1D0MA

The escherichia coli lytic transglycosylase slt35 in complex with bulgecin a and (glcnac)2
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
322
structure length
312
Chain Sequence
MVEPQHNVMQMGGDFANNPNAQQFIDKMVNKHGFDRQQLQEILSQAKRLDSVLRLMDNQGPNGAWLRYRKKFITPDNVQNGVVFWNQYEDALNRAWQVYGVPPEIIVGIIGVETRWGRVMGKTRILDALATLSFNYPRRAEYFSGELETFLLMARDEQDDPLNLKGSFAGAMGYGQFMPSSYKQYAVDFSGDGHINLWDPVDAIGSVANYFKAHGWVKGDQVAVMANGQAPGLPNGFKTKYSISQLAAAGLTPQQPLGNHQQASLLRLDVGTGYQYWYGLPNFYTITRYNHSTHYAMAVWQLGQAVALARVQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystallographic studies of the interactions of Escherichia coli lytic transglycosylase Slt35 with peptidoglycan.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Escherichia coli
molecule keywords 35KD SOLUBLE LYTIC TRANSGLYCOSYLASE
total genus 110
structure length 312
sequence length 322
ec nomenclature ec 4.2.2.n1: Peptidoglycan lytic exotransglycosylase.
pdb deposition date 1999-09-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13406 SLT_2 Transglycosylase SLT domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.8.350 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Helicase, Ruva Protein; domain 3 Bacterial muramidase 1d0mA01
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1d0mA02
4GCEA 1TDYA 1LZYA 2HUBA 4QEQA 1LSCA 1WTMA 2LZTA 1GFJA 2YBNA 5DN4A 1NQIA 1UIGA 1GE2A 5LVHA 5L3HA 4IATA 5LVGA 2LYMA 1T3PA 1YQVY 2F30A 5I54A 132LA 1IOTA 4TSBA 3W6BA 2W1MA 4TTDA 1UA6Y 3TMWA 1QSAA 1OP9B 2Z18A 2LYZA 3WU9A 3F6ZA 1GDWA 1XEJA 2DBTA 4NGOA 3WVXA 1BB5A 3B0OA 4X3BA 3AW7A 2YSSC 1DPWA 4YOPA 5A3EA 5DLAA 8LYZA 1CKGA 2Z12A 2WARA 2YBLA 3HBHA 3IJVA 4GLVA 1B7PA 4WM1A 3W6EA 2MEAA 1GXV2 1LHHA 3WULA 4UWVA 1B7LA 4ETCA 2A7DA 5LINA 2BQEA 2AUBA 3AZ4A 4NGYA 3WW6A 1HEOA 1VDTA 