4ANRA

Crystal structure of soluble lytic transglycosylase sltb1 from pseudomonas aeruginosa
Total Genus 101
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
101
sequence length
300
structure length
297
Chain Sequence
PQVAEFVSEMTRDYGFAGEQLMGLFRDVNRKQSILDAISRPAERVKQWKEYRPIFISDARISRGVDFWNKHAEDLARAEKEYGVPAEIIVSIIGVETFFGRNTGSYRVMDALSTLGFDYPPRADFFRKELREFLLLAREQQVDPLSLTGSYAGAMGLPQFMPSSFRAYAVDFDGDGHINIWSDPTDAIGSVASYFKQHGWVTGEPVVSVAEINDESAESAVTRGVDPTMSLGELRARGWRTLRDDQKVTAMRFVGDKGIEYWVGLPNFYVITRYNRSAMYAMAVYQLAGEIARARGA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Calcium-Dependent Complex Formation between Pbp2 and Lytic Transglycosylase Sltb1 of Pseudomonas Aeruginosa.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Pseudomonas aeruginosa
molecule keywords SOLUBLE LYTIC TRANSGLYCOSYLASE B
total genus 101
structure length 297
sequence length 300
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-03-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.8.350 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Helicase, Ruva Protein; domain 3 Bacterial muramidase 4anrA01
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4anrA02
2BQKA 1GFEA 2BQIA 4H9FA 3FE0A 4QGZA 3G3AB 1YAOA 5KXNA 4N1CC 3ATNA 2Z38A 1HC0A 1B0DA 1INUA 1LZSA 3QNGA 2HU1A 4EMNA 3HBHA 1JKCA 5LA8A 5L9JA 1IC5Y 1HEWA 1NQIA 1QDTA 1GE4A 4H93A 2EIZC 4WOAA 1GB6A 1CKCA 4UWUA 7LYZA 4H92A 2ZNXY 4WO6A 5A3ZA 1HELA 1ZVYB 5KXPA 4XN6A 1REZA 2H9JA 4XJIA 1IP6A 2I25L 1LTMA 4H1PA 3AZ6A 2VB1A 3TMUA 4HJYA 4MSTA 1IORA 1GB3A 1FLWA 4M6DA 4DDAA 1LMCA 4X3BA 4TSCA 4LYOA 1TCYA 1HMKA 1RCMA 4YEOA 3TXGA 1BHZA 4OWCA 5IELA 1LHHA 1C43A 4GN3A 1LSGA 1LSEA 2EPEA 4R6CA 5DN5A 1MLCE 2MEGA 2ZYCA 1XSFA 4GCEA 5HMJA 2EKSC 132LA 5KXRA 4NFVA 1WQRA 207LA 2IHLA 1DPWA 5L3HA 5FCPA 4IASA 2H9KA 5LAFA 2DQCY 4PRQA 1IP2A 1EQEA 1HEPA 2ZILA 3AZ4A 3TXBA 4AGAA 4A7DA 3BKHA 1XEKA 3WPKA 5A3EA 1GF6A 1CJ7A 1IR7A 1LJEA 4ET8A 1LJJA 1LJ3A 1LMQA 5KKJA 1GHLA 5APCA 4NY5A 4ETEA 