4ANRA

Crystal structure of soluble lytic transglycosylase sltb1 from pseudomonas aeruginosa
Total Genus 101
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
101
sequence length
300
structure length
297
Chain Sequence
PQVAEFVSEMTRDYGFAGEQLMGLFRDVNRKQSILDAISRPAERVKQWKEYRPIFISDARISRGVDFWNKHAEDLARAEKEYGVPAEIIVSIIGVETFFGRNTGSYRVMDALSTLGFDYPPRADFFRKELREFLLLAREQQVDPLSLTGSYAGAMGLPQFMPSSFRAYAVDFDGDGHINIWSDPTDAIGSVASYFKQHGWVTGEPVVSVAEINDESAESAVTRGVDPTMSLGELRARGWRTLRDDQKVTAMRFVGDKGIEYWVGLPNFYVITRYNRSAMYAMAVYQLAGEIARARGA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords SOLUBLE LYTIC TRANSGLYCOSYLASE B
publication title Calcium-Dependent Complex Formation between Pbp2 and Lytic Transglycosylase Sltb1 of Pseudomonas Aeruginosa.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas aeruginosa
total genus 101
structure length 297
sequence length 300
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-03-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.8.350 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Helicase, Ruva Protein; domain 3 Bacterial muramidase 4anrA01
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4anrA02
3IWRA 1LZ5A 1GB9A 1BB7A 1BB5A 2GV0A 4AGAA 4NHPA 1LHIA 4NFVA 208LA 3HBDA 4CFPA 4WM2A 1BB6A 1IWUA 1WTNA 4HP0A 1VDSA 4CGEA 1J1XY 4KPMA 1B5ZA 4TSCA 4DC4A 4NGLA 1GE1A 3A34A 3AGHA 4GLVA 5I53A 2B5ZA 3TXGA 1AZFA 4OW1A 1G7HC 2YBIA 4NWEA 2FBBA 4H93A 1FN5A 3G3AB 4WMGA 1IIZA 1GB8A 4B4IA 4GN4A 1CKFA 4DYGA 4HJZA 4TX7A 2EKSC 4YEOA 5LYTA 2C8OA 2ZYPA 5I4WA 1OUCA 2YVBA 4TSBA 3A6CY 1SQ2L 1JJ3A 4ETDA 1MLCE 3W6FA 1YANA 1BB4A 1LSZA 4QEQA 5LINA 1JJ0A 2IFFY 1MELL 3D9AC 2MECA 1QUTA 4N5RA 4NGIA 1RJCB 4NHSA 4UWVA 4XJGA 4DWXA 5JENB 5LAFA 1GBYA 2W1LA 2ZIJA 1WVUA 1LHMA 1FBIX 1GPQC 