4ANRA

Crystal structure of soluble lytic transglycosylase sltb1 from pseudomonas aeruginosa
Total Genus 101

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
101
sequence length
300
structure length
297
Chain Sequence
PQVAEFVSEMTRDYGFAGEQLMGLFRDVNRKQSILDAISRPAERVKQWKEYRPIFISDARISRGVDFWNKHAEDLARAEKEYGVPAEIIVSIIGVETFFGRNTGSYRVMDALSTLGFDYPPRADFFRKELREFLLLAREQQVDPLSLTGSYAGAMGLPQFMPSSFRAYAVDFDGDGHINIWSDPTDAIGSVASYFKQHGWVTGEPVVSVAEINDESAESAVTRGVDPTMSLGELRARGWRTLRDDQKVTAMRFVGDKGIEYWVGLPNFYVITRYNRSAMYAMAVYQLAGEIARARGA

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
3H1 (137-139)EMPTYAH2 (57-66)AH4 (87-94)S6 (289-297)AH3 (71-78)TI1 (182-185)AH8 (162-179)AH5 (97-121)AH6 (125-136)TVIII1 (139-142)3H2 (159-161)TI3 (189-192)TI2 (183-186)AH11 (270-276)TIV1 (194-197)AH9 (201-207)TI5 (210-213)TIV4 (261-264)TII1 (240-243)TIV2 (218-221)AH10 (223-237)S3 (246-251)TIV3 (219-222)3H3 (254-259)S4 (268-269)AH1 (40-53)S1 (145-146)AH7 (147-157)S2 (187-188)TI4 (195-198)S5 (278-279)TIV5 (285-288)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Lyase
source organism Pseudomonas aeruginosa
publication title Calcium-Dependent Complex Formation between Pbp2 and Lytic Transglycosylase Sltb1 of Pseudomonas Aeruginosa.
pubmed doi rcsb
molecule keywords SOLUBLE LYTIC TRANSGLYCOSYLASE B
total genus 101
structure length 297
sequence length 300
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-03-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.8.350 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Helicase, Ruva Protein; domain 3 Bacterial muramidase 4anrA01
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4anrA02
3ZEKA 3CSQA 1AZFA 1JISA 1B5XA 2W1XA 2BQKA 4XADA 1GDXA 4NG8A 2I25L 4KL7A 4I8SA 1XEKA 1IP5A 1YILA 3TXKA 1OUIA 1KXXA 5LYZA 5K7OA 1F0WA 1C08C 3LYTA 5F16A 1BB5A 1GB9A 4CHXA 1OUJA 3A6BY 1LJKA 1HERA 5I54A 1B7MA 7LYZA 1JWRA 1LHKA 4NGVA 2F2NA 1GBSA 1GF8A 2D91A 1GFGA 2FYDA 4M4OA 1LZDA 2CGIA 1LSBA 2HEEA 5JENB 2DQCY 4GN3A 4BADA 1HHLA 3AGIA 1LOZA 1GBXA 1HEMA 1H87A 3A93A 3SP3A 2PC2A 