1QUT | Genus

Total Genus 108

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	108
sequence length	322
structure length	312
Chain Sequence	MVEPQHNVMQMGGDFANNPNAQQFIDKMVNKHGFDRQQLQEILSQAKRLDSVLRLMDNQGPNGAWLRYRKKFITPDNVQNGVVFWNQYEDALNRAWQVYGVPPEIIVGIIGVETRWGRVMGKTRILDALATLSFNYPRRAEYFSGELETFLLMARDEQDDPLNLKGSFAGAMGYGQFMPSSYKQYAVDFSGDGHINLWDPVDAIGSVANYFKAHGWVKGDQVAVMANGQAPGLPNGFKTKYSISQLAAAGLTPQQPLGNHQQASLLRLDVGTGYQYWYGLPNFYTITRYNHSTHYAMAVWQLGQAVALARVQ

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Crystal structure of Escherichia coli lytic transglycosylase Slt35 reveals a lysozyme-like catalytic domain with an EF-hand. pubmed doi rcsb
molecule keywords	LYTIC MUREIN TRANSGLYCOSYLASE B
molecule tags	Hydrolase
source organism	Escherichia coli
total genus	108
structure length	312
sequence length	322
ec nomenclature	ec 4.2.2.n1: Peptidoglycan lytic exotransglycosylase.
pdb deposition date	1999-07-03

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF13406	SLT_2	Transglycosylase SLT domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.10.8.350	Mainly Alpha	Orthogonal Bundle	Helicase, Ruva Protein; domain 3	Bacterial muramidase	1qutA01
1.10.530.10	Mainly Alpha	Orthogonal Bundle	Lysozyme	Lysozyme	1qutA02

2B5ZA 4PPOA 1LZGA 1GE4A 2W1LA 3AGHA 1LMPA 3B0KA 3E3DA 3TXDA 2YBIA 5F14A 1LSAA 3N9EA 4PHIA 1GE1A 1XSFA 4XJIA 1AKIA 2H9KA 2FYDA 2G4PA 5FSTA 5KXNA 4UWUA 1EL1A 5KXWA 1LZ4A 1LTMA 1QUTA 3WU7A 1LJHA 2I26L 1DZBX 4GN3A 3WU9A 1F10A 1A4VA 3CSRA 3QNGA 4WLYA 4G4CA 1WQPA 2W1MA 1B0DA 3FE0A 1BB5A 3OJPA 132LA 1DKKA 1DKJA 3P68A 5FCPA 1JJ3A 2ZYCA 5JENB 1YKXX 1QQYA 2ZYPA 4GCFA 3W6DA 2HEBA 2ZIJA 2Z39A 2H5ZA 3TXKA 5HLLA 1CKHA 4WL6A 2IHLA 4ETDA 5F9XA 4ETBA 4IJ4A 1JTPL 1G7MC 5DL9A 1XEKA 1UIGA 1ZVYB 3AW7A 1XGPC 5L3HA 1FLQA 1LZ6A 