1QUTA

The soluble lytic transglycosylase slt35 from escherichia coli in complex with n-acetylglucosamine
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
sequence length
322
structure length
312
Chain Sequence
MVEPQHNVMQMGGDFANNPNAQQFIDKMVNKHGFDRQQLQEILSQAKRLDSVLRLMDNQGPNGAWLRYRKKFITPDNVQNGVVFWNQYEDALNRAWQVYGVPPEIIVGIIGVETRWGRVMGKTRILDALATLSFNYPRRAEYFSGELETFLLMARDEQDDPLNLKGSFAGAMGYGQFMPSSYKQYAVDFSGDGHINLWDPVDAIGSVANYFKAHGWVKGDQVAVMANGQAPGLPNGFKTKYSISQLAAAGLTPQQPLGNHQQASLLRLDVGTGYQYWYGLPNFYTITRYNHSTHYAMAVWQLGQAVALARVQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structure of Escherichia coli lytic transglycosylase Slt35 reveals a lysozyme-like catalytic domain with an EF-hand.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LYTIC MUREIN TRANSGLYCOSYLASE B
molecule tags Hydrolase
source organism Escherichia coli
total genus 108
structure length 312
sequence length 322
ec nomenclature ec 4.2.2.n1: Peptidoglycan lytic exotransglycosylase.
pdb deposition date 1999-07-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13406 SLT_2 Transglycosylase SLT domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.8.350 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Helicase, Ruva Protein; domain 3 Bacterial muramidase 1qutA01
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1qutA02
1VDPA 3SP3A 3AZ7A 4NHTA 4OWHA 1LHKA 1NDMC 1IORA 3A67Y 1NF5A 5APFA 5I53A 2CJLA 1C08C 2BQIA 2F2NA 4TWSA 2W1MA 4FDYA 4PPOA 3WH1A 4HPIA 4H8ZA 5HNLA 3AZ6A 1WQMA 2Y8PA 1LKSA 2W1LA 4W96A 1HHLA 194LA 4H9CA 4BADA 1HFZA 1O23A 1GEZA 5II3A 2YBHA 5IDDA 1GFHA 3TXGA 1QTKA 2MEEA 3WULA 5KKJA 1LHJA 1CKHA 1YL0X 3QY4A 4NGWA 4DDAA 3A8ZA 3TXIA 1KXYA 1DXJA 5D5CA 3D3DA 1P2CC 1OP9B 2XJWA 4X3BA 3A95A 5LVJA 4B4JA 1JTTL 1G7IC 4DT3A 1BHZA 1LMPA 4II8A 