2IN3A

Crystal structure of a putative protein disulfide isomerase from nitrosomonas europaea
Total Genus 63
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
63
sequence length
208
structure length
204
Chain Sequence
EKPVLWYIADPMCSWCWGFAPVIENIRQEYSAFLTVKIMPGGTNTPLLPEKRAQILHHWHSVHITTGQPFTFENALPEGFIYDTEPACRGVVSVSLIEPEKVFPFFAAIQRAFYVGQEDVAQLAILKKLAVDLGIPESRFTPVFQSDEAKQRTLAGFQRVAQWGISGFPALVVESGTDRYLITTGYRPIEALRQLLDTWLQQHG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of a putative protein disulfide isomerase from Nitrosomonas europaea
rcsb
molecule keywords Hypothetical protein
molecule tags Isomerase
source organism Nitrosomonas europaea
total genus 63
structure length 204
sequence length 208
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-10-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.472.60 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Cyclin A; domain 1 putative protein disulfide isomerase domain 2in3A02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2in3A01
2PPTA 5CNWA 5J9BA 5KN3A 1G6WA 1SKSB 1W4VA 3TJKA 4AJ7A 2KP2A 5ABRA 3GFKA 3H79A 4HOJA 4TKYA 2NVLA 1A8LA 5G1KA 5ECKB 5EPFA 5A4VA 2RLIA 2YV7A 2AUVA 1ST9A 2CZ3A 4KGIA 1HNCA 3DD3A 4G10A 1ZZYA 2VD0A 8GSSA 9GSSA 1YF1A 4PNGA 4BA7A 1EEMA 2DIZA 4EDZA 4ECCA 3KD0A 2LRCA 2O8VB 5AGYA 2VL2A 3HJPA 4MZBA 1AQXA 4HU9A 4V2MA 1B9XC 2REMA 4L8EA 3D4MA 4Z7XA 2HSHA 1PSQA 4PUFC 3CBUA 3FY7A 2PERA 2N5AA 3UOMA 2X8HA 2P5RA 1URMA 1QK8A 4RI7A 4ZBDA 2IMFA 1T8EB 4HZ2A 4IP6A 4HDEA 5A4WA 5DQSA 2B7JA 1SL2B 6GSXA 2GSTA 1ZYEA 3F8UA 2O89A 1AXDA 2X8CA 4TOPA 3IAM2 3IC4A 3LEFA 4PURA 1Z5YE 1JFUA 3CRTA 1R5AA 4L0UA 4XHMA 4O5RA 5ECMB 2FY6A 3TKSE 3TKRA 2C3TA 4PGTA 1OC9B 1T4ZA 2AYTA 3H4KA 1ZL9A 2C8UA 4WR4A 