5C6LA 1WTNA 2CWIA 4YENA 1GFAA 3T36A 4O34A 1UIEA 1VEDA 4H9IA 2YBMA 4HV2A 3WW5A 5JENB 5LXWA 1PS5A 1GE2A 1JIYA 1GFRA 1YKXX 1D0MA 1LZ6A 2YBJA 1LZDA 2FBDA 4CFPA 1LHKA 3EBAB 4TWSA 1C08C 1YKZX 1HSXA 9LYZA 1ZMYL 5HMVA 1LZ8A 2CGIA 2HTXA 1KXXA 1LJHA 1VDQA 4CJ2A 3W6EA 1YIKA 4H8ZA 1LPIA 3WU7A 1G7IC 1F6SA 208LA 1YAQA 2IFFY 2MEHA 1AT5A 1IWWA 3AZ5A 1KIPC 4NHPA 4UWNA 1FDLY 1MELL 4WG1A 5II3A 4C5FA 4GCFA 3KAMA 3IWRA 3CSQA 2YDGA 1JPOA 2W1MA 2DKVA 2DBTA 3LN2A 2D91A 5E4PA 133LA 3B6LA 4LYCA 4YF2A 2F2NA 3GXKA 4ET9A 1AT6A 4H8YA 1GF0A 1GPQC 8LYZA 4NSJA 1LSMA 1LYZA 1LZ5A 1LSDA 5DM9A 1JUGA 1GB0A 3WXUA 2HECA 4R0FA 4UWVA 4OWEA 1JSEA 1UIGA 2Z19A 1HHLA 4H91A 1XGUC 3W6DA 4NEBA 4M4OA 2D6BA 1QSAA 5KXSA 6LYTA 3AGHA 1LYSA 1NDMC 4TTDA 5FEKA 4DYGA 1LHIA 1B7OA 1LMTA 1B7PA 2LYOA 3A92A 5IDDA 3CT5A 4G4HA 154LA 3B0OA 4H9EA 1NKHA 3A3RX 134LA 2HUBA 1GEVA 4IATA 4FDYA 4IJ4A 3WU8A 2FBBA 3OK0A 2XJWA 1D0KA 2BPUA 2F4GA 1CNSA 4XJGA 2FYCA 1NBYC 1QSWA 1TAYA 2EQLA 1T3PA 4TX7A 4DD1A 2MEIA 1LSZA 5DN4A 1GWDA 2MEFA 1YL1X 4WL7A 1G7JC 1UACY 1GBYA 1GF5A 4RW2A 4ANRA 1C7PA 4N8ZA 1B5VA 153LA 5ILCA 1LSBA 4N1EI 5KXYA 4WG7A 1XGRC 5F14A 1GB7A 1GFTA 4TUNA 1B7QA 1GBOA 2BAAA 3A6BY 2YBHA 4BS7A 3A8ZA 1HEOA 1O23A 2MEAA 4NHIA 1IVMA 1YAMA 2HEFA 4B4JA 135LA 3LYTA 1YL0X 2W1LA 4FJRA 1JKDA 5APDA 4NGKA 5KY1A 1FBIX 2YSSC 3N9AA 1CKDA 2BLYA 3LYZA 4N0JA 1B5WA 3AW7A 1NF5A 3A96A 3HBDA 1GAZA 1LZ4A 4LT0A 2Z18A 1RJCB 1VDSA 1Z55A 5F81A 1OUEA 4OOOA 5HQ1A 1LZEA 1NMMA 1WVVA 1LZYA 4HTNA 4DT3A 1GDXA 3A90A 1N4FA 2LZTA 2HEEA 1CJ6A 1LZGA 2ZYPA 3W6FA 3TXDA 3EMSA 1JEFA 3VWOA 2YBIA 5I4WA 1CJ8A 1CKGA 1LHJA 1IR9A 4NWEA 1LZBA 1D9UA 1YROA 4WM3A 5B05A 5I53A 3TMVA 5B06A 1WTMA 3GXRA 1C45A 4PJ2C 5KXXA 5LAGA 4C3WA 1OUAA 4CGEA 1DI5A 4DD3A 1IY3A 1QDRA 4KPMA 3P68A 4LYBA 4YOPA 5D5CA 5B1GA 1LZ1A 4WM6A 5HLLA 1YKYX 4DD2A 4ZEEA 5C6JA 1IX0A 1D6QA 1JJ3A 1GBZA 1JSFA 4NGJA 2DQHY 3FI7A 1SLYA 2DQIY 1IO5A 1BB4A 5K7OA 1JTPL 1GFKA 5ILFA 5E9RA 5I4XA 4KT3A 1OUJA 1IOCA 3WYHA 1W08A 3CT0A 4LFXA 1DI3A 2BQMA 1LCNA 2F30A 