1YL1X 2CDSA 4YM8A 1GE4A 4TSCA 1TBYA 1B9OA 1LCNA 1ZV5L 4L41A 5M1YA 5LAGA 1LYYA 1BVKC 3LHMA 3AW6A 1D6PA 1FLWA 2ZILA 1HC0A 4YF2A 1LZ8A 4XADA 1LPIA 1LHHA 1C46A 1DKJA 4NGIA 2BQFA 5HNCA 1JWRA 3ATNA 3OJPA 1C10A 2BQLA 5F81A 4WL6A 1LSEA 4GLVA 132LA 1WQPA 5DN4A 1IP3A 1LSZA 1B2KA 2ZNXY 4XENA 5LIOA 1GB7A 1GF8A 2AUBA 4HP0A 1RJCB 3FI7A 9LYZA 4RLNA 5KKIA 3W6CA 4XJHA 5JENB 1YKYX 4NGKA 1D0LA 1IOQA 1DI5A 3TXBA 1LZ5A 3FE0A 2YVBA 1QUTA 3P4ZA 6LYTA 1DPWA 5L3IA 4C3WA 5J7CA 1CNSA 4PJ2C 1RCMA 2CGIA 3G3AB 4WM4A 4ETDA 5KXKA 2HEDA 4GCDA 4Z41A 4MCKA 2BLXA 3B6LA 3G3BB 4B0DA 3CT0A 1XGTC 1H6MA 1ZVHL 4OWAA 1LSNA 1GF5A 4ZEEA 3W6FA 2MEAA 5DL9A 5B1GA 4CHXA 2ZNWY 1YAQA 4NGYA 1D0MA 1XGQC 1CKDA 1JUGA 4A7DA 1NMMA 5LXWA 4NHQA 1F6RA 1IOTA 2HECA 3TXKA 5KJ9A 3CB7A 1XEIA 5EBHA 3WU7A 1UICA 5C6IA 1AZFA 2LZTA 3TMWA 1VDTA 1D6QA 2DQGY 1QIOA 3AZ5A 3VWOA 1HEWA 4OOOA 3RNXA 5B59A 1C45A 1AKIA 1A4VA 3W6DA 2G4QA 4WO6A 2BQAA 4NSIA 4LZTA 1GBZA 4J7VA 1VATA 1IWZA 1F6SA 1HERA 4TUNA 4BS7A 3AGIA 5ILFA 1IY3A 135LA 1UIBA 3B0KA 4OW1A 1D9UA 2BQDA 1WQOA 4WMGA 4RW2A 4O34A 3LYTA 4GCEA 4DYGA 3AJNA 1REZA 2LYZA 3ZVQB 1SLYA 4H9BA 3LZ2A 4KPMA 1H87A 1OUGA 1UC0A 1HEMA 4NGJA 2Z18A 1JKBA 1G7HC 1GF9A 1JSEA 1GEVA 1LZRA 3RZ4A 2YBIA 2NWDX 1VDQA 2A7FA 5E9RA 2MEFA 2VB1A 4ANRA 1LJFA 2DQFC 5LA5A 1GXXA 3AYQA 5LYMA 1OUFA 4NY5A 1HELA 1LSPA 1V7SA 3AGGG 2C8PA 4D9ZA 4HJVA 4Z46A 1TCYA 5APDA 1GD6A 1LZ4A 2B5ZA 1GE1A 1WTNA 3A94A 5FDJA 1LMTA 1WVUA 2MECA 4XJIA 1IVMA 4WG7A 1OUAA 1HFXA 1IP7A 4I0CA 2Z38A 4LYMA 193LA 4GN4A 3HBDA 1YAMA 1HMKA 1OUEA 1EL1A 1ZMYL 1IR7A 4BAFA 1LZCA 1A2YC 4XJBA 4EMNA 1GB8A 1C7PA 1JKAA 1GF4A 4M6DA 4H90A 5KXNA 1W6ZA 2LZ2A 1GBOA 1BB7A 3A6CY 1GF3A 4QY9A 1PZYA 1B5UA 3OK0A 4LT0A 4QEQA 1JSFA 2YBMA 5A3EA 1MELL 4YEOA 1HMLA 1IR8A 4H9IA 1GWDA 1HNLA 3WW6A 4ETBA 1LZBA 4DC4A 1GAYA 4J0LA 4LT2A 3CSZA 4Z98A 4R0FA 