4HV2A 4RLMA 1OUGA 2Z19A 3QY4A 4C3WA 4DD1A 5LYTA 1G7JC 193LA 4HTKA 5LVKA 4ETAA 1UIEA 1GF4A 1GFTA 2CWIA 4H8YA 1JTPL 2BQIA 4OWBA 1I1ZA 4HJVA 1CKHA 1IX0A 1MELL 1LMOA 3EBAB 2EKSC 3LHMA 5EBHA 4N1EI 4DD3A 4HPIA 1LZ9A 3B72A 1GB6A 1CJ8A 2DQHY 3K3TA 4GN4A 4NGIA 3TXKA 1LHJA 1LJIA 1QUSA 4BS7A 1GE0A 4H9EA 1HEWA 5II3A 5KJ9A 3WPKA 4DD7A 2XBSA 1GAZA 1DPXA 4H9CA 2BLXA 1GFKA 1C43A 1LJKA 3WVYA 1AT5A 1IWZA 2BQKA 1LTMA 1UC0A 1VFBC 1ZMYL 3CSZA 3N9EA 4PPOA 4B1AA 5LXWA 1AM7A 2BLYA 1LMTA 4I0CA 4ET8A 5L9JA 3W6AA 4QGZA 2B5ZA 2YDGA 4XJGA 5I53A 1RCMA 1REYA 2HEAA 3TXGA 1XGUC 5LYMA 1JEFA 2FBBA 2BAAA 3QE8A 4CGEA 1GF8A 5KXNA 1IY4A 1F6RA 1IR8A 1LYOA 2F2NA 2ZQ4A 4H92A 4UWNA 5LVJA 1LZBA 5I5QA 1JWRA 3TXBA 2FYCA 1LSZA 1JHLA 4NSGA 1IP4A 2FBDA 2MEFA 4OW1A 2N5ZA 4NY5A 1VDSA 1GB5A 2MEEA 3LZ2A 1LYZA 4H8ZA 2BQFA 4WL7A 4CJ2A 4WM5A 3ATNA 4NSJA 4WOAA 1GD6A 2MEHA 4G9SA 1GB8A 1LZSA 2DQCY 1YAPA 4TUNA 4B0DA 1LHMA 1LJGA 4L41A 4PRQA 4UWUA 1GBZA 1WQRA 1LMCA 3A3RX 4GLAA 3CSRA 1QIOA 3RT5X 5KKJA 1LMAA 1KIRC 1GBXA 1LPIA 1OUJA 4LYCA 4N0JA 1T6VL 1GE4A 2DKVA 1C7PA 3CT1A 1F6SA 2ZYPA 4YEMA 1YAQA 4WM6A 1J1PY 3TXEA 4N5RA 3WH1A 4ETBA 2YBIA 3RNXA 3W3EA 1BVKC 2H9KA 1GFEA 1GF3A 1LJHA 4G49A 1P2CC 1LZ5A 1OUAA 1JKBA 3ATOA 4DDAA 4H94A 3P66A 4NGLA 4NHTA 3BKHA 1OUBA 2BQNA 1B5VA 2Q0MX 1B7OA 4H8XA 1LHKA 1GF7A 4GCFA 4OWCA 3WMKA 3M3UA 1V7TA 1CJ6A 1FLYA 3WPJA 2BQLA 3KAMA 3WUAA 1C10A 1JPOA 1GF5A 1DI3A 1C45A 1GF0A 3QNGA 1IWXA 2G4PA 3WL2A 3WXTA 4WL6A 3HBEX 3VWOA 4LT2A 1LJJA 2RSCA 4LT3A 4ML7A 5LYZA 2HEEA 1GB3A 1GWDA 3G3AB 1IIZA 3B0IA 3A93A 4LT0A 4NGVA 3T6UA 3TMUA 133LA 1GB2A 4GN5C 1IO5A 1NDMC 1XGTC 2W1XA 3AGGG 1XGQC 1LSFA 4OWEA 1LSBA 4LYBA 1LSEA 2G4NA 4YENA 4LFPA 1LZDA 1UIBA 1JTOL 3RW8A 3LN2A 5HNCA 1JISA 1GFRA 4WM4A 1HFXA 1LJ4A 2NWDX 1GAYA 4FJRA 1HENA 3M18B 1CNSA 3GXRA 4LGKA 2HEDA 5KXZA 