1AKIA 1YAPA 4GCCA 4NGKA 2GV0A 5HQ1A 4A7DA 2DBTA 1LSMA 1XEIA 1GF6A 1LZ5A 1CKGA 3WU7A 4B0DA 1LZ9A 2HEBA 1HC0A 3P68A 1CKHA 1LHHA 1JEFA 4II8A 1GHLA 4PRUA 1FBIX 3WXUA 4H94A 2DQJY 3TMVA 5LVKA 1IO5A 1FDLY 2FYCA 1IWXA 1WQPA 4G4HA 3WUAA 5B59A 4OWCA 1UUZC 2A7FA 1I20A 2HU3A 2YBMA 2XBRA 1GWDA 4N1EI 1RCMA 3BKHA 1C46A 1C45A 1YQVY 2DQIY 4FJRA 4NGJA 3WVYA 1XGUC 5KXLA 1UIBA 2MEDA 2ZQ4A 3B0OA 2H9KA 2BAAA 5D5FA 1KXYA 2HU1A 3HBHA 4DD9A 5C6JA 5IHGA 2BQDA 134LA 5DM9A 1IOTA 1LMAA 5KXRA 3M18B 5KXYA 4WLYA 1XGTC 4CGEA 5LVHA 1GFEA 4QGZA 3WL2A 4WLTA 5B1GA 4NSGA 2MEAA 3ZVQB 4OOOA 1IWWA 2MEGA 1UA6Y 4DD7A 4WL6A 4HTKA 132LA 1LZAA 1EQ4A 1JSFA 1KXWA 1EL1A 3TXIA 4N9RA 1LYSA 2YBIA 1GBZA 5E9RA 4B49A 1REYA 1GE0A 4NHIA 1LSZA 5F9UA 1VDTA 4LYTA 1VDSA 2I26L 4Z3MA 1JKDA 3A91A 4XN6A 3F6ZA 4KT3A 3HFMY 1LJGA 1QTKA 3AZ5A 4MSTA 1HEOA 1BB7A 3N9AA 3OJPA 4DD3A 5LYMA 1HSWA 4NHSA 1DXJA 4RDSA 1B5UA 3IJVA 1WQQA 1QIOA 1NF5A 1BVXA 1RE2A 1LZ4A 3B6LA 5A3EA 1EQ5A 2IFFY 5B07A 3WYHA 2MEHA 2EQLA 2EPEA 4G49A 4WM1A 1VEDA 4HPEA 1IC7Y 1LSDA 3EMSA 4G9SA 4C5FA 1LMOA 1VDQA 4OWAA 4UWUA 208LA 1A4VA 1FLYA 4NIJA 4NSIA 1OUGA 1TEWA 3BKVA 3KAMA 1LHJA 4E3UA 3ULRA 1JKAA 3CSRA 4PHIA 1CKDA 4GCDA 4C3WA 5L3IA 2ZQ3A 4LT3A 4IATA 1JTOL 1HF4A 3J4GA 2D4IA 3AJNA 4MCKA 5FEKA 5KXWA 1ZV5L 4R6CA 4IASA 4NGLA 1IWUA 3VWOA 1D0MA 1B5YA 1LZRA 3W6BA 1FKQA 4TSBA 3T36A 2EIZC 4YENA 3TXDA 4XJFA 5HMVA 4ANRA 154LA 4EOFA 1ZVHL 4PGJB 1B7OA 4QY9A 4P2EA 4N8ZA 2RSCA 4H90A 1CNSA 1DI5A 4DDBA 1GE2A 4H8ZA 1AT6A 1RFPA 4NGWA 2IHLA 2LHMA 1UIFA 1REMA 1FLUA 1IEEA 1MELL 1N4FA 1I1ZA 4H8XA 1LPIA 1RI8B 3LYMA 4J1AA 4Z98A 3WUMA 4NGYA 5I4YA 5KXNA 1VATA 3WMKA 1AT5A 1ALCA 1DQJC 2H5ZA 4N0JA 4GLAA 1QDRA 4ETEA 1JTTL 4PRQA 3ATOA 4WO6A 2BLXA 1LSCA 4W96A 1LYZA 3RT5X 4ZFPA 5I4WA 1UBZA 1F6SA 2YBJA 1YANA 1SLYA 4TTDA 3A6CY 4RW2A 4WG1A 3TXHA 1DPWA 1B7LA 1BGIA 1HEWA 4WO9A 1CJ7A 5F9XA 3AGHA 5KXMA 3IWRA 1F10A 2MEIA 2CDSA 1WVVA 4UWVA 1LTMA 1LZNA 1XEJA 4G4CA 4YF2A 4HTNA 1LYOA 2N5ZA 4FDYA 4WG7A 2DQHY 1G7JC 2C8PA 2Z39A 5L3HA 2LZTA 1LJ4A 4B4EA 2CWIA 3EO5A 4NGIA 2ZILA 1BVKC 3K3TA 5KXPA 3D3DA 4CJ2A 1D0KA 5L9JA 1E8LA 1JHLA 