA 3ERFA 3LJRA 1FOVA 1XVWA 1OKDA 4I5QA 4JZQA 1K0OA 1ERWA 3KMNA 1NHYA 4J2FA 5LNKe 2C0FA 1G6WA 4I97A 4WKWA 4K6XA 3BBYA 3D0ZA 4E8HA 3TRXA 2LNTA 3A5WA 1EP8A 4AJ6A 3ZIVA 2DJ1A 1QXHA 1X9SB 5J5NA 4ZB9A 2FA4A 2WRTA 4MDCA 3VFIA 4TXOB 1YKCA 4TR1A 1B48A 3ZFLA 4XIHA 4PQ1A 4HOJA 1G7OA 3ZREA 2GQLA 2LJAA 1Z3EA 2BJXA 3IC4A 2DIYA 3DXBA 1V2AA 2LNSA 3CXGA 2QSIA 4HI7A 1TRWA 3C8EA 1BEDA 1TI3A 1ERVA 1K0CA 5ECPB 4GF0A 5HR3A 5ID2A 3WGXA 4ZB8A 2YNXA 5CRDA 1LBKA 2F8AA 3KP8A 2GSQA 1Z7RA 1LJRA 4TW5A 3UIWA 2B3SA 4F9ZA 5H5RA 2WCIA 3MAKA 4G9HA 4TR4A 13GSA 3DYRA 2B1KA 3J7Yk 6GSTA 3KGKA 4IQ1A 2IWTA 4ZXGA 3LXTA 3LYKA 3GTUA 2YJHA 3APOA 3QDNA 4MA9A 3KXOA 3MWHA 4ZL8A 4HJMA 3P2AA 3QPMA 4XRAA 4KB3A 2VCXA 2CVDA 1R4WA 1GL8A 1XW9A 1OVNA 4OFMA 2DLXA 5ECSA 1NM3A 4MZBA 3KCMA 5FWGA 2VAFA 5C04A 3MNGA 1RK4A 2WZ9A 5ECHB 1GSDA 2HYXA 1HD2A 3BCIA 5IOXA 4EUYA 3LFLA 4GCIA 3DVWA 3GHAA 4MPFA 1PA3A 2H0GA 2IN3A 1SU9A 1X5EA 4MF6A 3GX0A 4DVCA 5ECOB 3CSIA 3DVXA 2XHFA 3HXSA 1MDJA 6GSVA 2C3QA 4KCEA 4EDYA 4ML6A 2MBTA 2AV4A 2H01A 3FR3A 2IJYA 5DBQA 3DIEA 4AJ7A 1TW9A 3L0HA 2PGTA 1YEPA 2PUKC 1WWJA 3G7JA 2H73A 3CMIA 1SD9A 4D73A 1Z6MA 1AIUA 1N8JA 2NVLA 1JZRA 3N9JA 2WDUA 1YZXA 3Q18A 1EGRA 2IMEA 2YN1A 3FR6A 4N10A 3GNJA 3GIXA 2LRCA 4L0UA 2K8VA 2VLUA 2IL3A 2YWMA 3CSJA 2EIOA 2FGXA 5G5FA 2VIMA 2R37A 5G2ZA 1ZMAA 5DCHA 2MBSA 4F2IA 4HU7A 3TRPA 1PKZA 5HR2A 4MZCA 2PVOC 4ACSA 1M99A 3H4KA 4XS1A 2WGRA 2LQOA 1YKAA 2GZYA 4KW6A 5D9VA 3DKSA 3S9FA 5D9XA 2P5QA 1FAAA 1N2AA 4MLYA 2VD1A 4GTUA 3MSZA 4CHSA 2CAQA 3QAVA 1SK0A 3F4TA 1F3BA 1FVKA 1HNBA 4MP4A 4L5OA 1OC9B 2V6OA 1GP1A 4GRFA 3HVSA 1A2LA 1SJ6A 1X5CA 5IPGA 3ME7A 1TRUA 4AF2A 3ZL5A 1EZKA 3GSTA 1HNCA 2FLSA 1VF2A 3GN3A 3KH9A 3TJFA 2VL9A 2LSTA 4XS4A 5IMDA 3KEBA 2X8CA 5G30A 5A4WA 1TK8B 4TRXA 1ZGNA 1S3AA 3GV1A 2HRFA 