The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
67
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sequence length |
249
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structure length |
244
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Chain Sequence |
HGVCWIYYPDGGSLVGEVNEDGEMTGEKIAYVYPDERTALYGKFIDGEMIEGKLATLMSTEEGRPHFELMPGNSVYHFDKSTSSCISTNALLPDPYESERVYVAESLISSAGEGLFSKVAVGPNTVMSFANGVRITHQEVDSRDWALNGNTLSLDEETVIDVPEPYNHVSKYCASLGHKANHSFTPNCIYDMFVHPRFGPIKCIRTLRAVEADEELTVAYGYDHSPPEAPEWYQVELKAFQATQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Transferase
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| source organism |
Homo sapiens
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| publication title |
SET7/9 catalytic mutants reveal the role of active site water molecules in lysine multiple methylation.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Histone-lysine N-methyltransferase SETD7
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| total genus |
67
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| structure length |
244
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| sequence length |
249
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| ec nomenclature |
ec
2.1.1.43: Histone-lysine N-methyltransferase. |
| pdb deposition date | 2010-03-12 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00856 | SET | SET domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 type barrels. | ||
| Mainly Beta | Beta Complex | Beta-clip-like | SET domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4RZ0 A; 5HQ8 A; 4JDS A; 2F69 A; 4IJD A; 5TH7 A; 4IJ8 A; 3RAY A; 4YNM A; 5EX3 A; 3F9W A; 4QEN A; 4AU7 A; 1H3I A; 4FMU A; 3SW9 A; 3RU0 A; 4E47 A; 3BO5 A; 3QWP A; 4NVQ A; 5LSZ A; 3CBM A; 3OXL A; 3K5K A; 3M53 A; 5AYF A; 3S7F A; 5LSX A; 1XQH A; 2IGQ A; 3TG4 A; 3M56 A; 3TG5 A; 3KMJ A; 5T5G A; 2JV0 A; 3MO5 A; 3M59 A; 5JJ0 A; 1MVH A; 2QPW A; 4H12 A; 4Z4P A; 4J83 A; 3DAL A; 5F59 A; 5CPR B; 5TTF A; 5EG2 A; 4MI0 A; 4WUY A; 4YNP A; 3M57 A; 5F6L A; 3KMA A; 1N6A A; 1PEG A; 4YPA A; 3QWW A; 4O6F A; 3OOI A; 5T0M A; 4MI5 A; 5JHN A; 3S7B A; 