3GYKA 3TJJA 2OE0A 3CTGA 1A2MA 3TGZA 3GKKA 2MBTA 1X5CA 1U3IA 2JL4A 2IIYA 1A2LA 3UEMA 1TKDB 3F6FA 3GH9A 1SENA 4ML6A 10GSA 1AIUA 1SJZA 2IPAA 3TOTA 2GT6A 3W8JA 5FT3A 3VK9A 3VWUA 1H4OA 2LKUA 1R5PA 5GZZB 3TOUA 5IPHA 1K3OA 1FVKA 2K8VA 1V40A 1YEPA 4XCSA 2LS5A 1WJKA 4WF4A 5HR2A 2A2RA 4F03A 3EMXA 1GWCA 3KIJA 4BVXA 3L4NA 1XWAA 2YNXA 2PU9C 2WFCA 4XS6A 2C0GA 4IELA 1SK0A 4RUVA 1V2AA 3KTLA 4WF5A 3TJGA 2H30A 16GSA 1EP8A 3O76A 2YCDA 5F07A 1M99A 4F2IA 6GSWA 4MLYA 1A0FA 4CHSA 2TRXA 5F0GA 5H5QA 1TW9A 1I5GA 2X64A 2JSZA 2GSRA 1FOVA 1IYIA 3LJRA 2HZFA 2VCQA 1PGTA 1QQ2A 2YWNA 1SL1B 1U6TA 1ZYQB 1GSQA 2DMLA 3VI5A 1B4QA 4DSSB 3LYPA 4ECJA 4L0WA 1TK0B 4IP1A 3VWWA 5B6MA 4EC0A 3TKSA 3GL5A 2NTOA 2FA4A 3FYGA 4TVEA 4Q5RA 1J08A 4I2UA 2FGXA 3F4TA 5ECHB 2K18A 4I5QA 2NDOA 1B8XA 2QC7A 1U3AA 3O3TA 1NM3A 3BBYA 5ECOB 5KN0A 2HZEB 5IMDA 1G6YA 3SBCA 5GAND 1DE1A 3I6AA 1NSWA 2DJ2A 2VLVA 4HZ4A 1K0NA 2GS3A 3MNGA 1BJXA 3CSIA 2VL3A 2A4VA 2H1GA 4K7IA 2BTOT 4ULXA 5ECIB 2FD3A 5CRWA 1X9WB 1OAZA 1C72A 1EV9A 1FG4A 3G7JA 5J9CA 3IAS2 1XPVA 1HD2A 3GH6A 4P3YB 2WCIA 5INYA 2I4AA 5IM9A 3ZTLA 1PX7A 3O6TA 1XVWA 1Z7RA 4AGSA 1O85A 4KDXA 4X43A 3CRUA 2MMZA 2AJQB 3GUSA 1IYHA 1OC9A 2VM1A 1FAAA 3QAVA 4EUYA 3JCML 4KSMA 4JE1A 3WYWA 5F05A 1MEKA 2H6XA 3ZITA 3M1GA 2HRNA 3A2WA 4MA9A 3GA4A 3TKPA 4MH3A 4F82A 4MCUA 3RHBA 4YH2A 3LG6A 4FYBA 3FK8A 2H74A 4MH2A 4TRXA 3F6DA 5J41A 3W6GA 3ED3A 2WDUA 1TOFA 4O7HA 4IJ3A 5DDLA 1SKRB 2LEGA 2I81A 3CYNA 2YJ7A 3G7YA 1TJDA 2H19A 2Z9SA 4V1Ap 4NWYA 4MP4A 2VIMA 1XW6A 3NOFA 4K8MA 2X99A 5J4UA 5ELAA 4RQXA 4TXVA 2YN1A 1QUWA 2H01A 5JWQB 4TW5A 4EF0A 3APSA 4HQSA 3IV4A 5AISA 1HNBA 3VWXA 2DJ3A 3MSZA 1WMJA 4K1FA 1LU4A 4N11A 5HFGA 4KDUA 3UVTA 2E0QA 1THXA 2LNSA 5D73A 3CTFA 3PGTA 2V6KA 3F63A 4XIHA 5IMZA 2WZ9A 4AJ8A 