1QUTA

The soluble lytic transglycosylase slt35 from escherichia coli in complex with n-acetylglucosamine
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
sequence length
322
structure length
312
Chain Sequence
MVEPQHNVMQMGGDFANNPNAQQFIDKMVNKHGFDRQQLQEILSQAKRLDSVLRLMDNQGPNGAWLRYRKKFITPDNVQNGVVFWNQYEDALNRAWQVYGVPPEIIVGIIGVETRWGRVMGKTRILDALATLSFNYPRRAEYFSGELETFLLMARDEQDDPLNLKGSFAGAMGYGQFMPSSYKQYAVDFSGDGHINLWDPVDAIGSVANYFKAHGWVKGDQVAVMANGQAPGLPNGFKTKYSISQLAAAGLTPQQPLGNHQQASLLRLDVGTGYQYWYGLPNFYTITRYNHSTHYAMAVWQLGQAVALARVQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of Escherichia coli lytic transglycosylase Slt35 reveals a lysozyme-like catalytic domain with an EF-hand.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Escherichia coli
molecule keywords LYTIC MUREIN TRANSGLYCOSYLASE B
total genus 108
structure length 312
sequence length 322
ec nomenclature ec 4.2.2.n1: Peptidoglycan lytic exotransglycosylase.
pdb deposition date 1999-07-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13406 SLT_2 Transglycosylase SLT domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.8.350 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Helicase, Ruva Protein; domain 3 Bacterial muramidase 1qutA01
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1qutA02
1LJHA 1AT5A 4NGYA 1V7SA 1LJGA 4M6DA 4ET8A 5IDDA 4OWCA 4NSJA 1QDRA 1HNLA 1IWZA 1YILA 1INUA 4AGAA 5FDJA 1NWGA 1D6PA 3T36A 5T3FA 5LYZA 4DD0A 4NWEA 4NIJA 1BHZA 2BQMA 1XGTC 4LGKA 1LSZA 5L3HA 5LYMA 1B7RA 3FE0A 4W96A 4UWVA 5KY1A 4HTNA 1CKDA 1CKCA 1G7IC 1C08C 1LSMA 4HV2A 4MCKA 5F9UA 5FHWA 4DD9A 5FEKA 4Z3MA 1IC5Y 2G4PA 1TEWA 1GD6A 1QIOA 1B7NA 2YBMA 1IORA 1FLUA 4R0FA 1FLYA 1XSFA 2BQJA 1GEVA 1LSCA 2DQIY 1WVUA 3M3UA 2F2NA 1G7MC 1P2CC 2CWIA 2H5ZA 3TXKA 3WUAA 2ZIKA 1LYYA 2FYDA 5HMJA 1LJJA 1LZBA 2W1LA 3HBDA 5D5CA 3AGHA 5B1FA 1B5YA 3AGIA 5C6LA 1NHEA 2LHMA 1IY4A 2BQOA 4LFXA 4J1BA 1D0KA 4WL7A 5I5QA 2F30A 