3UBKA 5G1KA 3LWAA 4GWRA 1UC7A 5J3RA 1AAZA 4L5LA 5KN3A 2I4AA 1GUMA 4WETA 5G5EA 2I3YA 5IO0A 1K3LA 4OD7A 3M3MA 1KBNA 1OC8A 2JZSA 2YZHA 2I9HA 3G9BA 1O7UA 4HQZA 3TKQA 3GH9A 2B7KA 2JZRA 4ML1A 3RAZA 4FYCA 4FYBA 2H76A 1EGOA 3D4MA 4TR3A 3FZ9A 1X9MB 2A2RA 1UVZA 4OFNA 1J0FA 3US3A 3ZRDA 3ZIJA 3HJPA 4IGJA 4Q5NA 3G7IA 1NSWA 4PNFA 4IBPA 2N5FA 2Z9SA 2LUSA 3GRXA 2KLXA 2VUPA 2FA8A 4F0CA 1CQHA 2DJ2A 2H0HA 5JWQB 1U3IA 2H70A 3F3QA 4F82A 3VPQA 2HZFA 5ENUA 4K2DA 4XCSA 4IW9A 2IFQB 3PR8A 2L4QA 2N5AA 3M8NA 2FCHA 3ZFBA 2YPMA 5B8AA 1WOUA 3HJMA 4ECBA 5DQSA 2WJUA 1VF3A 2HRNA 4TXOA 2F9SA 2FWFA 3IAM2 4G19A 1DE2A 4ZB6A 1S3DA 2AB6A 3HD5A 4EL1A 2KP1A 2D2ZA 1GSEA 2H74A 1R7HA 2CAIA 2KP2A 3EC3A 9GSSA 1OE8A 1VGLA 2PERA 4KNDA 4PXOA 2IMKA 5HFKA 2OACA 5GAND 3GSSA 1JZOA 2AUVA 2TIRA 1TK0B 2L59A 2YCDA 4FYUA 4HZ2A 5JCGA 4TVEA 5EL8A 5AISA 5ELAA 18GSA 2H71A 2YV7A 3IV4A 4WXTA 4IHUA 2X64A 2HI7A 1X5DA 4HEA2 2IMDA 3SWLA 4ID0A 1SL2B 4BVXA 2MMNA 2GSSA 1YJ6A 3G7YA 1PSQA 3TB2A 5DALA 1T7PB 3ISOA 1G7EA 1JLWA 3I9V2 2PMTA 3UEMA 4KA0A 5H5QA 1XWKA 3PGTA 4Q5FA 3W8SA 4EKZA 2JU5A 2X99A 3A2VA 2F3MA 3GX8A 5IO2A 1M9BA 1U88A 3IK7A 4EF0A 4V2LA 5GZZB 5ECIB 5B7CA 3FY7A 2R5GA 3VI5A 3IAS2 1HNAA 5J9CA 2DBCA 3WT1A 4TXVA 3HY2A 2DJKA 4MZWA 3CTFA 3VWXA 3H79A 3LG6A 2GZZA 1B4PA 1GLPA 5J9BA 4OWYA 4K0GA 3TRQA 4EXJA 4K7NA 3UVTA 3F9UA 3ME8A 3LGCA 4RI6A 2MZCA 4K1FA 3UARA 1XW6A 1DSBA 4XHMA 1GSFA 5LD0A 4HS1A 2K8SA 1GNWA 4JBBA 5EY6A 2YJ7A 5DAKB 1S3CA 1OKTA 1J9BA 2H1DA 5G1LA 2CQ9A 3TKSC 2EIQA 3F8UA 3VK9A 5IM9A 1K3OA 1SKSB 2VO4A 2H6ZA 1WJKA 1ML6A 2BTOT 3L9SA 3E3EA 2GSRA 3Q19A 6GSXA 1MTCA 4BA7A 5F05A 4ZBDA 1PKWA 2G0FA 4V2MA 4QQ7A 2L5OA 1AW9A 2I81A 1T8EB 3GFKA 3PH9A 1TK5B 3ZTLA 3F3RA 2L6DA 3QOUA 2XPDA 3VWVA 1HYUA 1QK8A 4G10A 4CW9A 3EVIA 5IMFA 3ZMLA 1A8YA 2HNLA 14GSA 