1YKYX 4RW2A 1W08A 4QGZA 1GFUA 4XJGA 1VDQA 3P65A 3FI7A 4XJDA 4DD2A 3CQLA 1C43A 4OWBA 1B7QA 3LYOA 3AGIA 2A7DA 1GE2A 1LHKA 1G7JC 4R6CA 4WM5A 3WXUA 3ZVQB 1HEQA 1LSMA 3AJNA 3QE8A 5A3ZA 4YEMA 2YDGA 4TWSA 3N9AA 2MEAA 3OK0A 5ILCA 1IOTA 1UICA 4NWHA 1LZNA 3AZ6A 4HP0A 1UCOA 1LYOA 1LAAA 4NGJA 3WULA 1LZ1A 2BQHA 4G9SA 1BB7A 4H93A 4ET9A 1NQIA 1CKCA 4B1AA 1YROA 1HHLA 5HMJA 1NWGA 4H94A 3TXBA 1LZ8A 1LHHA 2I6ZA 3A3RX 4UWVA 4LYTA 1LSGA 5I4YA 1OUIA 5HNCA 1ZVHL 1GB9A 1TBYA 1LOZA 4XJFA 4PRQA 1F6RA 4XYYA 1GF5A 3P4ZA 5I4XA 1GB0A 1NHEA 3LZTA 2BAAA 4HJZA 4GLVA 3T6UA 4HJYA 1IOCA 1BWJA 4N1CC 2MEIA 1JJ1A 3WPLA 1JTOL 2FBBA 1T6VL 1IWTA 3W6AA 1OUFA 4BAFA 1HEPA 2LZ2A 4HSFA 1E8LA 4R0FA 4H1PA 4NIJA 4LT2A 1CKFA 1CKDA 1JJ0A 1QDRA 2XTHA 4NWEA 5KXMA 1HMKA 1PZYA 3HBHA 3WW6A 1C45A 4ETAA 1LKSA 8LYZA 2HEAA 2MEHA 1IWUA 1YIKA 133LA 4LT1A 1BB3A 1FLYA 1JISA 1O23A 2ZNXY 5KXZA 4DDBA 3TMXA 4WM6A 4NG1A 1BVKC 4YM8A 3J6KA 1JKBA 1N4FA 1GFRA 3LZ2A 4NHSA 4HTNA 1PS5A 5IHGA 4MR1A 3CT1A 1B7OA 4DD7A 2BQLA 3EBAB 1RFPA 4TUNA 4E3UA 1W6ZA 1YQVY 2EQLA 3A96A 4A7DA 1IWXA 2HU1A 5AMYA 4XADA 1HEWA 2MEDA 2CDSA 1WVUA 1IP4A 1LKRA 4WG1A 1RCMA 2BQMA 5F81A 2CJLA 3AW6A 4NFVA 1JTTL 3TXHA 3WU8A 1C10A 3WUNA 1YAQA 1IWZA 1QSWA 3CT5A 5II3A 1OUBA 2YSSC 3GXKA 1LHJA 4WLTA 3TXGA 1G7IC 3W6BA 1GEVA 1LJIA 3HBDA 2LYZA 1BGIA 1NBZC 194LA 1CJ6A 2A7FA 1CKGA 4W96A 2DQCY 1NKHA 1GB6A 3B0IA 2MEGA 3HFMY 5KXLA 1B5WA 1TEWA 1XGUC 4H92A 1D9UA 2BQFA 4WO9A 5KXRA 2DQEY 3W3EA 1FLWA 1QTKA 4HV1A 2W1XA 5KXXA 1WTNA 2DQFC 1XGRC 5I4WA 1BB6A 7LYZA 1GBSA 4PRUA 5FELA 3LYMA 4H8XA 2RSCA 3K3TA 4IASA 5LXWA 1QIOA 5LVIA 1IP6A 4CHXA 1GFEA 3D9AC 5LYMA 5APFA 1KXXA 5FHWA 1B5VA 4NY5A 1GPQC 3M3UA 1LJNA 3WL2A 5HMVA 3P66A 5J7CA 4DD9A 2EPEA 5APEA 5LVKA 4BAPA 1LHLA 3M18B 3TXIA 208LA 2BQAA 3GXRA 3J4GA 4NGYA 1LZ9A 1TDYA 4J1AA 4LFPA 3WVXA 4DD3A 