1JJ3A 1LSYA 4WO9A 2BQLA 3E3DA 1LMQA 1V7TA 5F16A 2BQFA 1YKYX 2MECA 3P4ZA 4LZTA 1CJ7A 1LSDA 4NGLA 3BKVA 1JTPL 1OUHA 3WU9A 134LA 1D9UA 1LMTA 4OWBA 1LJFA 5ILCA 1LZCA 1RI8B 4KXIA 4XJHA 5KXXA 3CSZA 3GXRA 4WM2A 3FI7A 5KXZA 1XGRC 5KXKA 1LZNA 1QTKA 3WXTA 1J1XY 1LJKA 3IJUA 4R6CA 2BAAA 4NWHA 3RW8A 4UWUA 1LSAA 4H9FA 4NGWA 5B06A 4WMGA 1IP6A 1YQVY 4HSFA 3CSRA 1IWXA 1GF4A 3A96A 3AYQA 4OWAA 2BQNA 1LKRA 1BQLY 1LZSA 2Z2FA 1IP3A 1HERA 3AZ6A 4NSIA 1REXA 1TBYA 2D4JA 4WO6A 5I4WA 1BWJA 135LA 2G4NA 5D5FA 4DDAA 3W6CA 1IR9A 1IWTA 1IWVA 1NQIA 2YSSC 1GB7A 1MELL 3BKHA 4XJGA 1LYZA 4YEMA 5APDA 194LA 1OQMA 1KXXA 2BQDA 1ALCA 1CKHA 1JPOA 2DQFC 2W1YA 1A2YC 2W1MA 1GF8A 3HFMY 4XJFA 2Z37A 3WU7A 1REYA 1CJ6A 2DQJY 2GV0A 1DI3A 1GDXA 3CQLA 4N1EI 4WL6A 1JEFA 3A93A 4NGJA 3A34A 3GXKA 1G7LC 3P65A 4YM8A 3OJPA 1GE2A 1LZ8A 3P64A 1BB3A 4PGJB 1GFJA 2MEDA 3AJNA 2LYOA 4WG7A 3EXDA 4DD2A 2CGIA 1LZRA 4DC4A 1WTMA 1JTOL 4GCCA 3WVXA 1GAZA 4ETDA 1VEDA 3WULA 1UIDA 4GCEA 1T3PA 4MR1A 4I8SA 3SP3A 1CNSA 5KXOA 1I1ZA 1LZ9A 5APEA 1QSAA 1IIZA 2BQAA 2C8PA 2EQLA 1J1OY 4ETCA 4QGZA 5KXLA 1LHIA 1B5WA 3ATNA 1TDYA 2Z18A 1LPIA 3W6BA 3KAMA 5KXPA 1YL1X 4W94A 1WQPA 1REMA 4TX7A 4OOTA 1HMKA 1IOCA 4BS7A 1UCOA 1OUEA 3LN2A 3EMSA 2DQDY 4FJRA 2YBHA 3A94A 3B0KA 3EO5A 5LVJA 3WUMA 1EQ4A 1LYOA 3P68A 4GCDA 4H92A 1LHMA 153LA 4B1AA 5LXWA 1UIBA 2YBLA 1ZVYB 1C45A 1GAYA 5LVHA 1IWUA 1LZ6A 3A6CY 4M4OA 1EL1A 3J6KA 1GE1A 2DQAA 4GLAA 1DKKA 4ETBA 4C5FA 4RLMA 2D6BA 4WM5A 5I53A 5KXSA 3TXJA 2FBBA 3WXUA 1HFXA 1CKFA 1HHLA 2MEFA 1RE2A 1NF5A 2MEAA 1LJEA 1JUGA 2BQEA 5DM9A 3WUNA 1BGIA 1D0LA 1GB2A 4DD1A 5C6IA 3T6UA 4ZIXA 1RJCB 3QY4A 4N8ZA 3CT0A 3HBEX 1DPXA 4G9SA 4D9ZA 1GHLA 2Z12A 1GB3A 4HJYA 1F6RA 5LVIA 1JSFA 4B4EA 4A7DA 1YIKA 2LYZA 5B05A 2ZILA 3VWOA 1BWHA 5LA5A 4CFOA 5K7OA 4KPMA 5J7CA 2HU1A 4GLVA 2CDSA 4H8YA 2LYMA 1JKCA 1LYSA 4XJDA 1B2KA 2A7FA 4IASA 4DYGA 4YF2A 5E4PA 5E9RA 4BAPA 2XBRA 3CB7A 5LAGA 1IP2A 1G7JC 5I4YA 1QTEA 1JKAA 5KXNA 5ILFA 1NDGC 1NKHA 2BQHA 1E8LA 