4ANRA 3TXHA 1GXXA 1GF9A 1FKQA 4H9BA 6LYTA 153LA 1YKZX 3EXDA 5DN5A 4HTNA 5APCA 1EQ5A 1D0LA 1B7NA 4NGJA 5D5FA 1GEVA 1I56A 4B4IA 1GPQC 1A2YC 1GFHA 4XJDA 1LZ6A 1GB7A 2A7FA 2Z39A 3A6CY 4H93A 1IP7A 4ZEEA 2CDSA 5I4YA 1IWYA 1W6ZA 2G4QA 2ZIKA 1INUA 3A96A 1LSYA 4NWHA 4ZIXA 1FLUA 3ZVQA 1JJ3A 1UIHA 2H9JA 1HC0A 1J1XY 4XADA 4DT3A 1EQ4A 1LZGA 4EOFA 1HEPA 1CKFA 4H1PA 5ILCA 4DYGA 1YL1X 4D9ZA 4XN6A 2ZNWY 4XJIA 4LFXA 1OQMA 2EIZC 1A4VA 1FLQA 1OUHA 5D5CA 2DQDY 5LAFA 1QTEA 4A7DA 1XFPL 4Z3MA 3TXJA 3LYTA 3OJPA 1IP2A 4J1AA 5T3FA 1FKVA 1XGPC 1LMNA 1UCOA 3A8ZA 1JITA 1TBYA 5FSTA 5IELA 5F14A 5KXMA 5L3IA 1KIQC 1D9UA 4R0FA 4U3XB 1SLYA 1V7SA 4XYYA 1BB6A 1LJEA 5KXTA 4HJYA 1CJ7A 1LSNA 3A95A 4RDSA 4H90A 4R6CA 2W1YA 1CJ9A 1O23A 1RFPA 4PJ2C 4WO6A 5FHWA 3TMXA 4IASA 2VB1A 1F0WA 4N1CC 5J7CA 2BQGA 5IHGA 1B2KA 1MLCE 5IDDA 1LCNA 5B05A 1VEDA 4G4BA 3P65A 1HHLA 4TWSA 1NBYC 1OUIA 3RZ4A 1D6PA 1G7IC 4AGAA 5HNLA 2XBRA 1B5XA 1LSMA 1GB9A 1BB7A 5HQ1A 1LKSA 1WQPA 5KXLA 2HECA 1IVMA 5LA5A 1BGIA 3IJUA 3OK0A 2Z38A 3SP3A 4BAFA 1LZ4A 1C46A 4WG1A 5LA8A 3FI7A 1XEKA 2X0AA 4NG8A 4W94A 3CQLA 4LYZA 1GB0A 2C8PA 1EQEA 1IEEA 3W6DA 3HBDA 3WU7A 1BHZA 3WXUA 1BVXA 2IHLA 4DD0A 3LYMA 1WQNA 3LYOA 2HTXA 1GBSA 135LA 1JUGA 1QUTA 1F10A 1HEQA 4NHSA 4WM3A 4YEOA 4B4JA 134LA 1LZEA 1LZTA 3ZEKA 4G4HA 4ZFPA 1N4FA 1YAMA 1LSGA 1GBOA 4MR1A 2C8OA 5FELA 2MEDA 4GCCA 3WYHA 1ZVHL 3TXIA 1GF6A 1XGRC 5KXOA 4CFPA 5KXKA 3G3BB 3EO5A 1Z55A 4GN3A 5APEA 1YAOA 1HMLA 2YBMA 4MSTA 1JJ0A 1IWUA 1D6QA 9LYZA 1LJ3A 1YKYX 4W96A 6LYZA 1IC5Y 2DQJY 1NDGC 1IC4Y 2LYOA 2XTHA 3CT5A 3IWRA 2HU1A 3N9AA 4NGZA 3LZTA 1WQQA 1SQ2L 2DQFC 1KXYA 2Y8PA 1TCYA 4LZTA 1B7MA 4ETDA 1LMPA 1QDTA 2GV0A 1IWVA 1RI8B 4KT3A 2I26L 1JJ1A 2YBJA 1OUFA 4B4EA 5FCPA 2IFFY 4DDCA 4YM8A 1G7MC 4CFOA 1OUCA 2I6ZA 1REXA 1WTNA 5F9XA 3A3QA 2BQCA 3MGWA 5HMVA 4H9FA 1I20A 