4J1BA 1LYYA 1WVVA 1IOSA 2C8OA 1WQNA 5LVGA 3WYHA 1IOQA 1GF9A 1RE2A 1LZSA 1IP5A 4YEOA 4H9FA 2D4IA 3RNXA 4ZIXA 3A8ZA 5IDDA 1CNSA 1EQ5A 4RDSA 1LZCA 3B72A 4DYGA 1UIFA 1J1XY 3A91A 4CFPA 1IY3A 1VDPA 3AZ5A 1GFTA 1OUJA 5FEKA 4C5FA 2BQJA 4B4JA 4LZTA 5C6LA 2XJWA 1YAPA 5D5CA 1D6QA 1IC4Y 1LZAA 3HBEX 4LT3A 1JPOA 1LMOA 1JHLA 3IJUA 4NGKA 2BQNA 5DM9A 1VATA 1JKCA 4NSGA 4H9BA 5C6IA 2Z19A 1DPWA 1OUCA 4MCKA 4NHTA 5APCA 2I25L 4ANRA 3W6EA 5M1YA 4D9ZA 1FBIX 1BVXA 1JUGA 3A95A 4H9EA 3RT5X 4W94A 1IORA 3F6ZA 1LMAA 4H9IA 1HNLA 1QDTA 5C6JA 3WMKA 3AZ7A 1I20A 1REZA 5D5FA 1ZV5L 3WH1A 4NEBA 3D3DA 2HEFA 4KL7A 1LSNA 3WPJA 2F4GA 1V7TA 1RJCB 3WUAA 4C3WA 2BQBA 5APDA 3CB7A 1OQMA 1OP9B 1FLUA 1WQOA 4ZFPA 3B0OA 1QSAA 4TSCA 2D4JA 1LZBA 1GHLA 1LJEA 4MSTA 2HEEA 1GB3A 1GBXA 4OWCA 3LHMA 4FDYA 1WQRA 3WVYA 4BS7A 3TMWA 2MEEA 4J0LA 1HSWA 3BKHA 4XENA 5LAFA 2D6BA 2BLXA 4B4EA 4LYBA 4N8ZA 2YBNA 1C7PA 1IWVA 1LMTA 4H9AA 4WLXA 4P2EA 1LJFA 1JEFA 4NG8A 4YOPA 5LINA 2WARA 1SLYA 2W1YA 3EMSA 1CJ8A 1XGTC 1GAYA 2X0AA 1IWYA 3B6LA 1NF5A 1B5XA 1HC0A 4CGEA 3QY4A 4LYMA 4DT3A 1JSEA 1B7PA 1LHIA 2ZQ3A 4XJHA 1BHZA 1LSYA 1IP7A 1OUHA 2XBRA 3CT0A 1IC7Y 4OOOA 1LZDA 3WUMA 2HEDA 4DDCA 2Z37A 3G3BB 1GXXA 2DQGY 3KAMA 1UIBA 2ZILA 4NHPA 2F2NA 5B06A 207LA 1YAOA 1GE0A 4RW1A 4XN6A 3SP3A 2BLYA 1LMCA 1VFBC 5E9RA 1GE3A 1GFKA 1OUAA 1GFVA 1HEMA 1CJ7A 4OW1A 3RW8A 3ZEKA 1D0KA 4H9CA 1GF3A 2Z18A 1LJKA 2G4NA 4LYZA 4O34A 2BQCA 1OUDA 1KXWA 3IJVA 1C08C 3A92A 4GCBA 4II8A 4Z98A 2ZWBA 4KT3A 1ALCA 2EIZC 1IVMA 5KJ9A 5L9JA 4GN5C 3ULRA 1GF7A 6LYZA 2MECA 5LYTA 4TSBA 2YBLA 4WM3A 1IEEA 3AZ4A 1NDMC 1UACY 1T3PA 2AUBA 3EXDA 4HPEA 4HTQA 1DI4A 4NGZA 2HUBA 4NHIA 4OWEA 1LZRA 4L41A 1B2KA 1GFAA 1IP3A 4WM1A 1BQLY 1BWIA 1LCNA 1GB7A 1B7SA 1DI5A 4ETEA 2LZTA 1GBZA 1NBYC 4G49A 5B07A 4DD0A 1LZYA 1LYSA 4OOTA 2ZIKA 1IWWA 1FDLY 2XBSA 1GEZA 1LPIA 