4I8BA 3VURA 2CX3A 2FUG2 1PKZA 1SU9A 3HCZA 3RPNA 1AQWA 3GIXA 4DSSA 3DMLA 4CDOA 2YV9A 3ISOA 4WXTA 2H72A 3P2AA 5DAKB 2N5FA 2ZNMA 3TJFA 2JADA 2I9HA 3IDVA 3PR8A 3FHKA 2H71A 3ZFBA 4YQVA 4K0NA 4LMWA 2V41A 3KH7A 4ML1A 3QFAC 1XZOA 3IE3A 2B5EA 3M8NA 5G30A 14GSA 2GZZA 2HZEA 4JBBA 2OBIA 3QD9A 4F0BA 3KEBA 1R26A 3ME8A 3MAKA 5COHA 4JZQA 1GTUA 2B5YA 5ECLB 2PUKC 2VCZA 3ZMKA 4I97A 1QFNA 3IXRA 2OBKA 3FW2A 2FWGA 2DIYA 3HVVA 3D6IA 1FO5A 3I69A 1VF1A 4ZBAA 2H0IA 2X8GA 2GZYA 2CVDA 3EINA 3ZMLA 4XTSA 1GSEA 3APQA 3APOA 1PD21 2CAQA 4QQ7A 2ON7A 4O32A 3VI7A 5G5FA 3VPTA 5LD0A 3EE2A 1ERVA 17GSA 3FZ5A 4FYCA 4XS4B 3P8WA 2JU5A 4PNFA 3F3RA 4MF7A 2ZCTA 3C1RA 3E0UA 1ILOA 1XCCA 3GL3A 2BJXA 4ZL8A 3DVXA 1ZMAA 4ZB8A 1GULA 3NZNA 5B6NA 2LJKA 5D9WA 1B48A 3D5JA 2CVBA 5HFKA 2GQLA 2JZRA 3A2VA 1NHOA 2O7KA 5HR1A 1E2YA 2EIOA 2F3MA 1YJ6A 3F4SA 2DC5A 3ZVJA 3FZ9A 2D2ZA 4KCAA 5IO0A 2CAIA 4MZCA 2OJLA 3FKFA 3GHAA 3WGEA 5IMVA 4WEYA 2H1AA 4G19A 2R37A 4HU7A 2JACA 3HY2A 1PKWA 1S3AA 1FVJA 2FHEA 1YY7A 2VL9A 3HVSA 2XBIA 1JLWA 4YAPA 1BEDA 1A24A 4TXOB 3IBHA 1WIKA 2YJHA 2IFQB 1BYEA 2HRFA 3J7Yk 2E2GA 3KMOA 2HLSA 3LXTA 1GUHA 1K0MA 3GKMA 4TR1B 3DEXA 2GLRA 2GQMA 1AQVA 1ACVA 1M0UA 2GDRA 2VUPA 2HSYA 3HYPA 3QPMA 4NMUA 1X5DA 2L5LA 1O73A 2DJJA 2YANA 1J0FA 2FWHA 3TRQA 5CREA 2B3SA 3H8QA 4PQHA 5DBQA 2NBSA 3K8NA 5DAKA 5C04A 4GSTA 4L5LA 1FW1A 4OFNA 1M9BA 4O92A 2VL2C 3DYRA 3TRXA 4KSOA 4EKZA 4WBRD 5ENUA 1TRVA 1VGLA 1U87A 1T00A 4OFTA 4LL4B 2P31A 4HS1A 1Z7PA 2IJYA 4LA1A 1OKDA 5B8BA 4NXIA 1Z9HA 4EL1A 4MPGA 3FZAA 2C3NA 4NPBA 2G0FA 5DQYA 2AB6A 1GNEA 1M2AA 3GNJA 4IKHA 1T3BA 1V58A 1LJRA 2OA7A 2N5BA 5LNKe 2FA8A 1PL2A 5CYYA 4V1Ag 3L78A 1DE2A 4K9ZA 1YKAA 1V57A 5L71A 2J23A 4EO3A 2GVPA 1GSSA 3HKRA 1O6JA 2IMEA 4AJ6A 4GXZA 5A5KA 4XS4A 1RW1A 1VF3A 