1QQYA 1LMAA 2BQBA 1GB6A 1KXYA 1GBYA 4H1PA 3ZVQB 1UBZA 4DD7A 2HUBA 9LYZA 1DI4A 3AZ7A 1GDWA 1BVKC 2H9JA 3N9CA 3A95A 3MGWA 1HMLA 1UICA 2Z19A 4LYTA 1LZAA 5DL9A 6LYZA 1OUJA 4H8ZA 5F9XA 1GFHA 1JHLA 1HEWA 4HJZA 4LT0A 1JSEA 3WPLA 3AZ4A 4IATA 1FKVA 1AKIA 5DN4A 4G4CA 2HU3A 2YBIA 3W6AA 4QY9A 5KXRA 1FN5A 3G3BB 1IOSA 1SQ2L 1GB9A 1YKXX 1N4FA 3ZVQA 2XTHA 1GF5A 2ZQ4A 1GFTA 3RZ4A 1OUFA 3A91A 1T6VL 1B7OA 1FDLY 1KIQC 5LINA 1UA6Y 1KIPC 3IJVA 4J0LA 1JWRA 3ULRA 2FBDA 3EBAB 1VAUA 3P66A 1YKZX 1LZDA 1GE3A 4H9IA 3RNXA 1DZBX 1UIAA 1WQRA 1CKGA 3LZTA 1DQJC 5B1GA 1GF0A 3D3DA 3ATOA 1A4VA 4XJIA 4BADA 4NGZA 3WH1A 1GBXA 1IVMA 4P2EA 4II8A 2YVBA 2YBJA 1IWYA 1IOQA 1NBYC 2BQCA 3TXIA 3TXGA 4C3WA 4OOOA 1ZVHL 2HEDA 4NHTA 1VDPA 4QDNA 5DN5A 4H9HA 4RW1A 1OUCA 2Y8PA 1JJ0A 3HBHA 1FKQA 2N5ZA 1D0MA 1IOTA 1LHLA 4TWSA 3B0IA 3QE8A 1HENA 2DQEY 1LZTA 1UIHA 4B0DA 5L3IA 1OUDA 4CGEA 2BLYA 2IHLA 1QUSA 1GB5A 4DWXA 5M1YA 2MEHA 207LA 1F0WA 1IP1A 1I20A 1VATA 4HTQA 4NHPA 4YEOA 1VDQA 4CFPA 5HQ1A 5IHGA 1BB5A 1OP9B 2ZNWY 2EKSC 3OK0A 1SLYA 1C10A 1H87A 1OUGA 2BLXA 1GFGA 4OWEA 1B7LA 1HFZA 2EIZC 4NFVA 1F6SA 3LYMA 1J1PY 1B7QA 4N1CC 1VDSA 4NHIA 1HSXA 4PRUA 1HC0A 1IY3A 2W1XA 2I25L 1GBZA 1HSWA 2BPUA 4X3BA 4CHXA 1GEZA 4O34A 4Z98A 4WLXA 3A3QA 2B5ZA 1DKJA 1LZ4A 3B6LA 1DPWA 1QUTA 1XFPL 1XGUC 5II3A 2ZNXY 1LJ3A 4LYZA 3RU5A 4YENA 5KXMA 4LT1A 4QEQA 4N0JA 5KXYA 4N5RA 1WTNA 4H91A 4E3UA 2YDGA 5I4XA 1LMPA 1LJIA 2ZYCA 2VB1A 4NGKA 1UUZC 1WVVA 4NSGA 7LYZA 1OUAA 4LYCA 3LYZA 4XJBA 4WLTA 1FBIX 3A6BY 1IR7A 1B5XA 3M18B 4H9EA 4NHSA 4PRQA 5KKIA 5L9JA 1IC7Y 1YAPA 1VDTA 2D4IA 4DD3A 1D6QA 5FCPA 4B49A 5JENB 3TMVA 4I0CA 3LZ2A 5DLAA 2ZIJA 1IO5A 4NG1A 1IX0A 3WVYA 5F14A 4WM6A 3A67Y 4J7VA 1LHHA 5B07A 1GBSA 4U3XB 1GFUA 1GF7A 1LMCA 4WOAA 4WM1A 4KT3A 5IELA 2IFFY 2XBSA 4GN3A 4KL7A 1NMMA 1C46A 3TXBA 4ET9A 1LMOA 1GXV2 1NDMC 1LHJA 2EPEA 1CJ9A 4HPEA 1IP5A 4G49A 5APCA 1GB0A 4DT3A 1LZYA 4ZEEA 5EBHA 2D91A 1F10A 1IP4A 1LZ1A 5LVKA 4ML7A 1UIGA 2HECA 2YBNA 1O23A 154LA 