3MO2 A; 3IHX A; 5CCL A; 3RQ4 A; 3F9X A; 3CBO A; 3N71 A; 1N3J A; 2W5Y A; 5T0K A; 4I51 A; 1MT6 A; 5CCM A; 3F9Z A; 3RIB A; 3VUZ A; 3EP0 A; 1O9S A; 2BQZ A; 2G46 A; 3OXF A; 4J7F A; 5JIY A; 3CBP A; 3KMT A; 4LDG A; 3HNA A; 4NJ5 A; 3VV0 A; 4QEP A; 5HI7 A; 4QEO A; 2W5Z A; 3RJW A; 1ML9 A; 3M58 A; 3OPE A; 3SWC A; 3F9Y A; 3M5A A; 5KJK A; 3M54 A; 3M55 A; 2RFI A; 4BUP A; 1MUF A; 3FPD A; 4C1Q A; 3OS5 A; 4JLG A; 1ZKK A; 5EX0 A; 4YPU A; 5JIN A; 4YND A; 3QWV A; 5F5E A; 2R3A A; 5KJM A; 5F6K C; 3S7J A; 2O8J A; 4J8O A; 4J7I A; 3MEK A; 3MO0 A; 5KJL A; 3PDN A; 1MVX A; 3S8P A; 3S7D A; 5ARG A; 5KJN A; 3DB5 A; 3OXG A; 5ARF A; 5TEG A; 1N6C A; 4O30 A; 4YPE A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3EGD B; 5GAM h; 4M7A G; 3OYD A; 4JDS A; 1KSW A; 2JTM A; 5FU6 B; 3TRE A; 2XKO C; 3CCM Q; 4IJD A; 5A0G A; 5LJ3 e; 2FVU A; 2QA4 Q; 5HK0 A; 2PU9 B; 3CCL T; 3M4Y A; 3NMZ C; 3EFR A; 3NGP A; 2HL3 A; 3CBM A; 2L3P A; 2MIO A; 1WQW A; 1YCS B; 5KYY B; 3J80 E; 2QEX T; 2JW4 A; 1A0N B; 3JCM h; 2I2L A; 1SEM A; 4CC7 A; 2YXY A; 4X9D A; 3DAL A; 1B34 B; 2JXB A; 1YCY A; 1IZ6 A; 5KYN A; 1N5Z A; 1RAC B; 2WSE E; 2O31 A; 4D8K A; 4DBF A; 3X20 B; 3CCJ Q; 4BDZ A; 2CZ0 B; 5DLQ E; 1FXX A; 3S3M A; 1ABQ A; 2YLC A; 4RTV A; 3JCM W; 1Q7Y C; 2BTT A; 4M75 A; 3CCQ A; 1HJD A; 1ARK A; 3A5Z B; 3PVL A; 5LJ3 h; 4CC2 A; 2BQZ A; 3QKJ A; 1JXM A; 4JRK A; 1YJN T; 2KNB B; 2CGH A; 1PHT A; 4E7S A; 2YRC A; 1G83 A; 2HQX A; 4YTL A; 2CH4 W; 3X24 B; 2P0K A; 4ZNX A; 2LX9 A; 1K8A R; 3R6N A; 3QJY A; 5HCK A; 1YI2 Q; 3FJ5 A; 4CC4 B; 4Z8A A; 3QXE B; 3G71 Q; 3X25 B; 1S72 Q; 4IUU A; 1M90 R; 1KQ1 A; 1TUG B; 4FM4 B; 4AMC A; 3LYI A; 3OYJ A; 5CQY A; 1K73 U; 1Q82 C; 3EG2 A; 4BD3 A; 2O8J A; 3MP8 A; 4QVD A; 3CD6 A; 4M75 E; 5IHN A; 3CC7 A; 1M3C A; 4A4E A; 2JNG A; 4EMK B; 1GL5 A; 3OSV A; 1M9S A; 1QP3 A; 5TEG A; 4LUD A; 4C8Q G; 1U5S A; 2KQW A; 3UF4 A; 4FYV B; 1D09 B; 2L3S A; 1Q86 R; 4D6W A; 1VQ9 T; 4M7D E; 3QDR B; 3HRU A; 2Y90 A; 4M7D G; 1VQ5 Q; 2QK0 A; 2DL8 A; 3OYL A; 2RQT A; 3GP8 A; 4MMK A; 3A98 A; 2VC8 A; 3QZ9 B; 3L2U A; 4HKE A; 4HT8 A; 1G2B A; 2ROL A; 3M9Q A; 5GMK i; 3H0H A; 3BE3 A; 3GIB A; 3KBG A; 4DBQ A; 1VQ4 A; 3PNW C; 2LNV A; 3Q1J A; 4C92 A; 1IHW A; 4Q5W A; 5EG2 A; 1Q7Y