4YOPA 3AGGG 5DN4A 3SP3A 3TXEA 1GB0A 1B5XA 1DI5A 1HEMA 1QDTA 3AZ6A 4FJRA 1GBXA 1GHLA 5FELA 1IP7A 2DQJY 3EO5A 4N1EI 4A7DA 4OOOA 1OP9B 2BQIA 3TXBA 2ZNWY 1LSCA 2Y8PA 134LA 1GE0A 1UIEA 1XGPC 3B6LA 3K3TA 4H9BA 4H8XA 3EBAB 4HPIA 3P64A 4IATA 4LYBA 1OUBA 3LZ2A 3N9CA 1UUZC 5DN5A 1IWYA 4YEMA 5M1YA 4GLAA 4LYTA 3TXIA 1LHLA 2BQCA 5KXOA 4NGJA 5KY1A 1F10A 2HEAA 1LSGA 1UBZA 4LYZA 3TXHA 2HEDA 1GDWA 1TBYA 3B0KA 1P2CC 1NBYC 1IVMA 1IR8A 1JISA 4EOFA 153LA 1BVXA 2ZWBA 1W08A 5LVJA 1W6ZA 4QGZA 4NSGA 2NWDX 1C08C 1F6RA 154LA 2G4PA 2G4QA 1LJKA 4P2EA 1IEEA 2YBNA 5FHWA 2Z18A 1AKIA 6LYZA 1YL0X 3WUAA 1GB2A 4H90A 2BPUA 5KXLA 5HMJA 6LYTA 1LZ9A 3TMVA 4M6DA 1LAAA 1LMOA 1FKVA 2BQOA 2CWIA 1YKXX 3BKVA 1DI4A 1EQ5A 2YSSC 2IHLA 4NG1A 3QNGA 1XGTC 3EMSA 4GN5C 3G3BB 5B59A 1IC5Y 3M18B 3OJPA 3WU8A 4RDSA 4H1PA 2HECA 3A90A 1B2KA 3LHMA 4X3BA 1IR9A 1CJ6A 1D6PA 1EL1A 1LSEA 2XBRA 1LMPA 1C46A 3W6AA 4BAPA 3EXDA 1BHZA 4ETEA 1LJFA 1LHJA 5B07A 1FLUA 3W3EA 2XBSA 1UICA 5FSTA 1VFBC 1JSEA 2H5ZA 1LSAA 2A7DA 1JPOA 4NSHA 3RZ4A 1IOTA 3RNXA 1GB5A 1IX0A 3WW5A 3WPKA 1KIQC 1TAYA 3A92A 2F4AA 2BQFA 1GB7A 2LZTA 2DQCY 1HHLA 3A91A 4H91A 4G4HA 1IOSA 3RU5A 1IWVA 3AZ4A 5J7CA 3W6CA 1WQQA 5KXSA 4LYOA 4NHTA 1UIAA 4ML7A 1D6QA 5HNCA 4R0FA 3P66A 3CSRA 4WLTA 2A7FA 1REZA 1A4VA 1OUGA 3CSQA 1B7RA 1C45A 4OWBA 1OUEA 1PZYA 1GXV2 2ZQ4A 1LYOA 4G4CA 4C5FA 4QY9A 1ZVHL 5LXWA 4U3XB 1NKHA 2HEBA 3WULA 4L41A 1GE3A 2HEFA 3B0IA 3LN2A 3J6KA 4NEBA 1JHLA 1GAYA 1TEWA 1DXJA 3A93A 5F9XA 3RT5X 1DZBX 1NHEA 4WM1A 4WO9A 4HV2A 1QTKA 4W94A 2HUBA 3CT0A 4H8YA 4PJ2C 4RLNA 2Q0MX 4XENA 3VWOA 1EQ4A 1GF3A 3TXKA 1HERA 1HFYA 4GCFA 3B72A 3TXJA 1OUIA 2Z39A 2AUBA 2XJWA 4LFPA 1D0KA 4LT2A 4NGKA 4II8A 5KXKA 1XGRC 1VDTA 1LZ1A 5B05A 1D9UA 1HENA 2D6BA 4NG8A 1C10A 3P65A 3ZVQB 1DKKA 1YILA 5I4YA 1JUGA 2DQEY 2ZYCA 1B0DA 