3LXZA 4HJ2A 1TKDB 2CT6A 1A2MA 3M0FA 3FEUA 1VRSD 1BJXA 5FT3A 2VCWA 5JWRB 2RIIA 3NOFA 3HZ4A 1KTEA 4I6XA 1XOBA 2O85A 5ELGA 4XRDA 1M7TA 2JACA 1XOAA 1SYRA 3HA9A 2H6XA 3C7MA 2OBKA 2XC2A 1ZCPA 2H1GA 4X0XA 3CRUA 1JZDA 1ERUA 4MJEA 1A0RP 3FRCA 1AQXA 1OC3A 3TKSE 1O81A 1TTZA 1GWCA 3QFBC 4OO5A 4X43A 1WPIA 2HZEB 1F6MC 4KDXA 1T4YA 1FHEA 5LCZA 2X8HA 2N5BA 4KE3A 2NTOA 2MMOA 3BJ5A 4JR4A 2BMXA 2YZUA 1ILOA 1ZYEA 4HZ4A 4Q5RA 2CVKA 1O6JA 4HUAA 3L9VA 3VLNA 3HYPA 4KX4A 4BL7A 4LMWA 2AAWA 4ECJA 1GTAA 3GKMA 3ZITA 2PU9C 2DMLA 2H1BA 1BAYA 4NWYA 1O73A 1QQ2A 4LLRA 2WB9A 3TJBA 4PUAA 1PGTA 2HT9A 2VL2C 22GSA 1URMA 5IMZA 2H66A 6GSYA 4GSSA 2PPTA 2LS5A 4HU9A 5IOWA 4PQIA 4PNGA 1EOHA 3TCOA 4OMVA 3WD6A 1WIKA 5HR1A 3EINA 2VL3A 2YP6A 3TKPA 5ID2B 3Q74A 1R26A 1VF1A 3DD3A 1XWGA 1PRXA 2TRXA 3QCPA 1PX6A 3LORA 3TUEA 2O8VB 3J7Yb 2DC5A 2OE3A 4P3YB 4LMVA 1GULA 1QGVA 1ABAA 4ECCA 5AIVA 4WEYA 1GRXA 1WRYA 4YAPA 4ISDA 5KN0A 4JR6A 2A4VA 2B5EA 1V40A 4WR4A 3IBHA 3E0UA 4GLTA 2H75A 4FIWA 1KEBA 2B5XA 4K8MA 2CX3A 4TN8A 6GSWA 4YQUA 2IPAA 4LA1A 1M9AA 3F6DA 2V6KA 3MDKA 1U87A 1TXXA 2JADA 1YDKA 3GURA 5COHA 1PQNA 3BD2A 1THXA 2R2JA 1B8XA 5A4VA 1SK2A 5CO3A 2LRTA 1V57A 5CRWA 2GVPA 4Q5QA 1Y25A 1FB6A 1TDIA 3FZAA 2CVBA 2GDRA 2F51A 2LRNA 4O7HA 2AHEA 4K9ZA 3DEXA 3RHCA 3ZZXA 1FB0A 19GSA 4IS0A 2DJ0A 2YWOA 4N0VA 2C1YA 5INYA 4IKHA 5H5SA 3I69A 4LL4B 3WGDA 4FO5A 3IXRA 2PN8A 3P90A 3EURA 2FWGA 4PX1A 2M80A 2QKEA 3UMAA 1X0RA 1FW1A 3KZQA 1M2AA 2GS3A 3FK8A 2GT6A 3KIJA 10GSA 3F4SA 4PURA 4BWQA 1K0DA 4GSTA 5D9TA 3LEFA 1U6TA 5IMVA 4QL9A 4MJAA 2ES7A 2GTUA 3C1SA 3KMOA 1M2DA 5GAPD 1A24A 2V2GA 3P7XA 1GLQA 3DMLA 3H1NA 1EEJA 1K3YA 5J4UA 4NHZA 3PINA 5HFGA 1R5AA 4K0NA 3FKFA 4ILFA 4ZILA 1H4OA 1BYEA 4OFTA 4IQAA 3TKRA 3H93A 1MDIA 2OJLA 1NHOA 1O85A 4V1Ag 2LKUA 1B4QA 3L4NA 