U; 1Q81 U; 4KH1 B; 4AFU C; 4VUB A; 3G6E A; 4M77 G; 3OOI A; 4MZM A; 3CC4 A; 5GMK m; 4CI0 C; 1RAF B; 3CQT A; 4HVW A; 2CP2 A; 3VKI A; 2ENM A; 2QG9 B; 4PJO B; 4XK8 E; 1IGU A; 5GJV B; 1N8R R; 2EYQ A; 2R5M A; 5T0K A; 2K6D A; 3UPU A; 5CCA A; 4KUL A; 5CCM A; 1M5Q 1; 4QQ6 A; 5AT1 B; 1VQM T; 5J26 A; 2KRO A; 5KE3 A; 1VQL T; 2W0Z A; 4E6R A; 4OP0 A; 2RI5 A; 2PVO B; 3MPU B; 3QO3 A; 1KQ2 A; 3VV0 A; 4OGE A; 1H64 1; 4OB1 B; 3M58 A; 3SWC A; 2QTV A; 2DD5 A; 3M54 A; 3EG0 A; 1NBE B; 1JXO A; 2RA2 A; 2V8I A; 3QWX X; 4DOW A; 4CC3 A; 1M30 A; 3EFO A; 3OMC A; 2XID A; 4N4I A; 3OYK A; 1D1B A; 1FMW A; 2DF6 A; 4M75 F; 5GAO n; 2L2P A; 4IIM A; 3MCA B; 3JCM V; 2YUO A; 2X9H A; 1WJQ A; 4FYY B; 3OXG A; 3VS4 A; 3HP9 A; 4RZ0 A; 2FEI A; 1KD1 U; 3CCE Q; 2O2O A; 4M7D F; 2EWN A; 1E7O A; 1XTD A; 1KIK A; 1Y7X A; 2YUN A; 1I5L A; 1LJO A; 5GAO l; 1JJ2 S; 5J3B A; 2ZPF B; 2DTO A; 2RK1 A; 4E7K A; 4IUQ A; 3RU0 A; 3VYH B; 2XIC A; 5CIU A; 5GAM f; 5AYF A; 1G3W A; 4EIK A; 1OPL A; 3EGU A; 2LVM A; 1UEB A; 3FRN A; 1WHL A; 1ABO A; 2RJC A; 2RQW A; 3AT1 B; 4M77 F; 3UA6 A; 1PKT A; 2D8H A; 4MI0 A; 4A4F A; 2M9U A; 1TG0 A; 2MWO A; 4HVV A; 4OMM A; 1VQ6 Q; 4IUV A; 3SWN C; 2EGA A; 3JCM d; 1FX7 A; 3JCM f; 3IHX A; 1BK2 A; 2RN8 A; 3CPW A; 4HCK A; 2EJ9 A; 3PT9 A; 5GAN e; 3BY7 A; 1BYM A; 2M0Y A; 3QZ5 B; 2FZC B; 3VUB A; 4GBQ A; 1DJ7 B; 1VQN T; 4LE9 A; 2EQI A; 2ZGW A; 2GQV A; 5FWB A; 1WXU A; 3MEA A; 1OYX A; 2NUZ A; 2ED0 A; 1RAD B; 2NUP A; 3EGX B; 3V8K A; 1AD5 A; 4PK4 A; 2DL4 A; 4F7U G; 2DVE A; 4KUI A; 2EGC A; 5LJ3 f; 5CQX A; 2CDT A; 4QQD A; 4J9F A; 4C5H A; 1G3S A; 3OS5 A; 5D6W A; 4ELY C; 1U8R A; 1KHI A; 5JIN A; 2MK5 A; 1J3T A; 4YND A; 4HXJ A; 3WVD B; 3AHU A; 3S7J A; 4C8Q B; 2BZY A; 1MUZ A; 2VUB A; 3JRZ A; 3V8L A; 3ZFJ A; 5GAN h; 5KJN A; 2K79 A; 3RKW A; 4F04 B; 4R0K A; 3OQ5 A; 1RI9 A; 3OMG A; 2H3E B; 4PJJ A; 3EG1 A; 4IKF A; 4XTU A; 2JN0 A; 3CCU A; 2Y4X A; 3URG A; 3LWH A; 2LX7 A; 2D9T A; 1UGV A; 4QEN A; 1WIE A; 1NM7 A; 3JB9 I; 3BO5 A; 1QQJ A; 3QJ6 A; 2E6N A; 3OA6 A; 2ZPE B; 3M53 A; 1QVF S; 2IGQ A; 1EX4 A; 1M3B A; 4MDW A; 5I11 A; 1UG1 A; 5GAN 2; 3KMJ A; 1X6B A; 1M1F A; 5KYU A; 3M59 A; 3M0U A; 1MVH A; 2HNI A; 3RNJ A; 2RJF A; 5CPR B; 5TTF A; 2ZPH B; 3OBW A; 