4NIJA 5KXTA 4B49A 4MR1A 1LZ8A 4WM6A 1LHHA 1LZEA 1GF5A 4TTDA 5AMYA 3WU9A 5C6IA 1IP1A 1OUAA 1PS5A 4BADA 1LSYA 1HEWA 1QSAA 4XADA 4C3WA 1GE2A 2MEDA 4B4EA 4J0LA 4PRQA 1WQRA 2BAAA 2FYCA 4LYMA 4DD7A 7LYZA 4Z3MA 1BWJA 4N0JA 4ZFPA 1NWGA 4NHIA 4ZEEA 1GFKA 1DQJC 1LJ4A 2ZILA 2HU1A 3HFMY 4LFXA 4EMNA 3A6BY 5L3HA 4RLMA 1JEFA 3IJUA 3WW6A 4PRUA 3N9AA 5LYMA 1LHKA 4LT0A 4XJIA 3BKHA 2BQDA 5KJ9A 1YIKA 3CSZA 4I8SA 4J1BA 1IWZA 5A3EA 2H9KA 5LAGA 3OK0A 2W1YA 1H87A 2HEEA 3MGWA 1H6MA 5I5QA 2EIZC 4H9FA 2BQLA 5LVGA 1KXWA 1AT5A 1HNLA 1LZRA 1UIGA 2DQFC 4GN3A 2F30A 4NGWA 4W96A 1LJNA 4PGJB 5HMVA 1LZCA 2BQHA 2YBLA 1NQIA 1QDRA 4KXIA 1WQMA 1GFHA 1LKSA 5A3ZA 4OOTA 4WG7A 1BWHA 1LZBA 3WPJA 5F9UA 9LYZA 5E4PA 1LTMA 1FKQA 1LYZA 1JTPL 2BQJA 1CJ8A 1BQLY 3W6BA 1B9OA 3TXDA 4NWHA 3WVXA 1LZTA 1XGUC 1HMKA 4G9SA 4N9RA 1GF4A 4DDBA 5KXWA 1NBZC 1HC0A 1A2YC 3AW6A 5C6JA 3LYOA 2MEIA 1LZ4A 4XJDA 4CJ2A 5EBHA 3ZVQA 1RE2A 5KXXA 5IHGA 4XJBA 1DPWA 4BAFA 2DQAA 2I6ZA 1J1OY 4GCEA 5B1FA 1XFPL 4WG1A 3A8ZA 4DDCA 2LYZA 1ALCA 4NSJA 5APEA 2N5ZA 3B0OA 4LGKA 3CB7A 2LYOA 4UWNA 4HTNA 1LZGA 2EPEA 4NGZA 3HBEX 4OWAA 1VAUA 4H9EA 1VDPA 1GB3A 4YM8A 1GFGA 1NMMA 2C8PA 2MEBA 5KXZA 2Z37A 1JITA 1LSDA 5F81A 4ETBA 2BLYA 4LT1A 2F2NA 1FLQA 4GCCA 5E9RA 5KKJA 1DI3A 4NGYA 4Z98A 1JWRA 1GFJA 1XSFA 1LPIA 5K7OA 1FDLY 1HEQA 4WL6A 5LVIA 2BQGA 4D9ZA 1BVKC 3A3RX 3CT1A 5I54A 1C43A 4YENA 1GBOA 1LMCA 4FDYA 1GFUA 4WO6A 5LVKA 4HTKA 1TCYA 1IY3A 1BB3A 5ILCA 2ZQ3A 1GF8A 5KXMA 1E8LA 3WH1A 1LZAA 3AZ7A 4WLXA 4DD1A 1G7LC 2D4IA 2HTXA 1J1PY 193LA 4XN6A 4ET9A 3TXFA 1IOQA 1B5UA 1IP4A 2D4KA 3M3UA 5HNLA 5LA8A 1VEDA 1JKCA 4NGOA 132LA 1GDXA 1GEVA 1UA6Y 1UIBA 2G4NA 1Z55A 2MEGA 4HPEA 5APDA 4ET8A 1LJIA 5I4XA 2DQGY 1F0WA 1RI8B 1YKZX 1N4FA 2W1XA 1GFTA 2W1MA 1F6SA 1JKBA 2I25L 4NSIA 3WMKA 1WVVA 1LYYA 5APFA 4DD0A 