1REMA 2IFFY 1EQ4A 3CSRA 1LZNA 4OWEA 1F10A 3WPJA 4DDBA 4WLYA 3GXKA 3GXRA 5KXSA 2I25L 1LZ6A 1QDRA 1XGPC 4TTDA 3TMUA 4IJ4A 5LYZA 1J1XY 5LVKA 4BAPA 1I56A 1JPOA 2Z19A 2MEIA 1IWVA 1LMNA 3CT1A 3MGWA 4NSGA 3RU5A 5KXWA 5B05A 1J1OY 4H9AA 2BQOA 4NWEA 2XTHA 2C8OA 3TXJA 4H8XA 1IX0A 1OUDA 3A6BY 1BQLY 1LHIA 2BQCA 2PC2A 2FYCA 1GHLA 4ETAA 5KXOA 4N8ZA 1B5VA 4N0JA 1PS5A 2DQCY 3KAMA 3TMVA 2ZWBA 1IIZA 1IOSA 1CJ6A 2MEHA 1LSGA 4UWVA 4HTNA 5LVHA 5FCPA 1BWIA 3A91A 5F16A 2MEDA 4NSJA 4WM2A 1LZEA 1EQ5A 1UCOA 154LA 1JJ0A 3LYMA 1T6VL 3AW7A 4XYYA 1FDLY 4LYZA 5LA8A 5I4WA 208LA 4M4OA 2ZYCA 1UIGA 1NKHA 2ZIJA 5LAFA 3HFMY 1JKDA 1GB5A 5C6LA 4H1PA 2DQAA 4H94A 2DQEY 3A34A 2D4IA 2WARA 4N5RA 4NGZA 5F9XA 1IP6A 1YKZX 5IELA 4G4BA 3IWRA 3WXUA 1NBYC 5KXRA 1FBIX 1UIEA 1BB3A 5ILCA 2LYOA 4WOAA 4ML7A 4E3UA 1BVXA 2EQLA 3N9CA 1ALCA 134LA 2Z2EA 4B1AA 1KIRC 1FKVA 1LJ4A 3T6UA 5LINA 1XSFA 1CKCA 1NHEA 1QSWA 1JJ3A 4I8SA 5L3HA 1AM7A 1WQRA 1GB0A 4H91A 1GBYA 5DN5A 5E4PA 1V7TA 3RW8A 2H9JA 2GV0A 5KXXA 1SQ2L 2A7DA 1XEJA 4OWCA 5FELA 1GAZA 1LSCA 1UIFA 4GCFA 2BQKA 2HEAA 5HLLA 5B07A 1QTEA 1GB9A 1IP4A 2HEEA 1MLCE 4CFPA 1FLYA 1HF4A 4RW1A 4EOFA 3AGHA 1GE2A 4GLAA 4QGZA 1UIHA 4DD9A 5L9JA 2Z39A 2I26L 2DBTA 1LJJA 1LMCA 1RFPA 1YAPA 1B5WA 4G9SA 1GFGA 4QDNA 3CSQA 3P66A 1N4FA 1HEPA 1LZTA 2ZIKA 2RSCA 2ZQ3A 1JTOL 1LKRA 3A92A 1ZVYB 1LJ3A 4GN3A 1GB6A 4N9RA 1NDGC 1XGUC 1IC7Y 4NSHA 1GF7A 2YBNA 1QDTA 1AT6A 1B7QA 3ATOA 4YEMA 3W6AA 2LYMA 1YROA 1KIQC 2F4GA 5KXMA 2G4PA 2DQIY 4NGOA 1OUIA 1OUHA 1DI3A 4KXIA 1B5XA 4OOTA 2D6BA 1BGIA 5D5FA 2H9KA 1BWJA 2CWIA 4LFPA 1NWGA 1LSDA 3TMXA 4W94A 2D4KA 3EBAB 2BQMA 4H9EA 3AB6A 3EMSA 1FN5A 2BLYA 1OUBA 1LZ1A 4LYOA 1KIPC 3W6EA 1BB5A 1J1PY 4NEBA 5APEA 4CJ2A 1KXWA 4G4CA 1LMOA 1IEEA 4R6CA 2BPUA 4ZFPA 3RT5X 5HMVA 3E3DA 3WVXA 5KXYA 1D0KA 1WQNA 1LHLA 153LA 1IP2A 1TDYA 5KXZA 3B72A 