The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
48
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sequence length |
192
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structure length |
192
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Chain Sequence |
PETHINLKVSDGSSEIFFKIKKTTPLRRLMEAFAKRQGKEMDSLRFLYDGIRIQADQTPEDLDMEDNDIIEAHREQIGGSTVVTTESGLKYEDLTEGSGAEARAGQTVSVHYTGWLTDGQKFGSSKDRNDPFAFVLGGGMVIKGWDEGVQGMKVGGVRRLTIPPQLGYGARGAGGVIPPNATLVFEVELLDV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
publication title |
A structural biology approach enables the development of antimicrobials targeting bacterial immunophilins.
pubmed doi rcsb |
molecule tags |
Isomerase, protein binding
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source organism |
Saccharomyces cerevisiae
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molecule keywords |
Ubiquitin-like protein SMT3, Peptidyl-prolyl cis-trans isome
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total genus |
48
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structure length |
192
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sequence length |
192
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chains with identical sequence |
B
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ec nomenclature |
ec
5.2.1.8: Peptidylprolyl isomerase. |
pdb deposition date | 2012-08-09 |
chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
---|---|---|---|
A | PF00240 | ubiquitin | Ubiquitin family |
A | PF00254 | FKBP_C | FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase |
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
---|---|---|---|---|---|
Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1 | ||
Alpha Beta | Roll | Chitinase A; domain 3 | Chitinase A; domain 3 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2K6Q A; 4C02 B; 5G55 A; 3L08 A; 4AOF A; 2N7E A; 4EZK A; 3O5F A; 2CHZ A; 3PA7 A; 3QA8 A; 2ZZP B; 4DRJ A; 2KN5 A; 3ZW3 A; 1XQQ A; 1YJ1 A; 2MA9 B; 4N19 A; 4ICV A; 3ZNI D; 2D07 B; 5JHA A; 2XP7 A; 4W9I A; 3O5I A; 1OQY A; 3CF6 E; 4IW0 A; 1WXV A; 3A33 B; 4GGQ A; 1EUV B; 2RQS A; 2DX5 B; 1WGD A; 3ONS A; 4G11 A; 2KXJ A; 4FUL A; 2EMS A; 4NJ7 A; 2CHW A; 2RSE A; 4DHZ E; 4TW8 A; 4BVU C; 2C7H A; 1WMH B; 1WJ6 A; 1XD3 B; 4FJZ A; 2HTH A; 1TCO C; 3H6N A; 4MSP A; 4ODO A; 2DHZ A; 4AWJ A; 1WR1 A; 1UGM A; 3MHS D; 3LDZ E; 2OJR A; 3UIP B; 3LUO A; 4WWO A; 3A1Q A; 1QZE A; 1J6Y A; 1J4R A; 3VH4 B; 2VRR B; 3X23 A; 1Y0O A; 2D10 A; 2R2Q A; 2WWZ A; 1UEL A; 4MJS A; 1D6O A; 1BKF A; 2L76 A; 2HE7 A; 2LZ6 A; 3PVL A; 2KD0 A; 2JXX A; 2N9E B; 4WJQ A; 3V62 A; 4AJW A; 4J4O A; 1FKH A; 5KHO A; 3VTU A; 3R7Q A; 4OVU A; 2M1I A; 2KHW B; 4TUU A; 2IO1 B; 2K8B A; 2KMA A; 1QPL A; 4HXD A; 2L00 B; 3L10 B; 3H7P A; 2KTF A; 4OVV A; 5BO4 B; 4E71 A; 2G3Q B; 3IVF A; 4WAA A; 4PYU A; 5G2N A; 2L05 A; 5JHB A; 2QHO A; 3HM3 A; 4DT4 A; 3N3K B; 1YIW A; 2ZPY A; 1J4I A; 4FJV B; 1P3Q U; 5GMV A; 2RUQ A; 5AZF A; 1E8Y A; 2O6V A; 2AWG A; 1BT0 A; 4I6L B; 4W9H A; 2WX0 A; 3UIO B; 4M0W B; 3NZS A; 1C3T A; 4DWF A; 4BOS C; 4MGV A; 3U8Z A; 2DAF A; 3TDB A; 4MSM B; 1MG8 A; 4GSW A; 1C1Y B; 2ZQV A; 4BKG A; 1EQ3 A; 2KC1 A; 3ECI A; 5CHF A; 4B95 A; 3KCE A; 3ZTD A; 3W1S A; 4KZC A; 3R7R A; 1CMX B; 2KAN A; 2NBV B; 2Z0E B; 3H1U A; 4GN1 A; 4IC7 B; 5E6O A; 2MQJ A; 3KAC A; 2F21 A; 3NI6 A; 2HJ8 A; 3JYU A; 1NSG A; 3AU5 A; 1Q1C A; 2VN1 A; 1UH6 A; 2ZCC A; 1QZ2 A; 2IY1 B; 4LCD E; 2XEW A; 5DPS A; 5J2R A; 3A9J A; 2KGJ A; 4DHZ B; 1U79 A; 2KK8 A; 3M63 B; 3PLU A; 4W9C A; 2D9F A; 2NBW B; 5D7G A; 1Q1O A; 4F7Z A; 2KFW A; 2XP4 A; 3ZDM C; 1FJD A; 2LKN A; 4NAW A; 2IY0 B; 4IWP A; 1NMW A; 4G2P A; 3ALB A; 3PRD A; 3AI5 A; 4DDI D; 1F9J A; 2JY6 A; 2L7R A; 2LAS A; 4K81 A; 4W9D A; 2WX1 A; 2ZR6 A; 2MF9 A; 4IUM B; 3TMP B; 5EDS A; 3S2A A; 5HWB A; 2JF5 A; 3QJZ A; 4GDK A; 4CHK A; 1ZCN A; 1NI2 A; 4TV3 A; 2M0X A; 4ZYN A; 3V6C B; 1GUA B; 4J6I A; 4FN2 A; 3IKD A; 2LJ5 A; 5C23 A; 3JVZ X; 4I6N B; 3WAM A; 4DHJ B; 1P5Q A; 1WJN A; 2A5U A; 4U86 A; 2Y5B B; 3KYD D; 2DZJ A; 2LGO A; 4MDK E; 1OEY A; 1F8A B; 3DOW A; 1P0R A; 4JGH B; 2PPP A; 4DZ3 A; 3CGM A; 2L0F A; 3DBR I; 3QAQ A; 1EYM A; 2OFN A; 3NS8 A; 2Q5A A; 2O6V D; 4NJ6 A; 3TCZ A; 2OOB B; 3TIX A; 3VHT C; 5HT1 A; 3SDL C; 2EMT A; 3LJ3 A; 2LVQ A; 1M94 A; 3PGE A; 3VTW A; 1FKB A; 3KYC D; 3PRP B; 5D2M B; 2KE0 A; 2FCM A; 1LXD A; 2K1F A; 2FNJ B; 4JL9 A; 1V2Y A; 2UZ5 A; 3H9R B; 3X0W A; 1WX8 A; 3DVG Y; 5E6N A; 3RYT A; 2KNB A; 4BKS A; 4EOY A; 3VH3 B; 4O2T A; 2KDE B; 2AYO B; 3D32 A; 5LLI A; 1TGZ B; 4I6P A; 1K8R B; 4FBJ B; 