5AMYA 2HU3A 1A2YC 1HEQA 4WM4A 3K3TA 1G7LC 2BQBA 2ZQ4A 1OUGA 3ZVQB 2LYMA 1GBSA 1B7NA 1HNLA 2W1XA 3WH1A 1QUSA 2HEDA 5KJ9A 2MEDA 3WXTA 1B5UA 1LYYA 1B7SA 1I1ZA 1HENA 2ZWBA 1IP4A 1AM7A 1LHMA 3D3DA 1VATA 1IR8A 4U3XB 5LVIA 4NHTA 3M18B 1LKSA 2N5ZA 1AZFA 2XTHA 5KXLA 1IC4Y 3CT1A 4CFOA 1GDWA 1GFJA 2X0AA 3WUNA 1DQJC 4NGLA 1GFHA 3HBEX 3WUMA 1IP7A 2XBRA 4QEQA 1OP9B 3W6AA 5HNCA 1TDYA 5KXZA 5FSTA 4WLXA 1YANA 4G4BA 4NGOA 4RLNA 2HEAA 4XJFA 5C6IA 4RLMA 1LKRA 2HEBA 3LHMA 3ATOA 3WL2A 1GB2A 2D4IA 4P2EA 4H90A 1WVUA 1G7MC 4NWHA 1BVKC 3J4GA 1UIHA 1FLUA 2Z37A 3B0KA 1B9OA 3N9CA 2BQEA 3W6CA 2Z2FA 4H9HA 4Z98A 5LVHA 1B2KA 3IJUA 1KIRC 1V7TA 1JITA 1BWHA 1LHLA 1YQVY 2BQJA 2I6ZA 4W94A 5LYZA 3CSZA 1LMOA 1LAAA 5HNLA 5I4YA 6LYZA 1GE0A 1I56A 1LSYA 4HTQA 4HPIA 5DL9A 1QIOA 3BKVA 1BQLY 1FKQA 1FN5A 1NWGA 4HJZA 3F6ZA 3WW6A 2BQHA 2G4PA 1VFBC 4WL6A 3RW8A 1XGTC 4OWAA 4LGKA 1LMNA 3LZ2A 4EOFA 4Z46A 2B5ZA 4HV1A 4AXTA 1UUZC 3P4ZA 2MEBA 4H9AA 4XADA 1IP5A 4E3UA 4WLTA 5KXKA 3AB6A 1UIAA 3CQLA 3AGIA 3A34A 1IWZA 4BAFA 1LMAA 1KXYA 1W6ZA 1AKIA 3WUAA 5KXTA 1JKBA 2BQDA 2MEEA 1LJFA 3ULRA 2MECA 1OUBA 4NGIA 1EQ4A 2A7FA 2DQDY 3B72A 2XBSA 4WLDA 5KXWA 5LINA 2A7DA 2FYDA 3WPJA 1LJGA 1IC7Y 1LZRA 3AYQA 2ZQ3A 1BWIA 4WM1A 1BWJA 1LJIA 3A91A 5B59A 2BQAA 4RW1A 4ETDA 4B4EA 4LFPA 3QY4A 2LYZA 1NDGC 1IWUA 4DDCA 2C8PA 3AW6A 1YAPA 4NHSA 1LZTA 3J6KA 2CJLA 3B0IA 1XFPL 1LJNA 1ZVHL 2YVBA 4B4IA 1IOQA 1TEWA 3WULA 4WLYA 1HMLA 1LZNA 4NSIA 4B0DA 1GFUA 3AJNA 1LZAA 4LT3A 1KIQC 1JTOL 4GLAA 2Z12A 4ETBA 1DKKA 4Z3MA 1FLQA 3A67Y 1OUDA 1HERA 1RI8B 1BB7A 3AGGG 5LIOA 4DC4A 4NSGA 2Z2EA 4NG1A 5B07A 1OUFA 1B7RA 2Y8PA 1JHLA 1OQMA 1OUCA 3TMWA 5L3IA 5B1FA 2Q0MX 3W6BA 5M1YA 3OJPA 194LA 2RSCA 1H87A 2BQCA 1GF3A 4NGWA 1IWVA 1B5ZA 3W3EA 1KXWA 4ZIXA 4I8SA 1F10A 4G49A 1QTEA 4OOTA 1IOSA 1B5XA 3RT5X 4WM2A 1UBZA 3TXJA 2AUBA 4XJHA 1UIFA 3TMXA 4YEMA 1IP1A 3HFMY 1XEJA 1BB3A 1LZ9A 4H9CA 1GF9A 1UC0A 1GE3A 3P65A 4LYMA 1I20A 1SQ2L 1BGIA 2DQAA 4PRUA 5D5FA 3RU5A 3TXFA 2ZIJA 3TXKA 5LVGA 4B49A 4HJVA 1LSFA 