3WXTA 1GFTA 2EKSC 4MSTA 4IASA 4WG1A 2X0AA 4DD2A 4N1CC 3LYOA 2FBDA 4WM6A 4YENA 1LZSA 1WQQA 4LT1A 1GFRA 1TEWA 1XGRC 1B7PA 4RDSA 1IP5A 1G7LC 2DQJY 4WL7A 3J4GA 4DD0A 1GBSA 1GFEA 1Z55A 3B0OA 3P65A 1IC5Y 2Q0MX 3K3TA 1IY4A 2FBBA 3IJVA 2EIZC 4ET9A 4GCBA 2W1XA 2XBRA 4NGLA 3WMKA 3CT5A 1IWYA 3WVYA 1RI8B 3HBHA 4LGKA 1LYOA 1JTPL 1B7MA 1KXXA 1RE2A 5HQ1A 3A93A 4H8YA 1FKQA 1UIDA 4UWNA 1IWTA 1INUA 2HEFA 4NGVA 5I54A 4HJZA 3P64A 1YANA 1YKXX 2BQNA 2FYDA 4NFVA 2YBJA 1GBWA 1IWXA 4NIJA 1IR9A 3D9AC 3LYZA 4B4EA 4HV1A 1UACY 4IATA 3LN2A 1BB6A 1HENA 3ZEKA 4DDCA 1LJGA 1LZDA 5B06A 1GFAA 1B7OA 3N9AA 5APCA 1LJNA 1YQVY 3M3UA 1GDWA 1YILA 4FJRA 4P2EA 1JHLA 2MEBA 5B1FA 5T3FA 6LYZA 5LVGA 4HTKA 4PRUA 4RLMA 1G7JC 1BB4A 3N9EA 5A3ZA 4WM3A 4TX7A 4B49A 1DZBX 4MR1A 1HSWA 2Z2FA 4NWHA 1XFPL 1LYSA 3A3RX 207LA 5AMYA 1YAOA 1BWHA 2W1YA 2F30A 3A96A 1LZGA 1IWWA 2LHMA 4HPEA 1NQIA 4LFXA 2HTXA 4NHIA 1B7SA 5HMJA 1GXV2 4H9FA 1LMQA 3W6BA 4CGEA 4XJFA 4WM1A 3P68A 3EO5A 1LSYA 1JITA 1REYA 1EQEA 1XEKA 1LAAA 1LJIA 1VAUA 2HUBA 1UA6Y 1E8LA 1B5ZA 4TSBA 1DKKA 1LZYA 2YBLA 4G49A 5FHWA 4NG1A 1JEFA 1GPQC 1VDSA 2HEBA 4ETEA 1IC4Y 1WVVA 3F6ZA 4NHSA 3QNGA 4XJDA 1GE3A 1UBZA 3WYHA 5K7OA 3IJUA 1B7NA 1LYZA 1GFKA 1I20A 1GE0A 3WU8A 1QSAA 1LSMA 1IOCA 1GDXA 4AXTA 2BQBA 1VFBC 1DI4A 1LJHA 2Z37A 4DWXA 2MEGA 3J6KA 1LOZA 1B0DA 1C43A 4WLTA 1LSBA 1HSXA 2DQDY 3HBEX 4C5FA 1HFYA 3WW5A 1FLUA 1DQJC 1OQMA 1TAYA 2Z12A 5FSTA 5F9UA 4WO9A 1LJKA 5LVIA 3M18B 3W3EA 2F4AA 3TXDA 5KXTA 1GFVA 2BQGA 3WL2A 1YIKA 1JISA 1DPXA 4LYTA 1JIYA 5DLAA 8LYZA 3A3QA 1LSFA 5F14A 4DD7A 2YDGA 4XN6A 1CKGA 1WTMA 2HU1A 1JKCA 4Z3MA 1LJEA 1NBZC 1LHMA 4H93A 5FEKA 4U3XB 3WUNA 4DD1A 4HTQA 2D91A 2BQHA 1CJ8A 1CJ7A 3CQLA 2BQJA 3BKHA 3WUAA 3B0IA 1UUZC 2BAAA 4LT3A 4OWBA 3ULRA 2HU3A 1OUJA 1IP1A 1OUCA 4NHPA 3TXHA 4NG8A 4HJYA 5KXPA 3A90A 1LZ9A 4ET8A 3LZTA 