1QUTA

The soluble lytic transglycosylase slt35 from escherichia coli in complex with n-acetylglucosamine
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
sequence length
322
structure length
312
Chain Sequence
MVEPQHNVMQMGGDFANNPNAQQFIDKMVNKHGFDRQQLQEILSQAKRLDSVLRLMDNQGPNGAWLRYRKKFITPDNVQNGVVFWNQYEDALNRAWQVYGVPPEIIVGIIGVETRWGRVMGKTRILDALATLSFNYPRRAEYFSGELETFLLMARDEQDDPLNLKGSFAGAMGYGQFMPSSYKQYAVDFSGDGHINLWDPVDAIGSVANYFKAHGWVKGDQVAVMANGQAPGLPNGFKTKYSISQLAAAGLTPQQPLGNHQQASLLRLDVGTGYQYWYGLPNFYTITRYNHSTHYAMAVWQLGQAVALARVQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of Escherichia coli lytic transglycosylase Slt35 reveals a lysozyme-like catalytic domain with an EF-hand.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Escherichia coli
molecule keywords LYTIC MUREIN TRANSGLYCOSYLASE B
total genus 108
structure length 312
sequence length 322
ec nomenclature ec 4.2.2.n1: Peptidoglycan lytic exotransglycosylase.
pdb deposition date 1999-07-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13406 SLT_2 Transglycosylase SLT domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.8.350 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Helicase, Ruva Protein; domain 3 Bacterial muramidase 1qutA01
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1qutA02
4M6DA 4MSTA 1GDWA 3LYMA 1IY3A 4OWAA 3WUAA 5LVKA 4HV1A 3HBEX 2I25L 3EXDA 5E4PA 4NSJA 3WYHA 1B7RA 4NGWA 1NDMC 4EMNA 1NF5A 1JITA 1LCNA 5C6LA 4RLNA 1IP6A 1WTMA 1UIGA 5IHGA 5B06A 1JIYA 4BADA 1NQIA 5KXKA 1WQPA 6LYZA 1OUGA 4ETDA 4PRUA 4WO9A 1IOQA 1H6MA 1DZBX 1QTEA 2F30A 4GCFA 1IO5A 4NSHA 4NY5A 4DD7A 1BQLY 3AW6A 5LYTA 4H9FA 4NHIA 1E8LA 1GBSA 1H87A 1YQVY 5LA5A 3A91A 1LMNA 1TAYA 2HUBA 1GFHA 1IP4A 3AW7A 2C8PA 4H90A 4H8XA 3J6KA 4NHTA 3TXDA 5KXTA 1LHMA 2Z12A 4CFOA 