2F30A 3T36A 1YKZX 1UIAA 2LHMA 3A34A 4QDNA 4RLMA 3A3QA 1HF4A 1OUEA 4N1EI 2HECA 4WM4A 1CJ9A 1HSXA 3LYTA 2DQIY 1UA6Y 4B4IA 1YILA 4LGKA 4KPMA 4BADA 1IIZA 4NGLA 1RI8B 2BQKA 4WOAA 1GAZA 3AYQA 4WO6A 5DLAA 3WPKA 4ML7A 4AXTA 4B49A 5K7OA 1HERA 2DQAA 1B7MA 1IR9A 2EKSC 3P64A 5F16A 4I8SA 3EO5A 5DN4A 1UIEA 2FYCA 1AT6A 1J1OY 4LYCA 4GCEA 4NGIA 1GB2A 1F6SA 1XFPL 4ETCA 4NHQA 1LSCA 4ET8A 1UC0A 4H8YA 4HTKA 1GB5A 1BB4A 1REXA 1KIPC 1B5YA 1EQ4A 2MEFA 2VB1A 1GDWA 1VDTA 1IY4A 1GD6A 1KXYA 1P2CC 2FBDA 2Z12A 4M6DA 4Z41A 1INUA 1C46A 5IELA 5KY1A 1HELA 3A93A 9LYZA 2MEBA 4PGJB 1D6PA 4HJVA 1QUSA 4NGVA 4QY9A 1OUGA 3LN2A 1B5UA 1LMNA 1BWHA 1IR7A 1G7LC 1LZEA 193LA 1HEOA 1JKAA 3WW5A 1MLCE 1H87A 4Z46A 2Z38A 1GBYA 134LA 1MELL 2YVBA 1GF6A 4IATA 4NSIA 4WLDA 2BPUA 3TXEA 2BQDA 4GLAA 3IWRA 2N5ZA 4OWAA 2Y8PA 1GFJA 1D0MA 4N5RA 1LJ3A 2DKVA 2YBHA 1YL1X 4Z3MA 4EOFA 2DQHY 4KXIA 3MGWA 1B7NA 4RLNA 2HU3A 1VAUA 4WM2A 1HFXA 2G4QA 4XJBA 1JIYA 2YBJA 1LJ4A 2LYOA 4QEQA 2DBTA 1REMA 4G4HA 1FKVA 1GFGA 5T3FA 3N9CA 2H9JA 2Z2FA 3TMVA 1QTEA 1V7SA 1GB8A 1UBZA 5B05A 4LYOA 4EMNA 4N9RA 5LVHA 1GFHA 5HNLA 3RZ4A 4AGAA 1AM7A 1A2YC 1LHMA 2NWDX 4GCCA 153LA 1IP1A 1LSBA 1TAYA 4DWXA 6LYTA 1EQEA 2CGIA 3CSZA 3TMUA 3LYZA 5LIOA 5HQ1A 1B7RA 1IX0A 1XEJA 4X3BA 1FKQA 5ILFA 1GXV2 5I53A 1I1ZA 5LYZA 2IFFY 4ZEEA 1UIHA 1KIQC 3TXJA 5KKIA 2CWIA 5LAGA 1ZMYL 2YBMA 2D91A 154LA 4WG7A 1DPXA 2BQEA 4GN4A 5KXKA 4H90A 5B59A 1WQMA 1JITA 2BQGA 5KKJA 1F0WA 3RU5A 1LJGA 2DQDY 1B5ZA 4M4OA 4NGWA 2LYMA 4I0CA 5LA5A 1LSZA 1GBWA 1NMMA 4WL7A 5FDJA 2BQIA 1HFZA 1H6MA 5KXYA 1YL0X 4H91A 2HTXA 4N0JA 5KXTA 1NDGC 4YENA 1GF0A 1DQJC 4DC4A 3BKVA 4J7VA 4TX7A 1LSPA 4H9HA 1JKDA 4B0DA 1JSFA 1XEIA 1GDXA 1GF8A 1UUZC 4OWHA 4U3XB 4CFOA 1IC5Y 4CJ2A 2F4AA 3A90A 3A67Y 3WXTA 1LYZA 1VDSA 1VEDA 5LA8A 4YF2A 1I56A 5E4PA 5KXPA 1REYA 2PC2A 1LSEA 2BQOA 