3T36A 1JJ1A 1GF6A 4DD3A 1F0WA 2BQEA 1LZAA 3WPKA 7LYZA 1B7RA 1LSAA 4PRQA 4PGJB 1HEOA 5DM9A 1LMAA 5KY1A 1CJ9A 2I6ZA 2DQHY 4XJGA 1W08A 2DKVA 1VEDA 4ETCA 4WLDA 3TXEA 3WPLA 4WM5A 3WUMA 3WU9A 5IHGA 4YOPA 3QE8A 4UWUA 5I4XA 1GB2A 4KL7A 1GBXA 3TXFA 1I1ZA 2IHLA 5I4YA 4J1AA 1GFUA 4LYBA 5LYTA 133LA 1GF0A 4WLXA 5C6JA 1B7LA 1GFJA 1FLQA 2ZYPA 3BKVA 1B5YA 4KT3A 2G4NA 1T3PA 3AZ4A 1CKFA 3ZVQA 4J1BA 1GB3A 1G7MC 1QUSA 1REXA 2H5ZA 4H92A 4N1EI 4CFOA 4ZIXA 1UIAA 4HSFA 4PHIA 2N5ZA 4LYCA 1QQYA 2D4JA 2XBSA 4GN5C 2YSSC 4HV2A 4GCCA 1LTMA 4G4HA 1HEQA 4AGAA 5KXLA 1IWUA 4H9HA 2EPEA 3EXDA 5I5QA 4B4IA 1IO5A 1AT5A 2ZQ4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1VDPA 3SP3A 4NHTA 1KY0A 4OWHA 1IORA 5APFA 1NF5A 4TWSA 2EKFA 1LKSA 3K9PA 3L25A 1HHLA 1L53A 4H9CA 1HFZA 2FE8A 109LA 5IDDA 3TXGA 1L87A 5KKJA 1LHJA 1L74A 1A5TA 4NGWA 2CV0A 2HUMA 2F4VM 1QT4A 1OAIA 199LA 1LGUA 4IBEA 3TXIA 237LA 2XJWA 1K3XA 1DGHA 2LXEA 4B4JA 3M6AA 1L46A 1JTTL 2DWNA 4ZPUA 2HKJA 1GE4A 4TSCA 2C99A 216LA 3HT6A 1GO5A 4EPIA 5M1YA 3C82A 4IBIA 4YF2A 4I7SA 2UXCM 4XADA 2G3QA 3QAKA 1JWRA 3ILKA 3C9PA 1L22A 1NY5A 3R8FA 5DN4A 1B2KA 1L28A 2ZNXY 4HP0A 9LYZA 4IBBA 4B7FA 1XXHE 2HHHM 1ZMUA 2GQFA 5KO3A 1L32A 1YKYX 1IOQA 3P4ZA 2ERCA 4C3WA 1L56A 1DO2A 2LVAA 4MCKA 3G3BB 3DFZA 1CV1A 3CT0A 3TE6A 1H6MA 1XGTC 3HDFA 1LSNA 2FS1A 3J81S 4ZEEA 3GLIB 2B72A 2MEAA 1C6MA 1N77A 1KS3A 4I7JA 1XGQC 1L03A 1NSFA 4A7DA 1P46A 3TWLA 5KJ9A 2KNVA 2B70A 5KPRA 1AZFA 2LZTA 3H4MA 1L76A 3LW5F 2DQGY 1UFZA 1HEWA 4OOOA 1A4VA 1DV0A 1C67A 1LI6A 4WO6A 1HNZM 1Q02A 2BQAA 4DR6M 3RFWA 1NHWC 4ARPA 3IG8A 4BS7A 1HERA 2VIIA 5ILFA 1IY3A 1L36A 108LA 2BQDA 1L18A 4RW2A 5FTLA 3GPYA 1SLYA 1P2RA 3DKEX 1OUGA 3PXGA 1QAOA 1HEMA 3TWMA 1LZRA 4GKJM 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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