3LN2A 1W08A 1OUDA 1MELL 4PGJB 1LZCA 1LZSA 3T36A 2D4JA 4NGKA 1B2KA 3LYZA 2IFFY 5FHWA 5C6JA 4DD3A 4MCKA 3CSQA 4B49A 3ATNA 1HFZA 1QIOA 2XJWA 1GD6A 1GE4A 5FSTA 4UWVA 1UIBA 3OJPA 4QY9A 2MEEA 1JTOL 4CJ2A 2MEHA 1HEMA 3WH1A 4BAPA 3P65A 3K3TA 135LA 4N9RA 2ZNWY 2Z2EA 5ILCA 1JPOA 4I8SA 3WVYA 1LYZA 4B0DA 4XN6A 4ET8A 1LSGA 1QUSA 1LKRA 2LYOA 4NGZA 1JSEA 3W6FA 2F2NA 2DQEY 1LSZA 1OUFA 4ETEA 1GBYA 5KY1A 3WPLA 1HEPA 4UWNA 5I4YA 4H9CA 1JKBA 3AGHA 5I4XA 4XJIA 4LT0A 5HNCA 4U3XB 1HMLA 8LYZA 3AZ6A 1LKSA 4LGKA 1G7HC 4WL6A 4NIJA 1IOCA 1BB6A 1FLQA 1D9UA 1LZEA 5B07A 1LYOA 1SQ2L 4WM2A 4WM1A 4J0LA 4ETCA 4B4IA 1BVXA 1LJGA 4NSGA 1LSCA 1BB5A 1LMAA 1CJ7A 4XJDA 1LZGA 4NHQA 2BQOA 3ZVQB 1VEDA 1IWTA 1TCYA 1CKHA 2D91A 2H9JA 3EO5A 4OWBA 4G4CA 5LVGA 1YILA 134LA 3GXKA 1OP9B 2BQNA 5HLLA 1EQEA 1LZNA 1CJ8A 2I6ZA 1WQMA 1B7PA 3CSRA 2YBLA 2EPEA 1LZ9A 1VDSA 1CKCA 2MEBA 1GFVA 4DDCA 4RW2A 2BQMA 1UIDA 1GFJA 1JJ0A 1W6ZA 1PZYA 2GV0A 1IC4Y 4DD1A 1B7QA 2ZNXY 2IHLA 3SP3A 1LJEA 4LYBA 1LOZA 3G3BB 1BB3A 1NBYC 3HBHA 4TX7A 4NGYA 4QGZA 4WMGA 3WVXA 1RE2A 1LZ5A 4OOTA 1IEEA 1LHHA 2DKVA 1OUAA 2BQBA 4ANRA 1IC7Y 2YSSC 3N9AA 1GXXA 4LFPA 4N1EI 1NDGC 1KXYA 1FLUA 5B05A 1LJHA 4H1PA 1WQRA 1AZFA 5AMYA 3TXJA 3W6BA 1QSWA 2BQHA 4BAFA 4XADA 1ZMYL 1HF4A 4OWCA 5APFA 1BWIA 2G4PA 5DN5A 3QNGA 1IWVA 1CKDA 4WLYA 1AT5A 1GF8A 1HMKA 1WQNA 3LZ2A 1B9OA 3TMXA 1B5WA 3WPJA 4D9ZA 1AKIA 3LZTA 3TXKA 4KPMA 1XSFA 3QE8A 3WUNA 3WXUA 5DL9A 1C45A 1JHLA 1GF9A 1JSFA 2EKSC 3AYQA 4AXTA 1LSPA 1HEQA 3IWRA 4XJBA 4KL7A 3A6CY 3D3DA 4FDYA 2C8OA 1G7LC 1V7TA 4GN5C 4XJHA 4YOPA 5L9JA 1CKGA 1J1OY 1IX0A 4CFPA 2LZTA 1D6QA 3CB7A 3A94A 1LTMA 2ZIJA 1WVVA 3LYOA 208LA 2ZYPA 1IORA 3KAMA 1GFAA 1QDTA 1QTKA 1UACY 3RW8A 1A4VA 1JJ3A 4YEOA 1XEKA 1GE0A 4J1BA 5IELA 1B7MA 1GHLA 3EBAB 5APCA 2MEIA 3OK0A 2BLYA 2D6BA 2BQFA 4O34A 1IWZA 4W94A 1GBOA 