1HF4A 1LMNA 5F14A 5KKIA 4G49A 1XEJA 4KL7A 4QDNA 1EQEA 1IWWA 1GAZA 4XYYA 3T6UA 2DQHY 1HSWA 5T3FA 3FI7A 1VDQA 1IR7A 4OWHA 1JTOL 2H9JA 4DD9A 2DBTA 1JJ1A 1UACY 5D5CA 1NDMC 2BQNA 1CNSA 1LMQA 1UIFA 1UIDA 1D0MA 2YDGA 3GXKA 3GXRA 4TWSA 3LYZA 3QE8A 4H8ZA 1IWTA 1GD6A 1B7NA 3AB6A 1CJ7A 1OUHA 1CJ9A 1UIHA 3W6DA 194LA 3P4ZA 4ETCA 4DD2A 1B7SA 1CKHA 1DKJA 1XEIA 1LJJA 1QIOA 5HLLA 3ZEKA 4PHIA 1O23A 2YBJA 1G7IC 2BQKA 1IC4Y 4YF2A 2DKVA 1GFVA 2YBHA 4HJYA 4Z46A 1G7MC 1IO5A 2LHMA 1YAPA 5ILFA 3IJVA 5KXPA 4XJFA 207LA 2FYDA 4WLYA 2LZ2A 1LYSA 4H9HA 1B7MA 135LA 3F6ZA 3AGIA 3P68A 1IWXA 1LZDA 4LYCA 4WM3A 3AYQA 1HFXA 4RW2A 5DM9A 1NF5A 3WXTA 4RW1A 1HEOA 1WQOA 1HMLA 2BLXA 3A95A 1LSBA 1IC7Y 3TMXA 3ULRA 5FEKA 1YQVY 1GE4A 1HEPA 5II3A 4NY5A 4HV1A 1YAQA 1YAMA 1C7PA 1RCMA 1QSWA 3A96A 1LJHA 1YKYX 1JKDA 5DL9A 1CKDA 1IP5A 1GEZA 1HSXA 1B7LA 2ZIKA 2EQLA 3RW8A 2Z19A 4CHXA 4WL7A 1SLYA 1BWIA 1LCNA 5B1GA 4BS7A 1LMTA 1DPXA 2CDSA 4UWUA 3A67Y 2I26L 4MCKA 1GFEA 1LJGA 4Z41A 1GF7A 2X0AA 1OQMA 1CKCA 1YL1X 4AXTA 5B06A 4GCDA 1JKAA 1GXXA 1B7OA 3N9EA 3A94A 4LT3A 4H9AA 3WU7A 3FE0A 5D5FA 4TUNA 4GCBA 5FDJA 1G7JC 3AW7A 1JSFA 1ZMYL 1WTMA 4ANRA 4I0CA 1KXXA 1INUA 5LIOA 3CQLA 3E3DA 1GBWA 3WYHA 1B7PA 1HELA 1GBSA 2DQDY 2FBDA 4B1AA 1HFZA 2BQAA 4KT3A 1FLYA 5APCA 1REYA 3WL2A 4J1AA 2ZNXY 4WLDA 1IOCA 1REMA 1RFPA 4NHQA 1LZSA 1WQPA 4B0DA 1UC0A 2MEAA 5LA5A 1KIPC 1GFRA 4NGVA 4O34A 1QUSA 1KXYA 1D0LA 1T3PA 1NDGC 1GB6A 4R6CA 5L9JA 4LZTA 2HU3A 5KXRA 4H92A 5L3IA 1GF0A 3TMWA 1OUDA 1CKGA 2PC2A 3LZTA 5LVHA 2CJLA 4HSFA 5HQ1A 2VB1A 1FLWA 2F4GA 1UCOA 2Z2EA 3LYTA 1V7TA 4HJVA 3T36A 1LSFA 3LYMA 2RSCA 1TDYA 3WVYA 2MEFA 4E3UA 5FCPA 4M4OA 1AT6A 5IELA 1JIYA 1I20A 1IY4A 3WUNA 2LYMA 3J4GA 2Z38A 4H9CA 1LJEA 1WQNA 1I1ZA 1GWDA 1YROA 4ETAA 4B4JA 4H9IA 5IDDA 4CFOA 2D91A 1JTTL 3ATOA 1LOZA 1BGIA 4ZIXA 3ATNA 1GF6A 1B5YA 1B7QA 1LSPA 1LZYA 3QY4A 4OWCA 4PPOA 1I56A 3WPLA 3WXUA 1OUJA 5C6LA 1V7SA 2Z12A 1QQYA 1AM7A 4G4BA 3CT5A 2XTHA 4H94A 1GBZA 4IASA 4DT3A 1GF9A 1IP3A 2BQEA 2MEHA 2DQIY 3AJNA 4WM4A 3WUMA 2WARA 1VATA 3HBHA 5LYZA 1LSNA 1LJ3A 133LA 5KXYA 1ZV5L 1LMAA 1T6VL 1LZ6A 4IJ4A 3A3QA 3AZ5A 1LZNA 1IP6A 1LKRA 1IP2A 8LYZA 4N8ZA 1B5VA 5DLAA 4DD3A 1KIRC 1REXA 1XEKA 4MSTA 4N1CC 4OWEA 4XJHA 2CGIA 5F16A 5KXNA 4HTQA 3W6EA 4WOAA 4DDAA 2Z2FA 2D4JA 1GFAA 1ZVYB 2BQMA 4WM5A 1QTEA 2MEEA 1LSMA 1OUFA 2BQBA 1IORA 4J7VA 3KAMA 3TMUA 1B5WA 1XGQC 3D3DA 1YAOA 2YBMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4WW0A 1LZ5A 1BB5A 1C6KA 2GV0A 4NHPA 4DR3M 173LA 3HBDA 4CFPA 4WM2A 1WTNA 131LA 4HP0A 2OPFA 3FRHA 3GLGB 2JNHA 4DV0M 2BJWA 1CV1A 1QUGA 3CDRA 3UGJA 2VQFM 3L29A 1AZFA 4OVZA 1G7HC 3DNAA 4OW1A 4H93A 5IWAM 3FADA 1IIZA 1GB8A 3SASA 3KOZE 1CKFA 1G0JA 4TX7A 2C8OA 3M7GA 5FLXS 2C9OA 1OUCA 4TSBA 1LI3A 3A6CY 4ETDA 3FUVA 4KHPM 1L82A 3SFZA 2LNHC 4UWVA 4NGIA 2L09A 1L23A 1C6PA 2FS1A 3RGPA 3U6MA 5LAFA 1IBKM 1CVKA 5JI2E 4B7HA 1L25A 1LHMA 3SP3A 4YOPA 3AZ6A 1GBXA 4A7DA 2VDBB 2B72A 191LA 2FH0A 140LA 2D7GA 4AW4A 4H8XA 1K28A 1CU2A 3EBAB 4HPIA 2UXBM 4YEMA 3N9CA 1UUZC 3D4SA 1WXQA 2RKOA 1F10A 158LA 4L6V6 2HEDA 1IVMA 1IR8A 3HTGA 1BVXA 2ZWBA 5LVJA 3J80S 2NWDX 1C08C 4M9XA 4P2EA 4ITQA 235LA 1QAQA 4GEWA 1L05A 3WUAA 4H90A 176LA 5KXLA 1T97A 1FKVA 137LA 2X8AA 3BKVA 3SB8A 2IHLA 2ZTCA 4M9ZA 1XGTC 3OJPA 4H1PA 3LHMA 1IR9A 1EL1A 2XBRA 1L39A 1IY0A 3B89A 4ETEA 1LHJA 1R6BX 2K9DA 1SXJD 236LA 2ANXA 1LYGA 1SX2A 2A7DA 1IOTA 4IJFA 1J5EM 4GHAA 3FYCA 1TAYA 3A92A 2LZTA 3A91A 3W6CA 1L58A 3C83A 5KXSA 4LYOA 4NHTA 1JB0F 3UZUA 1L42A 4UN2B 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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