1PBK A; 3O5P A; 2JT4 B; 1KJT A; 2UWQ A; 4G0N B; 5CX3 A; 4B6W A; 5D75 A; 4R0X A; 1WM3 A; 2AWT A; 1FXT B; 3WAN A; 3TJP A; 3NTP A; 4RMA A; 2WDT B; 4K7U A; 1WXS A; 2NPT B; 3V6E B; 3PHX B; 5DPR A; 1RAX A; 1D3Z A; 3OJ4 B; 3RD2 A; 4EEW A; 3O5J A; 3EHV A; 5DIU A; 1WMH A; 2K39 A; 2GBN A; 3W1Y A; 4DK5 A; 2ZQU A; 3WH0 A; 4WJO A; 4KSK C; 2FID A; 4GOC A; 1B6C A; 4II3 B; 5E6P A; 3CMM B; 4GXB A; 4PS3 A; 3TC5 A; 1LQB A; 2LGX A; 3O5E A; 5CHW A; 1WE6 A; 2XP5 A; 4LAX A; 4HJK A; 2A4Z A; 2GBK A; 4DH0 A; 1FKS A; 3O5M A; 4MSQ B; 1X1M A; 2MWS B; 3IHP C; 3PTF C; 3RZF A; 1PIN A; 3WA0 A; 1WJ4 A; 1IPG A; 2NS5 A; 2RR9 A; 5KHQ A; 4JFK A; 4W9E A; 3PHW B; 4MGY E; 3C0R B; 4W9K A; 4IM2 A; 4DRI A; 2DYO A; 2JZ3 B; 3IG3 A; 4FHJ A; 2UYZ B; 2IZV B; 2KFK B; 2KFJ A; 3VUY A; 1FKG A; 1TBE A; 1J0G A; 2F2D A; 5LXI B; 1UZX B; 1P1A A; 4MGZ E; 3QK0 A; 2NVU I; 2XK5 A; 1WX9 A; 3SHQ A; 3GOE A; 4LDT B; 2KDI A; 2IF4 A; 2LUE A; 4DRQ A; 4BKS D; 4GB9 A; 3ODK A; 4FHK A; 3OOB A; 2KX3 A; 4YL8 A; 4TW7 A; 4EZL A; 1FKR A; 2V1Y A; 2ITK A; 3VXW A; 1Q6U A; 3NOB A; 4WWN A; 2V3S A; 3OAW A; 5DPT A; 4EKU A; 4JQW C; 2MLZ A; 4W9Q A; 2RUD A; 1L7Y A; 4X57 B; 2XP9 A; 5AEK B; 2KZR A; 1GG3 A; 2FIF A; 3QWZ B; 2LXA A; 1KT0 A; 2C9W B; 2PV1 A; 1LFD A; 4W9J A; 3DBS A; 2KO7 A; 3KAG A; 5JZE B; 3AXC A; 1HXV A; 4PS7 A; 2BYE A; 1OGW A; 4IM3 A; 3ZNH B; 2C60 A; 1FD9 A; 3SU8 X; 3VQI A; 3M3J A; 3ZKJ C; 4ANX A; 2KJH B; 2MLB A; 3O5O A; 2C5L C; 3BIN A; 2FCS A; 3DQV A; 4KIK B; 1YX5 B; 5AZG A; 3KH0 A; 1WFY A; 4ANU A; 1GNU A; 1WRD B; 4ASW C; 2JZV A; 3H7S A; 2MSE D; 2M1M A; 4FJY A; 1VD2 A; 2KI3 A; 4DRN A; 4GDL B; 2REX A; 1WZ3 A; 4G3X B; 3KZ7 A; 3QC8 B; 1N1A A; 3EC8 A; 2R2O A; 1SIF A; 3O5D A; 5B8I C; 4ODM A; 3V60 A; 3IFW B; 4XC2 A; 1BL4 A; 2ZCB A; 4URK A; 1JNT A; 1R9H A; 2N87 A; 3MDY B; 3O65 B; 3VTV A; 2PV3 A; 2LGY A; 2XP3 A; 2ZR5 A; 4JFJ A; 2AL6 A; 3GZN I; 2FCN A; 3WAP A; 3DBH I; 3VVW B; 4J4N A; 4ODP A; 5IAA C; 2KLC A; 3KUZ A; 1V81 A; 4HWI B; 5D6J B; 1D7I A; 1NMV A; 1P9D U; 4BBN C; 2MLX A; 1NBF C; 1RRB A; 4G50 A; 1V5O A; 4BBN F; 3NZU A; 4TYO A; 2BWF A; 1S1Q B; 2KWV B; 2GBR A; 3P2B A; 4W9F A; 4HVB A; 1D7J A; 1V80 A; 2IYD B; 1C9H A; 2G45 B; 2MP2 A; 2ZVO A; 1WXA A; 3A4R A; 3KAD A; 3RCZ A; 3U30 A; 2KWU B; 1P98 A; 2DZK A; 3WIM A; 1IP9 A; 1J4H A; 3O5G A; 5FR6 A; 4TX0 A; 1NDD A; 