1BWJA 4RLNA 3LYZA 4HV1A 1G7LC 1KXXA 1YIKA 2EPEA 1QTKA 1B7QA 1FDLY 1REMA 1B7SA 1QSWA 1GHLA 1UUZC 207LA 3GXKA 4HJZA 4O34A 4WLTA 4M6DA 2D6BA 2EQLA 3BKVA 2F4GA 3HFMY 3J6KA 2BQHA 4H9HA 4OOTA 4MCKA 2I25L 2ZILA 1VATA 4WLDA 1XSFA 5KXXA 3WW5A 4OWHA 1DQJC 5B06A 1GE3A 1HF4A 1W08A 1UIDA 4LYTA 5C6JA 1KIPC 5APDA 1BB3A 5LIOA 1IY3A 4DC4A 3A6BY 1HERA 1LKRA 1TAYA 4FDYA 4WO9A 4XJFA 1IP6A 2DQEY 2LZ2A 3B0KA 1ZV5L 4KPMA 4OOOA 4P2EA 2YBHA 3AZ6A 4WG7A 3B6LA 1IR9A 5HMJA 1LZAA 1FN5A 5HLLA 4DD2A 4NSHA 1QDRA 1GBWA 1HFYA 1H87A 2ZYCA 3P64A 4TX7A 3AJNA 5APFA 4HPEA 1JKAA 3FE0A 1B0DA 3AYQA 3P68A 3T36A 4YF2A 1QQYA 1LZRA 1B5YA 1HNLA 4NHIA 1ALCA 2BQDA 2F4AA 1YKXX 1CKDA 4LYOA 5C6LA 2CGIA 1CKCA 2BQOA 194LA 3TXFA 2DQIY 4WMGA 4WLYA 1HSWA 1PZYA 1LOZA 3A92A 4Z98A 4E3UA 5ILFA 3AGHA 3J4GA 1IP1A 1YANA 2BQBA 4HTQA 2D4KA 1B5UA 1GBYA 1LHLA 1LZ8A 4NHQA 4J7VA 1BWIA 2DQAA 4I8SA 2MEBA 4NSIA 1GFVA 1RJCB 1YILA 4NGKA 5A3ZA 1GE1A 1VDQA 5B59A 1VAUA 4HP0A 4GCBA 1IP5A 1WQOA 1HSXA 2D4JA 5I4XA 2Z37A 2PC2A 4G4CA 4DD9A 1IOCA 3CB7A 3A94A 4Z46A 2H5ZA 1UACY 4WM2A 3A90A 1LJNA 1DXJA 4DDBA 5KXPA 5DL9A 4XENA 3W6FA 1GFUA 2ZQ3A 4OWAA 1TEWA 4C5FA 1BB4A 5K7OA 2CJLA 2YVBA 1HELA 1LZ1A 1AT6A 3WU8A 3WUMA 2HU3A 2ZIJA 3ULRA 4NGWA 1IOQA 4AXTA 3ZVQB 1WVVA 1IR7A 1LJFA 3WUNA 2MEGA 2D91A 4N8ZA 1JSEA 1KXWA 2BQJA 5AMYA 4PRUA 1GEZA 1LYSA 1B5ZA 4J0LA 1LZCA 1DZBX 4QDNA 154LA 1LZNA 1LMQA 5B1FA 1HFZA 1GFGA 5C6IA 4EMNA 1HEMA 4PHIA 4TSCA 3P4ZA 1D0KA 2MECA 5I4WA 4J1BA 1NBZC 4NIJA 4RW1A 5B1GA 4ET9A 5FDJA 3WPLA 3AW6A 2W1LA 1NF5A 1GDXA 3N9CA 1LAAA 1NWGA 4XJBA 2Z2FA 5DM9A 5E9RA 5F81A 4IJ4A 1UBZA 1UIAA 3EMSA 5LAGA 5KY1A 1D0MA 1NHEA 5JENB 4LT1A 4LYMA 1EL1A 1PS5A 3D9AC 1G7HC 1LYYA 4WLXA 1BQLY 1VDPA 4NG1A 1DKJA 1IP3A 208LA 1RE2A 2DQGY 2HEFA 2ZWBA 1DKKA 4RW2A 1OUDA 4DWXA 1AZFA 1FBIX 3D3DA 2BQAA 3AGIA 3CT0A 