3ERWA 2PN8A 3GSSA 2EC4A 2R2JA 2MMAA 4JR4A 3FRCA 1GTIA 2B6MA 3EVIA 4KB3A 3RBTA 1THOA 4OMVA 4N0ZA 3BD2A 2NPBA 1F3AA 2VOCA 3EURA 5G5EA 4JRRA 2OE1A 3NIVA 2F9SA 4QL7A 2KOKA 1SKWB 1MDIA 3KJYA 4MMMA 2MZCA 2LTKA 3BCIA 3SWLA 2VCWA 1Y6EA 2C80A 3F0IA 4KUNA 2ALBA 5B7CA 3FZ4A 1XW9A 3PH9A 1NW2A 1SYXA 2YP6A 4Q5NA 4EDYA 1WE0A 1HQOA 3HJOA 2FNOA 1XXUA 1GUMA 4OFMA 2HE3A 3KTBA 3IR4A 4F9ZA 1GL8A 1MDKA 1Z6NA 4WKWA 3HHVA 4LMVA 3C7MA 5KN1A 4XRAA 1GSUA 3OR5A 2QGVA 5HR0A 4ACSA 1AW9A 1M2DA 5CRGA 4TXOA 2MBSA 1EWXA 4IW9A 5AN1A 4D73A 2R5GA 5IO2A 2H66A 2IFQA 1ERTA 4DSRA 2JZTA 1MD4A 1X0RA 3KZQA 4QL9A 2VLTA 3E9JB 2QSIA 2LV3A 4MDCA 1HNAA 4GQFA 2WB9A 3WGXA 2EIQA 4MF6A 3Q19A 4POLA 4ZILA 4FH8A 1SK1A 4IHUA 1TP9A 4TR1A 3RAZA 3CXGA 1Y25A 3I9V2 1S3CA 2GQKA 1X5EA 5IMFA 2AHEA 3M9JA 2FWEA 2R3XA 4ZL7A 3TKSC 3A3TA 5G1LA 1E6BA 2LRNA 5D8IA 1XIYA 3PINA 3C71A 1FB0A 2F8AA 3ZREA 3QMXA 2YWOA 1FHEA 18GSA 1DUGA 4GQCA 3ERFA 2H6ZA 2O85A 5DCHA 1UVZA 5F06A 5IOWA 3ZL5A 3QOUA 2M46A 1TI3A 5ECQB 2YOIA 1K0BA 1F2EA 3C8EA 2DBCA 2AV4A 4OO4A 1SD9A 3ZIVA 1JZWA 5JWOB 4PUAA 4E8HA 3EWLA 2C0EA 1CQGA 4BL7A 5ECSA 1XBSA 3ZLPA 4EE0A 4KW6A 5CRHA 5DJMA 3FR6A 3KP9A 2V2GA 3CSHA 3HJMA 2F51A 2IMDA 5H5SA 4MPFA 2H73A 5A4UA 3C73A 1RQMA 1N8JA 1GP1A 1VRSD 4BPYA 4ECIA 1SD8A 1KTEA 6GSTA 3GMFA 3HXSA 3IPZA 1A0RP 1Q4JA 2LJAA 2DJ1A 2H1DA 3V1WA 2OACA 1QGVA 20GSA 2IWTA 5KEJA 1PRXA 2TRCP 1XW5A 3M3MA 2YZUA 3S9FA 2L4CA 3GN3A 4KE3A 3I43A 3ZVJD 5ECPB 4I2TA 2J9HA 3D22A 2V6OA 2DSAA 4NHZA 2IN3A 4FIWA 4KAEA 4MF5A 3RPPA 5D96A 1XOBA 3W8SA 3IHQA 2E2MA 3DKSA 3IK9A 5LCZA 4JEDA 2ES7A 4ECBA 3GV1A 1WWJA 12GSA 3QR6A 3J7Yb 2K8SA 3TCOA 3DIEA 1XWCA 2VD1A 3P90A 2KLXA 2LRTA 2L6DA 3UAPA 3UBKA 3GRXA 4G2EA 1ML6A 3GX8A 5EL8A 1HYUA 3HZ4A 3BCKA 1VF2A 4J57E 5GSSA 3CSJA 2HI7A 