1EF5 A; 2ZQT A; 3JYJ A; 4ZRJ A; 4DRO A; 3JSV B; 3EFU A; 2KTR A; 3NHE B; 3APF A; 1Y8R C; 3ENE A; 2GOW A; 4AJY B; 5JH5 C; 1YX6 B; 2ASQ A; 3UGB B; 1FKK A; 2LRU A; 2LD9 A; 2K8I A; 2LPV A; 4MM3 A; 3VFK A; 4ICU A; 3IKG A; 3M62 B; 3JXV A; 2L0T A; 2JRH A; 2BKF A; 3UF8 A; 5J17 A; 1JVW A; 3IK8 A; 3UQI A; 2LJ4 A; 1T0Y A; 2D2Q A; 4HPM B; 4FA6 A; 2C7M B; 2MX2 A; 3H7P B; 3N32 A; 3T8M A; 4NY0 A; 2MPH A; 2JVC A; 4HCN B; 2O2V B; 3B1L X; 5GPG A; 1U4A A; 2KJ6 A; 2XP8 A; 2DG4 A; 1Z5S B; 4LJP B; 3PT2 B; 3AU4 A; 1Q6I A; 2XPA A; 3TCA A; 4PS8 A; 2PE6 B; 4A3O A; 4MGI E; 4DXA B; 3O5Q A; 4KZ0 A; 2LVP A; 4JYS A; 4ODQ A; 2RD0 A; 3RT3 B; 3ZNG C; 4E3C A; 1J19 A; 3Q3J A; 1WJU A; 2N1V A; 3L54 A; 1UBI A; 3QCA A; 4BOZ B; 3PS6 A; 2D11 A; 1YD8 U; 2KC2 A; 2ZPN A; 3NRK A; 1FKF A; 4W9G A; 5HW7 A; 3KUC B; 4DHJ D; 5HW6 A; 3PLV A; 3TBL D; 1YW5 A; 2BYV E; 4JFI A; 2J0K A; 3L0W B; 3N30 A; 4ODK A; 1WY8 A; 4JFM A; 3ML8 A; 1L1P A; 2DZI A; 1E8W A; 1WM2 A; 1A5R A; 3KAF A; 3PPA A; 4A3P A; 2MRP A; 3HM6 X; 2LVO A; 2KDB A; 1TZ1 A; 2N4F A; 2JZZ A; 3A9J B; 3UQA A; 2MBO A; 2YVC A; 1WGH A; 1ZKH A; 2CHX A; 4K7S A; 4M8M A; 1A7X A; 3FAP A; 4ODL A; 1WZ0 A; 2L2S A; 2VCD A; 2ZJD A; 4NAW B; 3ZRF A; 4DIP A; 2MLY A; 4KSL C; 4PYZ A; 4KDL B; 3QHT A; 1Z2M A; 3KVF B; 4GU2 A; 4ANW A; 2DAJ A; 2C7N B; 4AP4 C; 4IG7 B; 3UQB A; 4GDK B; 2BKR B; 3EEC A; 4CYE A; 2PBC A; 4HPL B; 1ZGU B; 3OLM D; 1ISN A; 2CU1 A; 4EFO A; 2DYM A; 4II2 B; 4A20 A; 2G4D B; 3O5K A; 2KKC A; 1RFA A; 3KW5 B; 1GC7 A; 3Q3F A; 3L16 A; 3QQ8 B; 4NQL B; 4FAD A; 1E8X A; 4WWP A; 4LAV A; 2NCN A; 3ZVV A; 3PRB A; 1EF1 A; 4CO7 A; 3GPK A; 4DRH A; 2M2A A; 4ODN A; 1AAR A; 4DRM A; 2NR2 A; 2CKH B; 3PRM B; 1FKD A; 4MEL A; 3ZTC A; 4W9P A; 3ZLZ A; 3DDC B; 3A9K B; 1WGG A; 4ZRK A; 5HUA A; 2RUR A; 1WYW B; 1RLF A; 1E8Z A; 4ITZ A; 4W9L A; 4GIV A; 1F40 A; 3ZRC A; 4IM0 A; 2PV2 A; 2FAZ A; 2EKE C; 2KX0 A; 4HK2 A; 4GDL A; 4BF8 A; 1V86 A; 2J0M A; 1V6E A; 5DCN A; 1I42 A; 4MEM A; 2MBE A; 1SGH A; 4TNS A; 1ROT A; 1EO6 A; 2XBB C; 1WF9 A; 3ZIM A; 2ZR4 A; 5HTG A; 3RUL A; 2J0J A; 1WXM A; 3CGN A; 3APC A; 1ROU A; 2ZQS A; 4JIO U; 2GMI C; 4MH0 E; 3VUW A; 1OTR B; 1UD7 A; 4DZ2 A; 4RM8 A; 2PE9 A; 2JPH A; 1E7U A; 1FAP A; 1FKL A; 4LDT D; 4WJN A; 3ZNZ B; 4WJP A; 1KT1 A; 2XPB A; 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