3PMT A; 3DKM A; 1OOT A; 1N6A A; 1I81 A; 2C0I A; 2EBP A; 2RPN A; 1WHK A; 2YWW A; 2KI7 A; 2COY A; 1SHF A; 4M7A C; 4PJO D; 3PVQ A; 3P8D A; 2HL5 C; 3TQ7 P; 1N3J A; 4AFS C; 3CCS A; 1D0Z A; 2GTJ A; 3RDV A; 3D7S B; 3X28 B; 5GAN 8; 1IB8 A; 1C0M A; 2B86 A; 2HMA A; 1RL2 A; 4PJL A; 3CCQ Q; 5JIY A; 1TH7 A; 4J7F A; 5GMK e; 4ZGJ B; 1KK7 A; 1K0X A; 4RG2 A; 1YJW T; 4F7U F; 4KBM B; 2GTO A; 3RMQ A; 2EVR A; 3CME A; 1KC8 U; 1RI0 A; 4L5G A; 2X4J A; 4JZ3 A; 1MHN A; 3TCJ A; 2RFI A; 3MKD A; 4BUP A; 5IXF A; 1NLO C; 1GBQ A; 4TVR A; 4M4Z A; 3P8B B; 4KT0 E; 2MPX C; 4LN2 A; 2YRD A; 4Z02 A; 2O4X A; 3SWN A; 2CH4 A; 2E6Z A; 3GNG A; 1GBR A; 2FG0 A; 5C0M A; 1K8A C; 4BAC A; 5I2S A; 3ER0 A; 4J6W A; 1WDX A; 2AZV A; 3HFO A; 1NPR A; 3CD6 Q; 1M90 C; 4M78 B; 4J9B A; 1IO6 A; 1R0B G; 2EFI A; 3CXC P; 3C0C A; 3CC7 Q; 3UAT A; 4KRT A; 1N6C A; 4DEX A; 2JZ2 A; 1VQK A; 3LH5 A; 2AIR B; 4EMH A; 3CCL A; 5GMK h; 1OU9 A; 4OMF B; 1MGQ A; 2BE7 D; 3CCJ T; 4HA8 A; 3SW9 A; 1X2K A; 4Y91 A; 4NVQ A; 4NL2 A; 2HDA A; 3K5K A; 2AKK A; 1KFZ A; 2CP6 A; 1BB9 A; 1Q86 C; 1QMC A; 2FRW A; 3TG4 A; 2QAS A; 4L59 A; 4ZTF A; 2KXD A; 4OB3 B; 2DKG A; 2YSQ A; 1X01 A; 2PZ1 A; 2QPW A; 4Z4P A; 2CZ6 B; 3EG9 B; 1VQ4 Q; 4E7H A; 1BIA A; 2RK2 A; 2FL7 A; 2CT4 A; 1FWZ A; 2LJ1 A; 4OVA A; 1TXQ A; 4M75 C; 1BIB A; 2FYK A; 3CCV T; 4UC4 A; 1C1A A; 2RHY A; 4IUT A; 3OBY A; 2CZ1 B; 5KCO A; 3G71 T; 3G6E Q; 5FWC A; 3RQ4 A; 3F9X A; 2C0T A; 3CC4 Q; 4FCY A; 4EDU A; 4M7D C; 3INZ A; 5KYX A; 2KK4 A; 2L3R A; 2YHT A; 1PSF A; 1X2Q A; 3I55 T; 4AFZ C; 2DBM A; 3DB3 A; 3LGL A; 3TSW A; 1YJN A; 2YT6 A; 1I07 A; 3GLX A; 2BUD A; 4NOY A; 2IVW A; 1U3O A; 2LZ6 B; 3QII A; 5CKF A; 4DA4 A; 4PNO A; 1N8R C; 1K8A U; 3MEW A; 2LQN A; 3PTA A; 1KQS S; 2K57 A; 1BCO A; 3FPD A; 2KT8 A; 4M77 C; 2CS7 A; 3ULR B; 2CSI A; 3NFC A; 3PMI A; 5FU7 B; 2XDD A; 4PJO G; 2KR3 A; 4M7A A; 1WJR A; 5FRN A; 2MAM A; 1HD3 A; 3C95 A; 2GGR A; 1MVX A; 2ESW A; 2EAY A; 5ARG A; 3LH0 A; 2DXU A; 1PRM C; 4IIO A; 4HVU A; 2X3X D; 4HCC A; 1M4Z A; 2DIG A; 1VQ9 A; 1Q86 U; 2QTX A; 3I9Q A; 2EYZ A; 4J9H A; 3RKX A; 3C94 A; 3ZL7 C; 2YUP A; 4EPC A; 3OW2 P; 5GAN f; 4DOV A; 4XU0 A; 2KSS A; 1XJW B; 4PFO A; 2X51 A; 2JS2 A; 3QG1 A; 1XQH A; 5GAO q; 1W70 A; 1D0Y A; 