4DD9A 1C10A 3FI7A 2ZILA 3MGWA 1NMMA 4H94A 4II8A 4IJ4A 4RDSA 4Z46A 1IP7A 2Y8PA 1FBIX 1GBXA 1B5XA 1C7PA 4N8ZA 4QDNA 1GBWA 3FE0A 2HU1A 5F9XA 1BB7A 4NG1A 5KXYA 3BKVA 1IP3A 1REXA 4E3UA 1HSWA 2BQIA 5A3EA 1JKAA 2EQLA 3WPKA 1LZBA 4HPIA 4HTKA 4WG1A 1TBYA 1REMA 3WW6A 1LSFA 1YAQA 3A67Y 3AJNA 3EMSA 4DWXA 4C3WA 5HQ1A 1QSAA 2BQEA 3ZEKA 4HJYA 2A7DA 4GCEA 4GCBA 4IATA 1IR8A 3IJUA 4AGAA 2W1XA 1LSYA 1IOSA 1J1PY 4NWHA 5I54A 3QY4A 1LMTA 3P68A 1REZA 5K7OA 1HFYA 1F6RA 5LVJA 1LJ3A 5II3A 1CNSA 2Q0MX 5APDA 1DI4A 4CHXA 1IWWA 2F4AA 1GF3A 1TDYA 1P2CC 3TXGA 2Z39A 4NGOA 5LA8A 1LSNA 2HU3A 1LZ8A 4Z41A 3HBDA 4N1CC 4PPOA 1NHEA 5B1FA 4L41A 4DD0A 4LT3A 3N9EA 4ZEEA 1DPXA 1B7SA 1OQMA 1YKXX 1FN5A 1KXXA 1GB0A 1HC0A 3CT1A 4KT3A 4NSIA 2FYDA 5KXLA 3A8ZA 1LJFA 1GB5A 1WTNA 9LYZA 1GF5A 2HECA 1GB7A 4WM3A 2LYZA 3N9CA 2G4QA 4PHIA 3TXFA 3WUMA 2HTXA 1GF4A 3VWOA 4EOFA 1GEZA 1YL0X 2DQAA 3WU9A 4LZTA 3RNXA 4HSFA 5LAGA 5LXWA 1GB8A 3A90A 4B1AA 1F10A 1YKYX 5HMVA 1GB3A 1WQQA 2MEDA 194LA 1JKCA 1C43A 3A93A 4YM8A 1GFTA 1V7SA 2BQCA 1GEVA 1RJCB 1J1XY 1GFKA 1UCOA 3B0IA 1FLWA 4NG8A 1GXV2 4WOAA 2A7FA 4NHSA 4DD2A 1NWGA 5M1YA 1LZ4A 2DQFC 1BWHA 2YBJA 1D0MA 2FYCA 2H5ZA 3GXRA 4XYYA 5HMJA 5B1GA 5F9UA 5KXXA 4ML7A 1INUA 3A3RX 5DLAA 1GAYA 4J1AA 1IOTA 1B5ZA 3W6EA 1LHJA 1FKQA 4DC4A 5LYMA 1GPQC 2XBRA 5LVIA 5D5FA 3T6UA 4G49A 1OUEA 4GLVA 1GDXA 1YROA 2AUBA 4WM4A 3TMWA 3W3EA 1GFUA 4HJVA 4WG7A 5KXMA 4BS7A 1GWDA 1KIQC 1ZV5L 1HENA 1IY4A 1LZYA 1FDLY 1YANA 1TEWA 3LHMA 4LYMA 1JJ1A 1AM7A 1LHKA 5APEA 3A34A 3P4ZA 4NFVA 1LZ1A 4ZFPA 1HSXA 1B0DA 4H93A 4FJRA 3WW5A 1YIKA 2RSCA 133LA 153LA 1VFBC 193LA 2BQJA 1LMQA 3P64A 4GLAA 3BKHA 1C46A 1GFEA 1LMPA 1GFRA 3B6LA 4HTNA 4XJFA 1GBZA 1REYA 2BQDA 4H9IA 1ZVYB 5A3ZA 4NGJA 1LSEA 3J4GA 1ALCA 3G3AB 1N4FA 3WU8A 4YEMA 1B7NA 4HTQA 1PS5A 1DPWA 1GAZA 3TMUA 1GE1A 4NEBA 1DQJC 