5KXOA 3AGGG 1J1PY 3ATNA 3A6CY 4NGOA 1HFYA 1AZFA 1SQ2L 4HPIA 1Z55A 2DQJY 5EBHA 1FN5A 1D0LA 3AB6A 4DD1A 3CSQA 1HENA 2ZNWY 5L3IA 4FJRA 2Q0MX 1JWRA 1LSFA 2ZQ4A 4LFXA 4UWNA 2GV0A 1G7HC 1LJJA 1LZ5A 1WTMA 1LMQA 4H8ZA 5DN5A 5F9UA 1GBOA 5B1GA 3W6FA 3W6CA 1AT5A 2D4KA 5LVJA 1IR8A 1GF4A 3A6BY 3G3AB 4NSJA 2Z2EA 5I5QA 5KXSA 1B9OA 3ATOA 4NSHA 1WQQA 4GCDA 3TXFA 4PJ2C 1IO5A 1YANA 4WMGA 5B1FA 3VWOA 1DXJA 1TCYA 4HV2A 4TTDA 5I54A 1DI3A 135LA 5A3EA 1KIRC 1B7LA 3A94A 1HMLA 4DDAA 2C8PA 4G4BA 1LZTA 3ZVQA 1YAMA 1XGQC 1LSDA 1GWDA 1IP2A 1UIDA 4LT0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily

4W5WA 3FRIA 1KY0A 4MGIE 3RE8A 2LXEA 1QUGA 4FD2A 2DAKA 232LA 3B0KA 225LA 245LA 3N9EA 1L23A 241LA 5FSTA 4AQNA 1L35A 2LC9A 1JR3D 5KXWA 1L51A 2LVAA 1IBKM 1DZBX 1OJLA 2F5SA 2A4TA 1T8FA 3W67A 1HQCA 1BB5A 1IFYA 1DKJA 1YKXX 151LA 1L16A 2ZIJA 2H5ZA 1KW7A 4P17A 1DYEA 4FWGA 2RBSA 1JTPL 2F5QA 2O79A 4W53A 5DL9A 4ETBA 1XEKA 1YUBA 1G71A 1I94M 1ZVYB 3GUMA 5L3HA 1LZ6A 1YKYX 4RW2A 1VDQA 3FI7A 3GLIE 186LA 1C43A 4FCWA 3J81S 1B7QA 3DN4A 3TQSA 4DR4M 146LA 1TLAA 1GE2A 1LHKA 3ZVQB 1HT1E 4CHTB 5A3ZA 2YDGA 4DV4M 3OK0A 139LA 4GC9A 1R7RA 3LQQA 4LFBM 1D2WA 1LZNA 3GLGB 3UK6A 4HP0A 1LYOA 3WULA 1LZ1A 4H93A 4CJ6A 3SB7A 1P6YA 1NQIA 1YROA 1HHLA 5HMJA 1G4AE 3U60A 1NWGA 3DN2A 4H94A 3KOXE 1LHHA 2HULA 5HNCA 1C6HA 1TBYA 1DGFA 3PFIA 4XYYA 4HJZA 5EQTA 4YHHM 2EUCA 1IM2A 2HL7A 1LYJA 3T6UA 1V33A 4BB9A 4N1CC 4HL4A 1G07A 3L25A 1JTOL 1XNQM 1L39A 1T6VL 1IWTA 3W6AA 1OUFA 5GKNA 1E8LA 4JYAM 1ZMVA 4NIJA 3AFHA 1CKFA 4NWEA 3FTEA 3E46A 4ETAA 2RBPA 3JR5A 2HEAA 4DQJA 1YIKA 2Q2EB 3QAKA 1JISA 1O23A 5ITRA 4NG1A 4E97A 1GFRA 3DMVA 4DD7A 2BQLA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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1QUTA

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