1XEKA 1PS5A 2MEGA 2Z39A 4H90A 3W6DA 1WQMA 4WG1A 3AGGG 5KKJA 5KXTA 3IWRA 4H9CA 4AXTA 4DDBA 5LYTA 1OUBA 5FSTA 1JKBA 4EOFA 3CT1A 1LSEA 1W08A 132LA 4XN6A 3A8ZA 1LJNA 2X0AA 4LT3A 3G3AB 3WL2A 4PHIA 8LYZA 3B0OA 4CJ2A 1LSBA 1B7SA 5LAFA 1GE0A 1HELA 1LHKA 1UACY 3K3TA 4MSTA 1REZA 5F81A 5HNLA 1RFPA 1GF9A 2BQGA 1XGPC 1Z55A 4NG8A 4NY5A 5C6JA 1JITA 1GF6A 1W6ZA 2I6ZA 3TMUA 3AW7A 4G4BA 3LHMA 5LIOA 4EMNA 1JJ1A 2Z38A 4TSBA 1I56A 2FYCA 5LA8A 2DQCY 1IC4Y 3AZ5A 1IR8A 3A92A 1YL0X 3WU8A 2HTXA 5A3ZA 5APFA 3B72A 2XJWA 3WPJA 4HTKA 3W3EA 1HEQA 1UC0A 4WM3A 1GB8A 4L41A 3RT5X 1GBWA 1XEJA 4ZFPA 2NWDX 4NGOA 1XGQC 3TXHA 1GXXA 4OW1A 4B4JA 1WQOA 3WPKA 1JIYA 2ZQ3A 1WQQA 4H8XA 4Z41A 1BVXA 1C43A 1H6MA 2A7DA 4H9BA 4B4IA 1BB7A 3LYTA 4NGIA 4PJ2C 5LVGA 2F4GA 4J1AA 1MLCE 2C8OA 1AT6A 3WYHA 5KJ9A 1UIFA 1LZEA 4N9RA 4NGVA 2RSCA 3A90A 3AW6A 5AMYA 4RDSA 2H9KA 1AZFA 1JTTL 4ETEA 4BAFA 1LTMA 4H94A 1B9OA 2HEEA 1LSPA 1ZMYL 1HEPA 2MEEA 1GFEA 3W6FA 4HJVA 2ZYPA 1LCNA 1VFBC 2ZWBA 3TXEA 2DBTA 3TXFA 1DXJA 3WW6A 1BB6A 1GBOA 1EQ5A 1GFVA 4H93A 5B59A 2BQIA 2MEBA 4RLNA 1LJ4A 4WLDA 1LMNA 3WW5A 1DI5A 1QDTA 2I26L 1LSFA 3CSQA 4ANRA 1GE4A 1ZV5L 2LZ2A 1XEIA 4LYOA 1FLWA 2DQGY 1IWWA 2CJLA 1HFYA 1BWIA 193LA 1B0DA 4GCBA 3TMXA 1JISA 1TCYA 4GCFA 1LSGA 1KIRC 1B5UA 1GWDA 5HMVA 3J4GA 2D4KA 4XYYA 3TXDA 3A3RX 5I54A 1C7PA 1HEMA 1PZYA 4OWHA 1LKSA 1TAYA 4XENA 2PC2A 1GFKA 1FLQA 3F6ZA 2G4QA 2BQKA 1IP7A 4HPIA 4NHQA 2HEAA 2Q0MX 3N9EA 5HNCA 2WARA 1UIEA 4LFPA 4IJ4A 4WLYA 3D9AC 2Z2EA 3N9AA 3LYOA 208LA 1EQEA 4ETAA 2HEFA 2MEIA 2DQHY 1B5ZA 3CT5A 3W6EA 1B7PA 1YANA 4YOPA 1HEOA 2HEBA 1YROA 3ZEKA 4UWNA 4LYBA 1YAQA 4TSCA 4FDYA 1G7HC 4XADA 4G4HA 1LSNA 3TMWA 3QNGA 1BB4A 4H9AA 2AUBA 4GN4A 1RCMA 1OUIA 2LZTA 3WMKA 1B5VA 4DDCA 4TUNA 4Z46A 6LYTA 1YAOA 5KXWA 1GPQC 1GF3A 1CJ8A 1QSWA 2F4AA 5A3EA 1GFRA 1NBZC 4TTDA 4NEBA 1HF4A 4NSHA 1LOZA 133LA 1B7MA 1KXWA 1AM7A 4HV1A 4RW2A 4HP0A 4LYMA 1IEEA 4GN5C 1LZGA 5HLLA 1GFAA 4PPOA 4WM4A 5FELA 1YAMA 1JKDA 1LZ5A 1LAAA 1WQNA 