1WQNA 1IY4A 1GF7A 3WU9A 1LOZA 1D0LA 1RFPA 4HP0A 4ETAA 1GXXA 2YBNA 5KXMA 4DD9A 1JTTL 2DQJY 4ML7A 4II8A 3TXHA 3T6UA 4J1BA 2H5ZA 3M3UA 1LJKA 1IIZA 1ZV5L 2ZIKA 1IWXA 3EO5A 1LJ4A 3TXIA 1B7MA 1GB9A 1GE1A 1WQMA 1GFVA 1REXA 2LZ2A 2D4JA 4MCKA 2BQOA 4ETCA 1OUHA 4XENA 1LSCA 2LHMA 4ZFPA 4MR1A 2BQFA 3WVYA 3LYMA 1HFXA 1GAYA 1QTKA 3A94A 1QUTA 2PC2A 2GV0A 1GFGA 1FLYA 4NGZA 1JJ0A 1LYOA 1REMA 1UA6Y 4NSHA 1T6VL 4QDNA 4DWXA 3AZ7A 4HSFA 2Z39A 4PHIA 5EBHA 2DQGY 1VAUA 3QE8A 4PGJB 3WMKA 1J1XY 4NGVA 4OWHA 3ZVQA 5LYMA 4WO9A 1CKFA 4BADA 1QQYA 1NBZC 4GLVA 1YILA 3EXDA 5KKIA 2D4KA 5APEA 1JISA 4H8XA 1BVXA 5APFA 1IWTA 5IHGA 1TBYA 1DZBX 3LYOA 1VDTA 2BQNA 3MGWA 3CB7A 4PPOA 4G4CA 4QY9A 1IP3A 4HTKA 4D9ZA 4Z41A 1HFZA 3RNXA 4N5RA 4LZTA 1PZYA 1B5YA 1XGQC 1GF4A 5FELA 4YM8A 1XGPC 1VDPA 4H94A 2WARA 1B7LA 1GB8A 1JKAA 4DD7A 4J0LA 1BB5A 3G3BB 1BB6A 4KXIA 2YBLA 4TSBA 4GCCA 2C8OA 1JJ1A 2G4NA 1F6RA 5DLAA 4G9SA 3IJVA 4WM5A 5F16A 1UIBA 1IOTA 1GB5A 5KXOA 4HPEA 1HFYA 4GN5C 1C10A 3ZEKA 5J7CA 2DQEY 3A95A 5LA5A 193LA 3A3QA 2ZNWY 3A6CY 4LYZA 3SP3A 4B1AA 4NG8A 4NIJA 1UIDA 4OW1A 3P66A 5LVKA 5LVJA 4GCDA 1GD6A 1RE2A 1IEEA 4H9BA 1EL1A 4CHXA 5I54A 2CDSA 1OUIA 4W96A 3TXEA 1EQ5A 1HF4A 1LSPA 1E8LA 5LYTA 1LZCA 2BQLA 1GBXA 1H6MA 1A4VA 4J1AA 1D6PA 1CJ9A 1P2CC 1REYA 4J7VA 4OWBA 4DDBA 1IWYA 4GN4A 4GCBA 1WQQA 1J1PY 4L41A 1GEZA 4N9RA 4NHQA 4XJBA 3RZ4A 1J1OY 1HSWA 1LSNA 1F0WA 1GBWA 1GXV2 1C46A 1DPXA 2F4AA 3E3DA 1LMPA 5FDJA 1HEMA 1JWRA 4LT1A 4LT2A 2DQFC 4NGYA 3D9AC 4DD0A 4BAPA 2W1YA 1CKHA 1XEIA 4KL7A 4RDSA 5I5QA 1DI4A 4WMGA 4XYYA 1LSAA 2NWDX 1UICA 1DKJA 2G4QA 3A93A 1UCOA 3N9EA 4LYTA 5F9UA 1GF8A 2BLXA 3WPLA 1DXJA 4XJDA 5FHWA 3WVXA 2BQGA 1NHEA 1FKVA 1WQPA 3LZTA 1ALCA 3CSRA 3P64A 4I0CA 5F9XA 2I26L 5T3FA 1V7SA 1WQOA 1G7HC