1WFW A; 4M7A E; 1NJI R; 4ELZ C; 4MDX A; 1JB0 E; 3H9N A; 2LJ3 A; 2AKL A; 2E3H A; 1JRI A; 3L2R A; 2IPO B; 1VIF A; 4XU3 A; 4C0D C; 3OYA A; 3A8O B; 3A8H B; 2JM8 A; 4KGZ B; 4F14 A; 1N8R U; 1YWO A; 1BU1 A; 1U1T A; 4RTY A; 1VQM A; 4GLK A; 2VGN A; 1EZZ B; 3CEY A; 3TEE A; 2QI2 A; 3V7C A; 4E7I A; 2DIQ A; 3E9G A; 4KUD K; 2DA9 A; 2E64 A; 3RMS A; 3BDU A; 4C0F A; 3IQL A; 3GPL A; 1R0C B; 1WXB A; 2FZG B; 2K2V A; 3JB9 D; 4PJO F; 2HBP A; 2P0Q A; 3EH2 A; 1ZBX A; 1S1N A; 4C8Q A; 3OW2 S; 2LDM A; 2CSQ A; 3JCM J; 4J8O A; 2CZ7 B; 2RF0 A; 4M78 D; 1AVZ C; 1WLP B; 4M7D A; 1QLY A; 2DFU A; 1YIJ T; 2Y4Y A; 2MCN A; 3SFM A; 3GNF B; 1TOV A; 1F1B B; 2DER A; 2GF7 A; 2F69 A; 3ZEH A; 3M4G A; 4XTY A; 4V2S A; 1YWP A; 1VQ6 T; 3CCU Q; 1BI0 A; 5EX3 A; 2SRC A; 4AU7 A; 1H3I A; 3FC3 A; 2QQS A; 2K3B A; 2K7A A; 1M2V B; 2Z0W A; 3A8M B; 2DZ9 A; 5GAN 5; 5IN1 A; 2OX7 A; 4J9C A; 2X4Y A; 4C8Q E; 4M77 A; 4LDW A; 1MNE A; 4M7A F; 1PD1 A; 3TG5 A; 2RO0 A; 1YN8 A; 3GF5 A; 3JAM E; 2H3J A; 2EJG A; 5F59 A; 1K9M R; 1SSF A; 1W2B P; 1N27 A; 3GBQ A; 3KMA A; 2DXB A; 4AG2 C; 5IHI A; 3VS2 A; 4FL6 A; 5JHN A; 5L8R E; 2RD1 A; 1QKW A; 4B6M A; 2LRQ A; 4L6V 5; 1VQN A; 2LT4 A; 2AHJ B; 3CCS Q; 3A8L B; 1YIT A; 3THK A; 4C5E A; 1XOV A; 2BE9 B; 3HNA A; 4M77 E; 1CKB A; 1ZUU A; 2J6F A; 3HRS A; 4WCI A; 5KYW B; 1GFD A; 1BBZ A; 4QEO A; 4E2F B; 2RB6 A; 2CRE A; 2R5A A; 2M51 A; 1BI2 A; 1U06 A; 2NUT B; 2OTJ Q; 1JJ2 P; 1VQP T; 1Q95 G; 4Z88 A; 3JCM Q; 1VQ7 T; 3M0R A; 3QPH A; 1ZSZ C; 5KE2 A; 2ABL A; 1C6V X; 1EFN A; 2F2W A; 5CKE A; 1YJ9 T; 8ATC B; 1HYO A; 1PSE A; 1WA7 A; 1NEB A; 5FU6 C; 3DLM A; 3H8Z A; 4D8D A; 2QXF A; 1UHF A; 3QDF A; 3REB B; 3VYG A; 3MO0 A; 4QVC A; 2X4W A; 2DD4 A; 2RQV A; 4JJN K; 1Q82 U; 3OY9 A; 3HSB A; 1Y07 A; 2J6K A; 2FZK B; 2RHI A; 1I8F A; 5IHK A; 3J81 E; 5HK3 A; 3RUX A; 2MF2 A; 1W2B S; 1VQK Q; 3BFM A; 4OF1 A; 4A4G A; 4LDU A; 5CKB A; 2OAW A; 3CCL Q; 1B07 A; 2LP5 A; 2M1H A; 5CO7 A; 1QVG S; 3JB9 G; 1OUL A; 2V1R A; 4C8Q F; 2XDP A; 3PFS A; 3S7F A; 5DM7 R; 2FPF A; 1NZ9 A; 2DM1 A; 1OV3 A; 3MO5 A; 1RLP C; 2LTO A; 4JPB W; 2G3R A; 1VQO A; 3CCQ T; 1WXT A; 3KUF A; 5FRM A; 2XHC A; 4M78 G; 1M8V A; 4YNP A; 3OYC A; 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