2H9KA 1G7MC 4NGLA 3RT5X 7LYZA 1IVMA 1UC0A 2EIZC 5KXNA 1GFGA 2X0AA 3WL2A 1UA6Y 1JKDA 3ZVQA 2D4IA 2ZQ3A 1BWJA 4RLMA 2Z37A 2VB1A 2HEEA 1IWUA 1LZ6A 4LYTA 1IWXA 2BAAA 5JENB 4C5FA 1GB6A 1EQ5A 1YAMA 2WARA 4OWEA 5DN4A 5LYZA 4NGIA 3D9AC 4P2EA 1QQYA 2BPUA 1RFPA 132LA 1B5VA 1DKJA 2HEFA 2NWDX 4HV2A 4TSBA 2BQAA 1LMCA 4GCDA 2PC2A 2ZIKA 3WMKA 5F16A 1LSAA 4DDAA 2HEAA 2YVBA 4LFXA 3W6CA 3ATOA 1D0LA 2YBNA 1I20A 2W1MA 3AZ5A 2Z2FA 4X3BA 2DQGY 5KKJA 3LYTA 5L3IA 1EQ4A 2DQDY 4NWEA 3AZ4A 1LHIA 3B0OA 2ZQ4A 5ILFA 4M4OA 4N5RA 2YBIA 1AT6A 2DQIY 4PJ2C 2FBBA 4N0JA 1QUTA 2W1YA 3CT5A 2D4KA 4WM5A 3TXBA 4KXIA 4A7DA 1XGTC 1O23A 1DXJA 3M18B 5LVHA 1XEIA 2G4NA 3F6ZA 4MR1A 1GF6A 3A3QA 1XGUC 1LZTA 3HFMY 4OWHA 6LYTA 1DI5A 4H8ZA 2FBDA 4B4EA 1NBZC 1UIEA 1XGQC 1F0WA 1IR7A 1T6VL 1YAPA 1BHZA 2YBHA 3AZ7A 5E9RA 1JWRA 3WXTA 5HNLA 1HELA 2HEBA 1LJIA 1WVUA 2XBSA 4XENA 3TMVA 1B7LA 1BVKC 1HERA 4DDBA 1B5YA 1OUBA 1I56A 5I5QA 1A2YC 5KJ9A 4WLTA 3TXEA 1JTPL 1LYYA 2MEAA 2BQGA 2LHMA 3AB6A 4NHPA 4IASA 5EBHA 5FDJA 2B5ZA 4WLXA 3W6DA 5C6IA 4G4HA 5LINA 3AGGG 2CJLA 1OUJA 4WL7A 3M3UA 5DM9A 2MEFA 5KXZA 4H8YA 1QDRA 4WLDA 2F4GA 4LYCA 1LPIA 5J7CA 1SLYA 3RU5A 1UIFA 2DQHY 4PRQA 3IJVA 1OUIA 2LYMA 1UBZA 4DYGA 4CGEA 1GB9A 3TXHA 1G7JC 4YF2A 1VATA 5FELA 4Z98A 1BGIA 1KIPC 1LHLA 2Z19A 2Z18A 4YENA 5KXRA 1LSBA 3CQLA 4H91A 4TTDA 1LSMA 3B72A 4GN4A 5L3HA 1UICA 2I26L 4H9BA 5KXOA 4R0FA 1IIZA 1XEJA 4H9HA 1XGPC 2CGIA 2YDGA 1IP5A 3AGIA 1VDPA 1B7OA 1LZRA 2CWIA 207LA 1Z55A 5LAFA 1UUZC 1B5UA 1YAOA 3TXIA 4LT2A 1IP2A 4WO6A 4G4BA 2N5ZA 4LYZA 1BB4A 1LMOA 2XTHA 5LIOA 3W6AA 1VDQA 1D0KA 3B0KA 1UIAA 1VAUA 5I4WA 1OUHA 5I53A 1GE3A 1RI8B 154LA 1JISA 1HEWA 1VDTA 4GN3A 5KXPA 1CJ9A 4H9AA 1HNLA 1ZVHL 3A95A 1WQOA 2W1LA 3WULA 1FKVA 3A92A 1DI3A 1GB2A 3A96A 1GF0A 1YKZX 1T3PA 2BLXA 1LZDA 4ETBA 2DQJY 1F6SA 4OOOA 1LJNA 5KKIA 