2LQQA 1TRUA 5FHIA 5IIZA 3G7IA 5IMAA 3N5OA 2LNTA 3US3A 1EGOA 2VM2A 3L0HA 1GTBA 1M7TA 2H0HA 2P0GA 2PMTA 4WBJA 3KMNA 2VAFA 3HDCA 3KGKA 2H8LA 2E7PA 5JCUA 2BMXA 3ZIJA 2KP1A 2R4VA 4NHWA 2IL3A 3WT1A 2HFDA 2O87A 2CA8A 6GSVA 2ON5A 4Q5QA 1TK8B 4H86A 2HXKA 1G7OA 1UA5A 4MJEA 2B1KA 5AIXA 5ECNB 4IN0A 5EY6A 4F0CA 5ID2B 2XBQA 4GLTA 4K0GA 2QKEA 1X9SB 3U5RE 1JHBA 1AC1A 3Q6OA 3E3EA 2C1YA 3LXZA 2GT5A 5D93A 1TU8A 1R4WA 1XVQA 1YQ1A 1GSDA 1EOGA 2WGRA 3FR3A 4ISDA 1SJIA 2ZUPA 1YDKA 5CP1A 3HA9A 3ZFLA 1F6MC 1EOHA 3LYKA 1W89A 1H75A 2K9FA 1WOUA 4DEJA 3ERGA 1BAYA 1OC3A 2M80A 1XOAA 4NAXA 1TRWA 1YF0A 1BX9A 4AF2A 3ZZXA 2XHFA 5G2ZA 4IQAA 1PA3A 2DMMA 1G7EA 3H93A 2YWIA 2XC2A 4EXJA 4D73B 1A2JA 1ZOFA 4ZL9A 1ERUA 3BJ5A 3ZYWA 1FB6A 3HVXA 4ID0A 2RM6A 4OD7A 2LUSA 2PVOC 1K3LA 4TN8A 3M9KA 1X9MB 2LQOA 2V1MA 3DRNA 2PBJA 5F8BA 3MDKA 2C3QA 1PQNA 1PL1A 3U6VA 2LSTA 2YWMA 3LWAA 5J5NA 1K3YA 1JZDA 2C4JA 2DJKA 3QAWA 5D9TA 1SYRA 3HZ8A 1XWKA 1YZXA 1Z6MA 1VF4A 4HJMA 2CVKA 4IVFA 1TK5B 4MABA 2H1BA 13GSA 3L9VA 3GKXA 4OCFA 1B4PA 1TDIA 3TRPA 1R7HA 2OADA 1F3BA 3A2XA 5HR3A 5CRDA 1NHYA 2I3YA 7GSSA 1U88A 2HNLA 4G9HA 4POBA 1PN9A 2PVQA 3EMPA 1MTCA 2L57A 4MJAA 1RK4A 1O7UA 3IRAA 1AAZA 4ZB6A 4IQ1A 2MMNA 5AIVA 2B1LA 2C0FA 3FR9A 2H75A 2K6VA 2A2SA 3EU3A 4GSNA 1V98A 4JR6A 4OWYA 2CX4A 1TXXA 1V9WA 5DCGA 3UARA 4MZWA 2F8FA 4K7OA 1ZCPA 6GSYA 1LBKA 4N30A 3MWHA 1XFLA 4L5OA 4MJCA 2XPEA 1G0TA 1O8XA 2RM5A 4FO5A 3KCMA 4HQZA 5IOXA 3VFIA 1TTZA 4GTUA 2AAWA 2CZ2A 1N2AA 1JZOA 1F9MA 4LLRA 2DLXA 3KH9A 3Q74A 3VPQA 3C1SA 1BQ7A 3GTUA 4FYUA 5ID2A 3TUEA 2FWFA 1AUCA 3VLNA 1KEBA 3GX0A 4IBPA 4ZB9A 2VCXA 3BOAA 4ILFA 3QDNA 2RUFA 4OO5A 3L9UA 2B7KA 3ZRDA 2VLUA 1GLPA 2H70A 4IJIA 5E59A 5CAXA 4N0VA 3UIWA 4YQMA 3EYTA 4X1UA 2OKAA 1USBA 2H6YA 4K6XA 5DJLA 3LFLA 