2C80A 1R5PA 2JSYA 3I43A 2VLVA 4DSSB 1CQGA 2LJRA 4J56E 2FD3A 4DSQA 3IRAA 1AQWA 5D93A 4EC0A 2V41A 3LYPA 5ECKB 1DE1A 3KTBA 5ECLB 1OE7A 4IJ3A 2MYGA 3UVHA 3ZVJD 5DQYA 1DBYA 1EEMA 3GYKA 2OKAA 1GTUA 4POLA 3SBCA 5CREA 5CNWA 3A2XA 1KNGA 1ZL9A 1MD3A 1Z7PA 2XPEA 5HFIA 3KTLA 1V98A 2PVQA 1T1VA 1XZOA 3QAWA 3TDGA 1XVQA 1W89A 2LEGA 2LTKA 3KH7A 4XS4B 3QD9A 1Q98A 1UA5A 4WF4A 4WBRD 1MD4A 3GUSA 5GSTA 3H8QA 2OE1A 4RQXA 5CP1A 5CAXA 3IDVA 3C71A 3ERGA 5B6NA 4TOPA 1SL0B 4KCAA 3KD0A 3IR4A 2L4CA 4IP6A 2C3NA 1EV9A 2H30A 3EU3A 3F63A 2ALBA 2WS2A 2FWEA 3ZVJA 1JFUA 1XWCA 3KJYA 4PUFC 3U5RE 4G2EA 3D5JA 2FUG2 1FG4A 2IIYA 1QMVA 2RUFA 4DEJA 2HZEA 3O3TA 3WGEA 2WFCA 1V9WA 5G31A 3N5OA 3V1WA 3TKSA 2DSAA 4MF7A 1SYXA 5HR0A 2B7JA 3BCKA 4GQFA 1W4VA 3LSZA 5DVBA 4I2TA 4KGIA 3CSHA 3L78A 4Z7XA 4I8BA 4L8EA 2HSYA 4N11A 1UN2A 2NBSA 1TOFA 4XTSA 1XFLA 2VD0A 3ED3A 3A3TA 4KSOA 3HDCA 3HVXA 1YY7A 3OR5A 2H8LA 3IHQA 2ZUPA 2XBIA 4JEDA 5ECMB 2RM6A 3DRNA 1E2YA 1WMJA 2NDOA 6GSSA 4MK3A 4KSMA 1FO5A 1JLVA 4HQSA 3HJOA 1XCCA 1A0FA 4JRRA 5DDLA 2I1UA 4IN0A 3APSA 1OYJA 4IELA 2CZ3A 3VI7A 5C00A 4EE0A 2K9FA 3QAGA 1XW5A 2P5RA 4MABA 1XXUA 1SD8A 4IP1A 2ZNMA 2PBJA 7GSSA 1V58A 3KP9A 1XWBA 1EV4A 3CBUA 2H6YA 3GKXA 11GSA 2X8GA 2VLTA 4MMMA 2EIRA 2PWJA 1GSYA 1YQ1A 4PGTA 4BWSA 4TKYA 3F4RA 3QFAC 4NHWA 3GH6A 2MMZA 3TGZA 4X1UA 3ZYWA 3GKKA 1WE0A 5AGYA 2E7PA 5DALB 4MH3A 5JCWA 1DUGA 1I5GA 1BX9A 3WT2A 2ZCTA 3FW2A 3K8NA 4AGSA 1AUCA 1C72A 4PQHA 4OCEA 4GSNA 2VM2A 5JWOB 3VWUA 2YOIA 5JCUA 2C8UA 5IQYA 1OC9A 4NAXA 3O76A 4QL7A 3UL3A 5B8BA 3C73A 4RQRA 3F6FA 2P31A 5J41A 5A4UA 4ZBBA 1BG5A 16GSA 4LL1B 4I2UA 4IVFA 4POBA 2RUEA 1HQOA 4ECIA 1OAZA 4OO4A 1RW1A 1K0NA 3EE2A 1XPVA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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