1DKKA 4ZIXA 1GE2A 5F81A 1HEOA 4I0CA 2HEDA 1JEFA 1OUCA 4Z3MA 5FCPA 5B59A 4DT3A 3WU7A 1NKHA 1IWYA 4QEQA 2DQCY 5F14A 3P66A 4J7VA 1KIRC 1LJJA 4TSCA 1RCMA 2LZ2A 2MEGA 1JTTL 3ULRA 4B4JA 1KXWA 1LYSA 1IR9A 1YL1X 4ET9A 1C08C 1I1ZA 1HHLA 1UIHA 2BQKA 4GCCA 4H92A 2CDSA 1G7IC 5IDDA 1GF7A 2YBMA 3A6BY 4NGVA 4HP0A 4WM6A 1LSDA 1XGRC 1XFPL 5KXWA 2DBTA 4UWUA 5T3FA 1CKFA 4OW1A 1LAAA 5KXSA 3CT0A 3RZ4A 4G9SA 1LZAA 2MECA 1LJ4A 4LYOA 2ZWBA 1EL1A 2ZYCA 2BQLA 1IP1A 4R6CA 4W96A 4RW1A 4TUNA 1CJ6A 1MLCE 1HFXA 1JUGA 1LJKA 1IC5Y 3E3DA 5FEKA 4ETAA 4HJZA 4HPEA 4TWSA 1D6PA 1FLYA 5D5CA 2Z38A 3CSZA 4H9EA 4LT1A 4XJGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1R4GA 2KNZA 4OWAA 3LYMA 1Z5CA 3I04M 1NDMC 2Z3XA 2LC9A 3L29A 4LF7M 1LCNA 1C6EA 4HEOA 4BADA 2NQ8C 3HY5A 2UXCM 4PRUA 152LA 4WO9A 2HULA 4GCFA 232LA 183LA 3AW6A 4H9FA 3PXGA 4W55A 178LA 1H87A 5LA5A 2F5SA 2C8PA 4NHTA 5KXTA 3TXDA 3SC3A 3V2WA 4IBGA 1MELL 201LA 1RU3A 3T36A 4NGKA 1B2KA 3VW7A 5C6JA 4DD3A 2XF3A 4B49A 4FCTA 246LA 2DWLA 6LZMA 5FSTA 4OO9A 1QUOA 1OVHA 2MEHA 1L08A 2JZ0A 1HEMA 3WH1A 3KW6A 1SXJD 2Z2EA 1L74A 2NTGA 2B72A 2O79A 5LMUM 4XN6A 4ET8A 3TPZA 2R6FA 1PQJA 3Q8GA 5KQ8A 4ETEA 5KY1A 3WPLA 3FUUA 4G4OA 2ZBKB 5I4XA 2YFQA 5HNCA 1HMLA 2L09A 1LKSA 240LA 1N32M 3GLGB 2KHHA 4NIJA 1BB6A 3DMZA 1LYOA 5BR8M 180LA 3J81S 1SQ2L 4WM1A 4FWHA 4J0LA 2HCBA 1BVXA 1BB5A 1LMAA 1L2BA 1Q39A 4I7TA 2QARC 4OWBA 3HTFA 4X62M 5F3WA 228LA 1EQEA 1LZNA 1CJ8A 3CSRA 248LA 1CKCA 4RW2A 1UIDA 1JJ0A 1PQMA 197LA 2DZOB 4JXJA 2ZNXY 2IHLA 171LA 1LJEA 1LOZA 1L48A 1L99A 1QVRA 3OTOM 1L67A 1QTBA 4NGYA 1RE2A 4OOTA 1LHHA 4DJHA 1OUAA 4PT5A 3FRIA 4FCWA 2O7AA 1ZMVA 5FTKA 2YSSC 3N9AA 1KXYA 1Q02A 1CV6A 3B7ZA 1FLUA 5B05A 5AMYA 243LA 1ZMYL 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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