1J9BA 1XWBA 4KH7A 4GCIA 1M2BA 2GSSA 2RUEA 4V2NA 2JSYA 4POMA 4GSSA 1JLVA 4MK3A 4IGJA 1TU7A 4KDYA 1ERWA 3M0FA 4TR3A 1A8YA 5E4WA 5DVBA 1K0AA 4J56E 1OE7A 4JU5A 2H76A 3A5WA 2L5OA 1O81A 4GWRA 5IMCA 4WETA 3DWVA 3TDGA 3GURA 2LJRA 2HT9A 2EIRA 2I1UA 3WD6A 3Q18A 3G9BA 2GSQA 1ON4A 2WULA 4HI7A 2GZPA 5D9XA 3RHCA 3TKQA 1Z3EA 4CW9A 1YEXA 1CQHA 4OCEA 1GH2A 3F4RA 4WR5A 3VWVA 3TJBA 5FWGA 1OKTA 1M9AA 4HJ2A 1PX6A 2L59A 3QCPA 2VO4A 3IOSA 4XS1A 5J3RA 5HFIA 1DSBA 1OYJA 2L4QA 3AY8A 2WJUA 3LSZA 4PQ1A 3UBLA 5DALB 1KNGA 1UN2A 3F9UA 1KBNA 4KCEA 5GAPD 3QFBC 2GGTA 1T4YA 5G31A 3DVWA 3RDWA 1EP7A 2PWJA 1EEJA 4GRFA 3WT2A 1ZGNA 3UVHA 5ECRB 2CV4A 4I6XA 2P5QA 3L9SA 2YPMA 2YZHA 3LGCA 3TB2A 5B8AA 2WS2A 4DSQA 2JZSA 1EZKA 5EVOA 2B5XA 1MD3A 2MMOA 4BVYA 4Q5FA 1ABAA 3UMAA 1K0DA 4TR4A 3N9JA 3DXBA 3F3QA 1OVNA 4PX1A 1EGRA 4KX4A 4KNDA 4BWSA 2FLSA 3FEUA 4DVCA 1SK2A 3UJ1A 1UC7A 1QMVA 4V2LA 3LORA 4KA0A 1SL0B 4K2DA 2GTUA 1Q98A 3WGDA 2IMKA 1S3DA 3DGQA 5IQYA 3GSTA 1GLQA 1GRXA 1F37A 3QAGA 5KN2A 2OE3A 2WRTA 4HUAA 1T7PB 3EU4A 5CO3A 1QXHA 1B9YC 5ELGA 1TRSA 2VCVA 1WPIA 5HQPA 1I9DA 2L6CA 1YKCA 3IK7A 2CT6A 5JWRB 1K0CA 1TI1A 4LL1B 4PQIA 1MDJA 1T1VA 3D4TA 4K7NA 4GF0A 3P7XA 4PXOA 4EVMA 1BG5A 3KP8A 3EC3A 4N10A 2C0DA 1GNWA 1GTAA 1GSFA 4TR0A 2G2QA 2VCTA 19GSA 3H1NA 2H0GA 1A23A 2V32A 1PMTA 2R6KA 2XPDA 2FCHA 4BWQA 4RI6A 3KXOA 1OE8A 1WP0A 3R2QA 6GSSA 2TIRA 4NV5A 2PGTA 4ZXGA 2MYGA 1WRYA 3LQ7A 2HYXA 4NV2A 4ZIJA 3UL3A 4E8EA 3HD5A 5C00A 4XRDA 5IPGA 4MJBA 5D9VA 1JZRA 2DJ0A 1K0OA 1EV4A 22GSA 2KHPA 4IS0A 4HEA2 3CMIA 5JCWA 4YQUA 3D21A 4YAVA 4ZBBA 1OC8A 3IA1A 2CQ9A 1SJ6A 1O8WA 5GSTA 5JCGA 3D0ZA 6GSUA 4RQRA 11GSA 2RIIA 4POKA 1XWGA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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