5LXWA 4ZIXA 5B05A 4RW1A 4U3XB 4ETBA 1WQNA 4QDNA 2HUBA 1GFTA 1CJ8A 1GF4A 1GBWA 4CFPA 2MECA 2BQFA 1PZYA 2W1MA 5DL9A 4GCEA 1B2KA 3CT0A 4DDCA 4GCBA 1IOQA 1BB3A 1WQOA 2W1LA 3A67Y 4HV2A 4XYYA 1J1PY 1LSYA 5IELA 5LIOA 4GN4A 4X3BA 4LGKA 3TMUA 1JJ3A 1REXA 1B7NA 1DKJA 2I6ZA 1GDWA 4YOPA 1B7QA 1BB4A 4H1PA 4WMGA 3ZVQA 1QUSA 1LMNA 4YEOA 4B4JA 5FSTA 4GCFA 4RLNA 4WLDA 1FN5A 3P66A 4J0LA 1GXV2 1IWTA 1B0DA 1NDGC 1P2CC 2D4JA 3RZ4A 3T6UA 2F4AA 4WLXA 4ET9A 5APEA 1REZA 1GB3A 5FDJA 5LINA 133LA 1GBYA 1GFHA 1OP9B 1ZVYB 2BQHA 5APDA 153LA 5ILCA 3WW6A 1GE4A 4XJGA 1I56A 3CSZA 1WVUA 2HEAA 1OUEA 2BQMA 2DQEY 1TBYA 2Z2FA 4DD1A 1T3PA 5KKIA 5B06A 1W6ZA 4OWEA 4LT2A 3EBAB 1B7PA 5DLAA 1O23A 1CKFA 1IX0A 3LZTA 5APCA 1D9UA 1B7RA 1B9OA 1VAUA 1LZ8A 3WH1A 4NWEA 3A90A 5M1YA 4NHPA 4PPOA 5T3FA 1UIDA 1IC4Y 4TSCA 4TUNA 3TXEA 4DD2A 1IR9A 4G4BA 3WPKA 3FE0A 1JITA 1LZYA 2XJWA 4HTQA 4YEMA 2BPUA 2D4KA 5LAGA 1XGRC 1C10A 2G4PA 1DI3A 1XGPC 1F6RA 2BLYA 4IJ4A 4WOAA 4WM3A 3HBEX 4HSFA 5HNLA 3EXDA 1YL0X 3RNXA 4HJZA 1GPQC 4H9CA 1IOSA 1CJ9A 4KPMA 1GEZA 1JKBA 4HPIA 5B1FA 4N1CC 4NFVA 1IP6A 1G7HC 1LJJA 3WU9A 2Y8PA 3W6DA 1LHLA 1UCOA 1J1OY 2LZ2A 135LA 4EMNA 4LYBA 3P4ZA 3RW8A 3MGWA 2DQAA 3W6FA 1JIYA 1HFZA 1LSPA 2DKVA 1LSNA 1GFRA 2YSSC 1XGQC 4L41A 3CB7A 5ILFA 4GN5C 1FLWA 4WM5A 5E4PA 4MR1A 3WU8A 6LYZA 4KXIA 1NDMC 1OUFA 1YKYX 5KXSA 4WL7A 1G7MC 3M3UA 2ZYCA 1GFAA 207LA 2Z37A 194LA 3B0KA 1BHZA 3AB6A 3TXBA 1LZCA 4N5RA 1HELA 1QDTA 5EBHA 1BQLY 2ZIJA 1YAOA 2BQGA 3WULA 2DQDY 4H9AA 1NBZC 1WQMA 4AXTA 4XENA 1MLCE 3G3BB 4TX7A 3LN2A 1JTPL 1NWGA 5D5CA 5LYTA 2C8OA 4BAPA 1QTEA 1LJ3A 1B5ZA 1GFJA 3LHMA 4OWBA 1D6QA 1EQEA 4LFXA 1XSFA 3FI7A 2Z2EA 2FBDA 1IP4A 1HEQA 1OUBA 1GB2A 5FHWA 2MEEA 3N9EA 4XJIA 5LVIA 1QSAA 1FLQA 1WTNA 1GXXA 2YVBA 3A92A 1LJEA 4PJ2C 1LZ6A 4Z46A 1BWIA 1HFYA 1GF7A 2ZNWY 3WPLA 1HFXA 4H9BA 4XJDA 1GFUA 4HV1A 1AM7A 4NG1A 1JPOA 2ZNXY 4D9ZA 1IP1A 2XBSA 2G4NA 1YIKA 1YROA 4R0FA 1LMPA 5FELA 3WUNA 5J7CA 4WM6A 5LVJA 5KXZA 3CT5A 1NBYC 3WVXA 1LZEA 1B5WA 2DQFC 3D9AC 5HMJA 1GE1A 1C7PA 3GXRA 4ZEEA 1UC0A 2YDGA 5AMYA 8LYZA 1UICA 1OQMA 1TCYA 5LA8A 3CQLA 3QE8A 4ETCA 1BWHA 