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1D9WA 1GFEA 3LVWA 3G3AB 5KXNA 2HU1A 3QWLA 5L9JA 1NQIA 2R46A 3DKEX 4LJ4A 1D3JA 1GE4A 4WO6A 4LFCM 1JQUA 4M9SA 1REZA 4XN6A 3D8LA 3T15A 2H9JA 1IP6A 4LGMA 1IBMM 144LA 1C67A 4DDAA 4I4LA 196LA 1OWYA 4LYOA 1LHHA 1TR8A 2VIIA 1CV5A 2QHOB 4GN3A 2EPEA 1LSEA 4I7PA 4NXMM 2ZYCA 5L3HA 1L40A 5LAFA 1L47A 1EQEA 3TXBA 2ZILA 1PQKA 2EUCA 177LA 1GL6A 250LA 2J7OA 3BKHA 5A3EA 4B7FA 3DN2A 1IR7A 3NY8A 4AI6A 1LMQA 5KKJA 4KO8A 4O34A 1VEDA 1L92A 5JENB 1L55A 3VKHA 1GFRA 1YKXX 1L43A 1LZDA 2YFQA 4GEWA 4IBJA 1ZURA 4L8RC 2FBDA 4TWSA 2HTXA 2DAIA 3OE9A 1L57A 4WW0A 3U61B 4JI8M 1R5LA 4HL4A 1LPIA 1IY2A 4L6V6 4LZZA 2MEHA 3D4SA 4BLCA 1AT5A 3VW7A 3KDSE 1ZMUA 4I5SA 1C64A 4I7OA 1ORYB 4C5FA 1I94M 3KAMA 2DKVA 4DR3M 2D91A 1WGLA 3B6LA 4LYCA 3GXKA 4ET9A 184LA 1AT6A 1VQ1A 5DYIA 4DR7M 2VF7A 1GPQC 4NSJA 2NTHA 1XJTA 2V1CA 3FUUA 1I6SA 1J7KA 3DA1A 4GHLA 1KNIA 1J5EM 3GUNA 3GUKA 4HEOA 4MB7A 4AQYM 2VDBB 1XGUC 3B9PA 3I4YA 3C81A 4DV1M 5EP1A 5FEKA 4G6ZA 1L50A 3A92A 2LYOA 1L02A 2JWSA 3UJNA 1MU5A 4H9EA 4YXAC 2HUBA 3W68A 2QENA 2QP9X 3WU8A 2FBBA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 1D9W A;  1GFE A;  3G3A B;  5KXN A;  2HU1 A;  5L9J A;  1NQI A;  3DKE X;  1D3J A;  1GE4 A;  4WO6 A;  1JQU A;  4XN6 A;  1REZ A;  2H9J A;  1IP6 A;  144L A;  1C67 A;  4DDA A;  196L A;  1OWY A;  4LYO A;  1LHH A;  1CV5 A;  4GN3 A;  2EPE A;  1LSE A;  4I7P A;  2ZYC A;  5L3H A;  1L40 A;  5LAF A;  1L47 A;  1EQE A;  3TXB A;  2ZIL A;  1PQK A;  177L A;  3BKH A;  250L A;  5A3E A;  3DN2 A;  1IR7 A;  3NY8 A;  1LMQ A;  5KKJ A;  4O34 A;  1VED A;  1L92 A;  5JEN B;  1L55 A;  1GFR A;  1YKX X;  1L43 A;  1LZD A;  1ZUR A;  2FBD A;  4TWS A;  2HTX A;  3OE9 A;  1L57 A;  1LPI A;  2MEH A;  3D4S A;  1AT5 A;  3VW7 A;  1C64 A;  4I7O A;  4C5F A;  3KAM A;  2DKV A;  2D91 A;  3B6L A;  4LYC A;  3GXK A;  4ET9 A;  184L A;  1AT6 A;  1GPQ C;  4NSJ A;  2NTH A;  1XJT A;  1I6S A;  1KNI A;  3GUN A;  3GUK A;  1XGU C;  3C81 A;  5FEK A;  1L50 A;  3A92 A;  2LYO A;  1L02 A;  4H9E A;  4YXA C;  2HUB A;  3WU8 A;  2FBB A;  2XJW A;  4DQ5 A;  1QS5 A;  1G1V A;  2MEI A;  4EKP A;  1GBY A;  1GF5 A;  1C7P A;  153L A;  1LSB A;  4N1E I;  257L A;  1XGR C; 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