1NKHA 4NFVA 1JIYA 1UICA 2XJWA 5LVIA 5KXWA 1WQMA 4CHXA 1LSDA 5F9UA 4H91A 4NHPA 4BADA 1FLWA 2HEBA 1WVUA 4NEBA 3AZ7A 3CSQA 1IWWA 1H6MA 1E8LA 1LSPA 2BQMA 1HMKA 1IWTA 2Z2EA 5KXRA 4M4OA 1LHIA 1B5WA 4HSFA 1OUEA 1J1OY 1AKIA 1IORA 1YL0X 1IC7Y 2MEIA 7LYZA 2ZNXY 1B9OA 3TXDA 5FEKA 3A67Y 3AB6A 1NMMA 1UIFA 2BPUA 2D4IA 4H9AA 4Z41A 1JTTL 1XEIA 1GFAA 5KXSA 1REZA 1C08C 1DI5A 2FYDA 1JKDA 1ZVYB 1JSFA 3A91A 4II8A 1JKCA 1YROA 5B07A 4PGJB 4H9IA 4BAPA 3RU5A 1LSAA 1BWHA 5KXYA 4KL7A 3E3DA 5E4PA 3TMVA 4XJHA 4QY9A 5M1YA 1IOSA 4GCDA 5F16A 4KXIA 2LHMA 5KKIA 4B49A 4NWEA 3W6CA 1B7RA 4ETEA 4N9RA 3A34A 3AZ5A 1DI4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1TDYA 3CF0A 2QQ8A 109LA 2B3TA 5DN4A 1NQIA 5LVHA 2KDLA 5LVGA 1D2YA 1HJPA 3F92A 2LYMA 1YQVY 1CU2A 4AKIA 2W1MA 1SXJE 3F8VA 5E6JA 3TMWA 2Z18A 2LYZA 3WU9A 1XEJA 3SYLA 4LFCM 1E32A 1OVHA 4NGOA 2X49A 3B0OA 3MJ5A 4YOPA 2BJVA 2Z12A 2YBLA 3UGJA 4WM1A 1B7PA 2MEAA 2K0BX 4ETCA 143LA 2AUBA 3AZ4A 1VDTA 3QY4A 1G7JC 4W58A 1WXQA 1GFTA 3GP1A 2CWIA 3GLIE 1I1ZA 1CKHA 239LA 1IX0A 238LA 1MELL 1L46A 1E9RA 1CU6A 4W51A 1TH4A 151LA 3LHMA 4N1EI 2HCBA 4DD3A 1J09A 3B72A 4NGIA 1XNRM 3UJNA 2DQHY 2FS1A 1CV0A 3K3TA 1C6BA 1L71A 1NY6A 3HU8A 1QYRA 3C58A 221LA 1DPXA 3KP0E 4DR5M 3HUKA 1P2LA 3WVYA 1LYHA 3IG5A 185LA 258LA 4DQ5A 1D2NA 3NBXX 3RFWA 1AM7A 2BLYA 1C64A 4I0CA 1L23A 156LA 4GRVA 4QGZA 1QS9A 1REYA 3U6EA 3AOGA 1XGUC 1SSYA 1C7YA 4WP2A 1SX2A 1I6SA 5C18A 1IY4A 3FKEA 2CEAA 1G0QA 1JWRA 4MM3B 1LSZA 2FYCA 4NSGA 1IP4A 4P16A 4NY5A 4IBKA 223LA 1L00A 1N75A 1HNXM 3ATNA 4NSJA 1LZSA 2DQCY 4RKUF 4IBDA 1J7KA 4LJ4A 4L41A 4I7TA 1GBZA 4I7KA 2D7HA 3DOAA 1Z5CA 3QAUA 4GLAA 3CSRA 4W55A 1QIOA 4DV3M 3HHZA 5KKJA 1GBXA 1OUJA 1QSBA 1T6VL 2DKVA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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