1CKCA 3A94A 4LYMA 1GB6A 2F4GA 1LHIA 4H91A 4HP0A 1BWJA 2W1YA 4H93A 1GF3A 2G4QA 1UIAA 1IORA 1D0LA 3LYZA 1IWYA 3A3RX 2HECA 2ZIKA 3J6KA 3TMXA 2Z19A 1FKVA 1LCNA 4DT3A 1H6MA 3TXJA 2BQLA 2VB1A 1OUHA 2Z18A 1SQ2L 3AZ6A 1IY3A 3AGGG 1J1XY 1LKRA 4H8YA 2BQIA 1LMCA 3W3EA 1BB6A 2HEFA 4H9EA 1LJHA 3IJUA 4H92A 2X0AA 1UIGA 1KIPC 1G7IC 4LYOA 3TXFA 5KXKA 5KKJA 5I4XA 1T6VL 1IOCA 1GB8A 1NQIA 1IY4A 4RLMA 2LYZA 4GLVA 1LZSA 1D6PA 4NWHA 2BQCA 1YKXX 3WXTA 1Z55A 4DWXA 3E3DA 1GAYA 3QY4A 2YBLA 4I0CA 1GB7A 5A3ZA 5HNCA 4WM4A 1LSEA 3CT1A 4TWSA 4QEQA 1LZTA 1IC5Y 4H9HA 1LAAA 1HENA 3B72A 1IVMA 1LJFA 2HTXA 4NGOA 5DN4A 1HSXA 3A8ZA 4DC4A 4DYGA 4UWNA 1LKSA 1RJCB 1V7TA 1LHMA 4H9FA 1GE3A 5KY1A 5KJ9A 3A96A 1JKCA 4W94A 1NHEA 1B5VA 4NY5A 1GB5A 4OOTA 4NHTA 2BQNA 5DN5A 4LT1A 1UIEA 3B0IA 1IP2A 3A95A 1TAYA 1WQRA 1C43A 2YBNA 1A2YC 2AUBA 3P64A 1G7LC 1GD6A 9LYZA 3AW7A 1TDYA 1HMKA 1DPXA 3W6CA 2Q0MX 2LYOA 5KXXA 4J7VA 4NSHA 1DZBX 1WTMA 4WM2A 1LSFA 1GAZA 1KIQC 2FBBA 3OK0A 4LT0A 4DDAA 4ETAA 5LA5A 1JSEA 4XJHA 5IDDA 4B1AA 1IWZA 3RU5A 4NHQA 2BQEA 1GEVA 1NKHA 1UACY 3P65A 3TMWA 1IR8A 4BS7A 4ET8A 1VDPA 2A7DA 2BQOA 2Z12A 2WARA 4M6DA 1LMTA 1YAQA 3WPJA 2Z38A 3WW5A 1GF5A 1JJ0A 5I5QA 2H9JA 1LZ1A 2EKSC 2MEFA 1LZBA 1OUCA 4LYZA 2DQGY 1NMMA 4Z41A 5II3A 3ATNA 4LZTA 6LYTA 4DD0A 1V7SA 4NGZA 3G3AB 3HBDA 1LSGA 4H9IA 1QUTA 1PS5A 2D6BA 2F30A 4OWHA 4J1BA 1DI4A 4ETDA 2BQBA 4ML7A 4XJBA 1XFPL 1IIZA 3LYOA 1UIHA 1GBOA 1LJIA 1VFBC 1OUAA 1YKZX 5I53A 1HNLA 1IR7A 5C6LA 2BQJA 2YBHA 1LYYA 1LZGA 2B5ZA 2BQAA 2MEBA 2ZWBA 1IP3A 1JJ1A 2XTHA 1HEPA 1GFKA 3GXKA 5APFA 193LA 2ZYPA 5FCPA 1QQYA 3AZ4A 5LVGA 5F81A 3TXGA 1DKKA 1LSAA 1OUDA 3AW6A 1KIRC 3W6AA 4AGAA 1LJNA 5KXTA 4HJYA 2LYMA 4NEBA 1INUA 4LFPA 4CFOA 1IP7A 5HLLA 3AZ7A 4B4IA 1GF9A 3N9CA 1GB0A 1W08A 4NSJA 5C6IA 4OW1A 3W6EA 1GFVA 1QSWA 3LZ2A 2NWDX 4YM8A 4BAFA 5F14A 1HMLA 1JUGA 2CJLA 1YAMA 1B7SA 1GF0A 4LYCA 5LAFA 2HEDA 1CJ6A 1LMQA 3A3QA 4HJVA 3QNGA 1YL1X 5KXOA 3AYQA 4O34A 1IWVA 1ZMYL 3A34A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3ZEKA 2DAKA 4YY3M 3QWLA 2B3TA 2W82A 3CSQA 2W1XA 3M7GA 3C7ZA 2RAYX 1IP5A 3SBAA 4X62M 1OUIA 