2DKVA 3AB6A 4LT2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4NGYA 1AT5A 3HUQA 4S12A 4K5YA 5IDDA 4NSJA 3BXWA 3HUKA 1QDRA 2KRKA 1IWZA 1NWGA 3T36A 5LYZA 1C6BA 4IBKA 4PCZA 1XGTC 4LGKA 3QAKA 3AL0C 3KP0E 1LPYA 3GQ3A 3FRIA 5F9UA 1G07A 1C08C 4MCKA 4DD9A 1G0QA 218LA 1PJTA 1FLUA 1Z59A 4DJHA 1SXJA 1FLYA 4JI2M 1XSFA 1LSCA 3M3UA 4X64M 1P2CC 3TXKA 2LH0A 1D3FA 3WUAA 2FYDA 3HBDA 2Q2EB 4GHLA 2DAMA 230LA 3AGHA 3AGIA 3GRUA 1J5EM 2LHMA 167LA 1IY4A 4J1BA 4L78A 3T1YM 2QARC 1V92A 4K0KM 4WO9A 1LMQA 113LA 3E21A 1CJ7A 142LA 1D9UA 1LJFA 2CUZA 4MGHA 5FTNA 1QUHA 4WM2A 4DQ5A 1LZNA 5EXTA 4R6CA 3GLHB 4MGZE 4B7FA 5EQTA 1YQVY 4HSFA 1GF4A 3OE8A 1L92A 5JI2E 1LKRA 5ILCA 2B74A 5I4WA 3PNVA 1BWJA 4LZJA 5D5FA 1IQPA 4LF9M 1NQIA 2J5YA 2V6ZM 1NJGA 2YSSC 1T3TA 1GB7A 4GMQA 3SAWA 253LA 4W52A 4YEMA 3F92A 2RB0X 1L86A 190LA 4EKPA 1IBMM 4NC6A 2BQDA 1A2YC 2Y20A 5IREB 1TTEA 1YLAA 2XGNA 1GDXA 3HT7A 3GUNA 4NGJA 3A34A 4YM8A 3CDQA 1LZ8A 1L37A 3EXDA 4DD2A 1KS3A 1JTOL 1GAZA 3VLFB 3KS4A 4MR1A 3SP3A 2XEPA 1I1ZA 5APEA 3GLGA 2BQAA 2C8PA 4ETCA 1B5WA 2C98A 1LPIA 2Z18A 1WQPA 1REMA 3SARA 4GC5A 3LN2A 3EMSA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 232L A;  4ARQ B;  1EE8 A;  1ZV5 L;  2LZ2 A;  1L73 A;  1L41 A;  1IWW A;  4QNR A;  240L A;  209L A;  3GRV A;  1L82 A;  1LSG A;  3W68 A;  3CDV A;  1C7P A;  1ORY B;  2QEN A;  2G4Q A;  1IP7 A;  4HPI A;  4NHQ A;  2R65 A;  242L A;  4RNA A;  3D9A C;  1SG9 A;  208L A;  3SB9 A;  1B5Z A;  3GPU A;  3CT5 A;  3LQQ A;  2YQZ A;  1B7P A;  3LMM A;  1HEO A;  2O4W A;  3J7B A;  4FDY A;  1G7H C;  2RBQ A;  4XAD A;  4G4H A;  1LSN A;  1BB4 A;  2KNA A;  5KPR A;  3M0E A;  3WMK A;  2R4E A;  4Z46 A;  5KXW A;  1L26 A;  3ODU A;  1GF3 A;  4JN6 A;  1T97 A;  1NY5 A;  2CV2 A;  4WP2 A;  3WHK A;  1L35 A;  4F1I A;  4HP0 A;  5KPT A;  4DV4 M;  235L A;  1YAM A;  246L A;  1LZ5 A;  2R44 A;  1WQN A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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