4NXMM 1C08C 5F16A 2F5QA 1GB9A 1OUJA 2LZMA 1LJKA 4E97A 3U6LA 7LYZA 1JWRA 4IIWA 1UM8A 3KP1E 1QT6A 2F2NA 2B6ZA 1L2CA 1MX0A 1LSBA 4L16A 2DQCY 4GN3A 1HHLA 212LA 3AGIA 1LOZA 3V76A 1GBXA 1JTNA 1D3FA 3AOEA 3SMSA 1L19A 4NGKA 2LVQD 2GV0A 1XXHB 4P16A 1C6IA 1L31A 1LZ5A 1LZ9A 1JEFA 4II8A 1FBIX 3TMVA 2FYCA 5B59A 3WUAA 1E94E 4K0KM 2XBRA 1WHCA 4N1EI 1D2NA 3GLIA 3U61A 186LA 1I94M 2ZQ4A 1ZURA 1G4AE 5IHGA 1GO5A 2DZOB 1L17A 4WLYA 3FRHA 4CGEA 3L25A 5LVHA 1L69A 4WLTA 3GULA 1GABA 1L52A 1QUOA 1Q39A 1IWWA 2P5TA 3B7QA 1PQIA 4DD7A 1X37A 1QT7A 165LA 5E9RA 1GBZA 1LW9A 2LWXA 2RKOA 2RGOA 1QTHA 1LSZA 2CWBA 4W56A 4YXCA 1VDSA 4Z3MA 1JKDA 2JZ1A 2XZUA 3HFMY 4MSTA 1HQCA 1HEOA 5LYMA 4NXNM 2QBYA 1C6FA 4NHSA 4RDSA 127LA 3GRUA 1ORYB 2OTZX 1BVXA 1L65A 1LZ4A 2RRUA 2IFFY 211LA 3F9LA 2C98A 4WM1A 5EXTA 3K1JA 3KOWE 3T38A 3HH3A 1A4VA 3BKVA 1L32A 4AKGA 4Y28F 1P6YA 1DYCA 1JKAA 3CSRA 4W59A 1L79A 114LA 5L3IA 3TWMA 3J4GA 3HGIA 2RB2X 1OQYA 5KXWA 4IASA 4NGLA 1L96A 1CV3A 1D0MA 1LZRA 3W6BA 4TSBA 4YENA 5HMVA 4ANRA 154LA 4PGJB 4P2EA 4DR2M 4N8ZA 4IBIA 3THGA 1DI5A 4WURA 5IZ7D 4EKSA 4EXMA 4NGWA 4J1AA 1LYHA 1C65A 4NGYA 1L15A 2XSZD 1DQJC 2H5ZA 236LA 1JTTL 3SARA 224LA 4I7NA 2DAMA 1G8PA 1IN4A 1L05A 3MK6A 1WTHA 2KNZA 5DYGA 1LYZA 3RT5X 4ZFPA 3MHVC 3TXHA 1YANA 4RW2A 4FWHA 4WO9A 1BGIA 1L82A 3C80A 183LA 3UONA 3IWRA 3SAUA 1L41A 1LYOA 226LA 2DQHY 2C8PA 4LFCM 1LJ4A 4B4EA 1P5CA 2DHYA 4M9ZA 160LA 3AL0C 1JHLA 1Q3CA 1CUPA 1Y8GA 4ZIXA 2R0IA 1R4GA 115LA 1WQNA 1L02A 3J27B 1CJ8A 253LA 1GBWA 1PZYA 145LA 3GLGE 1L50A 3EMLA 1BB3A 1WQOA 4HV2A 2FS1A 5LIOA 1P7SA 1L67A 4GN4A 4X3BA 3DNAA 1DKJA 3SYKA 166LA 1GKIA 4YEOA 3HU1A 254LA 3JR5A 4RLNA 1FN5A 1OWZA 1NSFA 2JY8A 1IWTA 1B0DA 3GUMA 2LTUA 3T6UA 4W58A 2F4AA 2LHCA 4WLXA 1GB3A 5EP4A 3ZCBB 5ILCA 1SSWA 2O4WA 2R45A 1CU3A 1I56A 217LA 1QANA 2LVNC 1ZMVA 2Z2FA 2LXEA 4AG6A 1T3PA 3JR6A 107LA 2EO2A 2D7EA 1W6ZA 4LT2A 4F1IA 4HEOA 3TWKA 3GLGB 1GJTA 5DYIA 1CKFA 1IX0A 1O23A 3RFWA 1D9UA 5APCA 1L59A 4NWEA 198LA 2GQFA 4NSRA 1LYEA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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